Entits de recherche

valuation du HCERES sur lunit :

Laboratoire de Biotechnologies Vgtales appliques
aux plantes aromatiques et mdicinales
BVpam
sous tutelle des
tablissements et organismes :
Universit Jean Monnet Saint-tienne - UJM
Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS

Campagne dvaluation 2014-2015 (Vague A)

 Entits de recherche

Pour le HCERES,1 Au nom du comit dexperts,2

Didier HOUSSIN, prsident Philippe POTIN, prsident du comit

En vertu du dcret n2014-1365 du 14 novembre 2014,

1 Le prsident du HCERES "contresigne les rapports d'valuation tablis par les comits d'experts et signs par leur prsident." (Article 8,
alina 5)
2 Les rapports d'valuation "sont signs par le prsident du comit". (Article 11, alina 2)
Laboratoire de Biotechnologies Vgtales appliques aux plantes aromatiques et mdicinales, BVpam, U Saint-tienne, CNRS, Mme
Sylvie BAUDINO

Rapport dvaluation
Ce rapport est le rsultat de lvaluation du comit dexperts dont la composition est prcise ci-dessous.

Les apprciations quil contient sont lexpression de la dlibration indpendante et collgiale de ce comit.

Nom de l'unit : Laboratoire de Biotechnologies Vgtales appliques aux plantes

aromatiques et mdicinales

Acronyme de l'unit : BVpam

Label demand : FRE CNRS

N actuel : EA3061

Nom du directeur Mme Sylvie BAUDINO

(en 2014-2015) :

Nom du porteur de projet Mme Sylvie BAUDINO

(2016-2020) :

Membres du comit d'experts

Prsident : M. Philippe POTIN, CNRS, Roscoff

Experts : Mme Anne-Genevive BAGNERES-URBANY, CNRS, Tours

Mme Michle BOITEL-CONTI, Universit de Picardie Jules Verne, Amiens

(reprsentante du CNU)

Dlgu scientifique reprsentant du HCERES :

M. Gabriele SORCI

Reprsentants des tablissements et organismes tutelles de l'unit :

M. Christophe DESRAYAUD (reprsentant de lcole Doctorale Sciences

Ingnierie, Sant - SIS - ED 488)

Mme Martine HOSSAERT, CNRS

M. Youcef OUERDANE, Universit Jean Monnet

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Laboratoire de Biotechnologies Vgtales appliques aux plantes aromatiques et mdicinales, BVpam, U Saint-tienne, CNRS, Mme
Sylvie BAUDINO

1 Introduction

Historique et localisation gographique de lunit

Le laboratoire BVpam a t cr en 1981 au sein de lUniversit Jean Monnet de Saint-tienne (UJM). Il est
dirig depuis janvier 2011 par Mme Sylvie BAUDINO qui a succd M. Laurent LEGENDRE (tous deux enseignants-
chercheurs de lUJM). Le laboratoire BVpam bnficie dune longue exprience dans les tudes morpho-anatomiques
des systmes scrteurs chez les plantes parfum, aromatiques et mdicinales (PAM), principalement de la famille
des Rosaces et des Lamiaces. Il a t labellis Jeune quipe en 1997 et quipe daccueil depuis 1999. Sous
limpulsion de sa directrice, lunit a dvelopp des liens forts avec diffrentes units de recherche du sud de la
France affilies au CNRS et demande la cration dune Formation de Recherche en volution (FRE) pour avoir
lopportunit de se rapprocher dune UMR accueillant sa thmatique.

quipe de direction

Mme Sylvie BAUDINO, directrice de lunit.

Nomenclature HCERES

Principal : SVE2_LS9 Biotechnologies, sciences environnementales, biologie synthtique, agronomie

Secondaire : SVE1_LS3 Biologie cellulaire, Biologie du dveloppement animal

SVE1_LS1 Biologie molculaire et structurale, biochimie

Effectifs de lunit

Nombre au Nombre au
Effectifs de lunit
30/06/2014 01/01/2016

N1 : Enseignants-chercheurs titulaires et assimils 6 6

N2 : Chercheurs des EPST ou EPIC titulaires et assimils

N3 : Autres personnels titulaires (nayant pas dobligation de recherche) 3 3

N4 : Autres enseignants-chercheurs (PREM, ECC, etc.)

