Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
TUTORIAL OSWEGO
GRUPELE: 4 SI 5
1
STUDENTI:
GRUPA 4:
DRAGUT STEFANIA-ALEXANDRA
DUMA LAVINIA ELENA
DUMITRU FLORIN-VLADUT
DUMITRU SIMONA-GABRIELA
FERARU MIHAELA
FLOREA CLEOPATRA-GEORGIANA
GHIATA CRISTIAN-STEFAN
GHIOCEL (URSACHE) IONICA-DORINA
GRECU DANIELA-ELENA
IGNAT DANIELA
ILINA BEATRICE-LARISA-NICOLETA
ION ADINA-MIHAELA
ION ANDREEA-DANIELA
2
GRUPA 5:
IONITA MARIA-ALEXANDRA
JALOBA ANDREEA-CORINA
MARIN IRINA
MARTIN ANA MARIA-ALEXANDRA
MIHAI MIHAELA-VALENTINA
MILITARU ELENA
MORARU STEFANIA
MOROGAN GEORGIANA
MUSOIU NICOLETA-RAMONA
OLTEANU TEODOR
ONEL LIVIU-STEFAN
OPRINESCU ALEXANDRU-RADU
PANDELE ANA-MARIA
3
TUTORIAL OSWEGO
SESIUNEA 1
Introducere
In data de 19 aprilie 1940, ofiterul de sanatate locala din satul Lycoming, Oswego
County, New York, a raportat existenta unei boli gastrointestinale in Districtul Ofiterului de
sanatate din Syracuse. Doctorul A.M. Rubin, ce urma pregatirea pentru a deveni epidemiologist,
a fost desemnat la conducerea investigatiei.
Cand doctoral Rubin a ajuns la fata locului, a aflat de la ofiterul de sanatate ca toti cei care
sufereau de aceasta boala au participat la o cina organizata in cadrul bisericii, in data de 18
aprilie. Membrii familiilor, care nu au participat la aceasta cina, nu sufereau de aceasta boala.
Astfel, investigatia a fost indreptata spre cina.
Interviuri complete, privind prezenta simptomelor, incluzand data, ora debutului si mancarea ce a
fost consumata la cina, au fost completate pe baza a 75-80 de persone ce au participat. Un total
de 46 de persoane, ce au experimentat boala gastrointestinala, au fost identificate.
Intrebarea 1
Este asta o epidemie?
Este prematur pentru a putea determina daca exista un progresepidemic al bolii. Discutati fiecare
posibilitate cu colegii, apoi alegeti ce considerati a fi corect.
Numarul cazurilor de diaree in Oswego este:
1. O epidemie
2. Endemie pentru o regiune
3. Variatii in functie de anotimp
4. Variatie intamplatoare
RASPUNS:
A. O EPIDEMIE
Nu poate fi o variatie ce depinde de anotimp. Este aproape imposibil sa fie
rezultatul unei sanse, deoarece, dupa analizarea informatiei, noi am concluzionat (cu un interval
al sigurantei de 95%) ca numarul cazurilor de gastroenterita este cu mult peste numarul cazurilor
asteptat raportat la numarul populatiei.
4
Intrebarea 2
Pasii unei investigatii asupra unui focar
Succesul unei investigatii, ce priveste un focar, depinde de o planificare organizata cu
grija. Sunt cativa pasice trebuie sa fie luati in considerare. Alti pasi trebuiesc luati in
considerarepana laparasirea investigatiei, in timp ce altii vor ramane implementati pe teren.
Discutati cu colegii care sunt pasii si care este importanta acestora. Va rugam, completati-va
lista inainte de verificarea raspunsurilor. Daca aveti nevoie de ajutor, dati click pe “hint”.
Care sunt pasii unei investigatii asupra unui focar?
RASPUNS:
Nu exista o singura lista corecta, dar fiecare epidemiologist desemnat pe teren ar trebui sa
utilizeze o apropiere sistematica fata de un focar de investigatie. Beneficiul in a avea o astfel de
lista este ca, in toiul investigatiei, investigatorii nu vor omite vreun pas esential.
Ordinea pasilor nu este una fixa: in unele cazuri, masurile de siguranta (pozitionate pe locul 10 in
lista de mai jos) pot si ar trebui implementate imediat.
Verificarea diagnosticului se poate efectua odata cu verificarea existentei unei epidemii, sau
confirmarea venita din partea unui laborator care poate saajunga chiar si dupa cateva saptamani
de la terminarea investigatiei.
Multe componente sunt dinamice: definitiile cazului, ordonarea in linie, descrierea
epidemiologiei si ipoteze, toate pot (si ar trbui) sa se schimbe cu informatii suplimentare.
5
Descrierea clinica
Evenimentul a inclus un grup de oameni cu varste variate, care au dezvoltat
gastroenterita, ce s-au manifestat prin cateva stari de greata si varsaturi. Au mai fost prezentate:
confuzii, crampe, dureri abdominale, asociate cu diaree fara sange.
Alte simptome include: stare generala de rau si frisoane. Nu au existat decesuri si nicio persoana
bolnava nu a acuzat febra.Toti si-au revenit in 24-30 de ore. Aproximativ20% din bolnavi au
consultatmedici. Niciun alt specimen sau proba biologica nu au fost obtinute pentru analizele de
laborator.
In grupul dumneavoastra, discutati importanta analizarii informatiei clinice pentru investigatie.
Definirea cazului
Bazat pe informatiile disponibile obtinute pana in acest punct, investigatorul cere o
definire a cazului.
