Naturaleza

del gen y el genoma

 Gen como unidad de herencia
•  Mendel y la herencia: su objetivo fue cruzar
plantas de guisante con diferentes características
hereditarias y determinar el patrón por medio del
cual estas propiedades se transmitían a la
descendencia.
 Conclusiones de Mendel
1. Las características de las plantas dependían de factores de herencia, que más tarde
llamó genes. Cada planta poseía dos copias del gen que podían ser idénticos o no.
Las dos formas alternativas de genes se conocieron como alelos. Uno de los dos alelos
dominaba sobre el otro. Si ambos aparecían juntos en la misma planta, el alelo
dominante enmascaraba la existencia del recesivo.

2. Cada célula germinativa (o gameto) sólo tenía una copia del gen correspondiente a
cada característica. Un gameto en particular podía contener el alelo recesivo o el
dominante para cada uno de los rasgos determinantes, pero no los dos alelos.

3. En cada planta los dos alelos que controlan un rasgo permanecen unidos durante
toda la vida, pero se separan durante la formación de los gametos. Esta referencia es
la base de la “ley de la segregación” de Mendel.

4. La separación de los dos alelos correspondientes de un rasgo no tiene efecto sobre
la separación de los alelos de otro rasgo, son independientes. La “ley de la
permutación independiente” de Mendel.
 Cromosomas y genes
•  En 1880, se descubrió que durante la división celular, el material del
núcleo se organizaba en “filamentos”visibles, que se denominaron
cromosomas, término que significa “corpúsculos coloreados”.

•  Poliespermia: alteración de la división celular y muerte temprana del

embrión.
–  Boveri concluyó que el proceso ordenado del desarrollo normal es
“dependiente de una combinación particular de cromosomas y esto
sólo puede significar que los cromosomas individuales deben poseer
diferentes cualidades”.

•  Esta fue la primera evidencia de una diferenciación cualitativa entre los

cromosomas.
 Cromosomas portadores de información
genética
•  Redescubrimiento de leyes de Mendel (1880).

•  1903: Walter Sutton – cromosomas “portadores físicos de

material genético o factores de Mendel”
–  Observó la formación de células en el espermatozoide del
saltamontes que, al igual que en el de Ascaris sp.

•  En las células germinales de la gónada masculina ocurren dos

tipos de divisiones: la mitótica, mediante la cual las
espermatogonias producen más espermatogonias, y la
meiótica, durante la que la espermatogonia genera
espermatozoides.
 •  Sutton cuantificó 23 cromosomas en pares “al parecer idénticos”.
–  Sutton comprobó que la presencia de pares de cromosomas, o
cromosomas homólogos y se correlacionan con los pares de
factores hereditarios descubiertos por Mendel.

Sutton explicó algunos otros hallazgos

de Mendel:

•  los gametos sólo contienen una
versión de cada gen (alelo);
•  el número de alelos que posee
cada gameto es igual al número de
alelos con el gameto homólogo
•  los dos gametos que se unen
durante la fecundación producen un
individuo con dos alelos para cada
rasgo.
 Cromosomas como grupo de ligamiento

•  Basados en la ley de permutación independiente

de Mendel.

•  Los genes en un mismo cromosoma debían

actuar como si estuvieran ligados entre sí, es
decir, formar parte de un mismo grupo de
ligamiento.
–  Los genes que controlan cada rasgo estudiado por
Mendel pueden identifi carse en cromosomas
diferentes o estar separados en el mismo cromosoma
y actuar de manera independiente
 Genética en Drosophila
•  1909, Thomas Hunt Morgan inicio los trabajos de genética con una
sola cepa (tipo silvestre).
•  Creó mutantes: ojos blancos en lugar de ojos rojos.
•  Alteración espontánea: entonces las poblaciones aisladas podrían
ser diferentes en términos genéticos las unas de las otras y dar
lugar a nuevas especies.
•  1915 existían más de 85 mutantes
hereditarias, sin permutaciones.

