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LWT - Ciencia y Tecnología de Alimentos

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Exploración de la diversidad y potencial biotecnológico de bacterias de ácido láctico a partir de tocosh


- tradicionales patatas fermentadas Perú - por secuenciación de alto rendimiento (HTS) y el
cultivo

Eugenia Jim enez do , 1 , Alba Y EPEZ un , 1 , Alba P Erez-Catalu ~ n / A un , Elena Ramos V asquez re ,
Doris zú ~ Niga D Ávila re , Graciela Vignolo do , Rosa Aznar un , segundo , *
un Departamento de Microbiología y Ecología, Universitat de Val encia (UVEG), Av. El Dr. Moliner 50, 46100, Burjassot, Valencia, España
segundo Departamento de Biotecnología, Instituto de Agroquímica y Tecnología de Alimentos (IATA-CSIC), Calle Agustín Escardino 7, 46980 Paterna, Valencia, España

do Centro de Referencia para Lactobacilos (CERELA), Chacabuco 145, 4000 Tucum una, Argentina
re Laboratorio de Ecología microbiana y Biotecnología “ Marino Tabusso ”, Universidad Nacional Agraria La Molina, Lima, Perú

información del artículo abstracto

Historia del artículo: Las bacterias ácido lácticas (LAB) diversidad asociada con tocosh, Peruanos patatas fermentados tradicionales, fueron para el fi tiempo primer
Recibió 9 de junio de 2017 recibida en investigado mediante el cultivo y secuenciación de alto rendimiento (HTS) se acerca. Se aplicaron en tres muestras es decir, patatas recién
forma de 21 Revisión de septiembre de
cosechadas, un mes y ocho meses de producción. Mientras que por el enfoque de la cultura dependiente de unos pocos Lactobacillus (Lb) especies
2017
( Lb. sakei, Lb. casei, Lb. farciminis, Lb. brevis, Lb. fermentum) y Leuconostoc mesenteroides (Ln) Se identificaron fi ed, veinticuatro UOT
Aceptado 22 de de septiembre de 2017 Disponible en Internet
pertenecientes a seis géneros LAB fueron considerados en tocosh muestras por HTS, siendo Lactobacillus dominante en las tres muestras. LAB
el 25 de septiembre de 2017
predominaba en las patatas frescas, mientras Clostridium, Zymophilus y Prevotella fueron los género más abundantes en 1- y 8-mes tocosh muestras.
Cuando se investigaron las características biotecnológicas, amilasa y habilidades fitato-degradantes, así como EPS y vitamina del grupo B (ribo Florida
palabras clave:
producción avin y ácido fólico) se exhibió por varios Lb. sakei y Ln. mesenteroides son. rasgos de seguridad de las principales especies de BAL
Las bacterias ácido lácticas

diversidad bacteriana
de tocosh mostró actividad antibacteriana, así como la capacidad de producción aminas biogénicas. El inventario molecular logrado por HTS
tocosh enfoque proporcionó información sobre composición de la población LAB durante la fermentación de este producto fermentado patata ancestral
Alta secuenciación rendimiento (HTS) potencial mientras cultivando permitió la selección de cepas de LAB adecuados para diseño novedoso culturas funcionales para la producción de
biotecnológico productos ricos en almidón fermentados.

Los compuestos químicos estudiados en este artículo:

Sacarosa (PubChem CID: 5988) fitato de calcio


(PubChem CID: 24495) fitato de sodio (PubChem CID:
66391) Ribo Florida avin (PubChem CID: 493570) ácido © 2017 Elsevier Ltd. Todos los derechos reservados.

fólico (PubChem CID: 6037)

L- Tirosina (PubChem CID: 6057)


L- Histidina (PubChem CID: 6274)
L- Lisina (PubChem CID: 5962)
L- Arginina (PubChem CID: 6322)

1. Introducción para preservar los cultivos nativos, así como su producción, recolección y almacenamiento durante
siglos. Entre ellos, las patatas, se originaron hace aproximadamente 8.000 años, en los Andes de
la fermentación de los alimentos de los hogares tiene una larga tradición y muy importante en América del Sur, albergues Perú uno de los reservorios más importantes de variedades y parientes
los países de América Latina ( Londoño sin-Zapata, Durango- silvestres ( Goldner, P Erez, Pilosof, y Armada, 2012; Mosso, Lobo, y Samm una de 2016; Vel asquez-Milla,
Zuleta, Sepúlveda-Valencia, y Moreno Herrera, 2017; Tamang, Watanabe, y Holzapfel, 2016 ). Casas, Torres-Guevara, y CruzSoriano de 2011 ). Numerosas formas ingeniosas de la preservación
comunidades andinas han logrado de las patatas con el fin de mantener existencias adecuadas para la supervivencia se han
desarrollado, tales como el secado al sol o liofilización natural para obtener blanco o negro chu ~

