Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Curs Biochimie
Acizii nucleici sau polinucleotidele sunt compusi macromoleculari a
caror masa moleculara atinge cateva zeci de milioane. Ei sunt constituiti din mai
multe nucleotide. Nucleotidele contin o baza purinica sau pirimidinica, un rest
glucidic (pentoza) si una sau mai multe grupari fosfat.
Bazele ce intra in componenta acizilor nucleici sunt substante ce au in
structura un nucleu heterociclic purinic sau pirimidinic, de unde si denumirea de
baze purinice, respectiv pirimidinice.
Bazele cu nucleu purinic sunt: Adenina (A) si Guanina (G)
Bazele cu nucleu pirimidinic sunt: Uracilul (U), Citozina (C) si Timina (T).
O nucleotida are in componenta: o baza (purinica sau pirimidinica), un
rest glucidic si una sau mai multe grupari fosfat.
Nucleotidele sunt prescurtate prin 3 litere, ca de exemplu:
Baza Nucleozida Abreviere
AMP = adenozinmonofosfat
Adenina Adenozina A
dAMP = deoxiadenozinmonofosfat Guanina Guanozina G
UDP = uridindifosfat Citozina Citidina C
Curs Biochimie
Acizii nucleici
Pentru a forma acizi nucleici, nucleotidele sunt legate intre ele prin punti
formate de acidul esteric dublu esterificat (cu grupa hidroxil de alcoolul secundar
din pozitia 3 a unei molecule de pentoza) pe de o parte, iar pe de alta parte, cu
grupa hidroxil de alcool primar din pozitia 5 a altei molecule de pentoza din
nucleotidul urmator.
Capatul 5`
Capatul 3`
FOSFATI
NUCLEOTIDE
BAZE
Curs Biochimie
REZUMAT 1
Curs Biochimie
Ordinea si energia biologica
Curs Biochimie
Organismele vii mentin, la toate nivelele, un grad ridicat al ordinii. Aceasta
ordine este intalnita de la aripile unui fluture, pana la nivel celular, subcelular si
molecular. Atomii constituenti sunt aranjati intr-o ordine anume, fiind blocati in
structuri precise. Chiar si o celula care aparent nu se dezvolta, are o ordine
interioara bine stabilita, pentru ca inevitabil, in interiorul celulei pot sa apara
accidente care trebuiesc reparate in mod constant.
Cum este acest lucru posibil din punct de vedere termodinamic?
Raspunsul este acela ca fiecare celula primeste combustibilul necesar din
mediul ce o inconjoara si il elimina sub forma reziduurilor; celula nu este deci un
sistem izolat din punct de vedere termodinamic.
Ordinea biologica este posibila prin cedarea de energie sub forma de
caldura de catre celule.
Conform celei de-a doua legi a termodinamicii, gradul de ordonare al
unui sistem descreste cu trecerea timpului. Asadar, cresterea continua a ordinii
intr-o celula vie nu se poate realiza decat cu o crestere si mai mare a dezordinii
mediului inconjurator celulei. Caldura este energie in forma cu gradul cel mai
mare de dezordine.
Curs Biochimie
Genele sunt formate din ADN!
Curs Biochimie
Acum se stie ca genele sunt compuse din molecule. La inceput a fost
greu sa se imagineze natura acestor molecule.
Ce fel de molecule ar putea fi depozitate intr-o celula, molecule
care sa directioneze mai departe activitatea unui organism in dezvoltare
si care, de asemenea, sa fie capabile de o replicare de cea mai mare
acuratete?
La sfarsitul celui de-al IX-lea secol, biologii au recunoscut ca
transportorii informatiei genetice sunt cromozomii care incepeau sa devina
vizibili cand celula incepea sa se divida. Ideea prezentei ADN-ului din care sunt
formate genele a aparut ceva mai tarziu. In 1944 s-a demonstrat ca, adaugand
ADN-ul pur al unei linii bacteriene la o alta, se poate observa conferirea unor
proprietati ereditare caracteristice primei linii bacteriene. Se stia ca doar
proteinele au o structura conformationala foarte complexa, asa ca ideea
aceasta a fost intr-adevar o surpriza pentru biologii timpului. Aceasta teorie a
fost acceptata doar la inceputul anilor 1950. Astazi este binecunoscut faptul ca
ADN-ul celular cu intraga sa insiruire de nucleotide este cel care transmite
informatia ereditara.
