Organizacin

del genoma
humano

Captulo 7, Human Molecular Genetics 2

Gentica Humana 1

Organizacin del genoma humano

Gentica Humana 2
 Genoma mitocondrial

Caractersticas generales
Es heredado de la madre
Doble cadena circular
Cadena pesada (H)
16.569 pb
Cadena liviana (L)
Presente en miles de copias
93% es codificante
28 Cadena H
Posee 37 genes
9 Cadena L
La mayora de las protenas codificadas en el
genoma nuclear
Gentica Humana 3

Genoma mitocondrial

22 ARNt
24 ARN maduros 23 S
37 genes 2 ARNr
16 S
13 son ARNm Polipptidos

Cdigo Gentico
Fig.

Gentica Humana 4
 Cdigo gentico del genoma nuclear y mitocondrial

Gentica Humana 5

Genoma mitocondrial

Regin de triple helice

Gentica Humana 6
Gentica Humana 7

Limitada Autonoma del Genoma

Mitocondrial

23 S y
16 S

tRNAs: 3ra base

8 cualquiera Stop codons:UAG
14 purinas o
UAA
pirimidinas
AGA
AGG
Gentica Humana 8
Genoma mitocondrial

Ejemplo de solapamiento de genes.

Gentica Humana 9

Genoma Nuclear

Gentica Humana 10
Genoma Nuclear
Contiene ms del 99% del ADN celular
(3300 Mb).
Tamao y disposicin:
Se distribuye en 24 cromosomas

150.000 vs 35.000 genes

Composicin:
42% de G-C

La frec. de aparicin del dinucleot. C-G es 1/5 de la esperada.

Existe un 3% de mC, por desaminacin espontnea, mC T.

El porcentaje se mantiene por las islas de G-C.

Presentes en ~56% de los genes (asociadas a los promotores de los mismos).

Gentica Humana 11

Genoma Nuclear
2 son sexuales (X e Y)
24 cromosomas
22 son autosomales

Poseen un tamao Se clasifican de mayor a menor salvo el 21

promedio de 130 Mb que es menor que el 22.

Gentica Humana 12
Genoma Nuclear

Contraste en la densidad de genes: (A) regin HLA (Human

Leukocyte Antigen), (B) regin del gen distrofina.

Gentica Humana 13

Genoma Nuclear
Respecto a los genes
Diversidad de tamaos En gral cuanto mayor es el gen mayor es el producto con
excepciones: apolipoprot. B 4563 aa. Vs distrofina 3685
aa.

Gentica Humana 14
Genoma Nuclear
Respecto a los genes
Exn promedio tiene 200 pb
Organizacin interna Fig.

La minora de los genes humanos no presentan intrones

Gentica Humana 15

Exones e Intrones en genes humanos

Tabla 7.7

Gentica Humana 16
 Genes superpuestos

Son raros
En gral en
regiones de
alta densidad
de genes.

Gentica Humana 17

Genes dentro de genes

La mayora de los snoRNAs.
En gral en genes que codifican protenas asociadas a los ribosomas o al
nuclelo.
Ejemplos
Gen de la Neurofibromatosis tipo I. (fig.).
Factor VIII
Gen de Suceptibilidad al Retinoblastoma (RB1)

Gentica Humana 18
Genoma Nuclear

30%
10%

Gentica Humana 19

Genoma Nuclear

~3%

Gentica Humana 20
Genoma Nuclear

ARN
ARNr: organizados en unidades
transcripcionales (28s, 18s y 5,8s) en
tandem.
Forman 5 clustres de 50 tandem
cada uno. Se localizan en los brazos
cortos de los cromosomas 13, 14, 15,
21 y 22.
5s
Varios centenares de copias
3 clusters en cromosoma 1q.
ARNt: es una gran familia
dispersa, compuesta a su vez por
ms de 40 subfamilias, cada una con
los distintos tipos de ARNt
citoplasmticos.
Gentica Humana 21

Genoma Nuclear
Organizacin de genes en Familias segn el grado
de homologa entre las mismas
Alto grado de conservacin en
gran parte de la secuencia. Idntica
funcin. Ej. Histonas, RNAr,
Clsicas protenas ribosomales.

Alta conservacin de una

regin especfica del gen
(dominio), en gral
Dominios asociado a una funcin
Organizacin en conservados especfica.
familias de genes
Motivos Familias caracterizadas
por una funcin comun y
conservados
la presencia de motivos
conservados muy cortos.