Urmatoarele sunt definitii ale cazurilor ce pot fi aplicate in acest exercitiu. 4 sunt gresite si una
este corecta.
Discutati cu colegii posibilele erori in definitii, pana ce veti alege una. Apoi, selectati difinitia
corecta a cazului si gasiti erorile in toate celelalte definitii.
1. Toti participantii de la cina in biserica din Oswego, au fost tinuti la subsolul bisericii in
Lyncoming, Oswego County, New York, in data de 18 aprilie 1940, intre orele 18:00 si
23:00, chiar daca au venit sau nu la biserica, chiar daca au participat sau nu la prepararea,
transportul sau distribuirea mancarii, cat si cei care fie au mancat fie nu.
2. Persoane care au prezentat simptome acute gastrointestinale in mai putin de 72 de ore de
la cina din Lyncoming, biserica din Oswego in data de 18 aprilie 1940, si cei care au
cerut transferarea la un spital.
3. Persoanele care au prezentat simptome acute gastrointestinale in mai putin de 72 de ore
de la cina savurata in data de 18 aprilie 1940 si cei care se afla printre participantii de la
Lycoming, cina de la biserica din Oswego.
4. Persoanele care s-au imbolnavit dupa participarea la cina din Lycoming, Oswego, in data
de 18 aprilie 1940.
5. Membrii bisericii care au prezentat simptome gastrointestinale acute in mai putin de 72
de ore de la ospiciul tinut in Lycoming, Oswego pe 18 aprilie 1940.
6
RASPUNS:
Cel mai bun raspuns este definirea cazului cu numarul 3.
Persoanele care au prezentat simptome acute gastrointestinale in mai putin de 72 de ore de la
cina savurata in data de 18 aprilie 1940 si cei care se afla printre participantii de la
Lycoming, cina de la biserica din Oswego.
Celelalte patru definitii sunt gresite. Haideti sa aruncam o privire detaliata asupra acestora.
1. Toti participantii la cina din Oswego, ce au fost tinuti in subsolul bisericii din
Lycoming, Oswego Couty, New York, in data de 18 aprilie, 1940, intre orele 18:00 si
23:00, fie ca au fost sau nu la biserica, fie ca au participat sau nu la prepararea,
transportulsau distribuirea mancarii, cat si daca au mancat sau nu.
In acest caz, nu exista definitii ale unei boli, astfel incat nu ai putea fi capabil sa
identifici sisa confirmi posibilele cazuri, sau sa ii compari cu oamenii sanatosi.
7
Diagnostic diferential
In acest punct ar trebui sa cautati pe internet, sau sa faceti cercetari despre perioadele de
incubare si simptomele clinice relatate in numeroasele cazuri de boala gastrointestinala.
Cautarea noastra pe internet asupra bolilor diareice si toxiinfectii alimentare au format o lista a
toxiinfectiilor alimentare si a perioadelor de incubare oferite de U.S. Food and Drug
Administration (FDA).
Curba epidemiei
8
Graficul 1: Incidenta Cazurilor de Diaree
in randurile Participantilor la Lycoming,
Cina de la biserica din Oswego, Iunie 1940
1. Care este cea mai probabila forma de transmitere din acest focar?
2. Luati aceste caracteristici ale unei curbea epidemiei, apoi verificati lista cu diagnosticele
posibile si discutatile cu colegii.
3. Sustine curba epidemiei teoria voastra legata de forma de transmitere?
4. In ce mod ajuta informatia despre perioada de incubare, combinata cu date despre simptomele
clinice, in diagnosticele diferentiale ale bolii?
Numiti cateva cauze ale diareei, ce pot fi considerate mai putin importante in acest punct.
RASPUNS:
Curba epidemiei prezentata pentru acest caz contine urmatoarele caracteristci:
Au fost mai mult de 20 de cazuriin timpul primei zile. Acest lucru se potriveste cu o crestere
brusca a numarului de oameni expusi la agent in acelasi timp.
Exista un singur varf.
Aceasta curba a epidemiei este compatibila cu un punct-sursa a infectiei. Au fost cativa oameni
expusi in acelasi timp. Nu exista o scadere treptata a numarului de cazuri, deoarece transmiterea
s-a incheiat in momentul terminarii cinei.
Meniulcinei la biserica
9
Date privind debutul bolii si mancarea consumata sau apa bauta de catre cele75 de personae
inetrvievate au fost oferite sub forma de tabele. Pentru doar o jumatate din persoanele, care au
experimentat boala gastrointestinala, a fost necesar doar timpul egal cu durata cinei.
Inainte de a continua, discutati fiecare produs cu colegii. Care din ele poate fi responsabil? Puteti
exclude vreun aliment in acest moment? (Printarea sau notarea ar putea fi folositoare pe viitor).
Chestionar
Cea mai buna cale de a strange informatii cu privire la o epidemie este prin utilizarea
unui chestionar. Este una din principalele unelte ale investigatiei. Va rog acordati-va ceva timp
pentru a discuta cu colegii diferitele iteme ce ar trebui incluse intr-un chestionar. Deasemenea, ar
trebui sa discutati si despre colectarea datelor si codificarii acestora.
Daca ai fi administrat un chestionar participantilor de la cina de la biserica, ce informatii ai
colecta?
RASPUNS:
Rezumarea este foarte importanta. Veti dori sa evitati problemele clinice, utilizand
campuri cu “DA/NU” pentru a determina daca o persoana a fost sau nu bolnava.
10
Caseta de dialog “Creati sau Deschideti proiectul” va aparea. In caseta “Numele Fisierului” veti
introduce numele pentru proiectului datei de baza (mai jos am ales “Oswego”) si vom apasa pe
“Deschidere”.
