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Bioquímica

Grado en Nutrición Humana y Dietética

BIOQUÍMICA

Anna Fenosa Bernadó


Bioquímica
Grado en Nutrición Humana y
Dietética

10.1. ÁCIDOS NUCLEICOS: DNA - RNA

Anna Fenosa Bernadó


Ácidos nucleicos

Ácidos nucleicos: son biomoléculas portadoras de la información genética.


Biopolímeros resultantes de la unión mediante un enlace fosfodiéster de unidades
básicas o monómeros llamados nucleótidos

 Meisher (1869): desubrimiento de los ácidos nucleicos

 Watson & Crick (1953): estructura del DNA

 Macromoléculas de elevado peso molecular

 Llevan la información de la secuencia de aminoácidos

de todas las proteínas

 Dos tipos de ácidos nucleicos: DNA i RNA


Ácidos nucleicos

Transmissión de la información genética


Àcids nucleics
Ácidos nucleicos

Nucleótido: monómero de los ácidos nucleicos. Composición:

 Compuesto heterocíclico nitrogenado: base nitrogenada Compuesto bàsico

 Azucar (monosacárido): pentosa Compuesto neutro

 Ácido fosfòrico (H3PO4) Compuesto ácido

Base
nitrogenada

1. Molécula energética: ATP


P
2. Mensajeros químicos secundarios: AMPc
3. Cofactores enzimáticos: NAD, FAD, FMN
4. Ácidos nucleicos
pentosa

Base + pentosa + fosfato = NUCLEÓTIDO


Monosacáridos: pentosas

Pentosas

 β-D-Ribosa: aldopentosa, forma el RNA

 β-D-Desoxiribosa: azucar derivado de la ribosa, forma el DNA

β-D-Ribofuranosa β-D-Desoxiribofuranosa
Bases nitrogenadas

Bases nitrogenadas: molécules heterocíclicas con más de un átomo de nitrogeno,


formando un anillo

 PURINA: molécula heterocíclica formada por dos anillos condensados

 PIRIMIDINA: molécula heterocíclica formada por un único anillo

4
6 7

5
3 5
1

8
2
6 2

4
1
3 9
Bases nitrogenadas

Bases nitrogenadas: moléculas heterocíclicas con mas de un átomo de nitrógeno,


formando un anillo (pirimidina) o por la condensación de dos anillos (purina)

Timina
Adenina

Citosina

Guanina Uracil
Ácido fosfórico

Ácido fosfórico (ortofosfórico, H3PO4)

Ácido pirofosfórico (PPi) Ácido trifosfórico (PPPi)


Nucleósidos

Nucleósido: unión de una base nitrogenada y la pentosa corresponendiente, la ribosa


en el caos del RNA y la desoxiribosa en el cas del DNA

purina nucleósidos purínicos


Base
nitrogenada
pirimidina nucleósidos pirimidínicos
Nucleósido
Enlace
Unión covalente N-glicosídico
(N-heteròdis)
ribosa ribonucleósidos
Pentosa

desoxiribosa desoxiribonucleósidos
Nucleòsids
Nucleósidos

Nucleósido: unión de una base nitrogenada y la pentosa corresponendiente, la


ribosa en el caso del RNA y la desoxiribosa en el caso del DNA, mediante un enlace
β-N glucosídico entre el C1 (carbono anomérico) de la pentosa y el N1 de la
pirimidina.

β-N glucosídic
Nucleòsids
Nucleósidos

Nucleósido: unión de una base nitrogenada y la pentosa corresponendiente, la


ribosa en el caso del RNA y la desoxiribosa en el caso del DNA, mediante un enlace
β-N glucosídico entre el C1 (carbono anomérico) de la pentosa y el N9 de la purina.
Nucleòtids
Nucleótidos

Nucleótido: ésteres fosfóricos de los nucleósidos. Unión covalente que se establece


entre un grupo fosfato y el grupo hidroxilo del carbono 5 de la pentosa (ribosa /
desoxiribosa)

purina nucleòsids purínics


Base
nitrogenada
pirimidina nucleòsids pirimidínics
Enlace
N-glicosídic

ribosa ribonucleòsids
Fosfato Pentosa
Enlace
fosfato desoxiribosa desoxiribonucleòsids
Nucleótidos

