Unidad 1

Aminoácidos y
Proteínas

BIOQUÍMICA GENERAL
DBIO1037

Edición:
Paula Aracena S., PhD
Funciones de proteínas
Las funciones de las proteínas son múltiples debido a la diversidad posible de
estructuras.

MOVIMIENTO
Miosina, actina
TRANSPORTE CATÁLISIS
Albúmina, hemoglobina Enzimas
DIVERSIDAD DE
FUNCIÓN

ADHESIÓN COMUNICACIÓN
CELULAR Hormonas, proteínas de
Integrinas, caderinas señalización
DIVERSIDAD DE
PROTEÍNAS DE
ESTRUCTURA
MEMBRANA INMUNIDAD
Receptores, bombas Anticuerpos, complemento
ASISTENCIA
Histonas, chaperonas
 Resultado de aprendizaje

Relaciona los niveles de organización estructural de

las proteínas con la función biológica, considerando
los tipos de aminoácidos involucrados y las
interacciones con su medio ambiente.
 Recursos Conceptuales

ESTRUCTURA DE FUNCIÓN DE REGULACIÓN DE

AMINOÁCIDOS
PROTEÍNAS PROTEÍNAS PROTEÍNAS
¿Qué son? ¿Cómo se organizan ¿Cómo se relaciona la ¿Cuáles son los
¿Cómo funcionan? estructuralmente los estructura con la función de mecanismos que provocan
¿Para qué sirven? aminoácidos en una una proteína? cambios en la función
proteína? proteica?
Aminoácidos
Son moléculas que contienen a lo menos un grupo amino y un grupo carboxilo.

R – NH2

R1 – NH – R2 O
R–C
R1 – N – R2 OH
–

R3

GRUPO AMINO GRUPO CARBOXILO

Función orgánica nitrogenada Función orgánica oxigenada,
unida a carbonos que no forman formada por un alcohol unido a
parte de grupos carbonilo. un carbonilo.
Aminoácidos
Son moléculas que contienen a lo menos un grupo amino y un grupo carboxilo.

Ácido g-aminobutírico
Ácido aminolevulínico (GABA)

Levodopa Alanina
a-aminoácidos
Son aminoácidos en los que los grupos amino carboxilo están unidos al mismo
carbono, denominado carbono alfa (a).

Ácido g-aminobutírico
Ácido aminolevulínico (GABA)

Levodopa Alanina
a-aminoácidos
Son aminoácidos en los que los grupos amino carboxilo están unidos al mismo
carbono, denominado carbono alfa (a).

Alanina Levodopa

a-aminoácidos clásicos a-aminoácidos no

clásicos
Corresponden a los 20 Son a-aminoácidos no
a-aminoácidos que forman parte proteinogénicos, que presentan
de las proteínas funciones metabólicas.
a-aminoácidos clásicos
Presentan una estructura genérica, basada en cuatro grupos unidos al carbono
a: hidrógeno, amino, carboxilo y cadena lateral (R).

NH2 Ca COOH

L-a-aminoácido D-a-aminoácido
El carbono a (central) es quiral en
todos los a-aminoácidos clásicos,
excepto glicina.
a-aminoácidos clásicos
La cadena lateral es lo que le proporciona identidad y reactividad específica a
cada a-aminoácido.

(Triptofano)
(Arginina)
204Da
- +

R 75Da
(Glicina)
(Aspartato)

TAMAÑO CARGA

NH2 Ca COOH POLARIDAD REACTIVIDAD

(Fenilalanina) Ácido-Base

H Polar Apolar
Nucleofilicidad

Electrofilicidad
(Aspartato)
Redox
Tamaño de a-aminoácidos
El tamaño de las cadenas laterales es específico para cada a-aminoácido y este
tamaño repercute en su disposición cuando forma parte de proteínas.

Lisina

Prolina
Glicina
Fenilalanina

Alanina Histidina Triptófano

Ácido glutámico
Polaridad de a-aminoácidos
Las cadenas laterales de los a-aminoácidos pueden presentar grupos polares o
apolares, determinando sus posibilidades de interactuar con agua.

Serina a-aminoácido polar

Puente de hidrógeno Cadena lateral soluble en
agua y poco soluble en
lípidos.