* Autor correspondiente. Departamento de Microbiología y Ecología, Universitat de Val encia (UVEG), Av. El Dr.
Moliner 50, 46100 Burjassot, Valencia, España. no y la fermentación para obtener tocosh.
Dirección de correo electrónico: rosa.aznar@uv.es (R. Aznar).
1 Igualmente contribuido. Papas tocosh es un producto alimenticio fermentado ancestral que es

https://doi.org/10.1016/j.lwt.2017.09.033
0023-6438 / © 2017 Elsevier Ltd. Todos los derechos reservados.
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siendo preparado en pequeñas comunidades de las tierras altas de los Andes Centrales del Perú por Tradicionalmente, preparado por los productores locales de la comunidad de un Tambog, (Hu anuco,
campesinos locales ( Horkheimer, 1973 ). El método de preparación tradicional consiste en la Perú) situado en 2500 m sobre el nivel del mar ( Figura 1 ). La región presenta temperaturas medias
excavación de un pozo (0,70 1,50 m de profundidad) en el suelo cerca de un manantial de agua en la anuales de 12 C, veranos e inviernos con heladas fuerte, la temperatura de lluvia durante el día
que grandes cantidades de patatas (patatas normalmente descartadas) se colocan entre las capas siendo en gran parte variable de (22 a 3 C) pero mantenga constante a lo largo del año. Debido a dif fi acceso
de paja. Rocas se utilizan para cubrir la pila con el fin de evitar que los tubérculos de ser arrastrado culto a este lugar, se recogieron todas las muestras a la vez en el verano de 2012, correspondiente a
por la ligera corriente de agua que pasa a través de la zanja; las patatas se deja fermentar en esta las patatas recién cosechadas (antes de colocar en el Groundwell), 1-meses y 8 meses tocosh pozos
agua corriente hasta 12 meses. Después de este tiempo, las patatas sufren un pardeamiento de almacenamiento. Se analizaron muestras (5 g) como se describe previamente para los recuentos
enzimático ( Zvitov-Ya'ari y Nussinovitch, 2014 ) Y se ponen en una zona de sombra en seco para microbianos ( Elizaquível et al., 2015 ): Recuentos de mesófilos totales en la placa Count Agar, se
permitir que el agua drene. El producto obtenido se mantiene para el consumo, venta o más incubaron aeróbicamente a 30 C durante 72 h; LAB en MRS que contenía glucosa (MRS), maltosa
comúnmente, como un secado al sol y la tierra fi nordeste Florida nuestro tipo de producto que se (MRS-M) o almidón (MRS-S) al 0,5% (w / v) y la levadura Glucosa Lactosa Peptona (YGLP), se
utiliza para preparar diferentes caldos, guisos y “ mazamorra ” que es un alimento semi-líquido con incubó anaeróbicamente a 30ºC durante hasta 7 días; levaduras totales y moldes en levadura y agar
consistencia espesa ( De Moreno de LeBlanc, Todorov, Vignolo, Savoy de Giori, y LeBlanc, 2014 ). Moldes, incubados aeróbicamente a 30 C durante 72 h. Los conteos se realizaron por triplicado. Para
Desde un punto de vista microbiológico, sólo los estudios preliminares se han realizado demostrando cada muestra, hasta seis colonias por placa y medio LAB, que representan diferentes morfologías, se
que tocosh resultados de la fermentación microbiana, principalmente por los lactobacilos. Además de seleccionaron al azar a partir de placas con 30 mi 300 colonias y sub-cultivaron en el medio
ser un alimento básico importante para la población local, los compuestos generados por estos bene fi correspondiente. Los aislados que eran Gram positivas y catalasa negativos fueron considerados
Se cree que los microorganismos ciales para ser responsable de la gran diversidad de propiedades como LAB presunto y se almacenaron a 20 C en los mismos medios líquidos que contienen 20% (v /
medicinales atribuidas a este producto como tal ser conocido como el “ antibiótico natural de los Incas ”. v) de glicerol para su posterior análisis. Muestras pH se determinó a partir de muestras
Aunque ningún científico fi Se encontraron artículos c apoyan estas reivindicaciones, su potencial homogeneizadas utilizando un medidor de pH digital (PT-10 Sartorius).
probiótico se demostró usando un modelo animal experimental y se compara con un probiótico
reconocido Lactobacillus acidophilus

