SEP SES

TECNOLÓGICO NACIONAL DE MÉXICO

Instituto Tecnológico de Tijuana

Ing. Bioquímica

Bioquímica del Nitrógeno

Guía de estudio
Unidad 2

Profesor

M.C. Eduardo Méndez Valenzuela

BQ5A

Alumna
Sánchez Martínez Anabel
15211261

Tijuana, B. C. 10 de Octubre del 2017

Guía de estudio – unidad 2
1. ¿Cuáles bases nitrogenadas de las pirimidinas se encuentra únicamente en el ARN?

Uracilo

2. ¿Cómo se denomina la pentosa activada, que representa el punto de inicio de la ruta de

formación de las purinas?

5–Fosforibosil-1-pirofosfato

3. ¿Quién actúa como donador de unidades monocarbonadas en la conversión de dUMP a dTMP

Tetrahidrofolato

4. Mencione los compuestos pueden actuar como agentes alostéricos sobre la subunidad 1 de la
Ribonucleótido reductasa

 ATP
 dATP
 dGTP
 dTTP

5. Mencione tres características de la carbamoil fosfato sintasa

 Posee tres sitios activos diferentes

 Enzima tipo túnel
 La principal fuente de amoniaco es la glutamina
6. Represente como se lleva a cabo la degradación de los nucleótidos de purina y pirimidina
(elabore un diagrama)
7. Elabore una representación gráfica de cada uno de los nucleótidos
 8. ¿Cuál es la importancia de los nucleótidos?

Constitituyen la moneda energética en las transacciones metabólicas, son los nexos químicos en
los sistema celulares y son los constituyentes de los ácidos nucleicos, ADN y ARN.

9. ¿Sobre cuáles carbonos de la ribosa (o desoxirribosa) se presenta el enlace fosfodiester en los

ácidos nucleicos?

Carbono 5´y 3´

10. Representan los dos precursores más importantes en la ruta biosintéticas de novo de los
nucleótidos de pirimidinas

 Carbamoil fosfato
 Aspartato

11. En qué consiste la enfermedad conocida como Inmunodeficiencia severa combinada.

(Descríbala lo más detalladamente posible)

Esta enfermedad se debe a la ausencia hereditaria de la enzima de degradación adenosina

desaminasa.

La adenosina desaminasa actúa sobre la 2´desoxiadenosina que procede de la degradación del

DNA. En segundo lugar, los glóbulos blancos poseen unas concentraciones elevadas de las enzimas
de salvamento, como las nucleosido quinasas, así pues, la adenosina y la 2´desoxiadenosina que se
acumulaban, se convierten con facilidad en los leucocitos en sus respectivos nucleótidos. Estos
nucleótidos incluyen el dATP, que es un inhibidor potente de la replicación del DNA, ya que inhibe
la síntesis de la desoxirribonucleotidos a partir de los ribonucleótidos. Para que se produzca una
respuesta inmunitaria, los glóbulos blancos deben proliferar. A su vez, esta proliferación requiere
una síntesis abundante de DNA y de sus precursores.

12. ¿Cuáles son las bases nitrogenadas que integran a las purinas?

13. En qué consiste la enfermedad conocida como síndrome de Lesch-Nyhan. (Descríbala lo más
detalladamente posible)

Los ácidos nucleicos, especialmente los RNA son degradados por nucleasas que liberan
nucleótidos. Estos nucleótidos son finalmente hidrolizados de forma enzimática a las bases libres
púricas y pirimidínicas. Los vertebrados pueden salvar las bases púricas libres al convertirlas de
nuevo en nucleótidos para reutilizarse en la biosíntesis de ácidos nucleicos. Las dos enzimas
principales que lo hacen, la adenina fosforribosiltransferasa (APRT) y la hipoxantina-guanina
fosforribosiltransferasa (HGPRT).

Un análisis cuidadoso de los pacientes con gota simple debida a un déficit de HGPRT revela unas
concentraciones residuales bajas, pero significativas, de la enzima afectada, Evidentemente, las
mutaciones que causan esta enfermedad altera la actividad catalítica de la enzima, pero no causan
una abolición completa de la misma. Las consecuencias de las “mutaciones nulas” del gen de la
hipoxantina-guanina fosforribosiltransferasa, que causan una ausencia total de la enzima, son
mucho más graves.la guanina y la hipoxantina no se salvan y en su lugar, se degradan conduciendo
a un exceso de excreción de acido úrico.

El síndrome de Lesch-Nyhan es un rasgo ligado al sexo, ya que el gen estructural de la hipoxantina-

guanina fosforribosiltransferasa está situado en el cromosoma X. Los pacientes con este trastorno
presentan una artritis gotosa grave, pero también sufren una disfunción dramática del sistema
nervioso, que se manifiesta en trastornos de la conducta, discapacidad para el aprendizaje y
comportamientos hostiles o agresivos, a menudo contra sí mismos. En los casos más extremos los
pacientes se muerden las puntas de los dedos o, si no se les impide, los labios causándose
automutilaciones graves.

