RESUMEN DE BIOQUíMICA 3ª PARTE

ÁCIDOS NUCLEICOS

Los ácidos nucleicos son moléculas polianiónicas de alto peso molecular,

compuestos por una secuencia de monómeros llamados nucléotidos. Es decir son
cadenas polinucleotídicas.

Los ácidos nucleicos son 2: DNA y RNA.

El DNA se encuentra principalmente en los cromosomas del núcleo celular.

El RNA se encuentra en el citoplasma celular un 90% y el 10% restante en el

nucleolo.

EL DNA es la base química de la herencia y de las enfermedades genéticas.

El DNA dirige la síntesis de RNA, que a su vez regula la síntesis de proteínas.

El DNA esta formado por 4 desoxiribonucleótidos:

dAMP, dGMP, dCMP y dTMP.

El RNA esta formado por 4 ribonucleótidos:

AMP, GMP, CMP y UMP.

La unión de un nucleótido con otro para formar la cadena polinucleótica (estrucutura

base de los ac. nucleicos) se llama, enlace 3´5´-fosfodiester.

DNA B o “Modelo de Watson y Crick”

Características estructurales
• Doble cadena antiparalela
• Correspondencia de bases:
A=T (2 puentes de hidrógeno)
G=C (3 puentes de hidrógeno
• Distancia por vuelta 3,4 nm
• Distancia entre cada nucleótido .34 nm
• 10 pares de bases por cada vuelta
• Giro de la doble helice hacia la derecha
• Diámetro 2 nm
• Tamaño variable, según la especie

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 1

DNA A

Características estructurales

• Giro de doble helice hacia la derecha

• 11 pares de bases por vuelta
• Diámetro 2.55 nm
• Distancia por vuelta 2.46 nm

DNA Z

Características estructurales

• Giro de la doble helice hacia la izquierda

• 12 pares de bases por vuelta
• Diámetro 1.84 nm
• Distancia por vuelta 4.56 nm

Nucleosoma.- Se compone de DNA enrollado alrededor de un conjunto de

moléculas de proteínas básicas llamadas histonas.

Los nucleosomas constan de 4 tipos de histonas dispuestas formando un octámero,

(H2A)2 y (H2B)2, (H3)2, (H4)2.

Este octámero forma un núcleo o “core” alrededor del cual el DNA (146 pares de
bases) se enrollan en casi 2 vueltas.

Un nucleosoma esta conectado con otro por una secuencia espaciadora de aprox.
20 pares de bases.

A estas secuencias espaciadoras se fijan las histonas H1.

Aprox. 6 nucleosomas pueden enrollarse en torno a un canal central formando una

fibra de cromatina de aprox. 30 nm de diámetro.

Características estructurales del RNAm

• Esta formado por una sóla cadena, pero donde es posible se aparean A=U y
G=C.
• Su tamaño es heterogéneo (según mensaje)
• Se sintetiza a partir de una cadena del DNA por transcripción
• Su vida media es corta (horas en bacterias)
Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 2
 • Su función es contener la información para sintetizar un polipéptido o
proteína.
• A cada 3 nucleótidos con sentido para un aminoácido se le llama codón.
• Contiene un capping de 7-metil guanosina en el extremo 5´ (sólo en
eucariotes)
• Contiene una cola de poli-A en el extremo 3´(sólo en eucariotes)
• Corresponde al 2% del total de RNA.

Características estrucuturales de RNAt

• Esta formado por una sóla cadena, pero donde es posible se aparean A=U y
G=C
• Tamaño entre 70-90 nucleótidos
• Se sintetiza a partir de una de las cadenas del DNA por un proceso llamado
transcripción
• Su función es transportar aminoácidos para la síntesis proteica
• Al menos existe 20 diferentes
• Tiene forma (cristalográfica) de L invertida
• Contiene una asa TC
• Contiene un asa llamada anticodón
• Contiene un asa DHU
• En el extremo 3´ contiene el triplete terminal CCA al cual se une al
aminoácido
• Corresponde al 16% del total RNA

Características estructurales del RNAr

• Esta formado por una sola cadena, pero donde es posible se aparean A=U
y G=C
• Tamaño.
+ Eucariotes: 28S, 18S, 5.8S y 5S
+ Procariotes: 23S, 16S y 5S
• Se sintetiza a partir de una de las cadenas del DNA por un proceso llamado
transcripcion
• Función.- Asociándose a proteínas forma ribosomas, sitio donde se lleva a
cabo la traducción del mensaje
• Contiene bases modificadas (generalmente metiladas)
• Corresponde al 82% del total de RNA

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 3

RIBOSOMAS

Los ribosomas son los organelos donde se lleva a cabo el proceso de síntesis de
proteínas.

