SEMANA 3

Aminoácidos: Estructura,
clasificación, propiedades.

Péptido: Enlace peptídico,

polipéptidos.

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 1

 Estructura.
Clasificación según sus cadenas
laterales.
Estereoisomería de aminoácidos.
Aminoácidos no estándar.
Modificaciones pos-traduccionales
de aminoácidos.
Propiedades ácido-básicas y
curvas de valoración.
Enlace peptídico.
Polipéptidos.
Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 2
 ¿Qué son los aminoácidos?
Grupo carboxilo
(disociado)
Grupo amino
(protonado)
-
COO
+
H3N C H
R
Carbono α
Cadena
lateral
Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 3
 Molécula
Estereoisomería
Imagen
especular
quiral:
después de
de la
hacer rotar la
molécula molécula, no es
original posible
sobreimponerla
sobre la imagen
especular del
Molécula original
original
Molécula
Imagen
aquiral:
especular después de
de la hacer rotar la
molécula molécula, es
original posible
sobreimponerla
sobre la imagen
especular del
Molécula original
original

Enantiómeros

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 4

 Configuración Absoluta
(La Regla CORN)

CO-R-N

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 -ORCH2 > -OH > -NH2 > -COOH > -CHO > -CH2OH > -CH3 > -H

(S)-Amino Acido (R)-Amino Acido

(L)-amino Acido (D)-Amino Acido

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 6

 Aminoácidos de las Proteínas
Código de Código de Código de Código de
Nombre del AA 3 letras 1 letra Nombre del AA 3 letras 1 letra

Alanina Ala A Isoleucina Ile I

Arginina Arg R Leucina Leu L
Asparagina Asn N Lisina Lys K
Aspártico Asp D Metionina Met M
Cisteina Cys C Prolina Pro P
Fenilalanina Phe F Tirosina Tyr Y
Glicina Gly G Treonina Thr S
Glutámico Glu E Triptófano Trp W
Glutamina Gln Q Serina Ser T
Histidina His H Valina Val V

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 Clasificación de
aminoácidos

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 Aminoácidos alifáticos o neutros (a)
COO-
COO- COO-
+
H 3N + C H
+
H 3N C H H 3N C H
CH
H CH3 H 3C CH3
Glicina Alanina Valina
Gly, G Ala, A Val, V
No esencial No esencial Esencial

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 Aminoácidos alifáticos o neutros (b)

COO-
H 3N + C H Leucina
CH2 Leu, L
CH Esencial
H 3C CH3

COO-
H 3N + C H Isoleucina
CH Ile, I
H 3C CH2
Esencial
CH3

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 10

 Aminoácidos aromáticos
COO- COO- COO-
H 3N + H 3N + C H
C H H 3N + C H
CH2
CH2 CH2

NH
OH
Fenilalanina Tirosina Triptófano
Phe, F Tyr, Y Trp, W
Esencial No esencial Esencial

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 11

 Absorbancias de los Aminoácidos Aromáticos

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=stryer&part=A289

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 Hidroxiaminoácidos

COO-
Serina
H 3N + C H Ser, S
No esencial
CH2OH

COO-
H 3N + C H Treonina
Thr, T
H C OH Esencial
CH3

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 13

 Tioaminoácidos o Sulfurados
COO-
H 3N + C H
Cisteína
CH2 Cys, C
SH No esencial

COO-
H 3N + C H
CH2 Metionina
CH2 Met, M
Esencial
S
CH3
Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 14
 Aminas secundarias (Iminoácidos)

COO-
+
NH2
Prolina
Pro, P
No esencial

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 Aminoácidos dicarboxílicos y sus amidas
COO- COO-
COO- COO- H 3N + C H H 3N + C H
H 3N + C H H 3N + C H CH2 CH2
CH2 CH2 CH2 CH2
COO- CONH2 COO- CONH2
Ác.Aspártico Asparragina Ác.Glutámico Glutamina
Asp, P Asn, N Glu, E Gln, Q
No esencial No esencial No esencial No esencial