No se conoce la causa bioquímica de este patrón de comportamiento extraño, pero el trastorno,

aunque raro, tiene un gran interés, puesto que todas las aberraciones derivan en última instancia
del déficit de una sola enzima bien caracterizada que afecta a las concentraciones de HGPRT. En la
actualidad no se dispone de ningún tratamiento eficaz, y las personas afectadas presentan una
artritis gotosa tan grave, que rara vez superan los 20 años de vida. La sobreproducción de ácido
úrico puede bloquearse por el alopurinol, pero este tratamiento no es eficaz frente a las
características neurológicas del síndrome de Lesch-Nyhan. No obstante, el trastorno puede
diagnosticarse prenatalmente por amniocentesis, mediante análisis genético molecular del gen
HGPRT.

Las purinas libres se pueden recuperar y volver a integrar en nucleótidos. Defectos genéticos en
ciertas enzimas de recuperación son la causa de este transtorno.

14. ¿Cuáles son los precursores a partir de los cuales se forman la estructura de las purinas?

 Glicina  PRPP
 Aspartato  CO2
 Glutamina  Formil
15. Mencione tres enfermedades asociadas al metabolismo de los nucleótidos (explicar su
fundamento desde el enfoque bioquímico)

 “La gota”

Es una enfermedad de las articulaciones debida a una concentración elevada de acido

úrico en la sangre y en los tejidos. Las articulaciones se inflaman, producen dolor y
desarrollan artritis a causa de una deposición anormal de cristales de urato sódico. Los
riñones también resultan afectados, porque el exceso de acido úrico se deposita en los
tubos renales. Su causa exacta es desconocida, pero a menudo implica una subexcreción
de urato. En algunos casos podría existir una deficiencia genética de alguna enzima del
metabolismo de las purinas. Se consigue una mejoría importante de los síntomas con el
fármaco alopurinol, in inhibidor de la xantina oxidasa, la enzima que cataliza la
transformación de las purinas en acido úrico. El alopurinol es un sustrato de la xantina
oxidasa, que convierte el alopurinol en oxipurinol. El oxipurinol inactiva la forma reducida
de la enzima al permanecer fuertemente unido al sitio activo. Cuando la xantina oxidasa
esta inhibida, los productos de excreción del metabolismo de las purinas son la xantina y la
hipoxantina, que son mas hidrosolubles que el acido úrico y tienen mayor probabilidad de
formas deposito cristalinos.
16. Es la enzima responsable de hidrolizar el enlace entre el grupo fosfato y la ribosa del
nucleótido

Fosfodiésterasas (PDE) o nucleasas (son las llamadas enzimas hidrolasas).

17. Indique por medio de un diagrama cual es la diferencia entre una base nitrogenada, un
nucleósido y un nucleótido.

18. ¿Estructuralmente que se podría comentar del siguiente nucleótido dADP?

Es un nucleótido formado por nucleósido desoxiadenosina esterificado con un grupo de dos

fosfatos. La molécula está formada por azúcar desoxirribosa vinculado con base nitrogenada
adenina por N-ligado entre el 1 'del azúcar de carbono y nitrógeno en la posición 9 de la base, y un
grupo de dos fosfatos esterificado carbono-5', que se unen entre sí por enlace anhidro

19. ¿Cuáles son las bases nitrogenadas que integran a las pirimidinas?

20. ¿Cuáles son los elementos que integran un nucleótido?

 Base nitrogenada
  Azúcar (pentosa)
 Grupos fosfato

21. ¿Cuál es la enzima responsable de la conversión de dUMP a dTMP?

Timidilato sintasa

22. ¿Representa el intermediario más importante de la ruta biosintética de novo de las

pirimidinas

Orotidilato

23. ¿Qué tipo de actividad tiene la enzima carbamoil fosfato sintasa? ¿En qué proceso participa?

Participa en la condensación y activación de amonio y acido carbónico para formar carbamoil

fosfato en el proceso de la ruta de novo de las pirimidinas.

24. Este compuesto actúa como agente regulador central en la regulación de la biosíntesis de
nucleótidos de pirimidinas, uniéndose al sitio alostérico de la aspartato transcarbamoilasa
(ATCasa).

CTP = citidina trifosfato

25. ¿En la metilación del uridilato para producir timidilato por parte de la timidilato sintasa, el
THF transfiere el -CH3 que se genera a partir de que compuestos?

 Metilo
 Metileno
 Formilo

26. A partir de que compuestos inicia la cadena transportadora de electrones que tiene como
resultado final la reducción de la ribonucleótido reductasa.

