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ARBOR Ciencia, Pensamiento y Cultura

Vol. 190-768, julio-agosto 2014, a157 | ISSN-L: 0210-1963


doi: http://dx.doi.org/10.3989/arbor.2014.768n4011

BIOTECNOLOGÍA ESPAÑOLA / SPANISH BIOTECHNOLOGY

ACERCA DE LA BIOTECNOLOGÍA ENVIRONMENTAL


AMBIENTAL BIOTECHNOLOGY

Rafael Blasco Pla


Universidad de Extremadura
rblasco@unex.es

Francisco Castillo Rodríguez


biocastillo2@gmail.com

Cómo citar este artículo/Citation: Blasco Pla, R. y Castillo Copyright: © 2014 CSIC. Este es un artículo de acceso abierto
Rodríguez, F. (2014). “Acerca de la biotecnología ambiental”. distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons
Arbor, 190 (768): a157. doi: http://dx.doi.org/10.3989/ Attribution-Non Commercial (by-nc) Spain 3.0.
arbor.2014.768n4011

Recibido: 9 junio 2014. Aceptado: 14 julio 2014.

RESUMEN: La Biotecnología ambiental trata de corregir los ABSTRACT: The aim of environmental biotecnology is to correct
desequilibrios causados en el medio ambiente por activida- environmental imbalances caused by modern industrial
des industriales que alteran los ecosistemas naturales me- activities. Many of these imbalances affect biogeochemical
diante contaminación química o biológica y que también cycles in the biosphere, mainly catalysed by microorganisms.
afectan a los grandes ciclos biogeoquímicos en la biosfera, Deviations in the balances of carbon, nitrogen, sulphur and
mayoritariamente catalizados por seres vivos, entre los que iron compounds may cause very complex phenomena such as
los microrganismos juegan un papel esencial. Las desviacio- global warming, destruction of the ozone layer, environmental
nes en los balances de compuestos carbonados, nitrogena- pollution and acidification of the sea. On the other hand, the
dos y azufrados atmosféricos pueden causar fenómenos de poorly understood microbial interactions --either with each
gran complejidad como el calentamiento global, la destruc- other or the environment-- have important consequences
ción de la capa de ozono, la contaminación ambiental o la in generating highly recalcitrant chemical species which,
lluvia ácida. Por otra parte, las interacciones de los micro- accumulating in the trophic chains, are highly toxic for living
organismos entre sí y con el medio, desconocidas en su ma- organisms. To cope with these problems it is necessary to
yor parte, tiene importantes repercusiones en la generación improve knowledge of microbial ecology and the functioning
y persistencia de especies químicas que, depositadas en las of the biogeochemical cycles at the molecular level, although
cadenas tróficas, son altamente tóxicas para los organismos it is also worth designing technologies to eliminate pollutants
vivos. Para atajar estos problemas es necesario avanzar en el either in situ or ex situ, to avoid its uncontrolled production
conocimiento a nivel molecular de la ecología microbiana y as well as to correct the unbalancing processes affecting
del funcionamiento de los ciclos biogeoquímicos, aunque no phases of the biogeochemical cycles, either in the present
es menos necesario desarrollar tecnologías para la elimina- day or in the future.
ción de contaminantes industriales in situ y ex situ, evitar su
producción y utilización incontroladas así como corregir las
actuaciones desequilibrantes, actuales o futuras, de la bio-
geoquímica planetaria.

PALABRAS CLAVE: Biorremediación; ciclos biogeoquímicos; KEYWORDS: Biorremediation; biogeochemical cycles;


biocombustibles; célula de combustible microbiana; pilas biofuels; microbial fuel cells; bioelectrochemical cells.
bioelectroquímicas.
INTRODUCCIÓN mayor a menor importancia: pérdida de biodiversidad,
ciclos del nitrógeno y fósforo, cambio climático, acidi-
El término biotecnología es una miscelánea con el
ficación oceánica, calidad de las aguas continentales,
a157 denominador común de utilizar seres vivos, o parte
usos agrícolas, descarga de aerosoles en la atmósfera,
de ellos, para uso humano. De esta definición habría
capa de ozono atmosférica y contaminación química.
que excluir animales y plantas, tanto naturales como
Acerca de la biotecnología ambiental

