Guía Práctica de Evaluación Genética Animal Con VirtualBlup

Gua Prctica de
Evaluacin
Gentica
Animal
Con
Gua Prctica de
Evaluacin
Gentica
Animal
Con
Rubn Muoz Flores Carmen Gonzlez Verdejo
Ingeniero Agrnomo Mdico Veterinario

M.Sc. Mejoramiento Gentico Animal. Esp. Gentica Molecular y Biologa Forense.
Asesor Tcnico y Administrador en Servicios Colaborador en Servicios Informticos y

Informticos y Tecnologas Web, E.I.R.L. Tecnologas Web, E.I.R.L.
Villarrica-Chile. Madrid Espaa.

Gua Prctica de
Evaluacin Gentica Animal
con VirtualBlup
Versin digital
Registro de Propiedad Intelectual N 263.561
Villarrica, Chile
Marzo de 2016.
Servicios Informticos y Tecnologas Web, E.I.R.L.

Julio Zegers N973. Villarrica. Chile
http://www.virtualblup.cl/
Autores:
Rubn Muoz Flores, Ingeniero Agrnomo, M.Sc.
Carmen Gonzlez Verdejo, Mdico Veterinario.
Se permite la reproduccin parcial de la informacin aqu contenida,

siempre y cuando se cite esta publicacin como fuente.
ndice
Introduccin 05
1.1.- Datos de produccin 08
1 Evaluacin Gentica
Animal
1.2.- Registros genealgicos
1.3.- Parmetros genticos
09
10
2.1.- Archivo de datos productivos 18

2.2.- Archivo de genealoga 19
2.3.- Parmetros genticos 19
2.4.- Generacin de archivos 19
2.5.- Evaluacin gentica 21
2 Modelo Animal
Simple
2.6.- Ajuste del modelo
2.7.- Factores fijos
26
27
2.8.- Valores genticos estimados (VGE) 28
2.9.- Utilizacin de los valores genticos 30
2.10.- Coeficiente de consanguinidad 31

3 Modelo Animal de
Repetibilidad 3.6.- Ajuste del modelo
40
41
3.10.- Efecto del ambiente permanente 45
Modelo Animal con
4 Efectos Ambientales
Comunes
4.5.- Evaluacin gentica
4.6.- Ajuste del modelo
50
54
55
4.10.- Efecto del ambiente comn 58

5
Modelo Animal con
Efectos Maternos 5.6.- Ajuste del modelo 66
5.7.- Factores fijos 67
5.10.- Efecto del ambiente permanente 71
materno
Mrito econmico 73
Glosario 75
Literatura consultada 77
Introduccin
El presente documento tiene como objetivo guiar y orientar a las personas que
deseen llevar a cabo el proceso de evaluacin gentica con VirtualBlup, principalmente a
los que quieran iniciarse en el tema o los que trabajan en el mbito aplicado del
mejoramiento gentico animal. Por esta razn no se explican los fundamentos estadsticos
de la metodologa ni se detallan las asunciones y frmulas matemticas que la sustentan.
Se desarrollan paso a paso cuatro evaluaciones genticas con pequeos conjuntos

de datos, a modo de ejemplo, para conseguir tres cosas: ilustrar la forma de proceder con el
software, explicar e interpretar los principales archivos de resultados y mostrar la utilidad
prctica de esta informacin.
Los ejemplos se desarrollan sobre caracteres conocidos y que rutinariamente se

evalan en el ganado. Aunque fueron elegidos de forma arbitraria, stos son representativos
del modelo de evaluacin en el que figuran y extrapolables a otras especies animales.
Los conjuntos de datos son muy pequeos pero ilustrativos, de tal forma que la nica
diferencia que exista con una situacin real sea la cantidad de registros contenidos en los
archivos.
Aunque no es el objetivo central del documento, se hace mencin al proceso de

seleccin utilizando los valores genticos estimados de los ejemplos y tambin en el
apartado de mrito econmico, cuando se selecciona por varios caracteres.
La presente gua es un complemento a los Videotutoriales que VirtualBlup tiene en

su canal de YouTube y en los que se explican con detalle las dems opciones y
caractersticas del software. Esperamos que tanto stos como el presente documento sean
de ayuda para el usuario.
Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

5
1
1
La evaluacin gentica animal es el proceso por el cual se predice el valor gentico de los
individuos de una poblacin para una o varias caractersticas de inters econmico.
El objetivo es obtener una medicin confiable del potencial gentico de los animales, que
permita al ganadero o profesional competente, identificar los mejores individuos y
seleccionarlos como reproductores para que transmitan a su descendencia los genes
favorables para produccin.
Existen varios mtodos de evaluacin gentica en produccin animal pero el ms utilizado,

gracias a sus bondades estadsticas, es el BLUP o mejor prediccin lineal insesgada (de
sus siglas en ingls Best Linear Unbiased Prediction). VirtualBlup, como su nombre lo
indica, utiliza dicha metodologa en su algoritmo de clculo.
Para llevar a cabo el proceso de evaluacin gentica son necesarias tres fuentes de
informacin, las que se describen a continuacin.
1.1.- DATOS DE PRODUCCIN
Son los registros de produccin de los animales. Estos deben figurar en un archivo junto con
informacin de las circunstancias concretas en las que tuvo lugar cada dato productivo.
59
Por ejemplo, si se desea realizar una evaluacin gentica para el carcter peso al destete
en ganado bovino de carne se deber incluir, adems del dato de peso, el sexo del individuo
ya que normalmente los machos suelen pesar ms que las hembras. Si no incluysemos
ese factor sexo los machos apareceran sistemticamente mejor valorados que las
hembras. A estas variables que influyen de forma evidente en la produccin se les denomina
Factores Fijos.
Mientras ms factores fijos se incluyan en el anlisis, mejor ya que se eliminar el efecto

confundidor que estos tienen sobre el valor gentico de los individuos.
Un ejemplo de archivo de datos se muestra la Figura 1. Contiene once filas y cinco

columnas. Cada lnea o fila corresponde al registro de un individuo y cada columna identifica
lo que compone cada registro. Las tres primeras columnas contienen los factores fijos
REBAO, SEXO y EDAD respectivamente, la cuarta los datos de peso al destete y la
quinta columna, las correspondientes identificaciones de los individuos.
Figura 1. Archivo de datos productivos
8 Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

1
OBSERVE QUE
Los factores fijos REBAO y SEXO presentan niveles que permiten clasificar los datos. As,
cada registro pertenecer a uno de los tres rebaos existentes y a uno de los dos sexos. Sin
embargo, para el factor EDAD no es posible hacer una clasificacin porque no existen niveles
sino un espectro continuo de valores. A este tipo de Factores, que son resultado de una
medicin, se les denomina covariables.
Qu relacin existe entre las covariables y el carcter?
Existe una relacin proporcional entre ambas, es decir, si vara una la otra tambin variar.
La relacin entre ambas puede ser directa o inversa. En el ejemplo anterior, la covariable
edad se relaciona directamente con el carcter ya que, a mayor edad, los individuos
presentarn mayores pesos al destete.
1.2.- REGISTROS GENEALGICOS
Se refieren a la correcta identificacin de los individuos y la de sus respectivos padres. Esta

informacin debe figurar en un archivo en el que deben existir tres columnas: una con las
identificaciones de los individuos, otra con la identificacin de los padres y otra con la
identificacin de las madres (Figura 2).
Generalmente el orden de aparicin de las columnas en los archivos de genealoga es

individuo padre madre, sin embargo, en VirtualBlup el orden de aparicin de estas
columnas no es importante.
Figura 2. Archivo de genealoga.

9
1
OBSERVE QUE
Los primeros cuatro individuos constituyen lo que se denomina poblacin base. Son en conjunto la
generacin parental, es decir, la que dio origen a los individuos de las siguientes generaciones.
Es un requisito fundamental para desarrollar el BLUP asumir que no se conocen los padres de
estos individuos. Por ello, la casilla de identificacin de sus padres contiene un 0.
Es importante resaltar que, para efectos de realizar una evaluacin gentica mediante
BLUP, deben existir individuos con padres desconocidos en el archivo de genealoga.
Por otro lado, en la Figura 2, los individuos destacados con fondo gris son los que cuentan
con dato productivo y por tanto se encuentran tambin en tal archivo.
Todos los individuos que figuren en el archivo de datos deben figurar obligatoriamente
tambin en el archivo de genealoga. Por el contrario, puede haber individuos en Genealoga
que no cuenten con dato productivo y por tanto no aparecer en datos.
1.3.- PARMETROS GENTICOS:
Los parmetros genticos son indicadores poblacionales de la caracterstica a evaluar. El

ms importante es la Heredabilidad o ndice de herencia, la que se denota por h2.
2
La h es un coeficiente que indica la proporcin de las diferencias observadas en el carcter
que son de origen gentico, por ende puede tomar valores de entre 0 y 1.
Figura 3. Concepto de Heredabilidad.

1
Siguiendo con el ejemplo del peso al destete, una heredabilidad de 0. 27 nos indica que un
27% de las diferencias observadas entre los animales son de origen gentico y pueden
transmitirse a la descendencia.
Por lo tanto:
Si la heredabilidad es ALTA, las diferencias observadas entre animales son debidas

principalmente a los genes.
Si la heredabilidad es BAJA, las diferencias son debidas principalmente al

ambiente (en nuestro ejemplo al factor sexo, edad y rebao).
1.3.1.- Otros parmetros genticos son:
REPETIBILIDAD (r):
Indicador del grado de asociacin existente entre los registros repetidos de un mismo
carcter. Puede tomar valores entre 0 y 1.
CORRELACIN GENTICA (rxy):

Grado de asociacin entre los valores genticos de dos caracteres. En este texto nos
referiremos a la correlacin entre los efectos genticos directos y los efectos genticos
maternos. Puede tomar valores entre -1 y 1.
NDICE C2:
Medida de covariacin entre parientes causada por un ambiente comn. Puede tomar
valores entre 0 y 1.
HEREDABILIDAD MATERNA (h2m):

Proporcin de la variabilidad total que es de origen gentico materno. Puede tomar valores
entre 0 y 1.
Cmo saber cul o cules parmetros son necesarios en una evaluacin

gentica?
Como se mencion anteriormente la Heredabilidad es el parmetro ms importante por lo

que siempre ser requerida. Adicionalmente sern necesarios uno o ms parmetros en
funcin del modelo de evaluacin gentica a utilizar. Esto ltimo depender a su vez del
carcter que se desee evaluar. En la Tabla 1 se muestran los modelos de evaluacin
disponibles en VirtualBlup junto con los parmetros necesarios en cada uno de ellos.
Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup 11

