Irm Dillenseger 1

Perfectionnement en IRM
Vendredi 1er octobre 2010
Jean-Philippe DILLENSEGER
Enseignant - Section DTS IMRT
Lycée Jean Rostand de STRASBOURG
Le codage spatial
Les séquences
Le codage spatial en IRM
Vendredi 1er octobre 2010
Enseignant - Section DTS IMRT
Lycée Jean Rostand de STRASBOURG
Plan de la présentation
A Introduction / généralités
Domaine fréquentiel
B = Lien Domaine temporel <=> spatial
Gradients de champs magnétique

C = Lien Domaine temporel <=> fréquentiel
D Possibilités de codage spatial



Echo = signal de RMN émis par les protons d’hydrogène

suite à leur excitation par une onde RF
DTS IMRT - STRASBOURG
Ce
ta
Il existe différents types d’échos... prè
s-m
- Echos de spin idi
- Echos de gradients
- Echos stimulés
Echo de gradient
- ...
Echo de spin Echo stimulé
Ce
ta
... créés par différentes séquences .... prè
s-m
idi
Ce
ta
... créés par différentes séquences .... prè
s-m
idi
Ce
ta
... qui se distinguent par : prè
s-m
idi
- le type d’échos qu’elles créent
- leurs vitesses de création d’échos
- leurs possibilités de pondération
- leurs sensibilités aux artefacts
Ce
ta
... qui se distinguent par : prè
s-m
idi
- le type d’échos qu’elles créent
- leurs vitesses de création d’échos
- leurs possibilités de pondération
- leurs sensibilités aux artefacts
Chaque écho provient de l’ensemble du

volume soumis au champ magnétique B0
Pour créer des images, il est nécessaire de

d’imposer une origine spatiale aux échos (=
codage spatial) ...
... à l’aide d’ outils : les gradients de champs
... à l’aide d’ outils : les gradients de champs
Domaine temporel
Gradients
Le remplissage de l’espace de Fourier est
nécessaire pour obtenir une image IRM
Domaine fréquentiel Domaine spatial
Relation
mathématique
Domaine Domaine fréquentiel Domaine spatial

temporel
C B
Il existe différentes manières de remplir
l'espace de Fourier D
Le choix du type de remplissage est
indépendant du type d’écho utilisé
Echo de spin
Echo de gradient
Echo stimulé
Echo de spin
Echo de gradient
Echo stimulé
Echo de spin
Echo de gradient
Echo stimulé
Ce
ta Ce
prè ma
s-m tin
idi
Echo de spin
Echo de gradient
Echo stimulé


Lien Domaine temporel <=> spatial
B
s(t)
Domaine Temporel
LIEN ????
f(x,y,z)
Domaine spatial
B
s(t)
Domaine Temporel
Domaine Fréquentiel
f(x,y,z)
Domaine spatial
B
Domaine spatial réel Domaine Domaine Domaine spatial virtue

(= patient) temporel fréquentiel (= série de coupes)
f(x,y,z) s(t) F(kx,ky,kz) f(x,y,z)
B
Domaine fréquentiel Domaine spatial
B
Transformée de Fourier d’un signal à une dimension f(x)
f(x)
Tout signal peut être «éclaté» en un nombre infini de

fonctions trigonométriques (sin, cos)
B
Fréquences basses = allure générale

Fréquences hautes = détails
B
F(k)
(k)
Il est possible de classer l’ensemble de fonctions trigonométriques
d’un signal dans un domaine fréquentiel (= changement de variable)
B
f(x) F(k)
(k)
La transformée de Fourier est la relation mathématique

qui lie le domaine spatial f(x) au domaine fréquentiel F(k)
B
∞
f(x) Po
f(x) = ∫
-∞
F(k)e-2πik x dk
x
pu
ur
l
rist es
es
TDF TDF-1
∞
F(k)
F(k) = ∫
-∞
f(x)e-2πik x dx
x
k
B
Transformée de Fourier d’un signal à deux dimensions f(x,y)
Domaine spatial Domaine fréquentiel
TDF-1
f(x,y) F(kx,ky)
TDF
B
Transformée de Fourier d’un signal à deux dimensions f(x,y)
∞ ∞
f(x,y) = ∫∫ F
-∞
(kx,ky) e-2πi(kxx+ k y) dkxdky
y F(kx,ky) = ∫∫
-∞
f(x,y)e-2πi(k x+ k y) dxdy
Po
x y
ur
pu l
TDF rist es
es
f(x,y) F(kx,ky)
TDF-1
B
Propriétés de l’espace de Fourier
B
ky
ky
Hautes fréquences
kx
kx
Basses fréquences
B
Illustration P. CHOQUET / CHU Strasbourg
Centre de l’espace K Périphérie de l’espace K

