Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Los componentes del medio, como la triptona y el extracto de levadura, genómico completo como plantilla. Los cebadores para este experimento
se compraron a Oxoid (Thermo Fisher Scientific, Waltahm, MA). El orto- fueron 27 adelante (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3 ') y 1391 inversos
nitrofenil-β-dgalactopiranósido (ONPG) y el ditiotreitol se adquirieron en (5′-GACGGGCGGTGTGTRCA-3'). La cadena amplificada se sometió a
Sangon Biotech (Shanghai, China). Isopropil-β-d-tiogalactopiranósido y secuenciación de ADN en Biosune Biotechnology Co. Ltd. (Shanghai,
5-bromo-4-cloro-indolil-β-d-galactopiranósido (X-gal) se compraron en China) para un análisis adicional. Se utilizó el programa de alineación de
Sigma-Aldrich (Shanghai, China). El acetonitrilo se adquirió de Sigma- secuencias en línea NCBI BLASTN2.2.26 + (Zhang et al., 2000) para
Aldrich. El marcador de proteína de peso molecular se adquirió de comparar y analizar la identidad de la secuencia con los datos del ARN
Thermo Fisher Scientific. El kit de determinación de proteínas se adquirió ribosomal 16S bacteriano. Se infirió un árbol filogenético utilizando los
de Zoman Biotechnology (Beijing, China). El kit de determinación de datos de alineación con el software MEGA7 (Tamura et al., 2004; Kumar
glucosa se adquirió de Rongsheng Biotech (Shanghai, China). Las enzimas et al., 2016). Para la identificación de la cepa objetivo con experimentos
de restricción y la polimerasa se adquirieron de New England Biolabs fisiológicos y bioquímicos, la utilización de varias fuentes de carbono y los
(Beijing, China). Otros reactivos fueron de grado reactivo analítico. Los resultados de la producción de ácidos de varios azúcares se probaron de
anfitriones de Escherichia coli DH5α y BL21 (DE3) fueron existencias en acuerdo con los métodos descritos anteriormente (Hauben y Swings,
nuestro laboratorio. 2005).
La β-galactosidasa comercial derivada de Aspergillus oryzae se adquirió Producción y purificación de β-galactosidasa de Erwinia sp. E602
de Jiangsu Ruiyang Biotech Co. Ltd. (Wuxi, China). La leche utilizada para
La cepa E602 se rayó en medio TSA a 26ºC durante 24 h. Una sola colonia
el experimento de hidrólisis de lactosa fue leche fresca extraída de la
de la cepa se inoculó en 5.0 ml de líquido TSA y se cultivó con agitación
granja lechera local (Wuxi, China).
a 26 ° C durante 12 h. La cepa E602 se activó en medio TSA a 26 ° C
Aislamiento de cepa e identificación durante 24 h. Una sola colonia de la cepa se inoculó en 5.0 ml de líquido
TSA y se cultivó con agitación a 26 ° C durante 12 h. Se tomaron partes
Se tomó una muestra de suelo congelado de una granja forestal
alícuotas del cultivo y se inocularon en una proporción de 1% (vol / vol)
suburbana en Qiqihar (provincia de Heilongjiang, China) y se usó para la
en 100,0 ml de líquido TSA en un matraz y se cultivaron a 26 ° C durante
detección de cepas microbianas, que produjeron β-galactosidasa
15 h. La semilla secundaria se inoculó luego en una proporción de 1% (vol
adaptada al frío. El medio (triptona 15,0 g / L, peptona de soja 5,0 g / L,
/ vol) en 5.0 L de líquido TSA suplementado con lactosa (2.5 g / L) en un
K2HPO4 2,5 g / L, lactosa 2,5 g / L, extracto de levadura 3,0 g / L, NaCl
fermentador (New Brunswick Scientific, Edison, NJ) y se fermentó a 26 ° C
5,0 g / L, agar 15,0 g / L, pH 7,3– 7.5; TSA) se usó para el aislamiento de
Durante 18 h con la velocidad de agitación de 200 rpm. Las células de
las cepas diana. Se añadió una muestra de 10.0 g del suelo a 100.0 mL de
cultivo de la cepa E602 se recogieron y se sometieron a centrifugación a
