A Través Del Cristal Cómo La Cristalografía Ha Cambiado La Visión Del Mundo

Martín Martínez-Ripoll, Juan A.
Hermoso y Armando Albert
1. Introducción
Copyright © 2014. Editorial CSIC Consejo Superior de Investigaciones Científicas. All rights reserved.
“¿P or qué el agua hierve a 100 ºC y el

metano a -161 ºC?, ¿por qué la sangre
es roja y la hierba es verde?, ¿por qué el
continuado de muchos científicos,
cómo son los cristales, las moléculas,
las hormonas, los ácidos nucleicos,
diamante es duro y la cera es blanda?, las enzimas, las proteínas..., a qué se
¿por qué los glaciares fluyen y el hierro deben sus propiedades y cómo podemos
se endurece al golpearlo?, ¿cómo se entender su funcionamiento en una
contraen los músculos?, ¿cómo la luz reacción química, en un tubo de ensayo
del sol hace que las plantas crezcan y o en el interior de un ser vivo.
cómo los organismos vivos han sido El inesperado descubrimiento de
capaces de evolucionar hacia formas cada los rayos X por Wilhelm Conrad
vez más complejas?... Las respuestas a Röntgen a finales del siglo XIX,
todos estos problemas han venido del unido al fenómeno de la interacción
análisis estructural.” Con estas palabras, de esa “extraña” radiación con los
y refiriéndose a la cristalografía, se cristales, descubierto por Max von
expresaba Max F. Perutz (laureado con Laue en 1912, y a la teoría expuesta
el Nobel de Química en 1962) en julio en aquel mismo año por William
de 1996, según consta en los archivos Lawrence Bragg abrieron la puerta
del Churchill College, Cambridge para que en pocos años la cristalografía
(Reino Unido). revolucionara muchas ramas de la
La cristalografía es una parte de la ciencia, como la física y química
ciencia actual gracias a la cual hemos de la materia condensada, la biología
podido averiguar, a través del esfuerzo y la biomedicina.
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A través del cristal: cómo la cristalografía ha cambiado la visión del mundo, Editorial CSIC Consejo Superior de Investigaciones Científicas, 2014. ProQuest Ebook Central,
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a cabo la mioglobina y la hemoglobina.
Tras la determinación de la estructura
del ribosoma podemos entender cómo
funciona la fábrica de proteínas de
nuestras células y también diseñar
nuevos antibióticos. Podemos aumentar
la resistencia de las plantas frente al
deterioro medioambiental. Somos
capaces de modificar, o inhibir, enzimas
implicadas en procesos fundamentales
de la vida e importantes para
mecanismos de señalización que ocurren
en el interior de nuestras células, como
el cáncer. De la estructura de enzimas,

producidas por ciertos virus, hemos
aprendido cómo luchar contra bacterias
con alta resistencia a antibióticos, y ya
Estructura molecular de un fragmento de somos capaces de desentrañar las sutiles
ADN, obtenida mediante cristalografía. Gracias al conocimiento estructural maquinarias de defensa que han
que aporta la cristalografía, hoy somos desarrollado estos gérmenes, con lo que
capaces de producir materiales con no es un sueño pensar que podremos
propiedades prediseñadas que combatirlos con herramientas
empleamos en aplicaciones muy alternativas.
sofisticadas, como catalizadores para una La Asamblea General de la
reacción química de interés industrial, Organización de Naciones Unidas
materiales de gran dureza para uso declaró 2014 Año Internacional de la
quirúrgico o determinados componentes Cristalografía. Se reconocen así 100 años
de los aviones, pero también en de desarrollo imparable de esta disciplina
actividades cotidianas, como en la pasta científica que ha sido fundamental para
de dientes o en placas de vitrocerámica. el conocimiento de la estructura de la
Más aún, la cristalografía desveló los materia, en el control y tratamiento de
secretos estructurales del ADN, el enfermedades, resolviendo problemas
llamado código genético. Ya de contaminación medioambiental o
comprendemos el funcionamiento de estrés celular; por su impacto en
de procesos vitales complejos como nuestra vida diaria a través del diseño de
la fotosíntesis o el almacenamiento fármacos, por su papel en el desarrollo
y transporte de oxígeno que llevan de nuevos materiales o en los avances en
12

nanotecnología y biotecnología, entre de procesar el entramado de proteínas
otros, y en definitiva por su impacto en que sustentan la vida y fascinantes
el desarrollo social. muestras de moléculas implicadas
La relevancia y amplitud con las en enfermedades infecciosas
que la cristalografía ha incidido y congénitas.
en la ciencia y en la sociedad La frontera entre lo vivo y lo inerte
desarrollada sobrepasaría el alcance la escenifica el capítulo dedicado
de este trabajo. Este libro intenta a los virus, entidades biológicas, capaces
dar a conocer aspectos sobre los de multiplicarse en el interior
orígenes, fundamentos y desarrollo de las células y de propagarse entre
de esta ciencia, y también una células y organismos.
espléndida y significativa muestra de El apartado dedicado a la
problemas científico-técnicos biotecnología nos ilustra sobre
totalmente actuales, en donde la los procesos enzimáticos responsables

cristalografía ha sido, y sigue siendo, de la producción de materias de alto
la clave para su comprensión y valor añadido, llegando hasta la propia
resolución. fábrica de proteínas que sustenta la vida
Tras la introducción histórica celular. Antes de finalizar con algunas
nos encontramos con el mundo de perspectivas de nuestra ciencia,
las interacciones intermoleculares estudios sobre las bases
denominadas débiles, clave para moleculares de resistencia de las plantas
comprender el lenguaje de comunicación en situaciones de estrés nos ilustran
química. Le sigue un capítulo sobre sobre el sutil lenguaje
novedosas formas estructurales del de comunicación entre células.
carbono, capaces de enjaular otras La cristalografía ha abierto una
especies químicas, así como el dedicado ventana al mundo molecular y nos
a sorprendentes edificios cristalinos, desvela la extraordinaria complejidad
que pueden construirse a semejanza y belleza en las que se asientan tanto lo Cristal de compuesto inorgánico (arriba) y
de proteína (abajo) sujeto por un lazo que
de los andamios o estructuras de los vivo como lo inanimado. Esperamos lo mantiene sumergido en un crioprotector,
inmuebles, con interesantes aplicaciones que este libro sea capaz de suscitar la montado para el experimento de difracción.
y propiedades. curiosidad del lector para que, por su
El salto al mundo de lo vivo lo cuenta, profundice en cualquiera de sus
encabeza el capítulo dedicado a las aspectos.
asombrosas máquinas capaces ¡Que lo disfrute!
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A través de los cristales, y usando técnicas
sofisticadas, vemos los átomos y moléculas que
componen la materia.

Martín Martínez-Ripoll
2. Una historia con

claroscuros plagada
de laureados Nobel
2.1. Cristales para magia, piedras con fines protectores y garantía
remedio, belleza y confort de salud, y algunos cristales reducidos
a polvo con fines cosméticos, como
Las primeras referencias históricas sobre la galena y la malaquita para sombra
el uso de cristales, es decir, de materia de ojos.
ordenada y llamativa por su aspecto, Probablemente, la primera
provienen del cuarto milenio a.C., de los contribución española a la historia de los
antiguos sumerios, pues parece probado cristales aparezca ya citada por Plinio el
que estos pueblos los usaban en fórmulas Viejo (siglo I) en su conocida Historia
mágicas, quizá inducidos por sus colores Natural, en donde describe cómo las
y peculiares formas externas (figura 2.1). ventanas e invernaderos de los habitantes
Los cristales tuvieron (y tienen) cierto más ricos del Imperio romano estaban
uso en la medicina tradicional china, cubiertos por cristales de Lapis specularis,
hecho que parece remontarse al menos el nombre latino de grandes cristales
a 5.000 años. Los antiguos egipcios transparentes de yeso. Esta forma
hicieron también un uso muy extendido cristalina del sulfato cálcico dihidratado
de minerales cristalizados: el lapislázuli, la extraían los romanos de los
la turquesa, el rubí, la esmeralda y el alrededores de Segóbriga (La Mancha) y
cuarzo transparente como joyas, algunas era muy apreciada por su transparencia,
15

Figura 2.1. Muestras de

minerales, lapislázuli, rubí
y esmeralda.
Figura 2.2. Johannes Kepler y copo

de nieve con morfología hexagonal.
tamaño y capacidad de exfoliación. 2.2. 1611-1891: los cimientos

Y es probablemente de esta de esta historia.
circunstancia histórica de donde viene las matemáticas se interesan
la confusión entre los sustantivos por la morfología de los
vidrio y cristal que, probablemente de cristales
forma inadvertida, mantenemos en
nuestro idioma común. A los vidrios No fue hasta mediados del siglo XVII
de las ventanas los conocemos cuando el matemático, astrónomo y
normalmente con el nombre de astrólogo alemán Johannes Kepler
cristales, pero en las cristalerías solo (1571-1630) fue consciente de que los
venden vidrios. La palabra “cristal” copos de nieve que aterrizaban sobre su
debería, pues, referirse exclusivamente chaqueta siempre mostraban una
a materia ordenada, trasparente u perfecta simetría de seis puntas
opaca, mientras que la palabra “vidrio” (figura 2.2), y que estos nunca aparecían
designa genéricamente materiales con cinco o siete puntas. Esta primera
normalmente trasparentes o observación sobre la forma externa de los
traslúcidos, pero desordenados. cristales dio pie al nacimiento de las
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Figura 2.3. Ley de la constancia de ángulos
entre caras en los cristales, observada por Niels
Stensen (izquierda) y formulada por Jean-
Baptiste Louis Romé de l’Isle (derecha).
primeras ideas sobre el ordenamiento

(empaquetamiento) de los átomos,
considerados entonces como los
componentes mínimos de la materia.
A Kepler le siguieron otros estudiosos

como el danés Niels Stensen
(1638-1686) y el francés Jean-Baptiste
Louis Romé de l’Isle (1736-1790),
quien formuló matemáticamente
las observaciones de Stensen sobre
la constancia de ángulos entre las caras
de los cristales (figura 2.3).
Sin embargo, el primer pilar sólido
y definitivo para la comprensión de la
estructura de los cristales fue establecido Figura 2.4. René J. Haüy y su modelo cristalino mostrando las celdillas elementales.
por el abate francés René Just Haüy
(1743-1822), profesor de Humanidades
en la Universidad de París (figura 2.4). cristales. De dicha teoría se deriva el matemáticos introducidos durante el
La teoría sobre la estructura cristalina concepto de repetición de pequeñas siglo XIX, nos pusieron frente a las
que elaboró Haüy en 1784, basada en unidades (“celdillas elementales”) que, puertas de la cristalografía estructural
sus planteamientos sobre las leyes de la como ladrillos, se apilan en las tres moderna. Así, en 1830, el médico
Simetría, de los Índices Racionales direcciones del espacio dando lugar al alemán Johann Friedrich Christian
(tripletes de números enteros que sólido cristalino, siendo el ordenamiento Hessel (1796-1872) demostró que,
diferencian unas caras de otras) y de la repetitivo el responsable de las como consecuencia de la Ley de los
Constancia de Ángulos entre caras, no peculiaridades morfológicas que Índices Racionales formulada por Haüy,
difiere sustancialmente de los conceptos ostentan estos cuerpos. las diferentes morfologías cristalinas se
que prevalecen hoy en día sobre el Las observaciones previas combinaban para generar exactamente
conocimiento morfológico de los mencionadas, junto a los desarrollos 32 tipos de simetría en el espacio
17

Figura 2.5. J. F. C. Hessel y la portada de su tratado Figura 2.6. A. Bravais y algunas de las 14 redes
sobre los grupos puntuales. de su nombre.
euclidiano, es decir, 32 “grupos Aunque publicado muy 1891 los 230 posibles grupos espaciales
puntuales” (32 combinaciones de posteriormente en forma de compendio, que restringen las posibilidades de
elementos de simetría que pasan por un en 1848 el físico francés Auguste Bravais distribución repetitiva de las unidades de
punto del sólido cristalino), y que estas (1811-1863) demostró construcción de los cristales (átomos,
son las únicas combinaciones matemáticamente que solo pueden iones y moléculas), poniendo el punto
compatibles con la repetición de ladrillos existir 14 redes únicas en los sistemas final a toda la teoría vigente sobre la
elementales introducida por Haüy. El cristalinos tridimensionales (figura 2.6), geometría y simetría de los retículos
argumento de Hessel (figura 2.5) fue corrigiendo la conclusión anterior sobre los que se fundamentan los
más allá, demostrando que en los (15 redes) concebida algunos años antes cristales (figura 2.7).
espacios repetitivos solo podrían existir por el alemán Moritz Ludwig A partir de los conocimientos
determinados ejes de rotación, los de Frankenheim (1801-1869). Y, geométricos mencionados, establecidos
orden 2, 3, 4 y 6, mediante los cuales finalmente, las 14 redes de Bravais y los entre los siglos XVII y XIX para explicar
cualquier contenido de los cristales 32 grupos puntuales fueron las la peculiar morfología y el entonces
podría repetirse a sí mismo mediante limitaciones entre las que se movieron el supuesto orden interno de los cristales,
giros de 360/n grados, siendo n=2, 3, 4, cristalógrafo ruso Evgraf S. Fedorov dio comienzo el desarrollo de la
o 6, lo cual justificaba las observaciones (1853-1919) y, de forma independiente, denominada cristalografía moderna, la
de Kepler sobre las 6 puntas el matemático alemán Arthur Schönflies ciencia que nos ha conducido hasta el
(ni 5 ni 7) de los cristales de nieve. (1853-1928), para deducir entre 1890 y actual grado de conocimiento sobre la
18

Figura 2.7. E. S. Fedorov (abajo, izquierda)
y A. Schönflies (arriba, derecha), coautores
independientes de la deducción de los 230
grupos espaciales de simetría.
en donde concluyó la Licenciatura en

Ingeniería Mecánica. Tras algunos años
en Zúrich como asistente del profesor
de física August Kundt (1839-1894), en
1872 (con 27 años) se trasladó con este a

la Universidad de Würzburg (Alemania),
pero al no poder obtener ningún puesto
(por no haber aprobado en su momento
los exámenes de latín y griego) acabó
en Estrasburgo, en donde, finalmente, en
estructura de la materia, a nivel atómico y sus sombras, se asimilan a algunas 1874, obtuvo una plaza de profesor que
y molecular. Como veremos a piezas de un concierto musical. cinco años más tarde cambió por otra en
continuación, este salto cualitativo ha la Universidad de Giessen y, finalmente,
sido consecuencia del hecho de que los con aproximadamente 45 años, obtuvo
cristales reaccionan de un modo muy 2.3. 1895-1901: ¡se enciende una cátedra de Física en Würzburg, en
especial cuando se iluminan con “luz una luz! donde llegó a ser rector.
adecuada”, y esa interacción nos permite ‘Obertura’, por Wilhelm Su descubrimiento vio la luz (¡nunca
“visualizar” el interior de los mismos, Conrad Röntgen mejor dicho!) en Würzburg el 8 de
dejando al descubierto las posiciones de noviembre de 1895, a sus 50 años,
cada átomo y molécula que los Wilhelm Conrad Röntgen (1845-1923) durante algunos experimentos con rayos
compone. inició el “concierto” con la “obertura” catódicos y gracias a la circunstancia
Con la licencia del lector, y dicho sea que supone el descubrimiento casual de fortuita de que una lámina de cartón
con todo respeto hacia la memoria de los la “luz” que años más tarde “iluminaría” cercana (impregnada en cianuro de
grandes personajes que nos trajeron el interior de los cristales. Röntgen, platino y bario) mostrara una
hasta este nivel de desarrollo, la “obra nacido en la provincia del Bajo Rin fluorescencia totalmente inesperada tras
cristalográfica” que se relata a (Alemania), estudió en la Escuela exponerse a una radiación
continuación puede describirse en forma Técnica de Utrech (Holanda) y a los aparentemente invisible. Un mes tardó
de etapas sucesivas que, con sus luces 20 años se trasladó a Zúrich (Suiza), Röntgen en comprender el alcance de su
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mediático, haciendo alusión a que “sus
altos vuelos se estrellaban”. Sin embargo,
a principios de 1896, Röntgen comenzó
a salir de su situación incómoda gracias
a su decisivo envío a la revista británica
British Medical Journal de una
radiografía con un brazo fracturado,
lo cual daba idea de la capacidad
diagnóstica de su descubrimiento. Sin
embargo, debieron de pasar algunos
años hasta que su “increíble luz” fuera
reconocida como de interés médico,
e incluso le reportara el máximo
galardón, el primer Premio Nobel

de Física de 1901.
2.4. 1912-1914: ¡se levanta

el telón!
‘Preludio’, por Max von laue,
con acompañamiento de Paul
Figura 2.8. W. C. Röntgen y la radiografía
P. Ewald
obtenida de la mano de su esposa.
Cortesía de Röntgen-Deutsches Museum.
descubrimiento, preparando
inmediatamente una comunicación Si el descubrimiento de Röntgen
científica para la Sociedad de Física y fue condición indispensable para
Medicina de Würzburg, en donde daba la fructificación de la cristalografía
cuenta de la propiedad más llamativa de moderna, el primer gran salto cualitativo
esa desconocida radiación que bautizó fue debido a otro alemán, Max von Laue
con la letra de las incógnitas: “X”. La (1879-1960), premio Nobel de Física
noticia sobre la existencia de esa de 1914, quien deseando demostrar la
“increíble luz”, capaz de atravesar los naturaleza ondulatoria de los
cuerpos opacos (figura 2.8), llegó rayos X descubrió, además, la capacidad
rápidamente a los periódicos. Sin de interacción de los rayos X con los
embargo, casi con la misma celeridad, cristales, es decir, el fenómeno conocido
en la impaciencia de que aquel como difracción.
descubrimiento encontrara aplicación El joven Max, nacido en un pueblo
práctica, le llegó el esperado descrédito cercano a Koblenz, pasó su adolescencia
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entre varias ciudades alemanas debido a
la profesión militar de su padre. Estudió
matemáticas, física y química en la
Universidad de Estrasburgo, aunque
inmediatamente pasó a la Universidad
de Göttingen y en 1902 a la Universidad
de Berlín, en donde comenzó a trabajar
con Max Planck (1858-1947), quien, a
su vez, llegaría a obtener el Premio
Nobel de Física en 1918, es decir, cuatro
años más tarde que Von Laue. Entre
1909 y 1912 pasó por las Universidades
de Múnich, Zúrich, Frankfurt y
Würzburg, regresando finalmente a