Fenilalanina
a-aminoácido apolar
Cadena lateral poco soluble
en agua y soluble en lípidos.
Reactividad redox de a-aminoácidos
Existen pocos a-aminoácidos con la capacidad de entregar electrones. Dicha
actividad está determinada por la presencia de azufre (S) en la cadena lateral.

Cisteína Puente disulfuro

R R

Modificación
Metionina por un oxidante O Sulfóxido

Se pueden oxidar, por lo que se pueden comportar como

Carga de a-aminoácidos
La carga de los a-aminoácidos depende de su reactividad ácido-base, dada
sólo por la presencia de grupos amino y carboxilo (ionizables).

Fenilalanina Lisina

Serina

¡Es una
amida!

Glutamina Ácido glutámico

2 grupos 3 grupos
ionizables ionizables
Ionización de a-aminoácidos
Los aminoácidos pueden ionizarse en virtud de la reactividad ácido-base de sus
grupos carboxilo y amino.

(base) (ácido)

R NH2 R
R COOH

H+
NH2 Ca COOH
H+

H
R NH3+ R COO-
Ionización de a-aminoácidos
Los grupos ionizados y no ionizados reciben nombres diferentes y tienen
distintas propiedades ácido-base.

R NH2 + H+ R NH3+

Grupo Grupo
AMINO
(base) AMONIO
(ácido)

R COOH R COO- + H+

Grupo Grupo
CARBOXILO
(ácido) CARBOXILATO
(base)
Ionización de a-aminoácidos
Por convención, las ionizaciones siempre se escriben como reacciones de
ácidos. La constante de acidez (Ka) indica el grado de acidez de estos grupos.

R NH3+ R NH2 + H+

Grupo Grupo
AMONIO
(ácido) AMINO
(base)
[base] [H+]
Ka =
[ácido]
R COOH R COO- + H+

Grupo Grupo
CARBOXILO
(ácido) CARBOXILATO
(base)
Ionización de a-aminoácidos
Cada vez que se valora el grado de acidez de dos o más grupo químico, se
comparan sus valores de Ka o pKa.

[base] [H+]
Ka = pKa = - Log Ka
[ácido]

Mejor ácido Peor ácido

MAYOR Ka Ka MENOR Ka

MENOR pKa pKa MAYOR pKa

Ionización de a-aminoácidos
Cada vez que se valora el grado de acidez de dos o más grupo químico, se
comparan sus valores de Ka o pKa.

R
Asignar un valor de pKa a un
NH2 Ca COOH
grupo básico es UN ERROR.
pKa = 11
pKa = 3
H
Ionización de a-aminoácidos
Cada vez que se valora el grado de acidez de dos o más grupo químico, se
comparan sus valores de Ka o pKa.

¿Cuál de estos grupos es el mejor ácido?

R
¿Cuál es el peor ácido?
NH3+ Ca COOH
¿Cuál tiene más facilidad para entregar su protón?
pKa = 11
pKa = 3
H ¿Para cuál es más difícil entregar su protón?
Ionización de a-aminoácidos
El valor de pKa es el más útil, ya que permite deducir el estado de ionización de
los grupos ionizables de los aminoácidos a diferentes pH del medio.

ÁCIDO BASE Si el pKa = 3:

R AH R A- + H+
¿A qué pH habrá más ácido?
¿A qué pH habrá más base?
¿A qué pH habrá iguales
pH concentraciones de ácido y
pKa ÁCIDO
de base?
ÁCIDO BASE
BASE ÁCIDO
BASE
Ionización de a-aminoácidos
El valor de pKa es el más útil, ya que permite deducir el estado de ionización de
los grupos ionizables de los aminoácidos a diferentes pH del medio.

ÁCIDO BASE Si el pKa = 11:

R AH R A- + H+
¿A qué pH habrá más ácido?
¿A qué pH habrá más base?
¿A qué pH habrá iguales
pH concentraciones de ácido y
pKa ÁCIDO
de base?
ÁCIDO BASE
BASE ÁCIDO
BASE
 Ionización de a-aminoácidos
Los a-aminoácidos presentan a lo menos dos grupos ionizables (y dos valores
de pKa), por lo que pueden sufrir a lo menos dos reacciones de ionización.

