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UNIVERSIDAD SAN PEDRO

FACULTAD DE MEDICINA HUMANA


ESCUELA ACADMICO PROFESIONAL DE MEDICINA

GUIA PRACTICA DE GENETICA E


ITRODUCCION A LA EMBRIOLOGIA

PRACTICA 1

Autor:
MD. CALDERON CHAVEZ JUAN CARLOS T.

Coordinador de Asignatura

Ao
2017
UNIVERSIDAD SAN PEDRO GENETICA E INTRODUCCION
ESCUELA PROFESIONAL DE MEDICINA HUMANA A LA EMBRIOLOGIA HUMANA

SEMANA 1: GENOMA HUMANO Y BASES CROMOSMICAS DE LA HERENCIA

1) CAPACIDAD ESPECFICA: Analiza las caractersticas del genoma humano,


mediante exposiciones y experiencias en laboratorio; demostrando predisposicin
al aprendizaje, responsabilidad, pensamiento crtico, creatividad y trabajo en
equipo.

2) INFORMACIN BSICA:

INTRODUCCIN

En cada organismo la fuente esencial de la informacin biolgica son los cidos


nucleicos. La forma y las actividades de las clulas estn determinadas en gran
medida por las instrucciones genticas contenidas en el DNA (o el RNA en
ciertos virus). De acuerdo con el dogma central de la Biologa molecular, la
secuencia de las bases nucleotdicas del DNA codifican para la secuencia de
aminocidos (aa) de las protenas. Muchas de las protenas celulares son
enzimas que catalizan los procesos metablicos dentro del organismo. Otras
protenas tienen un papel estructural o regulador, o participan en el
mantenimiento y la transmisin de la informacin gentica.

Dos clases de cidos nucleicos, DNA y RNA, almacenan la informacin y la


hacen accesible para la clula. La estructura de estas molculas debe ser
consistente con las siguientes condiciones:

1. La informacin gentica debe almacenarse en una forma que sea manipulable


en tamao y estable durante un periodo prolongado.
2. La informacin gentica debe codificarse, a menudo muchas veces, para
utilizarse. La transcripcin es un proceso por el cual las secuencias de
nucletidos del DNA se copian a RNA, de modo que puedan dirigir la sntesis
de las protenas, un proceso conocido como traduccin.
3. La informacin contenida en el DNA o el RNA debe estar accesible a las
protenas y otros cidos nucleicos. Estos agentes deben reconocer los cidos
nucleicos (en muchos casos, en una forma especfica de secuencia) y unirse
a ellos de un modo que altere su funcin.
4. La progenie de un organismo debe estar equipada con el mismo conjunto de
instrucciones presente en sus progenitores. De esta manera, el DNA se
replica (se hace una copia exacta) con el fin de que cada clula hija reciba la
misma informacin.

Como se podr imaginar, se requieren muchos componentes celulares para ejecutar


todas las funciones de los cidos nucleicos. Sin embargo, estos son entidades casi
inertes "de slo lectura". En particular, el RNA, debido a su naturaleza de hebra
simple, es una molcula dinmica que proporciona el andamiaje estructural, como
tambin la actividad cataltica en numerosos procesos que decodifican la informacin
gentica.

NUCLETIDOS Y CIDOS NUCLEICOS

Los cidos nucleicos son macromolculas que conforman las subunidades de las
cadenas de DNA y RNA, y son clave en el almacenamiento y transmisin de la
informacin gentica. Participan en numerosos procesos biolgicos, transportan
energa, son parte de coenzimas esenciales y regulan numerosas funciones
metablicas. Los nucletidos estn compuestos por tres partes integrales: Fosfatos,
azcares y bases pricas o pirimdicas.

