Tema 1.

Introduccin a IB

Basada en roles, tareas o dominios:

Se centra en la funcin de la informacin dentro de las organizaciones:
- Informtica de la enfermera
- Informtica de la salud publica
- Informtica clnica

La informtica Biomdica es una disciplina multidisciplinaria, se relaciona con:

- Ciencias de la computadoras (Software)
- Bioingeniera
- Epidemiologa
- Estadstica
- Ciencias Biomdicas
- Ciencias Clnicas
- Ciencias Administrativas
- Hardware
- Ciencias Cognitivas

Definicin de informtica biomdica:

Campo cientfico multidisciplinario para la atencin de calidad que implica mltiples
disciplinas (medicina, estadstica, epidemiologia, ingeniera, psicologa, genmica,
robtica, entre otras) que analiza la bsqueda, organizacin, recuperacin,
almacenamiento, anlisis y aplicacin de los datos, la informacin y el conocimiento para
la toma de decisiones bajo condiciones de incertidumbre y solucin de problemas de
salud.

La informtica biomdica se centra principalmente en cuatro corolarios, que engloban

todas sus reas de investigacin y aportacin en la medicina, los cuales son:
- La IB desarrolla, estudia y aplica teoras, mtodos y procesos para la generacin,
almacenamiento, recuperacin, uso y comparticin de datos, informacin y
conocimientos biomdicos.
- La IB aporta y potencia las ciencias y tecnologas de la comunicacin, de la
computacin y de la informacin para su aplicacin en medicina y ciencias
biomdicas.
- La IB investiga y apoya el razonamiento, el modelaje, la simulacin, la
experimentacin y la traslacin a travs de todo el espectro de molculas a
poblaciones, tratando con una variedad de sistemas biolgicos y construyendo
puente entre la investigacin bsica clnica y la practica en los sistemas de salud.
- La IB utiliza las ciencias sociales y de la conducta para informar el diseo y la
evaluacin de soluciones tcnicas y la evolucin de sistemas complejos
econmicos, ticos, sociales, educativos y organizacionales reconociendo que los
usuarios de la informacin biomdica en ultima instancia son seres humanos.
Tema 2. Taxonomas DICS

Los cuatro componente del modelos de Taxonoma DICS son:

Datos:
Smbolos que representan propiedades de objetos, eventos y su entorno
Por s mismo carece de sentido y valor si no lo procesamos mentalmente
Producto de la observacin, materia prima de la informacin
Somatometra, signos vitales, edad, resultados de estudio de laboratorio, estado
socioeconmico etc.

Informacin:
Datos+significado
Procesamiento de datos con relevancia y propsito
En medicina nos permite responder : qu, quin, cundo y dnde
Contextualiza los datos para la toma de decisiones, los hace valiosos y tiles.

Conocimiento: (Tactito o explicito):

Es necesario interpretar la informacin, y aplicarla a travs del conocimiento para
tomar una decisin.
Aplicacin de datos e informacin
Transforma la informacin en instrucciones
Nos ayuda a responder el cmo
Sntesis de informacin de varias fuentes
Conocimiento explcito (saber qu) vs conocimiento tcito (saber cmo)

Sabidura:
Tiene que ver con la intuicin, comprensin en interpretacin humana
Implica un mayor nivel de abstraccin
Mayor capacidad de ver al horizonte y planear.
Basada en juicio tico, experiencia y creencias del individuo.

El modelo de taxonomas DICS fue propuesto inicialmente en el ao de 1989 por

ACKOFF.
Tema 3. Estndares en Medicina

Estndares en IB
Obtencin de informacin para utilizarla y tomar decisiones acertadas en el momento que
se requiera, esta informacin puede estar almacenada en bases de datos.
Son necesarias normas o acuerdos que permitan la codificacin adecuada de los datos
mdicos y la posibilidad de transmitirlos.
Hay dos niveles de codificacin: la abstraccin y la representacin.
La abstraccin implica la exploracin e los datos registrados y su asociacin con una
terminologa que lo describa de forma general y breve. La representacin busca
decodificar tanto detalle como sea posible.
Cuando hay dos o ms tecnologas, sistemas o componentes tienen capacidad de
intercambiar informacin y usarla, se dice que tienen interoperabilidad.
Enfocado a la medicina, segn la OMS, un estndar es un modelo, criterio, regla de
medida o de requisitos mnimos aceptables para la operacin de procesos especficos con
el fin de asegurar la calidad en la prestacin de los servicios de salud.

