UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE BAJA CALIFORNIA

COORDINACIÓN DE FORMACIÓN PROFESIONAL Y VINCULACIÓN UNIVERSITARIA

COORDINACIÓN DE FORMACION BÁSICA
PROGRAMA DE UNIDAD DE APRENDIZAJE POR COMPETENCIAS
I. DATOS DE IDENTIFICACIÓN

1. Unidad académica (s): FACULTAD DE INGENIERÍA, ENSENADA

FACULTAD DE INGENIERÍA, MEXICALI
FACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICAS E INGENIERÍA, TIJUANA

2. Programa (s) de estudios: Técnico, Licenciatura: Bioingeniero 3. Vigencia del plan: 2009-2
Licenciatura (s)

BIOQUÍMICA
4. Nombre de la unidad de aprendizaje: 5. Clave 11791

6. HC 3 HL 0 HT 2 HPC 0 HCL 0 HE 3 CR 8

7. Etapa de formación a la que pertenece: disciplinaria

8. Carácter de la unidad de aprendizaje: Obligatoria x Optativa

9. Requisitos para cursar la unidad de

Química orgánica
aprendizaje:

Formulación: Fecha de elaboración:

Dra. Graciela Guerra Rivas
Dra. Claudia M Gómez Gutiérrez
M.I. Susana Norzagaray Plasencia
Dra. Aseneth Herrera Martínez
M. C. Carmen Jáuregui Romo
Facultad de Ingeniería, Ensenada
Facultad de Ingeniería, Ensenada
Facultad de Ingeniería, Mexicali
Facultad de Ingeniería, Mexicali Abril del 2014
Facultad de Ciencias Químicas e Ingeniería, Tijuana
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 II. PROPÓSITO GENERAL DEL CURSO

La unidad de aprendizaje de bioquímica se encuentra dentro de la etapa disciplinaria como asignatura obligatoria del programa educativo del bioingeniero. Es una materia integradora
que requiere conceptos de fisicoquímica, química orgánica y biología celular, que serán las bases para lograr una comprensión clara y precisa de los conceptos y procesos estudiados. El
propósito del curso es el de familiarizar al estudiante con la estructura y funcionamiento de las biomoléculas y de las principales vías metabólicas, así como con las enzimas que
catalizan estos procesos. Además de manejar a nivel molecular los procesos estudiados, el estudiante aprenderá a visualizarlos con un enfoque integrador, tanto entre los elementos de
cada uno de ellos como entre los procesos mismos. Por otra parte, las competencias aquí adquiridas serán la base para su posterior aprendizaje en el diseño de instrumentación
biomédica, así como en aplicaciones dentro de diversos procesos biotecnológicos y otras aplicaciones de la Bioingeniería.

III. COMPETENCIA(S) DEL CURSO

Reconocer las posibilidades de uso de enzimas, metabolitos y procesos metabólicos para la producción y diseño de dispositivos biomédicos, materias primas para bioempresas y
procesos de fabricación en tecnologías limpias mediante el análisis de la función catalítica y la integración de procesos bioquímicos, con un enfoque de aplicación en problemas
relacionados con la bioingeniería y una disposición al trabajo colaborativo en equipos multidisciplinarios.

IV. EVIDENCIA(S) DE DESEMPEÑO

 Estudio de casos resueltos sobre biomoleculas, catálisis enzimática, vías metabólicas y biosíntesis de proteínas.
 Ensayos de investigación bibliográfica que contengan la fundamentación teórica, la metodología y la discusión de resultados sobre temas de biocatalisis, bioenergética, vías
anabólicas y catabólicas.
 Elaboración y presentación de informes de actividades experimentales realizadas durante el semestre
 Portafolio de evidencias: casos resueltos, recopilación de investigaciones, informes de laboratorio, ejercicios, evaluaciones, guía de observación.