Los ribosomas de procariotes tienen un coeficiente de sedimentación 70 S

(unidades Svedberg)

• La subunidad menor sedimenta a 30 S y contiene 21 proteínas diferentes,

además de RNAr 16S
• La subunudad mayor sedimenta a 50 S y contiene 31 proteínas diferentes,
además de RNAr 23S y RNAr 5S

Los ribosomas de eucariotes tienen un coeficiente de sedimentación 80 S

• La subunidad menor sedimenta a 40 S y contienen 30 proteínas diferentes,

además de RNAr 18S
• La subunidad mayor sedimenta a 60 S y contiene 50 proteínas diferentes,
además de RNAr 28S, 5.8S y 5S

DIGESTIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS

Los ac. nucleicos son degradados a mononucleótidos por la ribonucleasa y

desoxirribonucleasa, ambas de origen pancreático, produciendo nucleótidos libres

Los nucleótidos libres se hidrolizan a nucleósidos por nucleotidasas intestinales y

producen nucleósidos

Los nucleósidos se degradan por enzimas nucleosidasas para producir pentosa y

base nitrogenada libre y fosforilasas para producir pentosa-P y bases
nitrogenadas libres.

Estas últimas enzimas también son de origen intestinal.

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 4

VÍA DE RECUPERACIÓN O RESCATE DE BASES PURÍNICAS.

• La adenina se recupera en AMP por acción de la APRT (adenina

fosforribosil transferasa) utilizando PRPP.
• La guanina se recupera a GMP y la hipoxantina en IMP por acción de la
HGPRT (hipoxantina guanina fosforribosil transferasa) utilizando PRPP.
• La deficiencia de la HGPRT produce el síndrome de Lesch-Nyhan.
• El síndrome de Lesch-Nyhan se caracteriza por:
+ Hiperuricemia
+ Agresividad
+ Automutilación
+ Retraso mental

VÍA DE RECUPERACIÓN O RESCATE DE PIRIMIDINAS

• El hígado es el sitio más importante para la síntesis de nucleótidos
pirimidínicos.
• La síntesis de nucleótidos pirimidínicos es muy baja en los linfocitos
periféricos.
• El encéfalo humano no sintetiza pirimidinas.
• Estas se recuperan a partir de nucleósidos por cinasas específicas
Uridina-----------uridincitidincinasa------------- UMP
Cistidina---------uridincitidincinasa------------- CMP
Timidina---------timidicinasa---------------------- TMP

SÍNTESIS Y CATABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS PURÍNICOS.

• Se requiere de ribosa 5-P (proveniente de la vía de las pentosas) para formar

PRPP.
• En la síntesis de purinas:
El N3 y N9 es proporcionada por la Glutamina
El C2 y C8 es proporcionado por el Tetrahidrofolato
El C4, C5 y N7 es proporcionado por la Glicina
El N1 es proporcionado por el Ac. aspártico
El C6 es proporcionado por CO2 de la respiración
• El primer nucleótido purínico formado es IMP.
• La síntesis de IMP de novo consume el equivalente de 6 ATP
• AMP y GMP se forman a partir del IMP.
• El regulador más importante en la biosíntesis de purinas de novo es la
concentración de PRPP.
• AMP, GMP e IMP regulan a las enzimas PRPP sintetasa y glutamina PRPP
sintetasa.

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 5

 El catabolismo final de los nucleótidos purínicos produce ac.
úrico

La enzima clave en el catabolismo de las purinas es la xantinoxidasa que convierte

a la hipoxantina en xantina y a la xantina en ac. úrico.

Hiperuricemía, es el aumento de ac. úrico en sangre, el cual se cristaliza y se

acumula en las articulaciones ocasionado la enfermedad llamada gota.

Los cristales de urato monosódico monohidratado provocan una reacción

inflamatoria caracterizada por un dolor intenso.