Organismos de estandarizacin.
Existen diversos organismos de normalizacin o estandarizacin. En el campo de la salud
la evolucin de las normas se ven beneficiadas con estndares que ayudan al mdico a
mantenerse actualizado.

CIE:
Publicada en 1992,dcima edicin en ingls, los trminos tienen una estructura jerrquica

Grupos relacionados por el diagnstico (GRD):

Proporciona un nmero relativamente pequeo de cdigos de la hospitalizacin y
gravedad de la enfermedad. Se basa en los factores que afectan el costo y la duracin de
la estancia.

Clasificacin Internacional de la Atencin Primaria:

Publicada por la Organizacin Mundial de Medicina de Familia, la versin ms reciente,
ICPC-2 clasifica unos 14oo trminos de diagnstico.

Terminologa actualizada de procedimientos mdicos (CPT):

Mantenido por la American Medical Associationl, describe los servicios mdicos
quirrgicos y de diagnstico para unificar la informacin entre mdicos, codificadores,
pacientes,instituciones.

Manual de Diagnstico y Estadstico de los Trastornos Mentales (DSM):

Definiciones de trastornos psiquitricos , incluye los criterios de diagnstico especfico,
coordinado con la CIE-10.
SNOMED:
Contiene trminos para 344 000 conceptos. Permite agrupar un alto nivel de detalle,
descripciones de los conceptos en mltiples idiomas, trminos locales, intenta abarcar
todo el espectro del control del vocabulario, cada trmino est definido por sus relaciones
con el resto.

GALEN:
Tiene como objetivo el desarrollo de herramientas y mtodos para la construccin y
mantenimiento de clasificaciones de procedimientos quirrgicos.

LOINC:
Estndar universal y una base de datos para la identificacin de resultados de laboratorio,
que permite el intercambio y almacenamiento de informacin.

Diccionario de Frmacos de la OMS:

Terminologas pblicas y comerciales para representar trminos utilizados para prescribir
y administrar medicamentos. Proporciona los nombres usados en diferentes pases,
ingredientes activos y sustancias qumicas.

Medical Subject Headings:

Trminos que indexan la bibliografa mdica mundial, los trminos estn organizados en
jerarquas.

DeCS:
Trilinge, creado para servir como lenguaje nico en la indizacin de artculos, revistas,
libros, informes tcnicos para usarse en la bsqueda y recuperacin de asuntos de la
bibliografa cientfica en las fuentes de informacin disponibles en LILACS, MEDLINE y
otras.
ANSI:
Organizacin privada sin fines de lucro responsable de aprobar estndares americanos a
nivel nacional .

Health Level Seven (HL7):

Crea mtodos para la interoperabilidad e intercambio de datos entre sistemas de salud;
concentra datos clnicos, administrativos de proveedores, consultores entre otros. Incluye
plantillas para la administracin de pacientes como los ingresos, egresos y traslados,
consultas, informes, observaciones, programacin etc.
DICOM:
Es el estndar reconocido mundialmente para el intercambio de pruebas mdicas
(imgenes), pensado para su manejo, visualizacin, almacenamiento, impresin y
transmisin.
Tema 5. Fuentes de informacin

Base de Datos:
Es la organizacin estructurada de un conjunto de informacin con al menos una
caracterstica en comn que permite su agrupacin

Caractersticas importantes de las fuente de informacin primaria:

- Contiene informacin original
- Presentadas en su totalidad (completas)
- Resultado de una investigacin.
- Ejemplo: libros, artculos de revistas, tesis, informes, normas, fofografas, mapas,
etc.