líquido TSA y se cultivó a 12 ° C con agitación a 200 rpm. Después de 48
4 ° C y 10.000 x g durante 30 min en una centrífuga Beckman Avanti J-
h de cultivo, el cultivo se diluyó 10 veces y se sembró sobre la superficie
26xp (Beckman Coulter Inc., Fullerton, CA) y luego se trataron con
de medio TSA suplementado con lactosa (2,5 g / l, como un inductor para
sonicación. El sobrenadante se trató con saturación de sulfato de amonio
la producción de β-galactosidasa) y X-gal (1,0 mg / ml), seguido de
al 20% y luego se centrifugó a 4 ° C, 10.000 x g, durante 10 min. Después
incubación a 4 a 12 ° C durante 72 h. Las colonias azules que aparecieron
de la centrifugación, el sedimento se descartó y el sobrenadante se llevó
en las placas se recogieron todas y se inocularon en líquidos de TSA
a saturación de sulfato de amonio al 40%, seguido de centrifugación a 4
suplementados con lactosa (2,5 g / L) para una investigación adicional de
° C, 10.000 x g, durante 10 min. El sedimento se recogió y se disolvió en
las actividades de la β-galactosidasa a diferentes temperaturas. La cepa
10,0 mmol / l de PBS (pH 7,0) y se dializó a 0 ° C durante 12 h. La solución
con mayor actividad de β-galactosidasa a 10 ° C se seleccionó como la
resultante se sometió a cromatografía de intercambio aniónico, seguida
cepa objetivo de este trabajo y se denominó E602. La morfología celular
de cromatografía de filtración en gel. El proceso de cromatografía de
y de colonias de la cepa diana se determinó mediante tinción de Gram y
intercambio aniónico se realizó en un sistema purificador AKTA (GE
microscopía. Para la identificación de la cepa objetivo en un enfoque
Healthcare, Little Chalfont, Reino Unido) utilizando una columna HiPrep
16/10 DEAE y se equilibró con 20,0 mmol / l de Tris-HCl (pH 7,0). La enzima fueron Li +, Na +, K +, Mg2 +, Ca2 +, Zn2 +, Cu2 +, Fe2 +, Mn2 + y Pb2
diana se eluyó con una solución (que contenía 2,0 mol / L de NaCl y 20,0 +. También se examinaron los reactivos de tiol 2 mercaptoetanol y
mmol / L de Tris-HCl, pH 7,0) a gradientes (vol / vol) de 10, 15, 27, 33 y ditiotreitol, el inhibidor enzimático ácido p-cloromercuribenzoico y el
40%. La velocidad de elución fue de 5.0 mL / min. El proceso de agente quelante EDTA. La actividad relativa se estimó en los experimentos
cromatografía de filtración en gel también se realizó en un sistema anteriores en comparación con la actividad obtenida en el control.
purificador AKTA utilizando una columna HiPrep 16/60 Sephacryl S-100
Análisis cinético de la β-galactosidasa
(GE Healthcare). La β-galactosidasa se eluyó en 50.0 mmol / L de PBS
(150.0 mmol / L de NaCl, pH 7.0) a una velocidad de 0.5 mL / min. Los parámetros cinéticos (la constante de Michaelis, Km y la velocidad
de reacción enzimática máxima, Vmax) de la β-galactosidasa se
Ensayo de actividad enzimática
calcularon a partir de gráficos de Lineweaver-Burk utilizando ONPG
La actividad de la β-galactosidasa se determinó como se describió como sustrato. La concentración de ONPG osciló entre 0,8 y 10,0 mmol
anteriormente (Xia et al., 2010) con algunas modificaciones. La solución / l. Para el análisis de los efectos de inhibición de los reactivos similares
de sustrato de 5,0 ml (ONPG, 0,5 mg / ml, pH 7,0) se mezcló con 0,9 ml al sustrato sobre la β-galactosidasa, las soluciones de ONPG se
de PBS (pH 7,0) y la mezcla se mantuvo en un baño de agua a la agregaron con lactosa, galactosa y glucosa a concentraciones finales de
temperatura óptima de la enzima durante 30 minutos. Los 100.0 µL de 10.0, 100.0 y 100.0 mmol / L, respectivamente. Todos los experimentos
enzima purificada (0.02 mg / mL) se agregaron luego a la mezcla y se anteriores se llevaron a cabo a 40 ° C y pH 7.0.
