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1 Thayer School of Engineering, Dartmouth College, Hanover, New Hampshire 03755; e-mail:
percival.zhang@dartmouth.edu , Lee.R.Lynd@dartmouth.edu
Publicado en línea el 10 de noviembre de 2004 Wiley InterScience (www.interscience.wiley.com). DOI: 10.1002 / bit.20282
Resumen: La información relativa a la hidrólisis enzimática de la celulosa por Henrissat, com. Commun.). También durante este periodo, se han introducido
sistemas de enzimas celulasa no complejados se revisa con un énfasis particular en sistemas de clasificación basados estructuralmente extensas para ambos
el desarrollo de la comprensión agregada que incorpora características de sustrato
módulos catalíticos y de unión a celulosa, y han dado lugar a nuevos
además de la concentración y múltiples componentes de celulasa. Temas
conocimientos e hipótesis con respecto a la evolución de los sistemas de
considerados incluyen propiedades de celulosa, adsorción, hidrólisis de la celulosa,
y los modelos cuantitativos. Se propone un esquema de clasificación para los celulasas (Henrissat, 1991; Henrissat y Bairoch, 1993, 1996 ), actualizado con
modelos cuantitativos para la hidrólisis enzimática de la celulosa basado en el frecuencia en http //: afmb.cnrs.mrs.fr/CAZY.
número de actividades solubilizantes y variables de estado sustrato incluidos.
Sugerimos que ha llegado el momento de revisar y revitalizar el modelado funcional
Para que el gran volumen de información disponible en componentes de
de hidrólisis de la celulosa, segundo 2004Wiley periódicos, Inc.
celulasa para ser ejercida sobre las aplicaciones principales que motivan
interés en la hidrólisis de celulosa,
por ejemplo, la conversión de biomasa producida renovable a los combustibles y productos
químicos de los productos básicos, es necesario incorporar esta información en una comprensión
de los sistemas de celulasa compuestos de múltiples componentes con distintos modos de acción.
La situación se complica aún más debido a la acción de los sistemas enzimáticos de celulasa se ve
palabras clave: adsorción; celulosa; celulasa; hidrólisis; modelo cinético
afectada por las propiedades del sustrato además de la concentración como el grado de
particular que está siendo investigado y el cambio como la avanza la reacción. En el curso de la
INTRODUCCIÓN búsqueda de una 'comprensión de la hidrólisis enzimática de la celulosa '' agregados' que incorpora
un modelo cuantitativo, que puede ser utilizado para formular rápidamente nuevos hipótesis de
Tecnología para probar si la comprensión de componentes de celulasa y sus interacciones es suficiente para
números de contrato de subvención: DE-FG02-02ER15350 y 60NANB1D0064 explicar una observación dada. Además, una vez que se valida un modelo cuantitativo, que puede ser utilizado para f
(Hoshino et al., 1997; Lee et al, 1982;.. Sinitsyn et al, 1991), celulosa 1999; . Fierobe et al, 2002) proporcionan ejemplos de celulosa altamente
bacteriana de xylinum Aacetobacter ( Boisset et al., 1999; Gilkes et al., cristalina, mientras que el ácido fosfórico de celulosa hinchadas y celulosa
1992; Valjamae et al., 1999), y la celulosa de la alga Valonia ventricosa ( Boissetmolino de bolas son considerados como celulosa amorfa (Hoshino et al., 1997;
et al., Lee et al, 1982;. Ooshima
Avicel 0,5-0,6 20 300 0.33 DP norte se puede medir por membrana o presión de vapor osmometría,
antes de Cristo 0,76-0,95 200 2000 0.05 crioscopía, ebulloscopia, la determinación de la reducción de la concentración
PASC 0-0,04 240 100 1.0 final, o microscopía electrónica (Krassig, 1993). DP W
Algodón 0,81-0,95 n / A. 1000-3000 ,1-,033
Papel de filtro - 0.45 n / A. 750 0.13
se puede medir sobre la base de dispersión de luz, equilibrio de sedimentación,
La pulpa de madera 0,5-0,7 61-55 500-1500 0,06-0,2
y de rayos X pequeña dispersión de ángulo, y DP V se mide en base a la
1 BC, celulosa bacteriana; PASC, ácido fosfórico celulosa hinchada; CrI marca el índice de
viscosidad. La viscosidad de celulosa o derivados de celulosa disuelta se ha
cristalinidad; SSA marca el área de superficie específica por BET; DP norte denota el grado de
encontrado a la igualdad:
polimerización promedio en número; F RE denota la fracción de extremos reductores.