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Grupos fosfatdicos: Forman parte de los cidos nucleicos y nucletidos en


forma de monofosfatos (un tomo de P), difosfatos (dos tomos de P) o
trifosfatos (tres tomos de P).
Residuos de azcares: Generalmente son derivados de una ribosa, como P-D-
ribosa (en el cido ribonucleico, RNA) o P-D-desoxirribosa (en el cido
desoxirribonucleico, DNA).
Bases nitrogenadas de pirimidina: La citosina (C), la timina (T) y el uracilo (U)
son las tres bases nitrogenadas de pirimidina. Ellas difieren entre s en sus
cadenas laterales (-NH2 en el C4 de la citosina, -CH3 en el C5 de la timina, y
O en el C4 del uracilo). Adems, la citosina posee un enlace doble entre el C3
y el C4.
Bases nitrogenadas de purina: La adenina (A) y la guanina (G) son las dos
bases nitrogenadas de purina. Ellas difieren en sus cadenas laterales y en la
presencia de un doble enlace entre el N1 y el C6 (presente en la adenina,
ausente en la guanina).
Nuclesidos y nucletidos: Un nuclesido es un compuesto de un residuo de
azcar (ribosa o desoxirribosa) y una base nitrogenada. La unin es entre el
tomo de C en la posicin 1 del azcar y un tomo de N de la base (enlace N-
glucosdico). Un nucletido es un compuesto de un residuo de un azcar unido
a una base nitrogenada y un grupo fosfatdico.
cido nucleico: Los cidos nucleicos se forman cuando los nucletidos se
unen entre s por medio de puentes fosfodister entre el tomo de C3' de un
nucletido y el C5' del siguiente.

ESTRUCTURA Y FUNCIN DEL DNA


El DNA es una doble hlice, entrelazada y sumamente larga que almacena
informacin gentica. Sus componentes se ordenan con una relacin qumica
especfica, lo que determina la estructura.

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En la doble hlice, las bases enfrentadas se aparean y permanecen unidas por


puentes de hidrgeno. Las bases apareadas deben ser siempre combinaciones de una
purina con una pirimidina. No solamente las purinas no pueden aparearse con purinas,
ni las pirimidinas con pirimidinas, sino que, a causa de las estructuras particulares de
las bases, la adenina slo se aparea con la timina, formando dos puentes de
hidrgeno (A=T) y la guanina solamente con la citosina, formando tres puentes de
hidrgeno (G=C). Las bases apareadas son complementarias, y adems cumplen con
la denominada "Ley de Chargaff", que dice que la cantidad de adenina (A) es igual que
la de timina (T) y que la de guanina (G) es igual que la de citosina (C): A=T y G=C,
pero el nmero de A+T y el de G+C no son iguales entre s.

Dado que una molcula de DNA puede tener miles de nucletidos de largo, es posible
obtener una gran variedad de secuencias de bases diferentes, y la variedad es uno de
los requisitos primarios del material gentico.

Otra caracterstica de la cadena es que la misma tiene direccin: cada grupo fosfato
est unido a un azcar en la posicin 5' -el quinto carbono en el anillo de azcar- y al
otro azcar en la posicin 3' -el tercer carbono en el anillo de azcar-. As, la cadena
tiene un extremo 5' y un extremo 3'.

Las dos cadenas corren en direcciones opuestas, es decir, la direccin desde el


extremo 5' al 3' de cada cadena es opuesta y se dice que las cadenas son
antiparalelas. Aunque los nucletidos dispuestos a lo largo de una cadena de la doble
hlice pueden presentarse en cualquier orden, su secuencia determina el orden de los
nucletidos en la otra cadena. Esto es necesariamente as, porque las bases son
complementarias (G con C y A con T).

La funcin principal de la secuencia de bases a lo largo de la hebra de DNA es


almacenar y transmitir durante generaciones la "memoria gentica" para codificar la
sntesis de todas las protenas (proteoma) del cuerpo humano.

En cuanto a su funcin, podemos clasificar el DNA en dos grandes grupos: DNA


codificante es el que estructura los genes cuya misin es codificar la sntesis de
protenas y representa aproximadamente el 10% del total, y DNA no codificante que es
el 90% del total, no codifica protenas (por lo tanto, sus mutaciones no van a afectar la
estructura de estas) y tiene funciones de proteccin frente a cambios y de regulacin
(hoy se est viendo que mutaciones en este tipo de DNA pueden tener tambin
trascendencia patolgica). Adems, hay dos tipos de DNA no codificante, pero que
forman parte de estructuras diferenciadas del cromosoma. Uno es el DNA
centromrico constituyente de los centrmeros, que es un DNA alfoide que se dispone
en conjuntos de repeticiones en tndem de unidades elementales de 171 pb que no
son todas iguales. El otro es el telomrico que es el que forma los telmeros y es un
DNA de secuencias muy repetitivas en tndem del hexanucletido TTAGGG, que se
repite hasta formar conjuntos de longitud variable, de un promedio de 10 kb (1600
monmeros).