2.3. análisis dependiente de la cultura de las poblaciones LAB


LA-5 ® tensión ( Prentice y Milka, 2005 ). Las bacterias ácido lácticas (LAB) por lo general están
involucrados en los alimentos tradicionalmente fermentada de origen vegetal, y muchas especies de 2.3.1. identi LAB basado en PCR fi catión
BAL han sido descritas como productores de vitaminas o degradadores de fitato ( Anastasio et al., Extracción de ADN y identi fi cación de los aislados puros en especies fue abordado siguiendo
2010; Juárez del Valle, Lai ~ no, tres pasos programar como se ha descrito previamente ( Elizaquível et al., 2015 ), Con algunas
Savoy, de Giori, y LeBlanc, 2014; Ruiz-Rodríguez et al., 2016 ). Recientemente ambiental y modificaciones fi cationes: aislados de cada grupo ISR, se sometieron a análisis RAPD-PCR usando
microbiología de los alimentos se han beneficiado fi ted de los avances en biología molecular y cebadores universales P2 (5 0- GATCGGACGG-3 0) y P16 (5 0-
adoptadas nuevas estrategias para detectar, identificar y controlar los microbios. Un estudio en
profundidad de la diversidad microbiana en los alimentos ahora se puede lograr mediante el uso de TCGCCAGCCA -3 0) como se describe por Samar zija, Sikora, Redzepovi c, Antunac, y Havránek de
highthroughput secuenciación (HTS) se acerca después de la extracción directa de ácido nucleico de 2002 , Además, las secuencias de 16S ARNr de los aislados seleccionados que representan los
la muestra a ser estudiado; el escenario actual de esta aproximación metagenómica para estudiar la diferentes grupos se compararon con el Proyecto de base de datos ribosomal (RDP) ( http: // RDP.
microbiota comida fue descrito por Ercolini (2013) . Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue evaluar cme.msu.edu/ ) Para la identificación de especies fi catión.
las poblaciones presentes en LAB tocosh y dar a conocer su potencial biotecnológico para
aplicaciones futuras. patatas frescas y las muestras de fermentación de dos pozos correspondientes
a dos tiempos de almacenamiento se analizaron mediante la combinación de ambos enfoques, 2.3.2. El análisis de conglomerados de ISR-PCR y RAPD-PCR pro electroforética fi Les
dependiente de la cultura y HTS.
Las imágenes digitalizadas se convirtieron, normalizada, analizados y combinarse usando el
paquete de software BioNumerics 4,61 (Applied Maths, Kortrijk, Bélgica). identi fi cación de pro fi Les
fue realizado por comparisonwith una base de datos previamente generatedwith la ayuda del
software BioNumerics, que contiene ISR y pro RAPD fi les corresponde a 132 cepas de referencia ( Chenoll,
2. Material y métodos Maci una, Elizaquível, y Aznar, 2007 ).

2.1. Cepas y condiciones de crecimiento bacteriano

culturas de referencia de laboratorio utilizados en este trabajo fueron suministrados por la Colección 2.4. El análisis independiente del cultivo de las poblaciones bacterianas
Española de Cultivos Tipo (CECT) de la siguiente manera: Lactobacillus sakei subsp. sakei CECT 906 T, Leuconostoc
mesenteroides subsp. 2.4.1. aislamiento de ADN tocosh, 16S rRNA ampli gen fi cationes y pirosecuenciación
cremoris CECT 872 T, Leuconostoc mesenteroides subsp. dextranicum
CECT 912 T, Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides CECT 219 T, Lactobacillus amylophilus CECT Para el aislamiento de ADN, 10 ml de cada muestra homogeneizada fue tomada de la fase
4133 T. cepas de LAB se cultivaron rutinariamente en MRS (De Man, Rogosa y Sharpe) medio (Oxoid) líquida superior y se centrifugó (5.000 gramo, 10 minutos). El ADN total se extrajo utilizando el kit de
a 28 C y se almacena en un medio líquido de crecimiento que contiene 20% (v / v) de glicerol a 80 DO. preparación de ADN bacteriano (Jena Biosciences, Alemania) según las instrucciones del fabricante.
Listeria monocytogenes FBUNT (Facultad de Bioquímica, Qui yo mica y Farmacia, UNT, Argentina) y

Amplicón preparación biblioteca y pirosecuenciación se llevaron a cabo por Lifesequencing Inc.


Bacillus subtilis 168 (PROIMI-CONICET) se cultivaron durante la noche en caldo de soja Trypticase (Valencia, España). El ADN aislado a partir de
(TSB, Britania, Argentina) a 30 DO. tocosh muestras se utilizó como molde para la amplificación fi catión de la V3 mi V5 región hipervariable
del 16S bacterianas rRNA genes con conjunto de cebadores 357F / 926Rb ( Sim et al., 2012 ).
2.2. Procesamiento de las muestras, el análisis microbiológico y el aislamiento LAB Amplicon preparación biblioteca y pirosecuenciación se llevó a cabo por Lifesequencing Inc.
(Valencia, España) como se describe previamente en Elizaquível et al. (2015) .
Patata tocosh las muestras se obtuvieron a partir de pozos de tierra
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UN

que cubra las papas en capas

Excavado también. Los filtros de agua de paja manantial de agua

Las patatas se colocan dentro de

segundo

paja de capas

Patatas después de 8 meses de

Figura 1. Tradicional tocosh producción. (A) Planta bien excavado cerca de una fuente de agua donde las patatas se colocan entre las capas de paja; (B) Patatas quitan de un bien después de un almacenamiento de 8 meses mi tocosh.

