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Este documento describe un experimento para determinar la concentración y pureza de ADN en 8 muestras mediante espectrofotometría. Se midieron las absorbancias de cada muestra a 230nm, 260nm y 280nm y se calculó la concentración de ADN y los ratios DO260/DO280 y DO260/DO230 para evaluar la pureza. La mayoría de las muestras tenían contaminación por proteínas o compuestos aromáticos, aunque algunas tenían ADN puro. El objetivo era aplicar protocolos de espectrofotometría
Este documento describe un experimento para determinar la concentración y pureza de ADN en 8 muestras mediante espectrofotometría. Se midieron las absorbancias de cada muestra a 230nm, 260nm y 280nm y se calculó la concentración de ADN y los ratios DO260/DO280 y DO260/DO230 para evaluar la pureza. La mayoría de las muestras tenían contaminación por proteínas o compuestos aromáticos, aunque algunas tenían ADN puro. El objetivo era aplicar protocolos de espectrofotometría
Este documento describe un experimento para determinar la concentración y pureza de ADN en 8 muestras mediante espectrofotometría. Se midieron las absorbancias de cada muestra a 230nm, 260nm y 280nm y se calculó la concentración de ADN y los ratios DO260/DO280 y DO260/DO230 para evaluar la pureza. La mayoría de las muestras tenían contaminación por proteínas o compuestos aromáticos, aunque algunas tenían ADN puro. El objetivo era aplicar protocolos de espectrofotometría
La determinación de la concentración de ADN consiste en utilizar métodos en
las cuales una cierta cantidad de ADN extraido es utilizado para contabilizar su concentración. Una de las propiedades del ADN es la eficiente absorción de luz UV debido a la presencia de bases nitrogenadas a lo largo de la cadena, Cada una de las bases tiene su propio y único espectro de absorción y por lo tanto contribuye de manera diferente a la propiedad total de absorción de UV de una molécula de DNA. Los ácidos nucleicos tienen un máximo de absorción a una longitud de onda de 260nm
Los métodos más conocidos para determinar la concentración son: por
espectrofotometría, por fluorescencia con bromuro de etidio (electroforesis).
La espectrofotometría es una serie de métodos cuantitativos de análisis
químico que utiliza la luz para medir la concentración de sustancias químicas. Se conocen como métodos espectrofotométricos según sea la radiación utilizada como espectrofotometría de absorción visible, ultravioleta, infrarroja.
OBJETIVOS:
Determinar la concentración del ADN mediante la espectrofotometría
Conocer los protocolos para la realización de esta practica
Observar si las muestras son puras o si existe algún contaminante.
LECTURAS
230 nm 260 nm 280 nm
Muestra 1 0.200 0.210 0.115
Muestra 2 0.175 0.350 0.210
Muestra 3 0.150 0.260 0.130
Muestra 4 0.260 0.390 0.300
Muestra 5 0.250 0.500 0.220
Muestra 6 0.190 0.430 0.350
Muestra 7 0.300 0.550 0.260
Muestra 8 0.220 0.330 0.270
CUESTIONARIO
1) DETERMINAR LAS CONCENTRACIONES DE ADN DE CADA UNA DE
LAS MUESTRAS
Para determinar la concentración de ADN en las muestras se calculara
con la siguiente formula:
[ADN] = A260 * factor de dilución * factor conocido
Donde: A260: absorbancia a 260 nm
El factor de dilución: 1/50 → 50
Factor conocido: Una absorbancia de 1,0 a 260 nm se corresponde con
una concentración de 50 ng/µL
(50 µg/mL) de dsDNA puro.
2) DETERMINAR LA PUREZA DE LOS PREPARADOS Y REALIZAR UN
COMENTARIO AL RESPECTO, CON CADA UNA DE LAS MUESTRAS
Pureza: DO260/DO280: determina la pureza del ADN, el rango de la
relación es de ≥ 1.8-2, <1.6 presencia de compuestos aromáticos, >2.1 contaminación con ARN
Si la relación es menor al rango significa que la muestra esta
contaminada
Capacidad de absorbancia de sustancias posiblemente encontradas en
la muestra:
Proteínas: 280 nm
Sales caotropicas, fenol, hidratos de carbono: 230 nm
DO260/DO230: Determina si existe contaminación por sales caotropicas,
fenol, hidratos de carbono. Si la relación da valores de 2.0-2.2 la muestra es óptima. Si da menor a la relación está contaminada la muestra 3) LLENAR LA TABLA:
ADN DO260/DO280 DO260/DO230 COMENTARIO
Muestra 1 525 1.82 1.05 ADN de pureza aceptable,
contaminación por sales, carbohidratos, fenoles
Muestra 2 875 1.67 2 Contaminación con
compuestos aromáticos o proteinas, ADN puro sin (carbohidratos, fenol, etc.)
Muestra 3 650 2 1.73 ADN de pureza optima
Muestra 4 975 1.3 1.5 Contaminación por
compuestos aromáticos o proteinas, adn sin contaminantes (carbohidratos, fenol, etc.)
Muestra 5 1250 2.27 2 Contaminación por ARN,
ADN sin (carbohidratos, fenol, etc.)
Muestra 6 1075 1.23 2.16 Contaminación por
compuestos aromáticos o proteínas, ADN sin(carbohidratos, fenol, etc.)
Muestra 7 1375 2.115 1.83 ADN de pureza optima
Muestra 8 825 1.22 1.5 Contaminación por
compuestos aromáticos o proteínas, ADN optimo sin (carbohidratos, fenol, etc.)
BIBLIOGRAFIA
BANCO NACIONAL DE ADN CARLOS III (Universidad de Salamanca);
PROGRAMA CONTROL DE CALIDAD DE MUESTRAS, (PAGINAS : 1- 4) DISPONIBLE EN : http://www.bancoadn.org/docs/programa-control- calidad-muestras.pdf
DNA Genotek Inc., una filial de OraSure Technologies, Inc ; Protocolo de
laboratorio para purificación manual de ADN a partir de una muestra de 0,5 mL 2012 ( paginas 3-4) disponible en : https://www.dnagenotek.com/us/pdf/PD-PR-00216.pdf
Unidad de síntesis y secuencias de ADN,Instituto de biotecnología de la
Universidad Nacional Autonoma de México; Cuantificacion del ADN, [pagina web] URL disponible en: http://www.ibt.unam.mx/sintesis/cuantificacion.html#top