hicieron reaccionar durante 10 min. Después de eso, la mezcla de reacción
Hidrólisis de la lactosa en la leche por la β-galactosidasa
se añadió a 75,0 mg / ml de solución de Na2CO3 para terminar la
reacción. La mezcla de reacción se mantuvo luego a 25ºC durante 15 Se agregaron quince unidades de la β-galactosidasa purificada a 5 ml
minutos, seguido de un ensayo de la absorbancia a 420 nm. Una unidad de leche fresca (que contiene 5% (peso / volumen) de lactosa). La
de actividad enzimática se definió como la cantidad de enzima que solución se incubó a diferentes temperaturas que oscilan entre 4 y 40 °
hidroliza 1 µmol de sustrato ONPG por minuto. La actividad específica de C durante 12 h. Cien microlitros de las partes alícuotas se retiraron cada
las β-galactosidasas se expresó en unidades por miligramo de proteína 2 h de la incubación y la β-galactosidasa se desnaturalizó añadiendo
enzimática. Este método se utilizó para la determinación de todas las ácido tricloroacético al 10%. Después de la centrifugación a 4 ° C, 10.000
propiedades enzimáticas, excepto para los parámetros especiales x g durante 15 min, los sobrenadantes se sometieron a un análisis de
mencionados en el contexto. concentración de glucosa para evaluar la relación de hidrólisis de la
lactosa láctea; Cada prueba se llevó a cabo en 3 pruebas separadas.
Determinación de propiedades de β-galactosidasa
Transglicosilación de lactosa por la β-galactosidasa y el ensayo GOS
Los efectos de la temperatura sobre la actividad enzimática se
determinaron a temperaturas que oscilan entre 0 y 60 ° C. La Se agregaron cuarenta y cinco unidades de la β-galactosidasa
termoestabilidad de la enzima se probó mediante la incubación de la purificada a 5,0 ml de solución de lactosa (300 mg / ml). La solución se
enzima a temperaturas que oscilan entre 10 y 50 ° C durante 6 h. Los incubó a 40 ° C durante 12 h. Después de eso, se retiraron 0,5 ml de la
efectos del pH sobre la actividad enzimática se determinaron a 40 ° C en parte alícuota y se incubaron en agua hirviendo durante 2 minutos para
tampones que variaban en un pH de 4.0 a 9.0. El perfil de estabilidad del inactivar la enzima, seguido de la detección de GOS con LC-MS.
pH de la enzima se determinó mediante la incubación de esta enzima a 4
Clonación de la secuencia de codificación para la β-galactosidasa de
° C durante 1 h en tampones PBS (pH 4.0–9.0), seguido de la
Erwinia sp. E602
determinación de la actividad a 40 ° C en condiciones estándar. Los
efectos de estos factores se evaluaron mediante la determinación de las El ADN genómico completo de la cepa E602 se extrajo utilizando el
actividades enzimáticas del residuo y se ilustraron como las actividades método del bromuro de cetil trimetilamonio (Healey et al., 2014). El ADN
relativas. Los efectos de varios reactivos químicos sobre la actividad extraído fue parcialmente digerido con la enzima de restricción Sau3AI.
enzimática se determinaron analizando las actividades del residuo Los fragmentos de ADN en la digestión con Sau3AI se recuperaron
después de incubar la enzima en 1,0 a 10,0 mmol / l de los reactivos mediante la recuperación del gel con longitudes de 2 a 4 kb y luego se
(disueltos en PBS, pH 7,0) a 25 ° C durante 20 min. Los cationes analizados subclonaron al plásmido pUC19 y al huésped de E. coli transformado
DH5α. Se seleccionaron y secuenciaron aproximadamente 1.000 2012), se sugirió que la cepa E602 era Erwinia rhapontici. Esta especie es
transformantes positivos (de aproximadamente 3.500 colonias) de la una bacteria patógena condicional de la nucleación del hielo para las
subclonación, en la que se seleccionaron los fragmentos de inserción de plantas, y rara vez se informa en China (Wang et al., 2017). Como la
aproximadamente 3 kb para el análisis de marco de lectura abierto (ORF). relación filogenética entre E602 y E. rhapontici no fue tan obvia, la cepa
El ORF de aproximadamente 3 kb de longitud luego se amplificó E602 todavía no se puede determinar finalmente como una especie de E.
respectivamente con PCR y se clonó en el plásmido de expresión inducible rhapontici. Sin embargo, este trabajo podría ser el primer estudio
pET28a (+) con el sitio de restricción NcoI y XhoI. Los plásmidos enzimático detallado sobre la β-galactosidasa obtenido del género
recombinantes se transformaron luego en el hospedador de E. coli BL21 Erwinia.
