Bioqumica

Docente : Ing. Karina Alvarado Prez

Curso : Bioqumica

Alumnos : Gmez Santos, Luis Alberto

Trujillo Roncagliolo, Karen
Ureta Castro, Lucia

Ciclo : III

Horario : Jueves 2.00 3.30

Hunuco Per
2012

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I. INTRODUCCIN
Ademas de los compuestos naturales susceptibles de biodegradacion, la industria sintetiza miles
de compuestos quimicos, denominados xenobioticos que poseen una gran capasidad de
contaminacion ambiental dado que, al contrario que los compuestos naturales, presentan una
mayor o menor resistencia a la biodegradacion (recalcitrancial). Entre los compuestos
xenobioticos, los mas importantes desde el punto de vista cuantitativo son los derivados
aromaticos clorados y nidrados, base de industrias de fabricacion de explovos, colorantes,
herbicidas, plagicidas, disolventes, aislantes y todo tipo de productos manufacturados de gran
interes industrial. No obstante, algunos compuestos clorados y nitrados son de origen natural y
por esto no de extraar que existan rutas biodegradativas mas o menos elaboradas para este
tipo de compuestos xenobioticos.

II. OBJETIVO

Objetivo General:

Objetivos Especficos:

III. RESUMEN

IV. CONTENIDO

XENOBIOTICO

La palabra xenobitico deriva del griego xeno (extrao) y el sufijo bio (vida). Xenobitico es todo
compuesto qumico que no forme parte de la composicin de los organismos vivos.

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Suelen ser contaminantes (concentracin en exceso) de determinados ambientes y

Generalmente ejercen algn tipo de efecto sobre los seres vivos, aunque no tengan toxicidad
aguda.

TXICO: Toda sustancia qumica que, incorporada al organismo vivo a determinada

concentracin, produce en virtud de su estructura qumica a travs de mecanismos
fisicoqumicos y bioqumicos, alteraciones de la fisicoqumica celular, transitorias o
permanentes, siempre incompatibles con la salud y en algunos casos con la vida

Sustancias exgenas al organismo: XENOBITICOS

Sustancias producidas por seres vivos: TOXINAS

Los txicos son xenobioticos que producen efectos adversos en organismos vivos. Existe
un campo de estudio diferente; denominado toxinologia, que estudia el efecto de las
toxinas .

Xenobioticos Orgnicos:

TIPO
ALIFTICOS ( HALOGENADOS)
ALIFTICOS (NO HALOGENADOS)
AROMTICOS ( HALOGENADOS)
POLICCLICOS ( NO HALOGENADOS)
POLICCLICOS ( HALOGENADOS)
PESTICIDAS
EJEMPLOS
TRICLOROETANO, TRICLOROMETANO
ACILONITRILO, TOLUENO, BENCENO
PENTACLOROFENOL, CLOROBENCENO
NAFTALENO, BENZOPIRENO
BIFENILO POLICLORADOS(PCBs)
DDT, 2,3 D dieldrin

Xenobioticos Inorgnicos:

ENTRE LOS METALES TXICOS A ALTA CONCENTRACIN SE INCLUYE:

As, B, Cd, Cr, Cu, Pb, Mo, Ni, Se, Zn, Hg
LOS MICROORGANISMOS POSEEN LA CAPACIDAD DE TRANSFORMAR
ELEMENTOS MINERALES, POR EJEMPLO:

al usarlos como fuente de energa: Fe++ a Fe+++ por Thiobacillus.

Aceptor de electrones: Mn+4 a Mn+2 por Bacillus.

MEDIO AMBIENTE:
En el caso de la toxicologa ambiental el medio ambiente se describe en funcin de
los medios que contienen los txicos.