ÁCIDO
ÁCIDO pH BASE
BASE

pKa1 = 3 pKa2 = 11

R R R
H+ H+

NH3+ Ca COOH NH3+ Ca COO- NH2 Ca COO-

H+ H+
pKa = 11 pKa = 3 pKa = 11
H H H
MEJOR PEOR
ÁCIDO ÁCIDO
Especie más abundante Especie más abundante Especie más abundante
a pH < 3 a pH entre 3 y 11 a pH > 11
 Ionización de a-aminoácidos
Los a-aminoácidos presentan diferente carga neta, dependiendo de los pKa de
sus grupos ionizables y el pH del medio.

ÁCIDO
ÁCIDO pH BASE
BASE

+1 pKa1 = 3 0 pKa2 = 11 -1

R R R
H+ H+

NH3+ Ca COOH NH3+ Ca COO- NH2 Ca COO-

H+ H+
pKa = 11 pKa = 3
H H H

Especie más abundante Especie más Especie más abundante

a pH < 3 abundante a pH > 11
a pH entre 3 y 11
Ionización de a-aminoácidos
Los a-aminoácidos presentan diferente carga neta, dependiendo de los pKa de
sus grupos ionizables y el pH del medio.

ÁCIDO
ÁCIDO pH BASE
BASE

+1 pKa1 0 pKa2 -1

Especie Especie Especie

mayoritaria con mayoritaria con mayoritaria con
carga neta carga neta neutra carga neta negativa
positiva (desprotonada)
(protonada)

protonación
Especie zwitteriónica y punto isoeléctrico
La especie zwitteriónica es aquella con carga neta cero y el punto isoeléctrico
(pI) corresponde al pH en el cual sólo está presente esta especie.

ÁCIDO
ÁCIDO pH BASE
BASE

pKa1 pI pKa2

Sólo zwitterión
presente

Especie Especie Especie

mayoritaria con mayoritaria con mayoritaria con
carga neta +1 carga neta 0 carga neta -1
(protonada) (zwitterión) (desprotonada)
Especie zwitteriónica y punto isoeléctrico
El punto isoeléctrico se calcula como un promedio de pKa de los 2 grupos que,
al ionizarse, generan el zwitterión.

ÁCIDO
ÁCIDO pH BASE
BASE

pKa1 pI pKa2

pKa1 + pKa2
pI =
2
Especie zwitteriónica y punto isoeléctrico
El punto isoeléctrico se calcula como un promedio de pKa de los 2 grupos que,
al ionizarse, generan el zwitterión.

ÁCIDO
ÁCIDO pH BASE
BASE

pKa1 pI pKa2
3 7 11
R
¿Cuál es el punto isoeléctrico de este
a-aminoácido?
NH3+ Ca COOH

pKa = 11 ¿Qué especies serán mayoritarias a pH

pKa = 3
H 2, 5, 7, 9 y 12?
Especie zwitteriónica y punto isoeléctrico
Cuando un a-aminoácido presenta tres grupos ionizables (tres valores de pKa),
presentará tres reacciones de ionización.

+2
Lisina pKa = 2,2 3 grupos ionizables
+
En cada ionización, +1
H3
1 grupo carboxilo el grupo pierde un H+
pKa = 10.5 + 0
NH3 2 grupos amonio
pKa = 9,0 -1

protonación

pI = 9,8 pH
pKa1 pKa2 pKa3
+2 2,2 +1 9,0 0 10,5 -1
Especie zwitteriónica y punto isoeléctrico
Cuando un a-aminoácido presenta tres grupos ionizables (tres valores de pKa),
presentará tres reacciones de ionización.

+1
pKa = 4.3 pKa = 2,2 3 grupos ionizables 0
En cada ionización,
2 grupo carboxilos el grupo pierde un H+
Ácido glutámico
+
NH3 -1
1 grupo amonio
pKa = 9,7 -2

protonación

pI = 3,3 pH
pKa1 pKa2 pKa3
+1 2,2 0 4,3 -1 9,7 -2
Clasificación de a-aminoácidos
Existen muchas formas de clasificar a-aminoácidos. Una de las más usadas es
por tipo de cadena lateral.

Leucina Fenilalanina

APOLARES ALIFÁTICOS APOLARES AROMÁTICOS

Cadena lineal Cadena aromática
sin grupos polares sin grupos polares
Clasificación de a-aminoácidos
Existen muchas formas de clasificar a-aminoácidos. Una de las más usadas es
por tipo de cadena lateral.

