Universidad de Chile

Departamento de Química orgánica y Fisicoquímica.

Química Orgánica.

Prof. Eduardo Arturo Soto Bustamante

•K.Peter C. Volhardt, “Organic Chemistry” W.H.Freeman and Co. New York, 1987
•Andrew Streitwieser Jr., Clayton H. Heathoock. “Introduction to Orgaanic Chemistry”
Macmillan Publishing Co. Inc. N.Y. 1976

Aminoácidos (AA): Constituyentes esenciales de las

proteínas.

Formados por átomos de C, H, O, N y algunos con S.

Biológicamente son nutrientes que forman la base
estructural de las proteínas.

Poseen un centro quiral en posición 2 o carbono alfa.

En general poseen conformación (S).

Su identidad la define el grupo R.

Su estructura es similar a la de los azucares.

PROYECCIONES DE FISCHER
C2; Cα

COOH COOH COOH

H2N
HO H H2 N H H2 N H
CH2OH R
COOH
R
R
H S

Existen AA esenciales (son 20) y no

esenciales
Tipos de estructuras : Definición del grupo R.

Grupos alifáticos.

Grupos conteniendo hidroxilos.

Grupos conteniendo amina.

Grupos conteniendo Mercapto sulfuros

Grupos conteniendo ácidos carboxílicos
 COOH
H2N H

R AMINOÁCIDO Código pKa (-COOH) pKa (-NH2) pKa (otro)

-H Glicina Gli 2,4 9,8

CON GRUPOS ALIFATICOS

-CH3 Alanina Ala 2,4 9,9
-CH(CH3)2 Valina Val 2,3 9,7
-CH2CH(CH3)2 Leucina Leu 2,3 9,7
-CH(CH3)CH2-CH3 Isoleucina Iso 2,3 9,7
-CH2-(C6H5) Fenilalanina Fen 2,6 9,2
O
NH+
O *Prolina Pro 2,0 10,6

CON HIDROXILOS
-CH2OH Serina Ser 2,2 9,4
-CH(CH3)OH Treonina Tre 2,1 9,1
-CH2-(C6H5)-OH Tirosina Tir 2,2 9,1 10,1

H
N

N N
COOH
H

H2N H

CON AMINO
-CH2-CO-CH2 Asparagina Asp 2,0 8,8
-CH2-CH2-CO-NH2 Glutamina Glu 2,2 9,1
-(CH2)4-NH2 Lisina Lis 2,2 9,2 10,8
-( CH2)3NH-(C=NH)-NH2 Arginina Arg 1,8 9,0 13,2

Triptofano Trp 2,4 9,4

N
H

H
N
Histidina His 1,8 9,2 6,1

CON MERCAPTO SULUROS

-CH2-SH Cisteína Cis 1,9 10,3 8,4
-CH2-CH2-S-CH3 Metionina Met 2,2 9,3
CON ÁCIDOS CARBOXÌLICOS
-CH2-COOH Ácido asparágino Asp 2,0 10,0 3,9
-CH2-CH2-COOH Ácido glutamino Glu 2,1 10,0 4,3
*Al estado de Clorhidrato
PRECIO DE AMINOÁCIDOS EN USD POR 100 G
*Al estado de Clorhidrato

AMINOÁCIDO S R RACEMATO
Glicina (F) 3.6
Alanina 21 235 6
Valina 15 215 9
Leucina 12 420 27.5
Isoleucina 52 4.150 22.5
Metionina 15 245 1.5
Prolina 40 4.250 345
Fenilalanina 22 280 20
Triptofano 47 290 30
Serina 66 830 29
Teronina 47 138 51
Cisteína 35 12.400* 550*
Tirosina 10 700 40
Asparagina 23 110 45
Glutamina 13 1380 210
Ácido asparágino 10 100 5.5
Ácido glutamino (F) 5.5 325 42
Lisina 5.5* 690* 14*
Arginina 12 3.900* 505*
Histidina 23 305* 83*

I. Reacción de Hell-Volhard-Zelinsky.

II. Alquilación de esteres amino malónicos

N-Substituidos (Síntesis de Gabriel)

III. Síntesis de Strecker.

IV. Otros métodos

Carl Magnus Von Hell: 1849-1926, Profesor U. de

Stutgart

Jacob Volhard: 1834-1910, Profesor U. de Halle

Nicolai Zelinsky: 1861-1953, Profesor U. de Moscú.