N5 : Autres chercheurs (DREM, Post-doctorants, visiteurs etc.) 1

N6 : Autres personnels contractuels (nayant pas dobligation de

1
recherche)

TOTAL N1 N6 11 9

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Laboratoire de Biotechnologies Vgtales appliques aux plantes aromatiques et mdicinales, BVpam, U Saint-tienne, CNRS, Mme
Sylvie BAUDINO

Nombre au Nombre au
Effectifs de lunit
30/06/2014 01/01/2016

Doctorants 3

Thses soutenues 6

Post-doctorants ayant pass au moins 12 mois dans lunit 1

Nombre dHDR soutenues 2

Personnes habilites diriger des recherches ou assimiles 3 3

2 Apprciation sur lunit

Avis global sur lunit

Les thmatiques de recherche actuelles qui visent comprendre la diversit, les mcanismes de production et
de scrtion des composs organiques volatils (COV) des vgtaux aromatiques sont trs originales tant sur le plan
national quinternational et sont focalises travers 3 axes complmentaires bien identifis. Leurs tudes ont pour
but de mieux intgrer lensemble des facteurs qui modulent et expliquent la production des composs volatils par les
plantes. A travers les caractrisations biochimiques et gntiques de protines et gnes impliqus dans les voies de
biosynthse des parfums et huiles essentielles de plantes de la famille des Rosaces et des Lamiaces, ainsi que sur
leurs mcanismes de scrtion, les recherches de lunit apportent des connaissances fondamentales en cologie
fonctionnelle de ces familles de PAMs qui sont par ailleurs dun grand intrt conomique pour plusieurs filires
industrielles. Le laboratoire BVpam sappuie aussi sur une matrise reconnue de lanalyse des COVs par GC-MS et du
traitement des donnes associes, ce qui lui permet dintgrer ces approches dans une vision dcologie chimique. De
par ses collaborations historiques avec le laboratoire Reproduction et Dveloppement des Plantes (RDP UMR 5667, ENS
Lyon) et les rseaux nationaux sur la rose, le laboratoire a contribu lessor de la gnomique pour alimenter ses
approches biochimiques, mais aussi gntiques. Compte tenu de la taille de lunit, la production scientifique est
excellente et limpact moyen des publications reste stable. Les efforts consentis par lunit sur ses rsultats les plus
originaux devraient permettre une amlioration significative de limpact des publications du laboratoire. La visibilit
ainsi obtenue devrait donner lunit davantage de chances de succs lors des appels projets de recherche.

Lunit a suivi remarquablement les recommandations formules par le comit dexperts prcdent. Elle a
ainsi considrablement augment sa production scientifique dans un souci de valorisation optimale de ses travaux.
Elle sest aussi dote dun mode de gouvernance fdrateur qui a assur une forte cohsion de lensemble de lunit.

Points forts et possibilits lies au contexte

La thmatique de recherche de lunit, sur ltude des mcanismes de production des composs volatils chez
les plantes aromatiques et parfum, est unique en France. Elle bnficie aussi dun intrt accru linternational.

Les comptences de lunit sont solides la fois sur le plan de la biochimie fonctionnelle, de lanalyse
chimique des composs volatils et de lcologie chimique.

Linterface de cette thmatique entre la chimie des huiles essentielles et de lcologie chimique permet des
interactions avec les acteurs des 2 domaines, sur des aspects appliqus, mais aussi de plus en plus sur des aspects
fondamentaux en cologie ou en biochimie de la biosynthse des parfums des fleurs. Ceci sest traduit par un
doublement du nombre des publications au cours de ce contrat. Lunit a donc poursuivi et soutenu leffort lanc par
un article excellent publi dans PNAS lors du contrat prcdent.

Lunit bnficie dune excellente expertise trs reconnue dans le traitement des donnes mtabolomiques
multifactorielles pour les composs volatils, et cela tout particulirement grce aux comptences reconnues dun
enseignant-chercheur en bio-statistiques et bio-informatique. Cette expertise reprsente des opportunits de

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Laboratoire de Biotechnologies Vgtales appliques aux plantes aromatiques et mdicinales, BVpam, U Saint-tienne, CNRS, Mme
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collaborations avec de nombreuses quipes travaillant sur les fonctions des terpnes ou dautres COVs, par exemple
dans la rsistance au stress hydrique et dautres facteurs climatiques, ou encore en cologie volutive.

Les financements obtenus par les interactions avec les industriels du secteur de la parfumerie sont un atout
dcisif. Des programmes de recherche fdrateurs pour lunit ont ainsi t raliss (Claryssime 2008-2013 et 3
programmes avec la socit LMR-IFF) et tmoignent de collaborations public/priv exemplaires.