Berlín, en donde obtuvo una plaza de Figura 2.9. Uno de los primeros
profesor. Y fue durante parte de esta en teoría deberían comportarse como experimentos de difracción sobre un cristal
de blenda. M. von Laue (arriba, derecha),
última época, en concreto en 1912, redes de interferencia muy pequeñas.
P. P. Ewald (abajo, derecha).
cuando Laue conoció en Múnich a Paul Y así fue como, al hacer incidir un haz
Peter Ewald (1888-1985), quien de rayos X sobre un cristal de sulfato de
finalizaba su tesis doctoral con Arnold cobre, primero, y posteriormente sobre
Sommerfeld (1868-1951). Tras largos otros del mineral blenda, Laue obtuvo la
paseos, Ewald consiguió interesar a Laue confirmación de la naturaleza
por sus propios experimentos sobre electromagnética de esa extraña
interferencias entre radiaciones de gran radiación que Röntgen había descubierto
longitud de onda (prácticamente luz años atrás (figura 2.9), al mismo tiempo
visible) que realizaba sobre un “modelo que, inmediatamente, despertó gran
cristalino” basado en resonadores. cantidad de expectativas sobre la
Recordemos que en esta época todavía naturaleza interna de los cristales.
estaba en discusión la naturaleza Aunque es un hecho poco conocido,
corpuscular u ondulatoria de las resulta sorprendente la rapidez con la
radiaciones. que Ewald dio una elegante
Las ideas de Ewald llevaron interpretación a los experimentos de
finalmente a Laue a plantearse qué Max von Laue. Aunque esta se publicó
pasaría si, en lugar de longitudes de un año más tarde (1913), fue al cabo
onda largas (luz visible), se usaran otras de algunas semanas del descubrimiento
de mucha menor longitud, y de Laue cuando Ewald concluyó la
directamente sobre los cristales, quienes construcción de un completo modelo
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matemático, todavía vigente, que daba tenido en cuenta, al menos por el británico honores de primera clase en 1911. En
cuenta de la interacción entre los rayos X William Henry Bragg (1862-1942), 1914 fue nombrado profesor de ciencias
y los cristales. El modelo de Ewald ya y especialmente por su hijo William naturales en el Trinity College y
consideraba que la difracción era Lawrence Bragg (1890-1971). De modo galardonado con la Medalla Barnard por
consecuencia de las interferencias entre casi inmediato, ambos demostraron servicios meritorios a la ciencia.
los rayos X dispersados por los átomos del la utilidad del fenómeno descubierto Antes de los Bragg, los científicos
cristal, y que las intensidades observadas por Max von Laue, y concluyeron que, sabían que la materia se componía de
en el experimento eran el resultado de sorprendentemente, las “fotografías” átomos y de moléculas, pero nada se
que las ondas irradiadas en determinadas que originaban los rayos X al atravesar conocía sobre su forma y distribución en
direcciones lo harían constructivamente, los cristales proporcionaban información el espacio, y en ese contexto William
estando “en fase” o “llevando el paso”, sobre la estructura interna de los mismos. Lawrence Bragg y su padre constituyeron
como lo haría una formación de soldados William Lawrence Bragg nació en un eficaz equipo que, entre 1912 y 1913,
bien entrenados y en donde la estructura Adelaida (Australia), en cuya desarrolló la técnica de la cristalografía de
repetitiva del cristal haría las veces de universidad, su padre, William Henry rayos X en la Universidad de Leeds.
amplificador de las interferencias entre los Bragg, ejercía como profesor de Mediante un sutil desarrollo matemático y
rayos X y los átomos. Aunque en nuestra matemáticas y física. Su primer contacto de cuidadosos experimentos descubrieron
modesta opinión Paul Peter Ewald con los rayos X tuvo lugar con cinco que, a través de la interferencia de los
también fue merecedor del años, cuando su padre, que había rayos X con los cristales, se podía inferir la
reconocimiento de la Fundación Nobel, leído acerca de los experimentos de estructura interna de estos. Su aportación
su contribución al desarrollo de los Röntgen en Europa, usó un equipo científica se basa en la consideración de
primeros pasos de la cristalografía es experimental con esta radiación para planos virtuales en el interior de los
recordado a través del Premio Ewald que examinar la fractura del brazo que le cristales que se comportan como una
la Unión Internacional de Cristalografía había provocado la caída desde su batería de espejos paralelos, separados
otorga trianualmente a las contribuciones triciclo. William Lawrence fue un entre sí a distancias constantes d. Dichos
más relevantes en esta ciencia. estudiante muy capaz y con 14 años planos serían capaces de “reflejar” la luz X
ingresó en la Universidad de Adelaida cuando las ondas reflejadas se sumaran
para estudiar matemáticas, química constructivamente, es decir, cuando la
2.5. 1912-1915: ¡comienza y física, graduándose en 1908. En ese longitud de las trayectorias de los reflejos
el espectáculo! mismo año su padre aceptó la cátedra en cada uno de ellos difieran entre sí un
‘Allegro, ma non troppo’, Cavendish de Física en la Universidad de número entero (n) de veces la longitud de
por los Bragg Leeds (Inglaterra), trasladándose a dicha onda (λ) de los rayos X. Dicha condición,
ciudad con toda la familia. En 1909, que da cuenta del efecto constructivo de
Mientras que la sociedad científica y gracias a una importante beca para rayos dispersados “en fase”, viene
reaccionó muy lenta y vagamente estudiar matemáticas, William Lawrence expresada por la denominada Ley de
tras el descubrimiento de Röntgen, el ingresó en el Trinity College de Bragg: 2.d.sen θ = n.λ, en donde θ es el
hallazgo de Max von Laue en 1912 no Cambridge, amplió su formación con ángulo de reflexión de los rayos X
pasó desapercibido y fue inmediatamente estudios de física y se graduó con incidentes (figura 2.10). William
22

Figura 2.10. Ley de Bragg. W. H. Bragg (arriba,
derecha) y W. L. Bragg (abajo, derecha).
Lawrence Bragg presentó la deducción de

este modelo geométrico durante una
reunión de la Sociedad Filosófica de
Cambridge, celebrada el 11 de noviembre d
de 1912, y cuyo contenido fue publicado 2θ

un año más tarde. Este y los restantes
trabajos realizados conjuntamente con su
padre, divulgados de forma resumida en
1915, les hicieron merecedores del Premio 2.d.sen θ = n. λ
Nobel de Física de ese mismo año por la
excepcional relevancia de sus hallazgos, y
no solo dentro de los límites de la revelarían Max F. Perutz (1914-2002) 2.6. 1934-1935: tras una
cristalografía, sino por su incidencia a lo y John C. Kendrew (1917-1997) pausa, el concierto se anima.
largo y ancho de toda la ciencia. al conseguir resolver las primeras ‘allegro molto’, por arthur
Desde finales de la Primera Guerra estructuras de proteínas. lindo Patterson y David
Mundial, padre e hijo se distanciaron y La “pieza musical” interpretada Harker como solista
dieron por finalizado su trabajo conjunto. directamente por los Bragg lleva el
William Henry dirigió su atención hacia calificativo de allegro matizado con un Los descubrimientos de W. Lawrence
los compuestos orgánicos, hasta su ma non tropo, porque aunque sus Brag, y los de su padre W. Henry Bragg
fallecimiento en 1942. William Lawrence descubrimientos fueron fundamentales mostraron un panorama esperanzador,
centró su trabajo en la estructura de para sentar las bases de la determinación pero no ausente de incertidumbres. En
metales, y cuando tuvo el convencimiento de la estructura atómica y/o molecular efecto, cuando los científicos plantearon
de que la resolución de estos problemas de los cristales, esclareciendo la necesidad de aplicar la metodología
era perfectamente manejable, se dedicó a la estructura de materiales de los Bragg a las sustancias orgánicas y
trabajos relacionados con la materia viva. relativamente sencillos, con pocos átomos, biológicas, con bastante mayor tamaño
Se interesó por la estructura de las poca cosa pudieron aportar en aquel y complejidad que los compuestos
proteínas y su éxito en esta operación fue momento para abordar problemas más inorgánicos sencillos abordados hasta
indiscutible, tal como posteriormente complejos. entonces, fue fácil imaginar que haría
23
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electrónica, ρ(xyz), y no contiene más
complejidad que la de las posiciones de
Cristal y su estructura Patrón de difracción
(espacio real o cristalino) (espacio recíproco) los átomos en el interior de la celdilla
elemental. El segundo escenario,
conocido como “espacio recíproco”,
Intensidad
Diferencia introducido por Paul Peter Ewald
de fase
inmediatamente después de los
experimentos de Max von Laue, está
constituido por las ondas de rayos X
difractados, pero guarda un “cierto
secreto”, pues de estos solo conocemos
su efecto final sobre una película
fotográfica, manchas de diferente
intensidad. Y es que las ondas difractadas

Diferencia
Intensidad
de fase no se caracterizan exclusivamente por
sus intensidades, sino por sus
“diferencias de estado”, lo que se conoce
Figura 2.11. Relación entre estructura con el nombre de las “fases”
interna del cristal y su patrón de difracción. falta algo más para resolver tales (figura 2.11). Las intensidades que
Los haces difractados muestran su
retos. Y es que, por aquellas fechas, aparecen en el patrón de difracción son
intensidad en términos del ennegrecimiento
de la película y se nombran con tripletes de
las matemáticas ya habían puesto de magnitudes perfectamente medibles,
números enteros, mostrados genéricamente manifiesto el problema fundamental que pero su secreto, las diferencias de fase
con las letras hkl y denominados índices de planteaba esta nueva ciencia. entre unas ondas y otras, se nos
Miller.
El patrón de difracción, originado “escapan” de la medida experimental.
Cortesía de Deutsches Museum.
por los rayos X al pasar por el interior de En este punto, y con muy buen
los cristales, es la “huella digital” de su criterio, el lector podría pensar que con
estructura interna. Ambos escenarios (el un microscopio óptico tampoco somos
interior de los cristales y su patrón de capaces de medir las fases de los haces
difracción) están conectados mediante dispersados que pasan a través de un
“una puerta” representada por su objeto y, sin embargo, observamos la
correspondiente formulación imagen que nos amplía el sistema de
matemática (figura 2.11). El primer lentes que contiene este artilugio
escenario, conocido con el nombre de (figura 2.12, superior). Pues bien, la
“espacio real o cristalino”, está diferencia está en que para los rayos X
representado por el miembro de la no existen lentes capaces de realizar esa
izquierda de la expresión matemática, tarea de composición de fases, así que las
la denominada función de densidad “lentes” inexistentes se suplen mediante
24

intrincadas ecuaciones matemáticas y la
certera experiencia del cristalógrafo Sistema
de lentes
(figura 2.12, inferior).
Objeto
Mediante la expresión matemática
mencionada (figura 2.11) y dada una
Imagen Luz
estructura cristalina conocida (espacio ampliada
ers
ada visible
p
dis
real), siempre es posible simular Luz
matemáticamente el experimento y
obtener el patrón de difracción (espacio
recíproco) que originaría dicha Estructura
Computador
estructura, y no solo en lo que a las
s Cristal
posiciones e intensidades de las ondas de
da
ensi
difractadas se refiere, sino también su Int
Rayos X
secreto, las diferencias de fase entre es
¿Fa Hac ados
dichas ondas. Dicho de otro modo, ses
? difr
act
siempre podemos movernos desde la Cristalógrafos
izquierda a la derecha de dicha

expresión. Sin embargo, el lector ya Figura 2.12. Comparación entre un
habrá descubierto que el verdadero calculado (el miembro de la derecha de microscopio óptico (esquema superior)
y el que podríamos llamar “microscopio
interés es el contrario, es decir, la misma expresión) lo más parecido
imposible” de rayos X (esquema inferior).
trasladarnos desde la derecha a la posible al obtenido experimentalmente,
izquierda, o lo que es lo mismo, obtener señal inequívoca de la bondad de una
las estructuras de los cristales a partir del estructura propuesta. Sin embargo, en
experimento de difracción. ¡Y ese es el aquellos momentos, la comunidad
problema! científica ya fue consciente de que este
Los Bragg esquivaron magistralmente procedimiento era simplemente
el “problema de las fases” al resolver las inaplicable a estructuras más complejas,
estructuras de los compuestos sencillos es decir, con más átomos.
que habían analizado. La sencillez de las Sorprendentemente, la primera
estructuras abordadas les permitió usar la solución, al menos parcial, al intrincado
técnica denominada de “prueba y error”, problema de las fases vino de la mano de
de tal modo que variando lentamente las Arthur Lindo Patterson (1902-1966),
posiciones de los escasos átomos que un neozelandés que tuvo su primer
constituían dichas estructuras, es decir, contacto con el mundo de la difracción
modificando la parte izquierda de la de los rayos X durante su estancia como
expresión de la figura 2.11, conseguían estudiante en el laboratorio de William
obtener un patrón de difracción Lawrence Bragg. Continuando su etapa
25

Diferencia
Intensidad
de fase
Cristal
Función de Patterson
Figura 2.13. Arthur Lindo Patterson y la función

de su nombre, P(uvw), que elimina la necesidad una expresión matemática (P(uvw) en como las implicadas en su función, hubo
de conocer las diferencias de fase entre los figura 2.13) que, modificando que esperar algunos años hasta que su
haces difractados. Su función origina un mapa ligeramente la expresión de la densidad descubrimiento pudiera hacerse efectivo
(derecha, abajo) cuyos máximos coinciden con
los extremos de los vectores entre cada pareja
electrónica, ρ(xyz), conseguía dar un para resolver, indirectamente, el
de átomos del cristal (derecha, arriba). magnífico rodeo al problema de las fases. problema de las fases.
La elegante solución de Patterson Pero al margen de la dificultad
eludía el necesario conocimiento de las práctica que suponía el cálculo de la
formativa, en el Instituto Kaiser- fases, aunque lo reemplazaba por la expresión aportada por Patterson, en
Wilhelm en Berlín, Arthur Lindo necesidad de resolver un puzle algo 1935 nadie esperaba que David Harker
Patterson, físico de formación intrincado. Partiendo solo de las (1906-1991), un “aprendiz de
universitaria, se obsesionó por una intensidades de difracción, y cristalógrafo”, se diera cuenta de una
posible aplicación de la teoría de Fourier prescindiendo de las relaciones de fase circunstancia especial que facilitaba muy
[Joseph Fourier (1768-1830), entre cada onda difractada, su función significativamente la interpretación de
matemático francés] al análisis proporciona información, directa e aquella función, de la que Patterson no
estructural. Fue en 1933, como inmediata, sobre la posición relativa de había sido consciente. El californiano
consecuencia de su incorporación al cada par de átomos de la estructura, pero David Harker, graduado en 1928 como
Instituto de Tecnología de no su localización absoluta en el interior químico por la Universidad de Berkeley,
Massachusetts, y gracias a su amistad de la celdilla elemental. Así que se aceptó un trabajo como técnico en uno
con el matemático Norbert Wiener planteó un nuevo problema, difícil, pero de los laboratorios de la empresa
(1894-1964), cuando profundizó sus no imposible de resolver. Sin embargo, Atmospheric Nitrogen Corp. en el
conocimientos en las mencionadas debido a la precariedad tecnológica del estado de Nueva York, en donde, gracias
teorías. Y así nació en 1934 la momento para poder abordar a la lectura de artículos relacionados con
denominada “función de Patterson”, intrincadas y repetitivas sumas, estructuras, nació su interés por la
26

Figura 2.14. David Harker. Algunos vectores
interatómicos en un cristal (arriba). Disposición Plano de
de máximos en un mapa de Patterson (abajo) simetría
mostrando que los vectores entre átomos

relacionados por simetría se concentran en
zonas “fáciles de encontrar” en el mapa, en este
caso sobre una línea (máximos coloreados).
Átomos en el cristal
cristalografía. La gran depresión

económica de aquellos años fue la
culpable de que en 1933 perdiera su
trabajo y regresara a California. Pero
gracias a sus ahorros pudo entrar en el

Instituto de Tecnología de California y,
bajo la supervisión de Linus Pauling
(1901-1994), comenzó a practicar con la
resolución de estructuras simples. Máximos “Harker”
Durante una de las charlas semanales del
laboratorio se presentó la función que
recientemente había introducido parejas de átomos relacionados entre sí como el desarrollo singular más
Patterson y allí fue en donde Harker fue por elementos de simetría, lo cual importante, tras el propio
consciente de la dificultad que supondría simplificaba cualitativamente la tediosa descubrimiento de los rayos X por
abordar el cálculo e interpretación de esa interpretación de dicha expresión Röntgen en 1895. Y algo parecido puede
función para estructuras con un gran (figura 2.14). decirse de David Harker, quien además
número de átomos. Según él mismo Arthur Lindo Patterson falleció de haber sido coautor de otras novedosas
refirió, días después de la charla súbitamente en noviembre de 1966 metodologías matemáticas para la
mencionada, se despertó súbitamente e inexplicablemente su nombre está resolución del problema de las fases, fue
durante la noche y exclamó ¡tiene que pasando a la historia, al menos desde el introductor de una técnica (todavía
funcionar! En efecto, Harker hizo la última década del siglo XX, casi vigente) mediante la cual Max F. Perutz
patente el hecho de que la función de como el de un desconocido, y mucho (1914-2002) y John C. Kendrew (1917-
Patterson contiene información nos tememos que su nombre quede 1997), premiados con el Nobel de
específica, muy valiosa y fácil de localizar exclusivamente asociado a la Química en 1962, pudieron resolver las
en determinadas zonas de los mapas de denominación de parte de algún primeras estructuras de proteínas.
dicha función. Harker demostró que la programa de cálculo. Sin embargo, la El hecho de que ni Patterson ni
información más valiosa era aportación de Patterson a la cristalografía Harker fueran reconocidos por la
consecuencia de las distancias entre puede considerarse, sin exageración, Fundación Nobel forma parte de ciertos
27

episodios oscuros de nuestra historia, así la Universidad de Cambridge y en 1923
que al menos este apartado deja obtuvo un puesto de ayudante en el
constancia de que sus interpretaciones laboratorio de William Henry Bragg en
en el “concierto cristalográfico” merecen la Royal Institution de Londres. En
el calificativo de allegro molto, ya que sus 1927 regresó a Cambridge como
contribuciones desatascaron profesor, en donde muy pronto recibió
definitivamente el insuficiente recorrido de los alumnos del Laboratorio
que había tenido la contribución de los Cavendish el apelativo cariñoso de
Bragg al problema de las fases. “el Sabio”. Desde allí ilusionó también
por el mundo de la cristalografía de las
macromoléculas a muchos investigadores
2.7. 1940-1960: aparecen del King’s College y del Birbeck College,
nuevos intérpretes. y en 1937 obtuvo una plaza de profesor
‘Andante’, con partitura en esta última institución, lugar en