•  Existían cuatro grupos diferentes

grupos ligados y con muy pocos
genes mutantes.
–  Drosophila sp posee cuatro pares
de cromosomas homólogos
 Entrecruzamiento y recombinación
•  Las características maternas y paternas heredadas por un individuo
en cromosomas homólogos separados pueden remezclarse de
modo que terminen en el mismo cromosoma de un gameto.

•  Rotura de ligamento
–  Janssens: interacción entre cromosomas maternos y paternos por
rotura e intercambio de piezas del cromosomas a inicio de la meiosis.
–  Morgan: denominó entrecruzamiento, combinaciones inesperadas de
características genéticas

•  Análisis de la descendencia de un gran número de cruzas entre los

adultos que portan una variedad de alelos en el mismo cromosoma
indican que:
•  La posición de los genes a lo largo del
cromosoma o loci se determina por que un
par de genes tiene la misma frecuencia de
recombinación.

•  Cuanto mayor sea el espacio disponible entre

dos sitios del cromosoma, más probable es
que ocurra la rotura entre esos dos sitios y
mayor la frecuencia de recombinación.

•  Mapas cromosómicos
 ESTRUCTURA MOLECULAR DE GENES Y
CROMOSOMAS
Gran porción de los genomas de los eucariontes superiores no codifican mRNA ni ningún otro RNA
requerido por el organismo. Ese DNA no codificador constituye más del 95% del DNA cromosómico.

El DNA no codificador contiene muchas regiones que son similares, pero no idénticas.

Algunas secuencias de DNA repetitivo no se hallan en posiciones constantes en

el DNA de individuos de las mismas especies.

Las regiones del DNA que codifican proteínas –es decir, los genes- se sitúan en
medio de esa extensión de DNA aparentemente no funcional

Además del DNA no funcional entre genes, los intrones no codificadores suelen
encontrarse dentro de genes de plantas y animales multicelulares.
 Entre los intrones existe una amplia
variación de secuencia, incluida la
pérdida total.
La mayoría de las secuencias de
intrones tienen poca significación
funcional.

Las proteínas eucariontes especializadas

asociadas al DNA nuclear lo pliegan y
La longitud del DNA celular es
organizan para formar las estructuras de
un problema sustancial con el
DNA y proteínas visualizadas como
que deben lidiar las células.
cromosomas individuales durante la
mitosis.

Las mitocondrias y los cloroplastos

también contienen DNA.
Remanentes evolutivos, que codifica
componentes esenciales de estos
orgánulos vitales.
Secuencia completa de ácidos
nucleicos necesaria para la síntesis
de un producto génico funcional
(polipéptido o RNA)

La mayoría de los genes son

fragmentos de la molécula de ADN
que determinan la síntesis de una
proteína, otros realizan funciones
reguladoras.
 CONCEPTO DE GEN
•  Concepto mendeliano de gen,
–  Una unidad discreta de herencia que afecta a un carácter
fenotípico.
•  Morgan y sus colaboradores
–  Asignaron estos genes a loci específicos sobre los
cromosomas.
•  Avanzamos al ver al gen como
–  Una región de una secuencia nucleotídica específica a lo
largo de una molécula de DNA.
•  Finalmente, consideramos una definición funcional del gen
–  Como una secuencia que codifica para una cadena
polipeptídica específica.

TODAS ESTAS DEFINICIONES SON ÚTILES,

DEPENDIENDO DEL CONTEXTO EN EL QUE SE ESTUDIAN
LOS GENES.
•  Un gen contiene la información necesaria para que se
manifieste una característica heredable de un ser vivo.

•  En términos de su estructura, un gen es un fragmento de

una larga molécula de DNA que almacena información
para fabricar una determinada proteína.

•  Esta proteína es la que a su vez determina el carácter

correspondiente del organismo, ejemplo el color de la piel,
la presencia de semilla o la resistencia a una enfermedad.
Eucariontes: regiones de control de la transcripción
son secuencias amplificadoras o enhancers pueden
estar a 50 kb o más de distancia de la región
codificadora

Otras regiones no codificadoras son las secuencias que

especifican la escisión 3’ y la poliadenilación.
Los sitios de eliminaciones de intrones de RNA de los
transcriptos primarios que son los sitios de corte y
empalme

Las mutaciones en estas señales de procesamiento del

RNA evitan la expresión de un mRNA funcional y por lo
tanto del polipéptido codificado.