Si se sobrepasan los valores admitidos como frontera,


mejoradas por métodos naturales de cruzamiento, ya
se pueden generar desequilibrios que pueden afectar
que en tal caso se trataría de la agricultura y la gana-
no solo a uno de tales procesos en sí, sino también
dería clásicas, cuya aparición hace 10.000 años cons-
a los demás dado que la mayoría de ellos presentan
tituyó la primera revolución verde. Se suele hablar
fuertes interrelaciones. Así, un desequilibrio en el ci-
de biotecnología de animales y plantas cuando estos
clo del nitrógeno afecta al balance entre las diferentes
han sido manipulados genéticamente. En el caso de
formas de este elemento en la naturaleza, pero tam-
los microorganismos, la biotecnología incluye tanto
bién a la calidad de las aguas, la contaminación quími-
cepas naturales como microorganismos manipulados
ca, la capa de ozono o la lluvia ácida. Para mantener
genéticamente, cuya utilización en bio-reactores se
estos procesos u otros que, aunque menos importan-
puede denominar también microbiología industrial,
tes a nivel global sí pueden serlo a nivel local, dentro
bioquímica industrial o ingeniería bioquímica/biotec-
de límites aceptables, es necesario conocerlos muy
nológica. Cuando los bio-reactores se emplean para
bien desde los puntos de vista microbiológico, bioquí-
eliminar residuos, la biotecnología está claramente al
mico, genético, evolutivo y ecológico, conocimiento
servicio del cuidado del medio ambiente, ya que evi-
que hoy por hoy es absolutamente insatisfactorio.
ta su contaminación. Además, en muchos casos, los
bioreactores proporcionan productos con un valor En el presente artículo, los autores pretenden dar
añadido que los hace sostenibles. Atendiendo al ser una visión actualizada de la biogeoquímica planetaria,
vivo objeto de la biotecnología se clasifica en biotec- haciendo hincapié en las etapas de la misma que se en-
nología de microorganismos, de animales o de plan- cuentran en desequilibrio o en fase de estarlo. Por otra
tas, casi siempre con el matiz de su mejora artificial parte, se examinarán las biotecnologías encaminadas a
con un fin concreto que se emplea para clasificar a la corregir estos desequilibrios y que abarcan desde ac-
biotecnología sobre la base de nombres o colores. Así, tuaciones directas sobre el medio ambiente al diseño
a la biotecnología sanitaria se le suele asignar el color de dispositivos de última generación como los que uti-
rojo, a la de los alimentos el amarillo, a la del mar el lizan microorganismos para generar electricidad o com-
azul, a la industrial el blanco, etc. (DaSilva, 2004). El bustibles como H2 o NH3, proceder a la eliminación de
color verde puede agrupar la biotecnología ambiental contaminantes in situ o ex situ, diseñar nuevos materia-
y la de plantas, aunque hay quien aplica el verde solo les basados en los nanocables y otras aplicaciones que
a las plantas relegando la biotecnología ambiental al entran dentro del campo de la Biotecnología, sin pre-
discreto gris. El uso de los colores se justifica en la ne- tender la exhaustividad que solo puede obtenerse me-
cesidad de clasificar y simplificar, de cara a la socie- diante una extensa monografía (Castillo et al., 2005).
dad, los usos de la biotecnología, aunque aumentar
el número de colores y matices puede ser contrapro- 1. CONCEPTOS FUNDAMENTALES
ducente y puede resultar confuso mezclar criterios
Si se puede definir la contaminación ambiental
a la hora de clasificar. Por ejemplo, a biotecnología
como el desequilibrio puntual ocasionado en un
microbiana se puede emplear tanto en la industria
determinado proceso natural, sea este un ciclo bio-
farmacéutica (rojo) como en la eliminación de conta-
geoquímico o un medio natural terrestre, acuático o
minantes (verde o gris), en la fabricación de alimentos
atmosférico, y la función de la Biotecnología ambien-
(amarillo), etc. En cuanto a la biotecnología ambien-
tal es corregir estos desequilibrios, parece eviden-
tal, el color adecuado sería el verde, junto con la de
te que es necesario que el biotecnólogo conozca en
plantas, porque la biotecnología de plantas, además
profundidad tanto los ciclos como los seres vivos que
de muchas otras aplicaciones, es clave en la biotecno-
operan en ellos y, en especial, los microorganismos,
logía ambiental.
principales catalizadores de la biogeoquímica plane-
Hasta ahora se han descrito nueve procesos ame- taria. En la actualidad, la genómica ambiental, y en es-
nazados de grave desequilibrio a nivel planetario, que pecial la metagenómica, ha revelado que se está muy
constituyen lo que se denominan Planetary Bounda- lejos de conocer en profundidad la biodiversidad mi-
ries y que se enumeran a continuación en orden de crobiana y solo con el uso de los meta-análisis genó-

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micos, físico-químicos y metabólicos, que se valen de etc. Estas tecnologías se han revelado más o menos
las técnicas ómicas (genómica y metagenómica, trans- eficaces en el tratamiento de problemas concretos de
criptómica, metabolómica, microbiómica, etc.), de la contaminación ambiental, como en el caso del vertido
bioinformática, la biología de sistemas y de las nuevas masivo de crudos y otros compuestos naturales. Sin a157

tecnologías de identificación in situ, está emergiendo embargo, algunos compuestos xenobióticos no son
fácilmente biodegradables. Es más, se ha demostra-