Caseta “NUME PAGINA” va aparea. Vom introduce numele in caseta “Nume pagina” in cadrul
proiectului si apoi selectam OK. Mai jos, am ales “Oswego Pagina 1” ca si nume pentru prima
“Pagina” din cadrul proiectului “Oswego”.
Desi, proiectul nostru Oswego necesita o singura Pagina in chestionar, se poate sa intalniti in
proiectele viitoare un chestionar ce necesita mai multe pagini (Views) pentru a colecta toate
datele necesare.
11
Acum, pentru a introduce primul camp de date (chiar o eticheta, in primul caz) in chestionarul
dumneavoastra, plasati cursorul aproape de coltul superior din stanga al paginii albe si dati click
dreapta. Caseta DOMENIU DE DEFINITIE ce va aparea va ofera optiuni pentru a introduce
INTREBAREA SAU SOLICITAREA, CAMPUL SAU TIPUL VARIABILEI si numarul
caracteristicilor ce au fost implementate anterior in fisierele “retinute” in Epi Info 6.
Fiecare nume al variabilei este creat automat de Epi Info. Puteti dezactiva crearea numelor
automat, oricum, prin tastarea unui alt nume in caseta“ NUMELE PAGINII”. Cand schimbati
12
numele variabilei, nu schimbatisi INTREBAREA SAU SOLICITAREA ce va aparea pe
formular. Ca si exemplu, daca introduceti“ Barbat, Femeie sau sex necunoscut” in sectiunea
INTREBARE SAU SOLICITARE, numele variabilei ce este generat de Epi Info este
“Barbatfemeie”. Puteti schimba numele variabilei prin dublu click pe cuvantul “sex” din campul
INTREBARE SAU SOLICITARE, iar solicitarea va ramane “ Barbat, femeie sau sex
necunoscut”.
Cele trei butoane VALORI JURIDICE, CODURI și COMENTARIU JURIDIC pot fi utilizate
pentru customizarea introducerii datelor. Acestea prezinta alegeri ce apartin unor coduri ale
tabelelor in mod separate pentru a dirija si limita numarul datelor introduse.
Pentru primul camp al chestionarului, introduceti titlul formularului in caseta INTREBARE SAU
SOLICITARE si selectati ETICHETA/TITLU ca si CAMP SAU TIP DE VARIABILA. Apasati
OK.
Pentru a specifica modelul campului numeric, in acest caz fie 3 cifre sau 2 cifre al numarului
intreg, alegeti ### sau ## din lista MODEL. Deasemenea, puteti introduce modelul direct in
fereastra MODEL. Apasati OK, aflat la sfarsitul casetei de dialog.
13
Aceasta PAGINA ar trebui sa arate astfel.
14
ii) Introducerea datelor : - Obiectiv : Familiarizarea cu Introducerea
In acest exercitiu veti invata cum sa utilizati un chestionar (creat in Computer Task 1)
pentru a introduce date. Datele pe care le introduceti vor fi utilizate pentru a crea oaranjare in
linie.
Prima data, selectati Inroducere Date din meniul principal din Epi Info pentru a lansa
Introducere. (Observati ca folosim notiunile de Introducere Date si Introducere ca sinonime)
Apoi selectati fisierul pe care va doriti sa il deschideti prin a deschide comanda DESCHIDE in
submeniul “fisier”.
Selectati proiectul (data de baze) pe care doriti sa o folositi. (Pentru o mica ilustrare, alegeti
Sample.mdb, care contine Pagina Oswego de care avem nevoie). Click DESCHIDE.
15
In cadrul proiectului, selectati Pagina de care sunteti interesati. In proiectul Sample.mdb, pagina
pe care o dorim este Oswego (acelasi continut ca si Oswego View 1, pe care l-am realizat in
Computer Task 1). Click OK.
Acum, utilizati acest formular pentru a introduce datele. Tastati simplu continutul pentru fiecare
camp si apoi apasati ENTER pentru a avansa la urmatorul camp. La sfarsitul formularului, Enter
va salva automat continutul, astfel incat nu veti fi nevoit sa salvati continutul de fiecare data.
In unele cazuri poate veti dori sa vedeti inregistrarile anterioare. Pentru a face asta, utilizeaza
butoanele localizate in coltul inferior al ecranului pentru a naviga inainte si inapoi printre
inregistrarile existente in colectia de inregistrari. Pentru a selecta o anumita salvare, doar tastati
numarul inregistrarii in caseta etichetata ca “Inregistrare”. Pentru a merge la urmatoarea salvare
alba, apasati pe butonul “Nou”.
16
SESIUNEA 2
Rezumatul sesiunii 1
Pe data de 18 aprilie 1940 a fost semnalata o izbucnire a unei boli gastrointestinale in Lycoming,Oswego
County,New York. Toti subiectii in cauza participasera la o cina in cadrul subsolului bisericii locale.
Toate datele au fost culese si introduse in calculator. Folosindu-se de tehnologia ’’Time Warp”, Epi Info
2000 a fost utilizat pentru a ajuta echipa oamenilor de stiinta care au condus investigatiile.
Au fost urmasi pasii specifici in investigarea exploziei de boala,iar participantii la cina organizata de
biserica au fost intervievati. Toate datele au fost culese sub forma unui chestionar. Pentru a imbunatati
analiza informatiilor,Epi Info 2000 a fost selectat drept software pentru aceste investigatii.