=> contraste de l’image => détails de l’image


Lien Domaine temporel <=> fréquentiel
C Gradients de champs magnétique
Domaine Domaine
Domaine temporel Domaine
spatial fréquentiel spatial
L’usage de gradients est impératif en IRM = lien tps <=> fréquence
Domaine Domaine
Domaine temporel Domaine
spatial fréquentiel spatial
t
s(t) + application de
gradients de champs
dans 3 directions
Gradients de champs : représentation spatiale
Gradients de champs : représentation spatiale / temporelle
Gradients de champs : codage par la fréquence
Codage de
fréquence
Gradients de champs : codage par la phase
Codage de
phase
Gradients de champs : bilan des codages
Codage de Codage de
fréquence phase
a. Si application d’un gradient pendant les ondes RF
= codage de fréquence
L’écho renferme les informations d’une seule coupe ou tranche
(perpendiculaire à l’axe d’application)et non du volume complet
α α
Gradient
b. Si application d’un gradient pendant l’écho
α α
Gradient
Le signal mesuré au cours de la
lecture sera transféré directement
dans l’espace k en fonction de l’axe
d’application du gradient
Le signal mesuré au cours de la
lecture sera transféré directement
dans l’espace k en fonction de l’axe
d’application du gradient
k= (γ/2π).G.(t-TE)
γen MHz/T en s -1/T
G en T.m-1
t (instant) en s
kz en m-1 => Fréquence spatiale
Si t>TE => k >0

Si t<TE => k <0 Lien entre Echo et
espace K
c. Si application d’un gradient entre l’onde RF et l’écho.
= codage de phase
Le signal contiendra déjà, lors de sa lecture, un adressage fréquentiel le long de
l’axe d’application du gradient (de phase)
k= (γ/2π).G.T G en T.m-1
T (durée d’application) en s
α α
G
Gradient
T Si G>0 => k >0

Si G<0 => k <0
= codage de phase
Le signal contiendra déjà, lors de la lecture, un adressage fréquentiel le long de
α α
Gradient
Si G>0 => k >0

Si G<0 => k <0
= codage de phase
Le signal contiendra déjà, lors de la lecture, un adressage fréquentiel le long de
α α
Gradient
Si G>0 => k >0

Si G<0 => k <0
t
s(t) + application de
gradients de champs
dans 3 directions
k-théorème : Le signal RMN s(t) réceptionné est l’équivalent d’une

transformée de Fourier F du volume f(x,y,z) soumis à des gradients de
champs magnétiques.
s(t) = F{f(x,y,z)} (kx,ky,kz)
Selon le théorème k, l’obtention du volume f(x,y,z) en IRM impose le
remplissage de l’espace K selon ses coordonnées (kx,ky,kz)
TR = 1cycle n
cycle n-1 cycle n+1
α TE s(t) α
Gz
Gy
Gx
? ? ?
Cela nécessite la mise en place de 3 gradients de champs (Gx, Gy, Gz) à des
instants précis du cycle.


TR = 1cycle n
cycle n-1 cycle n+1
α TE s(t) α
Gz
Gy
Gx
? ? ?
Il existe plusieurs possibilités de codage du signal.
Possibilité 1 : Etude « voxel par voxel »
α α
Gz
Gy
Gx
α α
Gz
Gy
Gx
- Application simultanée de 3 gradients de champs lors de l’impulsion RF.

- 1 écho = 1 voxel du volume
- Il faut générer autant d’échos (cycles) que de voxels souhaités.
=> déplacement du patient / Gradients différents / RF différente
- Le passage par l’espace K n’est pas nécessaire
- Méthode longue, peu exploitée, abandonnée : DAMADIAN - FONAR 1977
- Application simultanée de 3 gradients de champs lors de l’impulsion RF.