Curs Biochimie
Moleculele de ADN sunt alcatuite din doua lanturi lungi, legate intre
ele prin legaturi complementare intre baze!
Lantul ADN-ului este un polimer lung, liniar, compus doar din 4 tipuri de
subunitati. Acestea sunt deoxiribonucleotide ce contin ca baze: Adenina (A),
Citozina (C), Guanina (G) si Timina (T). Nucleotidele sunt legate intre ele prin
legaturi fosfodiesterice care leaga C5` al unei grupe deoxiribozice de C3` al
urmatoarei.
Cum poate un lant lung de nucleotide sa contina informatia unui
organism, sau chiar doar a unei celule? Si cum pot fi transmie aceste informatii
de la o generatie la alta?
Raspunsul sta in structura ADN-ului.
Atat ADNul cat si ARNul sunt plomeri formati din inlantuirea mai multor
nucleotide. ARNul difera de ADN prin 3 caracteristici:
1. are in componenta rest de Riboza si nu Deoxiriboza ca in cazul ADN;
2. difera prin tipul bazelor intalnite in structura lantului: ARN contine Uracil, iar
ADN contine Timina
3. ARNul este format dintr-un singur lant, in timp ce ADN are structura unui lant
dublu helicoidal
Structurile ARN-ului si ADN-ului sunt prezentate in imaginile urmatoare:
Structura ARN-ului Structura ADN-ului
Curs Biochimie
Cele patru baze ale ARN-ului
,
Curs Biochimie
Capacitatea ereditara explicata prin structura ADN-ului
Curs Biochimie
Replicarea helixului ADN-ului
incepe cu o separare punctuala a celor
doua lanturi comlementare. Fiecare lant
se comporta apoi ca matrita pentru
Lantul nou format Lantul matrita
obtinerea unei noi molecule de ADN
obtinuta prin aditionarea secventiala a
deoxiribonucloetid-trifosfatilor.
Curs Biochimie
Dintr-un lant dublu helicoidal de
ADN se obtin doua lanturi identice.
Curs Biochimie
Erorile in replicarea ADN-ului cauzeaza mutatii
Una din caracteristicile cele mai importante ale replicarii ADN-ului este
acuratetea. In timpul replicarii, mecanisme foarte sensibile analizeaza si elimina
pozitionarile incorecte ale nucleotidelor. Ca rezultat, secventa de nucleotide din
molecula ADN-ului este copiata cu mai putin de o greseala la 109 nucleotide
adaugate. Totusi, foarte rar, in procedeul replicarii, este adaugata o nucleotida
gresita in locul alteia. Orice astfel de greseala este considerata o greseala
genetica denumita mutatie,
mutatie mutatie ce va fi copiata in toate noile generatii de
celule ca si cum ar fi varianta corecta a lantului de ADN. O astfel de greseala,
chiar si la nivelul unei singure nucleotide, poate avea implicatii enorme.
Pornind de la faptul binecunoscut ca proteinele sunt codificate de catre
gene, mutatia unei gene, poate duce la inactivarea unei proteine cruciale si mai
apoi la moarte celulara.
Pe de alta parte, o mutatie poate fi latenta si sa nu afecteze functiile
unei anumite proteine.
Foarte rar, prin mutatii se obtin gene cu o functie noua sau
imbunatatita. In acest caz, organismele care poarta aceasta mutatie vor avea un
avantaj, iar gena mutanta poate in final, prin intermediul selectiei naturale, sa
inlocuiasca gena originala intr-o anumita populatie. Curs Biochimie
Secventa de nucleotide dintr-o gena determina secventa aminoacizilor din proteine
ADNul este relativ inert din punct de vedere chimic. Informatia pe care o
contine este indirect exprimata in alte molecule: ADN-ul directioneaza sinteza unui
ARN specific si a unor anume proteine.
