Le contrôle de la division chez les

bactéries
Lydia Robert
(INRA MICALIS & Laboratoire Jean Perrin)

Avril 2014
 Le cycle cellulaire bactérien

Stewart et al. (2005) yazdi et al. (2012)

oriC

ter
 Le modèle de Donachie : l’initiation de la réplication à
masse constante

C+D

Time (min)
C

Doubling time (min)

Cooper & Helmsetter1968

Schaechter, Maaloe, Kjelgaard. 1958 Multi-fork replication

B Period C Period D Period
 Le modèle de Donachie : l’initiation de la réplication à
masse constante

Simulation ccycle
Cell mass

Applet4.jar

Time (min)
Donachie 1968
 Le modèle de Donachie remis en question
L’initiation à masse constante : vrai ou pas?
Wold et al. 1994 Bates et al. 2005

Quel lien entre l’initiation de la réplication et la division ?

Mutants avec altération de l’initiation: compensation dans la durée de réplication?
 Le contrôle spatio-temporel de la division chez E. coli

Le système min

From Männik et al 2012.

Occlusion du nucleoid
- Mulder & Woldringh 1989
- Discovery of Slma/Noc proteins
(Wu 2004; Bernhardt 2005)
 Le contrôle spatio-temporel de la division chez B.subtilis

Effet de l’initiation de la réplication

Harry et al.

Wu et al. 2011
Comment la cellule décide-t-elle de se diviser ?

Horloge interne ? mesure de taille?

OU
 Les modèles mathématiques de croissance-division

2 Classical PDE models

The « timer » model : the division rate is age-dependent, size-independent

Age = time elapsed since birth

The « sizer » model: the division rate is size-dependent, age-independent

 How does the bacterial cell decide to divide?
With Marie Doumic, Marc Hoffmann, Nathalie Krell

Is division triggered by a « timer »

or « sizer » mechanism ?

Data from Stewart et al. (2005) & Wang, Robert et al. (2010)
 Testing the « timer » and « sizer » models

Size (µm)
DATA Estimation of the experimental
age-size distribution

Age (min)

Estimation of Estimation of
Doumic et al. 2011
Doumic et al. 2012

Age-size distribution simulated with Age-size distribution simulated with

the « timer » model the « sizer » model
Size (µm)

Size (µm)
Age (min) Age (min)
The « timer » model does not fit the data
DATA
Stewart et al. Wang, Robert et al.

Size (µm)

Size (µm)
Age (min) Age (min)
SIMULATIONS of the TIMER model

Size (µm)
Size (µm)

Age (min) Age (min)

The « timer » model is sensitive to biologically irrelevant
hypotheses

Various assumptions on the growth law of very small and very large cells

Unrealistic for any exponentially growing organism

 The « sizer » model fits the data well

DATA
Stewart et al. Wang, Robert et al.
Size (µm)
Size (µm)

Size (µm) Age (min)

Age (min) Age (min)
SIMULATIONS of the SIZER model
Size (µm)

Size (µm)

Size (µm)

Age (min) Age (min)

Age (min)
Le modèle « Sizer »

Simulation

Estimation
 Acknowledgments

Marie Doumic, Marc Hoffmann, Nathalie Krell

Stéphane Aymerich, Didier Chatenay, Jérôme Robert, Marina Elez

… And thank you for your attention !