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 16

 COO- Aminoácidos Básicos COO-

H 3N + C H - H 3N + C H
COO
CH2
CH2 H 3N +
C H
CH2
CH2 CH2
CH2
CH2
NH
CH2 NH+ +
H 2N C
HN
NH3+ NH2

Lisina Histidina Arginina

Lys, K His, H Arg, R
Esencial Esencial Esencial

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 17

 Apolares (hidrofóbicos) son: …

Polares sin carga eléctrica son: …

Cadenas laterales con carga eléctrica:

pKa2 carga
Arginina 12.48 +
Ac. Aspártico 3.86 -
Cisteína 10.78 -
Ac. Glutámico 4.25 -
Histidina 6.00 +
Lisina 10.53 +
Tirosina 10.57 -
Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 18
 Aminoácidos poco frecuentes en proteínas

 ácido piroglutâmico: encontrado en una única proteína

"bombeadora de protón dirigida por luz" , llamada
bacteriorodopsina.
 ácido aminoadípico: encontrado en proteínas de la leche.

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 19

 Metabólitos importantes de aminoácidos

penicilamina: constituyente
de las penicilinas.

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 20

 Modificaciones post- traduccionales
Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 21
 Aminoácidos no proteicos: DOPA

COO-
+
Catecolaminas
H 3N C H
CH2 Hormonas
tiroideas

Melanina
HO
OH
L-DOPA
(dihidroxifenilalanina)

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 22

 Propiedades ácido base
ESCALA DE HIDROFOBIA

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 23

 IONIZACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS: CURVAS DE TITULACIÓN

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 24

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 25
 Aminoácidos en solución, por ser compuestos anfóteros,
establecen equilibrio entre el íon dipolar y la forma catiónica o la
forma aniónica en función del pH.

Glicina

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 26

 pKa αNH3 = 9,6
Ka = 1,00 x 10 - 9,6 Ka = 2,51189 x 10 - 10
Ka α COOH = 5,01187 x 10 - 3
pKa = - log Ka
pKa = - ( log 5,01187 + log 10 - 3 )
pKa = - ( 0,7 - 3 ) = 2,3
Mayor a la Ka = menor al pKa = mayor a la acidez

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 27

 Titulación de aminoácido neutro

COO-
pH > pKC
H 2N C H
CH3 pH > pKN III
Anión

COO- pH > pKC

H 3N + C H II
CH3 pH < pKN

COOH
pH < pKC
H 3N +
C H
I
CH3 pH < pKN
Catión
Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 28
 I II
Titulación de aminoácido dicarboxílico COOH COO-
H 3N + C H H 3N + C H
CH2 CH2
COOH COOH
pH < pKC pH > pKC

pH < pKL pH < pKL

pH < pKN pH < pKN

III IV

COO- COO-
H 3N + C H H 2N C H
CH2 CH2
COO- COO-
pH > pKC pH > pKC

pH > pKL pH > pKL

pH < pKN pH > pKN

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 29

 I II
COOH COO-
H 3N +
Titulación de aminoácido diamino
C H H 3N + C H
(CH2)4 (CH2)4
NH3+ NH3+
pH < pKC pH > pKC

pH < pKN pH < pKN

pH < pKL pH < pKL

III IV
COO- COO-
H 2N C H H 2N C H
(CH2)4 (CH2)4
NH3+ NH2
pH > pKC pH > pKC

pH > pKN pH > pKN

pH < pKL pH > pKL

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 30
 Punto Isoeléctrico: valor de pH en el cual todas las moléculas de
aminoácidos se encuentran en forma de ion dipolar, o sea sin caga
eléctrica neta.

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 31

 Las propiedades ácido-básicas de los aminoácidos permiten la
utilización de técnicas de separación por electroforesis.

