TAXONOMIA BACTERIANA

DIVERSIDAD DE LOS MICROORGANISMOS

TEMAS 20 – 33 : Se dedican
- A hacer un breve repaso del origen y la evolución de los microorganismos
- A estudiar las bases de la Taxonomía bacteriana
- A estudiar los principales grupos de organismos Procariotas
- A estudiar los microorganismos Eucariotas

Archaea : Termosphaera Eukarya: Saccharomyces

Eubacteria : Salmonella
 TEMA 20: EVOLUCIÓN Y PRINCIPIOS DE TAXONOMÍA BACTERIANA

aEVOLUCIÓN DE LOS SERES VIVOS

ESTROMATOLITOS Y BACTERIAS FÓSILES

LA VIDA PRIMITIVA: Condiciones físico- quÍmicas de la Tierra primitiva

Los organismos primitivos
ORIGEN DE LA CÉLULA EUCARIOTICA

a RELACIONES EVOLUTIVAS ENTRE LOS MICROORGANISMOS

CRONÓMETROS EVOLUTIVOS: ARN RIBOSÓMICO
ÁRBOLES FILOGENÉTICOS

a TAXONOMÍA : DEFINICIÓN E IMPORTANCIA

CLASIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS: Monotética, Politética y
Filogenética
CATEGORIAS TAXONÓMICAS Y NOMENCLATURA
IDENTIFICACIÓN DE LOS MICROORGANISMOS

IMS
ESTROMATOLITOS
 IMPORTANCIA DEL ESTUDIO DEL PROCESO EVOLUTIVO DE LOS
ORGANISMOS PROCARIOTAS

1.- La evolución (resultado de la interacción entre cambios genéticos y

ambiente) es la responsable de la diversidad de los Procariotas
2.- El proceso evolutivo ayuda a comprender porqué los microorganismos
son capaces de crecer en los hábitat mas dispares y en las condiciones
mas adversas
3.- Los Procariotas fueron las primeras formas de vida que aparecieron
sobre la tierra y las únicas durante mas de 2000 millones de años. Hay
bacterias fosilizadas con una antigüedad de 3500- 3800 millones de años
4.- Los Procariotas son los responsables de los grandes cambios
ambientales que han permitido la aparición de otros organismos, tal es el
caso de la formación de la atmósfera oxidante y de la capa de ozono
 ESTROMATOLITOS Y BACTERIAS FÓSILES

Estromatolito de 3500X 106 Estromatolitos de 1600 x 106 Estromatolitos modernos de

años . ( Oeste de Australia) años ( Norte de Australia) aguas calientes (Australia)

Gloeodiniopsis. 1500 Paleolyngbya. 950

Fósiles que recuerdan a Cianobacterias millones de años
3500 millones de años millones de años
BACTERIAS FÓSILES

Cianobacterias (850 106 años)

 O2 (% en la
0 Época de los dinosaurios Cámbrico atmósfera)
Organismos Evolución
superiores morfológica de los Precámbrico
metazoos
Hace > 500 millones de años
20%
1 Origen de los Metazoos

10%
Origen Eucariotas modernos
Endosimbiosis
Desarrollo dc la capa de ozono 1%
2 Ambiente oxigenado
Era de la vida
0,1%
microbiana
Origen fototrofos oxigénicos
Arquea Línea nuclear
Primera
Bacteria bacteria
3
fototrófica

Anóxico
Evolución
4 Síntesis prebiótica
química de macromoléculas
Antigüedad
( miles de
millones de Hace 4, 6 x 109 años EVOLUCIÓN
años) BIOLÓGICA
 LA TIERRA PRIMITIVA

1.- Ambiente reductor

2.- Abundancia de Anhídrido Carbònico, Metano,
Dinitrógeno Amoniaco,Vapor de agua,Sulfidrico,
Sulfuro de hierro…….
3.- Temperatura superior a los 100ºC
4.- Las fuentes de energía eran la radiación UV,
descargas eléctricas Radiactividad y energía
térmica proveniente de meteoritos y volcanes

ENERGÍA + COMPONENTES INORGÁNICOS

MOLÉCULAS ORGÁNICAS (MONÓMEROS)