de John D. Bernal donde también se formaron una parte
significativa de los cristalógrafos
Resulta sorprendente observar lo aventajados de la época. Sin duda, a
Figura 2.15. John D. Bernal, “el Sabio”.
acontecido durante este periodo en el John D. Bernal le corresponde un lugar
Reino Unido. La sinfonía progresa con prominente en la ciencia del siglo XX.
nuevos intérpretes en cada rincón del Demostró que, en condiciones
escenario, y todos parecen interpretar adecuadas, un cristal de proteína podía
magníficamente la partitura. En efecto, mantener su cristalinidad al exponerlo a
tras los hallazgos de Arthur Lindo los rayos X, y algunos de sus estudiantes
Patterson y David Harker, se disparó fueron capaces de resolver estructuras
el interés por la estructura de los tales como la de la hemoglobina, la
compuestos moleculares, especialmente penicilina, la vitamina B12 y otros
por aquellos relacionados con la vida: las materiales biológicos de importancia, de
proteínas. Y en este movimiento tuvo tal modo que la cristalografía comenzó a
mucho que ver un irlandés afincado revolucionar la biología. John D. Bernal,
en Inglaterra y descendiente de judíos fallecido a los 70 años, fue también el
sefardíes, John Desmond Bernal (1901- motor de estudios cristalográficos sobre
1971), quien sin lugar a dudas hizo de virus y, junto con su colaborador Isidor
centro de atracción para un conjunto Fankuchen (1905-1964), obtuvo los
de personajes, decisivos para el desarrollo primeros diagramas de difracción de
ulterior de la cristalografía. algunos de ellos.
Bernal (figura 2.15) se graduó en Max Ferdinand Perutz (1914-2002)
1919 en Mineralogía y Matemáticas por fue uno de los personajes relevantes que
28

encontramos en el Reino Unido Research Council. Max F. Perutz,
alrededor de la figura de Bernal. Perutz, laureado Nobel de Química en 1962,
nacido en Austria en una familia resolvió la estructura tridimensional de la
dedicada a la industria textil, se primera proteína, la hemoglobina, y fue
matriculó en química en la Universidad pionero en el uso de una metodología
de Viena y descontento con lo que él inspirada en David Harker, que consiste
denominó una pérdida de tiempo en la introducción de elementos de alto
dedicada al análisis inorgánico, decidió peso atómico en los cristales previamente
que su futuro estaba en la bioquímica formados de la proteína.
que parecía desarrollarse en Cambridge. John Cowdery Kendrew (1917-
Con la ayuda económica familiar, en 1997) nació en Oxford y en 1939
1936 se incorporó al grupo de John D. obtuvo su graduación en química en el
Bernal en el Laboratorio Cavendish, en Trinity College de Cambridge. Del
donde comenzó su tesis doctoral. Su mismo modo a como ocurrió con

relación con William Lawrence Bragg Perutz, la influencia personal de John D.
fue también decisiva, y ya en 1937 Bernal le indujo a trabajar en la
realizó los primeros experimentos de estructura de las proteínas y en 1946
difracción en cristales de hemoglobina ingresó en el Laboratorio Cavendish,
que había podido cristalizar en el colaborando con Max Perutz bajo la
Instituto de Biología Keilin Molteno, dirección de W. Lawrence Bragg. Se
de tal modo que se puede afirmar que doctoró en 1949 y junto a Perutz Figura 2.16. John C. Kendrew (izquierda)
Perutz (y su bicicleta) supusieron el formaron las “únicas fuerzas vivas” de la y Max F. Perutz (derecha), observando un
modelo de la estructura de la hemoglobina.
primer nexo real entre la física, que Unidad de Biología Molecular del
representaba el Laboratorio Cavendish, entonces recién creado (1947) Medical
y la biología. La invasión de Austria dejó Research Council. Aunque los trabajos
la economía familiar de Perutz de Kendrew se centraron
totalmente exhausta. Sin embargo, fundamentalmente en la mioglobina,
a partir de enero de 1939, Max pudo ambos compartieron el Premio Nobel
sobrevivir gracias a una beca de la de Química de 1962.
Fundación Rockefeller y a un puesto Otro de los grandes personajes de la
de ayudante en el laboratorio del joven época, que también se gestó alrededor de
W. Lawrence Bragg. En 1945 se la influencia directa de John D. Bernal,
renovaron sus expectativas gracias a una fue la controvertida e infortunada
beca del Imperial Chemical Industries londinense Rosalind Elsie Franklin
Research y ya en 1947 fue nombrado (1920-1958). Existen multitud de textos
director de la Unidad de Biología referentes a Rosalind E. Franklin y quizá
Molecular del recién creado Medical merezca la pena leer los preparados por
29

Figura 2.17. Rosalind Franklin y la “foto 51”
(arriba), patrón de difracción obtenido de una
fibra de ADN que condujo al descubrimiento
de la estructura en doble hélice. James Watson,
Francis Crick y Maurice Wilkins, distinguidos con
el Premio Nobel en 1962 (abajo).
Miguel Vicente, titulados “La dama

ausente: Rosalind Franklin y la doble
hélice” y “Jaque a la dama: Rosalind
Franklin en el King’s College”, porque
creemos que hacen justicia a su persona

y a su corta, aunque fructífera, y no
reconocida labor en la ciencia de
mediados del siglo XX. Rosalind
(figura 2.17) se doctoró en 1945 en la
Universidad de Cambridge y tras pasar
tres años (1947-1950) en París, en el
Laboratoire de Services Chimiques de
l’Etat, en 1951 se incorporó como
asociada de John Randall en el King’s
College de Londres. En ese laboratorio
Rosalind cruzó su trayectoria con la de
Maurice Wilkins (1916-2004), ya que
ambos estaban dedicados al estudio del
ADN. Lamentablemente, la
competencia, desleal hasta niveles
incomprensibles, la llevó a un conflicto
permanente con Wilkins, quien
finalmente le “pasó factura”. Sin
conocimiento de Rosalind, los diagramas
de fibra del ADN, que Rosalind había
obtenido e interpretado, llegaron a las
manos de dos jóvenes impetuosos,
James Watson (1928-)
30

y Francis Crick (1916-2004). Esos Watson consiguió en ese mismo año influencia de los resultados de
diagramas de difracción (figura 2.17), un puesto para trabajar con John Rosalind Franklin, quien falleció
que fueron bautizados por Bernal como Kendrew en el Laboratorio Cavendish, prematuramente a los 37 años. Los tres
las fotos de rayos X más bellas hasta en donde conoció a Francis Crick. Tras personajes, Watson, Crick y Wilkins,
entonces obtenidas, sirvieron para el dos años en el Instituto Tecnológico de compartieron el Premio Nobel de
establecimiento de la estructura California, Watson regresó en 1955 a Fisiología y Medicina de 1962, cuatro
doblemente helicoidal del ADN Inglaterra para trabajar un año más en años después del fallecimiento de
(figura 2.17). el Laboratorio Cavendish con Crick y Franklin. Las reglas del Premio Nobel
Maurice Wilkins (1916-2004), en 1956 ingresó en el Departamento limitan el número de personas a tres,
nacido en Nueva Zelanda, se licenció de Biología de Harvard. que estén además vivas, por lo que
como físico en 1938, en el St. John’s Francis Crick (1916-2004) nació Franklin ya no era elegible para el
College de Cambridge, fecha en la que en Inglaterra y estudió física en Nobel. Sin embargo, es indudable
se incorporó con John Randall a la Londres, en el University College. que al menos mereció una mención
Universidad de Birmingham. Tras Durante la Segunda Guerra Mundial explícita en el acto de adjudicación
obtener su doctorado en 1940, se trabajó en el Almirantazgo Británico, del premio, pero su papel, clave en la
incorporó al proyecto Manhattan en abandonando posteriormente este confirmación de la estructura del
California. Al concluir la Segunda empleo para estudiar biología y ADN, fue simplemente ¿olvidado?,
Guerra Mundial, en 1945, volvió a aprender los principios de la incluso por los tres premiados.
Europa, en donde John Randall cristalografía con William Cochran Dorothy Crowfoot Hodgkin
organizaba los estudios de biofísica (1922-2003). En 1949, mediante una (1910-1994), británica nacida
en la Universidad de St. Andrew en beca del Medical Research Council, se circunstancialmente en El Cairo, se
Escocia. Un año más tarde obtuvo una incorporó al laboratorio de Max instaló en Oxford gracias a una beca
plaza en el King’s College de Londres Perutz, en donde, en 1954, concluyó del Sommerville College, en donde
y en el entonces recién creado Medical su tesis doctoral. Y allí conoció a James aprendió cristalografía y los métodos
Research Council, en donde llegó a ser Watson, quien posteriormente influiría de difracción. Pronto se sintió atraída
vicedirector en 1950. definitivamente en su carrera. Sus por el personaje y los trabajos de John
James Watson (1928-) nació en últimos años los pasó en el Salk D. Bernal, de tal modo que en 1933
Chicago, y en 1950 obtuvo su título Institute for Biological Studies en ya estaba en Cambridge, explorando,
de doctor en Zoología por la California. bajo la tutela de Bernal, un conjunto
Universidad de Indiana. Pasó un año El amargo final de esta historia es de problemas estructurales de interés.
en Copenhague como becario Merck que Maurice Wilkins, James Watson En 1934 regresó a Oxford de donde
y durante un simposio celebrado en y Francis Crick recibieron todos nunca salió, excepto por cortos
1951, en Nápoles, conoció a Maurice los honores por sus “oficiales” periodos de tiempo. En 1946 obtuvo
Wilkins, quien despertó su interés por descubrimientos sobre la estructura un puesto como profesora asociada en
la estructura de las proteínas y de los molecular del ADN y su importancia cristalografía y aunque estuvo
ácidos nucleicos. Gracias a la en la transferencia de información en inicialmente ligada a la mineralogía,
intervención de su director de tesis, la materia viva, olvidando la decisiva pronto sus trabajos se encaminaron
31

2.8. 1970-1980: parece que se
acaba, ¡pero no! Incluso suena
‘música tecno’.
‘Finale’, con melodía
inacabada...
Aunque lo sucedido durante los

primeros 60 años del siglo XX resulta
asombroso y en cierto modo irrepetible,
la melodía cristalográfica inicial siguió
sonando, y en este sentido aún merece
la pena resaltar en estas páginas a
otros personajes que hicieron de la
cristalografía la base fundamental de sus

investigaciones. Gracias a ellos pudimos
averiguar, por ejemplo, características
importantes del enlace químico y
aprendimos cómo las matemáticas
volvían a dar un nuevo empuje a las
metodologías de resolución estructural.
Y todo ello amenizado por un imparable
impulso tecnológico que invadió todo el
Figura 2.18. Dorothy C. Hodgkin y la
estructura molecular de la penicilina. hacia el campo que siempre le escenario.
interesó y que había aprendido con William Nunn Lipscomb (1919-
John D. Bernal, los esteroles y otras 2011) nació en Cleveland y obtuvo su
moléculas interesantes desde doctorado en el Instituto Tecnológico de
el punto de vista biológico California. Fue profesor de física y
(figura 2.18). Tomó parte muy activa química en la Universidad de Minnesota
en la fundación de la Unión y, a partir de 1959, en la de Harvard. En
Internacional de Cristalografía. 1976 fue distinguido con el Premio
Sus trabajos sobre las estructuras Nobel de Química por sus estudios
de compuestos de cierta complejidad sobre las estructuras de los boranos,
para la época, como la penicilina, gracias a las cuales dilucidó algunas
la cefalosporina, y la vitamina propiedades del enlace químico
B12, entre otros, la hicieron (figura 2.19).
merecedora del Premio Nobel Es obligado hacer mención a los
de Química en 1964. esfuerzos realizados por otros
32

Figura 2.19. William N. Lipscomb y la estructura
del pentaborano.
cristalógrafos que, durante muchos años,

trataron de resolver el problema de las
fases mediante alternativas diferentes a
las que proporciona la metodología de
Patterson, abordando el problema

directamente desde las intensidades del
patrón de difracción y basándose en
ecuaciones de probabilidad: los llamados
métodos directos (figura 2.20).
Herbert A. Hauptman (1917-2011),
nacido en Nueva York, se graduó en de Chicago y obtuvo el grado de doctor Sin duda, las contribuciones de los
1939 como matemático por la en 1944. Finalmente, en 1946, se actores que hemos presentado fueron
Universidad de Columbia. Pasó por el trasladó al Naval Research Laboratory el motor del desarrollo de nuestra
Naval Research Laboratory de de Washington DC, en donde conoció ciencia. Pero no debemos olvidar que,
Washington DC y obtuvo su doctorado a Herbert Hauptman. La monografía como ya se ha mencionado, también el
en 1954. En 1970 se incorporó al grupo publicada por Hauptman y Karle en progreso tecnológico paralelo fue el
de cristalógrafos de la Medical 1953, “Solution of the Phase Problem I. combustible adecuado para el éxito de
Foundation en Buffalo, de donde llegó The Centrosymmetric Crystal”, contenía la cristalografía moderna. En este
a ser director de investigación en 1972. ya las ideas más importantes sobre los sentido, es imprescindible mencionar
Jerome Karle (1918-2013), también métodos probabilísticos que, aplicados los avances obtenidos en los procesos
neoyorquino, estudió matemáticas, al problema de las fases, les hicieron de producción, purificación y
física, química y biología, obteniendo merecedores del Premio Nobel de cristalización, especialmente en el caso
el grado de maestría en biología por la Química en 1985. No sería justo dejar de las macromoléculas biológicas, la
Universidad de Harvard en 1938. En de mencionar el papel de la esposa de generación de tecnología para la
1940 se trasladó a la Universidad de Jerome, Isabella Karle (1921-), quien obtención de los datos de difracción
Michigan, en donde conoció y se casó jugó un papel indiscutible, poniendo en de rayos X, la introducción de
con Isabella Lugosky. Trabajó en el práctica las metodologías mencionadas nuevas metodologías para la
proyecto Manhattan en la Universidad (figura 2.20). resolución estructural y su eficaz
33
21/4/14 13:41:20
el desarrollo de cuidadosas metodologías
b* y la aportación de la robótica han sido
determinantes para minimizar las
cantidades necesarias para los
experimentos de cristalización y agilizar
H
K dicho proceso.
Por otra parte, las débiles e
ineficientes “lámparas” de rayos X de las
a* primeras décadas, con algunos vatios de
O
potencia, fueron secuencialmente
reemplazadas a mediados del siglo XX
por tubos de hasta varios kW. Pero el
salto cualitativo en este sentido se
produjo en la década de 1980, como

consecuencia de la aplicación de los
-H-K
denominados sincrotrones, instalaciones
fH + fK + -f-H-K = invariante que constan de un gran anillo (del orden
de 1 km de longitud) por el que circulan
partículas cargadas (normalmente
electrones) a velocidades próximas a la
de la luz. Estas partículas recorren
canales rectilíneos que se quiebran para
adaptarse a la curvatura del anillo, y es
en ese momento, en el cambio de
dirección, cuando estas partículas emiten
una radiación muy energética
denominada radiación de sincrotrón,
compuesta por un continuo de
longitudes de onda que abarcan desde
las microondas hasta los llamados
Figura 2.20. Relaciones probabilísticas rayos X duros, y cuya potencia supera
para la determinación de las fases en los aplicación gracias al desarrollo en un billón de veces a la de los tubos
denominados métodos directos (arriba). computacional. convencionales (figura 2.21). Y todo ello
Los círculos negros representan puntos del
A pesar de que la tradicional receta sin tener en cuenta lo que promete el
patrón de difracción. Herbert A. Hauptman
(izquierda), Jerome Karle (centro), Isabella de “tiempo, espacio y reposo” sigue llamado XFEL (del inglés, X-ray Free
Karle (derecha). siendo válida para la obtención de Electron Laser), fuente de rayos X
cristales en el laboratorio (figura 2.21), producidos por un láser de electrones
34

Figura 2.21. Gota de solución con
cristales de proteína (arriba). Vista aérea
del anillo de luz sincrotrón del ESRF en
Grenoble, Francia (abajo).
35

Figura 2.22. Tiras de Beevers-Lipson (izquierda,
arriba), pequeño detalle del computador
ENIAC (izquierda, abajo). Detalle de una
granja de computación actual (derecha).
rotundo éxito durante casi 25 años hasta

la última década del siglo XX, fue
reemplazada por los denominados
detectores de área, muy sensibles, que
permiten la detección simultánea de

varios cientos de haces de difracción,
ahorrando con ello tiempo en el
experimento. Y todo ello asociado a la
increíble robótica que nos proporcionó
rápidos y eficaces goniómetros capaces
de manejar y orientar el cristal con gran
precisión durante el experimento de
difracción.
Pero el desarrollo de los medios de
cálculo ha sido igualmente parte
fundamental de nuestra historia, pues
sin disponer de la capacidad para
manejar miles, millones, de datos
numéricos implicados en la resolución
de la estructura interna de los cristales,
nada de esto habría sido posible. Las
denominadas “tiras de Beevers-Lipson”,
libres, que se convertirán en los placas fotográficas iniciales fueron tiras de papel con valores
sincrotrones de cuarta generación. reemplazadas por detectores electrónicos, predeterminados de funciones
Paralelamente al desarrollo de nuevas capaces de detectar fotones X, de trigonométricas para calcular
fuentes de rayos X, la tecnología multiplicar su efecto y transformarlo en ingeniosamente a mano las
asociada a los detectores de rayos X corriente eléctrica. Pero la tecnología de transformadas de Fourier, se usaron
también sufrió cambios drásticos. Las “detectores puntuales”, usada con hasta principios de la década de 1969
36

