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MICROBIOLOGIE
Module 2
Introduction
Module 1
A- Définition
B- La digestion
1- Définition
2- Les phases de la digestion
a- Phase buccale
b- La phase gastrique
c- La phase intestinale
3- Absorption
4- Facteurs interférant sur la digestion
a- Facteurs nutritifs
b- Facteurs alimentaires
c- Facteurs nerveux
d- Influence des parasitoses
I- Définitions
II- Facteurs de dépenses énergétiques
1- Dépenses d’entretien (métabolisme de base ou basale)
2- L’activité physique
3- L’effet calorifique des aliments
I- Généralités
1- Définition
2- Rôle
I- Rôle physiologique
II- Répartition
1- Lipides de réserve
2- Lipides circulants
U.V. BIOCHIMIE 31 :
Introduction
A- Les holosides
I- Oligoholosides
Diholosides
Diholosides réducteurs
Le maltose
Le lactose
Le cellobiose
Le gentibiose
Diholosides non-réducteurs
Le saccharose
Le tréhalose
Triholosides
Le raffinose
II- Polyholosides
1- Homopolyholosides
a- Homopolyholosides de réserve
Amidon
Glycogène
Dextrane (homopolyholosides de réserve des microorganismes)
Fructosanes
Pectines
Mannanes
Arabanes
b- Homopolyholosides de structure
La cellulose
La chitine
2- Hétéropolyholosides
B- Les hétérosides
I- Les glycoprotéines
1- Constituants monosaccharidiques
a- Les oses neutres
b- Les acides uroniques
c- Les osamines
d- Les acides sialiques ou neuraminiques
Acides N-acétyl-neuraminiquess
Acides N-glycosyl-neuraminiques
Acides N et O-Acétyl-neuraminiques
Acides N-Acétyl-muramiques
2- Les glycanes
a- Le n-glycanes
Les mucines sous-maxillaires
Le mucopolysaccharides
Acides hyaluroniques
Héparine
Acides chondroïtine-sulfuriques
Acide chondroïtine-S A (chondroïtine 4 sulfate)
Acide chondroïtine-S B (dermatone-sulfate)
Acide chondroïtine-S C (chondroïtine cis-S)
Kératane-sulfate
b- Isoglycannes
Isoglycannes de type N-Acétyl-lactosaminique
Isoglycannes de type oligomannosidique
Introduction
A- Classification
I- Classification en fonction de la forme
1- Protéines fibreuses ou scléroprotéines
2- Protéines globulaires ou sphéroprotéines
c- L’analyse quantitative
V- Structure quaternaire
1- Le pH (influence)
2- Influence de la concentration en sels
3- Effet des solvants
4- Effet de la température
Introduction
C- Les cires
I- Les cérides
1- Les alcools à acides gras des cérides
a- Les alcools
b- Les acides gras
2- Exemples de cires
a- Cires végétales
b- Cire d’insectes
c- Cire de mammifères
d- Cire des bactéries
II- Les stérides
I- Classification
1- Les acides aminés avec un R non polaire
Alanine
Valine
Leucine
Isoleucine
Proline
Phényialanine
Tryptophane
Méthionine
2- Acides aminés avec R polaire mais non chargé
Glycine
Sérine
Thréonine
Cystéine
Tyrosine
Asparagine et glutamine
3- Acides aminés avec R= acide
Acide aspartique
Acide glutamique
4- Acides aminés basiques
Lysine
Arginine
Histidine
5- Les analogues d’acides aminés et acides aminés rares
U.V. DE BIOCHIMIE 32 : ENZYMOLOGIE
Chapitre 1 :
Introduction
1- Effet de la température
2- Effet du pH
3- Effet des composés activateurs (cations métalliques, substances réductrices)
Les cations métalliques
Les substances réductrices
4- Effet des composés inhibiteurs (irréversibles-réversible)
Interprétations moléculaires des effets inhibiteurs
Inhibiteurs compétitifs
Inhibiteurs non compétitifs : (inhibiteurs non compétitifs classiques,
inhibiteurs non compétitifs mixtes)
Inhibiteurs incompétitifs
Interprétations cinétiques des effets inhibiteurs
1- Introduction
2- Les coenzymes d’oxydoréduction
Nicotinamide Adénine Dinucléotide (NAD)
Flavine Adénine Dinucléotide (FAD)
3- Coenzymes de transfert de groupes
Coenzyme A (CoA)
La biotine
U.V. DE BIOCHIMIE 33 : BIOENERGETIQUE
I- Définition
I- Notion de thermodynamique
II- Production et conservation de l’énergie biologique
Les biopolymères
Chapitre 3 : Electrophorèse
I- Introduction
III- Origine des charges électriques et leur influence sur le mouvement de molécule de
protéine
U.V. DE BIOCHIMIE 34 : MICROBIOLOGIE GENERALE ET ELEMENT
D’IMMUNOLOGIE
I- Historique
1- Les grandes découvertes
2- L’ère pasteurienne 1822-1895
3- L’ère post.pasteurienne
1- Définition
2- Place dans la nature
3- Rôle des bactéries dans la nature
4- Rôle chez l’homme
5- Rôle économique
6- Rôle en médecine
I- La nutrition
A- Les besoins nutritifs
1- Les aliments constitutifs
Les sources de carbones (bactéries autotrophes, bactéries hétérotrophes)
Les sources d’azote
2- Les aliments énergétiques
Les bactéries phototrophes