- 1 écho = 1 voxel du volume
- Il faut générer autant d’échos (cycles) que de voxels souhaités.
=> déplacement du patient / Gradients différents / RF différente
- Le passage par l’espace K n’est pas nécessaire
- Méthode longue, peu exploitée, abandonnée : DAMADIAN - FONAR 1977
Possibilité 2 : Remplissage «radial» de l’espace-K
kx
ky
kx
TE
α α
Gz ky
Gy
changement à chaque cycle
Gx
- Sélection d’une coupe par codage de fréquence pendant RF.

- 1 coupe = espace k (TF2D)
- Gradient de fréquence en x et y lors de la lecture de l’écho :
γ γ
ky= ( /2π).Gy(t-TE) kx= ( /2π).Gx(t-TE)
- 1 écho = 1 ligne de l’espace k de la coupe
kx
ky
- Avantages : Bon contraste car passage systématique par le

centre de l’espace k / Pas de repliement car pas de codage en phase
- Inconvénients : Artéfacts en étoile / Utilisation de filtres
nécessaires pour combler les lacunes périphériques de remplissage
de l’espace k
- Utilisé en IRM cardiaque, IRM de diffusion / Séquences anti-mouvements (Propeller ....)
kx
ky
- Avantages : Bon contraste car passage systématique par le

centre de l’espace k / Pas de repliement car pas de codage en phase
- Inconvénients : Artéfacts en étoile / Utilisation de filtres
nécessaires pour combler les lacunes périphériques de remplissage
de l’espace k
- Utilisé en IRM cardiaque, IRM de diffusion / Séquences anti-mouvements (Propeller ....)
Possibilité 3 : Remplissage «linéaire» de l’espace-K
TE kx
α α
Gz
Gy
changement à chaque cycle ky
Gx
- Sélection d’une coupe par codage de fréquence pendant RF.

- 1 coupe = espace k (TF2D)
- 1 écho = 1 ligne de l’espace k de la coupe
- Gradient de codage de phase en y avant la lecture de l’écho
γ
ky= ( /2π).Gy.T
- Gradient de fréquence en x lors de la lecture de l’écho
γ
kx= ( /2π).Gx(t-TE)
Possibilité 3 : Remplissage «linéaire» de l’espace-K
kx
ky
- Technique la plus utilisée

- Séquences Echos de Spin, Echo de gradient, Echo de Spin rapide, ....
- Avantages : Pas d’artéfacts en étoile / accès à des pondérations pures
- Inconvénients : Coupes>1,5 mm par manque de signal => pas d’isotropie /
Artéfacts de repliement en y (lié au codage de phase)/ long si coupes fines
Possibilité 4 : Méthode d’ « écho planar »
TE kx
α
Gz
Gy
ky
Gx
- 1 écho = 1 espace K
- Remplissage de l’espace K par « aller-retour »
- Alternance rapide des gradients = Intensité sonore élevée
- Imagerie très rapide
- Artefacts de distorsion
- Exploitée en Imagerie de Diffusion, Perfusion, Fonctionnelle
- Artefacts de distorsion
- Exploitée en Imagerie de Diffusion, Perfusion, Fonctionnelle
Possibilité 5 : Remplissage élliptique
TE kx
α α
Gz
ky
Gy
Gx
- Remplissage de l’espace K en «spirale»

- remplissage en une fois ou en plusieurs étapes (= plusieurs échos)
- Imagerie rapide
- Très exploitée en Angio-IRM Gado
Possibilité 5 : Remplissage élliptique
TE
α α
Gz
Gy
Gx
- Remplissage de l’espace K en «spirale»

- remplissage en une fois ou en plusieurs étapes (= plusieurs échos)
- Imagerie rapide
- Très exploitée en Angio-IRM Gado
- Souvent exploitée en 3D = Acquisition volumique
Possibilité 6 : Acquisition «volumique»
TE ky
α α
Coupe épaisse (=volume)
Gz
changement à chaque cycle kx
Gy
Gx
- Acquisition d’un volume (ou d’une tranche épaisse) = 3D.