1
Tabla 1. Modelos de evaluacin gentica disponibles en VirtualBlup y parmetros genticos
necesarios.
Escenario Modelo de Parmetros Algunos caracteres en los
evaluacin necesarios que se ajusta el modelo
Se cuenta con una Ganancia de peso vivo

medicin por individuo del
carcter a evaluar Peso al sacrificio
o Caractersticas de la canal
(peso, longitud, % cortes
El carcter se mide una Modelo animal Heredabilidad (h2) nobles, espesor de la
sola vez en la vida del simple grasa, grado de
individuo marmreo, rea del ojo de
bife, etc.)
y
Edad a la pubertad o al
no existen o no se desea primer parto, etc.
considerar efectos
maternos Circunferencia escrotal
Produccin de leche (Kg

de leche, grasa y protena)
Intervalo entre partos

Se cuenta con varias
2
mediciones por individuo Heredabilidad (h ) Tamao de camada
y Modelo animal de Peso del velln, dimetro

repetibilidad de la fibra, longitud de
No existen efectos fibra, etc.
Repetibilidad (r)
maternos
Resultados de carreras de
caballos
Produccin de huevos
Peso al nacimiento
Se cuenta con una
medicin por individuo. Peso al destete
Aplicable cuando el 2 Ganancia de peso

Heredabilidad (h )
individuo es parte de una Modelo animal con
camada. efectos ambientales N de crias
(Especies prolficas) comunes
C2 Vlido para especies
como porcino, cuye o
conejos
2
El carcter se mide a Heredabilidad (h ) Peso al nacimiento
edades tempranas en los
individuos Heredabilidad Peso al destete
2
materna (h m)
y Modelo animal con Ganancia de peso a
efectos maternos edades tempranas
Correlacin
Se cuenta con una
medicin por individuo gentica (rxy) Tiempo en lograr un
determinado peso al
2
C destete

1
Dnde puedo obtener estos parmetros genticos?
En estricto rigor deben ser calculados, ya que son especficos de cada poblacin. No
obstante pueden ser obtenidos tambin de estudios realizados en distintas especies.
En las tablas 2, 3, 4, 5 se muestran valores de parmetros genticos para distintos
caracteres, en distintas especies ganaderas.
Tabla 2. Parmetros genticos en el ganado bovino lechero.
Carcter h2 r
Produccin
Kg. de leche 0.20 0.40 0.40 0.50
Kg. de grasa 0.20 0.40 0.40 0.50
Kg. de protena 0.20 0.35 0.40 0.50
% de grasa en leche 0.30 0.60 0.40 0.70
% de protena en leche 0.40 0.70 0.50 0.80
Reproduccin
Intervalo entre partos 0.00 0.50 0.10 0.30
N de servicios por concepcin 0.00 0.05 0.03 0.10
Das abiertos 0.00 0.05 0.05 0.15
Tabla 3. Parmetros genticos en el ganado bovino de carne.
Carcter h2d h2m rdm / r C2

Produccin
Peso al nacimiento 0.20 0.30 0.01 0.15 (-0.40) (-0.80) 0.00 0.10
Peso al destete 0.20 0.40 0.10 0.15 (-0.25) (-0.90) 0.00 0.20
Ganancia de peso (crianza) 0.25 0.30 0.05 0.15 (-0.30) (-0.50) 0.05 0.30
Ganancia de peso a corral 0.35 0.45
Ganancia de peso a pastoreo 0.20 0.30
Peso a los 18 meses 0.45 0.55
Peso a la madurez 0.45 0.55
Peso al sacrificio 0.50 0.80
Reproduccin
N servicios por concepcin 0.00 0.05 0.03 0.10
Intervalo entre partos 0.00 0.10 0.02 0.20
Edad al primer parto 0.07 0.24
Edad a la pubertad 0.40
Circunferencia escrotal 0.50
Caractersticas de la canal
rea del ojo de bife 0.50 0.70
Terneza de la carne 0.50 0.60

13
1
Tabla 4. Parmetros genticos en el ganado porcino.
Carcter h2 r
Produccin
Ganancia de peso (post-destete) 0.25 0.50
Eficiencia alimenticia 0.15 0.50
Longitud de la canal 0.30 0.70
Espesor de la grasa dorsal 0.40 0.60
rea del Longisimus dorsi 0.20 0.60
Color de la carne 0.30 0.40
% de cortes magros 0.20 0.40
Reproduccin
Tamao de camada 0.05 0.15 0.10 0.25
Peso de la camada al nacimiento 0.10 0.20 0.15 0.30
Peso del lechn al nacer 0.05 0.10
N de lechones a los 21 das 0.10 0.15

N de lechones destetados 0.10 0.15
Tabla 5. Parmetros genticos en aves de postura.
Carcter h2 r
Produccin
Produccin de huevos por da 0.15 0.30
Peso del huevo 0.40 0.70 0.80 0.90
Peso corporal 0.30 0.50
Reproduccin
Fertilidad 0.05 0.15
Edad a la madurez sexual 0.30 0.40
Edad a la primera postura 0.20 0.40
Incubabilidad 0.05 0.20

1
Tabla 6. Parmetros genticos en el ganado ovino.
Carcter h2 r
Produccin
Peso al destete 0.20 0.40
Peso del Velln 0.30 0.60 0.50 0.60
Longitud de mecha 0.30 0.60 0.30 0.70
Dimetro de fibra 0.30 0.50 0.50 0.60
Cantidad de leche 0.20 0.35 0.40 0.50
Cantidad de grasa 0.15 0.35
Cantidad de protena 0.15 0.35
% de grasa en leche 0.10 0.50 0.10 0.60
% de protena en leche 0.15 0.55 0.30 0.70
Peso al nacimiento 0.30
Peso al destete 0.20 0.40
Peso a la madurez 0.40
Ganancia de peso (pos destete) 0.40
Reproduccin
Tamao de camada 0.05 0.15 0.10 0.30

15
2
Modelo Animal Simple
2 Modelo Animal Simple
El modelo animal simple se aplica cuando el carcter a evaluar se mide una sola vez en la
vida del animal o si solamente contamos con un registro por individuo. Ejemplos de estos
caracteres son el peso al momento del sacrificio, rendimiento de la canal, la ganancia de
peso, edad al primer parto, caracteres morfolgicos como la altura a la cruz, la
circunferencia escrotal o el permetro torcico, etc.
A continuacin se ilustrar una evaluacin gentica para el carcter Ganancia diaria de

peso en bovinos de carne considerando datos provenientes del periodo de recra del
ganado (etapa pos-destete), con animales bajo condiciones extensivas de pastoreo.
RECUERDE
Es necesario suministrar tres fuentes de informacin:

Datos de produccin,
Genealoga
Parmetros genticos
2.1.- ARCHIVO DE DATOS PRODUCTIVOS
La Figura 4 muestra el archivo de datos contenidos en una hoja de clculo Excel. Contiene
ocho columnas y diecisiete registros equivalentes a diecisiete animales. Incluye informacin
acerca del sexo de los individuos, la identificacin del rebao de origen y la estacin del ao
en la que se registr la ganancia de peso.
Figura 4. Archivo de datos productivos para el carcter ganancia diaria de peso en bovinos de carne.

2
2.2.- ARCHIVO DE GENEALOGA
El archivo de genealoga est compuesto por tres columnas y veinte registros equivalentes a
veinte animales (Figura 5). Los padres desconocidos estn identificados con un cero 0.
IMPORTANTE:
El usuario puede utilizar un cdigo

alfabtico, numrico o alfanumrico para
identificar los padres desconocidos.
Observe que la identificacin de los

individuos se encuentra en la tercera y
ltima columna.
2.3.- PARMETROS GENTICOS
Se utilizar una Heredabilidad de 0.51
2.4.- GENERACIN DE ARCHIVOS
Tanto el archivo de datos como el de genealoga se encuentran en una hoja de Microsoft

Excel. Por tanto, lo primero a realizar ser pasar estos dos archivos a formato de texto
(archivos .txt), que es como VirtualBlup los acepta.
Para generar los nuevos archivos

debe realizar lo siguiente:
- Dentro del archivo Excel ir

al men Archivo.
- Elegir la opcin Guardar

como.

19
2 Modelo Animal Simple
Se abrir un cuadro de dialogo para que seleccione la carpeta en la que desea guardar los
nuevos archivos.
- Seleccione Texto (delimitado

por tabulaciones) en el
recuadro Tipo del cuadro de
dilogo.
- Coloque un nombre al nuevo

archivo de datos y presione el
botn Guardar.
Tras guardar aparecer el siguiente aviso:
Presione Aceptar y contine.
Por ltimo, presione el botn S del nuevo recuadro.
Realizado los pasos previos habr conseguido guardar el archivo de datos en un archivo de
texto. Seguidamente, abra el archivo generado y elimine las cabeceras que contienen los
nombres de cada columna, como se muestra en la siguiente imagen.

2
Repita el mismo procedimiento para el archivo de Genealoga. Sus archivos resultantes
deben quedar como muestra la imagen de la Figura 6.
Figura 6. Archivo de datos y genealoga en ficheros de texto y sin cabeceras.
2.5.- EVALUACIN GENTICA
Ingrese a VirtualBlup con su nombre de usuario y contrasea. En la pgina inicial

seleccione la opcin realizar evaluacin gentica del recuadro correspondiente. 1
Aparecern dos nuevos recuadros, uno para indicar si existen grupos genticos en
genealoga y otro con los modelos de evaluacin gentica disponibles.

21
2
Seleccione NO en el recuadro de grupos genticos y Modelo animal simple en las
2 opciones de modelos. Luego presione Guardar
Contine a la pgina de archivos. En ella aparecern los recuadros para subir los archivos
de genealoga y de datos al servidor de VirtualBlup.
Busque sus archivos

presionando el botn
Examinar.
3
Una vez seleccionados
pulse Subir Archivo
para iniciar la subida.
IMPORTANTE:
Si sus archivos son muy pesados (superiores a 20 MB) la subida tardar tiempo en concretarse.
El tiempo de subida depender adems de factores como la conexin y velocidad de internet.
Especifique las variables contenidas en los archivos. Para ello presione Definir Variable del
4 recuadro correspondiente.
En genealoga seleccione la 1 columna para la variable individuo, la 2 para padre y la 3

para la variable madre. Coloque 0 en el recuadro ID de padres desconocidos. Guarde los
cambios.
Posteriormente defina las variables en el archivo de datos.
La 1 columna contiene las identificaciones de los individuos. Seleccinela y elija Animal en

el tipo de variable (Figura 7). Esta columna ser la conexin con el archivo de Genealoga.