Treonina Histidina Ácido aspártico

POLARES SIN CARGA POLARES POSITIVOS POLARES NEGATIVOS

Cadena con grupos Cadena con grupos amino Cadena con grupos carboxilo
polares no ionizables (BÁSICOS) (ÁCIDOS)
Esencialidad de a-aminoácidos
La clasificación de acuerdo a esencialidad depende de la capacidad biosintética
de los organismos.

CO2
NH4+
Cofactores

Síntesis Síntesis partir de

de novo otro a-aminoácido

ESPECIE ESPECÍFICA RUTAS DE BIOSÍNTESIS

Cada especie tiene sus propios Los a-aminoácidos esenciales NO presentan
a-aminoácidos esenciales ninguna ruta de biosíntesis en ese organismo
Fuentes dietarias de a-aminoácidos
Los a-aminoácidos son obtenidos de la dieta por degradación de alimentos
ricos en proteínas.

Huevos
Frutos
secos Leche

Frutas y
verduras
Quinua Carnes y
Granos y legumbres pescados

BAJA CALIDAD PROTEICA ALTA CALIDAD PROTEICA

Alimento bajo en proteínas o Alimento alto en proteínas
están desprovistos de 2 o más con todos los
a-aminoácidos esenciales a-aminoácidos esenciales
Resultado de aprendizaje

Relaciona los niveles de organización estructural de

las proteínas con la función biológica, considerando
los tipos de aminoácidos involucrados y las
interacciones con su medio ambiente.
Enlace peptídico
Corresponde al enlace que se forma entre dos aminoácidos, a través de una
reacción de condensación (salida de agua).

R R

NH2 Ca COOH
CO NH
NH2 Ca COOH

H H

H2 O
Enlace peptídico
Este enlace forma una nueva función orgánica (amida), que tiene diferente
reactividad a la de los grupos carboxilo y amina que reaccionaron.

NO SE IONIZA GEOMETRÍA PLANA ROTACIÓN RESTRINGIDA

Las amidas no tienen Existe resonancia del grupo El enlace C-N se comporta como un
reactividad ácido-base carbonilo (-CO-) con el nitrógeno enlace doble, a pesar de ser simple
Péptidos
Son polímeros pequeños formados por hasta 100 residuos de a-aminoácido.
Presentan al menos un enlace peptídico.

TRES ENLACES
PEPTÍDICOS
Péptidos
Son polímeros pequeños formados por hasta 100 residuos de a-aminoácido.
Presentan al menos un enlace peptídico.

4 CARBONOS a

4 RESIDUOS DE
a-AMINOÁCIDO

TETRAPÉPTIDO
Péptidos
Son polímeros pequeños formados por hasta 100 residuos de a-aminoácido.
Presentan al menos un enlace peptídico.

4 CADENAS
LATERALES
Péptidos
Son polímeros pequeños formados por hasta 100 residuos de a-aminoácido.
Presentan al menos un enlace peptídico.

Residuo de cisteína Residuo de glutamato

(Cys) (Glu)

4 GRUPOS
IONIZABLES

+NH -Cys-His-Glu-Met-COO-
3

Residuo de metionina
Residuo de histidina (Met)
(His)
Péptidos
Son polímeros pequeños formados por hasta 100 residuos de a-aminoácido.
Presentan al menos un enlace peptídico.

+NH -
3-Cys-His-Glu-Met-COO

Por convención el grupo Por convención el grupo

amonio (o amino) se escribe a carboxilato (o carboxilo) se
la izquierda escribe a la derecha

AMINO TERMINAL CARBOXILO TERMINAL

N-TERMINAL Secuencia C-TERMINAL
“RÍO ARRIBA” “RÍO ABAJO”
Clases de péptidos
De acuerdo al número de residuos de a-aminoácido que presenten, reciben
nombres especiales.

NH2

NH2

NH2 COOH

COOH

COOH

Angiotensina II Glucagón Hormona paratiroidea

(8 residuos) (29 residuos) (84 residuos)

OLIGOPÉPTIDOS PÉPTIDOS POLIPÉPTIDOS

2-10 residuos 10-50 residuos 50-100 residuos
(menos de 1 kDa) (1-5 kDa) (5-10 kDa)
Proteínas
Son polímeros de más de 100 residuos de a-aminoácido (masa sobre 10 kDa).
Son macromoléculas fundamentales para la función celular.