2.4.2. Bioinformática y datos pirosecuenciación análisis 2.5.5. la producción de aminas biogénicas


Secuencias más cortas de 300 pb y los de calidad media la puntuación más baja que 20 fueron La capacidad de descarboxilar los aminoácidos utilizados como precursores fue probado de
eliminadas mediante herramientas de servidor Galaxy ( Goecks, Nekrutenko, y Taylor, 2010 ), El acuerdo con Bover-Cid y Holzapfel (1999) metodología.
algoritmo de UCHIME mientras
Edgar, Haas, Clemente, membrillo, y Knight (2011) se aplicó usando la base de datos RDPII 16S 2.5.6. Actividad antimicrobiana
rRNA ( http://rdp.cme.msu.edu/ ) Como referencia para eliminar las secuencias quimera. Para estimar La actividad antibacteriana de los aislados de BAL se determinó contra
la riqueza de especies en cada muestra, el aRarefactWin programa gratuito por Holland ( http: // L. monocytogenes FBUNT y B. subtilis 168 (PROIMI-CONICET) como cepas sensibles por la prueba
strata.uga.edu/software/anRareReadme.html ) Se utilizó y se obtuvieron curvas de rarefacción. de la mancha agar ( Fontana, Cocconcelli, Vignolo, y Saavedra, 2015 ). La actividad inhibidora se
Entonces, las secuencias se agruparon en UOT (unidades taxonómicas operacionales) en 97% de expresó como þ ( presencia halo) o - (no hay halos) alrededor de la mancha.
similitud de secuencia con las secuencias depositadas en RDPII y se agruparon como se describe
por Cole et al., (2005) .

3. resultados

3.1. identi fi cación de la comunidad bacteriana como se determina por HTS


2.5. Caracterización funcional y la seguridad de LAB

identi fi cación de las poblaciones bacterianas asociadas a tocosh fue realizado por alto
2.5.1. Exopolisacáridos (EPS) de producción rendimiento 454 pirosecuenciación. Parcial secuenciación de genes 16S rRNA se obtuvo a partir de
la producción de EPS fue asignado a cepas que formaron colonias mucoides en MRS-sacarosa ADN extraído directamente de cada tres tocosh muestras. Después de control de calidad, 42.530
( Notararigo et al., 2013 ). lecturas se obtuvieron con una longitud media de 541 pb y se analizó (19.224; 9.254 y 14.052 en
patatas frescas, 1- y 8 meses muestras, respectivamente); lee distribución y valores Chao / Shannon
2.5.2. actividad fitato-degradantes se muestran en la tabla 1 . análisis vacuo y los índices de diversidad indicaron que therewas cobertura
actividad fitato-degradantes se ensayó utilizando el método descrito por Anastasio et al. (2010) . satisfactoria de la diversidad dentro de los tres lotes analizados. La abundancia relativa de los niveles
taxonómicos calculados a nivel phylum indica que Firmicutes predominado en tocosh producción,
seguida en menor proporción por Bacteroidetes. Como se puede observar en Figura 2 A, LAB
2.5.3. actividad amilolítica predominó en patatas frescas, mientras que estaban por debajo de 25% en 1y 8-ocho meses
La degradación del almidón fue investigado por inoculación punto de LAB activo aislamientos de muestras. asignación de secuencia a nivel de género ( Figura 2 B y C) mostraron que Lactobacillus y Leuconostoc
acuerdo con el procedimiento llevado a cabo por DíazRuiz, Guyot, Ruiz-Terán, Morlon-Guyot, y Wacher, se detectaron en todas las muestras, mientras Lactococcus Sólo se encontraron en un mes muestra
(2003) . Lb. amylophilus CECT 4133 T se usó como cepa de control degradantes de almidón positivo. de fermentación. Carnobacterium, Weissella y Pediococcus estaban presentes en porcentajes bajos.
Ocho meses de la muestra mostraron la mayor diversidad a nivel de género con fi cinco géneros
representado ( Lactobacillus, Carnobacterium, Pediococcus, Leuconostoc,

2.5.4. la producción de vitamina B Grupo


La producción de los folatos y ribo Florida avinwas evaluado siguiendo los métodos ya descritos ( Lai
~ no, Juárez del Valle, Savoy de
Giori, y LeBlanc, 2013; Juárez del Valle, Lai ~ no, Savoy de Giori, y
LeBlanc, 2014 ) Y con base en los bioensayos microbiológicos.
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tabla 1
Número de secuencias analizadas, observado riqueza diversidad (OTU), la riqueza OTU estimado (Chao1) y el índice de diversidad (Shannon) para ARNr 16S amplicones de tocosh.