Caractersticas importantes de las fuentes de informacin secundarias:

- Contiene informacin primaria, elaborad, sintetizada y reorganizada
- Refieren a fuente primarias
- Contiene representaciones condensadas de fuente primarias
- Ejemplos: Base de datos(como Medline), diccionarios, enciclopedias e ndices y
resmenes bibliogrficos.
Estrategias de bsqueda:
- Problema a resolver
- Termidos de bsqueda: conceptos que definan el planteamiento
- Operadores: Operadores Booleanos

Operadores Boleanos

AND= interseccin
OR= adicin (suma)
NOT= negacin

Ejemplo:

A. Pacientes alcohlicos. 22
B. Pacientes con Hepatitis. 20
C. Pacientes con
hipertrigliceridemia. 18
((Pacientes con hepatitis OR Pacientes con hipertrigliceridemia) NOT Pacientes
Alcohlicos)

Respuesta: 18

Gestores de bibliografa:

Facilitan el uso de normas, estilos y otros elementos que intervienen en el proceso de

recopilacin y organizacin bibliogrficas. Tambin son herramientas acadmicas y de
investigacin que ahorran tiempo y facilitan el manejo de recursos de informacin de
forma automatizada. Ejemplo: Mendeley
Tema 6. Biblioteca medica digital

La recuperacin de la informacin (RI):

A veces llamada "bsqueda", es el campo dedicado a la adquisicin, organizacin y
bsqueda de la informacin basada en el conocimiento (Hersh, 2009).

Los sistemas de RI almacenan y difunden informacin basada en el conocimiento, que es

la informacin obtenida y organizada o artculo de la investigacin por observacin o
experimental.

El objetivo de la RI o investigacin es encontrar contenido que cumpla las necesidades de

informacin de una persona, como artculos, pginas de internet, imgenes, etc.

Metadatos:
Son "datos acerca de los datos" y describen los componentes del contenido.

La RI incluye dos procesos intelectuales:

La indexacin:
Es el proceso de asignar metadatos a los elementos del contenido para facilitar su
recuperacin.

La recuperacin:
Es el proceso del usuario que ingresa su consulta y recupera elementos del contenido.

La informacin basada en el conocimiento puede subdividirse en dos categoras:

- La informacin basada en el conocimiento primario (o bibliografa primaria): Es la
investigacin original que aparece en revistas, libros, reportes y otros recursos.
Este tipo de informacin presenta el descubrimiento inicial de aspectos de salud,
con los datos originales o un nuevo anlisis de los datos.
- La informacin basada en el conocimiento secundario: Consiste en documentos
que revisan, concentran o sintetizan la bibliografa primaria. Est incluye
informacin sobre la salud orientada al paciente. Es el tipo de informacin que los
mdicos usan con mayor frecuencia.

Contenido bibliogrfico:
Incluye lo que por dcadas fue la base de los sistemas de RI: base de datos bibliogrficas.
Este contenido consiste en citas o indicadores referentes a la bibliografa mdica, o sea,
artculos en revistas. Ejemplo: Medline

Contenido de texto completo:

Versiones en lnea de libros o publicaciones peridicas con la informacin completa.
Trminos MeSH (Medical Subject Heading):
Vocabulario controlado de la NLM, se encuentran en ingls y son los ms relevantes al
contenido de un artculo.

MEDLINE:
Base de datos de citas y resmenes de artculos de revistas biomdicas.
Contiene ms de 20 millones de artculos; es una biblioteca gratuita desde el 26 junio de
1997.

El principal sistema de busqueda de libre acceso que aloja a Medline, es PubMed,

desarrolado por la NCBI en la National Library Medicine.

Ejemplos:

Para actualizacin de informacin

Medscape: http://espanol.medscape.com/
Up To Date: https://www.uptodate.com/contents/search
PubMed: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Identificacin de medicamentos:
PubMed: http://reference.medscape.com/pill-identifier
Micromedex: http://www.micromedexsolutions.com/micromedex2/librarian/
(Por apariciencia) MedScape: http://reference.medscape.com/pill-identifier

Procedimientos:
Clinical Key: https://www.clinicalkey.es/#!/browse/procedures
Medsacpe: http://emedicine.medscape.com/clinical_procedures

Educacin para el paciente:

Clinical Key https://www.clinicalkey.es/#!/browse/patient_handout
Up To Day: https://www.uptodate.com/contents/table-of-contents/patient-education
*Medline: https://medlineplus.gov/spanish/

Calculadoras tiles en medicina:

MedScape: http://reference.medscape.com/guide/medical-calculators/alpha
UpToDate: http://www.uptodate.com/es
Tema 7. Gestores de Informacin.

