Biofizica si biochimie: Cuprins

I Introducere in biofizica si biochimie

I Apa si solutiile apoase
I Organizare moleculara si supramoleculara
I Fenomene moleculare in solutii
I Termodinamica biologica
I Bioenergetica
I Metabolism
I Fenomene bioelectrice
I Receptori biologici
I Biocibernetica
I Influenta factorilor de mediu
I Metode experimentale

1 / 29
Curs 1: Introducere in biofizica si biochimie

2 / 29
Bibliografie

1. D.-G. Margineanu, M. I. Isac, C. Tarba,

“Biofizica”, Ed. Didactica si Pedagogica, Bucuresti, 1980.

2. R. Phillips, J. Kondev, J. Theriot, H. Garcia,

“Physical Biology of the Cell”
http://microsite.garlandscience.com/pboc2/home.html

3. B. Alberts, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter,

“Molecular Biology of the Cell”
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21054/

4. R. Milo, R. Phillips,
“Cell Biology by The Numbers”,
http://book.bionumbers.org/

3 / 29
Bibliografie

4 / 29
Bibliografie

5 / 29
Bibliografie

6 / 29
Definitii

Biologia studiaza viata in varietatea si complexitatea ei.

Biochimia studiaza viata la nivel molecular

Domenii:
I Biochimie structurala si functionala: structura chimica a
moleculelor
I Biochimie informationala: codificarea si transmiterea
informatiei biologice in celule si organisme.
I Bioenergie: Energia in organismele vii si transferul ei
intre procesele biologice

7 / 29
Definitii

Biofizica este o stiinta interdisciplinara care utilizeaza metode fizice

pentru a studia sistemele biologice.

Scop:
I Propune modele simplificate pentru sistemele si
procesele biologice
I Dezvolta metode experimentale de investigatie

Domenii:
I Biofizica moleculara si subcelulara
I Biofizica fiziologica si anatomica
I Biofizica mediului inconjurator

8 / 29
Biofizica

Philip Nelson, “Biological Physics: Energy, Information, Life”

9 / 29
Exemplul 1: E. Coli chemotaxis

http: // www. ks. uiuc. edu/ Research/ chemotaxis/

http: // chemotaxis. biology. utah. edu/ Parkinson_ Lab/ projects/ ecolichemotaxis

10 / 29
Exemplul 2: Neuroni

T. Trappenberg, “Fundamentals of Computational Neuroscience”

D. Purves et all, “Neuroscience”, http: // sites. sinauer. com/ neuroscience5e/

11 / 29
Viata
Sistem capabil de:
I metabolism (schimb energetic)
I auto-organizare prin utilizarea energiei
I memorarea informatiei genetice
I reproducere (celulele = cele mai mici unitati structurale ale
reproducerii)

12 / 29
Diversitatea vietii
I Procariote
I Bacteria (eubacteria)
I Archaea (archaebacteria): seamana cu eubacteriile d.p.v. al
metabolismului, dar cu eucariotele d.p.v. al
modalitatii de procesare a informatiei genetice
I Eucariote

Virusii nu sunt considerati vii

13 / 29
Celula procariotelor

14 / 29
Celula eucariotelor

15 / 29
Organite: mitocondria, cloroplastele

16 / 29
Dimensionalitate la nivel celular

R. Milo, R. Phillips, “Cell Biology by The Numbers”

17 / 29
Timpi biologici

18 / 29
Compozitia elementala a celulelor

R. Milo, R. Phillips, “Cell Biology by The Numbers”

23 / 29
Concentratia ionilor in celule

R. Milo, R. Phillips, “Cell Biology by The Numbers”

24 / 29
Energia

R. Milo, R. Phillips, “Cell Biology by The Numbers”

25 / 29
Energia

R. Phillips, S. Quake, Physics Today, 38, 2006

26 / 29
Seminar 1

27 / 29
http: // book. bionumbers. org/ , p.23
http://www.sfu.ca/~eemberly/phys347/lectures/1a_Scaling.pdf