El tratamiento de la gota se hace a base de colchicina (disminuir la reacción

inflamatoria) y alopurinol (disminuir la concentración de ac. úrico)

El alopurinol es un inhibidor competitivo de la xantinoxidasa.

SÍNTESIS Y CATABOLISMO DE NUCLEÓTIDOS PIRIMIDÍNICOS

ocurre en el citoplasma celular

• La carbamil-P sintetasa utiliza CO2, NH3 y ATP para formar carbamil-P

• La aspartato transcarbamilasa une ac. aspártico con carbamil y de esta
manera se proporcionan los 6 elementos del anillo
• Carbamil-P proporciona el C2 y N3 del anillo pirimidínico
• El aspartato proporciona el N1, C4, C5 y C6 del anillo
• El primer nucleótido pirimidínico formado es el UMP
• UMP regula a la carbamil-P sintetasa
• CTP regula a la aspartato transcarbamilasa
• La aciduria orotica tipo I se produce por deficiencia de:
Orotatofosforribosil transferasa
Orotidilato descarboxilasa
Cristaluria de ácido orótico
Disminución del crecimiento
Anemia megaloblástica
Deficiencia inmunitaria
• La aciduria orotica tipo II se produce por deficiencia de
Orotidilato descarboxilasa
Orotidinuria
Anemia megaloblástica

El catabolismo final de citosina y uracilo produce -alanina, CO2 y NH3

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 6

El catabolismo final de timina produce -aminoisobutírico, CO2 y NH3

DUPLICACIÓN

La duplicación del DNA debe ser completa y llevada a cabo con alta fidelidad para
mentener la estabilidad genética dentro del organismo y de las especies

Características de la replicación (duplicación) del DNA:

• Es semiconservativa
• Es bidireccional
• Con dirección 5´-------- 3´
• Proceso es semidiscontinuo.- En la horquilla de replicación, una cadena se
copia en forma continua (hebra guía) y la otra en forma discontinua (hebra
retardada).
• Se requiere de un primer de RNA (RNA cebador)
Aprox. 10 nucleótidos en eucariotes
100 nucleótidos en procariotes
• El proceso es unipuntual en procariotes y multipuntual en eucariotes
• La duplicación sucede en la fase S del ciclo celular

Enzimas que participan en la duplicación:

• Helicasa.- Rompe los puentes de H entre las 2 cadenas del DNA templado
para formar la horquilla de replicación.
• DNA girasa.- Evita el superenrrollamiento de las cadenas del DNA templado
provocado por la acción de la helicasa.
• Estas enzimas (helicasa y DNA girasa) pertenecen a las enzimas llamadas
topoisomerasas.
• Proteínas SSB.- Proteínas de unión al DNA de cadena sencilla.
Protegen al DNA templado de la acción degradativa de las endonucleasas
• DNA primasa.- Encargada de formar el primer (RNA cebador).
La función del RNA cebador es proporcionar el –OH 3´que requiere la DNA pol
para la incorporación del primer desoxirribunucleótido
• DNA pol III.- Realiza la síntesis del DNA propiamente dicha.
Su función es incorporar desorribonucleótidos al extremo –OH 3´de la
nueva cadena.
Duplica una cadena (cadena guía) en forma continua, con dirección 5´---3´,
Con la misma dirección duplica la otra cadena (cadena resagada) de manera
discontinua, formando los fragmentos de Okasaki.
Cada fragmento de Okasaky esta formado por aprox. 100 nucleótidos en
eucariotes y 1000 en procariotes.
• DNA pol I.- Verifica y corrige (actividad exonucleasa 3´---- 5´).

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 7

 Ademas elimina el RNA cebador de cada fragmento de Okasaki (actividad
exonucleasa 5´----- 3´), llenando a su vez los huecos formados al eliminar
estos (actividad polimerasa).
• DNA ligasa.- Cataliza la formación de un enlace fosfodiester en el –OH 3´
libre de un extremo de la cadena y el grupo fosfato del 5´del otro extremo.