 NADPH
 NADP+

27. ¿Cuáles son los precursores de las rutas de biosíntesis de salvamento de nucleótidos?
  Ribosa activada
 Aminoácidos
 ATP
 Co2
 Base nitrogenada

28. En que difieren estructuralmente la ribosa de la desoxirribosa

En la posición del grupo OH

29. ¿Cuál base de las pirimidinas se encuentra únicamente en el ADN?

30. Enzima responsable de hidrolizar el enlace entre la base y la ribosa del nucleótido

Nucleosidasa

31. Son dos proteínas transportadoras de electrones en la cadena electrónica, necesaria para la
reducción de la ribosa

 Tioredoxina
 Glutaredoxina

32. ¿Cómo se denominan las enzimas responsables de la generación de nucleótidos por medio
de las vías de salvamento?

 Adenosina fosforribosiltransferasa
  Hipoxantina-guanina fosforribosiltransferasa

33. ¿Cuál es el producto final de la degradación de nucleótidos de purina, previo a su

degradación a otras formas de derivados nitrogenados o nitrógeno orgánico?

Acido úrico

34. Este compuesto actúa como agente regulador central en la regulación de la biosíntesis de
nucleótidos de purinas, inhibiendo la formación de PRPP y por ende toda la ruta biosintética.

ADP

35. En que difiere un nucleótido, un nucleósido y una base nitrogenada

El nucleótido está compuesto por una base nitrogenada, azúcar y grupo fosfato, el nucleósido está
formado solo por la base nitrogenada y el azúcar y la base nitrogenada está constituida por una
purina o pirimidina.

36. ¿De qué forma excretan los anfibios y peces cartilaginosos el producto final de degradación
de nucleótidos de purina?

En forma de urea

37. Representa un punto de regulación importante de la biosíntesis de nucleótidos de purinas,

donde pueden actuar tanto AMP, GMP y IMP. ¿Sobre cuál enzima se lleva a cabo este efecto
regulador?

Glutamina – PRPP amidotransferasa

38. ¿Cuáles son los dos nucleótidos que se forman en la ruta biosintéticas de novo de las
pirimidinas?

 UTP = uridina trifosfato

 CTP = citidina trifosfato

39. ¿Cómo se denomina la pentosa que se encuentra únicamente en el ADN?

Desoxirribosa

40. Como se denomina el intermediario común en la degradación de AMP y GMP

Inosinato
41. ¿Cuál es el producto final de la degradación de nucleótidos de pirimidina, mismo que
posteriormente se degrada a succinil-CoA?

Metil malonil semialdehido

42. ¿De qué forma excretan los mamíferos el producto final de degradación de nucleótidos de
purina?

Alantoina

43. Es la enzima responsable de la reducción de la ribosa

Ribonucleotido reductasa

44. ¿En las rutas de novo de purinas como se denomina el primer nucleótido que se forma, el
cual es precursor de los nucleótidos de los ácidos nucleicos?

Inosinato (IMP)

45. Mencione tres diferencias, al menos, de las rutas de biosíntesis de nucleótidos.

Purinas Pirimidinas
Precursores Glicina, Aspartato, Carbamoil fosfato,
Glutamina, PRPP, Formil Aspartato, PRPP
Energía necesaria 5 ATP 2 ATP
Intermediario Inosinato (IMP) Orotidilato
Productos Adenilato(AMP) y Citidina trifosfato (CTP) y
Guanilato(GMP) Uridina trifosfato (UTP)
46. Represente mediante un esquema, como se lleva a cabo la conversión de los NTP a dNTP por
medio de la ribonucleótido reductasa.

47. ¿A partir de que nucleótido(s) se produce el dTMP?

Timidina monofosfato

48. ¿Cómo se denomina la pentosa que se encuentra únicamente en el ARN?

Ribosa
49. Existe alguna relación entre el metabolismo de los nucleótidos y el ciclo del ácido cítrico.
(Justificar su respuesta)

No existe relación como tal, sin embargo hay compuestos que se aprovechan entre estos dos
procesos, por ejemplo, en la degradación de las pirimidinas se obtiene como producto final el
metil malonil semialdehido que posteriormente se degrada a succinil-CoA a través de propionil-
CoA y metilmalonil-CoA.

50. Mencione todos los aminoácidos que se encuentran asociados a los procesos metabólicos de
los nucleótidos y en cuál de estos participan.

 Glutamina – síntesis de novo purinas, biosíntesis de AMP y AMP a partir de IMP,

biosíntesis de novo de pirimidinas
 Aspartato – biosíntesis de novo de pirimidinas y purinas
 Glicina – conversión de dUMP a dTMP, biosíntesis de novo de purinas