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Coeficiente de reparto Octano agua:

El coeficiente de reparto octanol-agua(KOW ) de una sustancia, tambin llamado coeficiente de
particin (POW), es el cociente o razn entre las concentraciones de esa sustancia en
una mezcla bifsica formada por dos disolventes inmiscibles en equilibrio: n-octanol y agua. Ese
coeficiente mide, pues, la solubilidad diferencial de unsoluto en esos dos disolventes. Se ha
elegido el n-octanol por ser un compuesto orgnico que simula bien el material lipdico de
la biota, o en partculas y sedimentos orgnicos. Este coeficiente simula bien el
carcter hidrfobo de una sustancia o la afinidad hacia los lpidos de una sustancia disuelta en
agua.

Dnde:

c es la concentracin de ese soluto en n-octanol y, anlogamente es la

concentracin en agua de esa misma sustancia. En el caso de solutos ionizables, slo se
considera la concentracin de sustancia sin disociar (cido o base libre), usando para ello el
tampn adecuado, con un pH inferior al pK en el caso de los cidos, o con un pH superior al
pK en el caso de las bases.

El valor de KOW de una sustancia est relacionado con su capacidad de adsorcin o su potencial
de bioconcentracin en tejidos grasos.1

Un valor bajo de KOW indica la probable movilidad y transporte de ese material por su buena
solubilidad, y fcil metabolizacin y biodegradacin, es decir, hay que esperar una
escasa bioacumulacin.

Por el contrario, un valor alto de KOW indica posible adsorcin en tejidos grasos, suelo y
sedimentos.Por tanto, es probable la bioconcentracin o bioacumulacin. Su escasa movilidad
favorece la toxicidad de estas sustancias.

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BIODEGRADACIN DE LOS COMPUESTOS XENOBIOTICOS

La biodegradacion de compuestos aromaicos clorados ha recibido gran atencion por parte de la

comunidad cientifica devido a su especial toxisidad. Ello se debe a que, ademas de sus efectos
directos deletreos sobre las estructutas biologicas (menbranas), algunos de ellos actuan como
hormonas (xenohormonas))(Fig. 15.1). este hecho ha provocado que los compuestos aromaticos
clorados se hallen en el ojo del huracan de la lucha contra la contaminacion quimica. Asi los
policlorobifenilos (PCB) se han relacionado con problemas de infertilidad,con el desarrolllo de
algunos tipos de tumores y con un desarrollo inadecuado del sistema nervioso cntral.

Como puede observarse en la figura 15.1, los PCB y las dioxinas y foranos clorados tienen cierta
semejanza con algunas hormonas como el estradiol, pero en la mayora de los casos no se
conoce exactamente a qu nivel actan.

Como pauta general, y como se sealaba en el captulo 14, cabe que las rutas degradativas de
todos estos compuestos forman un embudo metablico que converge en los clorocatecoles (Fig.
15.2).

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Este tipo de compuesto existe normalmente en forma de mezclas, y eso es lo que se quiere
resaltar en la figura 15.2 al no adjudicar una posicin concreta a los cloros. La dioxina ( sin
cloros) s una molcula que apenas se encuentra en la naturaleza, mientras que el dibenzofurano
y el bifenilo son compuestos naturales. Ello hace que las dioxinas cloradas sean doblemente
xenobioticas, por su estructura y por contener cloro, mientras que los clorobenzofuranos y
clorobifeniles lo son solo por tener cloro.

Otra diferencia que cabe destacar es que mientras que los PCB se produjeron intencionalmente
en grandes cantidades por sus aplicaciones industriales (vase ms adelante), tanto dioxinas
como dibenzofuranos clorados se generan accidentalmente

Como cuantitativamente son ms importantes, los PCB se tratarn en ltimo lugar junto con la
degradacin de clorocatecoles, mientras que la degradacin de dioxinas y dibenzifuranos
clorados a clorocatecoles se tratara de manera conjunta.

BIODEGRADACIN DE DIOXINAS Y DIBENZOFURANOS

ORIGEN Y TOXICIDAD

El origen de estos compuestos es variado y aunque las dioxinas se forman en pequeas

cantidades en los volcanes, los incebdios y en algunos procesos de PCB en la grasa de ballenas,
focas, pinginos, etc. Ello demuestra claramente que la contaminacin viaja a travs de la
cadena alimenticia y se acumula en los superpredadores.