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 V. DESARROLLO POR UNIDADES
UNIDAD 1.
ORGANIZACIÓN BIOQUÍMICA DE LA CELULA
Competencia
Inferir e inducir comportamientos específicos de solutos en soluciones acuosas mediante el manejo de las propiedades físicas y químicas del agua para predecir comportamientos de
biomoléculas complejas utilizando un lenguaje claro y preciso, con una actitud respetuosa hacia la complejidad de los seres vivos.

Contenido Duración 3 h
1. ORGANIZACIÓN BIOQUÍMICA DE LA CELULA

1.1 Ambiente celular, agua y solutos

1.1.1 Estructura y función celular
1.1.2 Estructura molecular del agua
1.2 Interacciones no covalente
1.2.1 Interacción Iónica
1.2.2 Fuerzas de Van der Waals
1.2.3 Puente de Hidrógeno
1.3 Propiedades Físicas del agua: solvente
1.3.1 Moléculas hidrofilicas
1.3.2 Moléculas hidrofóbicas y sus efectos
1.4 Propiedades químicas del agua
1.4.1 Ionización del agua
1.4.2 Ácidos, bases y pH
1.4.3 Buffer

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 V. DESARROLLO POR UNIDADES
UNIDAD 2.
AMINOACIDOS Y PROTEINAS: ESTRUCTURA Y FUNCION
Competencia
Analizar la estructura y función biológica de las proteínas con base en las características estructurales y funcionales de los aminoácidos para orientar este conocimiento a la aplicación
de problemas relacionados con la bioingeniería, la biomedicina y la biotecnología, con un enfoque integrador y colaborativo con otras profesiones afines o de actividad complementaria a
la del bioingeniero
Contenido Duración 12 h
2. AMINOACIDOS Y PROTEINAS: ESTRUCTURA Y FUNCIONAminoácidos
2.1.1 Aminoácidos estructura, propiedades y clasificación
2.1.1.1 Cadenas polares, no polares o con carga.
2.1.1.2 Nomenclatura: nombre corto y sistema de abreviaturas
2.1.2 Aminoácidos proteicos
2.1.3 Los aminoácidos como ácidos y bases
2.1.3.1 pKa de grupos ionizables
2.1.4 Reacciones de aminoácidos
2.1.5 El enlace peptídico
2.1.6 Péptidos
2.2 Proteínas
2.2.1 Clasificación según su función.
2.2.1.1 Proteínas globulares
2.2.1.2 Proteínas fibrosas
2.2.2 Estructura y fuerzas estabilizantes
2.2.2.1 Primaria.
2.2.2.2 Secundaria.
2.2.2.3 Terciaria
2.2.2.4 Cuaternaria
2.2.3 Desnaturalización
2.2.4Caracterización, purificación y análisis.
2.2.4.1 Métodos de separación basados en propiedades ácido-base
2.2.4.2 Métodos de separación basados en peso molecular.
2.2.4.3 Métodos de separación basados en afinidad estructural.
2.2.5 Conceptos asociados a la purificación y análisis: factores de dilución, diagramas de flujo, preparación de buffers.

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 V. DESARROLLO POR UNIDADES
UNIDAD 3.
ENZIMAS: ESTRUCTURA Y FUNCION

Competencia
Integrar el papel de las enzimas a la bioingeniería mediante la incorporación de conceptos básicos de la enzimología en las diferentes áreas bioingenieriles, con el fin de aplicarlos en la
biotecnología ambiental, la ciencia de los biomateriales y la biocatálisis, con una actitud creativa, innovadora y tendiente a la resolución de problemas.