Muestra No. de secuencias Otus índice Chao Diversidad de Shannon

patatas frescas 19224 74 97,75 (81,98; 144,61) 0.92 ( ± 0,00015)


1 mes un 9254 330 439,20 (396,23; 510,02) 4.06 ( ± 0,00025)
8 meses 14052 295 402,50 (356,43; 483,10) 3.76 ( ± 0,00018)

un El tiempo de almacenamiento en el pozo muestreado.

la UOT con un nivel de abundancia por encima de 0,1% en al menos una tocosh
muestra ( Fig. 3 ). Sesenta y tres OTU fueron identificados fi ed, de ellos veinticuatro perteneciente a
seis géneros LAB, fueron considerados. La diversidad en
Lactobacillus especies aumentaron de patatas frescas a 1 y 8 meses muestras con 3, 7 y 12
especies identi fi ed, respectivamente;
Lb. sakei siendo la única especie presente en las tres muestras.
Lactobacillus mostró la mayor diversidad de especies con 16 identifi-
fi ed UOT, seguido de Leuconostoc con tres especies recuperadas; uno de ellos Ln. mesenteroides estaba
presente en las tres muestras analizadas. Dos especies se identificaron fi ed que pertenece al género Lactococcus
y uno a Weissella, Carnobacterium y Pediococcus. Las especies más abundantes en tocosh la
producción eran Lb. sakei en las patatas frescas (96,6%) y la muestra 1-mes (9,5%) y Lb. casei en 8
meses de muestra (7,1%).

3.2. análisis microbiológico dependiente Cultura

Resultados en el análisis microbiológico de tocosh muestras se muestran en Tabla 2 . La


tendencia de los recuentos totales paralela a la de la población LAB en las tres muestras. bacterias
mesófilas totales en PCAvaried from4.3 10 6 a 1,9 10 8 CFU / g de la fase inicial al lote 8-meses,
mientras que los recuentos de LAB en medios MRS y YGLP mostraron niveles similares, que
aumentó de 7,4
10 2 y
1.1 10 3 CFU / g a 5,5 10 7 y 1.1 10 7 CFU / g, respectivamente, para las patatas frescas y 8-meses
muestras. No hay diferencia en los recuentos de LAB se observó inMRS-M o MRS-S excepto una
reducción de un registro de 8 meses muestra en MRS-S. Total de mohos y levaduras disminuyó de

7,1 10 3 ( patatas frescas) a 1,0 10 2 CFU / g (8-muestra). Una disminución en el valor de pH 5,5 a 3,8
se registró en la muestra 1-mes, en coincidencia con los recuentos de LAB más altas, mientras que
una fi valor final de 4,2 se encontró en muestra de 8 meses.

3.3. identi fi cación de LAB aísla y distribución de las especies entre las muestras tocosh

Un total de 151 colonias de tocosh muestras recuperadas fromMRS y placas YGLP fueron
considerados como LAB presuntivo porque eran Gram-positivas y catalasa-negativa. En primer lugar,
16S mi ampli 23S ISR fi catión dio un a fi cinco bandas de tamaños moleculares de 300 a 1000 pares de
bases correspondientes a los géneros Leuconostoc y

Lactobacillus. Se analizaron sesenta y seis secuencias de genes 16S rRNA que muestra los niveles
de similitud> 99% cuando se compara con secuencias públicas de especies de BAL. Distribución de
especies de BAL entre tocosh
muestras se muestran en la Tabla 3 . En las patatas frescas y muestras de 1 mes, sólo Lb. sakei y Ln.
Figura 2. identi fi cación de las poblaciones bacterianas en tocosh derivado de HTS análisis correspondientes a cada lote
mesenteroides se recuperaron, con un claro predominio de Ln. mesenteroides. En muestra de 8
muestreado, patatas frescas, y tocosh a partir de 1- y 8 meses de almacenamiento pozos excavados cerca de un manantial de
meses, Lactobacillus especies fueron más abundantes, que implica, además, Lb. brevis, Lb. casei,
agua. La abundancia relativa (%) de las familias (A), géneros (B) y géneros LAB (C) se muestran, teniendo en cuenta las
secuencias que excedieron 1% en al menos una de las muestras.
Lb. farciminis y Lb. fermentum, mientras Leuconostoc