Rafael Blasco Pla y Francisco Castillo Rodríguez


una visión más adecuada y realista del problema (Si-
mon y Daniel, 2011). do que el metabolismo de algunos compuestos xeno-
bióticos por bacterias normalmente presentes en el
Los seres vivos son sistemas necesariamente abier- suelo puede producir compuestos más tóxicos que los
tos que requieren un aporte continuo de energía y de originales (Blasco et al., 1995). Resultados como este
materia. Los ciclos biogeoquímicos existen porque la justifican la construcción racional, por ingeniería ge-
cantidad de materia (elementos químicos) disponible nética, de nuevas cepas con rutas híbridas que eviten
para los seres vivos en la Tierra, sistema cerrado en la formación de intermediarios tóxicos, que podrían
la actualidad, es limitada, y por lo tanto es necesario ser dotadas de sistemas de autocontención para evi-
reutilizarla. La biodegradación de contaminantes, que tar su posible expansión (Munthali et al., 1996).
es quizá la parte más conocida de la biotecnología am-
biental, consiste en la utilización de microorganismos 2. LOS GRANDES CICLOS BIOGEOQUÍMICOS
para transformar los compuestos químicos en bioma-
sa microbiana, aunque a veces solo se transforman en 2.1. El ciclo del carbono
otros (cometabolismo). Por lo tanto, es necesario cono-
cer la formula empírica, o composición elemental, de la En la naturaleza, el carbono está en la atmósfera
biomasa para procurar que exista la relación adecuada, (0,7 teratoneladas, Tt o 1012 toneladas), los océanos
estequiométrica, de los diferentes elementos químicos (38 Tt), la litosfera (carbonatos 60.000 Tt, kerógeno
(C/N/P/S) y oligoelementos que permitan los procesos 14.000 Tt), la biosfera (2 Tt) y los combustibles fósi-
biodegradativos tanto in situ como ex situ. A la vez, los les (4 Tt). El carbono se encuentra en varios estados
intermediarios químicos de los ciclos biogeoquímicos de reducción, desde el más oxidado (+4) en el CO2
están conectados por reacciones catalizadas por micro- hasta el más reducido (-4) en el CH4 (Figura 1). Entre
organismos, cada una de las cuales suele consistir en estos dos estados extremos existen formas como el
un par de oxidorreducción (redox). Esta semi-reacción, CO, los fragmentos monocarbonados metenilo (=CH-
junto con otro par, debe completar una reacción redox ), metileno (=CH2), metilo (-CH3), formimino (-HC=NH)
que suministre la energía necesaria para el proceso vi- y formilo (-HC=O), intermediarios metabólicos en la
tal. En definitiva, también se trata de una cuestión ter- carboxidotrofia, la metanogénesis, la metanotrofia, el
modinámica ya que el proceso tiene que ser exergónico metabolismo de aminoácidos y la ruta del Acetil-CoA.
en su conjunto, pero puede ocurrir, como en el meta- Otros intermediarios metabólicos son los del catabo-
bolismo, que un determinado microorganismo viva a lismo y anabolismo de azúcares, lípidos, proteínas y
expensas de un proceso endergónico que solo es viable los miles de compuestos carbonados generados por
acoplado a otro muy exergónico, catalizado por otro u la factoría biosintética vegetal y microbiana y, en la
otros microorganismos. Este fenómeno, muy común actualidad, por la industria químico-farmacéutica. Las
en la naturaleza, se denomina sintrofia y su ubicuidad rutas metabólicas del fragmento monocarbonado son
natural hace que muchos microorganismos no sean fá- muy importantes en el ciclo del carbono y requieren
cilmente cultivables en el laboratorio. coenzimas comunes, como los folatos o la cobalamina
o más exóticas como la metanopterina, la coenzima
Para poder actuar sobre la contaminación ambien- M (2-mercaptoetanosulfonato), la coenzima B (fosfa-
tal se requiere el conocimiento de la ecología micro- to de 7-tioheptanoiltreonina), la F420 (5-deazaflavina)
biana, de los ciclos biogeoquímicos y de las limitacio- y la F430 (un anillo tetrapirrólico, muy reducido, con
nes tanto termodinámicas como estequiométricas de níquel, abundante en las arqueobacterias ANME que
sus etapas. Así se podrá actuar sobre el componente catalizan la oxidación anaeróbica de metano en sin-
cinético, constituido por los microorganismos que ca- trofia con la reducción de sulfato). Un grupo monocar-
talizan el proceso. La biotecnología puede incidir en
bonado no menos importante es el grupo carboxilo,
la disposición de consorcios microbianos de alta po-
donde el carbono posee un estado de oxidación de
tencia catabólica gracias a la sintrofia, la adición al
+4, muy abundante en los intermediarios metabólicos
medio de co-sustratos inocuos que faciliten la biode-
gradación al activar enzimas presentes en comunida- y absolutamente clave en la fijación biológica del CO2
des microbianas preexistentes pero en estado latente, ya sea fotosintética o no.

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Figura 1. El ciclo del carbono en la biosfera

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Acerca de la biotecnología ambiental

La línea de puntos separa las reacciones que tienen lugar en presencia de oxígeno (izquierda) de las que tienen lugar en anaerobiosis (dere-
cha). Los catalizadores de los ciclos están abreviados como mtf (metanotrofos y metilotrofos), ctf (carboxidotrofos), hac (homoacetógenos),
mtg (metanógenos), rs (reductores de sulfato)

El CO2, el CH4 y los CFC ejercen un fuerte efecto Si en un intervalo de décadas se quema la materia
invernadero, también debido a otros gases atmosfé- orgánica (metano, carbón y petróleo) que ha nece-
ricos como el N2O, el O3 y el propio vapor de agua, sitado tiempo a escala geológica para formarse, es
debido a que absorben la radiación de 4000-24000 evidente que se desequilibra el ciclo del carbono al
nm emitida por la superficie terrestre, lo que genera incrementar la concentración de CO2 atmosférico.
un calentamiento global del planeta. Este fenómeno, El efecto invernadero debido a este provoca un au-
previsto por Joseph Fourier en 1824, fue descubier- mento de la temperatura y una acidificación de los
to en 1860 por John Tyndall, estudiado cuantitativa- océanos, principal sumidero del CO2, de consecuen-
mente por Svante Arrhenius en 1896 y sacado a la luz cias imprevisibles. Cualquier actuación biotecnológi-
pública por Guy Stewart Callendar en 1960, el deno- ca para solucionar este problema mejoraría el medio
minado efecto Callendar, al que en principio achacó ambiente y por tanto se puede considerar parte de la
un efecto beneficioso y no perjudicial. Los estudios biotecnología ambiental.
paleoclimáticos han revelado episodios de cambio
El ciclo del carbono se puede re-equilibrar de va-
climático global, el denominado PEMT, aunque lento
rias maneras, la más evidente es utilizar combustibles
por ser debido a causas naturales como emisiones de
cuya materia orgánica provenga de la fijación de CO2
CH4 acumulado como hidrato en el manto terrestre
atmosférico, normalmente de la fotosíntesis. La que-
(Pancost et al., 2007). Por otra parte, el seguimiento
ma de madera ya se hacía en la era pre-industrial,
del clima desde épocas históricas hasta la actualidad
pero los biocombustibles son productos más elabora-
ha revelado que existe una tendencia al aumento de
dos, cuyo carbono procede también de la fotosíntesis.
temperatura, relativamente rápido en este caso por
El bioetanol y el biodiesel se utilizan actualmente por-
ser presuntamente debido a causas antropogénicas
que se pueden adaptar a los motores de combustión
(Pla y Catalan, 2005).
interna. El bioetanol procede de la destilación del al-
El desarrollo de la humanidad requiere un creci- cohol obtenido por fermentación de azúcares, mien-
miento exponencial de la demanda energética, en tras que el biodiesel procede de las grasas. El reto de
buena parte procedente de combustibles fósiles. la biotecnología en este campo es conseguir biocom-

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bustibles baratos a partir de materias primas que no drocarbonadas). En este caso, una vez desaparecidos
compitan con la alimentación humana. Así, el etanol el cosustrato y el contaminante, la comunidad micro-
se puede conseguir a partir de residuos lignocelulósi- biana volverá a su estado latente al cesar el estímulo
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cos de la agricultura (Weber et al., 2010) y el biodiesel (Semrau, 2011). La MMO parece estar también impli-
a partir microalgas (Pienkos et al., 2012). También se cada en la oxidación anaeróbica de metano por Me-