Metadatos:
Datos sobre los datos, el trmino se refiere a los datos que se utilizan para ayudar a la
identificacin descripcin y localizacin de algn recurso. : Ej. Liga electrnica, datos
biomdicos, colecciones digitales, citas de referencias, etc.

Cienciometra: Es el estudio cuantitativo de los metadatos sobre la bibliografa

especializada, de manera particular los artculos de investigacin (Poniendo nfasis en que
es el productor principal de la ciencia).

Aplicaciones de la cienciometra:

1. Recuperacin de informacin mdica: Bsqueda de informacin precisa,

relevante para analizarla y resolver un problema mdico.

2. Revisiones bibliogrficas: Entender las caractersticas de un conjunto de

bibliografa, artculos de investigacin.

3. Obtencin de nuevo conocimiento mdico (Generacin de otras colecciones

bibliogrficas): Proceso ms complejo de un anlisis bibliomtrico. Se analizan
nuevas relaciones con las ya existentes

Bibliometria: Es el estudio cuantitativos de los metadatos sobre la bibliografa

especializada, de manera particular los artculos de investigacin (Poniendo nfasis en que
es el producto solo son documentos). Aporta mtodos, tcnicas e indicadores para evaluar
comunicacin y uso de la informacin cientfica y contribuir al anlisis y evaluacin de la
ciencia y la investigacin.

Tipos de documentos ms utilizados en biomedicina:

1. Informe de casos (Case Report): Manifestaciones clnicas y estudios de

evaluacin que dan lugar a un diagnstico.

2. Artculo Clsico (Classical article): Versin actual de un artculo impreso

anteriormente que marc un hito en la medicina o ciencia, comentarios
que anuncian su reimpresin.

3. Ensayo clnico (clinical trial phase I-IV): Estudio clnico pre-planificado

sobre seguridad, eficacia o esquema de dosis en uno o ms frmacos
concluyendo efectos favorables y desfavorables.
 4. Estudio comparativo: Comparacin de los resultados para diferentes
tcnicas.

5. Ensayo clinico controlado: tratamientos de prueba y de control.

Tratamientos pueden ser frmacos, dispositivos, medidas de control
incluyen dosificacin, regmenes.

6. Casos legales: Informes sobre leyes o casos resueltos.

7. Meta-anlisis: Estudios que utilizan un mtodo cuantitativo,

combinacin de los resultados de estudios independientes, sntesis de
resmenes, visin general de ensayos clnicos.

8. Revisin: Artculo publicado despus del examen del material, abarca

casos clnicos e informes experimentales.

Gestores bibliograficos:

Fuciones:

- Inserta citan citas en un domuento de Word

- Reliza las ucniones de contructor de bibliografa
- Gestor de la base de datos
- Buscador de refecnias
- Facilita el trabajo colabortativo para la publicacin de articulos
- Permite exportar citas bibliograficas a documentos segn normas internacionesl
- Almacenar enlaces a recusos y articulos de interes

*Zotero

*Mendeley: Fundado en 2007 *nico que ocupa meta datos.

*RefWorks:
Material realizado:

Landetta Mendez Ricardo

Informacin tomado de:

*Presentacin de los temas visto en clase hecha por Rene Medina Marroqun

*Presentaciones del aula virtual de Informtica BiomdicaSnchez Mendiola; Martnez

Franco, Informtica Biomdica, Editorial Elsevier, 2014, 2 Edicin.
*Resumidas por: Campos Tirado Luis Fernando.
Carrillo Velzquez Karla Mariana.
Carrillo Velzquez Diana Fernanda

*Apuntes durante clase de Ricardo Landetta Mendez