MACROMOLÉCULAS

VIDA RNA. RNA AUTORREPLICATIVO

EVOLUCIÓN DE FORMAS DE
VIDA CELULAR A PARTIR DE
VÉSICULA DE
FORMAS DE VIDA ARN LIPOPROTEÍNA

TIERRA
ESTÉRIL

VIDA RNA. RNA AUTORREPLICATIVO

VIDA CELULAR PRIMITIVA.
RNA COMO MOLÉCULA
PROTEÍNA
CODIFICADORA Y
CATALÍTICA

DNA

RNA COMO MOLÉCULA VIDA CELULAR MODERNA. EL DNA

CODIFICADORA. PROTEÍNAS CON SUSTITUYE AL RNA COMO MOLÉCULA
FUNCIÓN CATALÍTICA CODIFICADORA

DNA RNA PROTEÍNA

MECANISMO HIPOTÉTICO DE LAS CÉLULAS PRIMITIVAS PARA GENERAR ENERGÍA

ATPasa
primitiva

FUERA

Hidrogenasa
primitiva

DENTRO
MP
MP

reductasa

La formación de pirita da lugar a la producción de H2 y a la

reducción del Azufre elemental, generando un gradiente de
protones a través de una membrana plasmática sencilla.
(QUIMIOLITOTROFÍA DEL HIDRÓGENO)
 QUIMIOLITOTROFÍA SIMPLE

(FeS + H2S FeS2+ H2 )

GRADIENTE DE PROTONES

FERMENTACIONES SIMPLES MATERIA ORGÁNICA

DIVERSIDAD
DIVERSIDAD
FERMENTATIVA
FERMENTATIVA

ANILLO DE PORFIRINA
Fe2+ Co2+

Mg2+
Ni2+
Corrinoides,
Citocromos Tetrapirroles
de Niquel

Metanogénesis
Respiraciones Bclf y clorofila
Acetogénesis POSIBLE EVOLUCIÓN DE
anaeróbicas
LOS MECANISMOS
GENERADORES DE
Fotosíntesis anoxigénica ENERGÍA EN
( Fotofosforilación) PROCARIOTAS
Fotosíntesis oxigénica

R. aeróbica
PRODUCCIÓN DE OXÍGENO
 ORIGEN DE LOS EUCARIOTAS MODERNOS POR ENDOSIMBIOSIS

ANIMALES
ARQUEAS ( PROCARIOTAS)
EUCARIOTAS
MODERNOS SIN
MITOCONDRIAS PROTOZOOS

LÍNEA NUCLEAR
ANTECESOR (PROCARIOTA)
N
UNIVERSAL EUCARIOTAS
PROCARIÓTICO AUMENTO MODERNOS
EUCARIOTA
TAMAÑO ENDOSIMBIOSIS
PRIMITIVO
CELULAR
RELACIÓN ESTABLE CON
UNA CÉLULA NO
FOTOTRÓFICA
(MITOCONDRIA PRIMITIVA)
ANTECESOR DE
AGROBACTERIUM,
BACTERIAS (PROCARIOTAS) RHIZOBIUM ALGAS
RICKETTSIAS

RELACIÓN ESTABLE CON UNA

CÉLULA FOTOTRÓFICA
(CLOROPLASTO PRIMITIVO) PLANTAS
ANTECESOR DE PROCHLORON
 RELACIONES EVOLUTIVAS ENTRE
LOS MICROORGANISMOS

• CRONÓMETROS EVOLUTIVOS: ARN RIBOSÓMICO

• ÁRBOLES FILOGENÉTICOS
 CRONÓMETROS MOLECULARES : r RNA

ORGANISMO SECUENCIA

EL ÁRBOL SE CONSTRUYE
MEDIANTE ANÁLISIS POR
ORDENADOR

DISTANCIA EVOLUTIVA (ED) ED CORREGIDA

 ARBOLES FILOGENÉTICOS

A Rama B

SIN RAÍZ

C Nudos D

CON RAÍZ
C

A
 ÁRBOL FILOGENÉTICO UNIVERSAL

Árbol construido a partir de la comparación de las secuencias de los ARNs r

16S y 18S . La distancia evolutiva entre dos grupos de organismos es
proporcional a la suma de las distancias desde el final de las ramas hasta el
punto donde se unen los dos grupos. ( Woese)
 TAXONOMÍA : DEFINICIÓN E IMPORTANCIA

aCLASIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS: MONOTÉTICA

POLITÉTICA
FILOGENÉTICA

aCATEGORIAS TAXONÓMICAS Y NOMENCLATURA

aIDENTIFICACIÓN DE LOS MICROORGANISMOS

 DEFINICIÓN E IMPORTANCIA DE LA TAXONOMÍA

TAXONOMÍA ( del griego Taxis: estructuración, orden y Nomos: ley )

Es la Ciencia que estudia la clasificación , la identificación y
la nomenclatura de los organismos.