Les bactéries chimiotrophes
Les bactéries paratrophes
3- Les aliments spécifiques ou facteurs de croissance
B- Méthode d’étude
1- Matériaux de culture
2- Mesure de la croissance
Méthodes directes
La numération totale
La numération viable
Les méthodes indirectes
Détermination du poids sec
Mesure de l’azote bactérien
Mesure de l’activité enzymatique
Méthode turbidimétrique
I- Méthode d’étude
1- Microscope optique (photonique)
Etat frais : examen
Examen après coloration
La coloration simple
La coloration différentielle de GRAM
La coloration spécifique
2- Microscope électronique
Technique de coloration négative ou contraste négatif
Techniques d’inclusion
La membrane cytoplasmique
Organisation
Composition chimique de la membrane cytoplasmique
Rôle
Osmorégulateur
Activité enzymatique
Appareil nucléaire
Le cytoplasme et ses inclusions
2- Eléments inconstants
La capsule
Mise en évidence
La composition chimique
Rôle de la capsule
Les cils ou flagelles
Mise en évidence
Structure des cils
Le rôle (Mobilité, rôle antigénique, rôle dans la fixation des Bactériophages)
Les Pili ou Fimbriae
Pili communs
Les Pili sexuels (Pili F; Pili I)
La Spore
Rôle
Mise en évidence
La Structure
La composition chimique
Introduction
Nomenclature et classification
La classification naturelle
La classification bactérienne
Aspects morphologiques
Aspects physiologiques
Caractères génétiques
Historique
B- Taxonomie génétique
1- Génétique physiologique
Techniques de conjugaison bactérienne
Techniques de transduction généralisée
Transformation bactérienne
2- Composition en base du DNA
Rappel sur le matériel génétique
Méthodes d’étude
3- Hybridation des acides nucléiques
Technique
Interprétation
Les limites
C- Taxonomie moléculaire
Introduction
I- Généralités
A- Définitions
1- Notion d’antibiotique
2- Bactériostase-Bactéricide
3- Notion de CMI (Concentration Minimale Inhibitrice)
4- Notion de spectre
B- Classification des antibiotiques
1- Selon le spectre d’action
2- Selon le type d’action
3- Selon l’origine
4- Selon la structure chimique
2- Les Céphalosporines
Première génération
Deuxième génération
Troisième génération
Quelques définitions
1- Décontamination
2- Désinfection
3- Antiseptique
4- Aseptie
5- Les antiseptiques
6- Les Désinfectants
1- In vitro
2- In vivo
Introduction
1- Définition
2- La classification
Les toxines protéiques ou exotoxines
Les toxines glucidolipidoprotéiques ou endotoxines
II-Les toxines protéiques
1- Mode opératoire
2- Déterminisme génétique
3- Le pouvoir antigénique
4- Propriétés physicochimiques
5- Détoxication par le formol
6- Mode d’action et clinique
1- Mode de reproduction
2- Propriétés physicochimiques
3- Propriétés biologiques ou mode d’action
4- La clinique
5- Le pouvoir antigénique
I- généralités
1- Définition
2- Schéma général des défenses de l’hôte
1- Définition
2- Les concepts d’épitope et de paratope
Les récepteurs des lymphocytes B : BCR
Les récepteurs de cellules TCR
3- Concept de d’haptène
L’antigénicité
L’immunogénicité
4- Les fonctions immunologiques d’un Ag
a- Immunologie ou pouvoir immunogène
b- L’antigénicité ou spécificité antigénique
c- Allergénicité ou pouvoir allergisant
d- La tolérogénicité
e- Adjuvancité
f- La mitogénicité polyclonale
5- Notion d’affinité
1- Présentation de l’antigène
a- Présentation de l’Ag aux cellules B
b- Présentation de l’Ag aux cellules T
2- Expansion ou sélection clonale
1- Réponse humorale
Une phase de latence
Une phase de croissance exponentielle
Une phase plateau
Une phase de croissance
2- La réponse à médiation cellulaire
V- Tolérance immunologique
VI- Mémoire immunologique
I- Structure
1- Structure générale
2- Structure des chaines légères
1- Isotypie-Allotypie-Idiotypie
Isotypie
Allotypie
Idiotypie
2- Propriétés générales
a- Les IgG
b- Les IgM
c- Les IgA
d- Chaine J-récepteur des immunoglobulines polymérisés-pièce sécrétoire
e- Les IgD et IgE
Introduction
I- Préparation de la benzoïne
Généralités
Protocole opératoire
Généralités
Protocole opératoire
Principe
Mode opératoire
Principe de la manipulation
Protocole opératoire
Mécanisme
Protocole opératoire
V- Extraction de la caféine
Partie expérimentale
U.V. 304 DE REACTIONS EN CHIMIE ORGANIQUE
Généralités
Les organomagnésiens
Les organolythiens
Les organozinciques
Les organocadmiens
Principes généraux
Principe
Réactions de Friedel-Crafts
Réactions de Prins
Réaction de Mannich
Réaction de Diels-Alder
La réaction de Wittig
Généralités
Généralités