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Protocole n°001117004

Séminaire d’Epidémiologie Animale


Les différents types d’enquêtes

Les différents types d’enquêtes

• Etudes descriptives et analytiques


• Les enquêtes transversales
• Les enquêtes cohortes
• Les enquêtes cas/témoins
• Compléments

28-30/09/2011 Service Biométrie (CL)


Protocole n°001117004

Séminaire d’Epidémiologie Animale


Les différents types d’enquêtes

Les différents types d’études

Études Descriptives

Études Analytiques (‘explicatives’ / ‘explanatory’)


• Enquêtes d’observation
- Enquêtes transversales (‘Cross-sectional studies’)
- Enquêtes cohortes ( exposés/non exposés) (‘Cohort studies’)
- Enquêtes cas/témoins (‘Case-control studies’)
- Enquêtes hybrides
• Expérimentation
- Essais de laboratoire
- Essais randomisés

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Les différents types d’enquêtes

Les différents types d’études

Études Descriptives
L’ objectif n’est pas la recherche de Facteurs de Risque mais la description de cas
(monographies (‘case reports’), de séries de cas (‘case series’)) et surtout
l’estimation de la fréquence et de la répartition d’évènements pathologiques par
l’intermédiaire d’enquêtes.

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Les différents types d’enquêtes

Les études analytiques

Objectif
Etude de l’association entre des variables décrivant la conduite d’animaux ou de
groupes d’animaux et une pathologie M.

Epidémiologie Etiologique
Recherche de Facteurs de Risque de la maladie M.

Recherche de liens causaux…


Possible dans le cadre de l’expérimentation (Essais randomisés)

Dans le cadre observationnel,


Accumulation de résultats cohérents présomption de causalité…

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Les différents types d’enquêtes

Les enquêtes transversales

• Etat d’une population à un instant donné (« Flash instantané »)

• Mesures de Prévalence

• Représentativité de l’échantillon par rapport à la population-cible


(si constitution de l’échantillon par tirage au sort …)
On ne contrôle a priori que la taille globale de l’échantillon.

- Manque de puissance statistique (à taille globale d’échantillon fixée)


- Difficulté de séparer les facteurs associés à la persistance de la maladie et ceux
associés à l’apparition de celle-ci (nouveaux cas, mieux décrits par les incidences…)
- Raisonnement causal difficile à cause de la non connaissance de l’ordre dans
lequel apparaissent les périodes d’exposition et la survenue de la maladie.

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Les différents types d’enquêtes

Les enquêtes cohorte

• Enquêtes prospectives principalement

• Mesures de taux d’incidence ‘Rate-Based Analysis’ (populations ouvertes) ou


mesures de risque ‘Risk-Based Analysis’ (populations fermées)

• S’il existe un facteur de risque privilégié, contrôle a priori de la répartition de


l’exposition à ce facteur (p% Exposés / 1-p% Non Exposés).

• Comparaison des taux d’incidence ou des mesures de risque dans les populations
‘Exposés’ et ‘Non exposés’.

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Les différents types d’enquêtes

Les enquêtes cohorte

• Représentativité des échantillons conditionnellement à l’exposition ‘E / NE’


(toujours sous l’hypothèse de constitution par tirage au sort des groupes exposés
et non exposés…)
Les estimations de l’occurrence de maladie conditionnelles aux niveaux des
facteurs de risque sont non biaisées. Les estimations globales (non
conditionnelles) de l’occurrence de maladie et de la fréquence d’exposition sont
biaisées. Sans conséquence par rapport aux objectifs de l’étude.

• Contrôle des biais de confusion:


- A priori : Restriction de la population-cible (race, sexe, âge…)
- A priori : Stratification, appariement sur facteurs de confusion
- A posteriori : Ajustements dans modèles statistiques

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Les différents types d’enquêtes

Les enquêtes cohorte

+ Le contrôle de la répartition des ‘Exposés / Non Exposés’ permet d’avoir des


dispositifs plus puissants (cas optimal 50% E / 50% NE).