2
Individuo Factores Fijos Carcter
Figura 7. Visor del archivo de datos con sus variables ingresadas.
Las columnas 2, 3 y 4 contienen los factores fijos SEXO, REBAO y ESTACIN DEL
AO respectivamente. Seleccione las columnas y especifique Factor Fijo en el tipo de
variable para cada una de ellas.
RECUERDE
Los Factores Fijos son aquellas circunstancias ambientales identificables que influyen
significativamente en la produccin. Pueden ser variables de tipo Clasificacin (Sexo, rebao,
ao, estacin, N de lactacin, etc.) o bien de tipo Continuo (Edad, das en lactacin, intervalo
entre partos, peso al nacimiento, etc.). Estas ltimas se denominan Covariables
En las primeras se pueden distinguir niveles, en las covariables NO porque son el resultado de
una medicin.
La 5 columna contiene los datos de peso vivo al inicio del periodo de recra. La 6 columna
contiene el peso vivo al final del periodo y la 7 columna contiene la duracin del periodo en
das. Estas columnas no se utilizarn porque son las que dieron origen al dato productivo de
inters o carcter que se encuentra en la 8 columna y que corresponde a la ganancia diaria
de peso en gramos.
Seleccione la 8 columna y especifique Carcter en el tipo de variable.
La frmula utilizada para obtener la ganancia diaria peso fue la siguiente:

23
2
( )
= [ ] 1000

Dnde:
GDP = Ganancia diaria de peso (gramos)

PVinicial = Peso vivo al inicio del periodo (Kilogramos)
PVfinal = Peso vivo al final del periodo (Kilogramos)
Das = Duracin del periodo (das)
En los recuadros de niveles de referencia se debe colocar un nmero entero de entre 0 y el

nmero mximo de niveles que contenga el factor fijo en cuestin. Esta especificacin se
debe realizar para que la metodologa pueda tener solucin.
Si las casillas se dejan vacas, el software asignar el nmero 1, lo que significa que las
estimaciones de los niveles de un determinado factor estarn referidas al primer nivel
encontrado por el software al leer los datos. Si el usuario ingresa el nmero 2, estarn
referidas al segundo nivel encontrado y as sucesivamente. Un 0 indica que no se harn
referencias.
Ingrese el nmero 1 en todos los factores fijos. Guarde los datos y contine a la pgina de
opciones.
En la pgina de opciones habr tres recuadros.

5 El primero de ellos le preguntar si desea
imprimir un archivo con los individuos
consanguneos.
Si elige la opcin SI se generar un archivo adicional con la identificacin de los animales
que presentan un coeficiente de consanguinidad mayor a 0 y el respectivo coeficiente.
Seleccione la opcin SI.
El segundo recuadro le preguntar si desea

incluir la media de la poblacin en el anlisis. Si
6 decide incluirla ser considerada como un factor
fijo adicional.
Es interesante incluir este factor cuando se desea conocer el promedio poblacional de un

carcter calculado con las bondades estadsticas de la metodologa BLUP. El valor estar
corregido tanto por los restantes factores fijos como por los valores genticos de los
individuos.
En este ejemplo se incluir la media en el modelo. Seleccione la opcin SI.

2
El tercer recuadro contiene valores por defecto
para los criterios de convergencia y nmero de 7
remuestreos del proceso iterativo. Mantenga los
valores que vienen por defecto. Si desea ms
informacin del significado y ajuste de estos vea
el tutorial de este LINK (minuto 03:58).
En este recuadro tambin se ingresarn los

parmetros genticos.
Seleccione la opcin parmetros genticos e

ingrese la heredabilidad del carcter, es decir,
0.51.
IMPORTANTE:
VirtualBlup considera el punto como separador decimal.
Guarde las opciones y contine a la pgina de ejecucin (Figura 8).
Figura 8. Pgina de ejecucin.
Presione Comenzar para iniciar el proceso. Una vez finalizado podr acceder a la pgina de
resultados. Esta pgina estar compuesta de dos bloques. El primero contiene los 8
resultados de la revisin previa de los archivos de genealoga y datos (con el fin de detectar
errores en ellos y corregirlos). El segundo bloque contiene los resultados del BLUP (Figura
9).

25
2
Figura 9. Bloque de archivos de resultados generados en la etapa del BLUP.
2.6.- AJUSTE DEL MODELO
Para comprobar que el BLUP se desarroll correctamente se debe revisar el coeficiente de

determinacin del modelo o R2. Este ndice se encuentra en el archivo Ajustes.txt (Figura
10).
Figura 10. Extracto del archivo Ajuste.txt.
El R2 de este anlisis fue de 0.9233 y nos indica lo siguiente:
Los factores fijos SEXO, REBAO y ESTACIN DEL AO ms la media general de

la poblacin y el factor animal explican, en su conjunto, un 92% de la variabilidad de
los datos.
Los factores antes mencionados tienen una influencia real sobre la ganancia diaria
de peso, es decir, son causa de variacin entre animales para la ganancia de peso.
Si se hubiese omitido alguno de los factores anteriores el R2 hubiese sido menor y por ende
peor estimacin de los valores genticos de los animales.

2
IMPORTANTE:
El R2 es un coeficiente que debe oscilar entre 0 y 1. Si obtiene un valor fuera de ese rango
los resultados son ERRONEOS. En tal caso debe revisar y cambiar los niveles de referencia de los
factores fijos y volver a realizar el anlisis.
2.7.- FACTORES FIJOS
En el archivo Fijos.txt se encuentran los valores estimados de los factores fijos (Figura 11).
Figura 11. Archivo Fijos.txt.
La interpretacin de estos valores es la diferencia entre niveles de un factor.
SEXO: Los machos manifiestan una ganancia diaria de peso vivo superior a la de las
hembras en 396.43 gramos.
REBAO: La ganancia diaria de peso vivo en el rebao TK5 es 62.89 gramos

superior a la del rebao AA01 y 47.14 gramos superior a la del rebao BX03.
ESTACIN DEL AO: En otoo la ganancia diaria de peso es mayor que en invierno
en 186 gramos. En primavera lo es en 531 gramos respecto al invierno.
IMPORTANTE:
Cuando se especifican niveles de referencia, en al menos un factor fijo, las soluciones obtenidas
para todos los factores son relativas, es decir, la interpretacin de los valores estimados ser la
diferencia entre los niveles de un factor en concreto.

27
2
2.7.1.- Cmo se interpreta la media general de la poblacin?
La media se debe interpretar de la siguiente manera:
Media + Nivel de Factor SEXO + Nivel de Factor REBAO + Nivel de Factor ESTACIN
DEL AO.
En el presente ejemplo:
El promedio general de ganancia diaria de peso en las Hembras del rebao TK5
en Primavera es de 756.18 + (-396.43) + 62.89 + 531.17 = 953.81 gramos al da
El promedio general de ganancia diaria de peso en los Machos del rebao TK5 en
Primavera es de 756.18 + 0.00 + 62.89 + 531.17 = 1350.24 gramos al da
Note que si hacemos la diferencia entre los valores anteriores, el resultado es igual a la
diferencia de los valores estimados para machos y hembras:
( 1350.24 grs 953.81 grs ) = ( 0.0000 grs 396.43 grs )
2.8.- VALORES GENTICOS ESTIMADOS (VGE)
Las estimaciones de los valores genticos se encuentran en el archivo Gentico.txt

(Figura 12) acompaados de sus indicadores de precisin.
2.8.1.- Qu significa el valor gentico?
El valor gentico representa,

en la misma unidad del
carcter, la superioridad o
inferioridad que tiene un
individuo respecto al
promedio de los individuos de
la poblacin base.
Se denomina valor gentico

porque esa superioridad o
inferioridad es el resultado de
la suma del efecto de los
muchos genes que puedan
estar relacionados con el
carcter.
Figura 12. Archivo Genetico.txt.

2
2.8.2.- Cmo interpretar el valor gentico?
Tomemos como ejemplo el individuo ANIM01. Obtuvo un valor gentico de -33.31, lo que
significa que ese animal tiene una ganancia diaria de peso de 33.31 gramos/da menos que
la ganancia promedio de individuos de la poblacin base.
Por el contrario, el individuo ANIM16, con un valor gentico positivo, tiene una ganancia
diaria de peso mayor que el promedio de los individuos de la poblacin base en 90.39
gramos/da.
Al margen de la interpretacin del valor gentico, stos toman sentido prctico cuando se
comparan entre s a fin de tomar decisiones de seleccin de los animales.
2.8.3.- Cul es el promedio de ganancia de peso de los individuos de la

poblacin base?
El promedio de los valores genticos de estos individuos es por definicin cero 0, valor que
sirve de referencia. Es por ello que en las soluciones aparecen individuos con valores
positivos y negativos significando esto nicamente que un individuo se encuentra por
encima o por debajo del promedio de la poblacin base.
En este ejemplo es difcil comprobar que el promedio de la poblacin base es 0 porque del
individuo ANIM06 solo se conoce un progenitor, su madre. Sin embargo, si ambos padres
de ANIM06 hubiesen sido desconocidos, el promedio de la poblacin base hubiese sido cero
0.
2.8.4.- Qu son y para qu sirven los indicadores de precisin?
Los indicadores de precisin nos dan una idea del grado de confianza que debemos
asignarle a los valores genticos. Recordemos que estos ltimos son una prediccin hecha
a partir de cierta informacin con la que contbamos (datos productivos, genealoga y
parmetros genticos) y, como toda prediccin, tiene un error de medicin asociado.
Los indicadores que VirtualBlup suministra son la fiabilidad (r2), la precisin (r) y el error
estndar de la prediccin (SEP).
Tanto la fiabilidad como la precisin miden el grado de asociacin entre el verdadero valor
gentico y el predicho por el BLUP. Ambos pueden tomar valores entre 0 y 1. Cuanto ms
cercano a 1, ms confiable es el valor gentico obtenido.
Fiabilidad y precisin se diferencian en que esta ltima es la raz cuadrada de la primera.

La utilizacin de uno u otro indicador queda a criterio del profesional, no obstante, la
precisin es mucho ms utilizada como indicador de confiabilidad y comnmente es
llamada repetibilidad en los catlogos de sementales (no confundir con la repetibilidad
como parmetro gentico).
El error estndar de la prediccin (tambin llamado cambio posible) indica el cambio que
podra experimentar el valor gentico en una futura evaluacin. Se puede utilizar para
expresar un intervalo de confianza al 68%, es decir, valor gentico (VG) SEP.

