Bioqumica e Biofsica

Aminocidos.
Quiralidade.
Comportamento cido-base.
Classificao dos aminocidos.
Pptidos (ou peptdeos).
Protenas. Polmeros de aminocidos.
Ligao peptdica.

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Aminocidos
Podem ser qualquer cido carboxlico contendo um grupo amina.
So normalmente classificados como , , ou aminocidos (etc)
consoante a posio do grupo amina.

So conhecidos mais de 700 aminocidos (a.a.) naturais.

Destes, destacam-se 20 a.a., que merecem uma ateno especial: so
os que esto normalmente presentes nas protenas.
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Aminocidos
Todas as clulas do nosso corpo necessitam de aminocidos.
Os aminocidos so essenciais para a sntese de protenas e enzimas.

obtidos
sintetizados
pela
pelo
alimentao corpo
Aminocidos
essenciais
Aminocidos
Leucina Metionina no-essenciais
Isoleucina Fenilalanina
Valina Treonina Alanina Glutamina
Histidina Triptofano Arginina Glicina
Lisina Asparagina Prolina
cido asprtico Serina
Cistena Tirosina
cido glutmico

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-Aminocidos
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Os -aminocidos obtidos por hidrlise de uma protena tm uma base

estrutural comum, diferindo apenas na natureza do grupo R.
A influncia do grupo R determinante nas propriedades do a.a.

H O
+
H3N C C O

R
A glicina o a.a. mais simples e o nico em que o carbono no
quiral:
H O
+
H3N C C O

H (Gly ou G)
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Exemplos de -aminocidos
H O
+
H3N C C O

(Gly ou G)
H

H O H O
+ +

H3N C C O H3N C C O

CH3 CH(CH3)2
Alanina (Ala ou A) Valina (Val ou V)
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Bioqumica e Biofsica

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Aminocidos componentes das protenas

Apolares, grupos R alifticos

Glicina Alanina Prolina Valina

Leucina Isoleucina Metionina 8

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Aminocidos componentes das protenas
Polares, grupos R sem cargas

Serina Treonina Cistena

Asparagina Glutamina 9
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Aminocidos componentes das protenas

Grupos R aromticos

Fenilalanina Tirosina Triptofano

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Aminocidos componentes das protenas

Grupos R com carga positiva

Lisina Arginina Histidina

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Aminocidos componentes das protenas

Grupos R com carga negativa

Aspartato Glutamato

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DESIGNAO D/L PARA COMPOSTOS QUIRAIS
Configuraes relativas

Exceptuando a glicina (que no quiral), todos os a.a. componentes das

protenas tm configurao relativa L.
H, no entanto, muitos aminocidos naturais com configurao relativa D.
A D-alanina, por exemplo, um constituinte das paredes celulares das
bactrias.
O ponto importante a realar o facto de os aminocidos com configurao
relativa D no serem constituintes das protenas. 13
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-Aminocidos
Comportamento cido-base

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Os aminocidos so slidos cristalinos, no volteis, que fundem com

decomposio a temperaturas bastante elevadas (superiores a 200oC).
So insolveis em solventes apolares (ter de petrleo) e solveis em
solventes polares (gua).
Tm momentos dipolares superiores aos das aminas e aos dos cidos
carboxlicos simples.

So menos acdicos do que a maioria dos cidos carboxlicos e menos

bsicos do que a maioria das aminas.

parte
cida O pKa ~ 10-10

H3N CH C O
parte
R bsica pKb ~ 10-12

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Estas propriedades conjugam-se perfeitamente com uma

estrutura inica dipolar.

Os aminocidos so anfotricos, pois contm um grupo

funcional cido e um grupo funcional bsico.
O
H3N CH C O
H+ R H+
OH-
O OH- O
H2N CH C O H3N CH C OH
R R
A forma predominante depende do pH do meio!!!
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Consideremos a glicina a pH = 1

Nesta situao, tanto o grupo CO2H como o grupo NH3+ tm carcter cido.
Se o pH for aumentado lentamente (por exemplo numa titulao), qual dos
protes ser removido em primeiro lugar? Isso depender dos valores de pka
dos dois grupos!