El compuesto A puede formar distintos α-amonoácidos
racémicos por reacción con R-X o compuestos
carbonilicos α-β no saturados.
VARIANTE: Uso del Dietil-N-Etanoil-2-Amino Propandioato

OBTENCIÓN.

Ejemplos:

Adolf Strecker: 1822-1871,químico alemán Profesoor U. de Würzburg

RX de HCN con aldehidos.

Variantes: uso de una imina.


Heterociclos: Prolina.

Esterificaciones: Metanol, etanol o alcohol bencílico.

El éster se separa como clorhidrato por recristalización.

Preparación de ésteres bencílicos:

En presencia de ácido bencenosulfónico como catalizador.

El aminoácido se regenera sin el uso de hidrólisis ácida sino por hidrogenólisis.

Preparación de amidas.

En medio básico: N-benzoilación bajo condiciones de Schotten-Baumann

Con anhídrido acético.

Preparación de sulfonamidas

Identificación de aminoácidos: Reacción de la Ninhidrina

Se produce un color púrpura que absorbe a 570 nm en forma intensa.

Sólo el nitrógeno del grupo amino está comprometido.

La prolina no da reacción.

Péptido: 2AA

Oligopéptido: AA < 10.

Polipéptido : AA > 10.

Proteína: AA > 100.

Clasificación.
Estructura Primaria. (básica)

Secuencia de AA.

Determina el tipo de estructura secundaria y terciaria.

Estructura Primaria.
Ejemplo, Insulina: Hormona producida por el páncreas,
formada por 51,5 AA, encargada de regular la cantidad
de azúcar en la sangre.

Fig. Modelo molecular de la Insulina.

Estructura secundaria

Fig. Colágeno, componente más abundante de piel y huesos.

Fotografía tomada con Microscopio electrónico.

Estructura secundaria

Fig. Colágeno, componente más abundante de piel y huesos.

Fotografía tomada con Microscopio electrónico.

Estructura terciaria.
terciaria

El plegamiento de las estructuras primarias y
secundarias le confiere una forma tridimensional.

Actúa como interruptor biológico mediante la transducción de señales.

 Estructura cuaternaria.

Hemoglobina: transporta oxígeno por la sangre desde los

órganos respiratorios hasta los tejidos.
Proteína desnaturalizada: únicamente la estructura primaria.
En muchos casos, la desnaturalización es reversible: RENATURALIZACIÓN.
En algunos casos, la desnaturalización conduce a la pérdida total de la solubilidad,
con lo que la proteína precipita.

La formación de agregados fuertemente hidrofóbicos impide su renaturalización,

y hacen que el proceso sea irreversible.
SEGUNDO PASO: DETERMINACIÒN DE LA CANTIDAD DE AMINOÁCIDOS
CONSTITUYENTES
Hidrólisis de los péptidos con una solución de HCl 6M/L a 110 ºC por 24 hrs.

Desde el grupo N-Terminal.
Método de Sanger (1918, Profesor
de la Universidad de Cambridge,
Premio Nóbel 1958 y 1980).

Substitución nucleofílica con 2,4-dinitrofluorobenceno.

Separación en la hidrólisis del péptido e identificación.