29
2
En el ejemplo, el animal ANIM18 es el que tiene un valor gentico ms confiable, con una
repetibilidad de 77.8% y un valor gentico que puede oscilar entre -19.32 y -10.35 Kg (-
14.832 4.48031).
2.9.- UTILIZACIN DE LOS VALORES GENTICOS
Los valores genticos, junto con los indicadores de precisin, son utilizados para tomar
decisiones de seleccin, es decir, para identificar individuos genticamente superiores y
dejar descendencia de ellos. Representan una herramienta til a la hora de elegir la
reposicin, eliminar reproductores, comprar, vender, etc.
Al igual que en otras especies ganaderas, en el bovino de carne se evalan varios

caracteres de importancia econmica. De esta forma surge la necesidad de balancear el
mrito de cada carcter de acuerdo a algn criterio. Para ello se pueden utilizar los ndices
de mrito econmico, que combinan los valores genticos con ponderaciones econmicas, o
bien establecer niveles independientes de rechazo/aceptacin para cada carcter. Al
respecto, un punto importante a considerar es que mientras ms caracteres sean
considerados en el proceso de seleccin menor ser la respuesta que se conseguir en
cada uno de ellos, haciendo ms lento el progreso gentico.
En el presente ejemplo se utilizarn nicamente los valores genticos de ganancia de peso

como criterio de seleccin e efectos de ilustrar la utilidad e importancia de stos al momento
de comparar los animales.
En nuestro ejemplo se pueden plantear
las siguientes interrogantes:
- Cul es el mejor toro?

- Qu toro NO est contribuyendo
a mejorar la ganancia de peso?
- Qu vacas se deberan
reemplazar?
- Qu novillos o vaquillas podran
ser futuros reproductores?
En primer lugar analizaremos los toros. La

tabla 6 muestra la ordenacin de los toros
por su valor gentico en orden
decreciente.
El mejor toro es el ANIM04 y el peor el ANIM01. De este ltimo no tendra sentido dejar
descendencia si nuestro inters es ir aumentando la ganancia de peso ya que es el que
tiene peor potencial para este carcter.
Tabla 6. Valores genticos, precisin y DEP de los toros

2
En la tabla anterior se suministra una nueva variable, la DEP o Diferencia Esperada de la
Progenie. Este indicador es el que comnmente se suele publicar en los catlogos de
sementales bovinos. Se calculan a partir del valor gentico y corresponden a la mitad de
ste. Representan la performance esperada en la progenie del toro. Al igual que ocurre con
el valor gentico, un valor DEP por s solo no aporta mucha informacin pero si tiene
significado cuando se compara con otra DEP. De esta forma, si comparamos la DEP del
ANIM04 de 27.38 con la del ANIM09 de -16.65, podemos esperar que la descendencia del
primer toro tenga en promedio 44.03 gramos ms de ganancia de peso que las del segundo
toro (27.39 (-16.65) = 44.03).
De los machos que no son padres, ANIM16 es el que presenta mayor mrito y podra ser
candidato a futuro reproductor (Tabla 7). Si bien existen varios machos con valores
negativos, es necesario recalcar que esto no implica que un individuo sea malo per s, pero
si cuando se compara con otro que tiene un valor gentico mayor, como por ejemplo, los
individuos ANIM15 y ANIM18. Ambos tienen valores negativos pero si tuvisemos que
decidir entre ellos, ANIM15 tiene mayor mrito
Tabla 7. Valores genticos, precisin y DEP de los machos que no son padres
En el caso de las hembras, interesa identificar posibles reemplazos y verificar el potencial

gentico de las actuales madres. En este sentido, ANIM08 y ANIM03 que han sido madres,
son las peor ranqueadas y podra pensarse en reemplazarlas por ANIM17 y ANIM12 que
son las mejor posicionadas en el ranking (Tabla 8).
Tabla 8. Valores genticos, precisin y DEP de las hembras.
2.10.- COEFICIENTE DE CONSANGUINIDAD
Se ha indicado al software que imprimiera un archivo con los individuos consanguneos. El

archivo generado se llama Consanguinidad.txt y muestra la identificacin de los individuos
consanguneos junto con el respectivo coeficiente (Figura 13).

31
2
Figura 13. Archivo Consanguinidad.txt.
En este ejemplo los individuos ANIM12, ANIM14, ANIM15, ANIM16 y ANIM18 son
consanguneos.
Es importante por una parte chequear si existen individuos consanguneos en el rebao (o

poblacin) y por otra evitar apareamientos entre parientes para evitar tener descendencia
consanguinea.
VirtualBlup cuenta con un procedimiento especialmente ideado para calcular el parentesco

entre de parejas de individuos. Con ello se podr identificar los que estn emparentados y
evitar el apareamiento entre estos. Para ms informacin acerca de esta opcin ver el
videotutorial del siguiente LINK.
IMPORTANTE:
La consanguinidad es la consecuencia de aparear individuos emparentados. Es una caracterstica

no deseable en produccin animal porque aumenta la probabilidad de que se expresen genes
recesivos indeseables. El efecto individual de esos genes es pequeo pero tomados todos en
conjunto pueden disminuir significativamente la performance productiva y sobre todo
reproductiva del ganado. Esto es lo que se conoce como depresin consangunea.

3
Modelo Animal de Repetibilidad
3 Modelo Animal de Repetibilidad
El modelo de repetibilidad o de medidas repetidas es aplicado cuando el carcter a evaluar

se mide varias veces en un individuo. Un tpico carcter en el que se ajusta este modelo es
la produccin de leche. Ya sea una vaca, oveja o cabra, la produccin de leche de estas
puede ser medida varias veces, tantas como lactaciones hayan tenido en su vida productiva.
Otros caracteres en los que se podra utilizar son el intervalo entre partos, el tamao de
camada, el peso del velln, el dimetro de la fibra, la produccin de huevos en gallinas o los
resultados de carreras de caballos, entre otros.
A continuacin se ilustrar una evaluacin gentica para el carcter Produccin de leche

en bovinos. Se asumir que los datos provienen de un rebao explotado en condiciones
extensivas con la pradera como principal fuente de alimentacin.
RECUERDE

Datos de produccin
Genealoga
Parmetros genticos
cuatro columnas y dieciocho registros provenientes de diez vacas. Incluye informacin
acerca del nmero de lactacin y la poca de parto de las lactaciones.
Figura 14. Archivo de datos productivos para el carcter ganancia produccin de leche en bovinos.
Observe que, a diferencia del modelo animal simple, este archivo de datos cuenta con uno o
ms registros de produccin por animal.

3
El archivo de genealoga est compuesto por tres columnas y quince registros equivalentes
a quince animales (Figura 15). Los padres desconocidos estn identificados con un cero 0.
IMPORTANTE:

Se utilizar una Heredabilidad de 0.25. Adicionalmente, para que el modelo considere

todos los registros de un individuo, se debe suministrar la Repetibilidad, que en este
ejemplo ser de 0.29.

(archivos .txt), que es como VirtualBlup los acepta. Realice la conversin de los archivos
siguiendo el ejemplo visto en el Modelo Animal Simple en la pgina 19.

seleccione la opcin realizar evaluacin gentica del recuadro correspondiente. 1

35
Seleccione NO en el recuadro de grupos genticos y Modelo animal con efecto ambiental

2 permanente en las opciones de modelos. Luego presione Guardar.
Contine a la pgina de archivos. En ella aparecern los recuadros para subir los archivos
de genealoga y de datos al servidor de VirtualBlup.
Busque sus archivos

presionando el botn
Examinar.
3
pulse Subir Archivo
para iniciarla subida.
IMPORTANTE:
Si sus archivos son muy pesados (superiores a 20 MB) la subida tardar tiempo en concretarse. El
tiempo de subida depender, entre otros factores, de la conexin y velocidad de internet.
4 Especifique las variables contenidas en los archivos. Para ello presione Definir Variable en
el recuadro correspondiente.

3
En Genealoga, asigne la 1 columna para la variable individuo, la 2 para padre y la 3 para
la variable madre. Coloque 0 en el recuadro ID de padres desconocidos. Guarde los
cambios.
Posteriormente defina las variables del archivo de datos. Seleccione las cuatro columnas
que contiene y especifique el tipo de variable que representa cada una de ellas (Figura 16).
La 1 columna contiene las identificaciones de los individuos. Seleccione Animal en el tipo

de variable. Esta columna ser la conexin con el archivo de Genealoga.
Las columnas 2 y 3 contienen los factores fijos a incluir en el anlisis, NMERO DE

LACTACIN y POCA DE PARTO respectivamente. Seleccione Factor Fijo para ambas
en la casilla tipo de variable.
RECUERDE
una medicin.
La 4 columna contiene los datos de produccin de leche por lactacin estandarizada a 305
das. Seleccione Carcter en el tipo de variable.

37
Factores
Individuo Fijos Carcter
En los recuadros de niveles de referencia para los factores fijos se debe colocar un nmero
entero de entre 0 y el nmero mximo de niveles que contenga el factor en cuestin. Esta
especificacin se debe realizar para que la metodologa pueda tener solucin.
referencias.
Ingrese el nmero 1para el NMERO DE LACTACIN y el 0 para la POCA DE PARTO.

Guarde los datos y contine a la pgina de opciones.
En la pgina de opciones habr tres recuadros. El primero de ellos le preguntar si desea

imprimir un archivo con los individuos consanguneos. Si elige Si se generar un archivo
adicional con la identificacin de los animales que presentan un coeficiente de
consanguinidad mayor a 0 y el respectivo coeficiente.
En este ejemplo no se pedir un archivo con

los individuos consanguneos. Seleccione
5 NO. Si desea conocer la estructura de este
archivo y su interpretacin vea el ejemplo del
Modelo Animal Simple en la pgina 31.

3
incluir la media de la poblacin en el anlisis. 6
Si decide incluirla ser considerada como un
factor fijo adicional. Es interesante incluir este
factor cuando se desea conocer el promedio
poblacional de un carcter calculado con las bondades estadsticas de la metodologa
BLUP. El valor estar corregido tanto por los restantes factores fijos como por los valores
genticos de los individuos.
En este ejemplo no se incluir la media en el modelo. Seleccione NO.
El tercer recuadro contiene valores por

defecto para los criterios de convergencia y
nmero de remuestreos del proceso iterativo.
Mantenga los valores que vienen por defecto.
7
Si desea ms informacin del significado y
ajuste de estos vea el tutorial de este LINK
(minuto 03:58).

parmetros genticos.

ingrese la heredabilidad y repetibilidad del
carcter, es decir, 0.25 y 0.29
respectivamente.
IMPORTANTE:

39
resultados. Esta pgina estar compuesta de dos bloques. El primero contiene los
8 resultados de la revisin previa de los archivos de genealoga y datos (con el fin de detectar
18).

19).
Los factores fijos NMERO DE LACTACIN y POCA DE PARTO ms el factor

animal y las medidas repetidas de los individuos explican, en su conjunto, un 93% de
la variabilidad de los datos.

3
Los factores fijos antes mencionados tienen una influencia real sobre la produccin
de leche, es decir, generan diferencias entre animales para este carcter.
Si se hubiese omitido alguno de los factores anteriores el R2 hubiese sido menor y, por
ende, peor estimacin de los valores genticos de los animales.
IMPORTANTE:
3.7.1.- Nmero de lactacin:
Vacas de segunda lactacin producen 757.84 Kg ms de leche que las de primera

lactacin.
Vacas de tercera lactacin producen 1638.18 Kg ms de leche que las de primera

lactacin.
Vacas de tercera lactacin producen 880.33 Kg ms de leche que las de segunda

lactacin.
3.7.2.- poca de parto:
Vacas con partos en primavera producen por lactacin 8773.46 Kg ms de leche que las
con partos de otoo.

