TALLER BIOLOGA MOLECULAR, Jos Miranda Gmez

1. Describa la diferencia entre la organizacin polimrica del ADN y la del ARN

Existen numerosas diferencias entre el ADN y el ARN. Las ms importantes se

refieren a la presencia de diferentes glucosas en las molculas de ambas. Ribosa en
al ARN y desoxirribosa en el ADN.

ADN: cido desoxirribonucleico

ARN: cido ribonucleico.

A pesar de que el ADN y el ARN consisten en unidades repetidas de

nucletidos, como hemos visto antes, la diferencia est en la glucosa. Por lo
dems, el ARN una gama mucho ms amplia de cidos nucleicos, unas 4
veces ms grande comparado con el ADN. Esta singularidad del ARN le
confiere una mayor capacidad para asumir diferentes formas y funciones.

El ADN lleva a cabo la parte ms importante, que es la de seleccionar el

cdigo gentico que se va a transmitir a la siguiente generacin, y el ARN va a
ser el encargado de transmitir dicho cdigo, digamos que el ADN lo escribe y el
ARN lo transporta. El ADN funciona en dos fases y el ARN en una sola fase,
pero los dos son de una importancia crtica para la evolucin y ambos se
necesitan el uno del otro.

La desoxirribosa en el ADN contiene enlaces CH por lo que es ms estable y

reacciona menos en condiciones alcalinas. El ADN resulta muy difcil de atacar
por enzimas u otras sustancias perjudiciales. En cambio, la diferencia con la
ribosa, es que es ms reactiva con enlaces C-OH y no es tan estable en
condiciones alcalinas, lo que le confiere una gran vulnerabilidad a los ataques
de enzimas o la exposicin a rayos ultravioletas.

Tanto el ADN como el ARN son cidos nucleicos, pero tienen algunas
diferencias bsicas. Tal y como hemos explicado antes, el ADN agrupa sus
protenas en forma de hlices pero a pares, siendo una doble cadena, mientras
que el ARN, forma una hlice simple.
 La misin final del ADN es la de llevar a cabo el almacenamiento a largo plazo y la
trasferencia al futuro vstago de la informacin gentica. El ARN, por otra parte,
realiza la funcin de mensajero entre el ADN y los ribosomas.

El ADN se encuentra siempre en el ncleo, en cambio el ARN puede encontrarse

tanto en el ncleo como en el citoplasma.

Podemos resumir las anteriores diferencias en estas 4 diferencias principales:

El ARN usa ribosa y el ADN desoxirribosa

El ADN tiene doble cadena de hlice y el ARN cadena simple
El ADN es estable en condiciones alcalinas, pero al ARN no lo es.
El ADN almacena y guarda la informacin gentica, pero el ARN hace de
mensajero.

2. Explique la relacin que existe entre la diferencia de tamao entre el ADN y

el ARN y los procesos fisiolgicos en los cuales estn implicadas estas
molculas.

El ADN debe ser ms grandes puesto que contiene todas la informacin gentica de
un ser vivo.

El ARN solo es UN SEGMENTO DE ADN recuerda que hay 3 tipos de ARN,

1) ARN ribosmico.

2) ARN mensajero.

3) ARN de transferencia.

Cada uno de estos tiene una funcin diferente pero muy especfica dentro de cualquier
clula

ADN.

1) Contiene un azcar (desoxirribosa)

2) una de las siguientes bases nitrogenadas (adenina, timina, guanina y citosina).

3) Se podra decir que son 2 cadenas de ARN complementarias entre si

ARN.

1) contiene un azcar (en este caso ribosa)

2) contiene las siguientes bases nitrogenadas (adenina, guanina, citosina y uracilo).

3) es solo una cadena en comparacin del ADN.

En conclusin el ADN es ms grande debido a que contiene mas componentes
qumicos es por eso que se encuentra empaquetado en los cromosomas.

Mientras que el ARN es solo un pequeo segmento muy corto de ADN adems de ser
qumicamente diferente en unos aspectos.