Algunas secuencias de DNA se transcriben a RNA que no

codifican proteínas, por ejemplo: tRNA y rRNA.
Son genes de tRNA y rRNA, causan fenotipos específicos
cuando está mutado aunque los productos finales de estos
genes son moléculas de RNA y no proteínas
 La mayoría de los genes eucariontes producen mRNA
monocistrónicos y contienen intrones largos

Muchas proteínas
- Muchos mRNA bacterianos grandes en organimos
son policistrónicos. superiores tienen
- La mayoría de los mRNA
Posee un sitio de unión eucariontes son dominios repetidos,
ribosómico cerca del sitio de
inicio para cada una de las monocistrónicos. codificados por genes de
regiones codificadoras de La estructura casquete 5’ repeticiones de exones
proteínas, o cistrones, en el dirige la unión de los ribosomas similares separados por
mRNA. y la traducción comienza en el
codón de inicio AUG más
intrones de longitud

cercano, por lo que la traducción variable, por ejemplo:
El inicio de la traducción
puede comenzar en cualquiera
sólo comienza este sitio. fibronectina, codificada
de estos múltiples sitios internos por un gen que contiene
múltiples copias de 3
•  Operón bacteriano.
–  Única unidad de transcripción.

–  Se transcribe a partir de un promotor particular a un único transcripto primario.

•  Genes y unidades de transcripción son distinguibles en los procariontes.

•  La mayoría de genes eucariontes y unidades de transcripción son idénticas.

•  Unidades de transcripción eucariontes, dos tipos según el destino del transcripto

primario.
•  Transcripto primario producido a partir de una única unidad de transcripción.

–  Único tipo de mRNA.

–  Única proteína.
Los intrones se sitúan entre los exones y
son eliminados durante el procesamiento
del transcripto primario, por lo tanto no
aparecen en el mRNA monocistrónico
funcional Las mutaciones en una región de
control de la transcripción (a,b)
pueden reducir o evitar la
transcripción, disminuyendo o
impidiendo la síntesis de la proteína
codificada

Una mutación dentro de un exón ( c)

puede producir una proteína
anormal con actividad disminuida.

Una mutación dentro de un intrón

(d) que induce un nuevo sitio de
corte y empalme produce un mRNA
con proceso de splicng anormal, que
codifica una proteína no funcional
Múltiples mRNA pueden surgir a partir de
un transcripto primario mediante tres
formas:

El uso de diferentes sitios de corte y

empalme produce mRNA con los
mismos exones 5’-3’, pero con
diferentes exones internos, lo que se
denomina el salteo de exones

El uso de sitios poli (A) alternativos, que

producen mRNA que comparten los
mismos exones 5’ pero tienen diferentes
exones 3’

El uso de promotores alternativos, que

producen mRNA que tienen diferentes
exones 5’ y exones 3’ comunes. Un gen
expresado selectivamente en dos o más
tipos de células a menudo se transcribe
a partir de distintos promotores
específicos de tipo celular.
Estructura de un gen en
eucariontes
Organización cromosómica de los genes y
del DNA no codificador
Mucho del DNA en ciertos
organismos no codifica RNA o no
tiene ninguna función reguladora
o estructural

Los vertebrados con mayor

El contenido de DNA por célula
cantidad de DNA por célula son
también varía en forma
anfibios, que son menos
considerable entre especies
complejos que los seres humanos
estrechamente relacionadas.
en estructura y comportamiento

La Amoeba dubia, una especie

protozoaria unicelular, tiene 200
veces más DNA por célula que los
seres humanos, o los tulipanes
que tienen 10 veces más DNA.
 El secuenciamiento detallado y la
identificación de los exones en el DNA Por ejemplo: una pequeña porción del
cromosómico proporcionar evidencia grupo de genes B-globina de los seres
directa de que los genomas de los humanos, de alrededor de 80 kb de
eucariontes superiores contienen largo, codifica proteínas. (grupo de
grandes cantidades de DNA no genes inusualmente rico en secuencias
codificador. codificadoras)

