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Sommaire
Introduction et définitions
1. Les premières vaccinations et les prémices de la microbiologie
2. De la découverte des virus à leur caractérisation
3. De la définition des virus aux critères de classification
1. Virologie générale
Chapitre 1 : Les virus : structure et classification
1. Structure
1.1. L’acide nucléique viral
1.2. La capside
1.2.1. Nucléocapside à symétrie hélicoïdale
1.2.2. Nucléocapside à symétrie icosaédrique ou cubiqu
1.2.3. Capside à symétrie complexe
1.3. L’enveloppe virale
2. Classification et nomenclature des virus
3. Quelques exemples d’interaction virus-récepteur cellulaire
3.1. Les picornavirus
3.2. Le virus de la grippe
3.3. Le virus de l’immunodéficience humaine
II – Les interférons
1. Gènes et protéines
2. 2. Cellules productrices
3. Interférons et maladies infectieuses
3.1. Infections aiguës
3.2. Infections chroniques
3.3. Infections du système nerveux central
4. Rôle des interférons dans l’infection virale
5. Mécanisme de l’activité antivirale des interférons
5.1. Protéines antivirales
5.2. Résistance à l’effet antiviral
6. Autres effets biologiques des interférons
6.1. Effet sur la mitose des cellules normales et tumorales
6.2. Effet sur la réponse immunitaire
6.3. L’activité antitumorale
7. Utilisation de l’interféron en thérapeutique
7.1. Pharmacocinétique et modes d’administration
7.2. Thérapeutique antivirale
7.3. Thérapeutique antitumorale
1. Prévention
1.1. Introduction
1.2. Prévention primaire
1.2.1. L’isolement
1.2.2. L’hygiène générale
1.2.3. Le contrôle des vecteurs
1.2.4. L’immunisation : cas particulier de la vaccination
1.3. Prévention secondaire et dépistage
1.4. Prévention tertiaire
2. Maîtrise et éradication des maladies virales
3. Rappels de quelques définitions
2. Virologie systématique
Chapitre 14 : Picornaviridae
I – Caractères généraux
1. Classification
2. Caractères du virus
2.1. Structure
2.2. Le génome
2.2.1. Variations antigéniques et génétiques
2.2.2. Application au diagnostic, à l’identification et à l’épidémiologie
2.3. Résistance physico-chimique et conséquences épidémiologiques
3. Pouvoir pathogène
II – Les Rhinovirus
1. Caractères du virus
2. Multiplication
3. Pouvoir pathogène
4. Diagnostic virologique
4.1. Le diagnostic direct
4.2. Le diagnostic indirect
4.3. Indication
6. Traitement
Chapitre 18 : Astroviridae
1. Classification
2. Caractéristiques virologiques
2.1. Morphologie et propriétés physiques
2.2. Le génome et les protéines virales
3. Multiplication du virus
4. Épidémiologie
5. Pouvoir pathogène
6. Diagnostic virologique
7. Traitement et prévention
Chapitre 19 : Coronaviridae
I – les Coronavirus humains (HCoV)
1. Caractères du virus
1.1. Structure physico-chimique
1.2. Multiplication
1.1.1. Animaux sensibles
1.1.2. Culture du virus
1.1.3. Réplication in vitro
1.1.4. Évolution
1.3. Propriétés antigéniques
2. Épidémiologie, pouvoir pathogène
3. Diagnostic biologique
II – Torovirus
1. Caractéristiques du virion
2. Pouvoir pathogène
3. Méthodes de diagnostic
Chapitre 20 : Togaviridae
Les Alphavirus
Chapitre 25 : Bornaviridae
1. Classification et spectre d’hôte
2. Caractéristiques virologiques
2.1. Morphologie et propriétés physiques
2.2. Le génome et les protéines virales
3. Multiplication du virus
4. Épidémiologie
5. Pouvoir pathogène
5.1. Pathogenèse
5.2. Caractères cliniques de l’infection naturelle
6. Diagnostic virologique
6.1. L’isolement du virus ou la détection de ses constituants (antigènes ou génome) relève