Nucleótido: ésteres fosfóricos de los nucleósidos. Unión covalente que se establece


entre un grupo fosfato y el grupo hidroxilo del carbono 5 de la pentosa

Unión del ácido fosfórico con el azúcar: enlace fosfoester entre el carbono 5 de la
pentosa y un grupo hidroxilo del ácido fosfórico
Nomenclatura de los nucleótidos

PURINAS PIRIMIDINAS

Abreviatura A G C T U

Base Adenina Guanina Citosina Timina Uracil

Adenosina Guanosina Citidina Timidina Uridina


Nucleósido
Desoxiadenosina Desoxiguanosina Desoxicitidina Desoxitimidina Desoxiuridina

Adenilat Guanilat Citidilat Timidilat Uridilat


Nucleótido
Adenosin+fosfat Guanosin+fosfat Citidin+fosfat Timidin+fosfat Uridin+fosfat

Abreviatura AMP GMP CMP


dTMP UMP
monofosfato dAMP dGMP dCMP
Nomenclatura de los nucleótidos
Funciones dels nucleótidos

1. Compuestos ricos en energia que participan en intercanvios energéticos


ADP
ATP

2. Actuan com señales químicas 3. Componentes estructurales de cofactores y


AMPc intermediarois metabòlicos

NAD+

FAD+

4. Constituentes de los ácidos nucleicos


Áocids nucleicos: DNA - RNA

Localitzación y función de los dos tipos de ácidos nucleicos

Localitzación
Función
Eucariotas Procariotas Virus
Depositario y
Nucleo celular Zona nucleoide transmisor de la
Dentro la
(varios cromosomas) del citosol información genètica,
cápside (solo
DNA matriz mitocondrial y (un cromosoma organitzada en genes
en alguns tipos
estroma de y varios que codifican
de virus)
cloroplastso plasmidios) productos genéticos
(proteínas o RNA)
Nucleo celular
Intervienen en la
(temporalmente),
transmisión de la
citosol, matriz Dentro de la
RNA Citosol información des del
mitocondrial y cápside
DNA hasta los
estroma de
productos génicos
cloroplastos
Nivel estructural de los ácidos nucleicos

2 µm 1,7 mm
Nivellestructural
Nivel estructuralsdedels
los àcids
ácidosnucleics
nucleicos

1. Estructura primaria: Polímero lineal formado por la unió de numerosos nucleótidos mediante
un enlace fosfodiéster.

2. Estructura secundaria: Disposición espacial relativa de los nucleótidos que se encunetran


próximos en las secuencias.

 DNA: Doble cadena polinucleotídcas

 RNA: Protuberancias, bucles y horquillas en determinadas regiones de la molécula

3. Estructura de orden superior: Todas aquellas de orden superior a los niveles primario y
secundario.

 DNA: Resultante del superenrollamiento de la cadena de DNA o la de su asociación con


proteínas básicas (cromatina, cromosomas)

 RNA: Plegamiento tridimensional definido (tRNA)


Estructura primaria de los ácidos nucleicos

Ácidos nucleicos: polinucleótidos, largas cadenas de polímeros lineales de nucleótidos


(DNA y RNA). La unión de los diferentes nucleótidos se hace mediante un enllace
fosfodiester, enlace covalente 3’-5’
Estructura
Estructuraprimària
primariadels àcids
de los nucleics
ácidos nucleicos

 Un esqueleto lineal constante (unidades de


fosfato y pentosa que se van alternando) función
estructural.
 Una secuencia variable de bases púricas y
pirimidínicas unidas a intervalos regulares al
esqueleto, información genética.

