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THÈMES À EXPLORER
18-08-26 A.BENFEDDA
3. La respiration cellulaire
3.1. Respiration aérobie
3.2. Réaction globale du glucose et bilan d’énergie
3.3. Le cycle de Krebs
3.4. La fermentation alcoolique et lactique.
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1ÈRE PARTIE
STRUCTURES DE BASE DES ÊTRES VIVANTS
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1. Les deux types de cellules
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q Cellule Eucaryote (après noyau): cellule possédant des organites
dans son cytoplasme.
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Classification biologique contemporaine
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2. L’anatomie d’une cellule eucaryote
La cellule est une unité vivante qui a sa vie propre, c'est-à-dire qui a sa
propre homéostasie (biochimie), mais en même temps doit répondre
aux besoins de l'organisme, c'est-à-dire doit être réceptive.
Les cellules sont caractérisées par leur membrane, leur noyau et leur
cytoplasme (plasma parce que, initialement, les structures autres que le
noyau et le contour cellulaire n'étaient pas visibles).
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L’anatomie d’une cellule
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2.1. Les organites dans le cytoplasme.
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Le noyau (organite de synthèse)
ü localisation et réplication
de l'information génétique (ADN),
ü synthèse des ARN (ARNm), ARNt)
et (ARNr).
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La mitochondrie (organite de Synthèse).
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Le Réticulum Endoplasmique (RE) (organite de Synthèse).
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L'appareil de Golgi (organite de Synthèse).
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Le ribosome (organite de Synthèse): est un énorme complexe
ribonucléoprotéique permettant la traduction des ARNm en protéines.
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Le lysosome ( organite de dégradation): C’est l’estomac de la cellule
ü dégradation des nucléotides, des protéines, des lipides et des
polysaccharides.
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Les vacuoles (organite de transport chez les cellules végétales):
ü Contiennent de l’eau et d’autre substances
ü Utilisées pour stocker ou transporter les molécules.
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Le cytosquelette (organite de structure):
ü Rôle dans la mobilité cellulaire (cils et flagelles)
ü Charpente de la cellule (maintien de sa forme)
ü résistance aux agressions physiques,
ü forme cellulaire, contraction musculaire.
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2.2 La membrane plasmique
Les cellules sont entourées par la membrane plasmique qui est
essentiellement une barrière indispensable entre le cytoplasme et le
milieu extracellulaire.
La membrane plasmique est un film très fin constitué de molécules
protéiques (50% de la masse) et lipidiques (également 50% ).
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Évaluation formative.: Questions à choix multiple.
1. Je suis l'organite qui stocke la matière que la cellule n'utilise pas immédiatement.
Le noyau
La vacuole
Le réticulum endoplasmique
La cytoplasme
2. Cet organite est gélatineux et baigne les autres organites cellulaires.
Le noyau
La vacuoles
Le réticulum endoplasmique
Le cytoplasme
3. Cet organite est le centre de contrôle de la cellule. Il possède l'ADN.
Le noyau
La vacuole
Le réticulum endoplasmique
Le cytoplasme
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Évaluation formative.: Questions à choix multiple/suite
4. La mitochondrie est:
Le centre de contrôle de la cellule.
Responsable de la structure de la cellule.
Responsable de la production d'énergie de la cellule.
Le lieu de la photosynthèse chez la cellule végétale.
5. Les organites qui ne sont pas présentes chez les cellules animales sont :
Les vacuoles et les mitochondries
Les chloroplastes et les mitochondries
Les mitochondries et les ribosomes
Aucunes de ces réponses
6 . Les chloroplastes sont vertes grâce au :
Cytoplasme
Chlorophylle
Mitochondries
Membranes
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Évaluation formative.: Questions à choix multiple/suite
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Correction du QCM:
1. Je suis l'organite qui stocke la matière que la cellule n'utilise pas immédiatement.
La vacuole
2. Cet organite est gélatineux et baigne les autres organites cellulaires.
Le cytoplasme
3. Cet organite est le centre de contrôle de la cellule. Il possède l'ADN.
Le noyau
4. La mitochondrie est:
Responsable de la production d'énergie de la cellule.
5. Les organites qui ne sont pas présentes chez les cellules animales sont :
Aucunes de ces réponses
6 . Les chloroplastes sont vertes grâce au :
Chlorophylle
7. Réseaux de tubes qui transportent les nutriments dans la cellule.
Réticulum endoplasmique.
8 .Le site de la photosynthèse :
Le chloroplaste
9 .La cellule absorbe les nutriments et sécrète les déchets grâce :
à la membrane cellulaire
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3. La Bactérie:
3.1. définition
La taille d’une bactérie varie entre 1 à 10 µm. Le poids d’une bactérie est
d’environ 10-12 g. Elle contient 70% d’eau. Rapporté au poids sec, une
bactérie est constituée de protéines (55%), de lipides (10%), de
lipopolysaccharides (3%), de peptidoglycane (3%), de ribosomes (40%),
d’ARN (20%) et d’ADN (3%).
