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A diferencia del enlace peptídico los enlaces entre el grupo amino y el átomo de C alfa y
entre el átomo de carbono A y el grupo COO- son enlaces sencillos puros. Las dos
unidadespeptídicas adyacentes rígidas pueden girar alrededor de estos enlaces de forma que
se producen carias orientaciones. Esta libertad de rotaciónalrededor de dos enlaces de cada
AA permite a las proteínas plegarse de formas muy diversas. El Angulo de giro alrededor
del enlace entre el átomo de N y el C α se conoce como Fi. Elángulo de giro en el enlace
entre el C A y el COO- se llama Psi.. los giros alrededor de estos ángulos se concentran en
los llamados ángulos de torsión. Un giro en la dirección de las agujas del reloj sobre
cualquiera de estos enlaces visto desde el átomo de N hacia el carbono α o desde el COO-
hacia el carbono A corresponde a un valor positivo. Los ángulos fi y psi determinan la
arquitectura de la cadena polipeptídica.La importancia de las uniones tanto rígidas como
móviles de las proteínas recae en su estructura, puesto que debido a ellos se establecerá una
estructura determinada, estructura que determinara y condicionara eventualmente, los
demás niveles de estructura proteica, estructura que en última instancia determinara la
identidad de la proteína y por tanto sus funciones y capacidades.
Importancia Biológica:
Los requerimientos estructurales para que una proteína cumpla correctamente su papel
fisiológico son muy rigurosos. No solo es necesario mantener el número y tipo de AA
constituyentes: además, cada uno de ellos debe ocupar una posición definida en la
cadena, alteraciones en ese ordenamiento, o sustituciones de AA, pueden afectar la
capacidad funcional de la Molécula y hasta volverla inútil.
*Este punto que incluyo acá no es pedido en el programa de morfo, más lo incluyo
para que puedan entender con mayor detalle los puntos siguientes*
Existen dos tipos de esta clase de proteínas. Las α y las β queratinas, las αqueratinas son
principalmente proteínas del pelo y uñas y también se las encuentra en la piel de animales.
Son ricas en cisteína. Laα queratina posee dos helicoides queestán unidos de forma
entrecruza por interacciones débiles, tales como fuerzas de van der Waals e interacciones
iónicas. Estas interacciones vienen facilitadas por el hecho de que la superhelice levógira
altera a las dos hélicesdextrógiras, de modo que hay 3,5 residuos por vuelta en vez de 3,6.
De este modo el patrón de interacciones de las cadenas laterales puede repetirse cada siete
residuos, formando la heptada repetitiva. Dos helicoides con tal repetición son capaces de
interactuar uno con el otro si las repeticiones son complementarias. Así por ejemplo los
residuos que se repiten pueden ser hidrofóbicos, estableciendo entre ellos fuerzas de van
der Waals o pueden tener cargas eléctricas opuestas, permitiendo interacciones iónicas,
además, las dos hélices pueden estar unidas por puentes disulfuro formados por residuos
vecinos de cisteína. Launión de las hélices da cuenta de las propiedades físicas de la lana.
Unejemplo de la α queratinaen la estructura de estas proteínas filamentosas predominan las
αhélices, en trozos de más de 300 AA de longitud. Dos de estas largas αhélices suelen
enrollarse una sobre otra formando una doble hélice (Consta de dos hélices αdextrógiras
enrolladas mutuamente para formar un tipo de hélice de héliceslevógiras, llamadas superhelice.).
En el pelo, es común encontrar fibras muy flexibles, constituidas por superhelice de cuatro
cadenas polipeptídicas. En otros tejidos, especialmente en las uñas, las fibras tienen menor
flexibilidad debido a la existencia de gran cantidad de puentes de disulfuro entre cisteínas
de diferentes cadenas. Las β queratinas presentan laminas β como elemento estructural más
característico. Este tipo de proteínas se encuentra en plumas de aves y escamas de reptiles
8. Caracterizar la estructura de la fibroína de la seda como ejemplo de la
queratina: tomando en cuenta: A) AA más frecuentes B) dirección de las
cadenas polipeptídicas C) Fuerzas que la estabilizan D) AA que interfieren en
la formación de su estructura:
La fibroína de la seda es una agrupación de ß-queratinas en conformaciónhoja plegada-ß
anti paralela unidas por enlaces de hidrógeno intracatenarios. La fibroína y otrasß-
queratinas son muy ricas en aminoácidos poco voluminosos (gly y ala), lo que facilita que
lashojas se apilen unas sobre otras, de tal modo que se alternan zonas de contacto entre
glicinas yzonas de contacto entre alaninas, interaccionando mediante fuerzas débiles de van
der Waals.Este hecho hace posible que la seda pueda extenderse en fibras fácilmente
separables (separandohojas) pero relativamente difíciles de romper (implicaría romper los
enlaces peptídicos).Por otro lado, existe la posibilidad de transformar la a-queratina en ß-
queratina. Así, cuando elpelo o la lana se someten a la acción del vapor (calor + humedad)
pueden incluso duplicar sulongitud. Lo que ocurre es que se rompen los puentes de
hidrógeno de la hélice-a y las cadenaspolipeptídicas adoptan una conformación-ß; no
obstante los grupos -R de las a-queratinas sonmuy voluminosos, lo que hace que la
conformación-ß se desestabilice y al poco tiempo adopte denuevo la conformación en a-
hélice con lo que el pelo o la lana recuperan su longitud original.
