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carboxilato
a- amino
carbono a
sustituyente o grupo R 3
La síntesis de aminoácidos necesita solucionar tres problemas
bioquímicos fundamentales
1) Obtener nitrógeno
Fijadores
Bacterias y cianobacterias fijadoras
libres de nitrógeno simbióticos
El mayor reservorio de nitrógeno de la Tierra
está en su atmósfera
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Nitrosp.png
…siempre nos quedaremos cortos a
la hora de evaluar la importancia
que tiene la fijación del nitrógeno,
por parte de los microorganismos
que fijan N2, para el metabolismo
de todos los eucariotas superiores…
Electrones
procedentes de la
ferredoxina
reducida a22
(potente reductor)
Dímero Tetrámero
Proteína Fe-S
Reductasa Nitrogenasa
(Fe-proteína) (MoFe-proteína)
8 átomos de Fe
7 átomos de S Átomo
central
homocitrato
conectados a la
proteína por Cada cofactor
unión vía Cys FeMo contiene:
1 átomo de Mo
7 átomos de Fe,
9 átomos de S,
1 átomo central
1 homocitrato,
conectados al a
proteína por unión
vía Cys y His
Recuerde que las agrupaciones hierro-azufre funcionan como transportadores
de electrones
Agrupaciones hierro-azufre
Proteína
Cada una de estas agrupaciones puede llevar a cabo reacciones de oxido reducción
Los iones Fe alternan ente los estados Fe2+ (reducido) a Fe3+ (oxidado)
El cofactor
Reductasa Nitrogenasa
hierro-molibdeno
(Fe-Mo)
se une al N2
atmosférico
y lo reduce
Nitrógeno
Subunidad-α
Ferredoxina
reducida
[4Fe-4S] Amoníaco
Agrupación-P
Subunidad-β
La reacción biológica genera además de 2 moles de NH3 por cada mol de N2,
al menos 1 mol de H2
Todos los aminoácidos menos la Gly son quirales, por lo cual las vías
biosintéticas deben generar el isómero correcto
Excepto la Glicina
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Chirality_with_hands.jpg
1) Obtener nitrógeno
2) Control estereoquímico
Glutamato Glutamina
α α
α-cetoglutarato Glutamato
(intermediario del Ciclo de Krebs)
Consume NAD(P)H (en algunas especies la enzima no diferencia entre NADH y NADPH)
Etapas:
-se forma una base de Schiff (carbonilo reacciona con amino, doble enlace C=N),
que se protona fácilmente
Base de Schiff
α -cetoglutarato protonada L-glutamato
Cα
Hidruro (H-)
en color verde
¿Cómo se sintetiza el Glutamina?
Cα Cα Cα
Etapas:
Regulación por
Modificación covalente
Alostérica por
retroinhibición acumulativa
…
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:PDB_2gls_EBI.jpg
Salmonella typhimurium
12 subunidades idénticas de 50kDa c/u
Regulación por modificación covalente
Adenilil
Transferasa
(AT) & PA
Glutamina Glutamina
sintetasa sintetasa
NO adenilada adenilada
(más activa) (menos activa)
Adenilil La actividad de
Transferasa adenililación o
(AT) & PD fosforólisis de la
adeniltransferasa (AT)
está regulada por una
proteína reguladora P
que existe en dos
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Adenylylated_Unadenylylated_GS.PNG formas PA y PD
PA se convierte en PD cuando se uridila
por acción de la enzima Uridil transferasa
PA, No Uridilada
Actividad adenililante de AT
Uridil Transferasa
PD, Uridilada
Actividad de fosforólisis de AT
- retroinhibición y retroactivación
- multiplicidad enzimática
- retroinhibición acumulativa
- cascada enzimática como en la glutamina sintetasa
La glutamina sintetasa
(GS)
Los aminoácidos se
sintetizan a partir
de intermediarios
del ciclo de Krebs,
la glicólisis, la vía
de las pentosas
fosfato
Biosíntesis de AA por transaminación: Asp, Ala
α-cetoácido
Lisina (Oxalacetato→Asp
Piruvato →Ala)
Enzima
α-ceto-
Glu glutarato
Cα
L-Aminoácido
Arginina
Protón que se
va a transferir
Lisina
Aminoácidos conservados
en todas las transaminasas
La formación de Asparragina
a partir de Aspartato requiere un
Intermediario adenililado
En mamíferos el dador de
NH3 es la glutamina
(por hidrólisis)
Arg
Glutamato g-semialdehído
glutámico
Prolina
El 3-fosfoglicerato (de la glucólisis)
es el precursor de serina
El corismato es el intermediario de la
síntesis de aminoácidos aromáticos
en bacterias, hongos y plantas
Los aminoácidos son precursores de muchas biomoléculas
Óxido Nítrico
una molécula mensajera
se forma a partir de Arginina
AA
y muchos más…
Gracias
Andrea Villarino