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pueden considerar biocombustibles otros compues- thylomirabilis oxyfera, proceso que ocurre en aguas
tos orgánicos producidos por los microorganismos dulces procedentes de medios agrícolas sobreabona-
como acetona, alcoholes, alcanos, isoprenoides, etc., dos acoplado a la reducción de NO2- a NO por la nitrito
y por supuesto el biogas, que es una mezcla gaseosa reductasa y a la dismutación de NO a N2 y O2 por la NO
de metano con otros compuestos. El biogas lo gene- dismutasa. En el medio marino, la oxidación anaeró-
ran los microorganismos mediante digestión anaeró- bica del metano está ligada a la reducción anaeróbica
bica de materia orgánica como residuos ganaderos o de SO42-, Fe2+ o Mn2+, posiblemente a través de la re-
productos agrícolas y se puede emplear para producir versión de la última etapa de la metanogénesis, lo que
electricidad (Lijó et al., 2014). Tanto los microorga- constituye un ejemplo extraordinario de confluencia
nismos como los compuestos químicos y los medios entre ciclos biogeoquímicos (Beal et al., 2009; Knittel
técnicos para producir estos se conocen desde hace y Boetius, 2009).
tiempo, quedando como un reto de la biotecnología
Otra fuente de desequilibrio carbonado es la pro-
ambiental explotar la biodiversidad microbiana y sus
ducción de alimentos. Aunque la luz que llega a la Tie-
nuevos productos (Timmis et al., 2014). El otro gran
rra desde el sol es de 1.37 kW m-2 (en total, 170 PW,
objetivo en este campo es mejorar por ingeniería ge-
1 petawatio = 1015 W), en promedio queda reducida
nética las capacidades de los microorganismos dispo-
a 342 W m-2 y dado que la atmósfera retiene la mitad
nibles, o generar otros nuevos, que permitan mejorar
de esa energía, llegan aproximadamente 150 W m-2 a
la eficiencia biotecnológica.
la superficie terrestre, de los que la fotosíntesis solo
La contaminación puntual de un sitio por el vertido es capaz de convertir en nutrientes vegetales menos
de materia orgánica desequilibra el ciclo del carbono del 2 %, eficiencia que disminuye enormemente por
en sentido contrario al del exceso de CO2 atmosférico. el coste de transformación del nutriente vegetal en
Cuando un petrolero vierte su contenido al mar hay carne de vacuno, con una eficiencia del 5%, o de ave,
que eliminar esa materia orgánica en el menor tiem- con una eficiencia del 15-20 %. Se ha calculado que se
po posible. En condiciones aeróbicas los microorga- necesitan, además, 10 unidades de energía fósil para
nismos pueden oxidar la materia orgánica formando producir una unidad de energía nutritiva, coste que en
CO2 y H2O (primer par redox del ciclo del carbono), USA alcanza el valor de 10 EJ al año (EJ, exajulio = 1018
siempre y cuando estos electrones se transfieran al J), el 10% del consumo energético total del país, que
O2, que se reduce a H2O (segundo par redox del ciclo en España disminuye hasta el 3% (Foley, 2011; Web- ����
del oxígeno), siendo el proceso exergónico en su con- ber, 2012). Como sería enormemente difícil aumentar
junto. Por tanto, en estas condiciones el contaminan- el rendimiento fotosintético, porque habría que ope-
te puede servir tanto como fuente de carbono como rar sobre un sistema metabólico muy complejo, pa-
de energía para determinados microorganismos. Es rece más razonable actuar sobre los costes de trans-
importante considerar el número de oxidación de la formación, procesado y transporte de alimentos así
fuente de carbono puesto que cuanto más reducida como disminuir la cantidad de desechos generados, el
esté más energía se puede extraer de ella. Además, es uso de plaguicidas y de abonos nitrógeno-fosforados,
necesario ajustar la reacción redox completa tenien- algo que cae dentro del ámbito de la biotecnología
do en cuenta la biomasa y el requerimiento de otros vegetal y microbiana, dentro de la llamada “Tercera
nutrientes. Conocido esto, es necesario modificar las Revolución Verde”, que implica el salto a los organis-
condiciones ambientales, o del medio de cultivo si se mos transgénicos.
actúa ex situ, para ajustarlas a las condiciones teóri-
Para paliar o evitar el calentamiento global se de-
cas, por ejemplo añadiendo una fuente utilizable de
ben considerar fuentes de energía alternativas a la fó-
nitrógeno, azufre o fósforo (bioestimulación) o una
sil, entre las que se encuentra la electricidad genera-
fuente de carbono o cosustrato (metano) que movi-
da por microorganismos. Las pilas de combustible son
lice una comunidad microbiana latente (metanotro-
una tecnología bastante desarrollada basada en que
fos), con una actividad enzimática (monooxigenasa
cualquier reacción redox se puede separar físicamen-
del metano, MMO) apropiada para la ruta catabólica
te en dos semirreacciones para producir electricidad
que se pretende activar (degradación de cadenas hi-