fue menos representado con una sola Ln. mesenteroides aislar recuperado.
y Weissella). Además de LAB, otros géneros se evidenciaron tales como
Clostridium, Zymophilus y Prevotella, siendo el primero el más abundante en 1 y 8-meses muestras ( Figura
2 A y B). Clostridium acetobutylicum y Clostridium tyrobutyricum fueron encontrados en una mayor 3.4. Caracterización funcional y la seguridad de las cepas de LAB
proporción ( Fig. 3 ).
Con el fin de buscar cepas de laboratorio con potencial biotecnológico, un total de 62 de 151 tocosh
La composición de la comunidad de LAB se analizó mediante la construcción de un mapa de Se seleccionaron cepas que representan diferentes especies y lotes, Lb. brevis ( 1), Lb. casei ( 9), Lb.
calor que representa la abundancia relativa de
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Fig. 3. Heat-mapa que muestra la abundancia de especies de bacterias y distribución en cada lote muestreado, patatas frescas, y tocosh a partir de 1- y 8 meses pozos de almacenamiento. Las especies que representan más del 0,1% están representados.
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Tabla 2 eran activos después del tratamiento con proteinasa K evidenciando su naturaleza proteica (datos no
Análisis microbiológico de patatas frescas, y tocosh lotes from1- y 8-meses pozos de almacenamiento.
mostrados).

patatas frescas 1 mes 8 meses

Los recuentos totales mesófilos 4.3 10 6 5,8 10 7 1.2 10 8 4. Discusión


LAB (MRS) 7,4 10 2 2.1 10 5 5.5 10 7
LAB (YGLP) 1.1 10 3 1.7 10 5 1.1 10 7 Para proporcionar una visión global de las comunidades microbianas de
LAB (MRS-M) 1.6 10 2 2,5 10 5 5.7 10 6
tocosh, y en particular las poblaciones de LAB, ambos enfoques dependiente de la cultura y
LAB (MRS-S) 1,5 10 2 6,2 10 4 4,2 10 6
-independiente se aplicaron con el fin de revelar las especies de BAL y recuperar cepas a ensayar
levaduras y mohos totales 7,1 10 3 2,7 10 3 1,0 10 2
pH 5.5 3.8 4.2 adicionalmente durante capacidades biotecnológicas pertinentes. Los métodos de cultivo mostraron
que LAB estaban presentes en un almacenamiento de 8-mes tocosh a nivel algo más bajo (10 6 mi 10 7 UFC
/ g) que otros productos tradicionalmente fermentados como el africano y alimentos amiláceos /

Tabla 3 bebidas andinas ( Elizaquível et al, 2015.; Sekwati-Monang & G €


La recuperación de las BAL aisladas de las patatas frescas, y tocosh lotes a partir de 1- y almacenamiento 8 meses pozos.

anzle de 2011 ). en fresca

así de almacenamiento (meses) Total patatas, LAB fueron una pequeña parte de la microbiota autóctona (10 2 mi 10 4 CFU / g) en
identificación de especies fi catión coincidencia con los resultados reportados por Di Cagno, Coda, De Angelis, y Gobbetti, 2013 , Para
0 1 8
las verduras y frutas crudas. análisis HTS proporcionan una instantánea de las poblaciones de
Número de aislados 41 46 64 151
bacterias que revela una presencia notable de Clostridium superando LAB en 1 y 8 meses muestras.
Lactobacillus Ambos enfoques evidenciaron una diversidad de especies LAB superior a 1 y muestras de 8 meses
Lb. brevis 1 1
que en patatas frescas, lo que podría ser explicado por cambios en nutrientes en fermentación en los
Lb. casei dieciséis dieciséis
pocillos. tubérculos de patata contienen aproximadamente 18 mi 20% de carbohidratos de los cuales
Lb. fermentum 1 1
Lb. sakei 10 19 44 73 16% es almidón ( Burlingame, Mouill e, y antes de Charrondi de 2009 ) Y por lo tanto bacteriana
Lb. farciminis 1 1 crecimiento depende de la degradación del almidón. La mayor parte de LAB carecen de actividad
Leuconostoc amilolítica; que está de acuerdo con la ocurrencia poco frecuente de genes de amilasa en
Lc. mesenteroides 31 27 1 59
lactobacilos ( GRAMO € anzle, 2014 ). Sin embargo, clostridia incluyen especies sacarolíticas, que
podrían haber contribuido a proporcionar de bajo peso molecular maltooligosacáridos para apoyar el
crecimiento del microorganismo no amilolítica.
farciminis ( 1), Lb. fermentum ( 1), Lb. sakei ( 28), Ln. mesenteroides
(22), que fueron seleccionados para varias características funcionales y de seguridad pertinentes ( Tabla
4 ). Entre las propiedades funcionales, la actividad amilolítica sólo se detectó en Ln. (mesenteroides 23%)
y Lb. sakei ( 7%) cepas, mientras que la actividad de fitato-degradantes notable (> 100 U / ml) se
encontró entre cepas que pertenecen a las tres especies. Como se esperaba, las cepas productoras patatas frescas fueron dominados por Lactobacillus, en coincidencia con la descrita
de EPS pertenecían a Ln. (mesenteroides 100%) y Lb. sakei ( 18%). Además, todos Lb. sakei producir anteriormente para las fermentaciones espontáneas amiláceas ( De Vuyst et al., 2014 ). Leuconostoc, representado
folatos y casi la mitad de ellos por encima de 70 ng / ml, mientras Ln. mesenteroides una proporción menor en tocosh muestras siendo esta de acuerdo con almidón Florida fermentaciones
nuestros y bebidas ( Elizaquível et al, 2015.; Ruiz-Rodríguez et al., 2016 ). A nivel de especies, el
enfoque HTS mostró el predominio de Lb. sakei seguido por Ln. gasicomitatum, Ln. gelidum y Ln.
principalmente producir ribo Florida Avin; 32% de themwere por encima de 100 ng / ml. Por otro lado, mesenteroides, estas especies se describieron también durante la fermentación kimchi ( Jung, Lee y
los rasgos de seguridad indicaron que la producción de tiramina principalmente para lactobacilos, Jeon, 2014 ). muestra de un mes mostró una floración de Clostridium de los cuales
especialmente Lb. sakei ( 50%) y Lb. casei
(30%). Cuando se proyectó actividad antimicrobiana, Ln. mesenteroides
(9%) y Lb. sakei ( 11%) mostraron anti- Listeria actividad, mientras que la inhibición contra Bacilo fue
distribuido diversamente entre las tres especies de BAL, estas dos cepas indicadoras que C. acetobutylicum y C. tyrobutyricum las especies principales constituidas. Ninguna de las especies
representan los contaminantes del medio ambiente industrial ( Tabla 4 ). Los compuestos de clostridios detectados en tocosh es patógeno para los seres humanos o producir toxinas; por lo
antibacterianos tanto, no comprometen