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Todo lo anteriormente dicho no pasara de ser preocupante si los PCB no fuesen txicos. La
exposicin a PCB provoca cuadros de toxicidad aguda que afectan principalmente al sistema
nervioso central, rin e hgado aunque sin dudad el efecto ms llamativo es su interferencia
con el sistema endocrino, tal y como se indic al principio del captulo. Por lo anteriormente
expuesto, la fabricacin de PCB est prohibida, en la mayora de los pases desarrollados. En la
CE no solo est prohibida su fabricacin, sino que los PCB inventariados deben ser eliminados
antes del ao 2010.

FORMAS DE ELIMINACON DE LOS PCB

Incineracin

Los PCB pueden ser incinerados, pero en instalaciones especialmente equipadas para que la
temperatura sea de 1.200C y con un tiempo de residencia de, al menos, 2 segundos. Ello hace
que la eliminacin de LOS PCB de los transformadores es desuso sea un proceso relativamente
costoso. Hay que aadir que en Espaa no existen instalaciones autorizadas. Cuando la
contaminacin se encuentra en el suelo, la incineracin resulta inviable y hay que recurrir a
procesos de inmivilizacion o de biodegradacin.

BIODEGRADACIN

Se han descrito gran variedad de microorganismos capaces de degradar PCB. Sin embargo, no se
sabe de ningn proceso que concluya con su mineralizacin total. Entre los microorganismos
han recibido especial inters las bacterias, ya que degradan una gran variedad de congneres y
son susceptibles de ser manipuladas genticamente con mayor facilidad que los eucariotas.
Tambin se han descrito hongos que transforman PCB.

A) BIODEGRADACION DE PCB POR BACTERIAS. PASOS LIMITANTES

Las contaminaciones accidentales del medio ambiente con PCB han permitido detectar
la presencia de microorganismos, fundamentalmente bacterias, capaces e
biodegradables. La estrategia comn para el aislamiento de bacterias capaces de
degradar PCB consiste en el enriquecimiento bacteriano a partir de suelos contaminados
usando bifenilo, un sustrato natural anlogo no toxico, como nica fuente de carbono y
energa. Ello ha permitido el aislamiento de gran variedad de bacterias capaces de
degradar PCB. Hay que adelantar que hasta el momento no se han encontrado ninguna
bacteria capaz de mineralizar todos los PCB. Para entender donde se encuentran, los
pasos limitantes que impiden su mineralizacin vase primero la ruta metablica por la
que las bacterias degrada el bifenilo (Fig. 15.5). El bifenilo es un compuesto natural
fcilmente degradado por diversas bacterias en condiciones aerbicas. Con ligeras
modificaciones, todas las bacterias estudiadas hasta la fecha degradan el bifenilo
siguiendo una estrategia comn que se puede dividir en dos procesos:
1) Oxidacin de bifenilo hasta benzoato con produccin de un derivado de 5 tomos
de carbono que se transforma en acetaldehdo y piruvato y
2) Oxidacin den benzoato hasta piruvato y acetaldehdo. Por analoga con la ruta
degradativa de tolueno, a la primera serie de reacciones de la denominada ruta
superior y a la segunda, ruta inferior.

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Dicha separacin no es solo convencional, ya que ambas rutas se suelen encontrar en dos
unidades transcripciones diferentes. Las mismas enzimas responsables de la degradacin del
bifenilo son las que atacan a los PCB, pero existen varios pasos limitantes. El primero es el grado
de cloracin. Cuantos ms cloros tenga el anillo aromtico, ms difcil se hace el ataque
electrofilico del oxgeno que, adems esta desfavorecido por impedimentos estricos. La
solucin de este problema puede ser, al igual qu en el caso de las dioxinas policloradas, en un
tratamiento microbiolgico del residuo en condiciones anaerbicas. Dicho trataminto se ha
mostrado muy eficaz en la descoloracin de PCB, con el nico inconvnient de que es muy lento.
Una solucin alternativa seria disear un pretratamiento quimicoreductivo. En cualquier caso,
una vez reducido el contenido en cloro, el residuo podra tratarse en condiciones anaerbicas
con las bacterias adecuadas para su completa destruccin.