Pana acum,doua caracteristici ale Epi Info 2000 au fost utilizate: MakeView (pentru a crea chestionarul)
si Enter (pentru a introduce datele in baza de date). In aceasta sesiune va fi utilizata comanda
Analizapentru a obtine informatia epidemiologica de baza despre explozia gastrointestinala.
Organizarea datelor
In acest punct,toata informatia a fost colectata si introdusa in calculator. Este important ca informatia sa
fie organizata inainte de a fi analizata.
Activitate practica
Creati o listare in linie a persoanelor care au participat la cina din biserica din Oswego.
Listarea in linie
La aceasta etapa trebuie ca datele sa fie deja organizate intr-o lista. Exista mai multe moduri in care datele
pot fi imbunatatite.
17
Activitate practica
Modifica lista creata initial. Prezinta datele grupate in functie de sex,conditia de sanatate si varsta.
Perioadele de incubatie
Cauza izbucnirii bolii este inca nesigura. Sunt multi posibili factori ce pot produce simptome acute ale
bolii gastrointestinale. Calculand perioada de incubatie a unora dintre ei face posibilia excluderea unora
drept cauze potentiale ale izbucnirii bolii.
Activitate practica
Grafice
Un grafic este un mod eficient de a rezuma datele. Epi Info 2000 poate genera 15 tipuri diferite de grafice.
Totusi,este important sa se aleaga tipul corect de grafic pentru scopul propus.
Realizati un grafic cu cazurile versus perioada de atac a bolii. Ce va spune acest grafic?
Derivatiile extreme
Exista cazuri la care perioadele de atac sa nu fie consistente cu experienta generala? Cum pot fi explicate
acestea?
Rate de atac
Folosind datele din listarea liniara si formula din rubrica Indiciu (Hint) a acestei intrebari,completati
tabelul de mai jos. Primele trei randuri au fost deja calculate.
Observati ca rubricile Procentaj III sunt calculate prin impartirea coloanei III la Total si ca Fractia ratei
de atac e obtinuta prin impartirea Procentajului III a celor care au mancatmancarea, la impartirea
Procentajului III a celor care nu au mancat mancarea pentru fiecare coloana.
18
Feluri de Numarul de persoane care AU MANCAT Numarul de persoane care NU AU
mancare servite un anumit aliment MANCAT un anumit aliment
Fractia
ratei de
Ill Nu Ill Total Procentaj Ill Nu Ill Total Procentaj atac
III(Rata III(Rata
de atac) de atac)
Jambon 29 17 46 63% 17 12 29 59% 1.1
Salata de varza
Jeleu
Pateuri
Paine neagra
Lapte
Cafea
Apa
Prajituri
Inghetata de
vanilie
Inghetata de
ciocolata
Salata de fructe
19
SESIUNEA 3
Rezumatul sesiunii 2
In cadrul sesiunilor trecute,am organizat datele intr-o lista a persoanelor care au participat la cina de la
biserica. Am remarcat persoanele care s-au imbolnavit si pe cele care au ramas asimptomatice. Alimentele
consumate de fiecare persoana au fost introduse in lista.
Am examinat perioada de atac (de inceput) a simptomelor gastro-intestinale in relatie cu ora la care a
avut loc cina si am calculat perioadele de incubatie acolo unde am avut date disponibile. Apoi am luat in
calcul mai multi posibili agenti patogeni prin identificarea perioadei lor de incubatie (care era deja
cunoscuta). Contaminarea unui aliment (sau a mai multor alimente) cu stafilococ auriu pare o etiologie
plauzibila a simptomelor gastrointestinale ale subiectilor.
In sesiunea urmatoare,cu numarul 3, vom folosi capacitatile statistice ale Epi Info 2000 pentru a examina
tabele 2x2 (cunoscute si ca tabele de contingenta) ale alimentelor (variabile de intrare) versus boala
(variabila de iesire),in incercarea de a sustine ipoteza ca un anumit aliment este responsabil pentru
izbucnirea bolii.
In final,vom revedea descoperirile care tin de istoric si concluziile izbucnirii bolii din Oswego si vom
discuta metode de preventie pentru izbucniri de boala provocate de alimente similare.
Tabelarea
Prin intocmirea tabelelor potrivite pentru diferite tipuri de alimente,identificati,daca este posibil,mijloace
comune de infectie.
Activitate practica
Creati tabele 2x2 definind alimentele ca expunere si starea de imbolnavire ca iesire. Analizati si
interpretati rezultatele. Examinati rata cotelor (OR) si riscul relativ (RR) pentru fiecare aliment.
Stratificarea
Stratificarea este unul dintre cele mai importante instrumente in statistica. Permite celui care
investigheaza sa controleze factorii de confuzie. Epi Info 2000 poate genera analiza stratificata doar prin
specificarea variabilei care este suspicionata ca factor de confuzie.
20
Este genul un factor de confuzie pentru asocierea gasita in acest exercitiu?
Activitate practica
Determinati daca genul este un factor de confuzie la asocierea dintre inghetata de vanilie si stare de
imbolnavire.
Investigatii suplimentare
Evidentiati investigatiile suplimentare ce pot fi efectuate.
Masuri de control
Importanta
Reanalizarea pasilor
In dupa-amiaza zilei de 17 aprilie,lapte proaspat (crud) de la ferma familiei P.... a fost adus pentru a fi
fiert intr-o baie de apa. Zahar si oua au fost adaugate si putina faina pentru a inchega compozitia.
Inghetatele de vanilie si ciocolata au fost preparate separat. Ciocolata Hershey’s a fost adaugata la
compozitie. La ora 6 dupa-amiaza inghetatele au fost transportate in recipiente acoperite la subsolul
bisericii si au ramas acolo peste noapte. Se presupune ca acestea nu au fost atinse de nimeni in toata
aceasta perioada.’’