Contenido Duración 6 h
3. ENZIMAS: ESTRUCTURA Y FUNCION
3.1 Enzimas
3.1.1 Nomenclatura, clasificación y función enzimática.
3.2 Factores fisicoquímicos y mecanismos de reacción en la acción enzimática
3.2.1 Energía de activación
3.2.2 Grupos nucleofílicos de los aminoácidos
3.2.3 Catálisis covalente
3.2.4 Catálisis ácido-base
3.2.5 Proximidad y orientación de grupos reaccionantes
3.3 Cinética enzimática
3.3.1 El enfoque de Michaelis-Menten en la cinética enzimática
3.3.2 El enfoque de Linewaeaver-Burk en la cinética enzimática
3.3.3 Inhibición de enzimas
3.3.4 Enzimas alostéricas
3.3.4.1 Efectores positivos y negativos
3.4 Mecanismos de control de la actividad enzimática.
3.4.1 Modificación covalente
3.4.2 Modulación alostérica
3.5 Enzimas en la bioingeniería
3.1.5.1 Las enzimas en el diseño de dispositivos biomédicos: marcapasos
3.1.5.2 Mecanismos enzimáticos de utilidad para la biotecnología ambiental
3.1.5.3 Aplicación de enzimas en procesos biocatalíticos
3.1.5.4 Utilidad de la enzimas en la producción de nuevos biomateriales

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 V. DESARROLLO POR UNIDADES
UNIDAD 4.
FUNDAMENTOS DE METABOLISMO
Competencia

Interpretar procesos vitales de los seres vivos mediante la aplicación de conceptos termodinámicos, químicos y moleculares a los elementos biológicos subyacentes en procesos
metabólicos selectos con el fin de visualizar los principios energéticos que gobiernan los cambios bioquímicos, con un enfoque integrador que relacione estructura, función y relevancia
de procesos, con una actitud visionaria capaz de extender estos principios a procesos metabólicos no analizados en clase.

Contenido Duración 16h

4. FUNDAMENTOS DE METABOLISMO
4.1 Fundamentos de metabolismo: anabolismo, catabolismo, transacciones energéticas.
4.2 Bioenergética
4.2.1. La espontaneidad de las reacciones bioquímicas: energía libre y aplicación de las leyes de la termodinámica.
4.2.2. Cambios energéticos en procesos metabólicos: reacciones exergónicas, endergónicas y acopladas.
4.2.3. Compuestos de alto potencial de transferencia de grupo fosfato y sus mecanismos de transferencia energética.
4.2.4 El papel del ATP en la economía energética de los seres vivos.
4.3. Energía libre y potenciales redox en los seres vivos.
4.3.1. Ecuación de Nerst y espontaneidad de las reacciones bioquímicas.
4.3.2. Potenciales redox y energía libre: dos enfoques sobre una reacción bioquímica
4.3.3. Transportadores electrónicos biológicos: mecanismos de óxido-reducción
4.3.4. Transporte de electrones y fosforilación oxidativa: mecanismos de acoplamiento.
4.4. Procesos bioquímicos selectos: características esenciales, metabolitos, bioenergética, enzimas.
4.4.1 La mitocondria y el citoplasma
4.4.2 Capacidad de integración entre procesos metabólicos
4.4.3 Glucólisis
4.4.4 Ciclo de Krebs
4.4.5 Transporte electrónico en mitocondrias

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 V. DESARROLLO POR UNIDADES
UNIDAD 5.
BIOSINTESIS DE PROTEINAS
Competencia
Visualizar las posibilidades de modificación de la biosíntesis de las proteínas mediante el análisis de los mecanismos bioquímicos, la función de las enzimas y la estructura de ácidos
nucleicos, para valorar su potencial biotecnológico en la ingeniería genética y su aplicación en el campo de la medicina, con una actitud guiada por los principios de la bioética.

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Contenido Duración 6h

5. BIOSINTESIS DE PROTEINAS

5.1 El código genético: casi universal, degenerado y redundante. Teoría del wobble.

5.2 El proceso de biosíntesis de proteínas: enfoque mecanístico-molecular, enzimas y cofactores

5.2.1. Activación de aminoácidos y el papel de RNAt

5.2.2. Iniciación y el papel del RNAm

5.2.3. Elongación

5.2.4. Terminación de la síntesis y liberación de la proteína

5.2.5. Modificaciones post-traduccionales

5.2.6. Enfoque energético del proceso

5.3 Proteínas recombinantes y sus aplicaciones

5.3.1 Definición, origen, características, justificación para su producción.

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 V. DESARROLLO POR UNIDADES
UNIDAD 6.
APLICACIONES ENZIMATICAS
Competencia

Discutir la función de las enzimas en el diseño y producción de biomateriales, biocatalizadores, dispositivos biomédicos y productos biotecnológicos de diagnóstico, con actitud crítica y
respeto al ser humano y al medio ambiente.