41
Nota: Eventualmente se podra decir que el promedio de produccin por lactancia de vacas
con partos de primavera es de 5201 kg y la de con partos de otoo de 4428 Kg, no obstante
lo correcto desde el punto de vista estadstico es hacer la diferencia debido a que se ha
especificado un nivel de referencia, independiente del factor en el que se haya realizado.
IMPORTANTE:
Los valores genticos de los animales se encuentran en el archivo Gentico.txt (Figura

21), acompaados de sus indicadores de precisin.
El valor gentico representa, en la misma unidad del carcter, la superioridad o inferioridad

que tiene un individuo respecto al promedio de los individuos de la poblacin base. Se
denomina valor gentico porque esa superioridad o inferioridad es el resultado de la suma
del efecto de los muchos genes que puedan estar relacionados con el carcter.

3
Tomemos como ejemplo el individuo ANIM01. Obtuvo un valor gentico de -60.51, lo que
significa que ese animal tiene una produccin de leche de 60.51 kg menos que el promedio
de individuos de la poblacin base.
Por el contrario el individuo ANIM13, con un valor gentico de +179.82, indica que tiene una
produccin de leche de 179.82 Kg ms que el promedio de los individuos de la poblacin
base.
Al margen de la interpretacin del valor gentico, stos toman sentido prctico cuando se
IMPORTANTE:
Observe que el individuo ANIM01 es un toro y por ende no cuenta con dato de produccin de leche,
no obstante su valor gentico est calculado a partir de la informacin de sus hijas.
Los indicadores de precisin nos dan una idea del grado de confianza que debemos
asignarle a los valores genticos. Recordemos que estos ltimos son una prediccin hecha
a partir de cierta informacin con la que contbamos (datos productivos, genealoga y
parmetros genticos) y, como toda prediccin, tiene un error de medicin asociado.
Los indicadores que VirtualBlup suministra son la fiabilidad (r2), la precisin (r) y el error
estndar de la prediccin (SEP).
Tanto la fiabilidad como la precisin miden el grado de asociacin entre el verdadero valor
gentico y el predicho por el BLUP. Ambos pueden tomar valores entre 0 y 1. Cuanto ms
cercano a 1, ms confiable es el valor gentico obtenido.
Fiabilidad y precisin se diferencian en que esta ltima es la raz cuadrada de la primera.

La utilizacin de uno u otro queda a criterio del profesional, no obstante, la precisin es
mucho ms utilizada como indicador de confiabilidad y comnmente es llamada
repetibilidad en los catlogos de sementales bovinos (no confundir con la repetibilidad
como parmetro gentico).
El error estndar de la prediccin (tambin llamado cambio posible) indica el cambio que
podra experimentar el valor gentico en una futura evaluacin. Se puede utilizar para
expresar un intervalo de confianza al 68%, es decir, valor gentico (VG) SEP.
En el ejemplo, el animal ANIM12 es el que tiene un valor gentico ms confiable con una
repetibilidad de 52.7% y un valor gentico que puede oscilar entre 71.0 y 79.5 Kg (75.289
4.2484).
decisiones de seleccin, es decir, para la identificacin de los individuos genticamente

43
superiores con el objetivo de dejar descendencia de ellos. En el ganado lechero se evalan

varios caracteres de importancia econmica. Los principales son cantidad de leche, de
grasa y protena, pero tambin son considerados los relativos a la fertilidad y funcionalidad,
por tanto el criterio final de seleccin generalmente es un ndice que combina los valores
genticos con los pesos econmicos de las caractersticas evaluadas (Ver mrito
econmico). No obstante en el presente ejemplo se asumir una situacin en la que las
decisiones de seleccin se basarn solamente sobre la produccin de leche, a efectos de
ilustrar la importancia del valor gentico como criterio de seleccin.
En un rebao lechero interesa identificar los mejores toros y las mejores vacas para
produccin de leche. En el caso de los toros, de los cuatro existentes, el mejor de ellos es,
sin duda, el ANIM10 ya que obtuvo el mayor valor gentico y, aunque tiene la menor
repetibilidad, el cambio posible (4.84491) en una futura valoracin no sera tan grande
como para dejarlo en una posicin ms baja del ranking (Figura 22).
Imagine que los cuatro toros de este ejemplo son de inseminacin artificial (valorados en el
extranjero). Ello significa que no estn en el predio. Aun as, se ha obtenido un valor
gentico a travs de la informacin de sus hijas. Esto supone que podemos identificar el
mejor toro en nuestras condiciones particulares de produccin y dejar al margen a los
que no lo son, con independencia de que lo sean en los catlogos de inseminacin
(Interaccin genotipo-ambiente).
140
120
100
80
60
VG (Kg de leche)
40
20
0
-20 ANIM01 ANIM02 ANIM04 ANIM10
-40
-60
-80
Figura 22. Valores genticos de los machos.
En el caso de las vacas, la que obtuvo mayor valor gentico fue la ANIM13 y la peor
valorada, la ANIM05 (Figura 23). Si solamente estuviramos seleccionando por produccin
de leche se debera priorizar dejar descendencia de la primera, la que procuraremos aparear
con los machos mejor valorados.
180
160
140
120
100
80
VG (Kg de leche)
60
40
20
0
-20 ANIM05 ANIM06 ANIM07 ANIM08 ANIM09 ANIM11 ANIM12 ANIM13 ANIM14 ANIM15
-40
-60
-80
-100
-120
-140
-160
Figura 23. Valores genticos de las hembras.

3
Es evidente que este ejemplo, en el que hay muy pocos animales y por tanto muy
emparentados, no sera prudente aparear la mejor vaca (ANIM05) con el mejor toro
(ANIM10), porque son hermanos completos, y su descendencia resultara ser consangunea.
Sin embargo, la lgica ser siempre aparear los machos mejor valorados con las hembras
mejor valoradas, evitando que estn emparentados.
Otro aspecto importante a destacar es que el BLUP predice valores genticos para todos los
individuos que figuren en genealoga, cuenten o no con dato productivo. De esta forma, si
hubiesen figurado animales ms jvenes en nuestro archivo de genealoga, como
terneros(as) o vaquillas, tambin se hubiese obtenido un valor gentico para ellos. Esto
supone un criterio adicional al momento de decidir la seleccin de vaquillas de reemplazo
y/o venta de animales jvenes.
3.10.- EFECTO DEL AMBIENTE PERMANENTE O MEDIDAS REPETIDAS
Las predicciones del ambiente permanente o medidas repetidas se encuentran en el archivo

Permanente.txt (Figura 24) y tambin, por ser una prediccin, vienen acompaadas de
indicadores de precisin.
Estos valores representan la influencia de aquellas causas ambientales que acompaan al

animal durante toda su vida productiva y que influyen en su produccin. En nuestro ejemplo
podra tratarse de la estructura de la ubre, la disposicin de los pezones o bien la nutricin
que tuvo una vaca en las primeras etapas de su desarrollo.
El efecto ambiental permanente no es trasmisible a la descendencia ya que es un efecto

ambiental por tanto no deber intervenir en las decisiones de seleccin. Sin embargo, la
suma del valor gentico de una vaca ms el efecto de su ambiente permanente es una
medida de su habilidad de produccin y puede constituir un criterio importante a
considerar a la hora de elegir las vacas de desecho.

45
Figura 24. Archivo Permanente.txt.
Para visualizar la utilidad prctica de estos valores calcularemos la habilidad de

produccin de la vaca ANIM07.
Habilidad de produccin = Valor gentico + Ambiente permanente
+7.112 = +11.369 + - 4.257
El potencial gentico de esta vaca se ve disminuido por el efecto de su ambiente

permanente, que es negativo. En otro animal puede suceder lo contrario, que posea un
efecto ambiental permanente positivo que refuerce su potencial gentico para producir
leche.
Si tuvisemos que elegir las vacas de desecho de este ejemplo, basndonos solamente en
este criterio, es evidente que las vacas ANIM05 y ANIM06 deberan ser reemplazadas ya
que poseen una habilidad de produccin negativa. No obstante, es importante resaltar que
la habilidad de produccin es solamente un criterio ms a considerar para la eleccin de las
vacas de desecho y vlido como herramienta para la toma de decisiones.

4
Modelo Animal con Efectos
Ambientales Comunes
4 Modelo Animal con Efectos Ambientales Comunes
El modelo con efectos ambientales comunes se aplica en especies prolficas en las que una
madre ejerce un efecto comn a sus cras haciendo que exista cierta similitud entre
miembros de una misma familia y diferencias entre estas. El carcter peso al destete en
ganado porcino es un buen ejemplo de esta situacin ya que los lechones de una misma
camada son criados juntos y comparten el ambiente comn que su madre les brinda.
Otros caracteres en los que se puede aplicar este modelo son el peso al nacimiento o la
ganancia de peso de los lechones durante el periodo de influencia materna.
A continuacin se ilustrar una evaluacin gentica para el carcter peso al destete en

ganado porcino.
RECUERDE

Datos de produccin,
Genealoga
Parmetros genticos
tres columnas y trece registros provenientes de trece lechones. Se ha incluido solamente el
factor sexo.
Figura 25. Archivo de datos productivos para el carcter peso al destete en ganado porcino.

Modelo Animal con Efectos Ambientales Comunes
4
El archivo de genealoga est compuesto por tres columnas y dieciocho registros

equivalentes a dieciocho animales (Figura 26). Los padres desconocidos estn identificados
con un guion -.
IMPORTANTE:

En colores estn destacadas las cuatro familias existentes. Observe que, a diferencia de lo
que ocurra con los ejemplos de ganado vacuno en el porcino, por ser una especie prolfica,
existen grupos de hermanos completos. Es por ello que en estas especies tiene sentido
incorporar el efecto del ambiente compartido que, recordemos, es de origen materno y de
tipo ambiental.
Se utilizar una Heredabilidad de 0.15. Adicionalmente, para que el modelo considere el

efecto del ambiente comn materno, se debe suministrar el parmetro gentico C2 que en
este ejemplo ser de 0.25.

siguiendo el ejemplo visto en el Modelo Animal Simple, en la pgina 19.