Luniversit de tutelle, lUJM, dialogue facilement et soutient trs fortement les orientations de lunit et son
ouverture nationale et internationale.

Lunit est fortement implique et moteur de rseaux comme celui du GDR 3658 Mdiation chimique dans
lenvironnementcologie Chimique (MdiatEC). Associ loriginalit et la pertinence de sa thmatique, ceci a
apport lunit une forte reconnaissance de lInstitut cologie et Environnement (INEE) du CNRS.

Lunit a considrablement amlior sa gouvernance avec ladoption en 2010 de statuts et leur mise en
application par llection dune nouvelle directrice.

Lunit a continu uvrer la mise en conformit de ses activits de recherche aux rgles dhygine et
scurit. Un document unique a t dit pour lanne 2013-2014. Ces efforts ont t reconnus par le Ministre lors
dune visite rcente sur site.

Points faibles et risques lis au contexte

Les faibles effectifs de lunit (essentiellement une quipe denseignants-chercheurs 50 % en recherche

maximum et un personnel technique restreint) ainsi que lisolement scientifique relatif (compens par des relations
avec les quipes lyonnaises et plusieurs rseaux nationaux) pourraient amener un puisement des permanents.

La valorisation des travaux de recherche est plus difficile compte tenu des espces vgtales non modles sur
lesquelles lunit travaille.

Le travail le plus original de lunit sur la biosynthse du parfum chez le rosier, avec la caractrisation du gne
de la protine commandant la production du graniol, essentiel lodeur des roses, na pas encore pu tre accept
dans une revue fort facteur dimpact. Une telle parution devrait amener une reconnaissance de lunit
linternational et faciliter de nouveaux financements.

Pendant toute la dure du prcdent contrat, tous les efforts de demandes de financement lANR ou au
niveau europen, en partenariats avec dautres laboratoires comme le RDP ou des membres de lancien GDR 2827
dcologie Chimique, ont chou. Le financement du laboratoire repose donc essentiellement sur des contrats avec
lindustrie et linterprofession. Ceci amne des risques notamment lis lobsolescence de matriels cls pour le
laboratoire comme des GC-MS et la microscopie mais galement limpossibilit de recruter des post-doctorants ou
des doctorants ddis des projets fondamentaux.

Recommandations

Fondamentalement, lunit est dans une excellente dynamique. Le comit dexperts encourage lunit a
poursuivre son projet de cration dune Formation de Recherche en volution (FRE) au sein de lINEE du CNRS.

Le comit dexperts recommande de poursuivre les efforts de focalisation sur deux thmatiques pour ne pas
disperser les forces :

1. Ltude des voies de biosynthse des COVs des plantes aromatiques, la fois sur le plan mcanistique et sur
leur rgulation dans un contexte gntique et gnomique, en se concentrant sur un nombre restreint de plantes.

Dans ce contexte, le comit dexperts encourage lunit a afficher son leadership dans le domaine des
mcanismes de production de parfums par la rose en marquant bien la spcificit de ses recherches sur les plan
biochimique, mais aussi gnomique et gntique vis--vis de lquipe du RDP de Lyon. La collaboration avec dautres
groupes linternational est aussi encourage dans un contexte de leadership pour le BVPam pour les plantes
tudies.

2. Les tudes de diversit des composs volatils en lien avec les facteurs environnementaux dans les
cosystmes mditerranens.

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Laboratoire de Biotechnologies Vgtales appliques aux plantes aromatiques et mdicinales, BVpam, U Saint-tienne, CNRS, Mme
Sylvie BAUDINO

Le comit dexperts recommande lunit de prenniser les liens avec des laboratoires complmentaires
danalyse des composs volatils de plantes odorantes (roses, lavandes) qui leurs permettent de dvelopper leurs
connaissances sur la diversit des parfums, pr-requis pour ltude des gnes de leurs voies de biosynthse.

Le comit dexperts encourage aussi lunit poursuivre sa recherche fondamentale en cologie volutive et
fonctionnelle qui permettra la fois de publier des rsultats originaux dans des revues fort facteur dimpact et de
maintenir lintrt du secteur commercial des PAMs pour les approches du laboratoire.

Le comit dexperts encourage galement lunit poursuivre son engagement en tant que leader dans ses
thmatiques dans des rseaux nationaux et internationaux.