Contenido Duración 5h

6. APLICACIONES ENZIMATICAS

6.1 Introducción a la biotecnología de enzimas

6.2 Enzimas para la Bioingeniería

6.2.1 Proteínas recombinantes en la medicina terapéutica

6.2.2 Inmovilización de enzimas para biotecnología ambiental

6.2.3 Las enzimas en las tecnologías limpias

6.2.4 Proteasas en la producción de biodispositivos

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 VI. ESTRUCTURA DE LAS ACTIVIDADES DE TALLER
No. de la Competencia(s) Descripción Material de Duración
actividad Apoyo (horas)
Familiarizarse con el manejo de cálculos para la Preparación de soluciones Vasos de precipitados, pipetas, pipeteador, balanza 2
1 preparación de soluciones de uso frecuente y analítica, potenciómetro, matraz de aforacion, agitador
aplicar el concepto de factor de dilución. magnético

Aplicar la ecuación de Henderson-Hasselbach en la Preparación de soluciones amortiguadoras Vasos de precipitados, pipetas, pipeteador, balanza 2
2 preparación de soluciones amortioguadoras analítica, potenciómetro, matraz de aforacion, agitador
magnético
Determinar la constante de acidez de un Calcular la constante de acidez de un acido
3 aminoácido, mediante la curva de titulación de un poliprotico. alanina, hidróxido de sodio, indicadores, bureta, 2
ácido políprotico (aminoácido) vidriería básica potenciómetro,

4 Soluciones de DL-alanina, triptofano, hidróxido de sodio

Analizar e identificar las propiedades de los Preparación de soluciones con diferentes albumina, gelatina, caseína, sulfato de cobre, ácido 2
aminoácidos y proteínas por medio de reacciones aminoácidos y proteínas. Realizar diferentes nítrico, ácido sulfúrico, etanol, Mechero, vidriería
químicas características. reacciones con las soluciones preparadas básica,
anteriormente. Observar e identificar las Soporte universal
proteínas presentes en la solución. Pipetas

5 Realizar una curva de calibración para la

Conocer y aplicar el principio de la Ley de Beer determinación de proteínas mediante el Vidriería básica, estufa, espectrofotómetros, celdas 4
método de Biuret para espectrofotómetro, reactivo de Biuret, estándar
de albumina
6 Calcular la constante de Michaelis-Menten en Llevar a cabo una reacción a temperatura Vidriería básica, bureta, termómetro, baño María, 4
reacciones catalizadas por un par enzimático controlada en concentraciones de substrato Ureasa, Buffer Tris, urea, HCl, indicador
diferentes, para la determinación constante de
Michaelis-Menten

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 Caracterización de proteínas solubles mediante Determinar el peso molecular de una proteína Cámara de electroforesis, fuente de poder, solución 4
electroforesis amortiguadora, proteína problema, marcadores
moleculares, gel de poliacrilamida, pipetas automáticas
de volúmenes variables.