actuellement de laboratoires spécialisés
6.2. Les méthodes sérologiques
Chapitre 28 : Paramyxoviridae
I – Virus Respiratoire Syncytial
1. Caractèristiques du virus
1.1. Structure physicochimique
1.2. Propriétés antigéniques
1.3. Multiplication au laboratoire
2. Épidémiologie
3. Pouvoir pathogène
3.1. Physiopathologie
3.2. Caractères cliniques
4. Diagnostic biologique
4.1. Le diagnostic par détection du virus en culture est moins utilisé que la recherche des
antigènes viraux qui permet un diagnostic rapide
4.2. Le diagnostic par titrage des anticorps anti-RSV a peu d’intérêt chez l’enfant
7. Traitement et prévention
II – Virus para-influenza
1. Caractèristiques du virus
1.1. Structure physico-chimique
1.2. Propriétés antigéniques
1.3. Multiplication
2. Épidémiologie
3. Pouvoir pathogène
4. Diagnostic biologique
4.1. Diagnostic direct et isolement
4.1.1. Prélèvements
4.1.2. Diagnostic direct
4.1.3. Isolement en cultures
4.2. Titrage des anticorps
5. Traitement et prévention
1. Caractères du virus
1.1. Structure physicochimique
1.2. Propriétés antigéniques
1.3. Multiplication au laboratoire
2. Épidémiologie
3. Pouvoir pathogène
3.1. Physiopathologie
3.2. Caractères cliniques
4. Diagnostic biologique
4.1. Diagnostic non spécifique
4.2. Diagnostic direct
4.3. Diagnostic par titrage d’anticorps
5. Traitement et prévention
IV – Virus de la Rougeole
1. Caractéristiques du virus
1.1. Structure physico-chimique
1.2. Propriétés antigéniques
1.3. Multiplication
2. Épidémiologie
3. Pouvoir pathogène
3.1. Physiopathologie
3.2. Caractères cliniques
4. Diagnostic biologique
4.1. Diagnostic direct
4.2. Diagnostic indirect
4.3 Diagnostic des complications neurologiques
5. Traitement et prévention
5.1. Traitement
5.2. Prévention
1. Classification
1.1. Virus Hendra
1.2. Virus Nipah
2. Distribution géographique
3. Manifestations cliniques
4. Diagnostic
5. Traitement
Chapitre 30 : Bunyaviridae
1. Caractères du virus
1.1. Morphologie
1.2. Propriétés physico-chimiques
2. Propriétés biologiques
3. Pouvoir pathogène
3.1. Genre Orthobunyavirus
3.2. Genre Hantavirus
3.2.1. Le virus Hantaan
3.2.2. Le virus Sin Nombre (Virus Hantaan du syndrome pulmonaire)
3.2.3. Le virus Puumala
3.2.4. Le virus Séoul
3.3. Genre Nairovirus
3.4. Genre Phlebovirus
4. Diagnostic de laboratoire
4.1. Diagnostic direct
4.2. Diagnostic indirect
Conclusion
Chapitre 31 : Arenaviridae
1. Caractéristiques des virus
1.1. Structure
1.2. Propriétés biologiques
2. Pouvoir pathogène
2.1. Virus de la chorioméningite lymphocytaire
2.2. Fièvre de Lassa
2.3. Fièvre hémorragique d’Argentine
2.4. Fièvre hémorragique de Bolivie
3. Diagnostic
3.1. Chorioméningite lymphocytaire
3.2. Fièvre de Lassa
3.3. Fièvres hémorragiques d’Amérique du Sud
4. Épidémiologie
5. Traitement
5.1. Traitement antiviral
5.2. Sérothérapie
6. Prévention
Chapitre 32 : Reoviridae
I – Reovirus
II – Orbivirus
III – Coltivirus
IV – Les rotavirus
1. Classification
2. Caractéristiques virologiques
2.1. Morphologie
2.2. Le génome
2.3. Les protéines et caractères antigéniques
3. Multiplication du virus
4. Épidémiologie
5. Pouvoir pathogène
5.1. Physiopathologie
5.1.1. Les facteurs de virulence
5.1.2. Tropisme et histopathologie
5.1.3. Mécanisme de la diarrhée
5.2. Caractères cliniques
6. Diagnostic virologique
7. Traitement et prévention
7.1. Prévention non spécifique
7.2. Prévention spécifique
Chapitre 35 : Poxviridae
1. Classification
2. Caractères du virus
3. Multiplication
4. Pouvoir pathogène des différents Poxvirus
4.1. Orthopoxvirus
4.2. Parapoxvirus
4.3. Molluscipoxvirus