Accesibilidad
Figura 2. valores DP típicos de celulosa y celodextrinas solubles. NC, algodón natural; NW, madera Walker, 1992;. Stone et al,
natural; P, pulpa; CT, borra de algodón; FP, papel de filtro.
R ¼ K PAG W máx re 8 Þ
celulasas enumerados en la Tabla II, incluyendo CBH1 en BMCC en 4 j C 1999). La adsorción de las MCM desde T. fusca Cel5A, Cel6B, Cel48A en
(Reinikainen et al, 1995b;.. Srisodsuk et al, 1993) y 50 j C (Bothwell et al., BMCC era reversible a baja concentración pero no se observó irreversibilidad
1997; Tomme et al, 1995b.), CBH1 en Avicel a 20-25 j C (Kim y Hong, 2000; a altas concentraciones de celulasa, aparentemente debido al atrapamiento
Stahlberg et al, 1991;. Tomme et al., 1990), y celulasa no fraccionada intersticial (Jung et al., 2002).
adsorber a Avicel en 4 j C (Lee et al, 1982;.. Lu et al, 2002;. Ooshima et al,
1983). Esta reproducibilidad sugiere que los métodos experimentales para la En un reactor discontinuo agitado, la intensidad de la agitación tiene poco efecto
medición de parámetros de adsorción pueden ser suficientemente sobre la hidrólisis de celulosa, siempre y cuando las partículas de celulosa se
normalizados tal que los valores de diferentes laboratorios pueden suspenden completamente (Huang, 1975). Jervis et al. (1997) estudiaron la difusión
compararse significativamente. Sugerimos que puede ser útil para calibrar superficial de Cellulomonas fimi celulasas Cex y CenA en la superficie de Valonia
técnicas con las mediciones realizadas en condiciones bien caracterizados ventricosa
cuando la presentación de datos de adsorción. Además de las variables celulosa microcristalina usando recuperación después de fluorescencia
experimentales, diferentes métodos de regresión pueden llevar a diferentes photobleaching (FRAF). Basado en la comparación del valor de coeficiente de
valores para los parámetros (Bothwell y Walker, 1995). difusión y la actividad celulasa específica, estos investigadores inferirse que la
difusión externa de celulasa no es un factor limitante de la velocidad para toda la
reacción. En general, los experimentos que examinan velocidad de agitación
también sugieren que la difusión externa de celulasa en la superficie no es limitante
Ghose y Bisaria (1979) encontraron que las endoglucanasas adsorben de la velocidad (Fan et al, 1981;. Fan y Lee, 1983). Pero cuando el área interna es
preferentemente en relación con celobiohidrolasas. Pero Ryu et al. (1984) mucho más grande que la superficie externa, la cual
encontraron que la celulasa contenía fuertemente ad-
es el caso para la mayoría de sustratos celulósicos, es probable que algunos de celulasa está cupied por una molécula de celulasa adsorbido es mucho más grande que el
atrapado en los poros, dando como resultado velocidades de hidrólisis más bajas. área de la red celobiosa repetición (mostrado en la Fig. 1b) para todas las
celulasas para el que se dispone de información. Como resultado, el número de
moléculas de celulasa que se puede unir a una superficie de celulosa es, en
general, sustancialmente menor que el número de celosías celobiosa accesibles
sobre esa superficie. Adsorción de celulasa exhibe una preferencia por el 110
Análisis espacial de adsorción y inferido Accesibilidad de
cara (Fig. 1b) en tanto T. reesei CBH1 (Chanzy et al, 1984;. Lehtio et al., 2003) y C.