Fibrilares

Globulares

DIVERSIDAD DE FORMA MÚLTIPLES FUNCIONES CODIFICADAS EN GENES

Múltiple disposición Desde funciones estructurales y Se sintetizan de novo a partir de
espacial de los residuos mótiles hasta la catálisis de genes, transcritos por ARNm y
que las conforman reacciones químicas traducidos en los ribosomas
Estructura primaria
Corresponde al ordenamiento (secuencia) de los residuos de a-aminoácido
que conforman a la proteína.

NH2

COOH

DETERMINADA ESTABLECIDA
ESPECÍFICA
GENÉTICAMENTE COVALENTEMENTE
Cada proteína tiene su La secuencia de residuos depende Se mantiene por enlaces peptídicos
propia estructura de la secuencia de ADN del gen (covalentes) entre los residuos que
primaria específica que la codifica las conforman
Estructura primaria
La forma que adopta una proteína es la expresión espacial de la información
lineal de la estructura primaria.

Glucagón

NH2-His-Ser-Gln-Gly-Thr-Phe-Thr-Ser-Asp-Tyr-Ser-Lys-Tyr-Leu-Asp-Ser-Arg-
Arg-Ala-Gln-Asp-Phe-Val-Gln-Trp-Leu-Met-Asn-Thr-COOH
Niveles de organización proteica
A partir de la estructura primaria se obtienen niveles jerárquicos de organización
espacial de las proteínas.

ESTRUCTURA ESTRUCTURA ESTRUCTURA ESTRUCTURA

PRIMARIA SECUNDARIA TERCIARIA CUATERNARIA
Estructura secundaria
Corresponde a la organización espacial que resulta de la interacción de cadenas
laterales entre sí, principalmente a través de puentes de hidrógeno.

Hélice a Hoja b
Estructura en Estructura en
forma de cable forma de sábana
(helicoidal) (plana)
Estructura secundaria
La hélice a se forma con mayor facilidad con residuos de cadena alifática,
como Met, Ala, Leu, Asp y Lys. Residuos de Pro provocan ruptura de la hélice.

EN PROMEDIO PRESENTA
3,6 RESIDUOS POR VUELTA

SE REPRESENTA COMO
UNA CINTA

ES DEXTRÓGIRA
Estructura secundaria
La hoja b se forma con mayor facilidad con residuos aromáticos y alifáticos
ramificados, como Thr, Val e Ile.

GENERALMENTE TIENE DE 3
A 10 RESIDUOS DE LARGO

SE REPRESENTA COMO
FLECHAS PARALELAS

ES EXTENDIDA
Estructura secundaria
La hoja b se puede presentar en dos conformaciones, dependiendo de la
dirección de la cadena polipeptídica (siempre de N-terminal a C-terminal).

Hacia el
C-terminal Hacia el
C-terminal

Hacia el
N-terminal Hacia el
N-terminal

CONFORMACIÓN CONFORMACIÓN
ANTIPARALELA PARALELA
Estructura de péptidos
Debido a su pequeño tamaño, oligopéptidos y péptidos no alcanzan altos niveles
de organización, sino usualmente estructura secundaria como máximo.

DESORDENADA HÉLICE a HOJA b

(coiled coil)
 Estructura terciaria
Corresponde a la organización espacial que resulta de la interacción de
estructuras secundarias entre sí y con el medio.

Proteína soluble
Sólo a en agua RESIDUOS
Coordinación de
Interacción iónica
iones
POLARES
Sólo b
Puente de
hidrógeno

a/b RESIDUOS Interacción

alternada a+b APOLARES hidrofóbica Puente
independientes Proteína integral disulfuro
de membrana

DETERMINADA POR LAS DETERMINADA POR MANTENIDA POR INTERACCIONES

ESTRUCTURAS SECUNDARIAS EL MEDIO DÉBILES Y PUENTES DISULFURO
La abundancia relativa de La disposición de los residuos Se mantiene principalmente por
estructuras secundarias es hacia la superficie y el interior interacciones hidrofóbicas y
específica depende de la solubilidad puentes disulfuro
Estructura cuaternaria
Organización espacial que resulta de la interacción entre dos o más cadenas
proteicas (subunidades) cada una con su propia estructura terciaria.