Tabla 4
rasgos funcionales y de seguridad de LAB aislamientos que representan las especies mayoritarias recuperados de tocosh.

Ln. mesenteroides Lb. sakei Lb. casei

(22 cepas un ) (28 cepas un ) (9 cepas un )

rasgos funcionales
actividad amilolítica 5 (23%) 2 (7%) mi

actividad fitato-degradantes segundo 9 (41%) 5 (18%) 2 (22%)


la producción de EPS a partir de sacarosa 22 (100%) 5 (18%) mi

la producción de vitaminas

Los folatos (B9) 6 (27%) (77 mi 102 ng / 12 (43%) (72 mi 100 ng mi

ml) / ml)
ribo Florida avin (B2) 9 (41%) (106 mi 465 ng / 2 (7%) (113 mi 127 ng / mi

ml) ml)
rasgos relacionados con la seguridad de los alimentos

la producción de tiramina 2 (9%) 14 (50%) 3 (30%)


La actividad antimicrobiana contra:
L. innocua 2 (9%) 3 (11%) mi

B. subtilis 6 (27%) 7 (25%) 3 (33%)

un Las cepas se recuperaron a partir de diferentes muestras y diferencian por pro RAPD fi les.
segundo Positivo> 100 U / ml.
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tocosh la seguridad. Clostridios son ubicuos en el suelo y su presencia en 2003 ); potencial de aminogenic Ln. mesenteroides y Lb. casei
tocosh se correlaciona con la anaeróbica, baja temperatura y carbohidratos ricos medio ambiente ( Wiegel, fromwine y sidra también fue descrito ( Coton et al., 2010 ). Por otro lado, LAB son ampliamente
Tanner, y Rainey, 2006 ). Su metabolismo saccharolytic probablemente habría conferido una ventaja conocidos por su capacidad para inhibir los patógenos de alimentos por la producción de compuestos
competitiva a la población LAB. Los resultados mostraron proporciones similares de los lactobacilos y antimicrobianos, tales como ácidos orgánicos, peróxido de oxígeno y bacteriocinas, que constituye
Leuconostoc en este tocosh una alternativa sostenible como conservantes de alimentos. La persistencia de la actividad
antibacteriana cuando sobrenadantes de Ln. mesenteroides, Lb. sakei y Lb. casei se trataron con
muestra; incluso en una proporción disminuida Lb. sakei estaba presente junto con Lb. plantarum, Lb. proteinasa K indica que un compuesto proteináceo es decir, una bacteriocina, podría ser responsable
oligofermentans y Lb. senmaizukei de
de acuerdo con su origen vegetal como se describe anteriormente ( Hiraga, Ueno, Sukontasing,
Tanasupawat, y Oda, 2008; Elizaquível et al., 2015 ). Entre Leuconostoc, Ln. gasocomitatum dominado L. monocytogenes y B. subtilis inhibición, como se describe anteriormente ( Fontana et al., 2015 ).
en esta etapa de fermentación. Además, viridescens Weissella también se detectó mediante enfoque Además, una alta proporción de cepas recuperó de tocosh exhiben actividad antifúngica y ful fi l la
HTS; su presencia durante fermentaciones amiláceas se ha descrito previamente ( De Vuyst et al, AESA requerimientos como ya se describió ( Russo, Spano, y Capozzi, 2017; Y EPEZ et al., 2017 );
2014.; Elizaquível et al., 2015 ). que son sensibles a los antibióticos o exhiben resistencias individuales, por lo tanto, un número de
los cuales es adecuado para aplicaciones alimentarias.

