Introduccion A La Bioinformatica Jose Pasos

Jos Anselmo Pasos Acosta 1G Jose.Pasos@certcaucel .edu.
mx
UNIDAD I: INTRODUCCION A LA BIOINFORMATICA
La bioinformtica en una ciencia que da a da esta avanzando a pasos
agigantados debido a que la tecnologa ha tenido un gran desarrollo y ha permitido
unir la informtica con otras ciencias como la biologa y la gentica las cuales no
ayudan en gran medida para saber ms sobre nosotros mismos.
Qu es la bioinformtica?
Es el uso de tcnicas computacionales, matemticas y estadsticas para el
anlisis, interpretacin y generacin de datos biolgicos, ha tenido un gran
desarrollo y ha permitido unir la informtica con otras ciencias como la biologa y la
gentica. Lo que hace es almacenar datos de genes a travs de minera de datos
y observar que hacen los genes. Se podra decir que los que busca la
bioinformtica es llegar a la medicina y ayudar en la obtencin de curas para
enfermedades como el cncer, las enfermedades que se derivan de mutaciones,
etc.
La bioinformtica puede ir abarcando distintas reas como lo
son:Genmica, transcriptmica, protemica, metabolismo, genmica comparativa,
genmica funcional y por ltimo anlisis filogenticos.
Bases de qumica
La Qumica segn Medina et al. (2012), es el estudio de la materia y la
materia est hecha de tomos (p.7), es decir es la ciencia que estudia la

Jos Anselmo Pasos Acosta 1G Jose.Pasos@certcaucel .edu.mx
composicin y las propiedades de la materia y de las transformaciones que esta
experimenta sin que se alteren los elementos que la forman.
Es el estudio de la materia, en el cual la materia est hecha de tomos, en
los cuales existen representaciones como son los modelos del atmico.
Modelo atmico: Es la representacin estructural de un tomo, que trata de
explicar su comportamiento y sus propiedades. Tambin est el modelo atmico
de Rutherford: mostraba que el tomo estaba compuesto por un ncleo de carga
positiva (protn) y alrededor carga negativa (electrones).
El tomo como bien se sabe es unidad ms pequea de un elemento
qumico, que mantiene sus propiedades y no es posible dividir por procesos
qumicos. Tambin existen otros elementos que son indispensable en la qumica y
son: la molcula y enlace qumico
Bases de la biologa
Es la ciencia que estudia a los seres vivos, los cuales son capaces de
reproducirse, la biologa se caracteriza por las reacciones qumicas bsicas son
las mismas en todos los seres vivos, todos los organismos se evolucionaran de un
nico ancestro comn, todos los seres se dividen en una categora y
subcategoras un ejemplo seran los reinos.
La biologa segn Medina et al. (2012) es la ciencia que estudia los seres
vivos y un ser vivo es todo lo que es capaz de reproducirse (p.8),
La bioqumica va constando niveles que son: Orgnico, biologa celular,
biologa molecular y clula