49
Ingrese a VirtualBlup con su nombre

de usuario y contrasea. En la pgina
1 inicial seleccione la opcin realizar
evaluacin gentica del recuadro
correspondiente.
Seleccione NO en el recuadro de grupos genticos y Modelo animal con efectos

2 ambientales comunes en las opciones de modelos. Luego presione Guardar
Contine a la pgina de archivos. En ella podr subir los archivos de genealoga y de datos
al servidor de VirtualBlup.
Busque sus archivos

presionando el botn
Examinar.
3
pulse Subir Archivo

4
IMPORTANTE:
Si sus archivos son muy pesados (superiores a 20 MB) la subida tomar tiempo en concretarse. El
tiempo de subida depender adems de factores como la conexin y velocidad de internet.
Especifique las variables contenidas en los archivos. Para ello presione Definir Variable en
4
En Genealoga asigne la 1 columna para la variable individuo, la 2 para padre y la 3 para
la variable madre. Coloque - en el recuadro ID de padres desconocidos. Guarde los
cambios.
Posteriormente defina las variables del archivo de datos. Seleccione las tres columnas que
contiene y especifique el tipo de variable que representa cada una de ellas (Figura 27).
La 1 columna contiene las identificaciones de los individuos. Seleccione Animal en el tipo

de variable. Esta columna ser la conexin con el archivo de Genealoga.
La 2 columna contiene el factor fijo SEXO, que en este caso ser el nico a incluir.
Seleccione Factor Fijo en el tipo de variable.
RECUERDE
una medicin.

51
La 3 columna contiene los datos de kilogramos de peso al destete a 60 das. Especifique

Carcter en el tipo de variable.
Factor
Individuo Fijo Carcter
encontrado por el software al leer los datos. Si el usuario coloca el nmero 2, estarn
referencias.
En este ejemplo existe solamente un factor fijo, por tanto no es imprescindible indicar un
nivel de referencia para que la metodologa se desarrolle correctamente. Ingrese el nmero
0 en el recuadro y guarde los datos.

imprimir un archivo con los individuos consanguneos. Si elige la opcin Si se generar un
5 archivo adicional con la identificacin de los animales que presentan un coeficiente de

NO. Si desea conocer la estructura de este

4
incluir la media de la poblacin en el anlisis.
Si decide incluirla ser considerada como un 6
En este ejemplo no se incluir la media en el modelo. Seleccione la opcin NO.

defecto para los criterios de convergencia y 7
nmero de remuestreos del proceso iterativo.
(minuto 03:58).

parmetros genticos.

ingrese la heredabilidad y C2 del carcter, es
decir, 0.15 y 0.25 respectivamente.
IMPORTANTE:

53
8 resultados. Esta pgina estar compuesta de dos bloques. El primero contiene los
resultados de la revisin previa de los archivos de genealoga y datos (con el fin de detectar
29).

30).
El R2 de este anlisis fue de 0.7386. Observe la figura que se presenta a continuacin:

4
Factor Sexo + Animal + Ambiente comn (Modelo)
Otros factores? (Error)
74% 26%
0% 20% 40% 60% 80% 100%
Al respecto se puede concluir lo siguiente:
El factor fijo SEXO ms el factor animal y el ambiente comn que las hembras
proporcionan a sus cras explican, en su conjunto, el ~74% de la variabilidad de los
datos.
El factor fijo SEXO tienen una influencia real sobre el peso al destete
Existe un 26% de variabilidad NO EXPLICADA por los factores anteriores, por lo que
es posible incluir ms informacin para aumentar el R2 y de esta forma mejorar la
estimacin de los valores genticos. Al respecto, un factor posible de incluir es el
tamao de camada ya que, en general, individuos provenientes de camadas
numerosas presentan un menor peso al destete en relacin a los provenientes de
camadas ms pequeas.
En este caso la interpretacin de los valores obtenidos es de tipo absoluto ya que no se

ingresaron niveles de referencias. De esta forma los lechones machos tienen un peso
promedio al destete de 15.15 kilogramos y las hembras de 11.91 kilogramos.

55
Los valores genticos de los animales se encuentran en el archivo Gentico.txt (Figura

32), acompaados de indicadores de precisin.
El valor gentico representa, en la misma unidad del carcter, la superioridad o inferioridad

que tiene un individuo respecto al promedio de los individuos de la poblacin base. Se
denomina valor gentico porque esa superioridad o inferioridad es el resultado de la suma
del efecto de los muchos genes que puedan estar relacionados con el carcter.
Recordemos que el carcter se midi en kilogramos de peso vivo a los 60 das. De esta
forma el valor gentico del individuo ANIM01, de -0.0188, indica que tiene un peso al destete
0.0188 kg menos que el promedio de los individuos de la poblacin base.
Por el contrario, el individuo ANIM09, con un valor gentico de +0.2738, indica que tiene un
peso al destete 0.2738 Kg ms respecto del promedio de los individuos de la poblacin
base.
Al margen de la interpretacin del valor gentico, estos toman sentido prctico cuando se

4
Los indicadores de precisin nos informan acerca del grado de precisin que tienen los
valores genticos. Los indicadores que VirtualBlup suministra son explicados con ms
detalles en la pgina 29.
decisiones de seleccin, es decir, para la identificacin de los individuos genticamente
superiores con el objetivo de dejar descendencia de ellos.
Al igual que en los anteriores ejemplos, en el ganado porcino se consideran varios

caracteres al momento de tomar las decisiones de seleccin (Ver mrito econmico). No
obstante, para ilustrar la importancia del valor gentico como criterio de seleccin, en el
presente ejemplo se considerar solamente el valor gentico para peso al destete.
En la tabla 9 se muestran los valores genticos de los padres de este rebao. Interesa
identificar cul o cules de ellos se podran seguir utilizando como reproductores o por el
contrario, eliminados.
Tabla 9. Valores genticos de los reproductores.
De la tabla anterior podemos concluir que los animales ANIM01 y ANIM04 podran ser
candidatos a ser reemplazados por otros que posean mayor valor gentico.
Tambin podemos identificar los lechones que podran ser candidatos a futuros
reproductores. La tabla 10 muestra el ranking de los lechones.
Tabla 10. Valores genticos de los lechones en orden decreciente.

57
Con un ranking como el anterior se puede fijar un valor gentico umbral y dejar como
candidatos a la seleccin los individuos que lo superen. Se puede ir un paso ms all y
considerar ms caracteres de importancia econmica. En tal caso habr que realizar la
correspondiente evaluacin gentica para ellos y construir los rankings. Con estos se
pueden seleccionar los candidatos estableciendo niveles independientes de aceptacin para
cada carcter o bien, se puede aplicar un ndice global que combine valores genticos de
los caracteres con distintos grado de ponderacin.
4.10.- EFECTO DEL AMBIENTE COMN
Las predicciones del ambiente comn se encuentran en el archivo Comun.txt (Figura 33) y
tambin, por ser una prediccin, vienen acompaadas de indicadores de precisin.
Figura 33. Archivo Comn.txt.
El efecto del ambiente comn puede utilizarse para calcular la habilidad de produccin
que, a diferencia del modelo de repetibilidad, en este caso correspondera a la habilidad
productiva de la madre. Esta ser la suma de su valor gentico ms la prediccin del
ambiente comn.
Ms all de la posible utilizacin de las predicciones del ambiente comn, estas tienen
importancia per se al haber sido consideradas en el anlisis al momento de calcular los
valores genticos, los que estarn corregidos por un factor ms.

5
Modelo Animal Con Efectos
Maternos
5 Modelo Animal con Efectos Maternos
El modelo con efectos maternos se aplica cuando existe una marcada influencia materna
sobre el carcter que se desea evaluar. Por ello tiene sentido aplicar este modelo sobre
caracteres que se miden a edades tempranas en los individuos como por ejemplo el peso al
nacimiento o el peso al destete en ganado bovino de carne. No tendra sentido ajustar este
modelo sobre el carcter ganancia de peso durante el engorde ya que este ocurre mucho
tiempo despus de la separacin del individuo con su madre.
Teniendo en cuenta solamente los factores genticos, el peso al destete de un ternero es

funcin de:
La propia habilidad del individuo para crecer: esta habilidad viene determinada por
el conjunto particular de genes que un individuo posee para el crecimiento.
La produccin de leche de la madre: determinada por el conjunto de genes para

produccin de leche. Mientras ms leche produzca una vaca para su ternero mayor
velocidad de crecimiento tendr y por ende un mayor peso al destete.
La habilidad materna de la madre: relacionada con la habilidad de sta para

amamantar y proteger a su cra y viene determinada por una base gentica.
La propia habilidad del individuo para crecer representa el componente directo del peso al
destete, mientras que la produccin de leche de la madre y la habilidad materna de esta
representan el componente materno. El BLUP con efectos maternos es capaz de separar
los componentes directos y maternos y proveer de predicciones para ambos.
A continuacin se realizar una evaluacin gentica para el carcter peso al destete en

ganado bovino de carne.
RECUERDE

1. Datos de produccin
2. Genealoga
3. Parmetros genticos
cinco columnas y once registros provenientes de once terneros(as). Incluye informacin
acerca del rebao, el sexo y la edad de los animales al momento del destete.

Modelo Animal con Efectos Maternos
5
Figura 34. Archivo de datos productivos para el carcter peso al destete en bovinos.
El archivo de genealoga est compuesto por tres columnas y quince registros equivalentes
a quince animales (Figura 35). Los padres desconocidos estn identificados con un cero 0.
IMPORTANTE:

Se utilizarn los siguientes parmetros genticos:
Heredabilidad : 0.27
Heredabilidad materna : 0.1621
Correlacin gentica : -0.3873
C2 ambiente permanente materno : 0.081

61

siguiendo el ejemplo visto en el Modelo Animal Simple, en la pgina 19.

1 seleccione la opcin realizar evaluacin gentica del recuadro correspondiente
Seleccione NO en el recuadro de grupos genticos y Modelo animal con efectos

2 maternos en las opciones de modelos. Luego presione Guardar
Contine a la pgina de archivos. En ella podr subir los archivos de genealoga y de datos
al servidor de VirtualBlup.

5
Busque sus archivos
presionando el botn
Examinar.
3
pulse Subir Archivo
IMPORTANTE:
Si sus archivos son muy pesados (superiores a 20 MB) la subida tardar tiempo en concretarse.
El tiempo de subida depender adems de factores como la conexin y velocidad de internet.
Especifique las variables contenidas en los archivos. Para ello presione Definir Variable en
4
En Genealoga, asigne la 1 columna para la variable individuo, la 2 para padre y la 3 para
la variable madre. Coloque 0 en el recuadro ID de padres desconocidos. Guarde los
cambios.
Posteriormente defina las variables del archivo de datos. Seleccione las cinco columnas del
archivo y especifique el tipo de variable que representa cada una de ellas (Figura 36).
Las columnas 1 y 2 y 3 contienen los factores fijos REBAO, SEXO y DAD AL

DESTETE respectivamente. Seleccione Factor Fijo en el tipo de variable solo para los dos
primero factores. El factor fijo EDAD corresponde a una covariable, es decir, una variable
medible que est relacionada proporcionalmente con el carcter. Debe especificarla como
tal en Tipo de variable.
La 4 columna contiene el carcter peso al destete a los 210 das. Seleccione Carcter en
Tipo de variable.