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(Figura 2). Los electrones de la corriente proceden de son los que utilizan oxidasas terminales de la cadena
la oxidación en el ánodo de uno de los pares redox y respiratoria para reducir aceptores como Fe3+ a Fe2+,
circulan a través del circuito hasta el cátodo para redu- los que transfieren electrones a otros organismos bien
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cir el otro componente. Si esto se consigue utilizando indirectamente mediante H2 o directamente median-
microorganismos como catalizadores se habrá cons- te apéndices conductores o, en tercer lugar, los que
Acerca de la biotecnología ambiental

truido una célula microbiana de combustible (MFC) transmiten señales eléctricas de quorum sensing.
(Logan et al., 2006). Dada la versatilidad metabólica
En una MFC, el potencial del ánodo (-0.2 V) está cer-
microbiana, se trata de producir electricidad queman-
ca del potencial del par donante de electrones CO2/
do cualquier tipo de materia orgánica, pero en vez de
CH2O (-0.3 V), pero la reacción de reducción catódica
hacerlo mediante una turbina de vapor, la electricidad
es fuertemente exergónica dado que el potencial re-
se genera directamente a partir de materia orgánica,
dox del par O2/H2O es + 0.82 V y el dispositivo genera
un proceso en teoría energéticamente mucho más
energía eléctrica.
eficiente. La clave está en los microorganismos que
catalizan el proceso y permiten, en principio, la uti- Producir electricidad en una depuradora de aguas
lización de cualquier fuente de carbono, incluidos los residuales es técnicamente posible y pronto puede
contaminantes. Los microorganismos capaces de ge- ser una realidad. Comparativamente, un humano
nerar corrientes eléctricas se llaman exoelectrogéni- adulto con un volumen de 0.1 m3 requiere para vi-
cos y entre ellos abundan las proteobacterias, además vir alrededor de 10.000 MJ por día, lo que equivale
de Firminutes, acidobacterias, cianobacterias y leva- al consumo continuo de una bombilla de 100 W. Es
duras. Pueden actuar solos o bien en comunidades decir, 1 m3 de biomasa humana consume aproxima-
sintróficas formando biopelículas en los electrodos damente 1 kW, mientras que la misma cantidad de
(Logan, 2009). Los microorganismos exolectrogénicos biomasa bacteriana, partiendo de un volumen de 0.5

Figura 2. Biocélula de combustible

El ánodo es un dispositivo de grafito cubierto por una película microbiana que oxida la materia orgánica y genera electrones que van hacia el
cátodo (que también se recubre de biomasa), donde tiene lugar la reducción del O2 a H2O. El proceso es exergónico porque la diferencia de
potencial entre el reductor y el oxidante es mayor de 1 V. El transporte de electrones en el ánodo está facilitado por contacto directo, nano-
cables bacterianos o mediadores bioquímicos.

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μm3 por célula, genera, en teoría, hasta 16 MW de tesis de bioplásticos y una gran variedad de sistemas
potencia eléctrica (Logan, 2009). Se ha calculado que de utilidad biotecnológica desde la biorremediación
la recuperación de la energía de las aguas residuales del cianuro generado en actividades mineras o indus-
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y la biomasa de desecho mediante MFC haría sos- triales, hasta el metabolismo del mercurio, los grupos
tenible el sistema de tratamiento de residuos de un nitroaromáticos o los furfurales. Esto indica la gran

Rafael Blasco Pla y Francisco Castillo Rodríguez


país occidental. El problema de las células de com- utilidad que sigue teniendo el aislamiento de bacte-
bustible microbianas surge de la complejidad en la rias por enriquecimiento selectivo y el gran futuro de
operación de las mismas y de las pérdidas de corrien- la secuenciación de genomas microbianos como base
te, para lo cual se puede aumentar el rendimiento de la biotecnología (Luque-Almagro et al., 2013). De
mediante la interposición de condensadores, que re- hecho, los datos metagenómicos serían muy difíciles
ducen la inversión de voltaje y estabilizan este cerca de interpretar si no se tuviese información funcional
de 1 V, máximo teórico posible (Kim et al., 2011), y/o previa de rutas metabólicas concretas y de genomas
el acoplamiento de la reacción redox con un proceso individuales.
de difusión de iones salinos (Logan, 2009).
Otra alternativa sería la producción de hidrógeno 2.2. El ciclo del nitrógeno
(y CO2) a partir de la materia orgánica mediante pilas El nitrógeno es un constituyente fundamental de
bioelectroquímicas. El hidrógeno podría transportarse los seres vivos al formar parte de proteínas, lípidos,
y utilizarse para el funcionamiento de cualquier dispo- azúcares, vitaminas y ácidos nucleicos. En las biomo-
sitivo movido por una célula de combustible conven- léculas su número de oxidación es -3 (R-NH2), mien-
cional. La descomposición (lisis) de la materia orgánica tras que la forma más abundante en la tierra es el
en H2 y CO2 requiere de la aplicación de un potencial N2 atmosférico químicamente muy poco reactivo. El
eléctrico externo, dado que se necesita dotar al ánodo nitrógeno puede adoptar prácticamente todos los
de un fuerte potencial oxidante (+0.5 V) para impul- estados de oxidación posibles desde -3 a +5, y en la
sar la reacción de oxidación del par redox CO2/CH2O figura 3 se muestran las reacciones más importantes
donante de electrones (-0.3 V) y permitir que los elec- de su ciclo, incluyendo algunos aportes humanos. El
trones sean transferidos al cátodo para reducir los H+ nitrógeno de los compuestos nitroaromáticos, como
a H2 (-0.42 V a pH 7). Evidentemente, la cantidad de el trinitrotolueno (R-NO2), se suele incorporar al ciclo
energía proporcionada por la posterior combustión en forma de nitrito, aunque también lo puede hacer
del hidrógeno debe ser mayor que la energía consu- en su forma amino. Sin embargo, en el cianuro y los
mida por la célula. La clave nuevamente estará en el cianuros orgánicos (nitrilos, R-CN) el nitrógeno ya se
componente biológico que cataliza el proceso y pue- encuentra reducido y los microorganismos lo asimilan
de permitir la utilización de infinidad de compuestos en forma de amonio. La cantidad de nitrógeno dis-
carbonados, incluidos compuestos contaminantes o ponible para el crecimiento las plantas es uno de los
subproductos orgánicos de cualquier tipo. En cuanto principales factores limitantes de la productividad de
al combustible producido en el cátodo puede ser des- las cosechas. La producción de fertilizantes mediante
de H2, hasta NH3 o incluso hidrazina, un combustible procesos derivados del de Haber-Bosch, constituyó,
utilizado para aviones, vehículos espaciales y cohetes, junto con la mejora genética, la segunda revolución
dependiendo del aceptor de electrones y del tipo de verde y ha permitido aumentar enormemente la pro-
microorganismo presente en el cátodo. ductividad de los cultivos al evitar el paso limitante
Una variante de las MFC potencia la capacidad mi- del ciclo, la fijación biológica de N2, que solo pueden
crobiana de generar electricidad con la electrodiálisis llevar a cabo algunos organismos muy especializados
inversa en un dispositivo llamado MRC utilizando car- como los rizobios. La producción y empleo de fertili-
bonato amónico como sal (Cusick et al., 2012). zantes es un parámetro empleado en la medida del
desarrollo de una sociedad. En la década de los se-
Otro tipo de tecnologías trata de transformar com- senta, el mayor empleo de fertilizantes tenía Jugar en
puestos carbonados de desecho, e incluso compues- los países desarrollados (75 kilogramos por hectárea),
tos tóxicos como el cianuro, en derivados policarbo- pero en 2006 Asia Oriental (incluida China) se puso a
nados que poseen muchas de las propiedades del la cabeza con un valor medio de unos 200 kilogramos
material plástico pero que por su procedencia bio- por hectárea, cifra que a menudo se multiplicaba por
lógica son biodegradables. Recientemente, se ha se- cinco en algunos lugares (Sutton y Bleeker, 2013). Con
cuenciado el genoma de una bacteria cianotrofa que el actual crecimiento económico y demográfico, para
posee una dotación génica completa para la biosín- el 2050 la FAO estima un aumento global de 70 por