Sendo o grupo CO2H o mais cido, este perder o proto em primeiro lugar.
O O
H3N CH C OH + OH- H3N CH C O + H2 O
H pKa1= 2.34 H
O pka1 calculado para este primeiro passo de 2,34, ou seja, o grupo CO2H da
glicina um cido consideravelmente mais forte do que o esperado para um
cido carboxlico normal (pka ~ 5).
Esta maior acidez do grupo CO2H dos aminocidos devida ao efeito indutivo
do grupo NH3+ que ajuda a estabilizar o anio carboxilato formado aps a
perda do proto (H+). 17
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E a titulao do segundo proto?
Verifica-se que o pka2 da glicina 9.6, ou seja da mesma ordem do
observado para a maioria dos sais de amnio.

Ou seja, globalmente a titulao da glicina pode ser descrita como:

Espcie Espcie Espcie

com carga +1 com carga 0 com carga -1

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pI: ponto isoeltrico o valor de pH para o qual a concentrao da

espcie com carga global nula mxima.

O valor do ponto isoeltrico especfico de cada aminocido.

uma constante que depende apenas do valor dos pkas

Aminocidos diferentes tm valores de pI diferentes, isto ,

apresentam carga nula a diferentes valores de pH.

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Ponto isoeltrico da valina

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Ponto isoeltrico de aminocidos cidos e bsicos

Ponto isoeltrico para o cido asprtico

O ponto isoeltrico para o cido asprtico calculado com os dois

pKa entre os quais est presente a espcie com carga global zero.

Neste caso ser:

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Ponto isoeltrico de aminocidos cidos e bsicos

Ponto isoeltrico para a lisina

O ponto isoeltrico para a lisina calculado com os dois

pKa entre os quais est presente a espcie com carga global zero.

Neste caso ser:

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Curva de titulao da glicina

OH (equivalentes) 23
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Curva de titulao de um aminocido cido

OH (equivalentes) 24
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Curva de titulao de um aminocido bsico

OH (equivalentes) 25
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Se a um dado valor de pH, diferentes aminocidos

apresentam espcies com cargas diferentes, isso pode ser
usado para os separar (se estiverem misturados!)
Electroforese: tcnica de separao e purificao baseado no movimento
de partculas carregadas, num campo eltrico. Esta tcnica muito usada
na separao de aminocidos, peptdeos e protenas e baseia-se na
diferente deslocao destas espcies quando submetidas a uma diferena
de potencial eltrico.

ctodo nodo

Arginina Alanina cido asprtico

pI = 10,76 pI = 6,02 pI = 2,98
A que pH foi feita a electroforese? 26
 Bioqumica e Biofsica
EXEMPLO DE ELECTROFORESE
Considere uma mistura dos 4 aminocidos seguintes:

O que acontece a cada um destes a.a. se submetermos a mistura

a electroforese a pH = 6?

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Protenas: so polmeros de a.a. que desempenham

funes vitais nos organismos vivos.
Principais constituintes dos tecidos animais
(pele, msculos, tendes, etc..)
Enzimas

Polipeptdeos: so estruturas polimricas, menores do

que as protenas, contendo algumas dezenas de
aminocidos que, em alguns casos, desempenham
funes biolgicas importantes.

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Reaes de condensao e de hidrlise

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Formao da ligao peptdica

Ligao peptdica (amida)

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Formao de um dipeptdeo

Os mesmos aminocidos podem dar

origem a um peptdeo isomrico:
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Formao de um tetrapeptdeo
4 Aminocidos (monmeros)

H R H R H R H R
H C O H C O H C O H C O
N C H N C H N C H N C H

H O H O H O H O

Monmero 1 Monmero 2 Monmero 3 Monmero 4

Reao de H2O H2O H2O

condensao

Polipeptdeo
H R H R H R H R
H C C C C O
N C N C N C N C H

H O H O H O H O

Resduo 1 Resduo 2 Resduo 3 Resduo 4

Condensao
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Exemplo de um pentapeptdeo

Terminal - N Terminal - C

Ser-Gly-Tyr-Ala-Leu

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Peptdeos naturais
Insulina (regula o metabolismo da
glucose) duas cadeias de peptdeos
com um total de 51 aminocidos.
As duas cadeias esto ligadas por
ligaes dissulfeto.

Bradiquinina (mediador da inflamao)

peptdeo com 9 aminocidos.

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Peptdeos naturais

Algumas serpentes e aranhas produzem venenos poderosos que so

peptdeos.
Por exemplo, o veneno da mamba verde um polipeptdeo com 61
aminocidos

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Medicamentos com ligaes peptdicas
Boceprevir e Telaprevir medicamentos usados no tratamento da
hepatite C

Boceprevir Telaprevir

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