Celulosa
fimi celulasas (Gilkes et al.,
Análisis de adsorción en términos espaciales es un requisito previo para la
comprensión de hidrólisis de la celulosa a un nivel mecanicista, y también proporciona 1992). Parece razonable plantear la hipótesis de que esto es cierto en general ya
un enfoque potencialmente poderosa para la evaluación de la accesibilidad de que esta es la cara en la que h- enlaces glucosídicos son accesibles por celulasa.
enzimas de celulasa. El área OC-
Tensión Enzima Temperatura. ( j DO) La actividad específica (sustrato) ( UNA mol GE / mg / min) Referencia
Gilkes et al. (1992) parámetros definidos compatible con una interpretación BMCC se ha usado en la mayoría de los estudios dirigidos a la determinación de
espacial de adsorción y incorporado estos parámetros en una ecuación de valores de los parámetros para el análisis espacial de adsorción. Esto es
Langmuir modificada: probablemente debido a la geometría de BMCC está bien establecida, en contraste
con la mayoría de otros substratos celulósicos. En particular, BMCC existe como una
Puede observarse molécula de celulasa que las celosías celobiosa ocupados En este momento, la mayor cantidad de información relevante para estimar el valor
/ atado, una, puede calcularse a partir de: de una está disponible para su C. fimi y T. reesei.
por C. fimi, Gilkes et al. valores (1992) de estimación de 32,9,
una ¼ norte 0 = UNA máx re 10 Þ
39.2 y 27.9 para Cena, el dominio de unión a celulosa de Cena, y Cex,
respectivamente. El dominio catalítico de CBH1 se cree que ocupar
Para una celulasa con un valor dado de una, el área de superficie accesible a
aproximadamente 48 retículas de celobiosa en una superficie totalmente
que celulasa (AS, m 2 / g) puede calcularse a partir de la capacidad máxima de
anisotrópico (Sild et al., 1996), basado en información estructural inferirse de
adsorción como sigue:
cristalografía de rayos X (Divne et al., 1994). El CBM de CBH1 de T. reesei se
donde N A = constante de Avogadro (6,023 10 23 moléculas / mol), A G2 = área 1995b). Reinikainen et al. (1995b) informaron de un rango de valores para UNA
máx para CBH1 unión a BMCC, a partir de qué valores de una 15 a 40 puede
de la red celobiosa (0,53 1,04 nm =
5.512 10 19, metro 2; Gardner y Blackwell, 1974a). ser calculado usando la Ec. [10]. Estos autores estiman un valor de
El valor de COMO es dependiente del valor de una, que variará alrededor de 40 para una, que es muy cercano al valor de 38,7 estimado por
dependiendo de la enzima está bajo consideración. Para sustratos de Tomme et al. (1995b) y es intermedio entre el tamaño del dominio catalítico y
celulosa pura, la fracción de el CBM. Desde la unión de CBHI se produce principalmente a la cara
h- enlaces glucosídicos accesibles a celulasa con respecto al número total de reactiva de BMCC (Chanzy et al, 1984;. Gilkes et al, 1992;.. Lehtio et al,
enlaces glucosídicos (F una) Se define como: 2003), el valor de una también puede estimarse a partir de la relación del
área de superficie reactiva a la superficie total de
F una ¼ 2 una UNA máx MW anhidroglucosa re 12 Þ
Sobre la base de un representante UNA máx valor de 4,6 UNA mol / g para
CBH1 adsorción a BMCC en 50 j C (Tabla II) y una en el rango de 15-40, hidrólisis de la celulosa
como valores para BMCC de 23-61 m 2 / g puede calcularse utilizando la
ecuación. [11]. Este valor corresponde al 18-50% del total de la superficie
Sobre el mecanismo de hidrólisis de la celulosa (no
externa de la cinta MBCC (15 m 2 / sol). A pesar de una valor, parece que la
complejados Systems)
celulasa no se adsorbe a una fracción significativa de la superficie externa de
BMCC. A partir de la hipótesis original de Reese para la acción de C1 (Reese et al,
1950, 1968;. Reese, 1976), ha habido sugerencias de que el mecanismo
Para Avicel (FMC PH105), 0,48 UNA mol / g es un representante A máx valor de hidrólisis de la celulosa implica la ruptura física de la celulosa insoluble
para la adsorción CBH1 en 50 j C (Tabla II), de la que el AS CBH1 de Avicel se además de endo- y exo-actuación enzimas. La importancia de tales
encuentra que es 6,4 m 2 / g usando la Ec. [10] con un valor de 40 asumido para a. trastornos, así como los componentes de celulasa responsables de la
el AS CBH1 valor de Avicel PH 105 es mucho más grande que el área de la misma, aún no está del todo claro. Coughlan (1985) utilizó el término ''
superficie externa (0,3 m 2 / sol; Weimer et al., 1990), indicando que amorphogenesis '' para describir los cambios físicos (es decir, hinchazón,
segmentación, o desestratificación de celulosa) que potencian la hidrólisis
> F 95% de área accesible es interna. Sin embargo, como CBH1 es mucho menor enzimática y rinden celulosa cristalina más accesible a celulasa. El
que la superficie total accesible al nitrógeno, F 20 m 2 para Avicel (Marshall y aumento de la accesibilidad de celulosa durante la hidrólisis enzimática se
Sixsmith, 1975), indicativo de la presencia de una amplia área de superficie ha atribuido a muchos factores. Estos incluyen H 2 O 2 producción en
interna en poros demasiado pequeños para ser visitada por moléculas de presencia de iones Fe (Koenigs, 1975), o el factor de formación de
celulasa. Consideración de Avicel y BMCC muestra claramente que la magnitud shortfiber-en filtrados de T. koningii ( Halliwell y Riaz, 1970), o T. reesei CBH1
del área de la superficie externa, interna, y bruto, así como la importancia (Chanzy et al, 1983;.. Lee et al, 2000) (. Lee et al, 1996) o su dominio
relativa de estos, es bastante diferente para diferentes sustratos. Usando la catalítico o el dominio catalítico CBH2, (Woodward et al., 1992)
ecuación. [12] con a = 40, F una se encuentra que es 6,0% para BMCC y 0,62%
para Avicel.