Su importancia radica en que:

- Permite organizar grandes cantidades de conocimiento
- Permite hacer predicciones
- Permite agrupar los microorganismos en grupos útiles
- Es esencial para la identificación de nuevos organismos
 TIPOS DE CLASIFICACIONES JERÁRQUICAS

FENÉTICA (ARTIFICIAL) : Basada en caracteres fenotípicos :

morfológicos, fisiológicos, ecológicos,
otros
MONOTÉTICA : Caracteres llave

POLITÉTICA ( numérica) : Semejanza general

FILOGENÉTICA ( NATURAL) : Basada en las relaciones filogenéticas

según la distancia evolutiva entre
especies
 AISLAMIENTO DE UNA
CLASIFICACIÓN FENÉTICA MONOTÉTICA BACTERIA DEL INTESTINO
DE UN ANIMAL

ALGUNAS CARACTERÍSTICAS FENOTÍPICAS OBTENCIÓN DE UN CULTIVO AXÉNICO

UTILIZADAS EN CLASIFICACIÓN E
IDENTIFICACIÓN TINCIÓN DE GRAM

MORFOLÓGICAS : FORMA Y TAMAÑO CELULARES GRAM POSITIVO GRAM NEGATIVO

TINCIÓN
BACILAR NO
CILIOS Y FLAGELOS
BACILAR
ENDOSPORAS FACULTATIVO AEROBIO ESTRICTO
FISIOLÓGICAS: FUENTES DE C Y N
FUENTES DE ENERGÍA FERMENTA NO
LACTOSA CON FERMENTA
TOLERANCIA OSMÓTICA PRODUCCIÓN LACTOSA
RELACIONES CON EL OXÍGENO DE ÁCIDOS Y
GAS
ECOLÓGICAS: RELACIONES SIMBIÓTICAS
PATOGENICIDAD
PREFERENCIA DE HÁBITATS REALIZAR PRUEBAS BIOLÓGICAS:
INDOL, ROJO METILO POSITIVAS
CITRATO, VP NEGATIVAS

ESCHERICHIA COLI
CLASIFICACIÓN FENÉTICA POLITÉTICA (NUMÉRICA) a: número de caracteres
presentes en ambos
organismos
Coeficientes de asociación de dos organismos: b y c : número de
caracteres que difieren en
a + d ambos microorganismos
Coeficiente de emparejamiento simple ( SSM ) :
a +b+c+d d: número de caracteres
ausentes en ambos
Coeficiente de Jaccard ( SJ ) : a
microorganismos
a +b+c
a +b+c+d :número total de
caracteres comparados

% de
semejanza
Matriz de Grupos de
semejanza cepas
similares

Bacteria Bacteria Dendograma

 CLASIFICACIÓN FILOGENÉTICA
ORGANISMO SECUENCIA

DISTANCIA EVOLUTIVA (ED) ED CORREGIDA

EL ÁRBOL SE CONSTRUYE
MEDIANTE ANÁLISIS POR
ORDENADOR
 RANGOS TAXONÓMICOS Y NOMENCLATURA DE LOS PROCARIOTAS

RANGOS TAXONÓMICOS EJEMPLO

Dominio Bacteria ( Eubacteria)
Reino Proteobacteria
Orden Enterobacteriales
Familia Enterobacteriaceae
Género Shigella
Especie S. dysenteriae

NOMENCLATURA : El nombre en latín y cursiva (Sistema binomial )