Por el contrario una extensión típica

de 80 kb de DNA de la levadura S.
cerevisiae contiene muchas
secuencias codificadoras de proteínas
estrechamente espaciadas sin
intrones y bastante menos DNA no
codificador

Las flechas rojas indican la ubicación de una secuencia Alu, una secuencia repetida no
codificadora
 Del 94% del DNA genómico
La mayoría de los exones humaos
humano que ha sido
contiene 50-200 pares de bases,
secuenciado, solo un 1,5%
aunque el exón 3’ en muchas
corresponde a secuencias
unidades de transcripción es mucho
codificadoras de proteínas
más grande.
(exones)

Un tercio del DNA genómico humano

se transcribe a precursores pre- La mayoría de intrones tienen
mRNA. alrededor de 90 bp de largo, algunos
El 95% de estas secuencias se son mucho más largos; su longitud
encuentran en los intrones, los cuales media es de 3,3 kb
son eliminados.

En los vertebrados la energía

Los microorganismo compiten por
invertida en la síntesis de DNA es
cantidades limitadas de nutrientes, se
trivial en comparación con la
asume presión selectiva.
energía metabólica requerida para
El ADN no codificante se elimina el movimiento de los músculos.
puesto que su codificación requiere
Poca presión selectiva para
energía.
eliminar DNA no funcional.
 Tipos de Genes
Expresión a un nivel Constitutivos
constante

Genes inactivos que se

Inducibles
activan bajo ciertas
condiciones

Genes activos, pero se

Represibles
silencian bajo ciertas
condiciones
 Estructura de los genes en eucariotas
•  Los genes, no se disponen linealmente en los cromosomas
sino espaciados por fragmentos de ADN que no poseen
información que pueda ser transcrita.
•  En todo gen, se distingue las siguientes regiones:

La región promotora o promotor

- La región codificadora

- La región terminadora o terminador

 Región •  situada al principio del gen
•  sirve para que las enzimas que realizan la
promotora transcripción reconozcan el principio del gen

•  contiene la información para la síntesis de la

proteína.
•  Los fragmentos de ADN que no contienen
Región información: los intrones, y fragmentos que sí que
codificadora contienen información: los exones.
•  El inicio de la región viene marcado por la
secuencia de bases nitrogenadas ATG y el final por
una de estas tres tripletas: TAA, TAG, TGA.

Región •  Marca el final del gen

terminador
 Clase longitud

GENES QUE Genes solitarios variable
CODIFICAN Genes duplicados variable
PROTEÍNAS
GENES QUE variable
CODIFICAN rRNA,
tRNA e histonas
repetidos en tándem
DNA de secuencia simple 1-500
Repeticiones intercaladas

Transposones de DNA 2-3 kb
DNA repetitivo Retrotransposones con 6-11 kb
LTR
Retrotransposons sin LTR
LINE 6-8 kb
SINE 100-300
 Genes codificadores de Proteínas
•  Están presentes una sola vez en el genoma
haploide.
•  Gen solitario codificador de la lisozima

Unidad de Las regiones que la

Secuencia de DNA transcripción simple flanquean se
de 15 kb que contiene 4 extienden 20 kb 5’ y
exones y 3 intrones 3’
En los organismos multicelulares, un 25-50% de
los genes codificadores de proteínas estás
representados sólo una vez en el genoma
haploide, son genes solitarios

Ejemplo: gen de la lisozima de pollo (escinde los

polisacáridos de la paredes celulares
bacterianas), una secuencia de DNA de 15 kb que
constituye una unidad de transcripción simple
que contiene cuatro exones y tres intrones.