Representación
esquemàtica

Representación 5’ – A G C T G A – 3’
abreviada:
Estructura primaria de los ácidos nucleicos

― Moléculas hidrófilas

― Longitud: DNA > RNA

― Estabilidad: DNA > RNA

― El RNA contiene U en lugar de T

― El DNA contiene 2’-desoxiribosa en lugar de ribosa

― Hay diferentes tipos de RNA con propiedades y

funciones diferentes:
 RNA mensajero (mRNA)
 RNA ribosómico (rRNA)
 RNA de transferencia (tRNA)
Estructura secundaria del DNA

Proporción de bases nitrogenadas de diferentes especies (regla de Chargaff)


Estructura secundaria del DNA

Estudio de la difracció de rayos X para muestras pràcticamente puras de DNA,


Rosalind Franklin (1952)

Repetición de la estructura

Estructura helicoidal
Estructura secundaria del DNA

Watson & Crick (1953): estructura de doble hélix del DNA. Es la que actualmente se
conoce como la forma B del DNA, la más común y más estable en les condiciones
fisiológicas de les células

 La molécula de DNA es bicatenaria

 Las dos cadenas son antiparalelas (5’-3’ i 3’-5’)

 El azúcar y el fosfato se situaran hacia el exterior


y las bases nitrogenadas hacia el interior

 Se mantiene unidas por puentes de hidrogeno

 Las dos cadenas se enrollan hacia la derecha


formando la doble hélix
Estructura secundaria del DNA
Estructura secundaria del DNA
Estructura secundaria del DNA

Estructura del B-DNA (hélix dextrogiras)


Estructura secundaria del DNA

El DNA es un molécula muy estable y con carácter hidrofílico


Estructura secunderia del DNA

El DNA és un molécula muy estable y con carácter hidrofílico


Estructura de orden superior del DNA

Genoma: material genética de un organismo. Es el conjunto único y completo de


información genética. Los eucariotas, procariotas y virus presentan diferentes genomas

 DNA lineal
 DNA circular
 DNA bicentenario
 DNA monocatenario

DNA Tamaño Longitud B-DNA Dimensiones células

E. coli 4,7·106 pb 1,6 mm = 1600 µm 2 µm (cèl·lula)


Cromosoma humà 50-250·106 pb 17-85 mm
4-6 µm (nucli)
Genoma humà 6,6·109 pb 2,2 m
Superenrollamiento DNA circular

Conformación relajada: estado enrollado pero no superenrollado. Conformación de


mínima energía y máxima estabilidad

Forma esquemática de representar el


DNA circular de doble hélix

Conformación superenrollada: estado no relajado o tenso. Se puede producir por un


giro de la doble cadena hacia la derecha o la izquierda

Superhélix hacia la
derecha (negativo)

Superhélix hacia la izquierda


(positivo)
Superenrollamiento DNA circular

Superenrollamiento DNA circular (procariotas, mitocondrial y cloroplastos)


Superenrollamiento DNA eucariota

El DNA del núcleo de las células eucariotas presenta una organización estructural
compleja des de estados poco compactados (fibras delgadas) hasta estados altamente
compactados (cromosomas metafase)

Nivel de condensación o empaquetamiento: coeficiente entre la longitud del B-DNA en


doble cadena y el tamaño del mismo una vez compactado. Se utiliza per comparar los
diferentes niveles de compactación, hay cuatro:

— Nivel 1: nucleosoma (fibras 10 nm), grado de condensación 6

— Nivel 2: solenoide (fibras de 30 nm), grado de condensación 40

— Nivel 3: eucromatina / heterocromatina, grado de condensación 50.000

— Nivel 4: cromosoma metafásico (dos cromátidas)


Estructura de orden superior del DNA

Superenrollamiento: giro sobre si misma de la doble hélix de DNA, de forma que el eje
de la doble hélix no sigue una línea recta, sino otra hélix (superhélix)

Doble
Cromatina Cromatina
hèlix Nucleosoma Solenoide extensa condensada
Cromosoma
Superenrollamiento DNA eucariota
Superenrollamiento DNA eucariota: nucleosoma

1. DNA bicatenario
 Cadena lineal
 Carga negativa a pH fisiológico
2. Histonas
 Proteínas de tamaño pequeño
 Carga positiva a pH fisiológica
 Interacciones electrostáticas con los fosfatos del
DNA
 Estabilización de la molécula de DNA
 H1, H2A, H2B, H3 i H4
 Cuatro histonas se unen entre ellas para formar un
octàmero
Superenrollamiento DNA eucariota: nucleosoma

