METABOLISMO

Bioquimica
 LA VIDA Y LAS REACCIONES
QUIMICAS
Los estudios sugieren que ha existido vida en la tierra
durante al menos 3700 millones de aos.

Una definicin, bioqumica, de vida es: un sistema de

molculas autocatalticas capaces de experimentar
evolucin darwiniana.

Dos etapas claves que se cree intervinieron en la formacin

de la vida, son: la formacin de aminocidos y la formacin
de vesculas celulares, ambas se pueden formar por
interacciones bioqumicas mas o menos espontaneas.
Un organismo vivo, consume energa para su
supervivencia, y requiere la realizacin de reacciones
qumicas, que posibilitan la generacin de energa y
estructuras que logran el mantenimiento de la vida.
Formacion de aminoacidos, Experimento de Miller (1952). fue la
primera prueba de que se pueden sintetizar molculas orgnicas a
partir de sustancias inorgnicas simples en condiciones ambientales
adecuadas.
En el experimento, uno de los
recipientes contiene agua con
calentamiento para evaporar, y en otro
recipiente hay gases de
metano, amoniaco, CO2 e hidrgeno, y
un par de electrodos que emiten
descargas elctricas en el matraz,
simulando una atmsfera de Tierra
primitiva.
Despus, el vapor de agua se condensa
y las gotas vuelven al primer recipiente,
que se vuelve a calentar en un ciclo
continuo, logrndose la formacin de
aminocidos.
La formacin de vesculas de
molculas anfipticas como
fosfolpidos, sucede de
manera espontanea.
 METABOLISMO.
El metabolismo es el conjunto de reacciones qumicas que se
producen en la clula.
La vida de cualquier clula, desde las bacterias hasta los
mamferos, depende de la realizacin del metabolismo.
El metabolismo tiene dos funciones principales:
La primera es obtener energa qumica del entorno, para luego
usarla en diferentes funciones celulares.
La segunda es convertir los nutrientes exgenos en
macromoleculas celulares.
Metabolitos: Son molculas que se producen en el curso de las
reacciones metablicas.
 Tipos de metabolismo

Metabolismo primario. Conjunto de reacciones que

implican la produccin de energa, y nuevas molculas que
necesitan las clulas para sus acciones vitales de
supervivencia y reproduccin.
Ejemplo: produccin de etanol por levaduras.

Metabolismo secundario. Conjunto de reacciones

internas que la clula realiza como respuesta a condiciones
adversas.
Ejemplo: produccin de antibiticos por bacterias y hongos
 BASES DEL METABOLISMO
PRIMARIO
Los ingenieros pueden ver la clula como un micro-reactor
que opera en condiciones de presin, temperatura y
volumen esencialmente constantes.
Pero, la clula es mucho ms que un simple reactor.
Genera su propia energa y al mismo tiempo se reproduce.
Toda clula viva debe realizar entre otras las siguientes
funciones:
Asimilacin de nutrientes y excrecin de los productos
metablicos.
Sntesis de los componentes celulares (protenas, lpidos,
nucletidos).
Movimientos, contracciones y otras funciones fsicas
propias de cada tipo de clula.
Reproduccin.
Todas estas funciones requieren energa, i/o molculas, las
mismas que son provedas por el metabolismo
Fases del metabolismo primario
Productos de
desecho

Movimiento
Anabolismo
E E Transporte de solutos
(biosntesis)

Catabolismo
Componentes
(degradacin)
celulares

Fuente de energa

El metabolismo, segn su funcin energtica puede ser:

anabolismo y catabolismo
El anabolismo es la fase de construccion de molculas
constitutivas de la clula, y el catabolismo es la fase
generadora de energa.
Catabolismo. Oxidaciones biolgicas
En el catabolismo las molculas complejas como los
azucares se oxidan para dar lugar a molculas ms
simples como el cido lctico, CO2, agua, etc.
Este proceso de oxidacin o combustin va acompaada
de liberacin de la energa qumica contenida en las
molculas que se degradan

Combustibles CO2 + H2O + ENERGA

Estas reacciones son generalmente de oxidacin, es

decir, suceden con prdida de electrones, de los sustratos
que se degradan.
Tambin pueden incluir la transferencia de tomos de
hidrgeno, por reacciones de deshidrogenacin.
 Anabolismo. Reacciones de reduccin
En este proceso, generalmente se construyen molculas
orgnicas altamente hidrogenadas por un proceso de
reduccin a partir de molculas simples. Esto requiere
electrones y protones para reducir a sus precursores.
ENERGA + Molculas pequeas molculas complejas
En resumen, el anabolismo es un proceso constructivo,
reductor que consume energa.
 PRINCIPIOS DE BIOENERGTICA
Termodinmica bioqumica.
Sistema: un sistema termodinmico es la parte del
universo que se est observando. El entorno es el resto del
universo.
Termodinmicamente, las clulas vivas y los organismos
son sistemas abiertos que intercambian materia y energa
con el entorno.