Un ejemplo es la electroforesis sobre papel

CÁTODO ÁNODO

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 32

 La reactividad de los Grupos R de los
aminoácidos

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 33

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 34
 Aminoácidos Azufrados

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 35

 Formación de enlaces laterales de disulfuro
H O H O
N C N C
N HC HC C
CH2 CH2
SH SH

O C N H
C CH2 S S CH2 C
H N C O

N C
Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 36
 Fosforilación de residuos de serina, treonina
y tirosina

Residuo Tirosina ATP

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 37

 Glicosilación de residuos de Serina, treonina

Glucosa
Residuo Serina

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 38

 Solubilidad Densidad
pI a Solubilidad Densidad pI a 25
Nombre (g/100g, del cristal
25 ºC Nombre (g/100g, del cristal ºC
25 ºC) (g/ml)
25 ºC) (g/ml)
Alanina 16.65 1.401 6.107
Leucina 2.426 1.191 6.036
Arginina 15 1.1 10.76
Lisina very - 9.47
Ácido
0.778 1.66 2.98 Metionina 3.381
Aspártico 1.340 5.74
Asparagina 3.53 1.54 - Fenilalanina 2.965 - 5.91
Cisteina very - 5.02 Prolina 162.3 - 6.3
Ácido Serina
0.864 1.460 3.08 5.023 1.537 5.68
Glutámico
Treonina very - -
Glutamina 2.5 - -
Glycina 24.99 1.607 6.064 Triptofano 1.136 - 5.88
Histidina 4.19 - 7.64 Tirosina 0.0453 1.456 5.63
Isoleucina 4.117 - 6.038 Valina 8.85 1.230 6.002

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 39

 ANÁLISIS DE MEZCLAS DE
AMINOÁCIDOS

Los aminoácidos pueden

separarse mediante técnicas
cromatográficas (intercambio
iónico, fase reversa). Como
pocos presentan
propiedades
espectroscópicas que
faciliten su detección al salir
de la columna, se suelen
derivatizar por reacción con
un compuesto coloreado o
fluorescente.

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 40

 Enlace Peptídico
Φ

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 41

 Residuos por Translación
Conformación Phi Psi Omega
vuelta por residuo
Antiparalela β -139 +135 -178 2.0 3.4

Paralela β -119 +113 180 2.0 3.2

Alfa hélice -57 -47 180 3.6 1.5

3-10 hélice -49 -26 180 3.0 2.0

Xi-hélice -57 -70 180 4.4 1.15

Poliprolina I -83 +158 0 3.33 1.9

Poliprolina II -78 +149 180 3.0 3.12

Poloprolina III -80 +150 180 3.0 3.1

Un diagrama que demuestra los ángulos en enlace dihedral para las conformaciones
regulares del polipéptido.
Nota: Omega = 0º es un enlace cis del péptido y Omega = 180º es un enlace del
péptido de transporte.

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 42

Diagrama de Venn que muestra la relación de los 20 aminoácidos que ocurren
naturalmente para una selección de características físico-química pensó que era
importante en la determinación de la estructura de una proteína.
Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 43
 TRH (Hormona liberadora de tirotropina)

NH2
O CO
O NH
NH N
O CH2

N
NH
Piroglutamil-histidil-prolinamida

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 Hormonas Peptídicas
SYSMEHFRWGKPV
α-MSH (hormona estimulante de los melanocitos)

SYSMEHFRWGKPVGKKRRPVKVYPDAGEDQSAEAFPLEF
ACTH (Hormona corticotropa)

CYIQNCPLG Oxitocina

CYFQNCPRG Arginin-Vasopresina

CYFQNCPKG Lisin-Vasopresina

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 Péptidos vasoactivos
ECA
DRVYHPFHL DRVYHPF

Angiotensina I HL Angiotensina II

RPPGFSPFR Bradiquinina

KRPPGFSPFR Kalidina

Clase 3 Mg. Ana I. F. Gutiérrez Román 46

 Neurotransmisores peptídicos

YGGFL (Leucin-encefalina)

YGGFM (Metionin-encefalina)

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