Alejandra Daz Zapata cc: 1152453447

Flaviviridae > Hepacivirus > Hepatitis C virus

1. Informacin general

Nombre de la cepa UNKNOWN-M58335

Organismo Hepatitis C virus
Flaviviridae -> Hepacivirus -> Hepatitis C virus -> Type
Taxonomia:
1b

Longitud de la secuencia 9416 pb

Nmeros de protenas 11
Tipo Molcula RNA genmico

Proteinas que codifica:

1C2P: HEPATITIS C VIRUS NS5B RNA (Trasferasa)

El virus de la hepatitis C (HCV)presenta una protena no estructural 5B (NS5B)

que proporciona la primera visin completa y detallada de una ARN polimerasa
dependiente de ARN. Si bien existen caractersticas polimerasa cannicas en la
estructura, NS5B adopta una forma nica, debido a extensas interacciones entre
los dedos y el pulgar de la polimerasa subdominios que sirven para rodear la
estructura de NS5B apoenzima en el sitio activo. NS5B: Modelo primer tambin
permite la identificacin de un nuevo modelo estructural que participan en la
estabilizacin del par de bases naciente

1CSJ: Estructura cristal de RNA polimerasa dependiente de RNA del Hepatitis B

Esta enzima es un objetivo clave para el desarrollo de la terapia antiviral especfica. La
estructura del dominio cataltico contiene 531 residuos plegadas en los dedos y palma,
 muestra que la polimerasa de virus de la hepatitis C se cristaliz en una conformacin
dedos cerrado, similar a la de VIH-1 de la transcriptasa inversa en el complejo ternario con
el ADN y dTTP. Esta superposicin revela la mayora de los residuos de aminocidos de la
enzima virus de la hepatitis C que pueden estar implicados en la unin a la molcula de
ARN replicante

1A1Q: Proteinasa NS3 de Hepatitis C (Hidrolasa)

Durante la replicacin del virus de la hepatitis C (HCV), los pasos finales del procesamiento
de la poliprotena son realizadas por una proteinasa viral se encuentra en el N-terminal de
un tercio de la protena no estructural.
La estructura tiene un sitio de unin al sustrato de acuerdo con la especificidad de escisin
de la enzima. Caractersticas novedosas incluyen un sitio de unin de zinc-estructural y
una larga N-terminal que interacta con las molculas vecinas mediante la unin a un
parche de superficie hidrofbica.

2. Fago: Los bacterifagos (fagos) son parsitos intracelulares obligados que se multiplican al
interior de las bacterias, haciendo uso de algunas o todas sus maquinarias biosintticas (p. ej.,
los virus que infectan bacterias). Existen muchas similaridades entre los bacterifagos y los
virus de clulas animales. As, los bacterifagos pueden ser visualizados como sistemas
modelo de los virus de clulas animales. Adems es necesario el conocimiento previo del ciclo
de vida del bacterifago para entender uno de los mecanismos por los cuales los genes
 bacterianos pueden transferirse de una bacteria a otra. Los fagos son ubicuos y pueden ser
encontrados en diversas poblaciones de bacterias, tanto en el suelo como en la flora
intestinal de los animales. Uno de los ambientes ms poblados por fagos y otros virus es
el agua de mar, donde se estima que puede haber en torno a 109 partculas virales por
mililitro, pudiendo estar infectadas por fagos el 70 % de las bacterias marinas. Los fagos
pueden generar el ciclo ltico o el ciclo lisognico, aunque muy pocos son capaces de
llevar a cabo ambos. si se lleva a cabo la lisis, no puede llevarse a cabo la lisogenia y
viceversa. En el ciclo ltico, las clulas hospedadoras del fago son lisadas (destruidas)
tras la replicacin y encapsulacin de las partculas virales, de forma que los nuevos virus
quedan libres para llevar a cabo una nueva infeccin.

Bacillus phage Andromeda

Hospedero: Bacteria > Bacillus pumilus BL8
Longitud de genoma: 45021.
%C-G: 41.91%
Genes que codifican para protena: 79
N de Proteinas: 279

Algunas proteinas:
1. DNA polimesada III (Subunidad psilon): 196 aa
2. Serina-Treonina quinasa : 296 aa
3. Helicasa: 425 aa
4. Hidrolasa de pared celular (Autolisis): 299 aa
5. Virin (Morfogenesis): 147 aa