63
La 5 y ltima columna contiene las identificaciones de los individuos. El tipo de variable a

especificar ser Animal. Esta columna ser la conexin con el archivo de Genealoga.
Factores
Fijos Carcter Individuo
Si el usuario no ingresa ningn nmero, el software asignar el nmero 1, lo que significa

que las estimaciones de los restantes niveles de ese factor estarn referidas al primer nivel
referencias.
Ingrese el nmero 0 para el factor REBAO y el 1 para el factor SEXO. La covariable no

necesita especificar ningn nivel de referencia porque no tiene niveles sino un espectro
continuo de valores. Guarde los datos y contine a la pgina de opciones.

imprimir un archivo con los individuos consanguneos. Si elige Si se generar un archivo
5 adicional con la identificacin de los animales que presentan un coeficiente de

NO. Si desea conocer la estructura de este

5
incluir la media de la poblacin en el anlisis.
Si decide incluirla ser considerada como un 6
En este ejemplo no se incluir la media en el modelo. Seleccione NO.

defecto para los criterios de convergencia y
nmero de remuestreos del proceso iterativo. 7
(minuto 03:58).

parmetros genticos.

ingrese la heredabilidad, la heredabilidad
materna, el parmetro C2 y la correlacin
gentica entre los efectos genticos directos
y los maternos, es decir, 0.27, 0.1621, 0.081
y -0.3873 respectivamente.
IMPORTANTE:

65
resultados. Esta pgina estar compuesta de dos bloques. El primero contiene los
8 resultados de la revisin previa de los archivos de genealoga y datos (con el fin de detectar
38).
Para ver si el BLUP se desarroll correctamente se debe revisar el coeficiente de

39).
Los factores fijos REBAO, SEXO y EDAD AL DESTETE ms el factor animal, el

factor gentico materno y el ambiente materno explican, en su conjunto, un 96% de
la variabilidad de los datos.
Los factores fijos antes mencionados tienen una influencia real sobre el peso al
destete, es decir, generan diferencias entre animales para este carcter.

5
Si hubiese sido omitido alguno de los factores anteriores el R2 hubiese sido menor y, por
ende, peor estimacin de los valores genticos de los animales.
IMPORTANTE:
5.7.1.- Factor Fijo REBAO:
El peso al destete de los animales del rebao FD03 supera en 17.75 Kg al de los
animales del rebao FD05.
El peso al destete de los animales del rebao FD03 supera en 25.11 Kg al de los
Los animales del rebao FD05 tienen un peso al destete 7.36 Kg superior al de los
El rebao que registra mayores pesos al destete es el rebao FD03 y el que registra
los menores pesos es el FD08.

67
5.7.2.- Factor Fijo SEXO:
Los machos tienen un peso al destete 23.44 Kg superior al peso promedio logrado
por las hembras.
5.7.3.- Covariable EDAD AL DESTETE
El ritmo de crecimiento de los terneros(as) durante en el periodo de crianza es de

604 gramos al da.
IMPORTANTE:
Este modelo suministra dos tipos de valores genticos: el valor gentico directo y el valor
gentico materno. El primero hace referencia al potencial gentico que un individuo tiene
para crecer, mientras que el segundo al potencial gentico para produccin de leche.
5.8.1.- Valor gentico directo
Los valores genticos directos se encuentran en el archivo Gentico.txt (Figura 41).

5
5.8.1.1.- Cmo se interpreta el valor gentico directo?
El valor gentico Directo (VGdirecto) expresa la diferencia de produccin entre un animal y el

promedio productivo de los individuos de la poblacin base. De esta forma, si tomamos el
valor gentico directo del individuo ANIM01 (VGdirecto: 0.36778), indica que tiene un peso al
destete 0.36 kg superior al peso promedio de los individuos de la poblacin base.
Por el contrario, el individuo ANIM07, con un valor gentico de -0.6189, indica que tiene un
peso al destete 0.61 kg menos que el promedio de los individuos de la poblacin base.
Al margen de la interpretacin del valor gentico, estos toman sentido prctico cuando se
5.8.2.- Valor gentico materno
Los valores genticos maternos se encuentran en el archivo Materno.txt (Figura 42).
Figura 42. Archivo Materno.txt.
5.8.2.1.- Cmo se interpreta el valor gentico materno?
El valor gentico Materno (VGmaterno) expresa las diferencias genticas en el potencial para
producir leche entre un individuo y el promedio de los individuos de la poblacin base. De
esta forma si nos fijamos en el valor gentico materno del individuo ANIM01
(VGmaterno: -0.11035), que es un macho, nos indica que las hijas de ese toro tendrn una
produccin de leche 0.11 Kg inferior al promedio de los individuos de la poblacin base.
El valor gentico materno toma sentido prctico cuando se compara con el de otro animal y
ms todava cuando se combina con el valor gentico directo lo que se explica en el
siguiente apartado.

69
El modelo con efectos maternos tiene la ventaja de suministrar valores genticos tanto para
el peso al destete como para el efecto gentico materno, representado por la produccin de
leche que las hembras suministran a sus cras durante la crianza. La obtencin de estos dos
valores genticos es posible gracias a que este modelo considera la correlacin gentica
entre estos. Esta correlacin es generalmente negativa por lo que en un hipottico caso de
seleccin basada solamente en el valor gentico Directo supondra un incremento en el
peso al destete pero una disminucin en la produccin de leche en las hembras.
Desde el punto de vista gentico, altos pesos al destete se consiguen teniendo cras que
tengan un elevado potencial de crecimiento en el periodo de crianza y a su vez que sus
madres que sean buenas productoras de leche para que ese potencial sea expresado.
Para lograr el objetivo anterior es posible utilizar un ndice que combina ambos valores
genticos como se muestra a continuacin.
IDM = ( 0.5 x VGdirecto ) + VGmaterno
El nuevo ndice es un valor que representa el potencial gentico para crecimiento y leche, de
tal forma que si bassemos la seleccin en este no se perjudicara el progreso de uno en
desmedro del otro.
La Tabla 11 muestra el ranking de los individuos de acuerdo al ndice combinado (directo-

materno). El animal ANIM05 fue el mejor valorado. Es un macho que an no ha sido padre
por lo que podra ser candidato a reemplazar al toro ANIM08 que qued ltimo en el ranking.
De igual forma se pueden tomar decisiones de seleccin con el resto de animales
comparando los valores obtenidos y, sobre todo, su posicin en el ranking. Observe que
un individuo con un ndice negativo no significa que sea malo y menos si est mejor
posicionado en el ranking respecto a otro. Tal es el caso de las hembras ANIM12 y ANIM14.
Ambas an no han sido madres y si tuvisemos que decidir cul dejar como reemplazo,
evidentemente que ANIM14 es mejor opcin que ANIM12.

5
Tabla 11. Valores genticos directos, maternos e ndice combinado (directo-materno)
ID Individuo VG Directo VG Materno IDM
ANIM05 0.94616 -0.14428 + 0.3288
ANIM02 0.01668 0.27414 + 0.2824
ANIM04 -0.40687 0.33211 + 0.1286
ANIM01 0.36778 -0.11035 + 0.0735
ANIM13 0.19393 -0.06609 + 0.0308
ANIM15 -0.12833 0.04849 - 0.01567
ANIM11 0.76989 -0.46398 - 0.07903
ANIM07 -0.61893 0.20567 - 0.10379
ANIM10 -0.52051 0.05272 - 0.20753
ANIM09 -0.20825 -0.23248 - 0.33660
ANIM14 0.36961 -0.64884 - 0.46403
ANIM03 0.02129 -0.4924 - 0.48175
ANIM12 -1.30033 0.15841 - 0.49175
ANIM06 -0.01761 -0.58462 - 0.59342
ANIM08 -0.83668 -0.28695 - 0.70529
5.10.- EFECTO DEL AMBIENTE PERMANENTE MATERNO
Las predicciones del ambiente permanente materno (APmaterno) se encuentran en el archivo

Permanente.txt (Figura 43) y tambin, por ser una prediccin, vienen acompaadas de
indicadores de precisin.
Figura 43. Archivo Permanente.txt.
Estos valores son de tipo ambiental y representan la parte del efecto materno que es comn
a todos los hijos de una misma madre. Al ser un valor de tipo no gentico no debera
intervenir en una decisin de seleccin. Sin embargo la suma del VGdirecto + VGmaterno +
APmaterno es una medida de la capacidad productiva de una vaca y puede constituir un
elemento importante a considerar al momento de elegir las vacas de desecho.

71
Mrito econmico
Los valores genticos estimados son la base para hacer seleccin animal. Hasta ahora
hemos ejemplificado la seleccin considerando solamente un carcter pero en la mayor
parte de los casos interesa seleccionar considerando varios de ellos. Existen varias
formas para hacerlo y, aunque no es el objetivo de este documento profundizar en ellas, s
queremos destacar la que quiz sea una de las ms utilizadas y que consiste en construir
un ndice de mrito econmico (H). Este ndice combina los valores genticos de varios
caracteres ponderados por su valor econmico (Ve). Este ltimo representa el beneficio
econmico adicional que se produce al aumentar en una unidad el carcter
correspondiente. De esta forma si el Ve de un carcter es positivo, se reforzar el peso de
ste en el ndice y, por el contrario, si el Ve es negativo (al aumentar el carcter disminuye
el beneficio econmico) disminuir su peso. En consecuencia se obtendr un valor
econmico para cada animal que puede ser utilizado para tomar las decisiones de
seleccin. El ndice se expresa de la siguiente manera:
H = (VGE1 x Ve1) + (VGE2 x Ve2) + (VGE3 x Ve3) + (VGEn x Ven)
Dnde:
VGE1 = Valor gentico estimado del carcter 1
VGEn = Valor gentico estimado del carcter n
Ve1 = Valor econmico del carcter 1

Ven = Valor econmico del carcter n
El nuevo ndice permite comparar en trminos econmicos el uso de los reproductores.