Las clulas hacen parte de dos clases de organismos: Pluricelulares y
Monocelulares por ejemplo la clula animal es pluricelular y las bacterias
monocelulares. La clula tiene las funciones de la nutricin, crecimiento, de poder
multiplicarse, diferenciacin, sealizacin y poder una evolucin.
La biologa tiene las siguientes caractersticas: la universalidad son las
reacciones qumicas bsicas son las mismas en todos los seres vivos, la evolucin
son todos los organismos se evolucionaran de un nico ancestro comn, la
taxonoma son todos los seres se dividen en una categora y subcategoras.
Ejemplo: reinos.
Encontramos tres (3) niveles: El orgnico que son todos los tejidos,
agregaciones de clula. Estructura o compartimento sub-celular, anlogo a los
rganos de seres vivos pluricelulares, que desempea una funcin concreta.
La biologa celular es el estudio sobre las clulas. Esto incluye su anatoma,
su fisiologa, las interacciones de sta con el medio, su ciclo vital, y su divisin y
muerte.
Bases gentica
Gentica.
Estudia los genes que determinan nuestras caractersticas, existen 4 tipos
de gentica: Gentica clsica, gentica cuantitativa, gentica evolutiva y por ltimo
gentica molecular.
La gentica molecular tiene un dogma denominado dogma central de la
biologa molecular.
Dogma Central de la Biologa Molecular.
Nos habla de cmo se pasa de genotipo a fenotipo. Genotipo: Conjunto de
toda nuestra informacin gentica (Nuestro Disco Duro). Fenotipo: Conjunto de
caractersticas Fsicas.
La replicacin consiste en la copia del ADN de una clula, antes de la
divisin celular, para que la clula hija tenga el mismo ADN que la madre. La
transcripcin consiste en convertir la informacin contenida en el ADN en un
formato legible para la maquinaria celular de sntesis de protenas, el ARN. La
traduccin es el mecanismo por el que el mensaje que lleva el ARN se utiliza para
sintetizar protenas.
cido Desoxirribonucleico (ADN).
Contiene la informacin gentica. Es una molcula (conjunto de tomos con
estructura tridimensional). Est conformado por el nucletido, azcar, fosfato y la
base. Nuestro ADN codifica nuestra informacin en cuatro (4) bits. El ADN codifica
la informacin en ATCG.
El ADN tiene mecanismos de reparacin y recuperacin, por esto debemos
saber que l tiene tres niveles de Estructura que son: estructura primaria,
secundaria y terciaria.
Traduccin y Transcripcin Gentica.
Transcripcin es el proceso de fabricacin ARN usando el ADN como
molde. Traduccin es la construccin de una secuencia de aminocidos (poli
pptido) con la informacin proporcionada por la molcula de ARN.
El cido Ribonucleico mensajero (ARNm) es el molde para la construccin
de la protena. El cido Ribonucleico ribosmico (ARNr) se encuentra en el sitio
donde se construye la protena: el ribosoma. El cido Ribonucleico de
transferencia (ARNt) es el transportador que coloca el aminocido apropiado en el
sitio correspondiente.
Cdigo Gentico.
Segn el astrnomo George Gamow (1930) quien seal que el cdigo
que representa a los aminocidos deba consistir en grupos de al menos tres de
las cuatro bases del ADN. (pag. 14)
Los 20 aminocidos estn representados en el cdigo gentico por la
agrupacin de tres letras (triplete) de las cuatro existentes. Si uno considera las
posibilidades de arreglo de cuatro letras agrupadas de a tres (43) resulta que
tenemos 64 posibilidades de palabras a codificar, o 64 posibles codones
(secuencia de tres bases en el ARNm que codifica para un aminocido especfico
o una secuencia de control).
Segn Nirenberg (1961)descubri que el ARNm, independientemente del
organismo de donde proviene, puede iniciar la sntesis proteica cuando se lo
mezcla con el contenido del homogneo de Escherichiacoli. (pag. 15)

Asimismo un ARNm artificial compuesto por bases A y C alternando codifica
alternativamente para histidina y treonina. Gradualmente se fue confeccionando
una lista completa del cdigo gentico.
Caractersticas.
Universalidad.
El cdigo gentico es compartido por todos los organismos conocidos,
incluyendo virus y organelos, aunque pueden aparecer pequeas diferencias. As,
por ejemplo, el codn UUU codifica el aminocido fenilalanina tanto en bacterias,
como en arqueas y en eucariontes. Este hecho indica que el cdigo gentico ha
tenido un origen nico en todos los seres vivos conocidos.
Gracias a la gentica molecular, se han distinguido 22 cdigos genticos, que se
diferencian del llamado cdigo gentico estndar por el significado de uno o ms
codones. La mayor diversidad se presenta en las mitocondrias, orgnulos de las
clulas eucariotas que se originaron evolutivamente a partir de miembros del
dominio Bacteria a travs de un proceso de endosimbiosis. El genoma nuclear de
los eucariotas slo suele diferenciarse del cdigo estndar en los codones de
iniciacin y terminacin.
Protenas.
Son biomolculas formadas por cadenas lineales de aminocidos,
desempean un papel fundamental para la vida y son las biomolculas ms
verstiles y ms diversas. Son imprescindibles para el crecimiento del organismo.
Realizan una enorme cantidad de funciones diferentes como: Estructural,

inmunolgica, enzimtica, contrctil, homeosttica, Transduccin de seales y
Protectora o defensiva
Las protenas de todos los seres vivos estn determinadas
mayoritariamente por su gentica (con excepcin de algunos pptidos
antimicrobianos de sntesis no ribosomal), es decir, la informacin gentica
determina en gran medida qu protenas tiene una clula, un tejido y un
organismo. Las protenas se sintetizan dependiendo de cmo se encuentren
regulados los genes que las codifican. Por lo tanto, son susceptibles a seales o
factores externos. El conjunto de las protenas expresadas en una circunstancia
determinada es denominado proteoma.
NCBI Entrez
Es un portal y un buscador que permite acceder a la base de datos del
National Center forBiotechnologyInformation (NCBI).
Cada cono es una base fundamental y diferente. Permite encontrar:
PubMed, pubMed Central, siteSearch, books, nucleotide, protein, genome,
structure y taxonomy. Toda la informacin biolgica es de dominio pblico. No se
puede patentar la informacin gentica. Podemos reducir la bsqueda con ayuda
de operadores Booleanos aqu se usan en mayscula AND, OR, NOT. Podemos
seguir reduciendo la bsqueda con Limits->limits to (Lo que se hace es poner
rangos de bsqueda).
Conclusin:
Se llega a la conclusin de que la bioinformtica es muy indispensable para
la vida sobre todo porque est relacionada con otras ramas o ciencias como son la
qumica, biologa, gentica, etc. Las cuales nos son muy tiles para la vida sobre
todo en cuanto a nuestra gentica, todos sabemos que la gentica es lo ms
importante ya que es lo que nos diferencia de las personas, de igual manera la
bioinformtica puede ir observando que hacen los genes, pero atreves de todo
esto eso se necesita aprender un poco ms de todas esas materias para poder
comprender la gentica y la bioqumica.