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ciento de la liberación de nitrógeno al ambiente. Este mientos tienen una enorme repercusión en el cono-
nitrógeno reactivo causa un enorme desequilibro en cimiento del funcionamiento del ciclo del nitrógeno,
el ciclo de nitrógeno que está íntimamente ligado con pero también en el diseño de bio-reactores, ya que
a157
el resto de los ciclos. Existen extensas revisiones del las formas oxidadas de nitrógeno no solo sirven como
ciclo del nitrógeno y el tema también ha sido tratado comburente para materia orgánica, sino también de
Acerca de la biotecnología ambiental

ampliamente con anterioridad (Castillo et al., 2005), otras formas de nitrógeno como el amoniaco. En ter-
por lo que aquí solo se harán algunas puntualizacio- cer lugar, el ciclo del nitrógeno también puede ser
nes sobre el ciclo resumido en la Figura 3. En primer instructivo en cuanto a biocombustibles. El amonia-
lugar, las técnicas metagenómicas han permitido des- co (y la hidracina), junto con el hidrógeno molecular,
cubrir auténticas autopistas del ciclo del nitrógeno son los dos únicos bio-combustibles que no producen
que permanecían ocultas por insospechadas y por ser CO2. El objetivo de la biotecnología sería producirlos a
catalizadas por microorganismos desconocidos y no partir de fuentes de energía renovables, lo que quiere
cultivados hasta ahora. La primera de ellas es la ANA- decir a partir de la energía solar. Esta idea ya ha sido
MMOX (anaerobic ammonia oxidation), que puede explorada con anterioridad (Ramos et al., 1984) pero
movilizar casi el 50% de nitrógeno reactivo del mar. En quizá merezca la pena retomarla a la luz de las nuevas
segundo lugar se ha demostrado una reducción anae- tecnologías disponibles. Tampoco se ha de olvidar la
róbica del metano en la que el oxidante parece ser el biotecnología de otras reacciones del ciclo del nitró-
óxido nítrico a través de una dismutación intramole- geno, como la fijación simbiótica, asociativa o libre,
cular a nitrógeno molecular y oxígeno (Figura 3), que de N2 a NH4+.
actúa como oxidante final del metano. Estos descubri-

Figura 3. Visión actualizada del ciclo del nitrógeno en la biosfera

Cada proceso del ciclo está representado por un color. R-NH2 hace referencia al nitrógeno que forma parte de la biomasa (fundamentalmente
proteínas y ácidos nucleicos). R-NO2 y R-CN representa nitrógeno orgánico de origen antropogénico en forma de compuestos nitrados y cianu-
rados, respectivamente. Las flechas grises representan procesos biodegradativos que devuelven el nitrógeno al ciclo en los puntos indicados.

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La dinámica del nitrógeno atmosférico también 2.3. El ciclo del azufre/hierro
obedece a reacciones que implican la formación de
El ciclo natural del azufre es más complejo que el
especies reactivas a partir de fenómenos eléctricos en
del nitrógeno debido a mayor variedad de especies a157
la mesosfera, que se manifiestan en forma de figuras
químicas implicadas con estados de oxidación diferen-
luminosas o eventos luminosos transitorios (ELT) ob-
tes así como a su interconexión con los ciclos de meta-

Rafael Blasco Pla y Francisco Castillo Rodríguez


servables a simple vista y que se deben a electrones
les como el Fe y el Cu. El azufre es muy abundante en
libres atmosféricos cuya energía es proporcional al
la corteza terrestre como sulfuros metálicos (piritas) y
campo eléctrico reducido o cociente entre el campo
sulfato de calcio y magnesio, y especialmente en los
eléctrico E y la densidad de moléculas del aire (N)
océanos, donde existe como sulfatos inorgánicos (1
medido en townsend (10-21 V m2). A partir de un va-
mg L-1) y sulfuro de dimetilo, DMS, compuesto volátil
lor superior a 120 Td se produce lo que se denomina
responsable del olor marino característico y produci-
ruptura eléctrica del aire y los procesos de ionización
do a partir del propionato de dimetilsulfonio, principal
por impacto electrónico, que genera N2+, superan a
osmolito del fitoplancton. Anualmente, unas 45 Mt de
la captura disociativa de electrones, que produce O
DMS de origen bacteriano se oxidan fotoquímicamen-
+ O- (Luque y Gordillo-Vázquez, 2012). Estas especies
te en la atmósfera a sulfóxido de dimetilo (DMSO),
químicas, junto con las que se producen por fotólisis
sulfato de metilo y ácido sulfúrico, que actúan como
del N2O, como el O. y de este con el N2O y NO, con-
partículas de condensación en la formación de nubes
trolan la generación del HO., un potente oxidante del
(Castillo et al., 2005).
metano y de los óxidos de nitrógeno. El NO regula la
producción de ozono y su oxidación a NO2 acaba por Entre los procesos redox del ciclo del azufre so-
generar NO3-, un componente de la lluvia ácida (Cas- bresale la asimilación reductora de sulfato a sulfuro,
tillo et al., 2005). con sulfito como intermediario, un proceso llevado