Evaluar el efecto de la temperatura en la velocidad Llevar a cabo una reacción a temperatura Vidriería básica, bureta, termómetro, baño María, 4
de reacción de un par enzimáticos variable, para evaluar su efecto en Ureasa, Buffer Tris, urea, HCl, indicador
concentraciones de substrato diferentes, para
la determinacion constante de Michaelis-
Menten
7 Clasificar los hidratos de carbono de acuerdo a su Identificar monosacáridos, disacáridos, Programa Chem-draw, computadora, libro de texto 1
estructura y funcionalidad polisacáridos y su relación con las principales
vías metabólicas
8 Diferenciar los diferentes tipos de hidratos de Realizar pruebas de identificación de aldosas, Soluciones de glucosa, sacarosa, lactosa, fructuosa, 3
carbono así como sus principales reacciones cetosas, azucares reductores, prueba de galactosa, almidón, reactivo de Fehling A y B, solución
osazonas e identificación de polisacáridos. de I2, material básico de vidrio, plancha de
calentamiento.
9 Clasificar los diferentes tipos de lípidos de Identificar los diferentes tipos de lípidos como: Libro de texto, internet, formato de ejercicios 1
acuerdo a su estructura y funcionalidad. ácidos grasos y sus esteres, hormonas,
vitaminas,
10 Analizar las diferencias y semejanzas entre las Resolución de casos de estudios sobre las Libro de texto, formato de ejercicios, internet. 3
principales rutas metabólicas, tanto anabólicas principales vías anabólicas y catabólicas.
como catabólicas
11 Aplicar los principios de óxido-reducción a Resolución de casos de estudio sobre Libro de texto, formato de ejercicios, calculadora, 2
reacciones bioquímicas. respiración y fosforilacion oxidativa internet.
12 Aplicar la ecuación de Nerst a reacciones de vías Resolver problemas de ecuación de Nerst Libro de texto, formato de ejercicios, internet, 2
metabólicas aplicada a sistemas biológicos. blackboard

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 VII. METODOLOGÍA DE TRABAJO
 El alumno debe trabajar en equipo, de forma colaborativa, realizando análisis de los tópicos propuestos para la sesión de clase, incluyendo casos de estudios y ejercicios.
 Participar proactivamente en las prácticas de laboratorio
 Presentaciones de forma oral y escrita para desarrollar un criterio analítico en la proposición de alternativas de solución de problemas de índole biotecnológico o en el diseño
de instrumentación biomédica que fortalezca su desarrollo profesional.
 Utilizar activamente la plataforma de blackboard, así como bases de datos académicas.

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 VIII. CRITERIOS DE EVALUACIÓN

Criterios de acreditación
 Se exenta del ordinario si en evaluaciones de unidad tiene 80 o más de calificación
 80% de asistencia para tener derecho a evaluaciones de unidad y ordinario.
 100% de asistencia a prácticas de laboratorio.

Criterios de calificación
 10% de ejercicios en clase
 10 % de casos de estudio
 25 % de reportes de prácticas de laboratorio
 55% de evaluaciones de unidad
 5% guía de observación

Criterios de evaluación
 Examen parcial al término de cada unidad. Los exámenes no se aplican fuera de la fecha programada, a menos que sea acordado por el grupo y el profesor, o por causas de
fuera mayor.
 Para derecho al examen extraordinario se deberá de contar con un mínimo de 40% de asistencia

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 IX. BIBLIOGRAFÍA
Básica Complementaria

 Lehninger, David L. Nelson y Michael M. Cox, Principios de Bioquímica, 5ta
edición, ed. Omega, 2007
 Mckee, T., Meckee, J. R. Biochemistry the molecular basis of life, New york:
Oxford University Press, 2009
 Voet, D., Pratt, C.W. Voet, J.G. Fundamentals of biochemistry: Life at the
molecular level. Hoboken, NJ: Willey, 2008.
 Campbell, M.K., Farrell, S. O. Bioquimica. 6ta ed. CENAGE Learning, Mexico. 2010;
818pp
 Mathews, C. K. Van Holde, K. E. Biochemistry, Cummings Publishing Co., Red Wood City,
CA, 1990; 1129 pp.
 Devlin, T. M. Bioquímica: Libro de Texto con Aplicaciones Clínicas , 3ra ed.; Reverté,
Barcelona, España, 2000, Vol 2, 1137 pp.
 Murray, R.K; Granner, D.K.; Mayes P. A.; Rodwell, W.V. Harpers Biochemistry, 23rd ed,
Lange Medical books; 1993; 806pp.
 Champe, P.C. Harvey, R.A . Lippincontt’s Ilustrated Reviews: Biochemistry, 2da. Ed.
Lippincott, Philadelphia, 2004; 444pp.

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