Los datos disponibles sugieren que el área accesible a las enzimas T. reesei complejo endoglucanasa-exoglucanasa (Sprey y Bochem, 1993), Humicola
celulasa, como se indica, por ejemplo, por AS CBH1, insolens CBH2 (Boisset et al.,
varía ampliamente dependiendo del sustrato. Además de la diferencia de 10 veces para 2000), Thermomonospora fusca celulasas E3 y E5 (Walker et al., 1990,
AS CBH1 se ha indicado anteriormente para BMCC en comparación con Avicel, los 1992), algunos dominios no catalíticos de celulasa tales como el CBM de C.
estudios usando no fraccionada T. reesei fimi endoglucanasa A (Din et al., 1991, 1994), un polipéptido corto
celulasa han informado de una 3 veces mayor capacidad de adsorción de generación de fibra de T. pseudokoningii ( Wang et al., 2003), una T. reesei
celulasa para Solka Floc SW40 en comparación con Avicel, y una 20-carpeta
mayor capacidad para PASC comparación con Avicel (Lee et al, 1982 (Steiner proteína formador de fibrillas (MW = 11,4 kD) (Banka et al., 1998), y una
et al., 1988);. Morag et al ., 1995). zona accesible en el orden Avicel <BMCC novela T. reesei proteína llamada swollenin (MW = 49 kD) (Saloheimo et al.,
<PASC también es apoyado por los datos de los CBM aislados a partir de C. 2002).
fimi ( Ong et al., 1993) y de Celk de C. thermocellum Se observa ampliamente que la estructura heterogénea de celulosa da lugar
a una rápida disminución de la frecuencia a medida que avanza la hidrólisis,
(Kataeva et al., 2001). incluso cuando se toman los efectos de la desactivación celulasa y la inhibición
Para materiales lignocelulósicos pretratados, la adsorción a la lignina del producto en cuenta (Zhang et al., 1999; Valjamae et al, 1999. ). Al explicar
típicamente se produce al mismo tiempo que la adsorción a la celulosa. Ooshima esta observación en un nivel mecanicista es una cuestión pendiente, con
et al. (1990) estimaron que la capacidad máxima de adsorción para no importantes implicaciones fundamentales y aplicadas. Aunque muy poco se ha
fraccionada T. reesei celulasa con respecto tanto a la celulosa y la lignina hecho que implica una caracterización detallada, parecería lógico esperar que la
presente en la madera dura diluida-acidpretreated. Encontraron la capacidad de disminución de la reactividad
adsorción
Cuando los sistemas de enzima celulasa actúan in vitro sobre sustratos celulósicos
insolubles, tres procesos ocurren simultáneamente: 1998). Por lo tanto, la hidrólisis enzimática de celodextrinas de longitud 4-6
1) cambios físicos en el residual (todavía no solubilizado) celulosa en fase asociada con la fase sólida puede ser una parte importante del proceso
sólida química y; 2) hidrólisis primaria, que implicaba la liberación de general de solubilización para sustratos cristalinos, pero no para sustratos
intermedios solubles a partir de la superficie de reacción de moléculas de amorfos.