(figura 2.22). Esta metodología de la aparición de los modernos orgánico de mediana complejidad y más
cálculo manual vio con asombro la computadores personales, de precio de 800 estructuras macromoleculares,
aparición de los primeros computadores, asequible, con capacidad de ensamblaje por poner un par de ejemplos), sino para
que a su vez reemplazaron al primer en forma de “granjas” para cálculo mitigar la dispersión de todos estos
“gran computador”, el ENIAC distribuido, proporcionaron a los resultados que aparecen en decenas de
(Electronic Numerical Integrator and cristalógrafos actuales el medio ideal revistas especializadas. Pero además, las
Computer), inaugurado en 1945 sobre para casi cualquier tipo de cómputo. bases de datos estructurales juegan un
una superficie de casi 70 m2 y Las facilidades de cálculo actuales han papel transcendental al proporcionar un
compuesto por 70.000 resistencias, permitido, además, abrir las puertas a acceso versátil y rápido a toda la
10.000 condensadores, 1.500 relés, nuevos y exitosos desarrollos información estructural, con una calidad
6.000 conmutadores manuales y metodológicos para la resolución superior a la fuente original (revistas de
17.486 válvulas. Con el desarrollo de estructural, inimaginables hace tan solo la especialidad), y la capacidad para
la microelectrónica, que introdujo los escasos años (figura 2.22). realizar búsquedas sofisticadas que
circuitos integrados, los centros de El desarrollo de la tecnología proporcionan información muy superior
computación llegaron a ser accesibles informática ha sido igualmente clave a la individualizada, mostrando
a los cristalógrafos, quienes durante las para facilitar el almacenamiento y relaciones entre estructuras y manejando
décadas de 1970-1980 acudían tratamiento de toda la información conjuntos de datos estadísticamente
masivamente a estas facilidades con sus estructural que la cristalografía significativos. Los bancos y bases de
enormes cajas de “fichas perforadas”, que proporciona continuamente, para todos datos más relevantes actualmente se
eran el único medio para el los tipos de materiales, desde los más clasifican por la tipología de materiales
almacenamiento de datos numéricos y simples hasta los más complejos. Pero que recogen, y así CRYSTMET
de los propios programas de cálculo. En han sido los propios cristalógrafos, de almacena las estructuras de minerales,
la década de 1980 los laboratorios de modo individual o colectivo, quienes a metales y aleaciones, ICSD (Inorganic
cristalografía se “inundaron” de los lo largo de los años han sido los Crystal Structure Database) se ocupa del
primeros computadores responsables del desarrollo de bancos y manejo de estructuras de materiales
departamentales, que por fin permitían bases de datos que contienen no solo las inorgánicos, CSD (Cambridge Structural
la independencia respecto de los grandes estructuras obtenidas, sino los datos Database) almacena estructuras orgánicas
centros de computación y de sus estrictas experimentales que han dado lugar a las y metalo-orgánicas de pequeño y
reglas de acceso. Los computadores de la mismas. Con todo ello, toda la mediano tamaño, y finalmente PDB
serie VAX (de la Compañía Digital información cristalográfica generada está (Protein Data Bank) recopila las
Equipment Corporation) marcaron una siempre a disposición de los especialistas estructuras de proteínas, ácidos nucleicos
época de esplendor para el cálculo y del público en general. Estas y grandes complejos.
cristalográfico, ya que además permitían herramientas, los bancos y bases de Con todo ello, la cristalografía ha
el uso de cintas magnéticas y de los datos, son imprescindibles no solo para sido (y sigue siendo) una de las ramas
primeros “discos duros” (¡de solo unos almacenar el ingente flujo de estructuras científicas de mayor carácter
cientos de Mb!) que eliminaron las que anualmente salen a la luz (más de multidisciplinar, al unir diferentes áreas
tediosas “fichas perforadas”. Finalmente, 60.000 estructuras anuales del tipo de investigación frontera, y es la que,
37

Figura 2.23. Cien años de imparable evolución

de la cristalografía. directa o indirectamente, Este capítulo está dedicado a las
ha generado el mayor número de personas que han hecho posible que la
laureados Nobel a lo largo de la historia, cristalografía se haya convertido en una
29 hasta la fecha de esta publicación de las herramientas más potentes y
(tabla 2.1). Por su parte, la Unión competitivas para “ver” y entender el
Internacional de Cristalografía (IUCr) mundo submicroscópico, el de los
desde 1986 estableció el Premio Ewald, átomos y moléculas. La cristalografía
que se concede trianualmente como moderna, que se inició averiguando la
un reconocimiento especial para estructura de algunos minerales y de
contribuciones especialmente relevantes materiales simples, nos ha permitido no
a esta ciencia. solo producir y mejorar las propiedades
38

M. Karplus, M. Levitt,
2013 Química Por el desarrollo de modelos multiescala para sistemas químicos complejos
A. Warshel
2012 Química R. J. Lefkowitz, B. K. Kobilka Estructura y función de receptores acoplados a proteínas G
2011 Química D. Shechtman Descubrimiento de los cuasicristales
2010 Física A. Geim and K. Novoselov Por experimentos innovadores respecto al grafeno como material bidimensional
V. Ramakrishnan,
2009 Química Estructura y función del ribosoma
T. A. Steitz, Ada E. Yonath
2006 Química R. Kornberg Bases moleculares de la transcripción eukariótica
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Mecanismo de síntesis del trifosfato de adenosina (ATP) y descubrimiento de una enzima para el
1997 Química P. D. Boyer, J. E. Walker, J.C. Skou
transporte de iones
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1994 Física C. Shull, N. Brockhouse Difracción de neutrones
1992 Física G. Charpak Desarrollo de la cámara proporcional multicable
1991 Física P-G. de Gennes Orden de sistemas simples aplicado a cristales líquidos
J. Deisenhofer, R. Huber,
1988 Química Estructura 3D de un centro fotosintético
H. Michel
1985 Química H. Hauptman, J. Karle Desarrollo de los métodos directos
1982 Química A. Klug Desarrollo de la microscopía electrónica cristalográfica
1976 Química W. N. Lipscomb Estructura de boranos
1972 Química C. B. Anfinsen Plegamiento de las cadenas proteicas
1964 Química D. Hodgkin Estructuras de varias sustancias bioquímicas
1962 Química J.C. Kendrew, M. Perutz Estructura de proteínas globulares
F. Crick, J. Watson,
1962 Fisiología o Medicina Estructura del ADN
M. Wilkins
1954 Química L. C. Pauling La naturaleza del enlace químico
1946 Química J. B. Sumner Descubrimiento de la cristalización de las enzimas
C. J. Davisson,
1937 Física Difracción de electrones por los cristales
G. Thompson
Contribución al conocimiento de la estructura molecular a través de sus investigaciones con momentos
1936 Química P. Josephus Wilhelmus Debye
dipolares y la difracción de rayos X y de electrones en gases
1929 Física L-V. de Broglie La naturaleza ondulatoria del electrón
1917 Física C. Glover Barkla Descubrimiento de los rayos X característicos de cada elemento
1915 Física W. H. Bragg, W. L. Bragg Uso de los rayos X para determinar la estructura de los cristales
1914 Física M. von Laue Difracción de los rayos X por los cristales
1901 Física W. C. Röntgen Descubrimiento de los rayos X
de incontables materiales complejos sido mucho más amplia y detallada Tabla 2.1. Premios Nobel asociados
con cristalografía.
que inundan nuestra vida cotidiana, si no hubiéramos omitido la
sino comenzar a entender participación y esfuerzo de otros muchos
los secretos de la vida a través del personajes, anteriores y actuales,
conocimiento estructural de sus notorios y anónimos, pero por suerte,
pequeñas piezas y de la interacción tras nuestro finale, la “música” sigue
entre ellas. Esta historia podría haber sonando. Vale.
39

Referencias bibliográficas Sitzungsberichte der Bayerische Akademie der
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41

Metodologías para el estudio de interacciones no-covalentes.

Ibon Alkorta y José Elguero
3. ¿Interacciones débiles?
¡No tanto!
S i uno preguntara a un grupo de

químicos cuál es el tema más importante
de su disciplina, sus respuestas variarán,
nombre de Interacciones Débiles (ID)
o Interacciones No-Covalentes (INC).
Hasta hace unos pocos años, las dos
pero con certeza una respuesta común ID que se analizaban en los libros
será “el enlace químico”. A pesar de cristalografía eran los enlaces de
de su larga historia, el concepto de hidrógeno (HB, en sus siglas inglesas)
enlace químico cambia y se expande y las interacciones de apilamiento
continuamente, haciendo de él un entre anillos aromáticos (π-π stacking
sujeto eternamente joven. Aunque en inglés), tal como ya se establecía
los enlaces covalentes presentes en las en un volumen divulgativo publicado
moléculas orgánicas y los enlaces iónicos por el CSIC en 1995. Pero de unos
que existen en los cristales inorgánicos años a esta parte, el número de ID
son generalmente bien entendidos, ha crecido mucho y, aunque no todas
mucho queda por aprender acerca de han sido descubiertas en cristales,
los enlaces organometálicos, enlaces que todas son o pueden ser importantes
implican átomos de la parte inferior en la determinación de la denominada
del sistema periódico, así como enlaces estructura secundaria de las moléculas.
intermoleculares. De estos últimos nos En el caso de cristales formados por
ocuparemos aquí. una única molécula, hay que considerar
La estructura secundaria de los tanto la molécula individual (estructura
cristales de pequeñas moléculas primaria) como su relación con otras
depende de lo que se conoce con el moléculas de la celdilla (estructura
43

secundaria). Si el cristal contiene 3.1. Introducción
distintas moléculas, sean estas entidades
Tipo de interacción o enlace Fuerza
químicas diferentes, o estructuras Hay que distinguir varios tipos de
Covalente 100-400
Coulomb (electrostática) 250
diferentes de la misma molécula (por interacciones débiles que, a su vez,
Ión-dipolo 50-200 ejemplo, confórmeros), la estructura deben ser subdivididas. La clasificación
Enlace de hidrógeno 10-65 primaria corresponde a la supramolécula que proponemos está basada en la que
Catión-π 5-80 formada por todas las entidades formuló Mulliken, en su libro de 1969,
Dipolo-dipolo 5-50
diferentes. Ello incluye todas las sales para los complejos de transferencia de
Apilamiento π-π 0-50
Fuerzas de Van der Waals <5
y todos los solvatos, pero también un carga. Si extendemos la noción de HB a
Metal-ligando 0-400 campo de gran relevancia en nuestros los átomos de los grupos 14, 15, 16 y 17
días, “la química supramolecular”: del sistema periódico (figura 3.1), el HB
Tabla 3.1. Energías de interacciones
y enlaces en kJ mol-1. clatratos, compuestos de inclusión y ocupa una posición singular, debido a
complejos huésped-hospedador (host- que el átomo de hidrógeno solo tiene un
guest en inglés). Como recordaba Jack electrón (1s1). Para los restantes, hay que
1 2 12 13 14 15 16 17
Dunitz, los cristales son un ejemplo introducir una nomenclatura nueva, aún
H perfecto de estructuras supramoleculares no totalmente consolidada, análoga a la
Li Be B C N O F y ¡eran conocidos mucho antes de notación HB, con una o dos letras antes
Na Mg AI Si P S CI que Jean-Marie Lehn inventara dicha de la B (de bond). El enlace siempre se
K Ca Zn Ga Ge As Se Br palabra! denominará de acuerdo con la naturaleza
Rb Sr Cd In Sn Sb Te I Las interacciones responsables de la del ácido de Lewis: X para halógeno
estabilidad de las estructuras (F, Cl, Br, I), Ch para chalcógeno (O,
Figura 3.1. Elementos implicados en supramoleculares son aquellas que vamos S, Se, Te), Z para pnictógeno (N, P, As,
interacciones débiles no metálicas. En negro a discutir en este capítulo, revisando y Sb), Si, C, Li, Be y B para los enlaces
más ancho, la línea de Zintl.
sistematizando dichas interacciones, ¡más de silicio, carbono, litio, berilio y boro,
fuertes de lo que se puede suponer! Y para respectivamente. Es útil recordar que
ello es útil un esquema con el rango de los elementos de las columnas 13 y 14
energías implicadas en los diferentes se denominan trieles y tetreles y que
tipos de interacciones (tabla 3.1). la línea de Zintl (figura 3.1) divide las
En este capítulo no serán tratadas zonas de los metales de los no-metales
ni las interacciones covalentes ni las (en azul, los metaloides).
metal-ligando. Las fuerzas de dispersión En la figura 3.2 se propone
de Van der Waals son fuerzas atractivas una clasificación sistemática de las
entre átomos y moléculas que nacen interacciones débiles.
de las fluctuaciones de la distribución En la descripción general de un
electrónica. Muy débiles, aunque muy enlace Y–X···D, la base de Lewis (neutra
importantes, tampoco serán tratadas o aniónica) suministra densidad
aquí. electrónica al aceptor X (ácido de
44

Figura 3.2. Clasificación de los enlaces
no covalentes.
Abreviación Nombre en inglés Nombre en español Ejemplo
HB Hydrogen bond Enlace de hidrógeno FH - - - - NH3
XB Halogen bond Enlace de halógeno FCI - - - - NH3

Lewis), el cual está unido ChB Chalcogen bond Enlace de chalcógeno F2S - - - - NH3
covalentemente al átomo Y (usualmente
ZB Pnictogen bond Enlace de pnictógeno F3P - - - - NH3
C, N o halógeno). Muy recientemente,
SiB Silicium bond Enlace de silicio F4SI - - - - NH3
en 2007, Peter Politzer introdujo la
CB Carbon bond Enlace de carbono F4C - - - - NH3
noción de hueco σ (σ-hole en inglés)
(figura 3.3), con la siguiente definición:
LiB Lithium bond Enlace de litio HLIi - - - - NH3
“En ciertos entornos moleculares, un
BeB Beryllium bond Enlace de berilio H2Be - - - - NH3

átomo de los grupos 15-17,
BB Boron bond Enlace de boro H3B - - - - NH3
covalentemente unido, puede tener una
región de potencial electrostático p-p Stacking Apilamiento C6H6:C6H6
significativamente positivo en su región Cation-p Na+:C6H6
exterior, a lo largo de la extensión del Anion-p CI–: C6H6

enlace covalente. Ello es debido al lóbulo
externo deficiente en electrones del
orbital enlazante p, medio lleno, que se
llama hueco σ. El hueco σ es el Pares libres del O
Par libre del Br
responsable de la interacción no-covalente
altamente direccional con un nucleófilo,
por ejemplo, el par libre de una base de
Lewis”. Los átomos de los grupos 15 y 16
Hueco-s
pueden tener respectivamente tres y dos Hueco-p
huecos σ en sus superficies.

Las tres ID del tipo LiB, BeB
y BB corresponden a enlaces dativos,
siendo el más conocido el que se
establece entre el boro y el nitrógeno La intervención de aniones y cationes Figura 3.3. Una representación
en el complejo H3B·NH3 (borano- es posible en todos los grupos y en el de los huecos σ.
amoniaco 1:1). caso de los HB, Gilli introdujo en 2009
El último grupo corresponde los denominados CAHB (charge assisted
a interacciones con electrones π, hydrogen bonds o enlaces de hidrógeno
generalmente con especies cargadas. asistidos por carga).
45

Dador
sencillo
Aceptor
sencillo
Aceptor doble
Dador doble
Figura 3.4. Tipos de enlaces bifurcados.
Figura 3.5. Ejemplo de interacción blue-shift:

caso del complejo fluoroformo···amoniaco.
3.2. Enlaces de hidrógeno de una molécula o de un fragmento

molecular X–H (en el cual X es
Introducido por Linus Pauling en 1931, más electronegativo que H) y un átomo
el término “enlace de hidrógeno” es o un grupo de átomos de la misma o de
universalmente conocido (se bromea una molécula diferente donde
diciendo “my name is Bond, Hydrogen hay evidencia de formación de enlace”.
Bond”). El grupo de trabajo de la Es muy frecuente que se usen las
IUPAC, pilotado por E. Arunan y en abreviaciones HBD y HBA para
el que participó uno de los autores de dador y aceptor de enlaces
este capítulo (I.A.), llegó a la siguiente de hidrógeno.
definición de enlace de hidrógeno: “El Existen una serie de interacciones
enlace de hidrógeno es una interacción relacionadas con los HB entre las cuales
atractiva entre un átomo de hidrógeno destacan las tres siguientes:
46

Figura 3.6. Un ejemplo de enlace de dihidrógeno en un dímero de azaborano construido con papeles de colores (origami modular).
• Bifurcados o de 3-centros. su vez, resulta en una disminución que el corrimiento al rojo). Hay
Tienen su origen en los estudios de la frecuencia de estiramiento numerosos ejemplos (figura 3.5),
cristalográficos, en los que con (stretching) de la vibración X–H. tales como, fluoroformo···óxido de
relativa frecuencia se observa que Un desplazamiento a frecuencias etileno, ión cloruro···bromoformo,
un átomo de hidrógeno de un más bajas se conoce con el nombre fluorobenceno···cloroformo, tal
HBD interacciona con los átomos de red-shift (corrimiento al rojo) como demostró Pavel Hobza.
de dos HBA o que recíprocamente y es fácilmente detectable por • Enlaces de dihidrógeno. Tal como
un átomo de un HBA está espectroscopias de infrarrojo y demostró Bakhmutov, esta variedad
interaccionando con dos átomos de Raman. Sin embargo, frente a de HB ocurre cuando un hidruro
hidrógeno de dos HBD (figura 3.4). este comportamiento general, en metálico interacciona con un
• Corrimiento al azul o blue-shift. algunos casos se observa el efecto HBD, es decir, entre un Hδ+ y un
En un HB típico la formación contrario y la señal de estiramiento Hδ–, para formar un sistema de tipo
del enlace X–H···Y conduce a un X–H se desplaza a frecuencias D–H···H–E. Por ejemplo, entre
debilitamiento del enlace X–H; más altas, es decir, ocurre un BH4– y H2O, entre Li–H y H–F,
este debilitamiento se acompaña de corrimiento al azul (en general, etc. Aunque este enlace debe mucho
un alargamiento del enlace que, a mucho más débil en valor absoluto de su estabilidad a una interacción
47

D–X D–X Y
|
Y–A A
Tipo I Tipo II
Figura 3.7. Tipos de enlace XB.
Hueco s
más voluminosos que los átomos

de hidrógeno, los XB son más
sensibles a los efectos estéricos que
los HB. Sin embargo, tal como
demostraron I. Alkorta y colaboradores

en 2013, ambos pueden ser analizados
Figura 3.8. Mapa de densidad electrónica por medio de las ecuaciones de tipo
coloreado según el potencial electrostático en Hammett-Taft.
la molécula de diyodo (rojo, el más negativo, y
electrostática, también se produce Según la geometría, se
azul, el más positivo).
una transferencia de carga hacia la distinguen dos tipos de enlaces de
región H···H central (figura 3.6). halógenos (XB), los de tipo I y los
de tipo II (figura 3.7). Esta distinción es
importante cuando en ingeniería
3.3. Enlaces de halógeno de cristales se diseñan nuevas
estructuras basadas en este tipo de
a dw Tal como estableció P. Metrangolo, sin interacciones.
w
dl B
duda alguna se trata de las ID más En la figura 3.8 se recoge una
A b importantes, después de las de representación de la molécula de diyodo:
l
l M hidrógeno (HB). El término XB indica las zonas azules corresponden al
cualquier interacción D···X–Y, en la cual hueco σ. Nótese su semejanza con la
D
X es el halógeno electrófilo (ácido de representación de la molécula de diyodo
Lewis, XBD), D es un dador de según Boltzmann en 1898 (figura 3.9).
densidad electrónica (base de Lewis, Entre las numerosas aplicaciones
E
XBA) e Y es carbono, nitrógeno, del concepto de enlaces de halógeno
Figura 3.9. Diagrama de Boltzmann de la halógeno, etc. La mayoría de las destaca su uso para el diseño de
molécula de diyodo (1898), mostrando el tendencias presentes en los HB y otras fármacos, tal como ejemplifica el
recubrimiento de las llamadas regiones
ID se encuentran en los XB. Como era reciente trabajo de Wilcken y
atómicas sensibles (α y β).
de esperar, siendo los halógenos mucho colaboradores.
48

