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Abstracto
Introducción
figura 3
Análisis SAXS de especies monoméricas y oligoméricas de α-sinucleína ( a )
curvas SAXS a partir de α-sinucleína 175 μM incubadas a 37 ° C en ausencia
(símbolos rojos) o presencia (símbolos negros) de doxiciclina 250 μM a las 0
h ( a ) , 2 h ( b ), 16 h ( c ) y 24 h ( d ). Funciones de distribución de distancia
correspondientes p (r) en ausencia ( e ) o en presencia de doxiciclina ( f ): 0 h
(línea oscura); 2 h (línea roja), 16 h (línea azul) y 24 h (línea magenta).
Los espectros infrarrojos, en la región amida I (1,700-1,600 cm -1 ), son
particularmente sensibles a la conformación de la cadena principal de las proteínas,
lo que permite discriminar la composición relativa de los elementos estructurales
secundarios . Con el fin de realizar un análisis comparativo entre α-sinucleína en
ruta y oligómeros fuera de ruta, la proteína se incubó en presencia o en ausencia de
doxiciclina y se tomaron alícuotas a intervalos regulares para la recolección de
espectros infrarrojos. Al comienzo de la incubación, las muestras son claramente
muy similares y sugieren que el contenido estructural es comparable
independientemente de la presencia de Después del proceso de autodesconvolución
de Fourier, la amida I muestra un contorno centrado en 1.649 cm -1eso es típico de
una proteína desplegada . Sin embargo, después de 2 h de incubación ), los
oligómeros fuera de camino reflejan un mayor contenido de estructura secundaria
ordenada, como lo revela la disminución en la banda FTIR a 1.641 cm -1
Figura 4
Discusión
Métodos
Preparación de α-sinucleína
La expresión y purificación de a-sinucleína humana recombinante se realizó como
se describió previamente 55 . La pureza de la proteína se evaluó mediante SDS-
PAGE. Se prepararon soluciones madre monoméricas de \ alpha - sinucleína en
HEPES 20 mM, NaCl 150 mM, pH 7,4. Antes de las mediciones, las soluciones de
proteínas se filtraron y centrifugaron durante 30 minutos a 12,000 x g . La
concentración de proteína se determinó midiendo la absorbancia a 280 nm
utilizando el coeficiente de extinción ε 275 = 5600 cm -1 M -1 .
Agregación de proteínas
El protocolo de agregación fue adaptado de estudios previos 56 . Las soluciones
monoméricas de α-sinucleína (70 μM) en HEPES 20 mM, NaCl 150 mM, pH 7,4,
se incubaron en un Thermomixer comfort (Eppendorf) a 37 ° C bajo agitación
orbital a 700 rev./min en ausencia o en presencia de 100 μM de doxiciclina.
Prueba de tioflavina T
La formación de la estructura β cruzada durante la agregación fue seguida por la
adición de la sonda fluorescente de tioflavina T (ThT) en alícuotas extraídas de la
mezcla de incubación en diferentes momentos, de acuerdo con LeVine 22 . Los
cambios en los espectros de emisión de fluorescencia con la longitud de onda de
excitación ajustada a 450 nm se controlaron usando un espectrómetro de PC1 ISS
(Champaign, IL).
Bis-ANS
La α-sinucleína se agregó tal como se describió anteriormente en ausencia o
presencia de doxiciclina. Se tomaron alícuotas a tiempo regular y se añadió bis-
ANS a una concentración final de 5 μM. Bis-ANS se excitó a 395 nm, y la emisión
de fluorescencia se recogió de 410 a 610 nm.
SAXS
Los datos de dispersión de rayos X de ángulo pequeño (SAXS) de α-sinucleína 175
μM, en ausencia o presencia de doxiciclina se obtuvieron en la línea de luz SAXS1
en el Laboratorio Nacional de Luz Síncrotron(LNLS, Campinas, Brasil). La
longitud de onda de la radiación se ajustó a 0.148 nm y se usó un detector Pilatus
300 para registrar los patrones de dispersión. La distancia entre la muestra y el
detector se estableció en ~ 1000 mm, lo que nos permitió explorar un vector de
dispersión mínimo de 0,10 nm -1 , donde q es la magnitud de la dispersión q -vector
definido por q = (4π / λ ) sin θ ( siendo 2θel ángulo de dispersión). De esta forma,
la distancia máxima de partículas accesible desde nuestra configuración
experimental fue de alrededor de 60 nm. Las muestras se establecieron entre dos
ventanas de mica y un espaciador de 1 mm, manipuladas en un portamuestras
líquido colocado perpendicularmente a la viga entrante. Las curvas obtenidas se
normalizaron teniendo en cuenta la disminución de la intensidad del haz de rayos
X durante el experimento. La curva de dispersión de la solución tampón se restó de
las curvas SAXS de la muestra, teniendo en cuenta la atenuación de cada
muestra. Todas las mediciones se tomaron a temperatura ambiente.
NMR
Todos los espectros de RMN se registraron en un espectrómetro Avance III Bruker
600 MHz usando un enfriado criogénicamente de triple resonancia 1 H ( 13 C / 15 N)
sonda TCI. Los experimentos 1D 1 H y 2D 1 H- 15 N SOFAST-HMQC (banda
selectiva optimizada del ángulo corto de transición) se registraron a 15 ° C en
muestras disueltas en tampón Hepes 20 mM a pH 7,4 en presencia de NaCl 150 mM
y 10 % D 2 O. Los espectros SOFAST-HMQC se adquirieron con los siguientes
parámetros: 32 escaneos, 30 ms de retraso de reciclado, 1 K y 256 incrementos y
SW de 16 y 26 ppm en las dimensiones 1 H y 15 N, respectivamente. Después de la
adquisición, los espectros fueron llenos a cero a 4 K ( 1 H) y 2 K ( 15N), procesados
con apodización de la campana sinusoidal y corrección de la línea base.