9. Caracterizar la estructura secundaria del colágeno, precisando las siguientes
características, unidad estructural, AA más abundante, arreglo espacial de las
cadenas polipeptídicas:
Las cadenas polipeptídicas del colágeno debido a su estructura primaria tan rica en prolina
e Hidroxiprolina, no pueden formar hélices A. el núcleo pirrolidina impone a la cadena
disposiciones incompatibles con la hélice A. en el colágeno se forma en cambio una hélice
más extendida que la A, enrollada hacia la izquierda (Hélicelevógira), con tres residuos por
vuelta. Este tipo de hélice es una estructura proteínica casi exclusiva del colágeno.
Tres cadenas polipeptídicas así enrolladas se asocian para formar una superhelice, las tres
hélices se envuelven a su vez apretadamente sobre un eje central, de manera similar a las
hebras de una soga. Las cadenas se interconectan y se mantienen unidas mediante puentes
de H, estas uniones son transversales, intercatenarias (Entre cadenas diferentes), lo cual las
distingue de la hélice A, estabilizada por enlaces intracatenarios. La triple hélice forma una
unidad estructural llamada tropocolágeno, bastoncillo de 300 nm de longitud y 1,5 nm de
diámetro, cada una de las cadenas de una unidad de tropocolágenoestán compuestas por
unos 1000 residuos AA, las unidades de tropocolágeno se disponen en hileras y estas a su
vez se empaquetan en aces que constituyen fibrillas.
Cada segmento de tropocolágeno en una hilera está desplazado con respecto al siguiente
segmento de la hilera en aproximadamente un cuarto de la longitud total de la unidad, este
desplazamiento se mantienen con gran regularidad y es responsable de las estriaciones que
presentan las fibrillas colágenas.
La rotación libre solo es posible alrededor de dos de los tres enlaces covalentes del
esqueleto polipeptídica: el carbono A, el COO- (Co) y el C A del enlace nitrógeno.
Elcarácter de doble enlace parcial del enlace peptídico que une el Co al nitrógeno A
requiere que el carbono carbonilo, el oxígeno carbonilo y el nitrógeno A permanezcan
coplanares, lo que evita la rotación. El Angulo alrededor del enlace C A-N recibe el
nombre de Angulo Fi, mientras que aquel ubicado alrededor del enlace de Co-CA es el
Angulo psi. Para AA que NO son Glicina, casi ninguna combinación de ángulos fi y psi
se permite debido a obstáculosestéricos. Lasconformaciones de prolina son aún más
restringidas debido a la ausencia de rotación libre del enlace N-Cα. Las regiones de
estructura secundaria ordenada surgen cuando una serie de residuos AA adoptan
ángulos fi y psi similares, los segmentos extendidos de polipéptidos llegan a poseer
diversos ángulos de ese tipo.
Por ejemplo:
Las proteínas globulares: son aquellas en las cuales la molécula se pliega sobre sí misma
para formar un conjunto compacto semejante a un esferoide u ovoide, con sus tres ejes de
similar longitud. En general, son proteínas de gran actividad funcional: Enzimas,
anticuerpos, hormonas, hemoglobina, etc., pertenecen a este grupo, son solubles en agua
Ej.: Albuminas, Hemoglobina, Anticuerpos, Glutelinas, Histina…
Los restos no polares aparecen, casi siempre, en el interior de la proteína, para no entrar
en contacto con el disolvente acuoso que la envuelve, creando un ambiente hidrofóbico.
Los residuos polares con carga se hallan situados, normalmente en la zona externa,
interaccionando con el medio acuoso. A veces, se requiere de estos centros en la parte
interna de la proteína y en estos casos también ocurre que están directamente
implicados en alguna funcionalidad de la proteína, bien a nivel estructural o bien a nivel
catalítico.
Los grupos polares sin carga, aparecen distribuidos por la totalidad de la cadena, si bien
mayoritariamente, también aparecen en las partes externas, en contacto con la
disolución acuosa.
Como consecuencia de esta distribución de restos, las proteínas globulares son muy
compactas,hay poco espacio en el interior, de modo que el agua difícilmente accede a dicho
espacio.Algunas proteínas, como le ocurre a la mioglobinaestán constituidas solo por
hélices-a. La estructura terciaria de la mioglobina, se trata de una proteína globular que
contiene unasola cadena polipeptídica, constituida por ocho segmentos de hélice-a. La
mioglobina se halla,principalmente, en las células de los músculos esqueléticos y es
especialmente abundante en losmamíferos buceadores, en los que no sólo actúa
almacenando oxígeno, sino tambiéncontribuyendo al aumento de la velocidad de difusión
del oxígeno. La proteína, además, contieneun componente no proteico, el grupo hemo que
permite la oxigenación y desoxigenación deforma reversible.
En general, los agentes desnaturalizantes no atacan las uniones peptídicas, razón por la cual
la estructura primaria no está afectada. Escomún que la desnaturalización produzca
insolubilidad de la proteína. Un ejemplo familiar de desnaturalización es la provocada por
el calor en las proteínas de la clara de huevo. Ladesnaturalización, que se exterioriza por la
aglomeración de todas las moléculas en una masa sólida. Frecuentemente este tipo de
desnaturalización es un proceso irreversible. En cambio cuando la desorganización
molecular no es muy intensa la proteína puede retomar su conformación original cuando se
elimina el agente desnaturalizante, se dice entonces que el proceso es reversible.
IMPORTANTE:
En la creación de esta guía se ha utilizado material didáctico obtenido de los libros:
Lubert Styer Bioquímica 6Ed Cap 2
Apuntes de clases “Aminoácidos y proteínas” Curso: CQU312 Bioquímica Facultad de Ciencias
agropecuarias, universidad de las américas
Harper Bioquímica Ilustrada 28Ed Cap 4, 5 y 6
Bioquímica de Blanco. Cap 3