(DE3) y los transformantes se colocaron en placas de agar Luria-Bertani
(LB) suplementadas con kanamicina (50.0 µg / mL), isopropil-β-d-
tiogalactopiranósido (1,0 mmol / L ), y X-gal (1.0 mg / mL). Las colonias Producción y purificación de β-galactosidasa de Erwinia sp. E602
azules se recogieron para secuenciar y verificar las secuencias de
Cultivamos la cepa E602 con inducción de lactosa para la producción
inserción.
de β-galactosidasa. La enzima producida se trató primero con
RESULTADOS Y DISCUSIÓN precipitación con sulfato de amonio y luego la enzima diana se purificó
aún más mediante separaciones en 2 etapas: cromatografía de
Aislamiento e identificación de β-galactosidasa que produce Erwinia sp.
intercambio aniónico y cromatografía de filtración en gel (los resultados
E602
se enumeran en las Figuras Suplementarias S1 y S2; https://doi.org/
El aislamiento de la cepa productora de β-galactosidasa se llevó a cabo 10.3168 / jds.2018-14605). La elución correspondiente al pico único se
mediante el análisis de colonias azules de las muestras diluidas colocadas recogió para el ensayo de actividad enzimática β-galactosidasa. Los
en placas de agar selectivas, seguido de una nueva prueba de la actividad procedimientos de purificación y los resultados de la enzima se
enzimática de las colonias y las identificaciones de cepas. Un total de 80 resumieron en la Tabla 2, que representó las actividades específicas y
aislados microbianos que mostraron colonias azules en placas de TSA los pliegues de purificación en los pasos. Después de estos
suplementadas con lactosa y X-gal se recogieron para los ensayos de β- procedimientos de purificación, la actividad enzimática final alcanzó
galactosidasa; 15 aislamientos produjeron β-galactosidasa activa a bajas 177.00 U / mg de proteína con una pureza de más de 100 veces la
temperaturas (0–12 ° C). La cepa con la mayor actividad de β- muestra original. Las muestras de enzimas de cada etapa de purificación
galactosidasa a 10 ° C se denominó E602. Las células de la cepa E602 se sometieron a un análisis de SDS-PAGE al 12% y la β-galactosidasa
tenían forma de barra, de 0,5 a 1,0 µm de ancho y de 1,0 a 2,0 µm de largo, final purificada mostró una banda única de aproximadamente 110 kDa
apareciendo individualmente o en pares, gramnegativas y no formadoras (Figura 2).