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UNIDAD I: INTRODUCCION A LA BIOINFORMATICA

La bioinformtica en una ciencia que da a da esta avanzando a pasos

agigantados debido a que la tecnologa ha tenido un gran desarrollo y ha permitido

ayudan en gran medida para saber ms sobre nosotros mismos.

Es el uso de tcnicas computacionales, matemticas y estadsticas para el

anlisis, interpretacin y generacin de datos biolgicos, ha tenido un gran

desarrollo y ha permitido unir la informtica con otras ciencias como la biologa y la

gentica. Lo que hace es almacenar datos de genes a travs de minera de datos

bioinformtica es llegar a la medicina y ayudar en la obtencin de curas para

enfermedades como el cncer, las enfermedades que se derivan de mutaciones,

La bioinformtica puede ir abarcando distintas reas como lo

son:Genmica, transcriptmica, protemica, metabolismo, genmica comparativa,

genmica funcional y por ltimo anlisis filogenticos.

La Qumica segn Medina et al. (2012), es el estudio de la materia y la

materia est hecha de tomos (p.7), es decir es la ciencia que estudia la

composicin y las propiedades de la materia y de las transformaciones que esta

experimenta sin que se alteren los elementos que la forman.

Es el estudio de la materia, en el cual la materia est hecha de tomos, en

Modelo atmico: Es la representacin estructural de un tomo, que trata de

explicar su comportamiento y sus propiedades. Tambin est el modelo atmico

de Rutherford: mostraba que el tomo estaba compuesto por un ncleo de carga

positiva (protn) y alrededor carga negativa (electrones).

El tomo como bien se sabe es unidad ms pequea de un elemento

qumico, que mantiene sus propiedades y no es posible dividir por procesos

qumicos. Tambin existen otros elementos que son indispensable en la qumica y

son: la molcula y enlace qumico

reproducirse, la biologa se caracteriza por las reacciones qumicas bsicas son

nico ancestro comn, todos los seres se dividen en una categora y

subcategoras un ejemplo seran los reinos.

vivos y un ser vivo es todo lo que es capaz de reproducirse (p.8),

La bioqumica va constando niveles que son: Orgnico, biologa celular,

biologa molecular y clula

Las clulas hacen parte de dos clases de organismos: Pluricelulares y

Monocelulares por ejemplo la clula animal es pluricelular y las bacterias

monocelulares. La clula tiene las funciones de la nutricin, crecimiento, de poder

multiplicarse, diferenciacin, sealizacin y poder una evolucin.

La biologa tiene las siguientes caractersticas: la universalidad son las

son todos los organismos se evolucionaran de un nico ancestro comn, la

taxonoma son todos los seres se dividen en una categora y subcategoras.

agregaciones de clula. Estructura o compartimento sub-celular, anlogo a los

rganos de seres vivos pluricelulares, que desempea una funcin concreta.

La biologa celular es el estudio sobre las clulas. Esto incluye su anatoma,

su fisiologa, las interacciones de sta con el medio, su ciclo vital, y su divisin y

Estudia los genes que determinan nuestras caractersticas, existen 4 tipos

de gentica: Gentica clsica, gentica cuantitativa, gentica evolutiva y por ltimo

La gentica molecular tiene un dogma denominado dogma central de la

Dogma Central de la Biologa Molecular.

Nos habla de cmo se pasa de genotipo a fenotipo. Genotipo: Conjunto de

toda nuestra informacin gentica (Nuestro Disco Duro). Fenotipo: Conjunto de

La replicacin consiste en la copia del ADN de una clula, antes de la

transcripcin consiste en convertir la informacin contenida en el ADN en un

formato legible para la maquinaria celular de sntesis de protenas, el ARN. La

cido Desoxirribonucleico (ADN).

Contiene la informacin gentica. Es una molcula (conjunto de tomos con

estructura tridimensional). Est conformado por el nucletido, azcar, fosfato y la

El ADN tiene mecanismos de reparacin y recuperacin, por esto debemos

Traduccin y Transcripcin Gentica.

Transcripcin es el proceso de fabricacin ARN usando el ADN como

molde. Traduccin es la construccin de una secuencia de aminocidos (poli

pptido) con la informacin proporcionada por la molcula de ARN.

El cido Ribonucleico mensajero (ARNm) es el molde para la construccin

de la protena. El cido Ribonucleico ribosmico (ARNr) se encuentra en el sitio