- Dispositif plus coûteux et durée de l’étude plus longue (étude cohorte prospective)

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Les différents types d’enquêtes

Un exemple d’enquêtes cohorte rétrospective

Etude sur les blessures musculosquelettiques des pur-sangs lors des courses (Cohen et
al., 1999).

Population
Chevaux ayant participés à des courses dans 4 hippodromes du Kentucky entre le
1/01/1996 et le 25/10/1997.

Avant chaque course


Examen de chaque cheval par une commission formée de vétérinaires et
établissement d’un score indicatif d’un accroissement du risque de blessure.

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Les différents types d’enquêtes

Un exemple d’enquêtes cohorte rétrospective

Traitement des données


Dichotomisation du score en deux classes : risque élevé (O/N)

Constitution d’un groupe formé par tous les chevaux ayant eu un risque élevé pendant
la période étudiée (groupe ‘Exposé’) et constitution par tirage au sort d’un second
groupe d’animaux non à risque (groupe ‘Non Exposé’).

Remarque : le statut ‘Exposé / Non Exposé’ peut changer pour un cheval d’une course
à l’autre (exposition non permanente) mais les animaux sont suivis pendant toute la
durée de l’étude (pas de perdus de vue). La population est fermée.

Analyse sur le risque de blessure (‘Risk-Based Analysis’)

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Les différents types d’enquêtes

Les enquêtes cas - témoins

• Enquêtes rétrospectives principalement

• Contrôle a priori de la répartition de la maladie : (1 : n) (cas : témoins)


Le plus souvent (1 : 1)

• Comparaison des proportions d’exposés à des présupposés facteurs de risque


entre les groupes cas et témoins

• Représentativité des échantillons chez les cas et les témoins


(sous l’hypothèse de constitution par tirage au sort des groupes cas et témoins…)
Estimations de l’occurrence de maladie impossible

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Les différents types d’enquêtes

Les enquêtes cas - témoins

• Contrôle des biais de confusion :


mêmes méthodes que pour les enquêtes cohortes.
Nécessité de méthodes d’analyses particulières dans le cas d’appariements
(modèles conditionnels)

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Les différents types d’enquêtes

Les enquêtes cas - témoins


Avantages / Inconvénients
+ Particulièrement adaptée à l’étude de maladies rares pour lesquelles le délai
d’exposition est long
+ Prise en compte de plusieurs facteurs de risque
+ En population générale elles reflètent les caractéristiques des expositions en moyenne
(intensité et fréquence), bonne connaissance de la part des différents facteurs dans
l’étiologie de la maladie étudiée.
+ Enquêtes généralement moins coûteuses et moins longues (études rétrospectives)

- Risques de biais plus importants que dans les enquêtes cohorte

- Définition des témoins souvent difficile


témoins = animaux exempts de maladie à la fin de la période à risque (nécessité que la
période à risque soit terminée avant la phase de sélection des individus)
Refus de participer problème de biais de sélection…

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Les différents types d’enquêtes

Exemple d’une enquête cas – témoins prospective

Etudes Cas-témoins « Grands nombres » ’ :


Problèmes d’acidification fromages fermiers’

…/…

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Les différents types d’enquêtes

L’utilisation des enquêtes cas – témoins dans des


domaines non strictement épidémiologiques

Remarque sur la notion de ‘maladie’


Elle est « sûre » et irréversible (pendant la durée de l’étude).
Une fois qu’un individu (animal, lots d’animaux, troupeaux) est caractérisé somme
‘malade’ il l’est définitivement.
C’est un statut définitif contrairement au statut d’exposition qui peut être variable
pendant la période d’étude.

On n’est pas toujours dans ce cadre pour certaines études menées à l’Institut.

Par exemple les élevages producteurs de fromages fermiers qui ont des problèmes de
d’acidification de leur fromage sont ‘cas’ vis-à-vis de ce problème. Mais ce statut peut
changer l’année suivante…

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Les différents types d’enquêtes

L’utilisation des enquêtes cas – témoins dans des


domaines non strictement épidémiologiques

Etude des facteurs déterminant la qualité de réalisation d’un « process » de


fabrication.