4.4. Yatapoxvirus
5. Diagnostic virologique
6. Utilisation des Poxvirus comme vecteur de gènes
Chapitre 37 : Polyomaviridae
1. Caractères du virus
1.1. Structure
1.2. Propriétés antigéniques
1.3. Multiplication
2. Épidémiologie
3. Pouvoir pathogène
3.1. Physiopathologie
3.2. Caractères cliniques
3.2.1. Leucoencéphalopathie multifocale progressive (LEMP)
3.2.2. Infections de l’appareil urinaire
3.2.3. Polyomavirus et tumeurs humaines
4. Diagnostic virologique
4.1. La microscopie électronique
4.2. Le cytodiagnostic et l’immunocytodiagnostic
4.3. L’isolement du virus
4.4. Les méthodes de biologie moléculaire
4.5. Le diagnostic sérologique
5. Traitement
1. Caractères du virus
1.1. Structure
1.2. Polymorphisme génétique
2. Multiplication
3. Épidémiologie
4. Pouvoir pathogène
4.1. Primo-infection
4.2. Manifestations cliniques liées à la persistance de l’infection
5. Diagnostic virologique
5.1. Diagnostic direct
5.2. Diagnostic indirect
6. Traitement
1. Caractères du virus
2. Multiplication
3. Épidémiologie
4. Pouvoir pathogène
5. Diagnostic virologique
1. Caractères du virus
2. Épidémiologie
3. Pouvoir pathogène
4. Diagnostic virologique
1. Classification
2. Caractéristiques du virus
2.1. Structure
2.1.1. Le génome
2.1.1.1. Organisation du génome
2.1.1.2. Variabilité génétique
2.1.2. Les protéines virales
2.1.2.1. Les protéines d’enveloppe sont composées de 3 formes différentes
2.1.2.2. La protéine de capside C et la protéine portant l’antigène HBe
2.1.2.3. La polymérase virale
2.1.2.4. La protéine X
3. Multiplication
3.1. Le cycle cellulaire du virus de l’hépatite B
3.2. Transcription du génome
4. Épidémiologie
5. Pouvoir pathogène
5.1. Physiopathologie
5.2. Manisfestations cliniques
5.2.1. La primo-infection
5.2.2. L’infection chronique
5.2.3. Virus de l’Hépatite B et cancer
6. Diagnostic virologique
6.1. Marqueurs directs du diagnostic virologique
6.2. Marqueurs indirects du diagnostic virologique
6.3. Interprétation des résultats des examens de laboratoire
1. Caractéristiques du virus
1.1. Structure
1.1.1. Le génome
1.1.2. Les protéines virales
1.2. Multiplication
2. Épidémiologie
3. Pouvoir pathogène
3.1. Physiopathologie
3.2. Manifestations cliniques
3.2.1. Le schéma classique : la co-infection et la surinfection
3.2.2. HDV et carcinome hépatocellulaire
3.2.3. HDV et immunodépression
4. Diagnostic virologique
4.1. Détection de l’Ag HD
4.2. Détection des anticorps
4.3. Détection du génome viral
4.4. Interprétation des marqueurs d’infection dans le sérum
5. Traitement et prévention de l’hépatite B et de l’hépatite D
5.1. Traitement des infections chroniques
5.1.1. Les Interférons (IFN)
5.1.2. La vidarabine et la vidarabine mono-phosphate
5.1.3. Les nouvelles thérapeutiques
5.2. Traitement des infections très sévères
5.3. Prévention
5.3.1. Prévention de l’infection par le HBV
5.3.1.1. L’ancien vaccin inactivé
5.3.1.2. Les vaccins obtenus par recombinaison génétiques
5.3.2. Prévention de l’infection par le HDV
1. Caractéristiques virologiques
1.1. Organisation génomique
1.2. Variabilité nucléotidique
2. Multiplication virale
3. Épidémiologie
3.1. Transmission
3.2. Distribution et prévalence de l’infection
4. Pouvoir pathogène
4.1. Mécanismes de la transformation
4.2. Manifestations cliniques
4.2.1. Leucémie à cellules T de l’adulte ou « Adult T Cell Leukemia » ou ATL
4.2.2. Paraparésie spastique tropicale (PST) ou « Tropical Spastic Paraparesis » (TSP) ou « HTLV
Associated Myelopathy » (HAM)
4.2.3. Autres pathologies
5. Diagnostic virologique
6. Traitement et prévention
3.
