Análisis de Vocalizaciones

Animales
Marcelo Araya Salas
New Mexico State University

Taller análisis de vocalizaciones

animales en R
 Análisis de vocalizaciones
Análisis depende del tipo de pregunta:
• Estudios descriptivos:
– ¿Cuál es el comportamiento vocal de X especie?
– ¿Cómo varia el canto geográficamente?

• Estudios experimentales:
– ¿Cómo afecta el tamaño corporal la frecuencia del canto?
– ¿Qué ventaja brinda producir un repertorio largo?
– ¿Cómo afecta la estructura del hábitat los llamados?
 Análisis de
vocalizaciones
Descriptivo Experimental
Análisis Análisis
cualitativos cuantitativos

Medición Medición
automática manual
Inspección
visual de Medición
elementos multivariada Correlación
de elementos cruzada
individuales
 Análisis cualitativo
Elementos: unidades discretas mas simples que
componen un canto
A B C D
 Análisis cualitativo
Elementos: unidades discretas mas simples que
componen un canto
A BB B C DDD
 Análisis cualitativo
Tipos de elementos:

• Tonos puros
• Modulados
• Trinos
• Atonales
• Armónicos
• Inflexiones
 Análisis cualitativo
Sílabas: Serie de elementos que ocurren juntas
en un patrón particular
 Análisis cualitativo
Frases: Serie de sílabas que ocurren juntas en un
patrón particular.
 Análisis cuantitativo
• Combinaciones Amplitud
de 3 variables
Frecuencia

Tiempo

Tiempo (s)
 Análisis cuantitativo
Duración de los elementos:
 Análisis cuantitativo
Tiempo entre elementos:
 Análisis cuantitativo
Frecuencia min y max: max

min
 Análisis cuantitativo
Rango de frecuencia (max-min):

Rango
 Análisis cuantitativo
Frecuencia fundamental (frecuencia mas baja en el
espectro armónico)
 Análisis cuantitativo

F pico
F dominante
F fundamental
Tiempo pico

Duración

F modulacion = Δ F dominante
Entropía : homogeneidad en la distribución energía

Asimetría : simetría en la distribución energía

 Análisis cuantitativo
Otras caracteristicas:
# de oscilaciones/tiempo

Rangos de frec
totales

Pendientes
 Análisis cuantitativo
Correlación cruzada:

Indiv. 1 Indiv. 2 Corr. cruzada

•Maximiza ajuste
entre espectros
•Valor entre 0 y 1
 Análisis cuantitativo
Coordinación del canto:

1 2 3 4
1 2 3 4

1 2 3
1 2 3 4
 Análisis cuantitativo
Coordinación del canto:

1 2 3 4
1 2 3 4

1 2 3
1 2 3 4
 Análisis cuantitativo
Diversidad/riqueza acústica:
 Análisis cuantitativo
Riqueza acústica:

RA = (rank(Ht ) × rank(M))/ n2
 Programas de análisis

• Syrinx (PC; www.syrinxpc.com)

• Raven (PC y Mac;
www.birds.cornell.edu/brp/raven/RavenOverview.html)
• Soundruler (PC, Mac, Linux;
www.soundruler.sourceforge.net)
• Avisoft (PC; www.avisoft.com)
• R: seewave, tuneR, warbleR (PC, Mac y Linux)
 SYRINX
Ventajas:
• Gratis
• Analiza tiempo y freq
• Fácil de usar
• Despliega grabaciones
multicanal

Desventajas:
• No se ajustan parámetros
• No hace tablas
• No muestra oscilogramas
• No esta en mantenimiento
AVISOFT
Ventajas:
• Ajuste de parámetros
• Analiza tiempo y frec
• Hace tablas
• Correlación cruzada
• Ventanas múltiples

Desventajas:
• 2200 Euros
Ventajas:
• Gratis
• Especial para analizar sonidos simples y
repetitivos (insectos, ranas)
• Reconocimiento automático de pulsos
• Correlación cruzada

Desventajas:
• Corta los tracks
• No es útil para manipular
archivos
• Análisis de espectrog.
limitado
• No guarda tablas
 RAVEN
Ventajas:
• Licencias gratis
• Se ajustan parámetros
• Guarda tablas
• Vista de espectros
• Correlación cruzada
• Detección automatica

Desventajas:
• Manipulación de imágenes
• Calidad baja de los espectrogramas
• 500 dólares (al menos)
Ventajas:
• Gratis
• Máxima flexibilidad
• Se puede hacer todo (en teoría)
• Permite producir análisis a la
medida del problema

Desventajas:
• Curva de aprendizaje larga
• Lento en algunos casos