3. Describa la razn por la cual los cidos nucleicos son cidos

Son cidos por qu tienen un radical fosfato (PO4), que es un cido, aunque tambin
son bases por algunos nitrgenos qu contienen, y nucleicos por estar en el ncleo de
la clula, el (ico) es por lo mismo de ser acido

4. Explique por qu las hlices que conforman la doble hlice de ADN son
complementarias y antiparalelas.

La base de una cadena que se une por los puentes de hidrgeno con la base de la
otra cadena se dice que forman un par de bases. La A se aparea con la T a travs
de dos puentes de hidrgeno y la G con la C mediante tres puentes de hidrgeno,
es decir, se dice que ambas hebras son complementarias.

Otra caracterstica muy importante de la doble hebra de DNA es que ambas

cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3' (el que termina con un grupo
hidroxilo) de una se enfrenta al extremo 5' (el que termina con un grupo fosfato) de
la otra.

5. Que diferencia existe entre la replicacin conservativa, semiconservativa y

dispersiva.

La REPLICACIN es el proceso por el cual el DNA se copia para poder ser

transmitido a nuevos individuos.

Con el modelo de la doble hlice de Watson y Crick se desarroll la idea de que

las hebras originales deban servir de patrn para hacer la copia, aunque en
principio haba tres posibles modelos de replicacin:
 Modelo conservativo: Propona que tras la replicacin se mantena la molcula
original de DNA intacta, obtenindose una molcula idntica de DNA
completamente nueva, es decir, con las dos hebras nuevas.
Modelo semiconservativo: Se obtienen dos molculas de DNA hijas, formadas
ambas por una hebra original y una hebra nueva.

Modelo dispersivo: El resultado final son dos molculas nuevas formadas por
hebras en las que se mezclan fragmentos originales con fragmentos nuevos. Todo
ello mezclado al azar, es decir, no se conservan hebras originales ni se fabrican
hebras nuevas, sino que aparecen ambas mezcladas.

6. Explique la importancia de la formacin del surco mayor y surco menor en la

molcula de ADN.
 La torsin de la doble hlice del ADN y la geometra de las bases crea un hueco
ms amplio (llamado surco mayor) y un hueco ms estrecho (llamado surco
menor) que corren a lo largo de la molcula, como se muestra en la figura anterior.
Estos surcos son importantes sitios de unin para las protenas que mantienen el
ADN y regulan la actividad de los genes.

7. Cmo se calcula la temperatura de melting (Tm) en un oligonucletido de

una secuencia de ADN especfica.

La Temperatura de Fusin, Tm, de un oligonucletido es un valor de crtica

importancia. Su determinacin ms confiable y exacta es emprica, sin embargo,
es bastante tediosa.

Muchas frmulas tiles y prcticas se han desarrollado para calcular la Tm para

experimentos de PCR, Southerns, Northerns, y para hibridizaciones in situ

Los principales factores que afectan este valor son: concentracin de sales,
concentracin de ADN, presencia de agentes desnaturalizantes (DMSO o
formamida), secuencia, longitud y condiciones de hidridizacin.

La ecuacin ms simple para calcular la Tm est dada por la Regla de Wallace

Tm = 2(A+T) + 4(G+C)

En donde A, G, C, y T corresponden al nmero de cada nucletido presentes. Esta

ecuacin se desarroll para oligos 'cortos' de 14 a 20 bases que hibridizaran con
sus correspondientes complementarios unidos a una membrana con una
concentracin de NaCl 0.9M.

8. Explique la estructura primaria, secundaria y terciaria del ADN y el ARN

Estructura del DNA

En su estructura tridimensional, se distinguen distintos niveles:

Estructura primaria: Secuencia de nucletidos encadenados. Es en estas cadenas

donde se encuentra la informacin gentica, y dado que el esqueleto es el mismo para
todos, la diferencia de la informacin radica en la distinta secuencia de bases
nitrogenadas. Esta secuencia presenta un cdigo, que determina una informacin u
otra, segn el orden de las bases.