”In dimineata zilei de 18 aprilie, domnul C..... a adaugat 4 grame de vanilie si 2 cani de lapte condensat la
amestecul de vanilie si 3 grame de vanilie si o cana de lapte condensat la amestecul de ciocolata. Apoi
inghetata de vanilie a fost transferata intr-un recipient de inghetat si plasata intr-un congelator electric
timp de 20 de minute,dupa care inghetata de vanilie a fost scoasa din recipientul pentru inghetat si mutata
intr-un alt recipient care fusese spalat cu apa fierbinte. Apoi amestecul de ciocolata a fost pus intr-un
recipient care fusese clatit cu apa de la robinet si lasat sa inghete timp de 20 de minute. La final, ambele
recipiente au fost acoperite si plasate in bazine mari din lemn care au fost umplute cu gheata. De remarcat
ca inghetata de ciocolata a ramas in recipientul in care fusese pusa.”
21
”Toti cei care au atins sau transportat inghetata au fost examinati. Nu au fost remarcate infectii respiratorii
superioare sau leziuni externe. Exudate nazale si faringiene au fost prelevate de la cele doua persoane care
au preparat inghetata.”
”Examene bacteriologice au fost facute de catre Diviziunea de Laboratore si Cercetare din Albania la
ambele tipuri de inghetata. Raportul lor este urmatorul:
”Un numar mare de stafilococ auriu si epidermic a fost gasit in inghetata de vanilie. Doar cativa
stafilococi au fost gasiti in inghetata de ciocolata.”
”Rezultatul exudatelor faringiene si nazale ale celor care au preparat inghetata este urmatorul: Stafilocoul
auriu si streptococul hemolitic au fost izolati din cultura nazala si stafilococul epidermic din cultura
faringiana a lui Grace P...... Stafilococul epidermic a fost izolat din cultura nazala a lui Marian P.....
Streptococul hemolitic nu era de tipul care este de obicei asociat cu infectiile la oameni.”
”Discutarea sursei: Sursa contaminarii bacteriene in cazul inghetatei cu vanilie nu este clara inca.
Indiferent de modul in care au aparut stafilococii,este rezonabil sa presupunem ca s-a intamplat intre
dupa-amiaza zilei de 17 aprilie si dimineata zilei de 18 aprilie. Nu se cunoaste un motiv specific pentru
contaminarea inghetatei de vanilie.”
Contaminarea
”In servirea inghetatei a fost utilizata aceeasi lingura. Nu este exclus sa presupunem ca in cazul inghetatei
de ciocolata contaminarea a aparut in acest mod. Este cea mai plauzibila explicatie pentru imbolnavirea
celor trei indivizi care nu au mancat inghetata de vanilie.”
Concluzie
”O explozie de gastroenterita a fost declansata dupa organizarea unei cine la Lycoming. Cauza exploziei a
fost inghetata de vanilie contaminata. Metoda contaminarii nu este pe deplin inteleasa. Daca rezultatul
pozitiv al exudatului faringian si nazal al familiei P... a avut vreo legatura este doar o conjunctura. Se
asteapta ca tipurile de fagi izolate din streptococul probei nazale prelevate de la Grace P... sa fie aceiasi
cu cei din inghetata de vanilie sau cei din probele luate din varsaturile si scaunele persoanelor
bolnave,pentru a demonstra faptul ca Grace P... este sursa contaminarii. Tipurile distincte de fagi pledeaza
impotriva ei ca fiind sursa contaminarii si sugereaza nevoia pentru investigatii ulterioare precum culturi
bacteriene sau alte persoane care au fost in contact cu inghetata in timpul prepararii. Se poate lua in
considerare si faptul ca sursa de contaminare a fost utilizarea laptelui de la o vaca ce sufera de mastita si
ca singurul lapte fiert a fost acela din care s-a preparat doar inghetata de ciocolata. Daca alimentul
contaminat a fost fiert suficient de mult incat sa distruga stafilococul,si totusi nu a distrus toxina,analizele
pentru toxina(cu aditie de uree) ar permite detectarea cauzei epidemiei. Un frotiu Gram ar putea
detecta,de asemenea,prezenta stafilococilor neviabili in alimentul contaminat.”
22
COMPUTER TASKS
In acest punct ar trebui sa aveti o idee legata de campurile pe care le doriti incluse in
chestionar. Puteti folosi Epi Info pentru a crea chestionarul, apoi sa il utilizati pentru a introduce
datele si sa creati o data de baze pentru a investiga focarul de la Oswego.
Primul pas este sa cream chestionarul.
Prima oara, selectati MakeView (Creati Pagina) din meniul principal al Epi Info. Din
submeniul File (fisier), alegeti Make New View(Creati Pagina Noua).
Caseta de dialog Create or Open Project (Creati sau Deschideti Proiect)va aparea. In
campul
File Name (Numele Fisierului), introduceti numele pentru proiectul datei voastre de baze ( mai
jos, noi am ales “Oswego”), si apoi click pe Open (Deschideti).
23
In Caseta Name the View (Numiti pagina) ce va aparea, introduceti numele Paginii, altul
decat proiectul, si apasati Ok. Mai jos, am ales “Oswego Pagina 1” ca si nume pentru pentru
prima Pagina a proiectului nostru “Oswego”. Desi proiectul nostru “Oswego” necesita o singura
pagina, pe viitor puteti intampina proiecte ce vor necesita mai multe pagini, pentru a colecta mai
multe date, necesare chestionarului.