SOD1 ATP
Homodímero SINTASA
Heteromultímero Coordinación de
Interacción iónica
iones

Puente de
hidrógeno

Fibrilares
Interacción
hidrofóbica Puente
disulfuro
HEMOGLOBINA Globulares
Heterotetrámero

DETERMINADA POR DETERMINADA POR MANTENIDA POR LAS MISMAS

LAS ESTRUCTURAS INTERACCIONES INTERACCIONES QUE LA
TERCIARIAS DE PROTEÍNA-PROTEÍNA Y ESTRUCTURA TERCIARIA
CADA SUBUNIDAD CON EL MEDIO
Fuerzas que mantienen la estructura proteica
Los niveles de complejidad son jerárquicos, por lo que las fuerzas que
mantienen cada nivel son sumatorias a las del nivel precedente.
Coordinación
Puente de de iones
hidrógeno
Puente de Interacciones
hidrógeno iónicas

Puente de
hidrógeno

Interacciones
Hidrofóbicas Puente
disulfuro

ESTRUCTURA ESTRUCTURAS TERCIARIA Y

SECUNDARIA CUATERNARIA
Resultado de aprendizaje

Relaciona los niveles de organización estructural de

las proteínas con la función biológica, considerando
los tipos de aminoácidos involucrados y las
interacciones con su medio ambiente.
Estructura-función de proteínas de interés
biológico
La función de proteínas está íntimamente relacionada con su estructura.

α-queratina

Motivo
Fibroína Gly-X-Y

Gly
Pro
Hojas β H-Pro
desordenadas Gly β-queratina
Región Pro
apolar Hojas β H-Pro
ordenadas
Gly
Cadena
amorfa

ALBÚMINA FIBROÍNA COLÁGENO QUERATINA

Proteína de transporte Componente de las fibras Componente del Componente de protección
plasmático de seda soporte conectivo de tejido epitelial
Relación estructura-función de proteínas
La función de proteínas está íntimamente relacionada con su estructura. Por lo
tanto, existen estructuras conservadas debido a la función que cumplen.

Motivo Walker A
de unión a ATP ATP

Humano GVPNVGKS
VacunoS
GVPNVGKS
Drosophila Lys
Dominio de S
Arroz
unión a ATP GVPNVGKS
Bacteria
S
GVPNVGKS
A
DOMINIOS MOTIVOS RELACIÓN ESTRUCTURA-
GIPNAGKST
FUNCIÓN
Regiones de la proteína con Secuencias de residuos de La forma de los dominios y la
una organización espacial que a-aminoácido conservadas, que disposición de los motivos determina
cumple una función forman parte de los dominios la función
Relación estructura-función de proteínas
Una alteración de la estructura puede conducir a la pérdida de la función de
las proteínas, en distinto grado.

GVPNVGKS
S

GVPNVGAS Ala
S

ALTERACIONES
MUTACIONES PÉRDIDA DE FUNCIÓN
ESPACIALES
Provocan la pérdida de la Cambios en la secuencia de los Puede ser total o parcial,
forma del dominio o que éste residuos de a-aminoácido de un dependiendo de la alteración
ya no esté expuesto al medio motivo
Conformación nativa de proteínas
Corresponde a la estructura espacial de menor energía de las proteínas, que es
la que expresa la función biológica.

Estructura primaria Conformaciones no

plegadas
Conformaciones no
plegadas

Conformaciones de
plegamiento intermedio
Conformaciones de
plegamiento intermedio

CONFORMACIÓN
NATIVA
Conformación nativa de proteínas
Corresponde a la estructura espacial de menor energía de las proteínas, que es
la que expresa la función biológica.

ARNm
Ribosoma

Péptido Proteína
naciente nativa

Prión

Creutzfeld-Jacob
Chaperonas

PLEGAMIENTO PLEGAMIENTO ASISTIDO ALTERACIONES DEL

ESPONTÁNEO POR CHAPERONAS PLEGAMIENTO
Para péptidos y proteínas Para la mayoría de las Es causa de múltiples
pequeñas proteínas enfermedades
Pérdida de la conformación nativa
La conformación nativa de proteínas puede perderse de dos maneras: mediante
hidrólisis o desnaturalización.

HIDRÓLISIS DESNATURALIZACIÓN
Pérdida de organización Pérdida de organización
espacial debido a ruptura de espacial, sin pérdida de
enlaces peptídicos estructura primaria
Hidrólisis del enlace peptídico
Es la reacción inversa a la condensación que forma el enlace peptídico, por lo
que rompe el enlace y regenera a-aminoácidos libres.