Estructura secundaria: Es una estructura en doble hlice. Permite explicar el

almacenamiento de la informacin gentica y el mecanismo de duplicacin del DNA.
Como he comentado en la introduccin histrica del DNA fue postulada por Watson y
Crick, basndose en: primero, la difraccin de rayos X que haban realizado Franklin,
Wilkins; y segundo, la equivalencia de bases de Chargaff, que dice que la suma de
adeninas ms guaninas es igual a la suma de timinas ms citosinas. En dicha cadena
doble, dextrgira o levgira segn el tipo de DNA, ambas son complementarias, pues
la adenina de una se une a la timina de la otra, y la guanina de una a la citosina de la
otra y adems son antiparalelas, pues el extremo 3 de una se enfrenta al extremo 5
de la otra. Las principales caractersticas son las siguientes: Las dos cadenas
helicoidales de polinucletido de giro hacia la derecha, se enrollan alrededor de un eje
comn formando una doble hlice. Al ser antiparalelas, sus puentes 3`,5`-fosfodister
van en direcciones contrarias. En un medio acuoso, el esqueleto covalente polar y con
carga de los grupos alternados de desoxirribosa y fosfato, se sitan en la parte
externa de la hlice, donde es favorable la interaccin con H20; las bases de purina y
pirimidina evitan el contacto con el agua, ocultndose al interior de la estructura. La
doble hlice es estabilizada por dos tipos de fuerzas: - Puentes de hidrgeno. -
Interacciones hidrofbicas y de van der Waals entre las bases apiladas. Quizs la
caracterstica ms importante de la doble hlice que le permite funcionar en el
almacenamiento y transferencia de la informacin gentica es el apareamiento de
bases complementarias. Esta combinacin lleva el mximo nmero posible de puentes
de hidrgeno y tambin permite que los pares de bases tengan la mxima estabilidad.

Estructura terciaria: Se refiere a como se almacena el DNA en un volumen reducido.

Vara segn se trate de organismos procariotas o eucariotas: En procariotas: se pliega
como una sper-hlice en forma, generalmente, circular y asociada a una pequea
cantidad de protenas. Lo mismo ocurre en las mitocondrias y en los cloroplastos. En
eucariotas: el empaquetamiento ha de ser ms complejo y compacto y para esto se
necesita la presencia de protenas, como son las histonas y otras de naturaleza no
histnica.

Estructura del ARN

Estructura primaria: Al igual que el ADN, se refiere a la secuencia de las bases

nitrogenadas que constituyen sus nucletidos. La estructura primaria del ARN es
similar a la del ADN, excepto por la sustitucin de desoxirribosa por ribosa y de timina
por uracilo. La molcula de ARN est formada, adems por una sola cadena.

Estructura secundaria: A diferencia del ADN, las molculas de ARN son de cadena
simple y no suelen formar dobles hlices extensas. No obstante, s se pliega como
resultado de la presencia de regiones cortas con apareamiento intramolecular de
bases, es decir, pares de bases formados por secuencias complementarias ms o
menos distantes dentro de la misma hebra. El ARNt posee aproximadamente 60.

Estructura terciaria: Una vez que se forma el ARN, como las protenas requiere
someterse a cambios para formar una estructura terciaria especfica. El andamio para
esta estructura es proporcionado por elementos estructurales secundarios que son
enlaces de hidrgeno en la molcula. El filamento forma bucles de horquilla, bultos y
bucles internos. Ya est cargada RNA, iones metlicos como Mg2 + son necesarios
para estabilizar muchas estructuras secundarias y terciarias.

Las estructuras terciarias de ARN se determinan usando asignacin de interferencia

de sondeo y modificacin qumica, cristalografa de rayos x y resonancia magntica
nuclear (RMN), criomicroscopa electrnica.
9. Explique la estructura y funcin de los micros ARNs. En que procesos
fisiolgicos estn implicados?