Inhibidores de la duplicación:

Actinomicina D (se intercala entre G-C),

Bromuro de etidio (altera la función del DNA templado)
Ácido nalidíxico (inhibe a la DNA girasa)
Ciprofloxacina (inhibe DNA girasa)

TRANSCRIPCIÓN

Características de la transcripción

• Sucede en cualquier fase del ciclo celular

• Se requiere de los ribonucleótidos ATP, GTP, CTP y UTP
• Se requiere el templado de DNA de doble cadena
• Se transfieren genes
• El mismo gene se puede transcribir varias veces
• La dirección de la transcripcion es 5´----------3´
• Se transcribe sólo en cadena
• No se requiere de un primer
• Sitio de la transcripción:
Eucariotes.- Núcleo
Mitocondria

Procariotes.- Citosol

Enzimas que participan en la transcripción

• RNA polimerasa (RNA pol)
Reconoce el sitio de iniciación en el DNA
Desenrolla parcialmente la molécula molde de DNA
Cataliza la elongación de la cadena al mismo tiempo que desenrolla
y enrolla el DNA
Termina la transcripción después de copiar el gene
Esta formada por varias subunidades (tetramérica):
2 ,  y ´
En eucariotes existen 3 RNA pol
RNApol I------------RNAr
RNApol II-----------RNAm
RNApol III----------RNAt
En procariotes existe solo una para todos los RNAs
Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 8
Previo al gene que se ha de transcribir existe una región llamada PROMOTOR
• En la región –10 del promotor existe la caja TATA o caja de PRIBNOW, sitio
que debe ser reconocido por la RNA pol para iniciar la transcripción
• En esta región del promotor existe la región –35 que tambien debe ser
reconocida por la RNA pol para iniciar el proceso
• El reconocimiento del promotor para iniciar el proceso corre a cargo de la
subunidad sigma () que se une a la RNA pol para formar la holoenzima.

El proceso de transcripcion se divide en 3 etapas: Iniciación, elongación o

alargamiento y terminación.

INICIACIÓN

• La RNA pol (holoenzima) abre la doble helice del DNA templado (separa la
cadena molde de la antimolde) en la región del promotor para iniciar la
síntesis de RNA.
• El primer ribonucleotido que se transcribe es una pirimidina, por lo tanto se
incorpora una purina.
• La subunidad sigma se disocia de la RNA pol, cuando la cadena de RNA
contempla 10 ribonucleótidos, hasta este momento se considera etapa de
iniciación.

ELONGACIÓN
La RNA polimerasa se aleja del promotor a lo largo del DNA molde incorporando
ribonucleótidos

TERMINACIÓN
Tiene lugar debido a la pérdida de estabilidad del complejo de elongación, al
transcribirse ciertas secuencias específicas del DNA.
• Estas secuencias son ricas en pares G=C (3 puentes de hidrógeno) por lo
que la velocidad de transcripción disminuye
• A estos sitios se les conoce como “sitios de pausa”
• En estos sitios existen regiones palindrómicas, que al transcribirse se forman
en horquilla
• Esta horquilla desestabilizada al híbrido RNA:DNA en el complejo por lo que
se desprende el RNA recién transcrito.
• La eficacia de la terminación de la transcripción aumenta por la presencia del
factor RhO ()

La rifampicina inhibe la transcripción el unirse a la subunidad beta de la RNA pol

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 9

Regulación de la transcripción en E. coli (operón lactosa)

En presencia de glucosa
• En el operón lactosa el gene I codifica para un represor activo
• El represor activo se une a la región del operador evitando la transcripción
de los genes Y, Z y A.

En ausencia de glucosa (presencia de lactosa)

• En el operon lactosa el gene I codifica para un represor
• La lactosa (es el inductor) se une al represor evitando a su vez que este
inhiba la transcripción
• Por lo tanto se transcriben los genes estructurales al fijarse la RNA pol a la
región del promotor
• Este fijado de la RNA pol es más efectivo en presencia de CAP-AMPc
• El gene Z codifica para -galactosidasa
• El gene Y codifica para la permeasa
• El gene A codifica para la transacetilasa

CÓDIGO GENÉTICO

El código genético esta formado por 64 codones

• 61 codones cifran para los 20 aminoácidos formadores de proteínas
• 3 codones son llamados terminadores, porque no cifran para ningún
aminoácido. UAA, UGA y UAG
• algunos aminoácidos son codificados por más de un codón (hasta 6), razón
por la cual se le conoce como código genético degenerado
• AUG es el codón que codifica para metionina y es el codón iniciador de la
síntesis de proteínas