Figura 3.10. Primera plana de la revista Journal
of Chemical Theory and Computation con el
artículo de Bauzá, Alkorta, Frontera y Elguero.
3.4. Enlaces de chalcógeno
El enlace de chalcógeno ha sido

denominado por Wang, Ji y Zhang
como “la hermana del enlace de

halógeno”. La mayoría de los ejemplos
conciernen el azufre y los ChB juegan
un papel relevante en la arquitectura
y funciones de las proteínas. Son más
débiles que los XB, pero pueden resultar
fuertes en situaciones intramoleculares,
tal como ha reportado Sanz en 2012,
para el tiomalonaldehido, y Alikhani
en 2014 para interacciones iónicas con
aniones F– y Cl–.
3.5. Enlaces de pnictógeno
Cuando el átomo puente pertenece al de los instrumentos analíticos de compuestos llamados atranos.
grupo de los pnictógenos (grupo 15 de la química cuántica han sido A propósito de estas interacciones,
en la figura 3.1) los enlaces se llaman aplicados a los enlaces de pnictógenos Del Bene, Alkorta y Elguero han
de pnictógeno. Su desarrollo debe (ZB) [mapas de potenciales generalizado la noción de hueco σ
mucho a Steve Scheiner, aunque ya en electrostáticos (MEP), AIM, ELF, a la hueco π (π-hole), y es frecuente
1985, Michael J. Frisch, John A. Pople NBO…]. encontrar trabajos, como el de Bauzá,
y Janet E. del Bene (citado en la Los ZB están presentes, aunque Alkorta, Frontera y Elguero, en donde
referencia de Scheiner) publicaron sus no haya sido nunca señalado, en una se comparan los enlaces XB, ChB y ZB
estudios del dímero de PH3. La mayoría importante y poco común familia (figura 3.10).
49

F
R R
O F
O Si Si H H H H H
F
F
R O O H H H H H
Si O Si O
R F O F O X A
N
H H H
OO Si
OSi (a) (b) (c) (d)
O
R
Si Si O R
Figura 3.12. Enlaces de carbón.
R O
R
3.6. Enlaces de silicio “carbono”, para evitar confusiones con
Figura 3.11. Cubo de siloxano. los enlaces covalentes clásicos.
A partir del concepto de hueco σ, Mani y Arunan fueron quienes, en

Bauzá, Mooibroek y Frontera, desde 2013, introdujeron la definición de estos
la Universitat de les Illes Balears, han enlaces (figura 3.12). Un ejemplo típico
llegado a los denominados “enlaces es la interacción entre el fluorometano
tetrel”, que implican átomos del grupo y el agua (figura 3.12, a) en donde
14 (Si, Ge y Sn en figura 3.1). La figura se ha podido excluir que sea un HB
3.11 muestra la molécula F–@Si8O12R8. trifurcado, (b) en estado sólido, que
Según estos autores, estos enlaces fue extendida al caso general (c), en
tienen fuerzas comparables con los HB donde A = O, N, S, Cl, etc., y X es un
y otras interacciones de tipo hueco σ. átomo o una molécula electrón-atractora
Estas cajas son análogas a los cubos de o, incluso, una molécula cargada
siloxano (figura 3.11). positivamente (por ejemplo, CH3NH2+).
Aunque no haya sido definido como
CB, hay una estructura reciente de
3.7. Enlaces de carbón microondas (por lo tanto de fase gas)
que corresponde a dicha situación: el
Como el carbono también pertenece complejo piridina-CF4 de Caminati (d).
al grupo de los tetreles, era de esperar
que pronto aparecieran los enlaces
de carbón (CB). Sin embargo, para 3.8. Enlaces de litio
muchos lectores estos enlaces pueden
resultar muy extraños, por lo que los Este tipo de enlaces son conocidos
trataremos con más detalle. Nótese desde antiguo, pues su descripción se
que se denominan de “carbón”, no de remonta a un trabajo de Peter A.
50

Figura 3.13. El complejo F2···Li+···F2
de simetría D2h.
Kollmann de 1970 y otro de Ault y

Pimentel de 1975. La mayoría
de los ejemplos son del tipo F···Li+···F
como el bello ejemplo representado
en la figura 3.13, reportado en 2009
por Del Bene, Alkorta y Elguero.
Análogamente a los HB, también
existen blue-shifted LiB.
Más recientemente, Solimannejad
ha descrito la posibilidad de efectos

cooperativos (positivos y negativos)
en sistemas neutros que incorporan
enlaces de litio.
3.9. Enlaces de berilio

CI2Be ··· NH3 CI2Be ··· OH2 CI2Be ··· FH
Este es un campo al que, junto
con Manuel Yáñez y Otilia Mó, los
autores de este capítulo han
contribuido de una manera
significativa. Un estudio bastante
exhaustivo de los complejos de BeX2
(X = H, F, Cl, OH) con diferentes bases
de Lewis (H3N, H2O, HF, H3P, H2S,
NCH, H2CO…) se llevó a cabo
CI2Be ··· PH3 CI2Be ··· SH2 CI2Be ··· CIH
por Sanz, Yáñez, Mó, Alkorta
y Elguero (figura 3.14). Mó, Yáñez,
Alkorta y Elguero también Figura 3.14. Complejos de BeCl2 con
estudiaron cómo los BeB modifican diferentes bases de Lewis.
las HB de una molécula,
por ejemplo, de imidazol
y del pirazol.
51

Figura 3.15. Estructura de rayos X del complejo benzonitrilo···trifluoruro de boro, resuelta por Smith en 2010.
3.10. Enlaces de boro Particularmente significativos son 3.11. apilamiento π-π

los trabajos, experimentales y teóricos,
Hay varios tipos de enlaces entre de Smith en el laboratorio de James A. Como ya se indicó en la introducción,
boro y nitrógeno (u oxígeno), Phillips (2002-2014) sobre complejos de Cano y colaboradores pusieron de
por ejemplo, los muy estudiados nitrilos con BF3, que él mismo extendió manifiesto que los apilamientos
aminoboranos (R2N–BR2). Pero a BH3 e incluso a dinitrógeno de anillos aromáticos (con sus electrones
nuestro interés se limita a enlaces (figura 3.15). π) constituyen uno de los elementos
intermoleculares, de los que ya hemos Los complejos de tipo borano- determinantes de la estructura cristalina
citado el que se establece entre el boro amoniaco 1:1, R3B···NR3 (al menos un de este tipo de compuestos. Como los
y el nitrógeno en el complejo H3B·NH3 R en cada lado debe ser H) eliminan anillos aromáticos (fenilos, naftilos…)
(borano-amoniaco 1:1). Ya hemos dihidrógeno (H2) por calentamiento o heteroaromáticos (imidazoles, indoles,
señalado que estos enlaces pertenecen y por ello han sido muy estudiados bencimidazoles… bases púricas y
a la serie de los trieles y que en la para almacenamiento de H2. Dicha pirimidínicas…) son frecuentes en las
literatura, sobre todo la inorgánica, se eliminación está asociada con la estructuras biológicas, es normal que
encuentran con el nombre de enlaces presencia en el complejo de un Hδ+ sea en estas estructuras en donde hayan
dativos B←N. y un Hδ–. sido caracterizadas muchas interacciones
52

Figura 3.16. Izquierda: fullereno C60 atrapado por unas “pinzas” moleculares. Derecha: estructura de un sensor de aniones
basado en la fluorescencia del dímero de pireno.
del tipo π-π. En la estructura de 3.12. Interacciones catión-π son un ejemplo de interacción catión-π/
pequeñas moléculas la estabilización anión-π.
debida al apilamiento contribuye a El tercer gran tema de las ID, junto con
determinar la conformación (efecto los HB (apartado 1) y los apilamientos
intramolecular), así como su estructura π-π (apartado 10) son las interacciones 3.13. Interacciones anión-π
secundaria (efecto intermolecular). catión-π dada su enorme importancia en
Este efecto intermolecular también se química, biología y ciencia de materiales, La posibilidad de invertir la tendencia
manifiesta de una manera espectacular y como muestra están los artículos de de los compuestos aromáticos de
en química supramolecular, como en el Smith y Mahadevi, respectivamente. interaccionar con cationes llevó a
caso del complejo fullereno-coranuleno Muchos autores han contribuido a este estudiar la interacción del
(figura 3.16). Como era de esperar, la tema, pero cabe destacar a George W. hexafluorobenceno y otros derivados
interacción es tanto más fuerte cuantos Gokel, Dennis A. Dougherty y François perfluorados con aniones tales como
más anillos aromáticos opongan sus Diederich. Lo ilustramos con un único fluoruros, cloruros, bromuros, cianuros,
respectivas caras, de ahí, por ejemplo, ejemplo (figura 3.17), ya que esta acetiluros, etc., tal como demostraron
que las interacciones pireno-pireno sean situación volverá a aparecer en la sección Alkorta, Rozas y Elguero, Estarellas et
tan fuertes. siguiente, pues ciertos apilamientos π-π al., y Mascal et al. El éxito de estos
53

Figura 3.17. Representación de los

complejos KB(C6H5)4 con un átomo de K estudios condujo a su generalización a químicos que podríamos denominar
“pinzado” entre dos fenilos (izquierda) y
otros sistemas aromáticos pobres en pensamiento matricial o
de un benceno coordinado con un potasio-
dibenzo-18-corona-6 (derecha).
electrones, como 1,3.5-triazina y su pensamiento combinatorio. Cuando se
derivado trifluorado. dispone de una colección de objetos A, B,
Tal como se ha explicitado en C… X, si la combinación A–X funciona,
la sección 11, varios autores se han ¿por qué no probar la combinación B–X?
interesado por sistemas que presentan Si se trata de situaciones más complicadas,
simultáneamente interacciones π con por ejemplo, trímeros, entonces
aniones y con cationes (figura 3.18), entre el orden importa y deberíamos
ellos los autores de este capítulo y el grupo hablar de pensamiento
de la Universitat de les Illes Balears, permutatorio.
llegando incluso a proponer diferentes Para generar estructuras
sistemas aromáticos como aislantes. supramoleculares presentes en los
cristales, en solución o en fase gas,
disponemos de una serie de interacciones
3.14. Conclusiones no covalentes (dejando de lado otra vez a
los metales), tales como X+, X–, X•, Hδ+,
Muchos de los avances en el campo de Hδ–, π-excedente, π-deficiente, diferentes
las interacciones débiles son el resultado hibridaciones, diferentes elementos de
de una manera de razonar de los una misma columna, gases nobles, etc.
54

Figura 3.18. Puntos críticos (AIM) del

De esa manera, y con la muchas áreas inexploradas, benceno interaccionando simultáneamente
ratificación de la información por ejemplo, dímeros radical-π, con un anión fluoruro y un catión sodio
(izquierda) y de Na+···C6H5···Cr(0)···C6F5···Cl–
cristalográfica, hemos pasado de los y muchos trímeros, aunque
(derecha).
enlaces de silicio a los de carbono, ya hay ejemplos de estas
de las interacciones catión-π estructuras que implican dos ID
a las anión-π. Pero quedan aún diferentes.
55

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57

Entramado metálico simulando un fullereno

endoédrico con Takeshi Akasaka en su interior,
uno de los más famosos químicos de fullerenos,
explicando el significado de la estructura.

Nazario Martín
4. Jaulas de carbono:
una visión a través
de la cristalografía
4.1. Introducción tiempo, únicamente dos alótropos de
carbono, el diamante —constituido por
El carbono es sin duda el elemento carbonos tetraédricos— y el grafito
químico más próximo al concepto de —constituido por carbonos trigonales—
vida y, por tanto, al ser humano. De eran conocidos por la comunidad
hecho, es el único elemento químico científica. Ambas formas alotrópicas de
conocido de los 94 elementos naturales carbono presentan una estructura
de la tabla periódica capaz de reunir las reticular con los átomos de carbono
propiedades necesarias para la aparición extendiéndose infinitamente en las tres
de la vida sobre la Tierra. Este hecho direcciones del espacio.
singular es producto de su capacidad de En el año 1985 se produjo el
hibridación de orbitales atómicos, dando accidental y sorprendente
lugar a carbonos de naturaleza digonal descubrimiento de los denominados
(lineal), trigonal (plano) y tetragonal fullerenos —jaulas cerradas de átomos
(tetraédrico), lo que le permite generar de carbono con elevada simetría—. El
una variedad de formas alotrópicas primero y más común de esta nueva
(las diferentes modificaciones familia de moléculas constituidas
estructurales de un elemento). Sin exclusivamente por átomos de carbono
embargo, hasta hace relativamente poco es el C60, que presenta una simetría
59

icosaédrica y que está constituido por de “coranuleno”. La desestabilización
12 pentágonos y 20 hexágonos, siendo, que resulta de dos pentágonos
por tanto, exactamente igual que el adyacentes (8 electrones π que no
conocido balón de futbol. La molécula cumplen la regla de Hückel), junto con
de C60 es la más abundante y común la reducción del solapamiento de los
de todos los fullerenos. La pregunta, por orbitales π debido a la curvatura
tanto, es: ¿por qué de las posibles jaulas de la jaula, explican la mayor estabilidad
que pueden formarse con átomos de encontrada para aquellos fullerenos que
carbono, la de 60 átomos es la más obedecen la regla del pentágono aislado.
favorecida? Es más, ya que todos los Desde el descubrimiento seminal de
fullerenos de fórmula general Cn están los fullerenos hace ya casi tres décadas,
Figura 4.1. Nanoestructuras de carbono
más abundantes: fullereno C60 (esfera
constituidos por hexágonos (con n ≥ 20, han sido descubiertas y sintetizadas un
de 60 átomos de carbono formada por con la excepción de n = 22) y elevado número de otras nanoformas de
pentágonos y hexágonos), nanotubo pentágonos (12 para todas las jaulas de carbono, también fascinantes. Entre
de pared sencilla (cilindro de átomos de fullerenos, siendo los responsables de la ellas, hay que destacar por su
carbono formado por hexágonos) y grafeno
(lámina de átomos de carbono formada por
curvatura), ¿por qué entre los importancia, y en orden cronológico,
hexágonos). 1.812 isómeros posibles para 60 átomos los denominados nanotubos de carbono
de carbono solo se forma la molécula —estructuras constituidas por átomos
de simetría icosaédrica? de carbono de forma cilíndrica— y,
Todas estas preguntas fueron más recientemente, el grafeno —lámina
finalmente respondidas por Harold bidimensional con el espesor en un
Kroto (uno de los laureados con el átomo—. Pero hoy también se conocen
Premio Nobel de Química de 1996 otras nanoestructuras de este elemento,
junto a Richard Smalley y Robert Curl tales como los fullerenos endoédricos,
por el descubrimiento de estas los nanocuernos de carbono,
moléculas), quien propuso que la nanocebollas de carbono, nanotorus
tensión local del edificio molecular (nanotubo de carbono cerrado sobre sí
aumenta con el número de enlaces mismo formando un anillo), nanovasos,
compartidos por dos pentágonos los nanocapullos (formados por un
(la unidad de “pentaleno”), conduciendo fullereno que emerge de un nanotubo a
a moléculas menos estables. Esta pauta, modo de un capullo sobre un tallo) o los
acuñada con el nombre de “la regla del denominados guisantes (formados por
pentágono aislado” (IPR del inglés un nanotubo de carbono conteniendo
Isolated Pentagon Rule), establece que moléculas de fullerenos). Pero sin duda
para conseguir estabilidad, cada los más estudiados, abundantes
pentágono debe estar rodeado por e interesantes son los fullerenos, los
hexágonos, formando así la unidad nanotubos y el grafeno (figura 4.1).
60

4.2. Al carbono le gusta
el fútbol: fullereno C60
El descubrimiento del fullereno por

Robert F. Curl, sir Harold W. Kroto
y Richard E. Smalley, en 1985
(figura 4.2), fue recompensado con el
Premio Nobel de Química en 1996, y
dado que esta molécula tenía una forma
semejante a la cúpula geodésica
construida por el arquitecto
Buckminster Fuller en la Exposición
Universal de Montreal de 1967 recibió el
nombre de buckminsterfullereno o, más

abreviadamente, fullereno. Además, por
la singularidad de su forma y estructura,
el fullereno fue declarada molécula del
año por la revista Science en 1991, hecho
que revela la enorme excitación que
produjo este descubrimiento en la
comunidad científica. De hecho, Figura 4.2. El equipo de Rice/Sussex el día
sobrepasó el ámbito puramente química. Sin embargo, como tantas antes de enviar su trabajo seminal sobre el
fullereno C60 a la revista Nature. Empezando
científico y por su descubrimiento veces ha sucedido en la historia de la
por la izquierda: O’Brien, Smalley, Curl,
inicial, en la Universidad de Rice en ciencia, buscando con más detalle Kroto y Heath.
Texas, su asamblea declaró oficialmente pueden encontrarse los orígenes de la
al llamado buckminsterfullereno C60 molécula en trabajos previos, muchos de
la molécula estatal de Texas en mayo de ellos realmente visionarios de un
1997. De este modo, los descubridores escenario que terminaría por hacerse
de esta singular molécula han pasado realidad. En este sentido, es necesario
ya a la historia de la ciencia por derecho señalar que la molécula de C60 ya fue
propio. De hecho, el impacto de esta propuesta por Eiji Osawa, un químico
molécula condujo al nombramiento japonés de la universidad de Kioto, en
de Harold Kroto como Caballero un trabajo publicado en japonés 15 años
por la reina de Inglaterra. antes de su descubrimiento. Y en 1970,
La propuesta de una molécula de R. W. Henson, del Atomic Energy
simetría icosaédrica que se asemeja a un Research Establishment, estudiando los
balón de futbol no tenía precedentes en daños de la radiación en los moderadores
61

Figura 4.3. Estructura química de la molécula de C60 mostrando su simetría icosaédrica