Estructura de los microARNs en el genoma

Los genes codificadores para microARNs pueden estar localizados en diferentes

regiones del genoma8, 21. Con base en lo cual son clasificados en:

(i) microARNs exnicos localizados en transcriptos no codificantes

(ii) microARNs intrnicos localizados en transcriptos no codificantes
(iii) microARNs intrnicos localizados en transcriptos codificantes para
protenas
(iv) microARNs exnicos localizados en transcriptos codificantes para
protenas22.

Adicionalmente, existen tambin algunos microARNs ubicados en unidades

transcripcionales que son expresados en grupo23.

Biognesis y procesamiento de los microARNs

En una gran proporcin los microARNs son generados a partir de un transcripto
primario largo, en un proceso secuencial de dos reacciones las cuales son guiadas
por Drosha y Dicer, en la llamada va cannica de generacin de microARNs. Sin
embargo, actualmente han sido descritos microARNs generados por vas alternas
llamadas vas no cannicas9, muchos de los microARNs procesados por estas
vas no satisfacen la definicin clsica de microARNs.

Va cannica de biognesis de microARNs

En la va cannica los microARNs son inicialmente transcriptos en el ncleo a
partir de precursores largos de ARN llamados microARNs primarios o (pri-
microARNs, del ingls primary transcritps). La transcripcin de los genes de
microARNs generalmente es mediada por la ARN polimerasa II24; sin embargo,
un grupo menor de microARNs asociados con repeticiones Alu pueden ser
transcriptos por la ARN Polimerasa III25. Los (pri-microARNs) generados por la
ARN polimerasa II tienen usualmente varias kilobases de longitud y contienen
estructuras en forma de horquilla compuesta de un tallo y un bucle.

Importancia biolgica de los microARNs:

Los microARNs tienen diferentes funciones regulatorias a nivel del desarrollo y

proliferacin celular en diferentes organismos. De igual forma, los microARNs
median diferentes procesos en tumorognesis, como inflamacin, regulacin del
ciclo celular, respuesta a estrs, diferenciacin, apoptosis e invasin. En clulas
madre de tejidos somticos, los microARNs tienen diferentes funciones incluyendo
la regulacin de mltiples pasos de la hematopoyesis, modulacin de la
miognesis y cardiognesis, diferenciacin osteognica y de la piel15. Los
microARNs tambin actan como oncogenes y genes supresores de tumor, estos
 microARNs son denominados en el idioma ingls como "oncomirs"16 y presentan
diferentes patrones en sus funciones, tasa de evolucin, expresin, distribucin
cromosmica, tamao molecular, factores de transcripcin y blancos17. Dada la
importancia de los microARNs en los procesos de tumorognesis y su expresin
en enfermedades especficas, tienen un gran potencial como blancos teraputicos
y nuevos biomarcadores para pronstico y diagnstico de cncer18. Por lo que se
ha propuesto que la manipulacin de la actividad y biognesis de los microARNs
como una estrategia para el desarrollo de terapias eficaces contra el cncer19.

10. Explique cmo se produce el giro dextrgiro y levgiro de la cadena de ADN.

La Doble hlice es una espiral Dextrgira, esto es, cada una de las cadenas de
Nucletidos gira a derechas; esto puede verificarse si nos fijamos, yendo de abajo
a arriba, en la direccin que siguen los segmentos de las hebras que quedan en
primer plano. Si las dos hebras giran a derechas se dice que la doble hlice es
dextrgira, y
Si giran a izquierdas, levgira (esta forma puede aparecer en hlices alternativas
debido a cambios conformacionales en el ADN). Pero en la conformacin ms
comn que adopta el ADN, la doble hlice es dextrgira, girando cada par de
bases respecto al anterior unos 36.

ADN-A: Dextrgiro (con ADN-B: Dextrgiro (con giro ADN-Z: Levgiro (con
giro a la derecha) a la derecha) giro a la izquierda)
BIBLIOGRAFA:

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