L’événement étudié n’est pas strictement une pathologie.


Cet événement peut ne pas être pérenne…
Exemple des accidents de fabrication

Conséquence : difficulté à définir correctement ce que l’on appelle un « cas » et un


« témoin »…

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Les différents types d’enquêtes

Compléments

Les études « Hybrides » (cf. VER [Ch. 10])


• Les dispositifs « cas – cohortes » (‘case – cohort ‘ design).
• Les dispositifs « cas – crossover » (‘case – crossover’ design)
• Les dispositifs ‘case – only study design’)

Les essais randomisés , ‘controlled trials’, terme synonyme ‘clinical trial’…


Etude du rôle de facteurs de risque considérés comme des « facteurs d’interventions »
Réalisation in situ sans modification du milieu (si possible…)
Comparaison de groupes d’animaux (d’élevages…) sur des conduites (programmes de
santé animale) avec constitution des groupes par tirage au sort.
Eligibilité des individus (critères d’inclusion/exclusion)
problèmes de représentativité difficulté des extrapolations…

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Les différents types d’enquêtes

Compléments

Les essais de Phase III


Mesure de l’efficacité d’un produits (médicaments…) dans une population

Guide des bonnes pratiques


Sous l’égide de :
‘The international Cooperation on Harmonization of Technical Requirement for
Registration of Veterinary Medicinal Products’

http://www.aphis.usda.gov/vs/cvb/vich/goodclinicalpractice6-2000.pdf

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Les différents types d’enquêtes

Éléments de bibliographie

Généralités

• Diehr, P., Martin, D.C., Koepsell, T., Cheadle, A. Psaty, B.M., Wagner, E.H. Optimal survey design for
community intervention evaluations: cohort or cross-sectional ? J Clin Epidemiol 1995; 48: 1461-
1472.

• Kalsbeek, W, Heiss, G. Building bridges between populations and samples in epidemiological


studies. Annu Rev Public Health 2000; 21: 147-169.

• Rothman, K., Greeland, S. Modern Epidemiology 2d ed Philadelphia: Lippincott-Raven, 1998.

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Les différents types d’enquêtes

Éléments de bibliographie

Enquêtes Cohortes

• Breslow, N.E., Day, N.E. Statistical methods in cancer research Volume II. The Design and analysis
of cohort studies. IARC Lyon France 1987.

• Cohen, N.D., Mundy, G.D., Peloso, J.G., Carey, V.J., Amend, N.K. Results of physical inspection
before races and race-related characteristics and their association with musculoskeletal injuries in
Thoroughbreds during races. J Am Vet Med Assoc 1999; 215: 654-661

• Prentice, R.L. Design issues in cohort studies. Stat Methods Med Res 1995; 4: 273-292.

• Rothman, K., Greeland, S. Modern Epidemiology 2d ed Philadelphia: Lippincott-Raven, 1998.

• Samet, J.M., Monoz, A. eds. Cohort studies. Epidemiol Rev 1998; 20: 1-136.
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Les différents types d’enquêtes

Éléments de bibliographie

Enquêtes Cas – témoins

• Breslow, N.E., Day, N.E. Statistical methods in cancer research Volume II. The analysis of case-
control studies. IARC Lyon France 1980.

• Martin, S.W., Nagy, E., Armstrong, D., Rosendal, S. The associations of viral and mycoplasmal
antibody titres with respiratory disease and weight gain in feedlot calves. Can Vet J Res 1999; 40:
560-570.

• Prentice, R.L. Design issues in cohort studies. Stat Methods Med Res 1995; 4: 273-292.

• Rothman, K., Greeland, S. Modern Epidemiology 2d ed Philadelphia: Lippincott-Raven, 1998.

• Schlessselman, J.J. case-control studies, design, conduct, analysis. Oxford University Press, Inc.
1982.

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