celulosa; y 3) la hidrólisis secundaria, que implica la hidrólisis de los La mayoría de los datos disponibles sobre la hidrólisis de celulosa se refiere a la
intermedios solubles para bajar intermedios peso molecular, y en última velocidad de solubilización (proceso 2) anterior, a menudo basado en la liberación de
instancia a la glucosa, como se muestra en la Figura 3. Los cambios azúcares reductores o equivalentes de glucosa soluble. En nuestra opinión, una
químicos en celulosa residual se manifiestan como cambios en la DP y la mejor caracterización de los cambios químicos y físicos asociados con la celulosa
concentración final de la cadena. Endoglucanasa aumenta la residual, así como la hidrólisis secundaria son prometedoras áreas de investigación
concentración de extremos de cadena y disminuye significativamente DP con el fin de mejorar la comprensión fundamental de la hidrólisis de la celulosa.
atacando porciones interiores de las moléculas de celulosa.
Exoglucanasas acortan DP de forma incremental y sólo ocasionalmente
disminuir la concentración de extremos de cadena. Así,
Las celulasas del género Trichoderma han recibido una atención intensiva debido en
parte significativa de los altos niveles de celulasa secretada. Trichoderma viride es
un agregado de especies válidas, que se utiliza para todos desconocida Trichoderma
especies; mientras que todos T. reesei se desarrolló a partir de un único aislado
(QM6a), llamado así en reconocimiento de las contribuciones pioneras de Elwin
Reese. La mayoría de las celulasas comerciales se producen a partir Trichoderma spp.,
con unos pocos también producido por Aspergillus niger ( Esterbauer et al., 1991;
Nieves et al.,
Tabla IV. La actividad específica de Trichoderma componentes de celulasa sobre sustratos solubles.
C. stercorarium Exo / endo 0.7 (a) 1.4 a 2.1 (Av) Riedel et al., 1997
C. thermocellum Exo / endo 2,5 (Av) 2,9 (FP) Tuka et al., 1992
Humicola insolens (CBH1 + CBH2) / EG1 6.8 (BC) Boisset et al., 2001
S. rolfsii CBH / EG 1,8 (AC) 4,9 (Av) 3.9 (ct) Sadana, 1985
S. pulverulentum Exo / endo 1 (AC) Streamer et al., 1975
T. koningii CBH / EG 7,6 (ct) Madera y McCrae, 1978
T. reesei CBH1 / EG1 1.3 a 1.4 (Av) Medve et al., 1998
T. reesei (CBH1 + CBH2) / EG1 1.5-2 2 ( AV) Woodward et al., 1988a
T. reesei CBH1, CBH2 / EG1 F 2 (Av) Baker et al., 1998
T. reesei CBH1 / EG1 F 1,5-2 (b) Srisodsuk et al., 1998
T. reesei CBH1 / EG1 1.7 (c) 4.1 (c) 7.8 (BC) Valjamae et al., 1999
T. reesei CBH1 / EG2 1,5 (AC) 2,1 (Av) 3,2 (ct) Hoshino et al., 1997
T. reesei CBH1 / EG2 F 6 (BC) Valjamae et al., 1999
T. reesei CBH1 / EG1 2,2 (Av), 2,5 (d) 3 (FP) 5 (BC) Henrissat et al., 1985
T. viride CBH1 / EG2 1.2 (e) 5 (f) 10 (BC) Samejima et al., 1998
T. viride Exo / endo 1,8 (AC) 1.7 a 3.5 (Av) Beldman et al., 1988
T. viride Exo / endo 2,1 (Av) Kim et al., 1992
* Av, Avicel; FP, papel de filtro; ct, algodón; BC, celulosa bacteriana; AC, celulosa amorfa; a, tratadas con ácido Avicel; b, algodón tratado con ácido; c, tratada con ácido BC; d, se homogeneizó Avicel; e,
tratada con ácido BC; f, SO 2- BC tratada.
inante papel en la determinación de si el DS es grande o pequeño. En apoyo de sis puede ser de aproximadamente 100 veces más rápido que las tasas de hidrólisis
esta interpretación, observamos que el orden anteriormente enumerados de de la celulosa en las condiciones previstas para procesos industriales y / o usando
sustratos celulósicos con respecto a DS es el mismo que el orden con respecto sustratos modelo cristalino.