Como se ha dicho anteriormente las bacterias degradan PCB usando las mismas enzimas
que catalizan la degradacin de bifenilo. Por tanto, segn el esquema de la figura 15.5,
la degradacin de PCB por bacterias conduce a la formacin de clorobenzoatos y un
derivado clorado de 5C. De la degradacin de este ltimo se sabe muy, pero por el

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contrario, se tiene constancia de que la mayora de las bacterias que degradan PCB no
degrada clorobenzoatos. Hay casos descritos en los que se produce descoloracin en la
ruta superior. As la relacin catalizada por la bifenilo dioxigenasa de Pseudomonas SP.
LB400 elimina el cloro en la posicin 2- de algunos PCB (Fig. 15.6).

B) DE LOS XENOBIOTICOS A LOS ANTIBIOTICOS

Al realizar los experimentos de co-inoculacion y resulatar fallidos se lleg a la conclusin
de que las bacterias del suelo deban producir un metabolito toxico a partir de 4-
clorobenzoato que envenena todo el sistema. Se ha demostrado que dicho
metabolito es la protoanmonina, un antibitico de origen vegetal que se produce por
una serie de reacciones catalizadas por las enzimas de la ruta del 3-oxoadipato (Fig.
15.10). La formacin de este antibitico es probablemente la razn por la que la
degradacin de PCB en el suelo no se acelera con la inoculacin de bacterias.

El uso de bacterias modificadas genticamente, y organismos en general, genera una

gran polmica. Por ello se han construido circuitos genticos que impiden la
proliferacin de la bacteria una vez que ha desaparecido la contaminacin (contencin
biolgica) y transferencia horizontal de plsmidos que contengan quimeras (contencin
gentica). Como dichos sistemas se han construido utilizando los elementos reguladores
del plsmidos TOL.

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LAS BACTERIAS COMO INGENIEROS METABLICOS: EVOLUCIN NATURAL DE LAS RUTAS

CATABLICAS
EVOLUCIN DE RUTAS METABLICAS POR RECLUTAMIENTO DE ENZIMAS
Las rutas metablicas naturales han evolucionado a lo largo de millones de aos
mediante mecanismos diversos, entre los que se incluye el reclutamiento de enzimas
preexistentes, que, mediante mutaciones al azar, han ido perfeccionando su capacidad
cataltica hacia nuevos sustratos. Para mejorar la eficacia del proceso, a lo largo de
periodos de tiempo han aparecido mecanismos de control basados en la modificacin
de la expresin gentica y en la interaccin entre metabolitos y protenas. La
degradacin de tolueno es un claro ejemplo de un proceso catablico bien
evolucionado, dotado de alta eficacia cataltica y un sofisticado sistema de control.
Por el contrario, los compuestos xenobioticos llevan poco tiempo en contacto con los
seres vivos y no ha habido tiempo material para la evolucin de las rutas catablicas
correspondientes. Sin embargo, la versatilidad de las bacterias les ha permitido
sobrevivir a la presencia de compuestos toxicosgracias al metabolismo y a la
construccin de un tipo de ruta degradativa poco eficaz desde el punto de vista catlitico
o regulador, pero muy efectiva a la hora de eliminar compuestos txicos. Un ejemplo de
estas rutas improvisadas es la del pentaclorofenol.

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V. CONCLUSIONES

VI. BIBLIOGRAFIA

Libros:

Robert K, Murray; Peter A. Mayes; Darul K. Granner. Bioquimica de

Harper. Manuel Moderno 15 edicin Mexico D. F. pp 18 19.
Dickson. Quimica: Enfoque Ecologico. Limusa 2009. Pp 199-203.
Farrell Shaw y Campbell Mary. Bioquimica. Thomson 4ta Edicion. Pp
34-45

Pginas Web:

http://www2.uah.es/tejedor_bio/bioquimica_ambiental/T2_inicio.pd
f

VII. ANEXOS

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