Para ilustrarlo de mejor forma, a continuacin se muestra un ejemplo en el que se calcula
el mrito econmico de tres toros considerando tres caracteres: Kg de leche, Kg de grasa
y Kg de protena.
Kg de Leche Kg de Grasa Kg de Protena
VGEleche VGEgrasa VGEprotena

A +710 +18 +31
VGEleche VGEgrasa VGEprotena

B +1070 +25 +27
C VGEleche VGEgrasa VGEprotena

+955 +50 +39
Valor econmico (Ve) -0.10 US$/kg +2.00 US$/kg +8.00 US$/kg

73
El mrito econmico de cada individuo ser:
Toro A
H = (710 kg x -0.10 US$/kg) + (18 x 2.00 US$/kg) + (31 kg x 8.00 US$/kg) = 213 US$
Toro B
H = (1050 kg x -0.10 US$/kg) + (25 kg x 2.00 US$/kg) + (27 kg x 8.00 US$/kg) = 161 US$
Toro C
H = (955 kg x -0.10 US$/kg) + (50 kg x 2.00 US$/kg) + (39 kg x 8.00 US$/kg) = 316 US$
De esta forma el toro cuyas hijas se espera generen un mayor beneficio econmico es el
toro C.
Aunque todos los valores genticos de este ejemplo estn expresados en las mismas
unidades, si no lo estuvieran, el mrito econmico igualmente se expresar en las unidades
econmicas utilizadas para calcular el Ve.
Respecto de la utilizacin de un ndice de mrito econmico podemos sealar lo siguiente:
1) Cada explotacin ganadera tiene su propia estructura de costes, sistema de precios,

etc., por tanto los valores econmicos no son generalizables ni constantes en el
tiempo.
2) Es necesario racionalizar el criterio de seleccin y priorizar solamente los caracteres
de mayor importancia econmica.
3) El incremento del beneficio econmico es independiente del progreso en cada
carcter ya que puede que algunos aumenten y otros disminuyan.
Por ltimo, el mtodo y los criterios de seleccin a utilizar para tomar las decisiones de
seleccin dependern del objetivo planteado en cada ganadera, programa de mejoramiento
o situacin particular. Por ejemplo, para una explotacin ganadera que se dedique a vender
gentica, es decir, reproductores que sean superiores en unas pocas caractersticas,
probablemente no sea til utilizar un ndice de mrito econmico pero si establecer niveles
independientes de aceptacin para los valores genticos de cada caracterstica y quedarse
con los animales que cumplan los lmites para todas ellas.

Glosario
BLUP Metodologa estadstica utilizada para la prediccin, lo ms exacta
y precisa posible, del valor gentico aditivo de los animales.
Cambio posible Posible cambio esperado en el valor gentico de un animal en una

futura evaluacin. Tambin es conocido como error estndar de
la prediccin y disminuye conforme aumenta el nmero de
informacin de un animal al ser evaluado.
Carcter Rasgo o caracterstica medible del ganado. En el contexto del

mejoramiento animal el carcter generalmente es un rasgo de
inters econmico.
Coeficiente de De in individuo, es la probabilidad de que los dos alelos de un gen

consanguinidad sean idnticos por descendencia, es decir, que ambos alelos
provengan de un ancestro en comn de sus padres. Se designa
generalmente por la letra F.
Covariable En el contexto de la evaluacin gentica, variable contina

relacionada proporcionalmente con el carcter objetivo de
evaluacin.
Criterio de El carcter o conjunto de caracteres utilizados para conseguir un

seleccin objetivo de seleccin propuesto.
Depresin Disminucin de la performance productiva y reproductiva de los

consangunea. animales por aumento de la consanguinidad.
Diferencia Esperada Diferencia en el comportamiento productivo esperado de los

de la Progenie futuros hijos de un animal en comparacin con el comportamiento
(DEP). productivo de los futuros hijos de otro animal en una misma
evaluacin gentica. Se estiman como la mitad del valor gentico y
se expresan en las mismas unidades del carcter evaluado (kg,
grs, %, mm, das, etctera).
Efecto directo Para peso al destete, parte de este carcter que se explica por los
genes del propio individuo.
Efecto materno Para peso al destete, parte de este carcter que se explica por los
genes maternos para produccin de leche principalmente y que
influyen en el crecimiento pre-destete de la cra.
Factor fijo Circunstancia que ejerce una influencia o es causa importante de

la variabilidad de un carcter. En un factor fijo se puede identificar
fcilmente las clases o categoras que presenta.
Fiabilidad Correlacin entre el valor gentico real de un animal y el valor

gentico estimado.
Genotipo En el contexto del mejoramiento animal, el conjunto de informacin

gentica que poseen los animales.

75
Heredabilidad Proporcin de la variabilidad fenotpica que es de origen gentico
aditivo.
Interaccin Cambio en la respuesta productiva de los individuos (genotipo) a

genotipo-ambiente diferentes ambientes. Por ejemplo, es probable que individuos de
ambientes clidos no manifiesten el mismo potencial gentico en
regiones fras
Modelo animal Metodologa particular de prediccin gentica en el que se

calculan valores genticos para todos los animales de una
poblacin cuenten o no con datos productivos.
Parentesco Vnculo gentico que existente entre dos individuos.
Poblacin base En el contexto de la evaluacin gentica, conjunto de individuos

de una poblacin que actan como base de referencia para la
estimacin de los valores genticos. Se asume que no estn
emparentados.
Valor econmico Cambio en el beneficio econmico (en uno u otro sentido)

producto del incremento en una unidad de un carcter concreto.
Valor gentico Valor que indica el potencial gentico de un individuo para un

carcter concreto resultante del efecto aditivo de sus genes.
Valor gentico Estimacin del valor gentico real de un animal para un carcter
estimado (VGE) concreto. El VGE es una manera de combinar la informacin
productiva disponible tanto del propio individuo como de sus
parientes (ascendientes, colaterales y descendientes). En los
catlogos de reproductores generalmente se expresa como
Diferencia Esperada de la Progenie.

Literatura consultada
Falconer, D.S. y Mackay, T.F.C. 1996. Gentica cuantitativa. Cuarta edicin. ACRIBIA,
S.A. Zaragoza, Espaa.
Galeano, A. P. y Manrique, C. 2010. Estimacin de parmetros genticos para

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Bovina. Primera edicin. Universidad Autnoma de Mxico. Mxico.
Genghini, R., Bonvillani, A., Wittouck, P y Echevarra, A. 2002. Introduccin al

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Instituto Nacional de Tecnologa Agropecuaria (INTA). EEA Mercedes. Corrientes.
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Produccin Porcina. 11 (2): 68-76.
Lpez-Ordaz, R., Olivera-Vega, I., Berruecos Villalobos, J.M., Peralta-Lailson, M.,

Ulloa-Arvizu, R., Vsquez Pelez, C.G. 2012. Parmetros genticos de pesos al nacer y al
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Martnez Gamba, R., Salmern Sosa, F. y Lpez Alcntar, M. 2006. Heredabilidad

estimada y comparacin de genotipos puros en porcinos de las razas Duroc, Landrace y
Yorkshire y en cruces recprocos de la raza Landrace y Yorkshire, para grasa dorsal y peso
a 154 das. Revista Cientfica FCV-LUZ. 16(2): 142 148.
Miguel, J.A., Asenjo, B., Ciria, J. y Francesch, A. 2006. Parmetros genticos y

respuesta a la seleccin en una poblacin de gallinas de raza castellana negra. Arch.
Zootec. 55 (209): 85-92.
Montes-V, D., Barragn-H, W., y Vergara-G, O. 2009. Parmetros genticos de

caractersticas productivas y reproductivas para ganado tipo carne en Colombia. Rev.
Colombiana Cienc. Anim. 1(2): 302-318.
Mueller, J. 2003. Curso de capacitacin en mejoramiento gentico de ovinos. Instituto

Nacional de Tecnologa Agropecuaria (INTA), EEA Bariloche. Argentina.
Ros Utrera, . 2008. Estimadores de parmetros genticos para caractersticas de

crecimiento predestete de bovinos. Revisin. Tc Pecu Mx. 46(1): 37-67.
Ros Utrera, ., Caldern Robles, R., Rosete Fernndez, J. y Lagunes Lagunes,

J. 2010. Estimacin de parmetros genticos para caractersticas de fertilidad en ganado
Suizo Pardo bajo condiciones subtropicales en Mxico. Vet. Mx. 41(2):117-129.
Zambrano, J.C.; Rincn, J.C. y Echeverr, J.J. 2014. Parmetros genticos para
caracteres productivos y reproductivos en Holstein y Jersey colombiano. Arch. zootec. 63
(243): 495-506.

77
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Ingeniero Agrnomo Mdico Veterinario

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Se permite la reproduccin parcial de la informacin aqu contenida,

1.1.- Datos de produccin 08

2.1.- Archivo de datos productivos 18

3.1.- Archivo de datos productivos 34

5.1.- Archivo de datos productivos 60

Se desarrollan paso a paso cuatro evaluaciones genticas con pequeos conjuntos

Los ejemplos se desarrollan sobre caracteres conocidos y que rutinariamente se

Aunque no es el objetivo central del documento, se hace mencin al proceso de

La presente gua es un complemento a los Videotutoriales que VirtualBlup tiene en

Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

Existen varios mtodos de evaluacin gentica en produccin animal pero el ms utilizado,

1.1.- DATOS DE PRODUCCIN

Mientras ms factores fijos se incluyan en el anlisis, mejor ya que se eliminar el efecto

Un ejemplo de archivo de datos se muestra la Figura 1. Contiene once filas y cinco

Figura 1. Archivo de datos productivos

8 Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

Qu relacin existe entre las covariables y el carcter?

1.2.- REGISTROS GENEALGICOS

Se refieren a la correcta identificacin de los individuos y la de sus respectivos padres. Esta

Generalmente el orden de aparicin de las columnas en los archivos de genealoga es

Figura 2. Archivo de genealoga.

Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

1.3.- PARMETROS GENTICOS:

Los parmetros genticos son indicadores poblacionales de la caracterstica a evaluar. El

Figura 3. Concepto de Heredabilidad.

10 Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

Si la heredabilidad es ALTA, las diferencias observadas entre animales son debidas

Si la heredabilidad es BAJA, las diferencias son debidas principalmente al

1.3.1.- Otros parmetros genticos son:

CORRELACIN GENTICA (rxy):

HEREDABILIDAD MATERNA (h2m):

Cmo saber cul o cules parmetros son necesarios en una evaluacin

Como se mencion anteriormente la Heredabilidad es el parmetro ms importante por lo

Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup 11

Se cuenta con una Ganancia de peso vivo

Produccin de leche (Kg

Intervalo entre partos

y Modelo animal de Peso del velln, dimetro

Aplicable cuando el 2 Ganancia de peso

12 Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

Tabla 2. Parmetros genticos en el ganado bovino lechero.

Tabla 3. Parmetros genticos en el ganado bovino de carne.

Carcter h2d h2m rdm / r C2

Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

N de lechones a los 21 das 0.10 0.15

Tabla 5. Parmetros genticos en aves de postura.

14 Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

A continuacin se ilustrar una evaluacin gentica para el carcter Ganancia diaria de

Es necesario suministrar tres fuentes de informacin:

2.1.- ARCHIVO DE DATOS PRODUCTIVOS

18 Gua Prctica de Evaluacin Gentica con VirtualBlup

El usuario puede utilizar un cdigo

Observe que la identificacin de los

Figura 5. Archivo de genealoga.

2.3.- PARMETROS GENTICOS

Se utilizar una Heredabilidad de 0.51

2.4.- GENERACIN DE ARCHIVOS