Acum, pentru a adauga primul camp pentru date (defapt, o eticheta, in primul caz) la
chestionar, plasati cursorul aproape de coltul superior din partea stanga a paginii albe, apoi dati
click dreapta. Caseta de dialog Field Definition (Definirea Campului) va aparea si va oferi
optiuni pentru a introduce Question or Prompt (Intrebare sau Solicitare), Field or Variable
24
Type ( Tipul de Camp sau Variabila) si numarul de caracteristici ce au fost implementate
anterior ca si fisiere “check”( “bifare” ) in Epi Info 6.
Pentru inceput, bifati casuta Required( Necesar), care va preveni utilizatorul sa lase vreun
camp necompletat. Este echivalentul comenzii Mustenter (Trebuieintrodus) din variantele cu
bifare din Epi Info 6. Repeat Last (Repetare la Final) va aduce in mod automat continutul in
camp din inregistrarea anterioara in cea curenta. Read Only (Citeste Doar) previne adaugarea
unor noi date. Soundex va verifica alte campuri cu o pronuntie similara, in baza de date.
Fiecare nume a variabilei este generat automat de Epi Info. Poti schimba numele creat
automat, oricum, prin introducerea unui nume in caseta Field Name( Numele Campului). Cand
schimbi numele variabilei, nu schimbi Question or Prompt ( Intrebarea sau Solicitarea) ce va
aparea pe formular. Ca de exemplu, daca introduce “Male, female or unknown sex” (Sex
masculin, feminin sau necunoscut) in campul Question or Prompt, numele generat de Epi Info
este Malefemale (Masculinfeminin). Poti schimba numele variabilei prin dublu-click pe
cuvantul “sex” din campul Question or Prompt, dar cererea campului respective va ramane
“Male, female or unknown sex”.
Cele trei butoane Legal Values (Valori juridice), Codes (Coduri) si Comment Legal
(Comentariu Juridic) pot fi folosite pentru a customiza modul de introducere a datelor. Acestea
prezinta variante continute in tabele de coduri separate, utilizate pentru a ghida si limita
introducerilor facute.
25
Pentru primul camp al chestionarului, introduceti titlul formularului in campul Question or
Prompt( Intrebare sau Solicitare) , apoi selectati Lbale/Title (Eticheta/Titlu) ca si Field or
VariableType (Tipul Campului sau a Variabilei). Selectati OK.
Pentru urmatorul camp ( primul camp “adevarat”), AGE (Varsta), mutati cursorul in locatia
dorita a campului pe formular, apoi apasati click dreapta pentru a crea campul AGE (Varsta).
Tastati “AGE” in “Question or Prompt” (Intrebare sau Solicitare). Alegeti numarul pentru “Tipul
Campului sau a Variabilei”.
26
Pentru a specifica modelul pentru campul numeric, in acest caz poate folosi ori de 3 cifre sau
de 2 cifre, intregul numar, alegeti ### sau ## din lista ”PATERN” (Model). Puteti de asemeni
introduce modelul direct in fereastra cu modele. Apasati OK in mijlocul casutei de dialog.
27
Pagina ar trebui acum sa arate asa.
28
Computer Task 2: Entering Data
Introducerea Datelor
In acest exercitiu ve-ti invata cum sa folositi un chestionar (creat in Computer Task 1) pentru
a introduce date. Datele pe care le veti introduce vor fi folosite pentru a crea o listare in linie.
Prima data, selectati Enter Data (Introduceti date) din meniul principal Enter (Introduceti)
din Epi info. (De retinut: noi utilizam numele din program Enter Data siEnter ca sinonime).
Apoi deschideti fisierul dorit prin accesarea comenzii “OPEN” din submeniu.
Selectati proiectul (baza de date) pe care doriti sa o utilizati. (Pentru acest exemplu, noi am
ales Sample.mdb, care contine Pagina Oswego de care avem nevoie). Apasati “OPEN”
(deschidere) .
29
In cadrul proiectului, selectati pagina de care sunteti interest. In proiectul Sample.mdb, pagina
pe care o dorim este pagina numita Oswego ( la fel ca si continut ca pagina noastra Oswego
View 1, pe care am construit-o in Computer Task 1). Apasati OK.
30
Acum, utilizati acest formular pentru a introduce datele dumneavoastra. Pur si simplu,
introduceti continutul in campul corespunzator si apasat Enter pentru a avansa la urmatorul
camp. La sfarsitul formularului, Enterva salva fiecare inregistrare in mod automat, astfel incat nu
veti fi nevoit sa apasati “Salvati datele” de fiecare data.
(In dreptul ultimei poze mici) In unele cazuri, poate vei dori sa revezi o inregistrare create
anterior. Pentru a face asta, utilizati butoanele cu sageti locate inferior in coltul stang al ecranului
pentru a naviga inainte si inapoi prin colectia de inregistrari deja existente. Pentru a selecta o
inregistrare specifica, doar tastati numarul inregistrarii in caseta , ce se afla sub eticheta “Record”
(Inregistrare). Pentru a merge la urmatoarea inregistrare goala, apasati butonul “New” (Nou).
31
Computer Task 3: Creearea unei Listari in Linie
In fereastra laterala din stanga, sub DATA, selectati comanda READ (Citeste). Comanda
READ este comanda utilizata in deschiderea proiectelor bazelor de date).
In caseta de dialog READ, care este afisata, ve-ti observa caseta CURRENT PROJECT
(Proiectul current) (DATA DE BAZE), DATA FORMATS ( FORMELE DATELOR) si DATA
SOURCE (SURSA DATELOR) (baza de date) si o lista cu toate paginile.