al grado de polimerización (ver Celulosa, arriba) y también es consistente con Además de cualquier diferencia en la reactividad intrínseca de
los resultados de modelado (Okazaki y Moo-joven , 1978). Superior sinergia h- glucanos ligados en comparación con una- glucanos con enlaces, tres
endo-exo se ha informado de sustratos que han sido tratadas para reducir CrI, propiedades de la celulosa y el almidón de influir en sus velocidades de
por ejemplo, se homogeneizó Avicel vs. Avicel (Henrissat et al., 1985) y la hidrólisis: 1) la fracción de bonos accesibles para sustratos insolubles, 2) la
bola-blanqueado Solka Floc vs. Solka Floc (Fan et al., 1981). Sin embargo, disponibilidad de cadena termina para sustratos insolubles, y 3) las solubilidades
Hoshino et al. (1997) observaron DS superiores como CrI aumentó. Como se ha de los productos de hidrólisis. La fracción de enlaces glucosa-glucosa
señalado anteriormente en nuestra discusión de la IRC, es difícil atribuir los accesibles, F una, varía de menos de 0,002 a 0,12 para la celulosa (basado en la
cambios observados con la IRC en base a los trabajos que impliquen Ec. [11] con a = 40). Esto es 8-500 veces menor que para el almidón soluble ( F a = 1),
tratamientos que también cambian de área de superficie accesible. solubles malto-oligosacáridos, o derivados de celulosa solubles como CMC ( F a = 1),
y es 5-200 veces menor que el almidón insoluble ( F a = F 0,2; Fujii et al., 1981). La
baja fracción de bonos accesibles se cree que limitar las tasas de interior
escisión del enlace. Cadena disponibilidad final (por ejemplo, por unidad de
Además al sustrato propiedades, condiciones experimentales también masa) es más baja para la celulosa de las de fécula debido a la alta DP de la
afectan a la extensión de la sinergia observada. Se ha informado de que la celulosa, así como la incidencia de ramificación en almidón. Para la celulosa, la
sinergia endo-exo aumenta con un aumento en la carga de enzima debajo de relación de unidades glucosilo por extremo de la cadena es igual a la DP y oscila
la saturación, pero disminuye con la enzima sobresaturado carga (Tuka et al., entre 300-2.000 (ver grado de polimerización, más arriba). Para el almidón, que
1992; Watson et al, 2002;.. Woodward et al, 1988a, b; Woodward, exhibe ramas cada 17 a 26 unidades de glucosa (Bertoldo y Antranikian, 2002;.
Bueleon et al, 1998), cada rama da lugar a un nuevo extremo de la cadena y la
1991). Además, se informa de tal sinergia a ser mayor en las condiciones proporción de unidades de glucosilo a extremos de la cadena está de este modo F
elegidas para minimizar la inhibición por productos de hidrólisis solubles en velocidades de hidrólisis 22. celulosa se cree que limitado por la disponibilidad
algunos (Fierobe et al, 2001, 2002;. Srisodsuk et al., 1998), pero no todos de cadena extremos para celobiohidrolasa (Schulein, 2000; Valjamae et al,
(Eriksson et al., 2002; Medve et al., 1998) estudios. 2001;. Zhang y Wilson, 1997), y la limitación de final de cadena también se ha
propuesto para la acción de glucoamilasa en maltosaccharides (Mazur y
Nakatani, 1993). Considerando celodextrinas son esencialmente insolubles en
DP> 6-10 (Miller, 1963;. Pereira et al, 1988; Zhang y Lynd, 2003).,
Maltooligosacáridos son solubles a DP hasta 60 (John et al,
Comparación de la celulosa y almidón Hidrólisis tarifas
Semimechanistic Basado en un modelo de adsorción defendible . correlación de datos . La comprensión a nivel de características de
a. con respecto al Concentración el único . diseño del reactor sustrato y actividades enzimáticas múltiples
sustrato varible estado sustrato . Identificación de las características esenciales
variables de estado sustrato, además de la comprensión a nivel de . Estado de desarrollo de modelos y disponibilidad
concentración, múltiples actividades características de sustrato y de los datos actualmente limitan la aplicación
basado estructuralmente Basado en información estructural . diseño molecular . Un reto para desarrollar modelos cinéticos
perteneciente a componentes de celulasa . Pruebas y desarrollo de la comprensión de la significativas sobre la base de la información