LA HLICE DE DNA

El DNA est formado por dos hebras de un polmero de desoxirribonucletidos


unidos por enlaces fosfodister. La forma biolgica ms comn del DNA se conoce
como B-DNA, que tiene las siguientes caractersticas:
1. Las dos hebras de polinucletidos antiparalelas se enrollan hacia la derecha
alrededor de un eje comn para producir una doble hlice de
aproximadamente 20 de dimetro.
2. Los planos de las bases nucleotdicas, que forman enlaces de hidrgeno

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apareados, son casi perpendiculares al eje de la hlice. En el B-DNA las


bases ocupan el centro de la hlice, mientras que los esqueletos de azcar-
fosfato se enrollan por fuera, y forman los surcos mayor y menor. Slo los
bordes de las bases apareadas estn expuestos al solvente.
3. Cada apareamiento de bases tiene aproximadamente el mismo ancho, lo que
justifica la simetra casi perfecta de la molcula de DNA, ms all de su
composicin de bases. Los apareamientos A-T y G-C son intercambiables:
pueden reemplazarse uno a otro en la doble hlice sin alterar las posiciones
de los tomos C1' de los esqueletos de azcar-fosfato. De forma similar, los
componentes de un apareamiento de Watson y Crick pueden alterarse (o sea,
por medio del cambio de un GC a un C G o un AT a un TA). Por el contrario,
cualquier otra combinacin de bases distorsionara la doble hlice en grado
significativo.
4. La hlice de B-DNA "ideal" tiene 10,5 pares de bases (pb) por vuelta (un
girode hlice de 36 por pb), y dado que las bases aromticas tienen el ancho
de Van der Walls de 3,4 y se encuentran parcialmente apiladas una sobre
otra, la hlice tiene un paso de hlice (pitch, avance por vuelta) de 34 .

La doble hlice de DNA puede asumir varias estructuras diferentes en funcin de la


composicin del solvente y la secuencia de bases.

Las variantes estructurales principales del DNA son el A-DNA y el Z-DNA.

La forma A es compacta y presenta 11 bases por vuelta a diferencia de la forma B


que presenta 10,5. El DNA-A es poco frecuente. Slo existe en estado de
deshidratacin y difiere de la forma B por 20 en la rotacin del eje perpendicular de
la hlice. El DNA-A posee un surco mayor y un surco menor chato.

El DNA-Z muestra una conformacin hacia la izquierda en lugar de girar hacia la


derecha. Su hlice posee una forma de mayor energa. Esto produce una mayor
distancia entre los pares de bases (0,77 nm) que en el DNA-B y una forma
"zigzagueante" del esqueleto de azcar-fosfato cuando se lo mira desde un costado
(de ah el nombre de DNA-Z). El surco nico del DNA-Z posee una densidad mayor de

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molcula de carga negativa. Un segmento de DNA-B abundante en pares G-C puede


convertirse en DNA-Z cuando se rotan las bases 180. En general, el DNA-Z es
termodinmicamente inestable. Sin embargo, la transicin a DNA-Z se ve facilitada
cuando una citosina se metila en la posicin 5 (C5). La modificacin del DNA por
metilacin de la citosina es frecuente en ciertas regiones del DNA de los eucariontes.

El DNA-Z cumple funciones biolgicas. Existen secuencias que favorecen la formacin


de DNA-Z cerca de las regiones promotoras en donde el DNA-Z estimula la
transcripcin.