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 10

 SÍNTESIS PROTEICA (eucariotes)
La síntesis proteica traducción se divide en 3 etapas:
Iniciación
Elongación o alargamiento
Terminación
Además de estas etapas, existen otras etapas necesarias para este proceso, 2 son
previas; activación y formilación y una más es posterior, llamada procesamiento
postraduccional
ACTIVACIÓN.- Activación del aa, se refiere a la unión de este con su RNAt
específico, es decir formación de aminoacil-RNAt
• Para esto se requiere de la enzima aminoacil-RNAt sintetasa
• Esta enzima requiere para su acción: ATP, RNAt y AAs
• Cada AA que participa en la síntesis proteica deberá ser activado, tanto en
procariotes como en eucariotes

FORMILACIÓN.- Esta etapa sucede sólo en la traducción en procariotes, y

solamente se formila el primer aa de la síntesis (metionina)

INICIACIÓN.- Esta etapa requiere de factores de iniciación y de la hidrólisis de GTP

en GDP y Pi
• Esta etapa inicia con la disociación del ribosomas por la presencia de los
factores de iniciación
• Acaba al formarse de nuevo el ribosoma, en este momento se distinguen 2
sitios en el, sitio P (peptidil) y sitio A (aminoacil)

ELONGACIÓN o ALARGAMIENTO.- También requiere de factores de

alargamiento y de la hidrólisis de GTP por cada aa que se incorpore.
• En esta etapa ocurre la actividad de peptidil transferasa (formación del
enlace peptídico)
• En esta etapa ocurre la translocación (desplazamiento del ribosoma sobre
el RNAm en el sentido 5´-----------3´)
• Esta translocación depende del factor de alargamiento EFG (procariotes) o
FA2 (eucariotes), llamados también translocasa y de la hidrólisis de GTP

TERMINACIÓN.- En eucariotes depende de los factores de relajación RF y de la

hidrólisis de GTP.
De acuerdo al codón de terminación será el factor de liberación o relajación:
RF1--------UAA y UAG
RF2--------UAA y UGA
Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 11
 RF3--------Potencializa la acción de RF1 y RF2.

PROCESAMIENTO POSTRADUCCIONAL.- En esta etapa puede ocurrir:

• Eliminación del grupo formilo de la formilmetionina terminal
• Eliminación de la metionina N-terminal
• Formación de los enlaces disulfuro
• Hidroxilación
• Fosforilación de hidroxiaminoácidos
• Carboxilación
• Metilación
• Unión a grupos prostéticos
• Proteólisis

Inhibidores de la síntesis proteica:

• CLORANFENICOL.- Inhibe alargamiento (peptidil transferasa) tanto en

procariotes como eucariotes
• ERITROMICINA.- Inhibe alargamiento (translocasa), en procariotes y
eucariotes
• PUROMICINA.- Inhibe alargamiento (actúa como análogo de tir-RNAt)
provocando una terminación prematura
• ESTREPTOMICINA.- Inhibe iniciación (impide la unión de formil-met-RNAt)
en procariotes y eucariotes
• TETRACICLINAS.- Inhibe alargamiento e iniciación tanto en procariotes y
eucariotes
• AC. AURINTRICARBOXÍLICO.- Inhibe iniciación (impide la unión del
ribosoma al RNAm) solo en procariotes

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 12

 MUTAGÉNESIS

Mutación.- Es una alteración en la secuencia de bases o material genético.

Mutante.- Estado genético de un organismo
Mutágeno.- Agente físico o químico que causa una mutación

Mutación puntual
Cambio de bases
Transición.- Cuando el cambio de bases es de una purina por otra o
de una pirimidina por otra.
Transversión.- Cuando el cambio de bases es de una purina por
una pirimidina o viceversa.

Por la alteración en la secuencia de aminoácidos las mutaciones pueden ser:

Sentido equivocado.- Un aminoácido es cambiado por otro
Sin sentido.- Se origina un codón de terminación
Ocre UAA
Ambar UAG
Ópalo UGA

Los mutágenos pueden ser:

Físicos.- Temperatura, RX, UV.
Químicos.- Ácido nitroso, Análogos de bases (bromouracilo, 2-
aminopurina), hdroxilamina, Agentes intercalantes (acridinas, bromuro de etidio).
Biológicos.- Virus

Autor: Marco Antonio Falcón Franco M en C. 13