32
Pentru acest exemplu, sub PAGINI, selectam viewOswego si dam click pe OK.Retineti mai
ales informatia afisata in browser (partea superioara a zonei din dreapta a ecranului): avem
accesul la 75 de inregistrari ale persoanelor (subiecti) implicate in focarul din Oswego.
Pentru a vizualiza datele celor 75 de personae, utilizam comanda LIST (LISTA) (Sub
STATISTICS in lista din partea stanga), care genereaza urmatoarea caseta de dialog. (Retineti:
comanda READ specifica sursa unei informatii, dar nu afiseaza datele. Comanda LIST arata
inregistrarile pentru sursa respectiva).
33
Dand click pe sageata ceduce in jos, din dreapta, la caseta VARIABLES (VARIABILE), va
deschide o lista cu toate variabilele disponibile, corespunzand cu campurile din chestionarul
nostru. Selectati una sau mai multe variabile pe care doriti sa le aveti afisate, sau selectati “*”
pentru a afisa toate variabilele, varianta ce este pre-selectata.
Butoane
OK- creeaza o comanda linie si executa instructiunile.
SAVE ONLY- creeaza o instructiune a unui program in textul editorului, dar nu executa
instructiunea.
34
CLEAR- sterge toate variabilele selectate.
CANCEL- renunta la listare si se intoarce la afisarea principal.
Sa selectam variabilele AGE, SEX, si ILL pentru afisare. De fiecare data cand ve-ti selecta
variabile din meniul ce este afisat in jos, ea va aparea in caseta mai mare, de sub meniu. Cu cat
este mai mare caseta, cu atat ea va putea contine, eventual, toate variabilele, selectate de
dumneavoastra.
Cand ai terminat de selectat variabilele, dati click pe OK si listarea in linie va putea fi vizibila
in browser. Puteti da in sus si in jos de bara, cu scopul de a vizualiza setul de date complet.
35
Acum, vom ilustra optiunea LIST ALL (*) EXCEPT, prin afisarea tuturor celor 75 de
inregistrari cu toate variabilele EXCEPTAND AGE, SEX si ILL.Alegeti LIST din nou, dar
verificati caseta ALL (*) EXCEPT, ca mai jos:
36
Computer Task 4: Improving a Line Listing
Obiectiv: Imbunatatirea organizarii unei lisari in linie prin gruparea sau sortarea domeniilor
Sarcini :SORTARE
SELECTARE
Prima data, selectati Analyze Data din meniul principal din Epi Info.
CITITI proiectul SAMPLE.MDB si selectati tabelul“viewOswego”. Pentru o descriere detaliata a
procesului, vezi Computer Task 3.
Dati click pe LIST si selectati variabilele AGE, SEX si ILL. Apoi click pe SORT
(SORTARE) si sortati data dumneavoastra de baze prin AGE. Comanda SORT poate fi gasita in
meniul din partea stanga, sub sectiunea SELECT/IF.
Pentru a selecta AGE ca si variabila a lui SORT, trebuie sa dam dublu-click pe AGE.Atunci
variabila AGE va fi mutate in caseta VARIABILELOR lui SORT in dreapta.
Ordinea prestabilita a lui SORT( SORTARE) este ASCENDENTA (++)(de la A la Z). Pentru a
schimba ordinea lui SORTin DESCENDENTA(--)(de la Z la A), apasati acel buton. Pentru a
inlatura o variabila din sortare, selectati REMOVE FROM SORT (stergeti din sortare).
37
Repetati comanda LIST utilizand aceleasi variabile (AGE, SEX si ILL). Afisarea in browser-
ul dumneavoastra ar trebui sa arate astfel. Retineti ca aceasta inregistrare este sortata ascendant
in functie de varsta (AGE).
Acum, dati click pe SELECT (selectare) (sub sectiunea SELECT/IF in partea stanga).
Urmatoarea caseta de dialog va fi afisata.
Tastati ILL=+ in caseta SELECT CRITERIA (selectati criterial), din fereastra SELECT, sau
utilizati fereastra AVAILABLE VARIABLES (variabile disponibile) si operatorul aritmetic si
celelalte butoane pentru a construi expresia ILL=(+). Retineti ca dand click pe “YES” va genera
un “+” in caseta SELECT CRITERIA.
38
Repetati comanda LIST utilizand aceleasi variabile (AGE, SEX, ILL).Aceasta fereastra ar
trebui sa arate astfel. Retineti ca ai selectat inregistrarile subiectilor ce au avut valoare pozitiva la
variabila ILL (bolnav).
39
Computer Task 5: Calculating Incubation Period
Prima data, selectati Analyze Data din meniul principal Epi Info.Cititi proiectul
Sample.mdb, apoi selectati tabelul “viesOswego”. Penru o descriere detaliata a procesului, vezi
Computer Task 3.
Pentru a calcula perioada de incubare, trebuie sa creeati o variabila noua pentru a stoca
diferenta dintre timpul debutului simptomelor si timpul cinei. Perioada de incubare poate fi
calculata utilizand formula:
INCUBATIA = PERIOADA de ATAC – MOMENTUL LA CARE A FOST LUATA CINA
Sub sectiune de VARIABILE a comenzii Analyze, selectati DEFINE. Urmatoarea caseta de
dialog va aparea:
40
Urmatorul pas este sa atribuim noi variabile INCUBATIE o valoare.Sub sectia de
VARIABILE a comenzii Analyze, selectati ASSIGN (atribuire). Urmatoarea caseeta de dialog va
aparea.