FUERZAS QUE ESTABILIZAN LAS ESTRUCTURAS DE LOS CIDOS NUCLEICOS

El DNA no muestra la complejidad estructural de las protenas dado que tiene slo un
repertorio limitado de estructuras secundarias y carece de estructuras terciarias o
cuaternarias comparables. Esto quizs es esperable, dado que los 20 aa de las
protenas tienen un espectro de propiedades qumicas y fsicas mucho mayor que las
cuatro bases del DNA. Sin embargo, y de modo anlogo a las protenas, hay ciertas
fuerzas que dan origen a las estructuras de los cidos nucleicos:

Desnaturalizacin y renaturalizacin: A pesar de que cada uno de los


puentes de hidrgeno entre las bases nitrogenadas es dbil, el DNA es estable
a las temperaturas fisiolgicas debido a que las dos cadenas se mantienen
unidas por muchos puentes de hidrgeno a lo largo de ms de cien millones de
nucletidos. Las dos cadenas se pueden separar cuando se desenrollan al ser
expuestas a una solucin de temperaturas crecientes o por accin de reactivos
suaves (por ejemplo, lcalis, formamida o urea). A este proceso se lo conoce
como desnaturalizacin. La temperatura a la cual las cadenas se separan (Tm,
del ingls melting temperature), depende de muchos factores, incluidos la
proporcin de pares G-C, ya que los tres puentes de hidrgeno entre G y C
son ms estables que los dos puentes de los pares A-T. Las molculas
resultantes de DNA de cadena simple se enrollan de forma aleatoria y no
mantienen la estructura helicoidal. Cuando se las enfra, se aumenta la
concentracin inica, o se neutraliza el pH, las cadenas se reasocian para
formar una doble hlice (renaturalizacin), pero nicamente si son
complementarias. Si son idnticas, hibridan rpidamente; si son muy
parecidas, hibridan lentamente; si no se parecen, no hibridan. Ambos procesos
son las bases para las tcnicas que analizan si las secuencias nucleotdicas de
dos cadenas simples de DNA estn relacionadas (hibridacin del DNA). Este
es un principio importante en el anlisis de los genes. El DNA tambin puede
hibridarse al RNA.
Apareamiento de bases: El apareamiento de bases parece ser un "adhesivo"
que mantiene juntas las dobles hebras de cidos nucleicos. La geometra de
Watson y Crick es la forma ms estable de apareamiento de bases en la doble
hlice, aun cuando los otros apareamientos son tericamente posibles. Esto es
as porque los pares de bases de Watson y Crick tienen una afinidad mutua
mayor que los otros.
Apilamiento de bases e interacciones hidrfobas: Las purinas y las
pirimidinas tienden a formar extensos apilamientos de molculas planas
paralelas. Estas interacciones de apilamiento son una forma de interaccin de
Van der Waals. Las interacciones entre las bases G y C apiladas son mayores
que las presentes entre las bases A y T apiladas, lo que justifica en gran
medida la mayor estabilidad trmica de los DNA con alto contenido de G+C.
Por lo que se puede afirmar que la energa de apilamiento de una doble hlice
depende de la secuencia.
Interacciones inicas: Cualquier teora sobre la estabilidad de las estructuras
de los cidos nucleicos debe tomar en cuenta las interacciones electrostticas

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de sus grupos fosfatos cargados. Los cationes divalentes como Mg+2, Mn+2 y
Co+2 se unen especficamente a los grupos fosfato, por lo tanto, son agentes
que escudan los cidos nucleicos en forma mucho ms efectiva que los
cationes monovalentes.

3) ACTIVIDADES: Construye una maqueta de una molcula de ADN aplicando


los contenidos conceptuales adquiridos en la teora.
a. Para esta actividad se agruparan en grupos de 03 estudiantes
b. Construirn la molcula de ADN ms comn en el ncleo de las clulas
humanas.
c. Para el desarrollo de esta actividad podrn consultar los siguientes
enlaces y escoger la tcnica a utilizar :
https://www.youtube.com/watch?v=IN3tBkk8UjQ&hd=1
https://www.youtube.com/watch?v=sD9Db7BTMig
d. Durante la construccin de su modelo de ADN debern tener en cuenta
las caractersticas estructurales de cada elemento as como la funcin
del mismo.
e. Al finalizar la construccin debern llenar la siguiente tabla:

N Componente Indique que propiedad del ADN se perdera en su


ausencia.

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Componentes: indique todos y cada uno de los elementos que se encuentran


en una molcula de ADN, no solo los elementos si no tambin los espacios que
se forman as como las estructuras complejas como los cidos nucleicos.

a. Explique el papel de la molcula de ADN en el genoma humano.

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