Nel sito A egli eucaristica deve entrare un trna carico.

Deve avere come caratteristica

quella di avere un amminoacido attaccato. Il fattore di elongazione legato a una
molecola di Gtp, che viaggia insieme al trna. Eftu Gtp che viene idrolizzato nel sito
apposito del amminoacido. L'appaiamento codone e anti codone deve essere perfetto. In
caso contrario, quello che accade e che il trna oscilla a causa del suo angolo di curvatura.
Se invece corretto il trna insieme al fattore di elongamento permette di stare stabile per
un tempo sufficiente a dare idrolisi di GTP. Se oscilla non interagisce con la tasca e in
questo modo c' un altissima probabilit che il legame codone e anti codone si esaurisca
prima che venga risolta l'idrolisi del GTP. L idrolisi del Gtp necessario perch possa
essere messo a disposizione l'amminoacido , in quanto il Gtp lo scherma.
Il secondo controllo di qualit in questo momento del passaggio di formazione del legame
peptidico consiste nell'accomodamento, che consiste nella rotazione del trna in modo tale
da avvicinare l'amminoacido alla catena peptidica. La catena deve girarsi e se
l'appaiamento corretto la torsione supportata dall energia che lega codone e anti
codone, mentre se il trna sbagliato non c' energia sufficiente da mantenere stabilit
quello che accade che la torsione allontana il legame, che quindi troppo lontano per
permettere un legame.
A questo punto il ciclo continua per tutti gli amminoacidi che devono essere incorporati.
In seguito al l'idrolisi del Gtp il fattore di elongamento esce dal complesso e viene riciclato
da un alto fattore che lo ricaricher con il Gtp.
In questi due passaggi si trovano due idrolisi di Gtp, che quindi fondamentale nella
sintesi proteica.

Il riposo a un ribozima, cio possiede rrna in grado di operare catalisi enzimatica.

Cambiando alcune basi del rrna il ribosoma viene inattivato. Il ribosoma deproteinizzato
permette di formare legami peptidici, mantenendo l'attivit peptidil transferasica.
La traslocazione
In questo processo il ribosoma si sposta di un codone lungo l'mrna in modo che il peptidil
trna va nel sito P, il trna scarico va nel sito E e si libera il sito A. Ef g gtp interagisce con la
subunit grande e idrolizza gtp. Questa idrolisi genera mimetismo molecolare in modo che
si infila nel sito A e induce lo spostamento dei due trna. L mrna viene trascinato 3 siti pi
avanti.
Mimetismo molecolare tra Gtp e efg e eftu e trna.

Il codone di stop non viene riconosciuto da nessun trna, ma da fattori proteici spesso di
rilascio e terminazione, i quali permettono di avere l'idrolisi del peptide dal peptidil-trna e il
ribosoma si apre liberando il peptide.
Il 40% degli antibiotici conosciuti ha come bersaglio il macchinario della traduzione.
Gli antibiotici interferiscono con i diversi passaggi della traduzione. Questo il motivo per
cui la sintesi proteica cos fondamentale.
Le tetracicline impediscono l'attacco dei trna per esempio.
La puromicina somiglia all'estremit 3 di un aa trna e quindi per mimetismo molecolare
induce la sintesi proteica.
Decadimento dell'mrna mediato dal nonsenso: presenza di condoni di stop prematuri
causano la degradazione del trascritto. Un codone non senso prematuro provoca la difesa
della cellula che riconosce l'mrna con questo codone non senso maturo e lo elimina in
quando spesso si trovano sull'ultimo esone. Il ribosoma passa e leva questi complessi. Se
la presenza iniziale il distacco prematuro.
Questo meccanismo funziona se la proteina associata a un corredo diploide.
Rimozione di mRna difettosi: se il codone di stop salta non saprei dove fermarmi. Questo
fa in modo che il ribosoma vada sulla coda di poli a. Se incontra la coda poli a inizia ad
avere solo lisina (aaa), il che un segnale per la cellula, che conosce l'assenza di proteine
con strutture simili, e quindi catalizza la degradazione di mrna e proteina.