Relacionados en funcin y en la
Superfamilias estructura gral de sus dominios;
Gentica Humana muy baja homologa. 22
Genoma Nuclear
Organizacin de genes en Familias segn el grado
de homologa entre las mismas
Alto grado de conservacin en
gran parte de la secuencia. Idntica
funcin. Ej. Histonas, RNAr,
Clsicas protenas ribosomales.

Organizacin en
familias de genes
Alta conservacin de
una regin especfica del
gen (dominio), en gral
Dominios asociado a una funcin
conservados especfica.
Familias caracterizadas
Motivos
por una funcin comun y
conservados la presencia de motivos
conservados muy cortos.

Relacionados en funcin y en la
Superfamilias estructura gral de sus dominios;
Gentica Humana muy baja homologa. 23

Genoma Nuclear

Gentica Humana 24
Genoma Nuclear
Organizacin de genes en Familias segn el grado
de homologa entre las mismas
Alto grado de conservacin en
gran parte de la secuencia. Idntica
funcin. Ej. Histonas, RNAr,
Clsicas protenas ribosomales.

Alta conservacin de una

regin especfica del gen
(dominio), en gral
Dominios asociado a una funcin
Organizacin en conservados especfica.
familias de genes
Motivos Familias caracterizadas
por una funcin comun
conservados
y la presencia de motivos
conservados muy cortos.

Relacionados en funcin y en la
Superfamilias estructura gral de sus dominios;
Gentica Humana muy baja homologa. 25

Genoma Nuclear

En gral tienen una funcin similar

Los genes de la flia DEAD box est compuesta por distintos genes cuyos
productos poseen funcin de ARN helicasa.

Los productos de la flia de genes con repeticiones WD estn involucrados en

regulacin de la division celular, transcripcin, etc.

Gentica Humana 26
Genoma Nuclear
Organizacin de genes en Familias segn el grado
de homologa entre las mismas
Alto grado de conservacin en
gran parte de la secuencia. Idntica
funcin. Ej. Histonas, RNAr,
Clsicas protenas ribosomales.

Alta conservacin de una

Organizacin en
familias de genes
regin especfica del gen
(dominio), en gral
Dominios asociado a una funcin
conservados especfica.
Motivos Familias caracterizadas
por una funcin comun y
conservados
la presencia de motivos
conservados muy cortos.

Relacionados en funcin y en la
Superfamilias estructura gral de sus dominios;
Gentica Humana muy baja homologa. 27

Genoma Nuclear

Superfamilia de las inmunoglobulinas

Gentica Humana 28
 En tandem: Alpha globina (alta similitud en secuencia y
Genoma Nuclear funcin)
Agrupacin cerrada: dispuestos ms separados, pero se
nico
mantienen en gral bajo un mismo sistema regulador, (alta
cluster
similitud en secuencia y funcin).
Grupos compuestos: Presencia de genes no relacionados
(ej.: complejo HLA).
Organizacin
de las Organizados en ms de una regin en el genoma.
familias de
Mltiples
genes segn clusters Alta similitud: ARNr
su Baja similitud: poseen alta homologa dentro
distribucin de cada cluster pero baja entre ellos. Ej. Flia de
globinas.
en el genoma No poseen una relacin obvia, se presentan solitarios en
distintos cromosomas.
Originados a partir de 2 genomas distintos.
Familias
Originados por una antigua duplicacin del genoma o
de genes
regin del gen. Ej. flia PAX
dispersos
Originados por retrotransposicin

Gentica Humana 29

Genoma Nuclear En tandem: ARNr (alta similitud en secuencia y funcin)

Agrupacin cerrada: dispuestos ms separados, pero se
nico
mantienen en gral bajo un mismo sistema regulador,
cluster
(alta similitud en secuencia y funcin).

Grupos compuestos: Presencia de genes no

relacionados (ej.: complejo HLA).
Organizacin
de las Organizados en ms de una regin en el
familias de genoma.
Mltiples
genes segn clusters Alta similitud: ARNr e Histonas (fig.)
su Baja similitud: poseen alta homologa
distribucin dentro de cada cluster pero baja entre ellos.
en el genoma Ej. Flia de globinas.
No poseen una relacin obvia, se presentan solitarios en
distintos cromosomas.
Originados a partir de 2 genomas distintos.
Familias
Originados por una antigua duplicacin del genoma o
de genes
regin del gen. Ej. flia PAX
dispersos
Originados por retrotransposicin