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3.2 les microorganismes hétérotrophes:
Se nourrissent de molécules organiques pour assurer leur développement.
Celles-ci servent en partie comme matériaux pour la synthèse de leurs
propres composés organiques (source de carbone) et en partie de carburant,
l’oxydation de ce dernier fournit l’énergie nécessaire à leur fonctionnement.
Cette catégorie de cellule est de loin la plus utilisée dans les bioprocédés
industriels. Les levures, les moisissures, les champignons
supérieurs et les cellules animales, sont des hétérotrophes.
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Exemples de bactéries hétérotrophes:
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Bactérie staphylococcus sp:
ü Espèces pathogènes: microbes responsables de maladies ( tuberculose, la
coqueluche, la typhoïde, le choléra, le tétanos, la diphtérie.
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Bactérie streptomyces sp:
ü Espèces pathogènes: microbes responsables de maladies ( tuberculose, la
coqueluche, la typhoïde, le choléra, le tétanos, la diphtérie.
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Bactérie bifidobactérium:
ü Espèces utiles: bactéries qui forment notre indispensable flore intestinale, qui
fermentent le yaourt, produisent le vinaigre ou décomposent les feuilles
mortes et les cadavres à la surface de la terre et dans toutes les eaux du globe.
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Exemple de bactérie autotrophe:
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Évaluation formative
1. Légender la cellule suivante:
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2. Questions à choix multiples.
La cellule :
a. constitue une unité commune uniquement aux eucaryotes
b. constitue une unité structurale mais non fonctionnelle
c. échange de la matière mais pas d’énergie avec son environnement
d. présente une organisation structurale et fonctionnelle commune chez tous les êtres vivants
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2ÈME PARTIE
MÉTABOLISME ET NUTRITION MICROBIENNE
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I. Introduction
Pour assurer sa croissance ou sa survie, un microorganisme doit trouver
dans son environnement de quoi satisfaire ses besoins nutritifs: sources
d’énergie, de carbone, d'azote, etc...
2. Le métabolisme
C’est l'ensemble des réactions biochimiques mises en jeu par un organisme
pour permettre sa croissance (voir diapo suivant).
Les réactions métaboliques peuvent être classées en deux catégories:
- celles qui produisent de l’énergie: catabolisme.
- celles qui consomment de l’énergie: anabolisme ou biosynthèse.
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On définit deux types d’énergie:
(ATP)
(GTP: coenzyme: Guanosine Triphosphates)
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Synthèse et Utilisation de l’ATP
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3. La respiration cellulaire: la dégradation du glycose
La respiration cellulaire est une réaction chimique d'oxydo-
réduction qui fournit l'énergie nécessaire à une cellule pour
fonctionner.
Une espèce chimique (atome, molécule, ion) qui capte un ou
plusieurs électrons est un oxydant.
Une espèce chimique qui donne un ou plusieurs électrons est un
réducteur.
Quand un réducteur perd des électrons, il s'oxyde.
Quand un oxydant capte des électrons, il se réduit.
Exemple:
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3.1. Respiration aérobie
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3.2. La réaction globale du glucose
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ü le cycle de Krebs où l’acétyl-CoA est dégradé en CO2 qui produit de
l'ATP, du NADH + H+ et du FADH2 (Coenzyme Q réduite).
ü les électrons aboutissent sur l'oxygène (O2) qui est réduit et s'associe
à des protons pour produire de l’eau.
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Processus global de la respiration cellulaire
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Glycolyse
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ü Le NAD+ est une forme oxydée, il a une charge + puisqu'il a un
électron de moins.
ü Le NAD+ capte les électrons et l'hydrogène du glucose grâce à des
enzymes qui s'appellent des déshydrogénases.
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ü Chaque NADH formé pendant la respiration cellulaire représente une
petite réserve d'énergie.
Le NADH est seulement riche en énergie mais il ne la stocke pas. Il
"donnera", plus tard au cours de la respiration cellulaire, son énergie à
l'ATP.
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La Glycolyse: Phase investissement de l’énergie
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La Glycolyse: phase libération de l’énergie
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Bilan de la glycolyse
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Le pyruvate produit dans le cytosol lors de la glycolyse entre dans la
mitochondrie par transport actif. Il y est transformé en acétyl-coenzyme A
par trois enzymes. La première réaction biochimique retire la fonction
carboxyle et libère une molécule de CO2. La seconde réaction transfert
des électrons au NAD+ qui devient du NADH + H+. La troisième étape
ajoute un coenzyme A qui rend l'acétyl-CoA très réactif. L'acétyl-CoA
alimentera le cycle de Krebs.