(idéntica a un balón de futbol con 12 pentágonos y 20 hexágonos).
de grafito de los reactores nucleares, posterior en la revista Carbon, publicada una capa esférica. Sin embargo, Jones
observó algunos patrones de difracción en 1999. nunca llegó a explicar cómo se podría
de rayos X inusuales para fibras La idea de una estructura en forma conseguir.
de carbono, hizo una propuesta de jaula de carbono fue inicialmente Aunque la estructura de la molécula
para su estructura y fabricó un modelo propuesta por David E. H. Jones en un de C60 pudo establecerse
de papel representando la molécula de artículo que publicó en 1966. Este autor inequívocamente mediante difracción de
C60. Sin embargo, la evidencia para esta sugirió la posibilidad de crear moléculas rayos X, resulta interesante señalar que
nueva forma de carbono fue muy débil gigantes huecas, distorsionando una red lo que inicialmente pudo caracterizarse
y no fue aceptada ni siquiera por sus plana de átomos de carbono enlazados fueron las estructuras de algunos de sus
propios colegas. Los resultados de hexagonalmente (alambrada de derivados previamente sintetizados, tales
Henson nunca fueron publicados, gallinero), añadiendo átomos de carbono como C60(OsO4)(4-t-butilpiridina)
t
t-butilpiridina)2
aunque el modelo en papel aún extra, lo que permitiría introducir la y (Ph3P)2Pt(h2-C60)·C4H8O, los cuales
se conserva y tuvo algún crédito curvatura necesaria para llegar a obtener mostraron una estructura icosaédrica
62

perturbada. La estructura de la propia molecular. Pero, además, también son de catálisis asimétrica, que consiste
molécula de C60, sin funcionalizar interés en química médica y esencialmente en el uso de moléculas
químicamente, fue bastante escurridiza, biotecnología, donde han demostrado su orgánicas como catalizadores que
hasta que finalmente pudieron eficacia como inhibidores de diferentes permiten acceder a nuevos fullerenos
prepararse cristales adecuados a partir enzimas, en procesos de neuroprotección quirales. En ellos, la determinación de la
de una disolución caliente de y transfección, presentando actividad configuración absoluta es esencial y, para
ciclohexano que, cíclicamente, se dejó citotóxica sobre células tumorales e ello, sin duda la difracción de rayos X ha
alcanzar temperatura ambiente, se enfrió incluso provocando la ruptura del resultado ser la herramienta esencial.
a 195 K y nuevamente se llevó a DNA con irradiación de luz visible. La organocatálisis, por otro lado, ha
temperatura ambiente. Las moléculas de Y recientemente también han potenciado el interés en la síntesis
C60 dan lugar a cristales de muy alta demostrado su utilidad para inhibir la orgánica como una estrategia muy eficaz
simetría y el análisis fino de su estructura infección de determinados virus como, para la construcción de moléculas
mostró todos sus detalles geométricos; por ejemplo, el ébola. quirales mediante el uso de catalizadores
por ejemplo, que la distancia entre Una propiedad menos estudiada en libres de metales. Sin embargo, esta
átomos diametralmente opuestos es de estos derivados de carbono es la aproximación catalítica
7.065(3) Å, que los dobles enlaces C=C quiralidad, es decir, la propiedad que medioambientalmente benigna no había
que fusionan dos anillos hexagonales tienen algunas moléculas de no ser sido aplicada a la ciencia de fullerenos
tienen una longitud de 1.355(9) Å, y superponibles con su imagen especular. debido, probablemente, a la falta de un
que la distancia C-C en los enlaces En este sentido, la síntesis y el empleo de método de activación eficaz de la jaula
sencillos C-C que fusionan un anillo fullerenos quirales en la búsqueda de de carbono cuando se utiliza un
hexagonal y uno pentagonal es de nuevas propiedades biológicas ha estado organocatalizador.
1.47(2) Å (figura 4.3). muy limitada. En nuestro grupo de En nuestro grupo de investigación
investigación de la Universidad hemos descrito el primer ejemplo de
Complutense se ha desarrollado un cicloadición organocatalítica sobre
4.3. Derivados de C60. método que permite, por primera vez, fullerenos, conduciendo a derivados de
¡Los fullerenos pueden la funcionalización altamente selectiva fullereno C60 con anillos carbocíclicos
ser quirales! de fullerenos en condiciones de reacción quirales con excelentes excesos
suaves mediante el empleo de metales, enantioméricos (se obtiene
Los fullerenos son moléculas que tales como plata o cobre, y de ligandos mayoritariamente uno de los dos
presentan excepcionales propiedades quirales en cantidades catalíticas. Esto ha enantiómeros). El proceso implica el uso
químicas, electroquímicas y fotofísicas, permitido tener un elevado control sobre de fosfinas quirales como
lo que les hace candidatos ideales para su la estereoquímica de los productos organocatalizadores nucleófilos que
aplicación en numerosos campos. resultantes. promueven una cicloadición (3+2)
Actualmente se investiga su posible Más recientemente, hemos aplicado estereoconvergente de alenoatos
aplicación en la obtención de una nueva metodología sintética dirigida racémicos sobre la molécula de C60. De
dispositivos fotovoltaicos o cables a la preparación de fullerenos quirales nuevo, ha sido el estudio cristalográfico
moleculares en la denominada electrónica mediante el uso de la denominada por difracción de rayos X el que ha
63

4.4. Fullerenos que encapsulan
átomos y moléculas
Inmediatamente después del

descubrimiento de los fullerenos,
los científicos se preguntaron sobre la
(3S)
posibilidad de introducir diferentes
átomos y moléculas en el interior de las
jaulas de carbono, especulando sobre
las nuevas propiedades que estos materiales
Re face híbridos podrían presentar. Esta
expectación se ha ido incrementando a
lo largo de los últimos años,
especialmente con la aplicación de estos

materiales en diferentes campos tales
como medicina y electrónica molecular.
Si face
Es importante señalar que las
propiedades de este tipo de fullerenos
C60
(fullerenos endoédricos, o
endofullerenos) pueden modificarse
Figura 4.4. a) Estructura cristalográfica de fácilmente dependiendo de las especies
un cristal de la molécula de fullereno quiral permitido la asignación inequívoca encapsuladas en las jaulas. En este
mostrando una configuración absoluta S
de la configuración absoluta del nuevo sentido, los endofullerenos se han
sobre el carbono C-3 del anillo fusionado al
C60. b) La formación de este enantiómero se
estereocentro generado en la reacción clasificado en dos categorías:
justifica mediante el ataque del C60 por la (figura 4.4). metallofullerenos, que son aquellos que
cara inferior del dipolo quiral. Los resultados anteriores contienen átomos únicos o sus formas
Fuente: Angew. Chem. Int. Ed., 2013, 52, 5115.
permiten prever la aplicación combinadas. Así, en este grupo se
de los fullerenos en campos donde la incluyen compuestos tales como los
quiralidad es un factor crítico, tales metallofullerenos clásicos M@C2n
como las aplicaciones biomédicas, o M2@C2n, con 60 ≤ 2n ≤ 88, carburos
así como también en la menos explorada metálicos, M2C2@C2n y M3C2@C2n,
ciencia de materiales en donde la donde 68 ≤ 2n ≤ 92; nitruros metálicos,
quiralidad puede tener un impacto M3N@C2n, con 68 ≤ 2n ≤ 96 y, más
importante en determinadas propiedades recientemente, óxidos metálicos,
físicas en las que el orden y control M4O2@C80. En general, estos compuestos
de la morfología jueguen un papel se preparan mediante técnicas de
fundamental. vaporización por láser o descarga en arco
64

eléctrico de materiales compuestos
de grafito y óxidos metálicos
en atmósfera de ciertos gases.
Otros tipos de endofullerenos son los
que encapsulan átomos o pequeñas
moléculas, tales como átomos de gases
nobles (He, Ne, Ar, Kr, e incluso Xe),
que se obtienen por tratamiento del
fullereno en condiciones extremas
(650 ºC y 3.000 atm de gas noble),
si bien el nivel de ocupación del huésped
es del orden del 0,1-1%. En una
segunda aproximación, moléculas tales
como H2 y H2O se han introducido en

jaulas de C60 y C70 mediante reacciones
químicas de apertura y cierre de la jaula
de carbono en lo que ha venido
a denominarse cirugía molecular.
El caso de la molécula de H2O@C60
es especialmente destacable, ya que
mediante el análisis de difracción de
rayos X de un monocristal de
H2O@C60⋅(NiOEP)2 (OEP:
octaetilporfirina), se reveló que,
a diferencia de otros metallofullerenos,
en donde el metal adopta una
localización fuera del centro de la esfera
y no se mueve libremente, el átomo de
oxígeno está localizado en el centro
de la molécula de C60, con los enlaces
O-H apuntando hacia los átomos de Ni.
Además, las moléculas de H2O@C60 Figura 4.5. Estructura de la molécula
y C60 pueden separarse fácilmente o gases nobles. Estos nuevos sistemas Li+@C60. El átomo de Li+ ocupa dos posiciones
de forma desordenada.
mediante cromatografía HPLC sobre permitirán el estudio de la molécula
una fase estacionaria derivada de de agua de forma aislada, así como la
perileno, lo que las diferencia de los modificación de la reactividad química
endoédricos que encapsulan hidrógeno exoédrica de este fullereno “húmedo”.
65
21/4/14 13:42:12
Figura 4.6. Estructuras de los fullerenos endoédricos La@C2v-C82, La2@Ih-C80 y Gd3N@Ih-C80, mostrando las especies químicas
encapsuladas en el interior de la jaula de átomos de carbono.
Los fullerenos endoédricos son ión Li+, situado en el interior de la jaula, aislado. La estructura de esta fantástica
particularmente interesantes si se y el PF6- del exterior, la cual tiene lugar a molécula puede describirse
considera que se caracterizan por la través de los anillos de seis miembros electrónicamente como [La]3+[C82]3-
transferencia de carga desde los átomos (figura 4.5). con una estructura electrónica abierta
metálicos encapsulados a la jaula de que es consecuencia de la transferencia
carbono, formando una sal que no se de tres electrones del La al C82. El spin
disocia, consistente en un catión 4.5. Metallofullerenos y electrónico resultante de la molécula de
metálico encapsulado en el interior de endofullerenos de tipo TNT La@C82 es responsable de una
un anión fulleruro. Esta transferencia reactividad química comparable a la de
electrónica permite estabilizar no solo A continuación, nos centraremos en los especies radicalarias, pudiendo inducir
las especies encapsuladas, sino también metallofullerenos mono y divalentes, así magnetismo a escala molecular o bien
la jaula de carbono que podría ser como en los nitruros metálicos, dado que aumentar la conductividad electrónica.
inestable por sí sola en su forma vacía. estos compuestos han sido investigados en El descubrimiento de esta molécula
Un ejemplo representativo de este detalle y su reactividad química ha sido ha originado un elevado número de otros
modelo iónico ha sido el aislamiento del razonablemente explorada. metallofullerenos tales como
metallofullereno endoédrico catiónico En 1991 Smalley y colaboradores M@C2n (M = Sc, Y, La, Ce, Gd...), siendo
Li+@C60 que puede únicamente demostraron que modificando las la jaula de tipo C2v-C82 la más abundante
estabilizarse en condiciones ambiente condiciones de obtención de fullerenos (C2v es el grupo puntual de simetría que
cuando coexiste con un contraión se podía aislar una nueva familia de estos contiene un eje binario y dos planos de
apropiado. Por ejemplo, la estructura compuestos conteniendo lantano, simetría perpendiculares). En estos
cristalina de la sal [Li+@C60](PF6)- llegándose a la molécula La@C82, compuestos el metal no está situado en el
muestra una fuerte interacción entre el que fue el primer fullereno endoédrico centro de la jaula, sino debajo de un anillo
66

Fullereno C70.
hexagonal a lo largo del eje binario. Como

consecuencia, la distribución de la
densidad de carga sobre la superficie es
altamente anisotrópica, lo cual permite
que los electrófilos y nucleófilos ataquen

selectivamente las dos regiones
diferenciadas.
En el caso de los fullerenos
endoédricos que contienen dos metales,
tales como M2@C80 (M = La, Ce…) las
jaulas con simetría Ih y D5h se forman
como los isómeros más abundantes.
En estos casos, la posición y movimiento
de los metales en el interior de la jaula
resulta no solo de la interacción metal-
jaula, sino, también, de la interacción
metal-metal. Es interesante destacar que
en el caso de las estructuras M2@Ih-C80
los átomos metálicos circulan en las tres
dimensiones del espacio. Sin embargo, por los relativamente bajos rendimientos cilíndricas de grafito (oxido metálico/
en las estructuras M2@D5h-C80 los obtenidos en su producción. Sin embargo, carbono/catalizador) se queman en
átomos metálicos circulan en dos desde que los nitruros trimetálicos fueron presencia de un flujo dinámico de He/H2
dimensiones a lo largo de una banda descritos por Dorn en 1999, estos sistemas conduciendo a cantidades
de 10 hexágonos contiguos en el interior han sido obtenidos con rendimientos macroscópicas de materiales tales
de la jaula (figura 4.6). mucho más elevados. Utilizando el como Sc3N@C80, con rendimientos que
El desarrollo de la química de los método de la denominada plantilla del sitúan a este fullereno endoédrico en el
fullerenos endoédricos ha estado trinitruro metálico (TNT, del inglés tercero más abundante después
limitada durante bastante tiempo Trimetallic Nitride Template), las barras del C60 y C70.
67

Las dos formas alotrópicas más conocidas del carbono, el diamante

(izquierda) y el grafito (derecha). Su estructura es responsable de sus
diferentes propiedades macroscópicas.
68

Es interesante destacar que el es decir, La3N@C88, La3N@C92 conllevan un aumento de la estabilidad
aislamiento de Sc3N@C80 en cantidades y La3N@C96. del producto resultante mediante su
macroscópicas ha permitido el estudio de funcionalización endoédrica (desde el
sus propiedades físicas y reactividad interior) o exoédrica (desde el exterior).
química. Así, de los siete posibles isómeros 4.6. El futuro: fullerenos En ambas aproximaciones, la clave
constitucionales para el C80 que satisfacen que no siguen la regla consiste en estabilizar el fullereno no-
la regla del pentágono aislado (IPR), solo del pentágono aislado IPR mediante la eliminación o
los dos isómeros vacíos, menos estables disminución de la tensión de los
con simetrías Ih y D5h, son los Como se mencionó anteriormente, el pentágonos fusionados.
predominantes cuando están llenos con fullereno C60 es, con gran diferencia, Así, la primera estrategia endoédrica
el cluster del nitruro metálico, siendo el el más abundante de todos los fullerenos. consistió en encapsular un cluster, o
isómero Ih el más abundante. La razón de este hecho radica en que es el complejo metálico, dentro de la jaula del
Utilizando el método TNT, se ha primero que sigue la regla del pentágono fullereno. De este modo, la tensión que
obtenido una amplia variedad de aislado (IPR). Menos de 60 átomos de provoca la fusión de los dos pentágonos
fullerenos endoédricos del tipo carbono conducen, necesariamente, disminuye significativamente debido a las
M3N@Ih-C80 con diferentes metales a anillos pentagonales fusionados, lo fuertes interacciones entre estos y el
(M = Sc, Y, La, Ce, Nd, Gd, Tb, Dy, Ho, que desestabiliza considerablemente la complejo metálico. Por tanto, para la
Er…) y, en general, el cluster metálico gira estructura del sistema. estabilización del fullereno endoédrico se
libremente dentro de la jaula de fullereno, Así, para un número determinado de precisa la presencia de interacciones
adoptando la unidad de M3N una átomos de carbono que forman una jaula, favorables entre las especies encapsuladas y
geometría plana, excepto en el caso del el número de isómeros de fullereno que la jaula de carbono. Esta estrategia ha
gadolinio Gd3N@Ih-C80, en donde el ión no siguen la regla IPR es permitido la formación de
nitruro está fuera del plano de los tres extraordinariamente mayor que aquellos metalofullerenos que no siguen la regla del
iones de gadolinio. que la obedecen. Además, también es pentágono aislado (no-IPR), tales como
Cuando se aumenta el tamaño posible la formación de pentágonos fullerenos de nitruros metálicos del tipo
del metal encapsulado, el rendimiento triplemente fusionados, lo que conlleva un Tb3N@C84, Sc3N@C70, y Y3N@C78,
con el que se obtienen estos compuestos aumento sustancial del número de fullerenos de carburos metálicos como
disminuye y se obtiene una distribución isómeros posibles. Sin embargo, y a pesar Sc2C2@C68 y fullerenos de cianuros
de moléculas con iones metálicos en la del enorme número de isómeros posibles, metálicos como Sc3NC@C78.
que se ven favorecidas las jaulas más cuyas propiedades y reactividad química Es importante destacar que los
grandes. Por ejemplo, con el gadolinio deberían ser diferentes de aquellos que no fullerenos endoédricos no-IPR que
se forman seis tipos de jaulas presentan pentágonos aislados (y que, por contienen uno o más átomos metálicos
de carbono: Gd3N@C78, Gd3N@C80, tanto, siguen la regla IPR), estos sistemas en su interior muestran una fuerte
Gd3N@C82, Gd3N@C84, Gd3N@C86, son muy poco conocidos. coordinación de los átomos metálicos a
y Gd3N@C88, mientras que con Para la preparación de fullerenos los anillos pentagonales fusionados, de
lantano solamente se observa la no-IPR (los que no siguen esta regla), se forma semejante a lo observado en una
formación de las tres jaulas mayores, utilizan actualmente dos estrategias que amplia variedad de especies
69

cavidad interior. En general, en aquellos
casos en los que el endofullereno tiene
un solo átomo metálico, este se
encuentra coordinado con la jaula,
lo que dificulta su movimiento.
Por otro lado, la segunda estrategia
está basada en la funcionalización
exoédrica de la jaula de carbono. Así, se
han llegado a producir una amplia
variedad de derivados no-IPR basados en
la alta reactividad que exhiben los anillos
pentagonales fusionados. Esta saturación
del doble enlace entre los anillos
pentagonales supone un cambio de

hibridación y la consiguiente eliminación
de energía tensional. El primer fullereno
pequeño, denominado #271C50
(siguiendo la nomenclatura de Fowler-
Manolopoulos para diferenciar isómeros
que especifica la simetría y/o un algoritmo
espiral), fue atrapado y estabilizado por
átomos de cloro en 2004. Desde entonces,
las jaulas de fullerenos han sido
funcionalizadas exoédricamente para
introducir átomos de hidrógeno o de cloro
en la superficie del fullereno, lo que
conduce a una gran variedad de derivados
Figura 4.7. Estructura del fullereno no-IPR de fullerenos no-IPR, tales como
#11188C72Cl4. Los pentágonos fusionados,
en verde, son los responsables de que esta
organometálicas en las que la cara C64H4, C71H2, C78Cl8, etc.
molécula no siga la regla del pentágono cóncava de la unidad de pentaleno Esta estabilización de los derivados
aislado. La sustitución exoédrica con cuatro (dos anillos pentagonales de carbono de fullerenos no-IPR se ha justificado
átomos de cloro alivia la tensión estérica fusionados con un doble enlace en la mediante el “principio del alivio de
y permite el aislamiento de esta molécula
posición de fusión) está coordinada al tensión” resultante de la rehibridación
como una especie estable.
Fuente: J. Am. Chem. Soc., 2010, 132, 17102. átomo metálico. Por el contrario, los sp2 a sp3 de los átomos de carbono, así
fullerenos endoédricos que siguen la como por el “principio de la
regla IPR muestran un movimiento de aromaticidad local”, que implica el
los metales o complejos metálicos en la mantenimiento de un esqueleto de
70