Figura 4. El ciclo del azufre en la biosfera

La línea de puntos separa las reacciones que tienen lugar en presencia de oxígeno (izquierda) de las que tienen lugar en anaerobiosis (de-
recha). R-SH representa el azufre que forma parte de la biomasa. Las abreviaturas son as (asimilación), dsl (desulfurilación), oxq (oxidación
quimiolitotrófica), rs (reducción de sulfato), DMSO (sulfóxido de dimetilo), DMS (sulfuro de dimetilo), dsp (desproporción).

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a cabo por microorganismos y plantas y que, dado el rreducens, poseen un alto potencial biotecnológico en
potencial muy negativo del par SO42-/SO32-, requiere cuanto a procesos de biorremediación, biominería y
la activación del sulfato con ATP formando aceptores en la transferencia de electrones a los electrodos de
a157
de electrones como el Adenosín-fosfo-sulfato (APS) las células de combustible microbianas.
y Fosfo-adenosín-fosfo-sulfato (PAPS), el compuesto
Por su parte, el Fe2+ es oxidado en aerobiosis y en
Acerca de la biotecnología ambiental

biológico con mayor energía libre de hidrólisis, cuyo


medios ácidos por Thiobacillus, Leptospirillum y Sulfo-
potencial redox es cercano al de los reductores bioló-
lobus, muy abundantes en las escorrentías de las mi-
gicos. Posteriormente, el S2-, muy tóxico, se incorpo-
nas de carbón. Este proceso genera muy poca energía
ra como grupo sulfidrilo a la O-acetilserina para dar
porque el potencial del par Fe3+/Fe2+ a pH ácido es cer-
cisteína. En ambientes anaerobios, sobre todo mari-
cano al del par O2/H2O y se genera poco ATP por fosfo-
nos, las bacterias reductoras de sulfato llevan a cabo
rilación oxidativa. Además, es necesario oxidar gran-
la desulfuricación, o reducción respiratoria de SO42- a
des cantidades de Fe2+ para producir poder reductor
S2- con lactato, piruvato o acetato como donantes de
por transporte inverso de electrones, por lo que se
electrones utilizando preferentemente el isótopo 32S.
producen grandes cantidades de hidróxidos férricos
Otras bacterias anaerobias reducen 0S a S2- o dismu-
insolubles. Las bacterias oxidadoras de Fe2+ son acidó-
tan el S2O32- o el SO32- a SO42- y S2- mediante la enzi-
filos que utilizan el gradiente natural de H+ acoplado a
ma rodanasa. Por su parte, el DMS se puede reducir
la transferencia de electrones al O2 para generar ATP
a S2- o CH4 por metanógenos u oxidarse a DMSO por
y poder reductor. En anaerobiosis, las bacterias foto-
bacterias rojas fotosintéticas. Otras bacterias como E.
trofas oxidan Fe2+ y S2- para reducir CO2. Otros micro-
coli y Campylobacter utilizan el DMSO como aceptor
organismos, como la archaea termófila Ferroglobus,
de electrones respiratorio. El metabolismo del DMS es
acoplan la oxidación del Fe2+ a la reducción de NO3-
clave en la detección de productividad oceánica por
(Castillo et al., 2005).
las aves marinas y en la formación de nubes.
El conocimiento del papel de las bacterias en los
En cuanto a la oxidación microbiana de compues-
ciclos biogeoquímicos de los metales ha llevado a su
tos azufrados, los sulfuros se oxidan a 0S o SO42- me-
utilización para la extracción de estos mediante la
diante bacterias fototrópicas verdes o rojas, halófilas
biotecnología minera. En este proceso de biolixivia-
o desnitrificantes como Thiobacillus. En las fuentes
ción, bacterias como Thiobacillus ferrooxidans oxidan
hidrotermales submarinas, el S2- que acompaña a las
minerales sulfurados liberando Cu, Ag, U, Ra y otros
emanaciones de S0, H2, NH4+, NO2-, Fe2+, Mn2+, CH4 y
metales, junto con grandes cantidades de H2SO4. La
CO es captado por la hemoglobina del gusano Riftia
biotecnología del Uranio es doblemente interesante
que junto con el O2, es transportado a bacterias sim-
tanto por su extracción de menas pobres como de re-
bióticas del trofosoma, Thiovulum, que oxidan el S2- a
siduos nucleares. El inconveniente es el drenaje ácido
S0 generando ATP y poder reductor que fija CO2 a car-
de las minas, que contamina fuertemente los acuífe-
bohidratos utilizados por las células heterótrofas del
ros causando un grave problema ambiental, puesto de
gusano y también por las branquias de almejas y me-
manifiesto recientemente en la catástrofe de la balsa
jillones presentes en este ecosistema independiente
de la empresa Boliden en la zona de Aznalcóllar, en
de la luz solar.
la Sierra Norte de Sevilla, España, que comprometió
En cuanto al hierro, es uno de los elementos más gravemente el equilibrio ecológico del Parque nacio-
abundantes en la corteza terrestre, bien en la forma nal de Doñana. Los estudios metagenómicos de aguas
Fe2+ o en la Fe3+, junto con el Fe0 producto de la acti- procedentes del drenaje ácido de minas, han revelado
vidad humana. En ambientes anóxicos predomina la una enorme complejidad de microorganismos y rutas
forma soluble Fe2+, mientras que en aerobiosis abun- metabólicas implicadas (Handelsman, 2004). No cabe
da Fe3+ en forma de hidróxidos insolubles de los que duda de que los microorganismos juegan un papel
las plantas o los microorganismos extraen hierro me- clave en los ciclos biogeoquímicos de los metales, sin
diante sideróforos y complejos sistemas de transpor- embargo, en lo referente al tratamiento de metales
te. En la naturaleza, el Fe3+ de la goetita o la hematita in situ las plantas pueden tener una ventaja sobre
es reducido por microorganismos como Geobacter aquéllos. Los microorganismos pueden cambiar el
que oxidan H2, S2- o S0 y también compuestos orgáni- estado de oxidación de los metales, haciéndolos más
cos que contaminan acuíferos ricos en Fe3+. Estos mi- o menos bio-disponibles, y también acumularlos ac-
croorganismos poseen una reductasa férrica asociada tuando como un filtro, pero no eliminarlos del suelo.
a la membrana y, como sucede con Geobacter sulfu- Sin embargo, las plantas los pueden extraer del suelo