Estado de un sistema: es la forma de comportarse del

sistema en un instante dado.
Funciones de estado: aquellas funciones termodinmicas
cuyo valor depende slo del estado del sistema.
Volumen V, Presin P, Entalpa H, Energa libre G, etc.
 Principios de la termodinmica
Las reacciones metablicas se rigen por las leyes de la
termodinmica: Principio de conservacin de la energa; Aumento
natural del desorden, y funciones de estado.
Las clulas, son sistemas bsicamente isotrmicos, por lo que las
variaciones de energa se dan en valores G y no de H.
G es la funcin de estado que gobierna procesos que se realizan a
temperatura y a presin constantes.
H = ENTALPA (contenido calrico del sistema) (J/mol)
Segunda ley de la termodinmica.
Si en un sistema se produce una transformacin, la variacin de
las funciones de estado dependen nicamente de los estados
inicial y final, y no del camino por el que se realiza la
transformacin.
G= H- TS
G: Es una funcin
de estado: (depende
del estado inicial y
final, no del camino
seguido o mecanismo)
 Energa libre G
Es la parte de energa de un sistema capaz de hacer trabajo a
presin y T, constantes. Es la nica energa que pueden utilizar las
clulas.
G (-), EXERGNICA, favorable o espontnea
G (+), ENDERGNICA, no espontnea.
G=0, equilibrio

G = H TS
Conociendo G de una reaccin, se podr predecir si es espontnea o no.
G = 0 Proceso en equilibrio
G >0, Reaccin endergnica, consume energa
G < 0 Reaccin exergnica, genera energa (espontnea
Primera ley: conservacin de la energa
La energa no se crea ni se destruye, solo se transforma
de una forma a otra
Ej: las clulas obtienen energa qumica de las molculas
nutrientes, que tienen energa potencial, (o de la energa
solar) la cual se libera por reacciones de oxidacin, en el
catabolismo. Esta energa es luego utilizada para las
reacciones de biosntesis, con formacin de nuevas clulas
(reproduccin celular), y calor.
 Tercera ley: Direccin de los procesos
favorables.
"en todo proceso el desorden total del universo aumenta
Entropa S= la energa de un sistema que no puede
utilizarse para realizar un trabajo til.
Si se incrementa la entropa, los productos presentan un
mayor desorden molecular (mayor entropa) que
los reactivos.

En las reacciones catablicas, las molculas complejas se

degradan en molculas simples con liberacin de energa.
 Relaciones bioenergticas
Las reacciones qumicas son
transformaciones energticas
por rompimiento o formacin de
enlaces.
Los nutrientes que usan las
clulas tienen energa qumica que
est almacenada en los enlaces
entre los tomos de una molcula,
y pueden liberarla (exergonico)
En cambio, la formacin de
nuevas molculas celulares,
consume energa en la
construccin de nuevos enlaces
(Endegonico).
En una clula estos procesos se
acoplan. El primer y segundo
principio predicen que la diferencia
de energa se libera como calor.
 Acople catabolismo-anabolismo
La transferencia de MOVIMIENTO
energa entre catabolismo OSMOSIS
FUENTES DE ENERGA
y anabolismo, sucede a
travs de dos ADP
mecanismos qumicos:

Mecanismo de

CATABOLISMO

ANABOLISMO
molculas
transportadoras (ATP) o
sistema ATP/ADP.

Mecanismo de transporte ATP

de electrones, o sistema
(NADH) CALOR

PRODUCTOS PRECURSORES
 Sistema ADP/ATP
Se usa una molecula transportadora de energa.
Las clulas almacenan y liberan energa en forma de
energa qumica de un enlace fosfato del trifosfato de
adenosina (ATP).
El enlace anhdrido que une el segundo y tercer grupos
fosfato, es un enlace que consume o libera una cantidad
importante de energa cuando se forma o cuando se rompe
(7.3 Kcal/Mol).
 Hidrolisis del ATP
Al hidrolizarse el ATP se rompe el ltimo
enlace ster fosfrico, formndose ADP y
liberndose una molcula de fosfato
(desfosforilacin) y energa
ATP + H2O ADP + Pi + Energa (7,3
kcal/mol)
ATP + H2O ADP + Pi
ADP + H2O AMP + Pi
 Otros compuestos de alta energa

El ATP es la molcula que ms se utiliza para almacenar y

transportar energa pero no la nica, existen otros
nucletidos UTP, GTP etc que hacen una funcin similar
 Formacin del ATP

Para impulsar sus reacciones anablicas, las clulas

requieren sintetizar y almacenar ATP
El ATP se forma por fosforilacin del ADP, en un proceso
endergnico.