de endoesporas. Esta cepa mostró una colonia blanca lechosa con un
Perfiles de temperatura y pH de β-galactosidasa
poco de brillo metálico en medio TSA y tuvo un rango de temperatura de
crecimiento de 4 a 30 ° C con un crecimiento óptimo a 26 ° C. Para la El efecto de la temperatura sobre la actividad enzimática se estudió a
identificación de esta cepa, la secuencia codificante de su ARNr 16S se temperaturas que oscilan entre 0 y 60 ° C a pH 7.0. La enzima purificada
amplificó por PCR a partir del ADN genómico de la cepa E602. El mostró la actividad máxima a 40 ° C (Figura 3A), que es similar a la
fragmento amplificado de 1,5 kb se sometió a alineación BLAST con la temperatura de reacción óptima de la β-galactosidasa adaptada al frío
secuencia de ADNr 16S bacteriana en línea (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov). de Pseudoalteromonas sp. 22b (Turkiewicz et al., 2003). Además, la
El árbol filogenético (Figura 1) se obtuvo utilizando los algoritmos de enzima en este trabajo retuvo cerca del 10% de la actividad a 0 ° C y
unión de vecinos en el software MEGA7. Los resultados del análisis 16S aproximadamente el 15% de la actividad a 10 ° C (Figura 3A), lo que
rDNA sugirieron que la cepa E602 pertenece al género Erwinia. Para sugiere una propiedad adaptada al frío de esta enzima. La
identificar la cepa E602 a las especies, se realizaron experimentos termoestabilidad de la enzima se determinó mediante incubación a 10,
fisiológicos y bioquímicos para probar la utilización de varias fuentes de 20, 30 y 40 ° C durante 6 h (Figura 3B). Los resultados mostraron que
carbono y la producción de ácido de varios azúcares. Los resultados se más del 85% de la actividad enzimática permaneció después de 6 h de
enumeraron en la Tabla 1. Según las características diagnósticas incubación a 10 ° C, y aproximadamente el 85% permaneció después de
publicadas por estudios previos (Hauben y Swings, 2005; Thapa et al.,
1 h de incubación a 40 ° C. La semivida enzimática de la β-galactosidasa lactosa era el sustrato natural de esta enzima. La Ki para lactosa y
a 10, 20, 30, 40 ° C fue de 13, 11, 8 y 7 h, respectivamente. También se galactosa fue de 7.00 y 36.84 mmol / L, respectivamente.
probó la termoestabilidad de la enzima a 50 ° C (figura no mostrada) y
Prueba de hidrólisis de lactosa en leche y transglicosilación por β-
la vida media de la enzima a esta temperatura fue de 2 min. Después
galactosidasa
de la incubación de la enzima a 50 ° C durante 15 min, la enzima se
inactivó casi por completo. La capacidad de hidrólisis de la lactosa de la β-galactosidasa purificada
de la cepa E602 se probó con leche fresca a diferentes temperaturas
Los perfiles de pH de la enzima se muestran en la Figura 4.mLa enzima
(Figura 6). Los resultados mostraron que la relación de hidrólisis de
mostró su actividad enzimática máxima cerca de pH 7.0 y retuvo más
lactosa en la leche alcanzó el 60% después de 12 h de hidrólisis a 30 °
del 80% de su actividad en el rango de pH de 6.5 a 7.5 (Figura 4A), lo
C. Cuando la reacción se llevó a cabo a 40ºC, se necesitaron 8 h para
cual es una buena propiedad con respecto al procesamiento de leche
hidrolizar el 50% de la lactosa. La velocidad de hidrólisis fue lenta a
porque el pH de la leche está cerca de 6.7. El ensayo de estabilidad del
temperaturas por debajo de 20 ° C, pero la relación de hidrólisis de
pH mostró que esta enzima era estable en el rango de pH de 5.0 a 8.0
lactosa a 4 ° C todavía alcanzó el 5,4% después de 12 h de reacción, lo
(Figura 4B). La actividad enzimática relativa se mantuvo
que indica que la reacción de hidrólisis se puede realizar durante las
aproximadamente 55% a pH 4.0 y más de 80% a pH 9.0, que es
etapas de transporte y almacenamiento de la cadena de frío de la leche,
ligeramente mejor que la β galactosidasa adaptada al frío nativa de
que Podrían realizar partes de las tareas de hidrólisis de la lactosa. En
Pseudoalteromonas sp. 22b (Cieśliński et al., 2005). Una comparación en
consideración a la rápida inactivación de la enzima a 50 ° C, la capacidad
la actividad específica, la temperatura y los perfiles de pH de esta
de hidrólisis de la lactosa a temperaturas más bajas es una buena
enzima con los de las otras β-galactosidasas adaptadas al frío (incluida
propiedad para el proceso de hidrólisis de la lactosa real. La reacción
una enzima comercial utilizada en la planta lechera local) se incluye en
de hidrólisis se puede realizar a temperaturas moderadas y se puede
la Tabla 3. Los resultados mostraron que la β- La galactosidasa obtenida
terminar por completo en los procesos de pasteurización o UHT; por lo
en nuestro trabajo tenía propiedades similares a las otras enzimas
tanto, la relación de hidrólisis se puede controlar fácilmente para
enumeradas y fue incluso ligeramente mejor que la comercial.
mantener la calidad uniforme de la leche procesada.
CONCLUSIONES