muestra de ocho meses fue dominada por Lactobacillus con Lb. casei, Lb. backii y Lb.
senmaizukei como especies principales, este ser en coincidencia a la descrita a partir de masas
africanas de cereales, ensilaje orchardgrass y salmuera Japonese, ( Hiraga et al., 2008 ). Lb. sakei se 5. Conclusiones
encontró en menor proporción, así como Lb. rossiae, Lb. plantarum, Lb. kisonensis, Lb. yonginensis, Lb.
parabrevis, Lb. perolens, Lb. harbinensis y Lb. coryniformis fueron, que se encuentra comúnmente en A lo mejor de nuestro conocimiento, este es el fi Estudio primera se centra en la estructura de la
las materias primas amiláceas tales como cereales Florida nuestro, masas madre y verduras comunidad LAB de la tradicional de los Andes tocosh mediante el uso de métodos de cultivo
fermentadas (tradicionales asiática De Vuyst et al., 2014 ). Además, aunque detectaron en proporción dependiente y HTS. identificación de especies fi Ed de las muestras analizadas y sus abundancias re
menor, la presencia de claramente Florida ected las condiciones ambientales particulares que abarcan el proceso de
fermentación. El pro microbiana fi Le reveló Lb. sakei y

Ln. mesenteroides, viridescens W. y P. parvulus También se informó de otras fermentaciones Ln. mesenteroides como las principales especies de BAL que se producen durante la fermentación.
vegetales ( De Vuyst et al., 2014 .) Se encontraron discrepancias entre ambos enfoques en Lb. Basándose en su caracterización funcional y la seguridad, las cepas con características valiosas para
sakei, seguir el diseño de alimentos fermentados con almidón funcionales fueron seleccionados.
que dominó en patatas frescas por HTS, mientras que mediante el cultivo era mayoría en muestra de Mantenimiento y promoción de la cultura indígena andina es crucial para asegurar la protección de
8 meses. Similar, Ln. mesenteroides dominado en patatas frescas mientras era igualmente presente los sistemas agroecológicos tradicionales y la biodiversidad agrícola.
en las tres muestras de HTS. Lb. farciminis y Lb. brevis fueron detectados por cultivo a pesar de sus
secuencias representaron menos del 0,1% y por lo tanto, no se consideraron en el análisis HTS.
Estos resultados estafadores fi rm de eso, ambos métodos son todavía fundamental y complementario
Expresiones de gratitud
con el fin de obtener imágenes satisfactorias de la ecología bacteriana en los productos alimenticios
y para explorar completamente LAB potencial biotecnológico.
La investigación que lleva a estos resultados ha recibido financiación de la gente del programa
(acciones Marie Curie) del Séptimo Programa Marco de la Unión Europea (FP7 / 2007 mi 2013) bajo el
acuerdo de subvención REA no. 247650, y las donaciones PICT 2010 0655 (ANPCyT) de Argentina,
la CDS 2007 hasta 00063 del Ministerio español de Ciencia e Innovación y PROMETEO / 2012/040
LAB características explotadas para el diseño de alimentos funcionales, seguras y saludables
de la Generalitat Valenciana. AYL es el beneficiario de una beca de doctorado del Ministerio español
han demostrado ser dependiente de la cepa más que un personaje especies ( Capozzi et al., 2011a ).
de Educación, Cultura y Deportes (FPU13 /
Varios Ln. mesenteroides
y Lb. tocosh sakei aislamientos de amilasa extracelular expuesto y EPS de producción, de acuerdo
con las actividades descritas para los aislamientos de estas especies de tubérculos y cereales ( Reddy,
03398).
Altaf, Naveena, Venkateshwar, y Kumar, 2008 ) Y la secreción de amilasa recientemente descrito para
Ln. mesenteroides durante la fermentación de la yuca ( Ramos et al., 2015 ); y su capacidad para
sintetizar un- polímeros de glucano ( Badel, Bernardi, y Michaud, 2011 ). actividad fitato-degradantes referencias

fue altamente distribuido entre las especies principales recuperados de tocosh como se describe para
Anastasio, M., Pepe, O., Cirillo, T., Palomba, S., Blaiotta, G., y Villani, F. (2010). Se-
Ln. mesenteroides y Lb. sakei de kimchi y de masa fermentada ( Oh, y en 2009 ) Y de algunos LAB lection y el uso de LAB fitato-degradante para mejorar los productos a base de cereales por solubilización mineral
probiótico y bi fi dobacterias ( Gonz alez-C ordova et al, 2016.; Khodaii, Natanzi, Naseri, Goudarzvand, durante la fermentación de la masa. Journal of Food Science, 75 ( 1), M28 mi M35 .

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