carbonos sp2 no funcionalizados que el más estable. Estos nuevos resultados carbono en formas de jaulas cerradas
permanece tras el proceso de abren el camino a la llegada de una altamente simétricas no son moléculas
funcionalización. Basándose en estos nueva familia de fullerenos no-IPR con de interés puramente académico, sino
dos principios, ha sido posible predecir un número casi ilimitado de estructuras que, por el contrario, pueden llegar a
la estabilidad de diferentes hasta ahora desconocidas. tener una gran influencia en futuros
fullerenos no-IPR funcionalizados Estas nuevas jaulas de carbono materiales basados en el elemento
exoédricamente. termodinámicamente menos estables químico carbono. En este sentido,
Una atención especial se ha dedicado deberían mostrar importantes en los años más recientes hemos sido
a la estructura del fullereno C72, un diferencias con respecto a aquellos espectadores de algunos hallazgos
denominado “fullereno perdido” ya que fullerenos que obedecen la regla del sorprendentes relacionados con el
la jaula de C72, tanto para isómeros IPR pentágono aislado (IPR), aumentando así carbono, como es el caso del
como no-IPR, no había sido aislada las propiedades y potenciales aplicaciones recientemente descubierto grafeno del
previamente. Sin embargo, de estos alótropos moleculares de carbono. cual se esperan numerosas aplicaciones
recientemente, han sido preparadas y En este sentido, la comunidad científica en diferentes ámbitos de la
caracterizadas varias especies basadas en debería estar lista para la llegada de nanotecnología futura. En este
la estructura de C72, tales como fullerenos sin precedentes que no siguen la sentido, los fullerenos ya han conducido
La2@D2(10611)-C72, regla del pentágono aislado, es decir, ¡los a células fotovoltaicas de naturaleza
Ce2@D2(10611)-C72, fullerenos del futuro inmediato! orgánica con eficiencias superiores al
La@C2(10612)-C72, 12% que las sitúa próximas a la
y Sc2S@Cs(10528)-C72. comercialización y que pueden
Resultados cristalográficos recientes 4.7. Conclusiones complementar de modo eficaz las células
(figura 4.7) han demostrado por primera de silicio.
vez la mayor estabilidad de un fullereno Científicos de la Universidad de Western Y la cristalografía no queda al
no-IPR que la de su isómero IPR para el Ontario descubrieron en 2010, mediante margen de este vertiginoso desarrollo
derivado C72Cl4. Estos resultados violan el espectro infrarrojo del telescopio de nuevas nanoformas de carbono. El
la regla IPR de carácter universal de los espacial Spitzer, que el espectro de uso de la difracción de rayos X, junto a
fullerenos, pero confirman la validez de infrarrojos de la nebulosa planetaria las técnicas de microscopia electrónica,
la “liberación de tensión” y el principio Tc 1 está dominado por bandas de configura las herramientas
de la “aromaticidad local” que han sido fullereno C60 y, en menor extensión, fundamentales para el estudio de las
tan útiles para predecir la estabilidad de por C70, ambos en forma neutra. Se sorprendentes y variadas estructuras de
diferentes derivados de fullerenos. La estima que la cantidad de fullerenos carbono. Los ejemplos mostrados en este
regla IPR es válida, por tanto, para presente en esta nebulosa planetaria Tc 1 capítulo son solo parte de la punta del
fullerenos sin modificar, mientras que es aproximadamente del 1,5% del iceberg de los numerosos estudios
para derivados de fullerenos surgen otros carbono total presente, siendo equivalente realizados, en donde las técnicas
factores adicionales que podrían a la masa de tres Lunas. cristalográficas han permitido resolver
eventualmente conducir a que una jaula Este descubrimiento sorprendente numerosas estructuras complejas de
de carbono de un fullereno no-IPR sea nos hace pensar que estos alótropos de carbono.
71

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72

M. Ángeles Monge y Enrique Gutiérrez-Puebla
5. Edificando cristales
con entramados
metal-orgánicos (MOF)
5.1. ¿Qué es un MOF? Horike y Kitagawa los definieron como

“polímeros de coordinación, compuestos
Jesse Rowsell y Omar Yaghi definieron con estructuras extendidas y abiertas
un MOF (Metal-Organic Framework) formadas por iones metálicos y ligandos
como “una estructura constituida orgánicos y/o inorgánicos unidos por
por dos componentes principales, un enlaces de coordinación”.
linker (ligando orgánico que sirve de Durante los últimos 15 años, la
unión entre centros metálicos) y un investigación centrada en este tipo de
conector (metal o centro metálico). Por compuestos ha experimentado un gran
tanto, la estructura cristalina de estos desarrollo, debido a las potenciales
materiales se asemeja al armazón o aplicaciones que exhiben. Así, se han
estructura de los edificios, constituidas sintetizado materiales que presentan
por un entramado de vigas y pilares redes o estructuras periódicas abiertas,
que dejan espacios abiertos (figura 5.1). con porosidad permanente, y que se
En los MOF, los linkers actúan de la pueden utilizar, por ejemplo, como
misma manera que las vigas y pilares, materiales para adsorción, separación y
uniendo a los conectores, que a su vez almacenamiento selectivo de gases o
actúan como los puntos o nodos de líquidos. Este comportamiento como
unión, generando estructuras porosas esponjas moleculares abre la puerta a
periódicas”. Y más recientemente, numerosas aplicaciones en el campo de
73

Figura 5.1. Esquema de formación de las redes
poliméricas de los MOF.
a los metales, a los linkers o a ambos

componentes del MOF que se puedan
detectar fácilmente.
Dentro de la evolución de
estos materiales, la cristalografía y la

cristaloquímica han jugado y juegan
un papel determinante, tanto por
proporcionar el conocimiento de
las características estructurales
de todos estos nuevos materiales como
por ocuparse del entendimiento y
racionalización de las nuevas estructuras
formadas. En la actualidad, y a pesar
de que en los últimos años ha habido
una gran explosión en la aparición de
la energía, tales como la mejora del catálisis, ya que es posible diseñar nuevos MOF en la literatura científica,
almacenamiento seguro de gases catalizadores heterogéneos con la investigación continúa centrada
combustibles (hidrógeno, metano) en componentes (metales y linkers) baratos y en la obtención racional de nuevos
depósitos de vehículos, aumentando su respetuosos con el medio ambiente y que tipos estructurales diseñados para su
autonomía. El secuestro y puedan llegar a ser muy selectivos en aplicación en las áreas ya mencionadas.
almacenamiento posterior del CO2, reacciones muy específicas para la síntesis En este sentido, el aspecto importante,
procedente de tubos de escape y de compuestos de alto valor añadido. Los consecuencia del creciente número de
chimeneas, es otra aplicación que tiene, MOF también son muy buenos estructuras cristalinas de estos materiales,
además, connotaciones candidatos para su uso como sensores, es la oportunidad para estudiar sus
medioambientales muy importantes para gracias a que la adsorción de topologías y crear bases de datos que
luchar contra el efecto invernadero. determinadas moléculas pueden permitan racionalizar sus características,
Y muchas otras aplicaciones importantes modificar alguna propiedad (óptica, como por ejemplo las tendencias en
se encuentran dentro del área de la magnética, eléctrica, etc.) asociada conectividad o en formación de clusters
74

Figura 5.2. Evolución de las publicaciones sobre
materiales MOF durante los últimos 20 años y
3.500
detalle de la estructura de un MOF quiral.
3.000
2.500
Número de publicaciones
2.000
de metales, los llamados SBU por sus 1.500

siglas en inglés (Secondary Building Units,
unidades secundarias de construcción). El 1.000
fin último es identificar los principios que
gobiernan el diseño de los MOF, es decir, 500

la predicción de sus estructuras.
0
1990 1995 2000 2005 2010
5.2. Un poco de historia Año de publicación
En 1989, Hoskins y Robson diseñaron

y desarrollaron el primer compuesto interpenetrada, de fórmula Gándara et al. y Bernini, Gándara
metal-orgánico, con el objetivo de [Cu(4,4’-bipy)1.5]NO3·(H2O)1.25. et al.) y ZIF, entre otros (por ejemplo,
obtener un material polimérico, A partir de ese momento y MOF-167, MIL-53, HKUST-1, RPF-7
tridimensional y con grandes cavidades. durante las últimas dos décadas se han o ZIF-8).
Años más tarde, en 1995, Subramanian desarrollado diferentes familias de esta
y Zawarotko, por una parte, y Yaghi clase de compuestos y su evolución
y Li, por otra, prepararon compuestos tiene un comportamiento exponencial 5.3. ¿Por qué son importantes
a partir de 4,4’-bipiridina, un ligando (figura 5.2). Aunque en general, tal los MOF?
bidentado lineal, y metales de transición. como propusieron Kim, Chen y otros
Los primeros sintetizaron un colaboradores del grupo de Yaghi, se Además de dar a conocer una nueva
compuesto de fórmula utilizó el término MOF (seguido de un clase de materiales, el descubrimiento de
[Zn(4,4’-bipy)2]BF4, el cual presentaba número) para identificar este tipo de los MOF dio lugar a una revolución en
grandes canales con una estructura compuestos, también se han bautizado el diseño de compuestos, de forma
que no mostraba interpenetración de con otros acrónimos y números, y entre semejante a como ocurrió con el diseño
redes, mientras que Yaghi sintetizó, por los más importantes se encuentran los de la estructura de edificios. Con los
metodología hidrotermal, un compuesto designados por MIL (Serre y Ferey), MOF se pueden formar redes
con una red porosa tridimensional, HKUST (Chui et al.), RPF (Monge, poliméricas con propiedades químicas y
75

físicas moduladas. Además, la presencia 5.4. Desde el diseño a la de gases y líquidos, catálisis, tamices
de componentes orgánicos e caracterización topológica moleculares, etc.) o distancias entre
inorgánicos permite obtener diversas metales (magnetismo, óptica...). En
estructuras, con diferentes formas, Desde la primera aparición de los resumen, la síntesis de estos materiales
tamaño y ambiente químico en sus materiales tipo MOF se ha venido no solo requiere la selección y
poros, lo cual es capaz de generar usando la palabra “diseño” con un preparación de los módulos del “Lego”,
propiedades específicas. La primera nuevo significado dentro del lenguaje sino la manera en que se ensamblan en
propiedad explorada de los MOF, la de los químicos, pues este vocablo se el sólido final. El éxito del diseño de
absorción, proviene de la naturaleza ha usado básicamente para racionalizar estas estructuras en base a las unidades
porosa de estos compuestos, en donde una reacción química con el objetivo de de construcción (SBU, en inglés) es
selectivamente pueden ser encapsuladas desarrollar una molécula determinada. fundamental para lo que se conoce como
diferentes moléculas de disolventes La idea principal es construir redes química reticular.
orgánicos, gases, medicamentos, poliméricas a partir de un conector que La caracterización fundamental de
aniones o cationes, dependiendo de la puede estar formado por uno o varios este tipo de materiales implica la
carga del entramado (framework), entre metales (clusters) y un linker, como si determinación de su estructura
otras. Es decir, se comportan como fueran piezas de un Lego (unidades cristalina, ya que los métodos
esponjas que son capaces de absorber de construcción), y eligiendo estas convencionales alternativos no suelen
específicamente una clase de moléculas piezas para que, con sus características aportar una información inequívoca, tal
y almacenarlas en su interior, sin que individuales, se pueda obtener una y como la proporciona la cristalografía.
haya cambios en su estructura, y determinada propiedad física o química. Pero este camino tiene su precio, pues en
posteriormente pueden liberarlas. La En química del estado sólido y en primer lugar hay que conseguir
separación de disolventes es una ingeniería cristalina, a este proceder monocristales, lo cual conlleva en
aplicación de estos materiales, ya que la se le ha venido a denominar “diseño ocasiones una cierta dificultad y/o un
selectividad en la absorción es una racional”. extensivo trabajo de síntesis. La mayoría
propiedad que depende directamente En la síntesis racional de estos de las veces estos compuestos se obtienen
del tamaño, forma y naturaleza compuestos, hay que tener en cuenta por síntesis hidro- o solvo-termal, o en
química del poro. Un ejemplo varios factores. Por una parte las microondas en condiciones suaves, lo
de esta propiedad es el uso de los unidades de construcción deben ser que implica el ensayo de un gran
denominados MIL-47 y MIL-53 cuidadosamente elegidas, ya que deben conjunto de condiciones, hasta que una
en la separación de los isómeros del retener sus propiedades en la nueva red de ellas nos lleve a la obtención de
xileno. Otras propiedades cristalina y, por otra, la conectividad es cristales.
directamente relacionadas con su fundamental a la hora de definir las Con la estructura cristalina se
estructura son la catálisis, propiedades de un MOF. Por ejemplo, obtiene, además, la composición
dosificación de fármacos y/o ausencia de centro de simetría química exacta del nuevo MOF. Una vez
propiedades físicas como la (fundamental para obtener una catálisis conocida, se verifica que solo aparezca
conductividad eléctrica e iónica, quiral y propiedades de óptica no lineal), una fase cristalina y que esta sea pura
magnetismo, luminiscencia, etc. presencia y tamaño de canales (absorción para poder proseguir con el estudio de
76

sus propiedades y aplicaciones. El nuevo
tipo estructural y su red topológica se Patente Metales + ligandos
introducen en las bases de datos, que se aplicación Grupos funcionales Síntesis/cristalización
geometría
están actualizando constantemente para
este nuevo tipo de materiales, a la vez Concentración,
Calidad de los cristales
pH, polaridad del disolvente,
que se crea el patrón simulado de temperatura, tiempo
formación de fases nuevas
difracción en polvo microcristalino que

sirve de modelo, como huella digital,
para la identificación y refinamiento de Correlación Análisis Determinación
toda la serie de compuestos estructura/propiedad topológico estructural
isoestructurales.
En algunos casos en los que no se Ajuste fino de
Caracterización
condiciones de síntesis
llegan a conseguir monocristales o estos
no difractan lo suficiente (ni siquiera

con fuentes de radiación de alto brillo,
como los sincrotrones), se están Evaluación de propiedades MOF puro y escalado
a cantidades para su estudio
resolviendo algunas estructuras usando
los diagramas de difracción que produce
el polvo cristalino y la ayuda de Figura 5.3. Esquema del proceso para la
modelos, aunque todo este proceso de transición, como conector, está obtención de materiales MOF, desde el
diseño a la aplicación.
encarna gran dificultad debido al gran determinada por la configuración
número de átomos, tal como electrónica y por su capacidad
demostraron Deng y colaboradores en de acomodar electrones en la esfera
2012. Todo el proceso se esquematiza de coordinación (orbitales d).
en la figura 5.3. Tras el uso de los metales de
transición se han desarrollado nuevas
redes metal-orgánicas basadas en
5.5. Tipos de conectores lantánidos y en metales alcalinotérreos.
Ambos grupos de elementos tienen una
Los conectores más comunes utilizados gran capacidad en conectividad, es decir,
para la síntesis de materiales MOF que se pueden unir a un elevado número
son los metales de transición, los cuales, de átomos vecinos (desde 6 hasta 12),
dependiendo del metal, configuración que es lo que se denomina número de
electrónica o estado de oxidación, coordinación (figura 5.4). La dificultad
pueden exhibir diferentes simetrías para trabajar con estos tipos de
o entornos de coordinación. Como conectores es el control de sus entornos
es bien sabido, la simetría del metal de coordinación, ya que en estos casos
77

quedan disponibles para formar
redes extendidas de alta estabilidad
estructural. Los compuestos
resultantes pueden poseer diferentes
Lineal Trigonal-planar Forma-T Tetraédrico Antiprisma trigonal Antiprisma Dodecaedro
monoapicado cuadrado e inusuales propiedades, tales como
magnetismo, fotoluminiscencia y
absorción, todas ellas al mismo tiempo,
Cuadrado-planar Piramidal de
base cuadrada
Octaédrico Prisma trigonal
biapicado
Antiprisma cuadrado
monoapicado comportándose con materiales
multifuncionales.
Prisma trigonal Bipirámide Bipirámide Prisma trigonal Antiprisma cuadrado

pentagonal trigonal triapicado biapicado 5.6. ‘Linkers’ orgánicos
Figura 5.4. Geometría de coordinación de las geometrías de coordinación En la síntesis de los primeros MOF
los diversos metales. Izquierda: metales de están determinadas por factores se utilizaron órgano-cianuros
transición. Derecha: tierras raras.
estéricos y electrónicos del ligando, y diaminas como ligandos orgánicos
más que por un efecto del campo o linkers. Actualmente, los grupos
cristalino de los mismos, que funcionales que más se usan son
es lo que ocurre con los metales de carboxilatos (ácidos orgánicos)
transición. Sin embargo, estas y entre ellos los derivados del ácido
características que crean benzoico, con dos o varios grupos
dificultades hacen a estos metales coordinantes, ya que estos
más atractivos para encontrar una grupos confieren suficiente estabilidad a
gran cantidad de compuestos con la red, no representan problemas
diferentes estructuras, nuevas topologías de toxicidad y no tienen impacto
y distintas propiedades y aplicaciones medioambiental apreciable. Se
de interés. denominan ditópicos, tritópicos,
En algunos casos, gracias tetratópicos, y en general politópicos,
a la habilidad de los ligandos para los que tienen tres, cuatro
agregar cationes metálicos, es posible o más grupos coordinantes,
formar centros polinucleares (clusters respectivamente. También se usan
metálicos) que presentan diferentes otros grupos funcionales como:
geometrías dependiendo de la fosfónico, sulfónico, fenólico, aminas,
cantidad de centros metálicos unidos azidas, etc., y en algunos casos ligandos
(figura 5.5, a). Estos módulos, que son mixtos, los cuales contienen uno o más
unidades secundarias de construcción grupos diferentes de los mencionados
(SBU, Secundary Bulding Units), (figura 5.5, b y c).
78

