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Universidad de Antioquia Andrés Felipe Jaramillo Taborda

Facultad de Ciencias Exactas y Naturales CC. 1033655355

Biología Taller #1

Genética General 12 de agosto de 2018

Desarrollo.

1. Las ADN polimerasas aparte de funcionar como polimerizadores de


desoxirribonucléotidos, también tienen actividad de exonucleasa, y pueden hidrolizar el
ADN en cualquier sentido. Esto es práctico para que aumente la fidelidad de la
replicación del ADN, puesto que además de seleccionar la base correcta para insertarla
en el nuevo ADN sintetizado, la polimerasa tiene como actividad la doble lectura para
corregir bases insertadas erróneamente, al instante. La doble lectura podría explicar el
porqué sólo sintetizan en dirección 5’-3’: la hidrólisis de un dNTP produce la energía
necesaria para unir éste desoxirribonucléotido a la cadena creciente de ADN. Si el ADN
se sintetizara en sentido contrario, se eliminaría la posibilidad de la doble lectura porque
la energía de polimerización tendría que obtenerse al escindir el grupo trifosfato del
nucléotido terminal recién incorporado al ADN y así al hacer la corrección se eliminaría
el nucléotido que porta la energía para seguir polimerizando la cadena.
2. Cuando una solución de ADN se calienta lo suficiente, el ADN de cadena doble se
desenrolla y los enlaces de hidrógeno que mantienen las dos cadenas juntas se debilitan
y finalmente se rompen. El proceso de romper el ADN de doble hebra en hebras simples
se conoce como desnaturalización del ADN. La temperatura a la que las hebras de ADN
están semidesnaturalizadas, es decir, mitad doble hebra, mitad hebra simple, se
denomina temperatura de melting (Tm).
Mientras que la proporción de G a C y de A a T en el ADN de un organismo es fija, el
contenido de GC (porcentaje de G +C) puede variar considerablemente de un ADN a
otro. El porcentaje de contenido de GC en el ADN tiene un efecto significativo en su
Tm. Debido a que los pares G-C forman tres enlaces de hidrógeno, mientras que los
pares A-T forman sólo dos, cuanto mayor es el porcentaje de contenido de GC, mayor
es su Tm. Así, un ADN de doble cadena rico en G y C necesita más energía para
romperse que uno rico en A y T, lo que significa una mayor temperatura de melting
(Tm).
3. El Riboswitch Cobalamina es un elemento regulatorio Cis (es decir, una región del
ADN no codificante que regula la transcripción de genes vecinos) ampliamente
distribuido en 5’-UTR de genes relacionados con la vitamina B12 (cobalamina), en
bacterias. Los riboswitches son dominios de unión de metabolitos dentro de ciertos
ARNm que funcionan como sensores de precisión para sus objetivos correspondientes.
Se produce un reordenamiento alostérico del ARNm cuando se une un ligando lo cual
resulta en la modulación de la expresión génica o en la traducción y producción de
proteínas. La cobalamina en forma de adenosilcobalamina reprime la expresión de
proteínas para la biosíntesis de la vitamina B12 a través de un mecanismo regulador
postranscripcional que implica la unión directa de ésta a las 5’-UTRs en genes de
interés, previniendo la unión de ribosomas y la traducción de esos genes.
4.

La única diferencia entre estos dos azúcares es la presencia, en la posición 2’, de un


grupo hidroxilo en la ribosa y su ausencia en la desoxirribosa. La desoxirribosa hace
parte del ADN y la ribosa hace parte del ARN.
5. Estos cuatro científicos descubrieron la estructura de doble hélice del ADN, lo cual
formó la base de la biotecnología moderna. Rosalind Franklin obtuve imágenes de ADN
usando cristalografía de rayos X, una idea planteada por primera vez por Maurice
Wilkins. No fueron sólo las imágenes de Franklin las que ayudaron a elucidar por
completo la estructura del ADN, sino que trabajos anteriores, como la creciente
evidencia de que era el ADN en los cromosomas era el responsable de la herencia; los
experimentos de Chargaff en donde se encontró que A=T y G=C; y el descubrimiento
de que algunas proteínas tenían forma de hélice, por Linus Pauling, permitieron a James
Watson y Francis Crick crear su famoso modelo de cadena doble, o doble hélice
6. Las ADN polimerasas son enzimas que sintetizan ADN a partir de
desoxirribonucléotidos. En los procariotas existen 3, denominados Pol I, Pol II y Pol
III. La Pol I está involucrada en la reparación por escisión con actividad de exonucleasa
de 3’-5’ y 5’-3’y en el procesamiento de fragmentos de Okazaki generados durante la
síntesis de la cadena aletargada. La Pol II tiene una actividad de exonucleasa de 3’-5’ y
participa en la reparación del ADN, el reinicio de la replicación para evitar daños y
puede ser un respaldo para la Pol III, ya que puede interactuar con proteínas
holoenzimáticas y asumir un alto nivel de procesividad. Se cree que su papel principal
es la capacidad de dirigir la actividad de la polimerasa en la horquilla de replicación.
Por último, la Pol III es la principal enzima implicada en la replicación del ADN.
7. Una Pfu polimerasa es una enzima termoestable de aproximadamente 92kDa aislada de
Pyrococcus furiosus. Cataliza la polimerización del ADN en la dirección 5’-3’, en
presencia de iones de magnesio. La enzima también exhibe actividad de exonucleasa de
3’-5’ (corrección de pruebas). Los errores en la replicación son inmediatamente
corregidos por esta enzima, lo cual es útil para reacciones de polimerización que
requieren de alta fidelidad. Funciona a 75°C. Su diferencia con la Taq polimerasa estriba
en que la Pfu es más termoestable y funciona mejor al corregir errores de inserción.
Además, la Pfu tiene la función de exonucleasa de 3’-5’ ya mencionada, mientras que
la Taq no. Por consiguiente, los fragmentos de las PCR generados por Pfu tendrán
menos errores que los fragmentos de PCR generados por Taq. Sin embargo la Pfu
funciona a una tasa de velocidad muy baja, comparada con la Taq.
8. Diferencias marcadas en los genomas:
PROCARIOTAS EUCARIOTAS
Un cromosoma circular Múltiples cromosomas lineales
ADN extra en plásmidos (ADN ADN extra en mitocondrias y bacterias
extracromosómico, con 4 o 5 genes)
Poco ADN, pocos genes, menos ADN Mucho ADN, muchos genes, mucho
no codificante ADN no codificante
ADN suelto sin formar cromatina ADN unido a proteínas histonas y
formando cromatina
Se encuentra en el citoplasma Contenido en un núcleo e incluye
(nucleoide) y no tiene intrones intrones.