Gentica Humana 30
 Organizacin de los genes de las Histonas

Gentica Humana 31

Familias multignicas organizadas en clusters

Tabla 7.9

Gentica Humana 32
Genoma Nuclear En tandem: ARNr (alta similitud en secuencia y funcin)
Agrupacin cerrada: dispuestos ms separados, pero se
nico
mantienen en gral bajo un mismo sistema regulador, (alta
cluster
similitud en secuencia y funcin).
Grupos compuestos: Presencia de genes no relacionados
(ej.: complejo HLA).
Organizacin
de las Organizados en ms de una regin en el genoma.
familias de Mltiples
genes segn clusters Alta similitud: ARNr
su Baja similitud: poseen alta homologa dentro
distribucin de cada cluster pero baja entre ellos. Ej. Flia de
globinas.
en el genoma
No poseen una relacin obvia, se presentan solitarios
en distintos cromosomas.
Originados a partir de 2 genomas distintos.
Familias
Originados por una antigua duplicacin del
de genes
genoma o regin del gen. Ej. flia PAX
dispersos
Originados por retrotransposicin

Gentica Humana 33

Familias de multignicas dispersas en el genoma

Tabla 7.9 b

Gentica Humana 34
Genoma Nuclear

Gentica Humana 35

Genoma Nuclear
No-procesados
Pseudogenes

Copias Procesados
defectivas de
genes

Genes truncados y
fragmentos de genes

Pseudogenes: Copia no funcional de la mayora o todo el gen, o al menos la

regin codificante.
Gentica Humana 36
Genoma Nuclear
No-procesados: son copias, en gral no funcionales, de genes. Se originan
de copias a nivel de DNA; la prdida de funcin se debe a mutaciones,
que generan codones STOPs. (algunos pueden ser expresados, gene ! en
Pseudogenes el cluster de la alpha globina).

Procesados: copias no funcionales de secuencias exnicas. Provienen

de la integracin de ADNc. Si es un transcripto de la ARNpol.II, para
que sea expresado debe integrarse cerca de algn promotor. Y si es un
transcripto generado por la ARN pol. III ?

Gentica Humana 37

Genoma Nuclear

Son originados por un crossover

desigual o un intercambio desigual de
cromtidas hermanas.

Genes truncados y
Truncado: les falta el extremo 5 3.
fragmentos de genes
Fragmento: de un gen

Gentica Humana 38
Genoma Nuclear
Ejemplos de pseudogenes, fragmentos de genes y
genes truncados en la familia HLA de clase I

20 genes, 6 se expresan (negro), 4 pseudogenes no procesados (celeste) y una variedad de

fragmentos de genes y genes truncados (recuadro celeste).

Gentica Humana 39

Genoma Nuclear No-procesados: son copias, en gral no funcionales, de genes. Se

originan de copias a nivel de DNA; la prdida de funcin se debe a
mutaciones, que generan codones STOPs, o prdida de funcin.
(algunos pueden ser expresados, gene ! en el cluster de la alpha
Pseudogenes globina).

Procesados: copias no funcionales de secuencias exnicas.

Provienen de la integracin de ADNc. Si es un transcripto de la
Origen de ARNpol. II, para que sea expresado debe integrarse cerca de
pseudogenes algn promotor. Y si es un transcripto generado por la ARN pol.
procesados III ?

Gentica Humana 40
 Secuencias de DNA extragnicas
repetidas
y
Elementos transponibles

Gentica Humana 41

Genoma Nuclear

Gentica Humana 42
Genoma Nuclear
Megasatlites

Secuencias Satlites
repetitivas
en tandem Minisatlites
Secuencia
extragnica
Microsatlites

LINEs
Secuencias
transponibles
SINEs

Alu

Gentica Humana 43

Genoma Nuclear

Gentica Humana 44
Genoma Nuclear

Localizacin de las principales clases de ADN repetitivo extragnicos

Gentica Humana 45

Microsatlites
Repeticiones de 1-4 bp en tandems de 150-200 bp.
Muy polimrficas
Dispersos en el genoma
Homopolmeros de A T muy comunes
0.3% del genoma (10 Mb)
Homopolmeros de G C muy raros
Repeticiones de dinucletidos CA/TG muy comunes
0.5 % del genoma
1 cada 50 kb
Expansin de repeticiones de trinucletidos pueden ser
causantes de enfermedades
Repeticiones de tri y tetranucletidos son comparativamente raras
Uso de los microsatlites? Y de los minisatlites?

Gentica Humana 46
Genoma Nuclear

Gentica Humana 47

Genoma Nuclear

LTR: long terminal repeat SINE: short interspersed

~ 30 % del genoma !! nuclear elements
LINE: long interspersed
Alu: 1 cada 3 kb
Gentica Humana nuclear elements 48
Genoma Nuclear

Retrotransposones en mamferos

Line

Alu

Gentica Humana 49

Genoma Nuclear

FIN

Gentica Humana 50