Los mecanismos de sntesis de ATP son:

fotofosforilacin: fotosntesis
fosforilacin oxidativa
fosforilacin a nivel de substrato
Fosforilacin a nivel de sustrato.
El ATP se sintetiza porque una molcula energizada (con grupos
fosfato) cede un grupo fosfato al ADP, transformndolo en ATP .
Fosforilacin oxidativa.
La fosforilacin del ADP se lleva a cabo gracias a la energa que
desprende el transporte de electrones a travs de una cadena
transportadora de los mismos, desde una molcula muy reductora
(NADH.H) que se oxida y los cede hasta un aceptor final. Proceso
similar al de flujo elctrico.
Estas cadenas transportadoras de electrones se sitan en la
membrana celular de las bacterias, o en la membrana interna de
las mitocondrias.
 Coenzimas Acarreadores de electrones

NAD = NICOTINAMIDA
ADENINA DINUCLETIDO
Es una coenzima, formada
por dos nucletidos unidos
a travs de sus grupos
fosfatos. Su funcin es la
transferencia de electrones.
NAD+ en su forma oxidada
(aceptor de electrones) y
NADH en su forma reducida
(donador de electrones).
El sistema de dobles
enlaces conjugados, implica
tres carbonos y un
nitrgeno participando en la
reaccin de
oxidorreduccin.
 Mecanismos de deshidrogenaciones dependientes de
El esquema muestra las NAD+:
transformaciones del anillo de
la nicotinamida en el transcurso
de una reaccin redox.
El centro reactivo de
nicotinamida, se reduce
incorporando en su ncleo dos
electrones, los que son
aportados por el sustrato que
se oxida (en este caso un
alcohol), en forma de ion
hidruro H- (el ion hidruro
contiene un protn y dos
electrones y por lo tanto tiene
carga negativa).
La forma oxidada de la
coenzima tiene una carga
positiva, al incorporar en su
estructura los equivalentes de
reduccin en forma de in
hidruro, la molcula queda
elctricamente neutra.
Otros acarreadores de electrones: FAD
El FADH2 (Flavn Adenin Dinucletido reducido) acta como
coenzima de las enzimas de oxidacin-reduccin conocidos
como flavoprotenas.
FAD + 2H+ + 2 e- FADH2

la oxidorreduccin del grupo prosttico de las

flavoprotenas, como el FAD, se describe por:
 TRANSPORTE DE NUTRIENTES
Sucede a travs de la
membrana celular.
Los lpidos restringen el
paso de sustancias
solubles en agua (polares).
El agua es una excepcin
por tener un pequeo
volumen molecular.

TIPOS DE TRANSPORTE
Difusin pasiva
Mecanismos de transporte
Difusin facilitada
Transporte activo: (cambio
conformacional,
translocacin de grupo
 Difusin pasiva- Osmosis

Difusin de agua
a travs de una
membrana que
permite el flujo de
agua, pero no el de
la mayora de
solutos.

La presin
osmtica.
Osmosis y membrana celular
 Difusin facilitada
Es impulsada por la energa
potencial derivada de las diferencias
de concentracin.
La difusin facilitada utiliza canales
(formados por protenas de
membrana) para permitir que
molculas cargadas (que de otra
manera no podran atravesar la
membrana) difundan libremente
hacia afuera y adentro de la clula.
Estos canales son usados sobre
todo por iones pequeos tales como
K+, Na+, Cl-.
La glucosa entra en la mayor parte
de las clulas por difusin facilitada.
 Transporte activo
Requiere gasto de
energa para
transportar la
molcula de un lado al
otro de la membrana.