9. Las proteínas que conforman los nucleosomas se llaman histonas. El ADN se envuelve
alrededor de este núcleo de proteínas. Específicamente, este núcleo está compuesto de
un octámero de histonas. Cada octámero de histonas está compuesto de dos copias de
cada una de las proteínas H2A, H2B, H3 y H4.
10. Las células eucariotas no pueden tener genomas circulares en su núcleo, dado que una
de sus características para denominarla “eucariota” es que tienen un núcleo verdadero,
en el cual el ADN está altamente empaquetado. Sin embargo, se ha postulado la Teoría
endosimbiótica como posible explicación del porqué en ciertas organelas como la
mitocondria y los cloroplastos existen genomas circulares, con las mismas
características de los procariotas (un solo cromosoma circular, replicación por fisión
binaria, ribosomas 70S, etc.). La teoría postula que una célula eucariota fagocitó estos
procariotas y esto resultó ser altamente benéfico para ambos organismos.
11. Podría pensarse que los intrones no especifican la síntesis de un producto de la célula,
aunque algunos sí codifican ARNs o proteínas funcionales. Además juegan papeles
importantes en la regulación de la expresión génica. Por ejemplo, la presencia de
intrones permite que los exones de un gen, se unan en distintas combinaciones, lo que
resulta en la síntesis de varias proteínas gracias a un mismo gen. Esto se da gracias al
proceso conocido como splicing, el cual permite que un repertorio de genes, en
eucariotas, puedan generar una amplia gama de proteínas y ARNs que superan en
número a la cantidad de genes. Esta es la ventaja del splicing en los eucariotas.

Referencias:

Respuesta #1: Cooper, G., & Hausman, R. (2013). The cell (6th ed., pp. 181-188).

Respuesta #2: Mandel, M., & Marmur, J. (1968). [109] Use of ultraviolet absorbance-
temperature profile for determining the guanine plus cytosine content of DNA. Methods In
Enzymology, 195-206. doi: 10.1016/0076-6879(67)12133-2

Respuesta #3: Nahvi, A., Sudarsan, N., Ebert, M., Zou, X., Brown, K., & Breaker, R. (2002).
Genetic Control by a Metabolite Binding mRNA. Chemistry & Biology, 9(9), 1043-1049.
doi: 10.1016/s1074-5521(02)00224-7

Respuesta #4: Ribose & Deoxyribose Sugars. (2018). Retrieved from


https://www.mun.ca/biology/scarr/iGen3_02-07.html

Respuesta #5: James Watson, Francis Crick, Maurice Wilkins, and Rosalind Franklin.
(2018). Retrieved from https://www.sciencehistory.org/historical-profile/james-watson-
francis-crick-maurice-wilkins-and-rosalind-franklin

Respuesta #6: Hübscher, U. (2010). DNA polymerases. Singapore: World Scientific.

Respuesta #7: Corporation, P. (2013). Pfu DNA Polymerase Product Information [Ebook].
USA. Retrieved from https://worldwide.promega.com/-
/media/files/resources/protocols/product-information-sheets/g/pfu-dna-polymerase-
protocol.pdf?la=en

Respuesta #8: Campbell, N., & Reece, J. (2007). Biología (7th ed., Chapter 18-19). Madrid,
España: Médica Panamericana.
Respuesta #9: nucleosome / nucleosomes | Learn Science at Scitable. (2018). Retrieved from
https://www.nature.com/scitable/definition/nucleosome-nucleosomes-30

Respuesta #10: Sagan L. On the origin of mitosing cells. J Theor Biol. 1967;14:225–274

Repuesta #11: Cooper, G., & Hausman, R. (2013). The cell (6th ed., pp. 266-272).

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