estructuralmente. '' En un grado mucho mayor que los modelos en otras categorías, modelos
basados estructuralmente son útiles para el diseño molecular, así como pruebas y desarrollo de la Sattler et al. (1989) desarrollaron la siguiente ecuación para describir la
comprensión de la relación entre estructura y función celulasa. Derivación de modelos cinéticos conversión fraccional final después de la hidrólisis enzimática de pretratada
significativas basadas en modelos estructurales no se puede hacer en este momento, y espera álamo en relación a la carga de celulasa:
grandes avances en el campo general de inferir la función de proteínas de estructura. Observamos
que la gran mayoría de los modelos cinéticos disponibles no tienen en cuenta los cambios en la Y ½ EK þ
¼ Y máx re 15 Þ
velocidad de hidrólisis en el transcurso de la hidrólisis, y los que representan estos cambios do 0 do 0 ½ mi
modelos basados estructuralmente son útiles para el diseño molecular, así como pruebas y donde Y / C 0 da la fracción de sustrato hidrolizado; [E] se da en la FPU / g de
desarrollo de la comprensión de la relación entre estructura y función celulasa. Derivación de sustrato añadido inicialmente (sustrato / g FPU); e y max / do 0 es la fracción de
modelos cinéticos significativas basadas en modelos estructurales no se puede hacer en este sustrato que máximamente podría ser hidrolizado a una carga enzimática
momento, y espera grandes avances en el campo general de inferir la función de proteínas de infinita, es decir, la digestibilidad máxima. Más tarde, Adney et al. (1994)
estructura. Observamos que la gran mayoría de los modelos cinéticos disponibles no tienen en aplicaron este modelo para describir la hidrólisis de celulosa tal como
cuenta los cambios en la velocidad de hidrólisis en el transcurso de la hidrólisis, y los que Sigmacell 50 y varias de madera-polvos pretratados.
representan estos cambios utilizando parámetros empíricamente armarios en lugar de parámetros
Un ejemplo
basados mecánicamente. modelos basados estructuralmente son útiles para el diseño molecular, así como pruebas de un
y desarrollo modelo
de la con lade
comprensión velocidad
la relaciónde reacción
entre (V) ycomo
estructura una
función salidaDerivación
celulasa. es el de modelos ciné
propuesto por Holtzapple et al. (1984c):
Modelos Nonmechanistic
V ¼ Ð X máx X Þ 2 re dieciséis Þ
t 1 = 2 X máx
modelos Nonmechanistic en la literatura proporcionan correlaciones, ya sea
para la conversión fraccional o la velocidad de reacción como una función de
donde X máx es la conversión máxima, X es la conversión, y t 1/2 está
varios factores. Factores incorporados en modelos con la conversión como la
alcanzando el tiempo 0,5 * X máx. Impulsada por la observación de que
salida incluyen carga enzimática y la concentración de sustrato (Sattler et al.,
disminuye la tasa con el aumento de la conversión, Ooshima et al. (1982)
propusieron la relación:
1989), así como propiedades biomasa pretratada (Chang y Holtzapple,
2000; Gharpuray et al, 1983;.. Koullas et al, dV
re 17 Þ
1992). Factores incorporados en modelos con la tasa como la salida dX ¼? kV
incluyen el tiempo de hidrólisis; (. Ooshima et al, 1982) (Karrer et al, 1925.
Miyamoto y Nisozawa, 1945), la enzima de cargar (Miyamoto y Nisozawa, en la que V es la velocidad de hidrólisis y X es la conversión.
1945), y la conversión de celulosa. Unos modelos nonmechanistic se
consideran aquí a modo de ejemplo. Nonmechanistic modelos desarrollados
antes de la década de 1980 se consideran en detalle en los comentarios de Modelos Semimechanistic
Lee et al. (1980) y Ladisch et al. (1981).
Siguiendo el esquema de clasificación presentado en la Tabla VI, los modelos
semimechanistic con respecto al sustrato y la enzima se basan en un modelo de
Un ejemplo de un modelo con grado de conversión como una salida es la
adsorción pero el uso de una única variable para describir el estado del substrato
propuesta por Gharpuray et al. (1983). Esos autores utilizaron regresión para
y describir la acción de la celulasa en términos de una sola actividad
desarrollar un modelo exponencial para describir la influencia de las
solubilizante.