Medicina personalizzata per capire come risponderebbe un singolo paziente ad un

determinato meccanismo. Un approccio simile pu essere l'adattamento di una cura in
base alla mutazione.
Esistono alcune molecole che hanno la capacit di alterare il ribosoma in modo da
permettere l'introduzione di un trna carico che pu superare il codone immaturo e
superare lo stop.
Farmaci read through permettono di superare il codone di stop, usata per duchenne o per
la fibrosi cistica.
Duplicazione del dna
Il processo in cui il genoma di una cellula viene duplicato prima della divisione cellula
permettendo la sua trasmissione alle cellule figlie. Possono anche uscire in fase g0, e in
questo caso si tratta di cellule postmitotiche
Possibili meccanismi i replicazione: semiconservativa, distributiva/dispersiva, conservativa
Meselsohn e stahl: esperimento con azoto e isotopo. Prendono il dna pesante e lo
mettono in terreno di azoto leggero. All'inizio tutto il dna pesante, poi sempre pi
leggero, e alla seconda avr tre pesanti e una leggera, poi sette bande pesanti e una
leggera -- > vedi sul libro.
Diminiusce quella pesante e aumenta la leggera. Se dispersiva alla seconda
generazione continuo a fare molecole che sono progressivamente pi leggere perch
sono un miscuglio tra la componente nuova e quella che c'era prima.
Il metodo conservativo non corretto. Alla generazione abbiamo due bande,una leggera e
una pesante, e poi la leggera diventa sempre pi grossa e la pesante diventa pi leggera.
Replicazione semidiscontinua.
La sintesi del dna richiede un innesco a rna. Dna polimera so non sa sintetizzare dna se si
d dsDna o ssDna. Vedi slide
Usa come precursore un deossinucleotide trifosfato.
Negli eucarioti ci sono pi origini di replicazione. Quando l'origine stata riconosciuta ed
attivata, si forma una bolla di replicazione. La bolla o occhio di replicazione corrisponde al
dna replicato all'interno di una regione di dna non replicato. possibile indurre la
formazione di queste strutture con pulse radioattivi. ???
Il punto in cui i due filamenti di dna si apodo o il dna viene replicato viene definito come
forca replicativa.
La bolla di replicazione indica dove ha inizio la sintesi del dna ma non dice se la sintesi
avviene in una o due direzioni.

La replicazione pu essere mono o bidirezionale.

Se do un impulso di radioattivit e diluisco tutto, se la replicazione monodirezionale il
chase and pulse fa in modo che abbia solo una parte marcata, mentre se bidirezionale
ho due estremit radioattive. Se non usassi questa leggera marcatura sembrerebbero
esattamente uguali.
Marco le estremit con il rosso e poi do nucleotidi gialli. In mezzo ho giallo mentre alle
estremit delle forca che ora si portata sempre pi all'estremit ho ancora il rosso,
mentre il giallo in mezzo continua a allungarsi.

In coli individuabile un unica origine, ma vista la lunghezza del genoma in circa 30 minuti
posso copiare tutto, con una velocit di 30 trenta kilobasi al minuto. L'uomo alla velocit di
3, come il lievito, con una sola origine impiegherebbe un anno per tutto il genoma e il
lievito 80 ore. Nel lievito 330 origine mentre nell'uomo apparentemente sembra ce ne
siano circa pi di diecimila. Quello del lievito si replica in 20 minuti mentre nel nostro 7
massimo 10 h.
Con un esperimento di pulse possibile individuare pi origini di replicazione vicine.
Le nostre origini di replicazione devono essere ben controllate, innanzitutto perch
vengano usate una e una sola volta per ciclo di replicazione per non duplicare info
genetica e anche fare in modo che permettano la replicazione di tutto il genoma, cosa che
provocherebbe altrimenti punti di tensione e rotture del genoma.
Una serie di proteine riconoscono il promotore e lo attivano, e quindi questo permette nel
passaggio successivo alla replicazione dalle varie origini. Immaginiamo che 3 e 5 vengano
attivate e inizino la replicazione, nel momento in cui arrivano ad un'altra origine di
replicazione che non era stata attivata, essa viene bloccata e non viene attivata. Sembra
che l'accensione delle origini di replicazione sia random e quindi questo le chiude.