kz
- Espace k volumique (TF3D)
- 1 écho = 1 ligne de l’espace k (du volume)
- Gradient de codage de phase en y et en z avant la lecture de l’écho
γ
ky= ( /2π).Gy.T γ
kz= ( /2π).Gz.T
- Gradient de fréquence en x lors de la lecture de l’écho
γ
kx= ( /2π).Gx(t-TE)
Possibilité 6 : Acquisition «volumique»
ky
kx
kz
- Technique en devenir : Angio / Haut champ (3T)
- Nécessite des séquences très rapides : EGR, ESR et dérivées...
- Avantages : Pas d’artéfacts en étoile / Pas de filtres nécessaires / accès à des
coupes fines (<1mm) => isotropie
- Inconvénients : Acquisitions longues (>6min (hors angio)) / Nécessite un S/B
très élevé (3T) / difficultés d’obtentions de contrastes purs (T1, T2,..)
Axe d’avenir : méthode itérative
α TE s(t) α
Gz
Gy
changement à chaque cycle
Gx
- Obtention et exploitation de «projections» sur 360° (comme pour la méthode 2)

- Reconstruction par méthode itérative (idem TEP) = abandon de la méthode par rétroprojection filtrée
http://www.youtube.com/watch?v=uTOhDqhCKQs&feature=player_embedded
SIEMENS 2010 : EGR-T1 - Acquisition radiale -
Axe d’avenir : méthode itérative Reconstruction itérative - cadence : 30 images/sec
- Obtention et exploitation de «projections» sur 360° (comme pour la méthode 2)

- Reconstruction par méthode itérative (idem TEP) = abandon de la méthode par rétroprojection filtrée
- Nécessite moins de projections donc moins de temps ! Possibilité de reconstruire des coupes à
des temps t différents (30 images/sec).
- Pas d’artéfacts en étoile
- Exploitée pour les acquisitions en tps réel hors synchro !

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Vendredi 1er octobre 2010

Gradients de champs magnétique

D Possibilités de codage spatial

Gradients de champs magnétique

D Possibilités de codage spatial

Echo = signal de RMN émis par les protons d’hydrogène

Echo de spin Echo stimulé

Chaque écho provient de l’ensemble du

Pour créer des images, il est nécessaire de

... à l’aide d’ outils : les gradients de champs

... à l’aide d’ outils : les gradients de champs

Domaine Domaine fréquentiel Domaine spatial

Gradients de champs magnétique

D Possibilités de codage spatial

Domaine spatial réel Domaine Domaine Domaine spatial virtue

f(x,y,z) s(t) F(kx,ky,kz) f(x,y,z)

Domaine fréquentiel Domaine spatial

Tout signal peut être «éclaté» en un nombre infini de

Fréquences basses = allure générale

La transformée de Fourier est la relation mathématique

Domaine spatial Domaine fréquentiel

Centre de l’espace K Périphérie de l’espace K

Gradients de champs magnétique

D Possibilités de codage spatial

f(x,y,z) s(t) F(kx,ky,kz) f(x,y,z)

f(x,y,z) s(t) F(kx,ky,kz) f(x,y,z)

Si t>TE => k >0

T Si G>0 => k >0

Si G>0 => k >0

Si G>0 => k >0

f(x,y,z) s(t) F(kx,ky,kz) f(x,y,z)

k-théorème : Le signal RMN s(t) réceptionné est l’équivalent d’une

Gradients de champs magnétique

D Possibilités de codage spatial

- Application simultanée de 3 gradients de champs lors de l’impulsion RF.

- Application simultanée de 3 gradients de champs lors de l’impulsion RF.

- Sélection d’une coupe par codage de fréquence pendant RF.

- 1 écho = 1 ligne de l’espace k de la coupe

- Avantages : Bon contraste car passage systématique par le

- Avantages : Bon contraste car passage systématique par le

- Sélection d’une coupe par codage de fréquence pendant RF.

- Technique la plus utilisée

- Remplissage de l’espace K en «spirale»

- Remplissage de l’espace K en «spirale»

- Acquisition d’un volume (ou d’une tranche épaisse) = 3D.

- Obtention et exploitation de «projections» sur 360° (comme pour la méthode 2)

- Obtention et exploitation de «projections» sur 360° (comme pour la méthode 2)

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