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TALLER 1 DE GENÉTICA
Guía de actividades
Introducción:
Existen múltiples técnicas moleculares para determinar de manera directa la secuencia de
nucleótidos presentes en un fragmento de ADN, que pueden utilizarse para detectar variaciones
respecto de una secuencia tomada como patrón (secuencia wild type). Esas variaciones son
consideradas mutaciones: cambios permanentes en la secuencia del ADN.
En este taller analizaremos dos aplicaciones de las técnicas directas de detección de mutaciones:
el diagnóstico molecular en el contexto de enfermedades producidas por mutaciones en genes
únicos y el uso en medicina forense (filiación, criminalística, etc).
Las técnicas analizadas en este taller son: PCR, PCR alelo específica y secuenciación de Sanger.
Para interpretar correctamente los resultados de las técnicas moleculares deben comprenderse
sus fundamentos bioquímicos y tener en cuenta las características de las secuencias presentes
en el genoma humano.
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Riordan, J.R.et al.(1989) Identification of the cystic fibrosis gene: Cloning and characterization of
complementary DNA. Science
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Para mayor información sobre los procesos celulares que involucran a la proteína cftr consultar:
http://www.uniprot.org/uniprot/P13569
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desde un punto de vista funcional celular pérdida de función (alelos nulos o alelos
hipofuncionantes). La mutación más prevalente en afectados es c.1521-1523delCTT//
p.Phe508del (mutación que a nivel del ADN representa la pérdida de 3pb entre los nucleótidos
1521-1523 del exón 10 y a nivel proteico se expresa como la ausencia del aminoácido
fenilalanina en la posición 508, generando un defecto en el plegado proteico que altera su
transporte a su localización definitiva en la membrana plasmática, comportándose como un
alelo nulo. Esta mutación presenta una prevalencia del 70% en población de Europa del norte.
En Argentina también es la mutación más frecuente con una prevalencia del 59% en los
afectados
Una niña de 8 años presenta signos compatibles con fibrosis quística, pero el diagnóstico es
controversial. Se decide realizar una prueba de diagnóstico molecular para determinar la
presencia de la mutación p.Phe508del. La prueba consiste en amplificar mediante PCR una
región del gen que contiene el triplete CTT del exón 10. Los productos de amplificación se
resuelven luego en un gel de poliacrilamida.
A continuación, se muestra el resultado de la prueba molecular de los miembros de la familia y
4: de la niña con diagnóstico presuntivo de fibrosis quística (probando):
C1 C2 1 2 3 4
C1, C2: controles (individuos de genotipo conocido)
1: padre del probando
2: madre del probando
3: hermano del probando
4: probando
1.1 Interprete el patrón de bandas para cada individuo de la familia. ¿Pude explicarse el
diagnóstico clínico del probando con esta prueba?
1.2 Explique el fundamento de la PCR alelo específica. ¿Qué resultados esperaría ver si la
mutación G551D estuviera ausente en la muestra analizada? ¿Y si estuviera presente? ¿Cómo
distinguiría la presencia de la mutación en homocigosis y heterocigosis?
El siguiente es el resultado de la PCR alelo específica para la mutación G551D
M CA CB 1 2 3 4
M: marcadores de peso molecular
CA, CB: controles (individuos de genotipo conocido)
1: padre del probando
2: madre del probando
3: hermano del probando
4: probando
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1.3 ¿Qué conclusiones puede sacar de esta prueba para la familia analizada?
Se realizaron pruebas con otras 10 mutaciones frecuentes, que en conjunto permiten explicar
el 84% de los casos. No se pudo encontrar una de estas mutaciones en la familia estudiada.
Por esa razón, se decidió secuenciar el gen CFTR en los miembros de la familia utilizando el
método de secuenciación de Sanger. Se detectó una variación respecto de la secuencia wild
type, en la posición 113 del exón 3. Esta mutación fue hallada en muestras de la madre y del
probando, pero no en muestras del padre y del hermano del probando.
A continuación, se muestra el fragmento de la secuenciación que compara la secuencia wild type
(izquierda) y la mutada (derecha)
2.1 ¿Por qué no se utiliza el análisis de ADN de regiones codificantes con fines forenses?
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El polimorfismo de los STR puede determinarse mediante la amplificación de estos por medio
de la técnica de PCR y el análisis posterior del tamaño de los productos de amplificación por
electroforesis en gel. A continuación, se observan ejemplos de tres STRs (M: marcadores de peso
molecular. 1-8: Distintos individuos analizados).
M 1 2 3 4 M 5 6 7 8 M
M 1 2 3 4 M 5 6 7 8 M
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M 1 2 3 4 M 5 6 7 8 M
2.2 ¿Por qué al analizar un microsatélite particular algunos individuos presentan una única
banda (ejemplo: individuo 5, para el microsatélite D7S820), mientras que hay otros que
presentan dos bandas (ejemplo: individuo 7, para el mismo microsatélite)?
2.3 ¿Cuáles son los mecanismos biológicos que permiten explicar el alto polimorfismo
poblacional de los microsatélites?
Para estimar el grado de certeza con que se asigna la paternidad es necesario contrastar la
probabilidad de que los alelos de un STR presentes en el hijo provengan del presunto padre
versus la probabilidad que los haya recibido de cualquier otro individuo en la población. De
acuerdo con eso, se calcula la razón entre ambas probabilidades, denominada índice de
paternidad (IP). Si al comparar los perfiles del hijo/a con los del presunto padre hay dos o más
STR en que los que no se observan alelos que tengan el mismo número de repeticiones, se
excluye la paternidad sin necesidad de realizar un cálculo probabilístico.
2.4 Observe la siguiente tabla perteneciente a un caso en que se quiere establecer una relación
de paternidad entre un niño y un presunto padre A (p-padre A), versus presunto padre B (p-
padre B). Los valores representan el número de repeticiones observadas en los alelos de los
microsatélites estudiados, que han sido determinados mediante la técnica de PCR con posterior
electroforesis en gel. ¿Qué conclusiones obtiene? ¿Alguno de los dos es el padre biológico del
niño? Justifique.
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