Revisão Ácidos Nucleicos e Replicação

1- Qual a composição básica dos ácidos nucleicos? E como estas unidades básicas
estão organizadas? São formados por cadeias de nucleotídeos (uma pentose, um grupo
fosfato e uma base nitrogenada) unidas por ligação fosfodiéster. Os ácidos nucleicos são
compostos de nucleotídeos organizados em cadeias polinucleotídicas, que são ligadas por
pontes de hidrogênio. Dentro de uma mesma cadeia tem as ligações fosfodiéster. As
unidades básicas são os nucleotídeos, que estão organizados em cadeias ligadas através de
ligações fosfodiéster e essas cadeias estão ligadas através de pontes de hidrogênio.

2- Apresente um desenho esquemático de um nucleotídeo, apresentando seus três

constituintes.

3- Quais as diferenças entre o DNA e o RNA? No DNA o açúcar é a desoxirribose e

no RNA é a ribose; enquanto no DNA é adenina, citosina, guanina e timina, no RNA não
tem a timina e passa a ter a uracila; RNA é normalmente fita simples e DNA é
obrigatoriamente fita dupla.

4- Descreva o modelo de dupla hélice do DNA, proposto por Watson e Crick, em

1953. Duas fitas complementares e antiparalelas se enrolam em torno do eixo da hélice.
As fitas se torcem entre si porque as bases nitrogenadas localizadas no meio das fitas são
de tamanhos diferentes e por isso vão se torcendo para melhor acomodar a dupla fita. As
bases nitrogenadas para melhor se acomodarem vão girando.
5- Explique os níveis de empacotamento do material genético. O DNA de cada um
dos cromossomos é empacotado numa estrutura compacta com a ajuda de proteínas
especializadas, as proteínas cromossômicas não-histônicas e as histonas. O conjunto de
nucleossomos compreende o primeiro nível de empacotamento, cada nucleossomo é uma
partícula em forma de disco contendo duas cópias de cada uma das quatro histonas (H2A,
H2B, H3 e H4). Esse octâmero de histonas forma um centro proteico, em volta do qual a
hélice de DNA enrola-se por duas voltas num total de 146 nucleotídeos. No segundo nível
de empacotamento, os nucleossomos adquirem uma forma helicoidizada (enrolam-se sobre
si mesmos) chamada solenóide, o que mantém a estrutura nessa forma é a H1, que fica no
meio e dá o suporte para manter a estrutura nessa forma. O terceiro nível de empacotamento
é o arcabouço, no qual um conjunto de proteínas forma uma estrutura que dá suporte e
aquele solenoide vai se dobrando por cima, ele não se liga todo, tem porções que vão se
ligando a ele, o que forma a fita de 300nm. O quarto nível de empacotamento é a super-
helicoidização, é quando a fita que estava reta vai se enovelar também, se retorcendo e
dando a estrutura do cromossomo metafásico.
*Durante todo o ciclo celular o DNA vai estar empacotado dessa maneira (nos 4 níveis)?
Não, ele vai estar dessa forma quando tem que ocorrer a divisão, por isso esse cromossomo
é chamado de metafásico. Antes de ter a divisão ou durante, tem a mitose, na fase da
metáfase da mitose que fica dessa maneira. Em todos os outros momentos vai estar
empacotado em níveis menores (geralmente primeiro ou segundo), vai estar sempre
relacionado a histonas, mas esse nível de empacotamento depende da fase. Onde vai ter
expressão precisa que a fita se separe para que consiga expressar os genes e para isso
precisa estar menos condensado.

6- Para que serve a replicação? Para garantir que as células filhas recebam o mesmo
material genético da célula mãe. Todo esse material genético vai ser duplicado e dividido
para as duas células filhas, para que fiquem com o material genético idêntico.

7- Justifique o fato de a replicação do DNA ser semiconservativa. Quais as

características desta molécula que possibilitam este tipo de replicação? Uma
replicação semiconservativa é quando tem duas fitas que são complementares, elas vão se
separar e cada uma dessas fitas vai servir de molde para a síntese da sua fita complementar
e dar origem para cada uma das moléculas filhas. As duas moléculas que serão formadas
agora serão idênticas entre si. O que possibilita a replicação semiconservativa é o fato de
as fitas serem complementares e antiparalelas, principalmente complementares.

8- Por que as origens de replicação são ricas em pares AT? Entre A e T tem apenas
duas pontes de hidrogênio, fica mais fácil de quebrar as duas para começar a replicação.
Entre C e G tem três pontes de hidrogênio.
9- Quais as principais enzimas envolvidas na replicação? Explique
resumidamente a função de cada uma. 1 - Helicases: quebram as ligações pontes de
hidrogênio entre as bases nitrogenadas das duas fitas, fazendo com que se separem; 2 -
Proteínas SSB: mantém as duas fitas separadas, evitam que o DNA fita simples sofra
torções e protegem degradação, mantendo a integridade da fita simples, porque ela se torna
muito mais suscetível a enzimas que degradam o DNA. 3 - Primase: fornece o primer que
se liga a fita existente para que a DNA-polimerase consiga iniciar a replicação. 4 - DNA-
polimerase: adicionam nucleotídeos ao primer que é complementar ao molde, revisam o
DNA e, em caso de erro, o reparam. 5 - Ligase: liga os fragmentos de Okasaki. 6 -
Topoisomerase: reduz a supertorção da fita que é causada pelo deslocamento da forquilha
de replicação.
*A primeira a atuar para que haja a replicação é helicase que quebra as pontes de
hidrogênio entre as duas fitas, a partir do momento em que separa as fitas, as proteínas
SSB mantém a integridade da fita simples e não permitem que forme grampos. A primase
começa a adicionar o primer e fica pronto para a DNA-polimerase atuar, a polimerase
começa a adicionar nucleotídeos, precisa da atuação da ligase que vai atuar na fita de
síntese descontinua porque vai ter primers sendo colocados que são de RNA, nenhuma
polimerase consegue iniciar sem o primer. Esse RNA não vai permanecer ali, vai ser
substituído por DNA. Na fita retardada, a polimerase não consegue ligar o nucleotídeo que
ela incorpora no primeiro nucleotídeo que tinha a partir do primer, ali vai ter a atuação da
ligase. Na frente da forquilha de replicação, para ir dissolvendo o pareamento e desfazendo
a supertorção atua a topoisomerase.

10- Como a DNA-polimerase sabe qual nucleotídeo deve adicionar? Ela tem a fita
complementar. Tem a fita molde que vai usar, respeitando a complementariedade ela sabe
qual nucleotídeo vai adicionar. Ou seja, se na fita molde tiver uma adenina, na fita
sintetizada será adicionada uma timina.

11- O que significa dizer que a DNA-polimerase tem atividade exonuclease?

Quando ela está fazendo a extensão, se identificar algum pareamento errado, ela pode ir na
extremidade e tirar. É exo porque vem a partir da ponta. Ela retira, depois vai e faz a síntese
do trecho novamente para garantir que não sejam incorporadas base de forma incorreta.

12- O que são fragmentos de Okazaki? Eles são formados porque uma das fitas tem
replicação descontínua, então vários primers serão incorporados ao longo da fita, o que
resulta na formação desses fragmentos de Okazaki. A partir de um primer um trecho está
sendo sintetizado na fita descontínua, então vários fragmentos que vão estar sendo
sintetizados e serão chamados de fragmentos de Okazaki.