Scribd Logo
Încărcați

Bine ați venit la Scribd!

  • Vina Screen Local

    Încărcat de

    Gigi Florica
    18 vizualizări1 pagină
    This script loops through all files matching the pattern ligand_*.pdbqt, extracts the name before the .pdbqt extension, echoes that it is processing that ligand, makes a directory with that name, and runs AutoDock Vina on the ligand file outputting results to files in the new directory.

    Descriere originală:

    Vina screen local

    Drepturi de autor

    © © All Rights Reserved

    Formate disponibile

    TXT, PDF, TXT sau citiți online pe Scribd

    Vi se pare util acest document?

    Este necorespunzător acest conținut?

    Raportați acest document
    This script loops through all files matching the pattern ligand_*.pdbqt, extracts the name before the .pdbqt extension, echoes that it is processing that ligand, makes a directory with that name, and runs AutoDock Vina on the ligand file outputting results to files in the new directory.

    Drepturi de autor:

    © All Rights Reserved
    Descărcați ca TXT, PDF, TXT sau citiți online pe Scribd
    Indicator pentru conținut neadecvat
    18 vizualizări1 pagină

    Vina Screen Local

    Încărcat de

    Gigi Florica
    This script loops through all files matching the pattern ligand_*.pdbqt, extracts the name before the .pdbqt extension, echoes that it is processing that ligand, makes a directory with that name, and runs AutoDock Vina on the ligand file outputting results to files in the new directory.

    Drepturi de autor:

    © All Rights Reserved
    Descărcați ca TXT, PDF, TXT sau citiți online pe Scribd
    Indicator pentru conținut neadecvat
    din 1

    #!

    /bin/bash

    for f in ligand_*.pdbqt; do
    b=`basename $f .pdbqt`
    echo Processing ligand $b
    mkdir -p $b
    vina --config conf.txt --ligand $f --out ${b}/out.pdbqt --log ${b}/log.txt
    done

    S-ar putea să vă placă și