Nucelosoma: unidad básica o elemental de la cromatina y el cromosoma. Cada


nucleosoma está formado por 9 histonas y un tramo de DNA. El núcleo está formado
por el octàmero de histonas y el DNA enrollado a su alrededor.
Superenrollamiento DNA eucariota: nucleosoma

Fibra básica o fibra de 10nm: estructura de nucleosomas espaciados a lo largo de la


molécula de DNA
Superenrollamiento DNA eucariota: solenoide

Solenoide o fibra de 30 nm: no se conoce su estructura exacta in vivo. La histona 1


acerca los nucleosomas entre ellos formando el solenoide y quedando en su interior.
Cada vuelta del solenoide contiene 6 nucleosomas.
Superenrollamiento DNA eucariota: cromatina

Cromatina o cromosoma interfásico: la fibra de 30nm forma unos bucles a partir de un


núcleo central lineal formado por proteínas no histonas, llamado esqueleto nuclear.
Superenrollamiento DNA eucariota: cromatina

Eucromatina: cromatina verdadera,


forma menoy condensada.
Majoritaria en les células en
interfase

Heterocromatina: máxima
condensación de la cromatina.
Mayoritaria en el moment de la
duplicación celular
Superenrollamiento DNA eucariota: cromosoma

Cromosoma metafásico: forma de máxima compactación de la cromatina. Estructura en


forma de dos cromátidas más o menos separadas. Espiralización de la heterocromatina.

 Centrómero o constricción primaria


 Brazos cromosómicos
 Telómeros
Superenrollamiento DNA eucariota

Niveles de organización del DNA eucariota

Doble hèlix Fibra 10nm Solenoide Cromosoma


Fibra 30nm Eucromatina Heterocromatina metafàsic

http://www.youtube.com/watch?v=X6bdNCuK-zw
Superenrollamiento DNA eucariota
Estructura secundaria del RNA

los RNA son poliribonucleótidos formados por cadenas lineales sencillas de longitud
mucho más corta que el DNA. Nunca presentaran una doble hélix, pero pueden presentar
hibridación de bases complementarias dentro la misma cadena.

RNA Ubicación Cantidad Características Función

Estructura Información para la


mRNA Citoplasma 5%
sencilla lineal síntesis de proteínas
Forma parte de
rRNA Citoplasma 75% Síntesis de proteínas
los ribosomas
50-60 diferentes Actua com adaptador
tRNA Citoplasma 20%
para cada aa entre el mRNA y los aa
Participa en la maduración
snRNA Nucleo <1% Forma los RNP
de pre m-RNA
Estructura secundaria del RNA

RNA mensajero (600-5000 nucleótidos), copia de la información contenida en una


secuencia de DNA. Actúa en el ribosoma como molde para la síntesis proteica.

 Se encuentran en forma lineal


 Vida útil muy corta
 Asociado a ribosomas de forma transitoria
Estructura secundaria del RNA

RNA de transferencia (70-90 nucleótidos), moléculas adaptadores en la síntesis de


proteínas. Tienen un tamaño muy pequeño pero presenten una gran complejidad
estructural
Estructura secundària tRNA
Estructura secundaria del RNA

Estructura terciaria del RNA de transferencia


Estructura secundaria del RNA

Estructura terciaria del RNA de transferencia


Estructura secundaria del RNA

RNA ribosómico (120-5000 nucleótidos), componente principal de los ribosomas de


mida muy variable. Puede presentar zonas con hibridación de bandas.

Ribosomas procariotas
 Subunidad grande (50S): 23S i 5S
 Subunidad pequeña (30S): 16S

Ribosomas eucariotas
 Subunidad grande (60S): 28S, 5.8S i 5S
 Subunidad pequeña (40S): 18S
Estructura secundaria del RNA

Estructura secundaria del RNA ribosómico

E. coli 5S rRNA

E. coli 16S rRNA


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10.1. ÁCIDOS NUCLEICOS: DNA - RNA

Anna Fenosa Bernadó

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