 Método de Edmann (1916, Profesor de la
U Universidad de Lund
Lund,, Suecia)

Con feniltioisocianato C6H5N=C=S y formación de un

derivado de la urea

Hidrolisable en condiciones bastante más suaves


DESDE EL GRUPO C-TERMINAL

Carboxipeptidasa (enzima) hidrolisa amidas C-terminales

La enzima continúa hidrolisando

Se pueden determinar unos 3 0 4 grupos C-terminales

LAS PROTEINAS PUEDEN SER FRAGMENTADAS

SELECTIVAMENTE.

Proteínas o péptidos pueden ser fragmentados.

Algunas enzimas fragmentadas selectivamente.

Tripsina Lisina o Arginina

Quimotripsina Fenilalanina, Triptofano, Tirosina
Pepsina Fenilalanina, Triptofano, Tirosina, Leusina,
Ác. Asparagino, Ác. Glutamino.

Reactivos específicos como BrCn: fragmenta una unión a una
metionina.

Los péptidos fragmentados se someten a cromatografía

Se separan y se identifican por el método de Edman

Los Bloques de péptidos se analizan en conjunto

Posible estructura de la proteína en estudio no debe incluir
repeticiones de secuencias.

La obtención del péptido por calentamiento de dos aminoácidos no funciona:

Se obtienen mezclas
- H2O
Gly + Ala Gly-Gly + Ala-Ala + Ala-Gly + Gly-Ala + Gly-Gly-Ala + .........
Δ
La policondensación de un aminoácido produce homopolímeros, o polipéptidos:
Reacción a través de la formación de una 2,5 dicetopiperazina.
La formación del dímero en una primera etapa es lenta, el que rápidamente se cicla
para formar la diamida cíclica.

Ataque de otro aminoácido libre o alguna cadena en formación:

Apertura del anillo y crecimiento de la cadena.

Requisitos:

1. Fácil de incluir en el aminoácido

2. Formación de un enlace de tipo amídico

3. Dicho enlace debe ser más fácil de hidrolizar que el

del nuevo enlace peptídico.

PROTECCIÓN DEL GRUPO AMINO

Grupo fenilmetoxicarbonil o grupo carbobenzoxi (cbz)
Reacción de un aminoácido con clorometanoato de bencilo o el éster bencílico del
ácido 1-clorofórmico en medio básico.

Liberación por hidrogenólisis.

Producción de un ácido carbamínico el que se descompone liberando CO2 y el
amoninoácido.

1,1-dimetiletoxicarbonil o terbutóxicarbonil (Boc)
Reacción entre el aminoácido y Bis(1,1,-dimetiletil)
bicarbonato o Di-ter-butildicarbonato.

Deprotección por tratamiento en medio ácido suave.

Ácido clorhídrico o ácido trifluoroacético a
temperatura ambiente.

Formación de ésteres metílicos, etílicos o bencílicos.

La hidrólisis o deprotección se produce en medio básico.

Ésteres bencílicos pueden ser sometidos a hidrogenólisis.

FORMACIÓN DEL ENLACE PEPTÍDICO; ACTIVACIÓN

DEL GRUPO CARBOXI Y SÍNTESIS DEL PÉPTIDO.

El grupo carboxílico se activa con agentes especiales.

Diciclohexilcarbodiimida (DCC). Agente deshidratante.
Preparación de DCC: Tratamiento de dos equivalentes de ciclohexilamina en
sulfuro de carbono en presencia de óxido de mercurio (HgO).

Mecanismo de la reacción: adición-eliminación


Síntesis de Glicinalanina.

Anclaje de aminoácidos a un resina poliestirénica.

Se funcionaliza el polímero (hasta un 10%) mediante una reacción de

substitución electrofílica aromática ocupando diclorometano como solvente.
Se asegura, además, que el polímero poliestirénico no reaccione con si
mismo entre los centros activados.
La liberación del péptido se produce por hidrólisis con Ácido Fluorhídrico.
El péptido así sintetizado puede ser lavado y filtrado cada vez que un
siguiente aminoácido es agregado, antes de hacer la hidrólisis final.