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incorporándolos a su biomasa utilizando la luz como conectadas por canales tubulares periplásmicos. Se
fuente de energía. Por el contrario las plantas pueden piensa que este tipo de conductores podría ser utili-
parecer en principio inútiles en el tratamiento de la zados para eliminar el H2S, un gas muy tóxico, o para
a157
contaminación del suelo por compuestos orgánicos, facilitar la transferencia de electrones en los electro-
ya que al ser autótrofas utilizan el carbono oxidado de dos de las células microbianas de combustible (Pfeffer

Rafael Blasco Pla y Francisco Castillo Rodríguez


la atmósfera. Sin embargo las plantas contribuyen a la et al., 2012).
biodiversidad y vitalidad de los microorganismos del
suelo y con ello a la biodegradación de compuestos 3. LLUVIA ÁCIDA Y CAPA DE OZONO
orgánicos contaminantes, ya que producen exudados
Durante el metabolismo microbiano se producen
que, además de mantener a los microorganismos,
emisiones de SO2, SH2 y (CH3)s=S. Las erupciones
en ocasiones actúan como sustratos cometabólicos
volcánicas e hidrotérmicas también contribuyen al
en la biodegradación de contaminantes. Es decir, las
aumento del azufre atmosférico (20 x 1012 g año),
plantas son bioestimulantes de la biodegracación de
mayoritariamente como SO2 que acaba formando
contaminantes orgánicos. A este proceso, junto con
H2SO4 en un proceso catalizado por el radical HO. y
la eliminación de metales, se suele denominar fito-
el peróxido de hidrógeno. Los óxidos de nitrógeno
rremediación, para distinguirla de la biodegradación
producidos durante la desnitrificación N2O y NO se
mediante microorganismos.
emiten a la atmósfera donde acaban como NO2, que
Un proceso de interconexión entre ciclos biogeoquí- también se forma como subproducto de la oxidación
micos puesto de manifiesto recientemente relaciona del N2 mediante fenómenos eléctricos. Al final, el NO2
los ciclos del azufre y del hierro con la generación acaba formando HNO3 por un proceso similar al que
de metil-mercurio, una potente neurotoxina que se forma H2CO3 a partir del CO2. La combustión de car-
acumula en la cadena trófica de diferentes medios bón o petróleo o la tostación de sulfuros minerales
naturales (Fleming et al., 2006; Gilmour et al., 2011). pueden provocar la formación de SO2 mientras los ga-
La correlación positiva entre la producción de metil- ses nitrogenados proceden mayoritariamente de los
mercurio y la actividad de bacterias reductoras de motores de combustión de automóviles. Para evitar
SO42- y Fe3+ tiene una base molecular consistente en estas emisiones solo queda, además de intentar eli-
la presencia de los genes hgcA, que codifica una pro- minar estos elementos en un proceso biotecnológico
teína con un grupo prostético corrinoide, y hgcB, que previo a su combustión (García et al., 2007), limitar el
codifica una proteína con 2 centros 4Fe4S, necesarias consumo de combustibles fósiles y el empleo de fuen-
para la metilación del mercurio en Desulfovibrio des- tes de energía alternativas, como la solar o la eólica.
ulfuricans ND 132 y Geobacter sulfurreducens PCA También sería necesario limitar el aporte de óxidos de
(Parks et al., 2013). La metanogénesis también está nitrógeno y azufre operando sobre los ciclos de estos
relacionada con la producción de metilmercurio, am- elementos, racionalizando el uso de fertilizantes nitro-
pliando la interconexión entre ciclos biogeoquímicos y genados y evitando las interferencias con el ciclo del
los problemas de contaminación ambiental (Hamelin azufre en la naturaleza.
et al., 2011).
Por otra parte, tanto los óxidos de nitrógeno como
En los sedimentos marinos se produce la transfe- los derivados fluororocarbonados, el radical HO., los
rencia directa de electrones entre microorganismos halógenos, los óxidos de nitrógeno y los aerosoles de
que forman un filamento de varios cm de longitud y sulfato reaccionan con el ozono atmosférico, provo-
que une las reacciones de la capa anóxica más pro- cando el adelgazamiento de la capa de este gas que
funda, donde se oxida el S2- a S, con capas anóxicas filtra la radiación UV y protege la vida de los organis-
superiores donde se reducen iones metálicos (hierro mos terrestres. En este sentido, la operación sobre los
y manganeso) y nitrato, que a su vez transfieren los excesos antropogénicos en los ciclos del nitrógeno y
electrones a microorganismos aeróbicos que utilizan del azufre también podría generar cambios impor-
O2 como aceptor. En términos comparativos, la distan- tantes en la gestión de la capa de ozono. Estas ope-
cia recorrida por los electrones equivaldría a 20 km raciones de macroingeniería atmosférica tampoco
para un ser humano (Nielsen et al., 2010). Las bac- caen fuera del ámbito de la biotecnología ambiental,
terias implicadas son de la familia Desulfobulbaceae aunque rozando ya el área de la tecnología informá-
que forman largos filamentos conductores con células tica para el estudio, manejo y previsión de sistemas
complejos (Castillo et al., 2005).

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