Figura 5.5. Algunos ejemplos de linkers
orgánicos: a) clusters o SBU; b) carboxilatos;
c) sulfonatos.
a)
b)
5.7. MOF para
almacenamiento de gases
Los materiales MOF constituyen una

nueva vía de gran interés para la

absorción y almacenamiento seguro
de gases combustibles en tanques de c)
vehículos para el transporte. En el caso
del almacenamiento de hidrógeno, se
llegan a alcanzar valores de superficie
específica (B.E.T.) mayores de
6.000 m2/g y capacidades de adsorción material absorbente, el cual ha logrado y posteriormente de los poros pequeños,
muy superiores a las de los materiales un porcentaje de absorción de H2 donde la interacción con las paredes de los
microporosos convencionales, como las superior a 7,5% a 70 bar de presión. Por poros es mayor.
zeolitas o los carbones activados, cuyos esta razón, el estudio de la interacción de Otra aplicación de gran interés es la
valores máximos aproximados en la las moléculas hidrógeno con las paredes absorción y almacenamiento de CO2,
saturación son, a 196 ºC, de un 2% internas de los poros y túneles de los para disminuir el impacto del aumento
y de un 5% en peso, respectivamente. MOF es de gran interés interés, y es por lo de este gas en la atmósfera y su
En todo caso, la afinidad de los MOF que se realizan experimentos de difracción consiguiente efecto invernadero. Los
por el hidrógeno debe mejorarse aún de rayos X y de dispersión inelástica de MOF de cinc e imidazol (llamados ZIF)
más para alcanzar los valores deseables neutrones durante los procesos de se comportan como jaulas colosales, que
de capacidad de adsorción de hidrógeno, adsorción y desorción de hidrógeno. Estos pueden ser utilizadas como depósitos
establecidos por el Departamento de experimentos indican que las moléculas de selectivos de dióxido de carbono. Por
Energía de los Estados Unidos (9% en hidrógeno se adsorben preferentemente en ejemplo, el ZIF-100 es capaz de
peso y 81 g/L) para 2015, para que sean las cavidades más pequeñas del material almacenar a 0 ºC hasta 28,2 litros de
competitivos a nivel comercial. antes que en las más grandes. Durante el CO2 por litro. Hay MOF flexibles,
Recientemente, Yaghi y colaboradores proceso de desorción, primero se suelta el susceptibles de ser utilizados como
han probado el MOF-177 como hidrógeno de los poros grandes esponjas selectivas para disolventes
79

Absorbente selectivo
Absorbente de hidrógeno Catalizador quiral

de disolventes
Figura 5.6. Tres redes cristalinas distintas para tres aplicaciones diferentes.
orgánicos y exhiben una elevada electrónico se pueden crear centros estructuras como en el de su aplicación.
capacidad de reconocimiento molecular. catalíticamente activos en diversos Dentro de las reacciones que han sido
Algunos (figura 5.6) muestran una alta tipos de reacciones orgánicas. Poseen probadas con diferentes compuestos tipo
capacidad de adsorción de acetonitrilo, características únicas; pueden actuar MOF se encuentran la cianosililación,
acetona y muy baja para disolventes como tamices moleculares, poseen condensaciones Knoevenagel,
aromáticos (benceno, tolueno), y nula selectividad de forma y pueden ser hidrogenaciones, oxidación de
para disolventes orgánicos alifáticos. funcionalizados postsíntesis. En estas moléculas orgánicas, acetalización,
Otros tienen canales hidrofóbicos y/o redes, se puede actuar también sobre el hidrodesulfuración, entre otras muchas
hidrofílicos que les hace muy buenos espaciador orgánico, funcionalizándolo más, tal como demostraron Corma
candidatos para la separación de mediante estrategias de síntesis orgánica y colaboradores.
contaminantes orgánicos del agua. convencional, lo que permite diseñar Estos catalizadores son excelentes
el material para aplicaciones específicas candidatos para realizar transformaciones
(figura 5.7). A pesar de sus características multietapa, especialmente cuando en
5.8. MOF como catalizadores favorables, las aplicaciones de los MOF cada fase se requieren sitios activos que
heterogéneos como catalizadores heterogéneos aún sean diferentes. Y en efecto, dado que en
siguen siendo minoritarias, por lo que los MOF existen multisitios
La catálisis es una de las aplicaciones es un campo en el que todavía hay un catalíticamente activos, que pueden
más importantes de los MOF, ya que gran trabajo por hacer, tanto desde el actuar cooperativamente o en diversas
variando el centro metálico y el entorno punto de vista del diseño de nuevas etapas, estos se están empezando a
80

CATALIZADORES MULTIFUNCIONALES PARA “QUÍMICA VERDE”
Naturaleza
Porosidad Fragancias:
del linker
síntesis de jasminaldehído,
melonal, etc.
Centros
Lewis
Industria farmacéutica,
síntesis orgánica
Centros
Brönsted
Industria petroquímica,
Centros
reacciones de
metálicos
hidrodesulfuración
Figura 5.7. Esquema de factores a tener en

utilizar en “catálisis multicomponente” o y se convierte en el producto deseado. cuenta al diseñar un catalizador según la
aplicación requerida.
en cascada, donde el producto resultante Cuando en la reacción las
es el reactivo de la reacción siguiente, y transformaciones se van produciendo
así sucesivamente sin detener el proceso consecutivamente, se da la reacción en
en cada paso. Pero se abren más cascada, esquematizada en la figura 5.8
posibilidades, como por ejemplo el como la caída de las fichas del dominó.
diseño de “imitadores de enzimas”, Hay ejemplos ilustrativos de cómo
cuyos entornos metálicos reproduzcan jugando con la síntesis se pueden
el sitio activo de las metaloproteínas para obtener, con los mismos componentes
la fabricación de biocomponentes y (conectores y linkers), distintos tipos
fármacos de alto valor añadido. En la estructurales dirigidos a diferentes
figura 5.8 se muestra esquemáticamente aplicaciones catalíticas. Este es el caso de
cómo el sustrato orgánico se aproxima a los MOF denominados LRH (Layered
los centros activos del MOF, que actúa Rare Earth Hydroxides) y de los RPF-5
como catalizador heterogéneo, reacciona (Rare-earth Polimeric Framework).
81

Catalizador
Catalizador
Figura 5.8. Izquierda: sustrato orgánico aproximándose a los centros activos del catalizador MOF. Derecha: ejemplo de reacción en cascada,
esquematizada por la caída de las fichas de dominó.
Ambos compuestos están formados por apilados, que son catalizadores muy con la estructura y dependen de los
tierras raras como conectores, y por el activos y selectivos para la oxidación de tipos de metales que los constituyen,
ligando 2,6 antraquinona (2,6-AQDS) sulfuros, mientras que los RPF-5, que distancias y ángulos entre ellos, vías de
(figura 5.5, c-4) como linker, sin tienen una estructura tridimensional con canje, interacciones π-π entre anillos
embargo, los dos poseen diferente más baja coordinación del metal y mayor aromáticos y formación de radicales,
conectividad y por lo tanto diferente carácter ácido, son buenos catalizadores entre otras. Por ejemplo, para que un
estructura (figura 5.9). Los LRH, de en reacciones de hidrodesulfurización MOF se comporte como un imán, es
fórmula [R4(OH)10(H2O)4]n An (R=rare- (figura 5.9). decir, para que aparezca el fenómeno
earth ions, A=intercalated organic anions), magnético cooperativo, se requiere de
descubiertos en 2008, son una nueva una interacción (acoplamiento) entre los
clase de materiales laminares muy 5.9. MOF y propiedades físicas spines de los cationes paramagnéticos en
relacionados estructuralmente con los la estructura. Las propiedades ópticas
LDH (Layered Double Hydroxide) de Al margen de las propiedades químicas generalmente son debidas a la presencia
estructura hidrotalquita, en los cuales la que muestran estos materiales, algunas de anillos aromáticos o conjugación
carga positiva de la lámina catiónica se de sus cualidades físicas son muy de enlaces en el espaciador orgánico
crea con cationes de tierras raras y prometedoras. Sus singularidades (que es fácilmente fluorescente) y/o a
grupos hidroxilo. Estas láminas alternan magnéticas y ópticas, o de conducción, la incorporación de lantánidos como
con aniones, creando materiales están directamente relacionadas centros metálicos, los cuales debido a su
82

Figura 5.9. Los mismos componentes, con
diferentes estructuras, para diferentes
O
reacciones catalíticas. S S O=S=O
H2O2
LRH Yb + 2,6 AQDS
configuración electrónica presentan la 7 bar H2

capacidad intrínseca de luminiscencia. 70 ºC
S
CH2
H2S +
H2C
5.10. MOF como conductores
eléctricos RPF-5
La preparación de materiales que

combinen alta movilidad de carga y alta
superficie específica presenta un gran
potencial para su aplicación en
dispositivos de almacenamiento de
energía, como por ejemplo en
supercondensadores. En general, los
MOF han sido poco estudiados como
conductores eléctricos debido a que en la
mayoría de los casos la estrategia de
formación ha consistido en la separación
de sus unidades de construcción
(conectores metálicos y espaciadores
orgánicos) con el objetivo de maximizar Figura 5.10. Estructura de RPF8 mostrando
el volumen de poro. Pero recientemente, y/o ligandos orgánicos que poseen la trayectoria de electrones (conductividad)
en 2012, Gándara, Uribe-Romo et al., en capacidad para ganar o perder electrones a lo largo de la dirección de apilamiento
de los anillos aromáticos (derecha).
el grupo de Yaghi, han demostrado que se y mostrar distintos estados de oxidación.
pueden preparar materiales que combinan En nuestro grupo, Gándara, Snejko et al.,
porosidad y conductividad eléctrica. En por una parte, y Medina et al., por otra,
estos casos, la conductividad se consigue han comprobado que bajo ciertas
gracias a la presencia de centros metálicos condiciones de síntesis se puede generar
83

el salto de ciertos iones a través de su
estructura rígida. Los conductores
iónicos actualmente tienen gran interés
como supercondensadores, baterías,
pilas de combustible y en varias clases de
sensores químicos.
Un conductor protónico es aquel
en el que el protón H+ es el ión que
salta en la estructura, es decir, es la
H3O2–
partícula que aporta la movilidad de
carga. Aunque el Nafion y los materiales
poliméricos han sido muy usados en
pilas de combustible que operan a bajas
temperaturas, es necesario el desarrollo

de nuevos conductores protónicos, con
una conductividad superior a 0,1 S cm-1
y que operen a un rango de temperatura
entre 25 y 300 ºC. De este modo se
aumenta la eficiencia de las células de
combustión. Pues bien, todos estos
Figura 5.11. Estructura en canales de un requerimientos los cumplen los MOF,
MOF de escandio, con la especie H3O2-, y y estabilizar un radical aniónico a través los cuales han abierto nuevas
los protones en el centro de los túneles
de la coordinación de un derivado oportunidades en este campo. Por lo
perpendiculares al plano de dibujo.
quinónico con elementos de las tierras general el material MOF es cristalino
raras, resultando en un material y por tanto se conoce su estructura a
conductor con altos valores de movilidad nivel atómico, lo que permite prever sus
de carga, 9 cm2 V−1 s−1 (figura 5.10). posibilidades, estudiando el camino y
mecanismo de la conducción, a la vez
que nos indica como diseñar otros
5.11. MOF como conductores nuevos cuyas estructuras mejoren esta
protónicos propiedad. Además, la posibilidad de
ajustar la estructura de estos materiales
Un conductor iónico es un electrolito nos proporciona un relativo control de
sólido, es decir, un material en el cual las propiedades como conductores
los iones tienen una alta movilidad. El protónicos, lo que nos llevaría al fin
fenómeno se basa en la posibilidad que último, al desarrollo de sensores y otros
tienen ciertos materiales de permitir dispositivos.
84

Un ejemplo de material que a la
vista de su estructura podría ser un buen
conductor protónico es un MOF de
escandio, de fórmula [Sc3(3,5-DSB)2
(μ-O2H3)(μ-OH)2(H2O)2], con una
estructura en túneles
monodimensionales en el centro de los
cuales se encuentran los protones
correspondientes a la especie H3O2-,
encontrada por primera vez en un MOF.
Estos protones están a 1,22 Å de sus
átomos de oxígeno correspondientes, y
la distancia entre ellos en principio
podría permitir el salto de los protones

en la dirección del túnel (figura 5.11).
Tal como demostraron en nuestro Eu0.05Tb0.09Gd0.86-DSB
equipo D’Vries, de la Peña-O’Shea et al.,
una vez medida la conductividad, y en
base a la estructura, esta se puede variar
o mejorar, introduciendo agua en los 80
canales, lo cual facilita el salto de
)
120
(K
50% Eu – DSB + 50%DSB-Na
160 ra
tu
protones, al crear puentes de conducción 200
ra
pe
240
400 500 600 700
m
entre los ya existentes en los túneles.

Te
Longitud de onda (nm)

Y también en nuestro grupo,
Gándara, Perles et al. nos ilustraron con Figura 5.12. Formación del MOF RPF-17,
otro ejemplo, el denominado LRH, al materiales sean buenos candidatos para evolución con la temperatura de su espectro
de emisión y diagrama de color.
que ya nos hemos referido como las membranas poliméricas cargadas con
catalizador, ya que se trata de un este material (figura 5.9).
material multifuncional. En su
estructura existe una red muy
importante de enlaces de hidrógeno 5.12. MOF en óptica
entre los grupos (OH)- y moléculas de
agua de la lámina catiónica inorgánica, La búsqueda de nuevos materiales con
y los protones de los grupos ácidos de las propiedades luminiscentes controlables,
moléculas orgánicas. A través de esta red para su aplicación en termometría, es
la posibilidad de movilidad protónica actualmente un campo de investigación
sería alta, lo que hace que estos muy activo. Los sensores de temperatura
85

Figura 5.13. Estructura de un MOF, o entramado
metal-orgánico, mostrando las cavidades
que genera su distribución espacial.
El diseño y síntesis de MOF con

luminiscencia sintonizable para
aplicaciones en dispositivos emisores de
luz y en pantallas, o para probar el
entorno local, la estructura y las especies

huéspedes, es un campo muy
prometedor, puesto que los MOF
ofrecen una variedad de características
como la síntesis dirigida, predicción de
estructuras y porosidad, procesabilidad
nanométrica y propiedades colaborativas
que permiten el desarrollo de materiales
multifuncionales. La obtención de MOF
con mezcla de diferentes lantánidos para
sintonizar la emisión de color está
recientemente desarrollándose en
algunos grupos. Un objetivo muy
reciente es el estudiar MOF
basados en la luminiscencia pueden Recientemente se ha dado un paso multimetales de lantánidos, para
superar algunas de las limitaciones hacia delante con la introducción de iluminación y termometría,
de los termómetros mecánicos y dos iones diferentes de tierras raras sintonizando el color y el rango de
eléctricos, mostrando buenas y para la obtención de termómetros temperatura óptimo no solo con los
rápidas respuestas, alta resolución con multicentros luminiscentes. La lantánidos, sino jugando también con la
espacial, precisión y no ser invasivos. emisión de cada uno de estos centros emisión del triplete del ligando, es decir,
Los termómetros luminiscentes sigue diferente comportamiento estudiando el efecto antena del linker.
están basados en el efecto de la térmico, y la correspondiente relación Un ejemplo aparecido recientemente en
caída de sus intensidades de emisión de intensidades puede ser muy la bibliografía, firmado por D’Vries,
cuando aumenta la temperatura. dependiente de la temperatura. Álvarez-García y algunos colaboradores
86

más de nuestro grupo, es el RPF-17, Building Blocks) formados por campo de investigación relativamente
formado por cationes de lantánidos multimetales es una vía importante para nuevo, en el que más de 4.000 estudios
(conectores) y aniones aplicaciones en iluminación y científicos han concluido que esta clase
3,5-disulfobenzato (3,5-DSB) (linkers), propiedades termométricas, lo que abre de “materiales milagro”, conocidos
figura 5.5, c-1, que ha demostrado tener una nueva vía de aplicación de estos genéricamente con el acrónimo
aplicación como termómetro óptico. Su materiales (figura 5.12). MOF, tienen un brillante futuro en
comportamiento está basado en la productos y tecnologías. Estas aplicaciones
dependencia de la temperatura del se extienden desde su utilidad para la
triplete de emisión del citado ligando 5.13. MOF, ¿materiales fabricación depósitos de hidrógeno para
(3,5-DSB), en la emisión Eu/Tb y en el milagro? vehículos hasta su uso para secuestro y
efecto drástico del Gd en el proceso de almacenamiento de dióxido de carbono
transferencia de energía. Parece probado En este capítulo se ha pretendido ilustrar (para disminuir el efecto invernadero), y
que la combinación de Gd, Eu y Tb en sobre el hecho de cómo la cristalografía son críticos para resolver algunos de los
un MOF con clusters o SBU (Secondary ha permitido el desarrollo de un mayores retos globales de siglo XXI.
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88

A Través Del Cristal Cómo La Cristalografía Ha Cambiado La Visión Del Mundo

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Martín Martínez-Ripoll, Juan A.

Hermoso y Armando Albert

“¿P or qué el agua hierve a 100 ºC y el

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el cáncer. De la estructura de enzimas,

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totalmente actuales, en donde la los procesos enzimáticos responsables

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2. Una historia con

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Figura 2.1. Muestras de

Figura 2.2. Johannes Kepler y copo

tamaño y capacidad de exfoliación. 2.2. 1611-1891: los cimientos

primeras ideas sobre el ordenamiento

A Kepler le siguieron otros estudiosos

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en donde concluyó la Licenciatura en

1872 (con 27 años) se trasladó con este a

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galardón, el primer Premio Nobel

2.4. 1912-1914: ¡se levanta

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Würzburg, regresando finalmente a

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Lawrence Bragg presentó la deducción de

de 1912, y cuyo contenido fue publicado 2θ

intensidad. Y es que las ondas difractadas

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siempre podemos movernos desde la Cristalógrafos

izquierda a la derecha de dicha

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Figura 2.13. Arthur Lindo Patterson y la función

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mostrando que los vectores entre átomos

cristalografía. La gran depresión

gracias a sus ahorros pudo entrar en el

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‘Andante’, con partitura en esta última institución, lugar en

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donde comenzó su tesis doctoral. Su mismo modo a como ocurrió con

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Miguel Vicente, titulados “La dama

creemos que hacen justicia a su persona

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Aunque lo sucedido durante los

cristalografía la base fundamental de sus

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cristalógrafos que, durante muchos años,

Patterson, abordando el problema

produjo en la década de 1980, como

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B0013 cristalizacion (FFF).indd 35 21/4/14 13:41:24

rotundo éxito durante casi 25 años hasta

permiten la detección simultánea de

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Figura 2.23. Cien años de imparable evolución

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B0013 cristalizacion (FFF).indd 39 21/4/14 13:41:28

Society A, 184: 64-83. [disponible en http://bit.ly/15WHBKr].