1. Nombre del género : primera letra en mayúscula Escherichia, Bacillus

2. Nombre específico : primera letra en minúscula E. coli, B. cereus

 IDENTIFICACIÓN

MÉTODOS TRADICIONALES MÉTODOS MOLECULARES

NECESIDAD DE AISLAMIENTO Y CULTIVO APLICABLES A MICROORGANISMOS

PREVIOS CULTIVABLES Y NO CULTIVADOS
DESCONOCIMIENTO DE LOS NUTRIENTES
ORGANISMOS NO CULTIVABLES PERMITE IDENTIFICAR LA PRÁCTICA
TOTALIDAD DE LOS MICROORGANISMOS
DE UNA MUESTRA
LAS 7700 ESPECIES DESCRITAS REPRESENTAN SÓLO
EL1% DEL TOTAL.
EN UNA MUESTRA AMBIENTAL EXISTEN 3 ÓRDENES
APORTA DATOS EVOLUTIVOS
DE DIFERENCIA ENTRE LOS ORGANISMOS QUE
EXISTEN REALMENTE Y LOS QUE CRECEN EN
MEDIOS DE CULTIVO
NO PROPORCIONA INFORMACIÓN
APORTAN GRAN CANTIDAD DE PRÁCTICA (MORFOLOGÍA, FISIOLOGÍA ETC)
INFORMACIÓN PRÁCTICA
SISTEMAS RÁPIDOS Y REPRODUCIBLES

NO PROPORCIONA DATOS SOBRE SU

ORIGEN Y RELACIONES EVOLUTIVAS
TAXONOMÍA POLIFÁSICA
 IDENTIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS:
METODOS MOLECULARES

GC (% mol)

Porcentaje GC FAME

Ribotipado
 CONTENIDO EN G+C

G+C x 100
A+T+G+C

GC (% mol)

Desnaturalización termal de DNA Porcentaje GC

HIBRIDACIÓN
RIBOTIPADO : REPRESENTACIÓN GRÁFICA DE UN PATRÓN
DE BANDAS OBTENIDO POR RIBOPRINTER
 FAME: CLASES DE ÁCIDOS GRASOS PRESENTES EN BACTERIAS

CLASE EJEMPLO

Saturado Ácido tetradecanoico

No saturado Ácido omega-7-cis

hexadecanoico

Ciclopropano Ácido cis 7-8 metilén

hexadecanoico

Ramificado Ácido 13- metil

tetradecanoíco

Hidroxi Ácido 3-Hidroxidecanoico

 FAME: PROCEDIMIENTO

Cultivo bacteriano Picos obtenidos

Extracción de Ácidos Grasos

Cantidad
Comparación
Obtención de formas Metil-éster con Patrones
de la base de
datos
Cromatografía de gases

IDENTIFICACIÓN
DEL ORGANISMO
 PASOS A SEGUIR TRAS LA IDENTIFICACIÓN DE UN
NUEVO MICROORGANISMO

GENERO /ESPECIE identificados

DESCRIPCIÓN

Se deposita en una colección

DEPÓSITO
Aprobada a nivel internacional (ATCC) como
CEPA TIPO

VALIDACIÓN
Publicación en el IJSB
( International Journal of Systematic Bacteriology)

ACEPTACIÓN OFICIAL
Inclusión en el Bergey´s Manual
 Bergey´s Manual of
Systematic/Determinative
Bacteriology

- 1ª Edición (..........Determinative Bacteriology)

D.H.Bergey 1923
- OTRAS EDICIONES MAS RECIENTES

- 9ª (.......... Determinative) 1994

- ...... Systematic Bacteriology . 1ª edición 1984- 89

- ...... Systematic Bacteriology. 2ª edición 2001-

5 volúmenes, sólo publicado el 1º
 ARBOL FILOGENÉTICO UNIVERSAL

Bacteria Archaea Eukarya

Animales
Euryarchaeota Entamebas
Bacterias verdes Hongos
Methanosacina
no del azufre mucosos Hongos
Mitocondria Halófilos
Methano
Bacterias bacterium extremos Plantas
Proteobacteria Gram Thermoproteus Methano
positivas coccus Thermoplasma Ciliados
Cloroplasto Pyrodictium
Thermococcus Flagelados
Cianobacterias
Crenarchaeota Pyrolobus
marinos Methanopyrus Tricomónadas
Flavobacterias
Korarchaeota

Thermotoga
Microsporidios
Thermodesulfobacterium
Diplomónadas
Aquifex (Giardia)