Ocurre contra el
gradiente de
concentracin.
La clula con sume
ATP como fuente de
energa.
Mecanismo de cambio conformacional
 FUENTES DE MATERIA Y ENERGIA
Segn las fuentes de carbono y
de energa, los organismos
pueden ser:
Por fuentes de carbono:
Auttrofos. Fuente de C, es el
CO2
Hetertrofos. Molculas
carbonadas complejas
Por fuentes de energa.
Fotgrafos. Fuente de E la luz
Quimitrofos. Fuente de E
qumica. Descomposicin de
molculas reducidas:
(fosforilacin oxidativa,
fosforilacin a nivel de substrato)
Categoras de los organismos segn su metabolismo
 Combinaciones
Los quimiolitoauttrofos. Obtienen energa de la oxidacin de
compuestos inorgnicos y carbono de la fijacin del CO2.
Ejemplos: bacterias oxidantes del azufre, bacterias oxidantes
del hierro, etc.
Los fotolitoauttrofos . Obtienen energa de la luz y carbono de la
fijacin del CO2, usando compuestos inorgnicos como
reductores. Ejemplos: Cyanobacteria (agua como equivalente
reductor), Chlorobiaceae (sulfuro de hidrgeno).
Los quimiolitohetertrofos. Obtienen energa de la oxidacin de
compuestos inorgnicos, pero no pueden fijar CO2. Ejplo:
algunos Nitrobacter spp., Wolinella (con hidrgeno como
equivalente reductor), algunas bacterias oxidantes del
hidrgeno.
Los fotoorganotrfos. Obtienen energa de la luz y el carbono y
los equivalentes reductores de compuestos orgnicos
 RUTAS METABLICAS.
Las reacciones que integran el metabolismo celular, no
son independientes sino que estn asociadas formando las
denominadas rutas metablicas o vas metablicas.
Una ruta o va metablica es una secuencia ordenada de
reacciones.
Adems, en la clula, cada proceso metablico tiene una
localizacin concreta, asi: la glucolisis ocurre en el citosol,
el ciclo de Krebs en las clulas eucariotas ocurre en la
mitocondria, etc.
Las rutas metablicas pueden ser: catablicas o
anablicas.
 Rutas catablicas
La degradacin de las molculas orgnicas (polisacridos,
lpidos y protenas) sucede por reacciones enzimticas
consecutivas organizadas en tres fases principales.
En la fase I del catabolismo, las grandes molculas
nutritivas se degradan o desdoblan. As los polisacridos
se degradan en hexosas o pentosas, los lpidos producen
cidos grasos y glicerina, y las protenas en sus
aminocidos.
En la fase II del catabolismo todos los productos de la
fase anterior se convierten en un pequeo nmero de
intermediarios ms sencillos, como el grupo acetilo del
acetilCoA.
En la fase III los grupos acetilo del acetil-CoA, y otros
productos de la fase II, son oxidados a dixido de carbono
y agua.
 Rutas anablicas
La biosntesis tiene tres
etapas:
En la etapa III se generan
pequeas molculas
precursoras que se convierten
en la fase II en molculas
sillares; stas, a su vez, se
ensamblan en la fase I para
construir macromolculas.
Las rutas catablicas tienen
un origen difuso y convergen
en la fase III.
Las rutas anabolicas son
divergentes; parten de
precursores en la fase III y
luego se ramifican formando
diferentes biomolculas.

La fase III constituye una ruta

comn que se conoce como
 Caractersticas de las reacciones metablicas
Aunque las reacciones metablicas pueden ser de distinta
naturaleza, todas ellas se caracterizan por:
Cada reaccin metablica tiene su enzima catalizador.
El metabolismo se produce por secuencias especficas e
interdependientes de reacciones enzimticas

El conjunto de reacciones que constituyen un proceso

metablico recibe el nombre de va o ruta metablica.
Las reacciones metablicas suceden en medio acuoso; por
tanto, los reactivos y los productos se encuentran en disolucin.
Las reacciones metablicas son bsicamente de
oxidorreduccin, e implican transferencia de electrones y de
energa.
Las reacciones metablicas tienen lugar en compartimentos
especializados de las clulas (mitocondrias, lisosomas,
cloroplastos), lo que permite que se desarrollen
simultneamente y sin interferencias entre ellas.
 Regulacin de las rutas metablicas
Algunas vas metablicas pueden ser regulables.
En su conjunto, las vas metablicas son reversibles
PERO TIENEN POR LO MENOS UN PASO
IRREVERSIBLE (PASO LIMITANTE)
Sirve para que:
La velocidad de la va est adaptada a las
necesidades de la clula
Las vas de sntesis y degradacin no estn activas a
la vez.

Se da a tres niveles:
1. Por los enzimas alostricos, capaces de cambiar la
actividad cataltica en respuesta a moduladores
estimuladores o inhibidores.
2. Mediante regulacin hormonal.
3. Por regulacin de la concentracin de un enzima en
la clula (regulacin gentica)
REFERENCIAS