41
Oricum, pentru a obtine o forma a rezultatelor mai convenabila, modificati cea mai recenta
expresie aritmetica pentru a include o divizare cu 60. Rezultatul ar trebui sa fie afisat atat in ore,
ca si in fractii de ore.
Comanda trebuie sa arate astfel:
ATRIBUIRE INCUBATIE = MINUTE(MOMENTUL LUARII CINEI,PERIOADA DE
ATAC)/60
Afisarea ar trebui sa fie astfel.
42
Computer Task 6: Finding the Mean
Gasirea Mediei
Prima data, selectati Analyze Data din meniul principal din Epi Info. Cititi proiectul
SAMPLE.MDB, si selectati tabelul “viewOswego”. Pentru o descriere detaliata a acestui
process, vedeti Computer Task 3.
Din meniul Analysis, sub STATISTICS in meniul din stanga, selectati MEANS. Urmatoarea
caseta de dialog ar trebui sa apara.
43
Apoi apasam ok.
Click aici pentru a vedea media INCUBATIEI dupa SEX.
Activitati suplimentare:
1. Calculati media varstei subiectilor.
2. Calculati media dupa sex.
3. Calculati media varstei a persoanelor bolnave stratificate dupa varsta.
Daca nu ati facut deja, selectati Analyze Data din meniul principal Epi Info.Cititi proiectul
SAMPLE.MDB si selectati tabelul VIEWOSWEGO. Pentru o descriere detaliata referitor la
acest process, verificati Computer Task 3.
Din meniul Analyze, sub STATISTICS din meniul lateral din stanga, selectati GRAPH.
Urmatoarea caseta ar trebui sa apara.
44
Caseta de dialog GRAPH vava permite sa definiti tipul de grafic pe care il doriti si specificati
variabilele ce urmeaza sa le puneti in grafic. Atribute, Titluri pe axis si raze pot fi specificate.
Ca si ilustrare, selectati HISTOGRAM ca si GRAPH TYPE (tipul graficului) si INCUBATIA
ca si VARIABILA Y. Introduceti un titlu potrivit (uitati-va dedesubt), la fel si etichetele pentru
axele X si Y. Apasati apoi OK.
45
Rezultatul dumneavoastra ar trebui sa fie similar cu acesta.
Activitati suplimentare: Creeati un grafic sub forma de PIE CHART (placinta) care sa arate
distribuirea participantilor la biserica pe sexe.
Obiectiv: Crearea tabelelor de 2x2 pentru identificarea asocierilor intre consumul anumitor
mancaruri (variabile expuse) si rezultate (chiar daca s-au imbolnavit sau nu in urma cinei)
Sarcini :Costruiti tabele de 2x2
Obtineti cote de raporturi
Creeati Tabele
Daca nu ati realizat asta inca, selectati Analyze Data din meniul principal Epi Info.
Cititi proiectul Sample.mdb si selectati tabelul viewOswego. Pentru o descriere detaliata asupra
procesului, cititi Computer Task 3.
Comanda TABLES (tabele) va realiza analiza a unor tabele de 2x2, producand statisticice vor
testa asocierea intre doua variabile. Din programul Analysis, sub STATISTICS, in partea stanga,
selectati TABLES. Urmatoarea caseta de dialog ar trebui sa apara.
46
Analysisva produce un table ce va afisa toate posibilele valori pentru fiecare variabila
selectata. Cand doua variabile selectate pot lua doar doua valori, tabelul ce va rezulta va fi de
2x2 (doua coloane si doua linii). Analysis calculeaza Cote de raporturi si Riscuri relative pentru
fiecare table de 2x2.
Urmatorul program din Epi Info va creea un set de tabele 2x2 utilizand produsele alimentare:
BAKED HAM( Sunca la Cuptor), CABBAGE SALAD ( Salata de Varza), CAKES (Torturi),
CHOCOLATE ICE CREAM ( Inghetata de ciocolata ) si VANILLA ICE CREAM ( Inghetata de
vanilie ) ca si variabile expuse si, ca si variabile de iesire, persoane ce au experimentat sau nu
imbolnavire.
1. READ ‘Sample.mdb’:viewOsweg
2. TABLES BAKEDHAM ILL
3. TABELES CABBAGESAL ILL
4. TABLES CAKES ILL
5. TABLES CHOCOLATE ILL
6. TABLES VANILLA ILL
[Click aici] pentru a vedea tabelul de 2x2 cu VANILLA ca si variabila de expunere si ILL ca si
variabila de iesire.
Activitati suplimentare: Creeati un table pentru sex, ca si factor de risc la imbolnavire. Este
sexul un factor de risc in imbolnavirea de la focarul din Oswego?
Analiza stratificata
Daca nu ai realizat asta, selectatiAnayze Data di meniul principal Epi Info. Citeste proiectul
Sample.mdb si selectati tabelul viewOswego. Pentru o descriere detaliata a procesullui, verificati
Computer Task 3.
47
Din programul Anylisis, sub STATISTICS in partea stanga, selectati TABLES (tabele).
In acele cazuri in care variabila este selectata in caseta STRATIFY BY (stratificati dupa),
Analysis va creea o analiza stratificata a factorului de risc (expunerea) si iesirea. Iesire va include
atunci o noua sectiune numita SUMMARY (sumar), unde Cotele de Raporturi brute si ajustate
sunt afisate.
Creeati o iesire pentru VANILA, ca si factor de risc pentru imbolnavire. Stratificati analiza
dumneavoastra dupa SEX. Este SEX o confuzie in acest focar?
[Click aici] pentru a vedea rezultatele dintr-o analiza stratificata.
48