R R

NH2 Ca COOH
CO NH
NH2 Ca COOH

H H

H2 O
Hidrólisis de proteínas
Dado que rompe el enlace peptídico, la hidrólisis provoca una disrupción de la
estructura primaria de las proteínas y, por lo tanto es irreversible.

Ácidos 100ºC
o bases Pepsina
fuertes 48 horas

Bromuro de
cianógeno Tripsina

ALTERA LA ESTRUCTURA
HIDRÓLISIS QUÍMICA HIDRÓLISIS CATALIZADA
PRIMARIA
Rompe enlaces peptídicos Producida por agentes químicos Intervención de enzimas
hidrolíticas (proteasas)
Desnaturalización de proteínas
Corresponde a la pérdida de la organización espacial de proteínas, sin pérdida
de la estructura primaria. Puede ser reversible.

Agentes
Temperatura
reductores

OVOALBÚMINA
(irreversible) Detergentes
Urea
Alta fuerza
iónica
CASEÍNA
(reversible) Ácidos y
bases débiles

AGENTES FÍSICOS AGENTES QUÍMICOS

Permiten reversibilidad en Interfieren con las interacciones que
algunos casos. mantienen niveles de organización.
Generalmente irreversibles.
Proteínas conjugadas
Son proteínas que contienen moléculas constituyentes que no son de naturaleza
peptídica. La porción proteica se denomina apoproteína.

LIPOPROTEÍNAS
METALOPROTEÍNAS
LDL
Calmodulina HEMOPROTEÍNAS
FLAVOPROTEÍNAS Hemoglobina
D-aminoácido
oxidasa
Grupos prostéticos
Estos grupos, generalmente unidos a la proteína conjugada por un enlace
covalente, permiten interacciones específicas con moléculas redox activas.
Intercambio
de electrones
Grupos Fe-S Interacción con oxígeno
molecular
Grupo hem

SUCCINATO
DESHIDROGENASA
FAD (Complejo II mitocondrial)
Intercambio de
átomos de hidrógeno
Resultado de aprendizaje

Relaciona los niveles de organización estructural de

las proteínas con la función biológica, considerando
los tipos de aminoácidos involucrados y las
interacciones con su medio ambiente.
Regulación a distancia de la función proteica
La función de las proteínas generalmente está regulada. Dicha regulación puede
ocurrir a distancia, es decir en un sitio distinto al funcional.

Activa Más activa

Inactiva Menos activa

REGULACIÓN ALOSTÉRICA COOPERATIVIDAD

Se puede producir en proteínas con Sólo se puede presentar en proteínas
estructura terciaria o cuaternaria con estructura cuaternaria
Regulación alostérica de proteínas
Corresponde a la regulación a distancia de la función proteica por acción de
moléculas que se unen a un sitio distante y diferente del funcional.

Sitio funcional Activador alostérico

Inhibidor alostérico

Sitio
alostérico

SITIO ALOSTÉRICO TIPOS DE MODULADORES

Sitio diferente al funcional, que une moléculas El modulador distorsiona u optimiza el sitio
diferentes a las que une el sitio funcional funcional, inactivando o activando la proteína
Regulación de proteínas por cooperatividad
Corresponde a la regulación a distancia de la unión de un ligando por una
subunidad, dada por el mismo ligando uniéndose a otra subunidad.

CONFORMACIÓN
Cooperatividad positiva
RELAJADA
Máxima avidez
por el ligando

Cooperatividad negativa
CONFORMACIÓN
TENSA
Mínima avidez
por el ligando

COOPERATIVIDAD TIPOS DE COOPERATIVIDAD

Se basa en el equilibrio entre conformaciones El modulador altera la avidez de la
con mayor o menor avidez por ligando proteína por el ligando
Proteínas de transporte de oxígeno
Son proteínas especializadas, que unen oxígeno molecular para transportarlo
entre tejidos. La unión a oxígeno se produce a través de los grupos hem.

MIOGLOBINA HEMOGLOBINA
Proteínas de transporte de oxígeno
Son proteínas especializadas, que unen oxígeno molecular para transportarlo
entre tejidos. La unión a oxígeno se produce a través de los grupos hem.