Espectroscopia infrarroja
Se recogieron muestras a 280 μM de α-sinucleína en ausencia o presencia de 400
μM de doxiciclina en tampón 20 mM HEPES, 150 mM NaCl, pD 7.0, D 2 O después
de 0, 2 y 16 h de incubación orbital a 37 ° C . Dado que la α-sinucleína monomérica
era más alta que la especie oligomérica, después de la incubación se separó
parcialmente del monómero usando un filtro de corte Amicon Ultra-0.5 de 100 kDa
y se ensambló en una celda termostatizada entre dos ventanas CaF 2 con una
longitud de ruta de 50 nm . Los espectros se registraron en un espectrómetro Nicolet
5700 equipado con un detector DTGS (Thermo Nicolet, Madison, WI) como se
describió previamente 29 . La cámara de muestra se purgó permanentemente con
aire seco. Los espectros se generaron promediando 256 interferogramas recogidos
con una resolución nominal de 2 cm -1 y apodized con una función de Happ-
Genzel. La contribución de D 2 O en la región amida I 'se eliminó restando los
espectros del tampón de la solución a la misma temperatura para obtener una línea
de base plana entre 1.900 y 1.700 cm -1 . La sustracción del disolvente, la
deconvolución, la determinación de la posición de la banda y el ajuste de la curva
de la banda de amida I original se realizaron tal como se describe 29 . El error en la
determinación del análisis estructural de FTIR a partir de la banda de amida I de
diferentes ejecuciones es del 3%.
Información Adicional
Nota del editor: Springer Nature permanece neutral con respecto a los reclamos
jurisdiccionales en mapas publicados y afiliaciones institucionales.
Referencias
1. 1.
Duda, JE , Lee, VM y Trojanowski, JQ Neuropatología de los agregados de
sinucleína . J Neurosci Res 61 , 121 - 127 (2000).
2. 2.
3. 3
4. 4
5. 5
6. 6
Expresiones de gratitud
Agradecemos al Laboratorio Nacional de Sincrotrón de Luz (Campinas, SP, Brasil)
por el uso de las instalaciones de línea de haz SAXS. También agradecemos al Dr.
Patrick P. Michel y al Institut du Cerveau et de la Moelle Epinière (ICM) por
permitirnos usar Cell Culture and Cell Image Platforms. Este trabajo fue apoyado
por subvenciones de FAPESP / CONICET (2014 / 50766-2), PIP-CONICET 0183,
PICT-MINCyT 2012-2882 y PIUNT-UNT D542 / 1.FGL recibió una beca del
Programa Bec.Ar de la Jefatura de Gabinete de Ministros de Argentina y CAMPUS
FRANCE. LRSB y RI están patrocinados por becas de investigación brasileñas del
CNPq (Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Technológico).
Afiliaciones
1. Instituto Superior de Investigaciones Biológicas (INSIBIO), CCT-
Tucumán e Instituto de Química Biológica Dr. Bernabé Bloj (CONICET-
UNT), Chacabuco 461 (T4000ILI) Tucumán, Argentina
o Florencia González-Lizárraga
o , Sergio B. Socías
o , César L. Ávila
o , Clarisa M. Torres-Bugeau
o Y Rosana N. Chehín
2. Institut National De La Santé et De La Recherche Médicale, U 1127,
CNRS, Unité Mixte De Recherche (UMR) 7225, Sorbonne Universités,
UPMC Univ Paris 06, UMR S 1127, Institut Du Cerveau Y De La Moelle
Epinière, ICM, París, Francia
o Florencia González-Lizárraga
o , Julia E. Sepúlveda-Díaz
o Y Rita Raisman-Vozari
3. Instituto de Física de la Universidad de São Paulo - IFUSP, Rua do
Matão, Travessa R, 187, São Paulo, Brasil
o Leandro RS Barbosa
o & Rosangela Itri
4. Laboratorio Max Planck de Biología Estructural, Química y Biofísica
Molecular de Rosario (MPLbioR, UNR-MPIbpC) e Instituto de
Investigaciones para el Descubrimiento de Fármacos de Rosario
(IIDEFAR, UNR-CONICET), Universidad Nacional de Rosario, Ocampo
y Esmeralda, S2002LRK Rosario , Argentina
o Andres Binolfi
o Y Claudio O. Fernandez
5. Departamento de Morfología, Fisiología y Estomatología, Facultad de
Odontología de Ribeirão Preto, Universidad de São Paulo, Brasil, Centro
de Investigación Interdisciplinaria en Neurociencias Aplicadas
(NAPNA), Universidad de São Paulo, Brasil
o Elaine Del-Bel
6. Laboratoire Croissance, Réparation et Régénération Tissulaires
(CRRET), CNRS ERL 9215, Université Paris Est Créteil, Université Paris
Est, F-94000, Créteil, Francia
o Dulce Papy-Garcia
Contribuciones
FGL, SBS y CMTB diseñaron y realizaron técnicas de fluorescencia. AB, CLA y
COF diseñaron y realizaron un experimento de RMN. LRSB, CLA y RI diseñaron
y realizaron el experimento SAXS. FGL y RNCh. realizó experimentos FTIR y
TEM. FGL, SBS y JESD diseñaron y realizaron ensayos de cultivo celular. DPG y
EDB contribuyeron al diseño experimental. RRV y RNCh. concibió y supervisó la
investigación. Todos los autores contribuyeron a la discusión y participaron en la
edición del manuscrito final.
Conflicto de intereses
Los autores declaran no tener intereses financieros en competencia.
Autores correspondientes
Correspondencia con Rita Raisman-Vozari o Rosana N. Chehín .