características de la paja de trigo pretratada en la conversión de celulosa (X = 1
Un modelo representativo de esta categoría es el modelo HCH-1
- [concentración de celulosa definitiva] / [concentración inicial de celulosa]),
desarrollado por Holtzapple et al. (1984a, b), que describe la velocidad
medido después de 8 h:
inicial de la hidrólisis por:
k½S½Ei
X ¼ 2: 044 re SSA Þ 0: 998 re 100 ICr Þ 0: 257 re L Þ 0: 388 re 14 Þ
V¼ re 18 Þ
re una þ ½ S þ q ½ mi Þ
una disminución de la cristalinidad el número de sitios de celulosa cubierta por una adsorbido
Variables dependientes
interacción ES
yo. modelos Semimechanistic con respecto al sustrato y la enzima (variable de estado 1 de sustrato, 1 actividad solubilizante) Huang, 1975
MM competitivo
Howell y Mangat, 1978 Langmuir competitivo
Beltrame et al., 1982 Langmuir
Holtzapple et al., 1984a y b, 1990 Langmuir no competitivo
Nagasaki et al., 1988 MM
Steiner et al., 1988 Langmuir
Howell y Stuck, 1975 además BG MM
Dwivedi y Ghose, 1979 además BG MM competitivo
Ghosh et al., 1982 además BG MM competitivo
Asenjo, 1984 además BG MM competitivo
Caminal et al., 1985 además BG MM competitivo
Borchert y Buchholz, 1987 además BG Langmuir competitivo
Guaskov y Sinitsyn, 1992 además BG MM no competitivo
Moldes et al., 1999 además BG MM competitivo
Belkacemi y Hamoudi, 2003 además BG MM
ii. modelos Semimechanistic con respecto a la enzima sólo (> variables de 2 de sustrato de estado, 1 de actividad solubilizante) Converse y Grethlein,
1987 AS + [S] MM
Converse et al., 1988 AS + [S] Langmuir competitivo
Movagarnejad et al., 2000 AS + [S] Langmuir
Sur et al., 1995 [S] + X Langmuir
Ryu y Lee, 1982 A+C Langmuir
Philippidis et al., 1992 y 1993 AS + [S] además BG Langmuir no competitivo
Luo et al., 1997 AS + [S] además BG Langmuir no competitivo
Oh et al., 2001 AS + [S] además BG Langmuir no competitivo
Peitersen y Ross, 1979 A+C además BG MM
Ventilador y Lee, 1983 A+C además BG Langmuir no competitivo
Scheiding et al., 1984 A+C además BG Langmuir no competitivo
Guaskov et al., 1985a y b A+C además BG Langmuir competitivo
González et al., 1989 A+C además BG MM competitivo
Nidetzky et al., 1993 A+C además BG Langmuir
Wald et al., 1984 AS + (A + C) además BG Langmuir competitivo
Gan et al., 2003 AS + (A + C) además BG Langmuir competitivo
iii. modelos mecanicistas Semi con respecto al sustrato (actividades de variable de estado 1 de sustrato y 2 solubilizantes) sólo Beltrame et al., 1984
solamente [S] Endo + Exo + BG MM no competitivo
Nidetzky et al., 1994b solamente [S] Endo + Exo Langmuir
modelos basados C. funcionalmente (es z 2 variables de estado sustrato, z 2 actividades solubilizantes)
* AS = área de la superficie; [S], la concentración de sustrato; X = conversión de celulosa; A, celulosa amorfa; C, celulosa cristalina.
previamente con eficacia la biomasa celulósica? ¿Cómo deben evaluarse estas características?
Sugerimos que ha llegado el momento de revisar y revitalizar el modelado viride. Eur J Biochem 46: 295-395. Bernárdez TD, Lyford K, Hogsett DA, Lynd LR. 1993. La
adsorción de
funcional de la hidrólisis enzimática de la celulosa. Además de centrar la atención
Clostridium thermocellum la celulasa sobre pretratada mixta de madera dura, Avicel y
de los investigadores y los patrocinadores de la investigación en este objetivo, los
lignina. Biotechnol Bioeng 43: 899-907. Bertoldo C, Antranikian G. 2002. Almidón hidrolizante
avances en el área de modelado funcional se beneficiarán del desarrollo y enzimas de ter-
aplicación de nuevas metodologías. Entre tales metodologías son procedimientos archarea mophilic y bacterias. Curr Opin Chem Biol 6: 151-160. Bertrain MS, Dale BE.
mejorados para la determinación de las propiedades del sustrato incluyendo DP, 1985. La hidrólisis enzimática y recristalización
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