Son hemoproteínas

Presentan alto contenido de hélice a

Son globulares

17,2 kDa 64,5 kDa

Monómero Tetrámero
1 hem 4 hem

MIOGLOBINA HEMOGLOBINA Estructura Estructura

(subunidad) terciaria cuaternaria

SIMILITUDES DIFERENCIAS
Regulación de hemoglobina y mioglobina
La hemoglobina, pero no la mioglobina, exhibe cooperatividad, debido a su
estructura cuaternaria. Además, la hemoglobina presenta regulación alostérica.

CONFORMACIÓN R CONFORMACIÓN T
Cooperatividad en la unión de oxígeno
La hemoglobina exhibe una cooperatividad positiva en la unión a oxígeno
molecular de sus subunidades.

A baja presión de oxígeno, la hemoglobina

se encuentra en conformación tensa y lo
O2 O2 une con baja avidez

Cuando 2 de las subunidades unen oxígeno

molecular, se produce una transición a la
conformación relajada
O2 O2
Esto provoca que la hemoglobina aumente
su avidez por oxígeno molecular
Cooperatividad en la unión de oxígeno
La cooperatividad positiva del oxígeno se evidencia en la ”curva de saturación de
oxígeno” de la hemoglobina, ausente en la de mioglobina.

MIOGLOBINA
La avidez (afinidad) por O2 de cada proteína
se deduce a partir de cuán empinada está
cada curva (pendiente)
Saturación con O2

La afinidad de la mioglobina por O2 es mayor

Este tipo de gráfico
que la de muestra cómo cambia la
hemoglobina
HEMOGLOBINA saturación de las proteínas con O2a medida
que aumenta
Pero la presión
la afinidad de O2 del medio
de la hemoglobina por O
2
aumenta a medida que aumenta la presión de
O2
La cooperatividad positiva del O2 se evidencia
por la forma sigmoidea de esta curva, a
diferencia de la hipérbola de la mioglobina
Presión de O2
Regulación alostérica de la hemoglobina
La hemoglobina también puede ser regulada alostéricamente, sujeta a inhibición
por protones (efecto Bohr) y por 2,3-bisfosfoglicerato.

O2 O2 La hemoglobina presenta sitios alostéricos

para protonesy para 2,3-bisfosfoglicerato

En presencia de estos inhibidores

O2 O2 alostéricos, la hemoglobina se inactiva
Regulación alostérica de la hemoglobina
El efecto Bohr y la inhibición por 2,3-bisfosfoglicerato también pueden
visualizarse en la curva de saturación de oxígeno de la hemoglobina.

-pH
2,3BPG
= 7,6
A pH más básico (menos protones, pH = 7,6),
Saturación con O2

la hemoglobina presenta mayor afinidad por

O2 que a pH más ácido (más protones, pH 7,2)
+ pH
2,3BPG
= 7,2
Asimismo, en presencia de 2,3-
bisfosfoglicerato (2,3BPG), la hemoglobina
presenta menor afinidad por O2 que en su
ausencia

Presión de O2
Relevancia biológica de la regulación de la
unión a oxígeno de hemoproteínas
Esta regulación explica la carga y descarga de oxígeno.

pO2, pH y 2,3BPG dependen de

la tasa metabólica
pO2
Alta pO2
pH
pH 7,6
2,3BPG
Baja tasa Alta tasa
metabólica metabólica

TEJIDO PULMONAR TEJIDO PERIFÉRICO

Relevancia biológica de la regulación de la
unión a oxígeno de hemoproteínas
Esta regulación explica la carga y descarga de oxígeno.

Mioglobina
La mioglobina es una proteína residente en tejido
muscular que actúa como reserva de O2, que sólo
lo descarga cuando la pO2 es mínima
Saturación con O2

En el tejido pulmonar, la hemoglobina carga

Hb en tejidos O2, debido a que hay mayor pO2 (se expresa
periféricos la cooperatividad positiva) y pH (menor
inhibición alostérica)
Hb en tejido
pulmonar
En tejido periféricos, la hemoglobina descarga O2
en forma dependiente de la tasa metabólica, que
determina pO2, pH y 2,3-bisfosfoglicerato
Presión de O2
Resultado de aprendizaje

Relaciona los niveles de organización estructural de

las proteínas con la función biológica, considerando
los tipos de aminoácidos involucrados y las
interacciones con su medio ambiente.