Grands syndromes
1. Généralités
2. La rubéole congénitale
3. L’herpès néonatal
4. L’infection à cytomégalovirus (CMV)
5. Le virus de la varicelle et du zona (VZV)
6. Le virus de l’immunodéficience humaine type 1 (HIV-1)
7. L’hépatite B
8. Le Parvovirus humain B19
9. Virus divers
9.1. Le virus de la rougeole
9.2. Le virus ourlien
9.3. Les poliovirus
9.4. Coxsackie et échovirus
Chapitre 55 : Les Dermatoses virales
1. Érythèmes
1.1. Érythèmes morbilliformes
1.1.1. Rougeole
1.1.2. Mononucléose infectieuse
1.1.3. Érythème à entérovirus
1.2. Exanthèmes roséoliformes
1.2.1. Rubéole
1.2.2. Exanthème subit ou 6e maladie (encore appelé roséole infantile)
1.3. Érythèmes de topographie particulière
1.3.1. Mégalérythème épidémique
1.3.2. Syndrome pieds-mains-bouche
1.3.3. Exanthème unilatéral thoracique
1.3.4. Syndrome en gants et chaussettes
1.3.5. Pityriasis rosé de Gilbert
1.3.6. Syndrome de Gianotti-Crosti
2. Affections vésiculeuses
2.1. L’herpangine réalise une gingivo-stomatite
2.2. L’herpès cutanéomuqueux (virus herpès simplex)
2.3. La varicelle
2.4. Le zona
2.5. Virus de l’hépatite C
3. Tumeurs
3.1. Papillomes viraux
3.2. Sarcome de Kaposi
3.3. Pox et parapoxvirus
3.3.1. Variole
3.3.2.Vaccine
3.3.3. Molluscum contagiosum (MC)
3.3.4. Orf
3.3.5. Nodules des trayeurs
3.4. Affections dues aux rétrovirus
1.1. Hypophyse
1.2. Thyroïde
1.3. Parathyroïdes
1.4. Surrénales
1.5. Gonades
2. Diabète et virus
2.1. Diabète insulinodépendant, de type 1
2.2. Diabète non-insulinodépendant, de type 2 (DNID)
3. Cœur et virus
3.1. Myocardites
3.2. Péricardites aiguës
4. Rein et virus
4.1. Néphropathies glomérulaires
4.2. Les complications rénales de l’infection HIV sont diverses, tant sur le plan clinique que
morphologique
4.3. Par ailleurs, l’infection du greffon rénal par le CMV est capable d’engendrer des lésions de
rejet aigu
4.4. La fièvre hémorragique avec syndrome rénal (FHSR)
4.5. D’autres infections virales peuvent toucher le rein
5. Hématologie et virus
5.1. Hyperleucocytoses
5.2. Cytopénies
5.3. Le syndrome d’activation macrophagique (SAM)
5.4. Le purpura thrombotique thrombocytopénique et le syndrome hémolytique et urémique