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le Cycle de Krebs
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Transport d’électrons et chimiosmose
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LA FERMENTATION
ü En l’absence de dioxygène, plusieurs types de cellules font appel à la
fermentation pour produire de l’ATP par phosphorylation au niveau du
substrat. L’acétaldéhyde (fermentation alcoolique) et le pyruvate
(fermentation lactique) servent d’accepteurs d’électrons dans l’oxydation
du NADH + H+ en NAD+.
Le NAD+ peut être employé de nouveau pendant la glycolyse. (a) L’éthanol
et (b) le lactate, la forme ionisée de l’acide lactique, sont deux des
principaux produits de la fermentation.
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Il existe plusieurs types de fermentation, notamment la fermentation
alcoolique et la fermentation lactique. Ils se distinguent par les sous-
produits formés à partir du pyruvate.
La fermentation alcoolique:
le pyruvate est converti en éthanol, en deux étapes.
Dans la première étape, du dioxyde de carbone est enlevé au pyruvate ;
celui-ci devient de l’acétaldéhyde, un composé à deux atomes de carbone.
Au cours de la seconde étape, le NADH + H+ réduit l’acétaldéhyde en
éthanol, régénérant ainsi le NAD+ nécessaire à la glycolyse.
Beaucoup de bactéries réalisent la fermentation alcoolique dans des
conditions anaérobies.
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Les levures (qui appartiennent au règne des Eucaryotes) peuvent également
réaliser la fermentation alcoolique. Depuis des milliers d'années, les
humains utilisent des levures pour fabriquer de la bière, du vin et du pain.
Outre l'alcool, les levures produisent du CO2, sous forme de bulles qui
s’accumulent dans la pâte et font lever le pain, ou qui engendrent
l’effervescence de vins comme le champagne.
la fermentation lactique :
Le pyruvate se fait réduire directement par le NADH+ , H+ : du lactate est
ainsi formé sans libération de dioxyde de carbone.
(Le lactate est la forme ionisée de l’acide lactique.)
Dans l’industrie laitière, la fermentation lactique due à des levures et à des
bactéries donne des fromages et du yogourt.
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LE MICROSCOPE OPTIQUE
(PHOTONIQUE)
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1. Introduction
Le microscope optique est un instrument d'optique muni d'un système objectif
et d'un système habituellement binoculaire qui permet de grossir l'image d'un
objet de petites dimensions (ce qui caractérise son grossissement) et de séparer
les détails de cette image (et son pouvoir de résolution) afin qu'il soit observable
par l'œil humain.
Il est utilisé en biologie cellulaire, pour observer les cellules, les tissus, en
pétrographie pour reconnaître les roches, en métallurgie et en métallographie
pour examiner la structure d'un métal ou d'un alliage. Il comprend des parties
mécaniques d'une très grande précision et des optiques tout aussi fragiles.
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2. Parties composantes du microscope :
A. Parties mécaniques
[1]. La potence
[2]. Pied ou socle
[3]. Platine
[4]. Vis macrométrique
[5]. Vis micrométrique
[6]. Vis de déplacement avant-arrière
[7]. Vis de déplacement latéral
[8]. Vis du condenseur
(déplacements haut-bas)
B. Parties optiques
[9]. Oculaire
[10]. Port-oculaire
[11]. Revolver
[12]. Objectifs
[13]. Préparation (lame)
[14]. Condenseur
[15]. Diaphragme
[16]. Lampe
[17]. Interrupteur
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3. Utilisation du microscope optique:
- Placer correctement le microscope devant soi, travailler assis, les coudes posés sur
la table.
- Vérifier que le petit objectif (x10) est en place et bien enclenché.
- Allumer l’éclairage.
- Placer la préparation microscopique (lame) sur la platine; positionner l’objet à
étudier dans le cône de lumière. La lame se glisse sur la platine, comprise par les
valets, de telle façon que la partie que nous désirons observer, soit au dessus et
placée au milieu du trou central.
- Faire la mise au point grossière en tournant la vis macrométrique puis ajuster
finement avec la vis micrométrique.
- Dans la préparation microscopique, rechercher puis centrer une zone favorable à
l’observation demandée.
- Adapter l’intensité de la lumière en jouant sur la commande du diaphragme.
- Passer à un grossissement supérieur si nécessaire: sans descendre la platine ;
tourner la tourelle revolver avec précaution (surtout avec le gros objectif x40)
jusqu'à encliqueter l’objectif. Retoucher la mise au point: pour les objectifs x20 et
x40, n’utiliser que la vis micrométrique pour ne pas casser lame et lamelle !
- A chaque changement de grossissement, refaire le centrage de la préparation et le
réglage de la lumière.
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Exercice d’application.
Légendez le schéma du microscope suivant:
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