La inceput, a fost studiata structura tridimensionala a ADNului de catre
biofizicieni folosindu-se difractia razelor X. Se cunostea deja ca proteinele sunt
lanturi de aminoaczi legati intre ei prin legaturi peptidice. Abia la inceputul anilor 50
cand a fost secventata insulina, o proteina de dimensiuni mici, s-a descoperit faptul
ca fiecare proteina are o secventa unica de aminoacizi si ca prin structura ei,
fiecare proteina are anumite proprietati specifice.
Curs Biochimie
Insulina bovina
Curs Biochimie
Portiuni din secventa de ADN sunt transpuse in ARN care ghideaza sinteza proteica
Curs Biochimie
Pentru ca fiecare molecula de ARNm poate fi transcrisa in mii de copii
de lanturi polipeptidice, informatia continuta intr-o regiune mica a ADNului poate
sa directioneze catre sinteza a milioane de copii ale unei proteine specifice.
Curs Biochimie
Moleculele de ARN eucariot sunt fractionate
pentru a indeparta secventele de introni
Curs Biochimie
De exemplu:
-Codonul GUG este transpus in aminoacidul Valina, iar
-Codonul GAG este transpus in Acid glutamic.
Curs Biochimie
In principiu, fiecare secventa de ARN poate fi transpusa in oricare
din cele trei moduri de citire (reading frames), in functie de pozitia din care
incepe procesul de citire, putand genera trei secvente de aminoacizi diferite.
Curs Biochimie
Datorita celor patru segmente mici ale ARNt cu structura de dublu helix,
ARNt are o forma asemanatoare frunzei de trifoi. Aceasta forma este mai amplu
compactata intr-o forma de L prin legaturi de hidrogen mult mai puternice (imagine).
Doua dintre seturile de nucleotide aflate la capetele ARNt sub forma de L
au o functie mai importanta in sinteza proteica: una este anticodonul (care este
complementar cu codonul de la nivelul ARNm), iar cealalta este secventa CCA de
la capatul 3 unde sunt atasati prin legaturi covalente diferiti aminoacizi.
ARNt al
Fenilalaninei
din drojdie.
Curs Biochimie
Mesajul ARNului este citit de la un capat la altul de catre ribozomi
Sinteza proteica
Curs Biochimie
Unele molecule de ARN au si rol de
catalizatori
Curs Biochimie
Secventa intronului de aprox 400 nucleotide lungime a fost
sintetizata si a fost studiata aratandu-se ca ea functioneaza ca o enzima in
reactie cu alte molecule de ARN.
De exemplu, poate lega foarte strans doua componente: nucleotidul
Guanina si lantul de ARN, catalizand formarea legaturii covalente:
Curs Biochimie
In acest model de reactie care este foarte asemanator cu prima
etapa din imaginea anterioara, aceeasi secventa de introni actioneaza
repetat pentru a desface mai multe lanturi de ARN.
Desi, in general acest proces de defacere a ARNului nu este
unul catalitic, autoscindarea ARNului cu secvente de introni ca in cazul
Tetrahymena a fost descoperita a fi prezenta si in alte celule de fungi si
bacterii.
Acest lucru sugereaza ca aceste secvente de ARN ar fi putut sa
apara inainte de separarea in cele doua clase de eucariote si procariote,
acum 1,5 milioane de ani.
Curs Biochimie
Recent, au fost descoperite si alte familii de ARN catalitic.
De exemplu, majoritatea ARNt este initial sintetizat sub forma unui
precursor de marime mai mare, iar pentru scindarea sa cu obtinerea ARN final, un
rol catalitic important il au alte molecule de ARN. Remarcabil, activitatea
ribozomilor este suspectata a fi in stransa legatura cu activitatea catalizatoare a
ARNului ribozomal, care ocupa mai mult de jumatate din acest complex.
Aceasta molecula mare de ARNr prezinta activitate de peptidil-
transferaza, catalizand formarea noilor legaturi peptidice (imagine):
Curs Biochimie
Cum este posibil ca o molecula de ARN sa se comporte ca o enzima?
Curs Biochimie