Las regiones que la flanquean se extienden por

alrededor de 20 kb en dirección 5’-3’, no
codifican ningún mRNA detectable
 Genes duplicados

Proteincinasas
Se localizan de 5-50 kb
Familia de genes Factores de
de distancia,
transcripcion
constituyen el 50% de Familia de proteínas
secuencia de DNA Proteínas del
citoesqueleto
 Los genes duplicados constituyen el
segundo grupo de genes codificadores En vertebrados, constituyen la
de proteínas. mitad de las secuencias de
DNA codificadores de
Son regiones con secuencias cercanas, proteínas
pero no idénticas.

Pocas familias de proteínas, como las Un conjunto de genes duplicados

proteincinasas, factores de transcripción e codifican proteínas con secuencias
inmunogobulinas incluyen cientos de de aminoácidos similares, pero no
miembros. idénticas se llama familia de genes.
La mayoría abarca hasta 30 o más como las Las proteínas homólogas
proteínas de shock térmico, alfa y beta codificadas constituyen una familia
globulinas de los vertebrados, etc. de proteínas.
β- globinas
•  Genes β- globina- duplicación de un gen
ancestral durante la recombinación meiótica
por entrecruzamiento desigual
•  Durante la evolución las dos copias del gen
resultante acumularon mutaciones aleatorias:

–  Confirieron cierto refinamiento a las funciones
básicas de transporte de oxigeno.
–  Desviación de la secuencia
 Pseudogenes
•  Dos regiones del grupo de genes contienen
secuencias no funcionales.
•  Tienen la misma estructura de los genes
funcionales** duplicación del mismo gen
ancestral.
•  Desviaciones de secuencias terminan la
traducción o bloquean el procesamiento del
mRNA
Dos regiones del grupo de genes de B-globinas, contienen secuencias no funcionales
denominadas pseudogenes, similares a aquellas funcionales a los genes de B-globinas.

La secuencia de los pseudogenes tienen la misma estructura aparente de exones e intrones que
los genes funcionales de B-globinas, lo que indica que surgieron por duplicación del mismo gen
ancestral.

Las desviaciones de secuencias durante la evolución generaron secuencias que terminan la

traducción o bloquean el procesamiento del mRNA, haciendo de estas regiones no funcionales
aun cuando se transcriban a RNA

Los pseudogenes no son dañinos, permanecen en el genoma y marcan la ubicación de

una duplicación de genes que tuvo lugar en uno de nuestros ancestros.
Los seudogenes no son dañinos, marcan la ubicación
de una duplicación de genes que tuvo lugar en uno
de nuestros ancestros
 Los genes repetidos en Tándem codifican
rRNA, tRNA, e histonas.

Repeticiones en tándem: Son genes que codifican los rRNA y algunos RNA no
codificadores como algunos de los snRNA no codificadores involucrados en el
corte y empalme de RNA.

v Se distinguen de los genes duplicados de las familias de genes en que los
múltiples genes repetidos en tándem codifican proteínas idénticas o casi
idénticas o RNA funcionales.
v Dentro de una disposición en tándem de genes de rRNA cada copia es
exactamente o casi exactamente igual a las otras y aunque las regiones
transcriptas son las mismas en un individuo dado las regiones espaciadoras
no transcriptas pueden variar.

•  Si se requiere mas RNA del que
puede transcribirse a partir de
un gen, se necesitan múltiples
copias del gen.
EJEMPLO:
•  En el desarrollo embrionario
temprano en los seres humanos
las células embrionarias tienen
un tiempo de duplicación de
alrededor de 24 horas y
contiene de 5-10 millones de
ribosomas así para producir
suficiente r RNA PARA FORMAR
T A N T O S R I B O S O M A S s e
necesitan al menos 100 copias
de rRNA con una actividad
cercana al máximo para que la
célula se divida cada 24 horas.

Todos los eucariotas incluidas las levaduras
contiene 100 o mas copias que codifican r RNA 5S y
r RNA de las subunidades mayor y menor.
IMPORTANCIA:
Se ilustra con los mutantes de Drosophila (bobbed)
ya que una mutación bobbed reduce el numero de
genes pre-r RNA a menos de 50 es una mutación
recesiva letal.
 V/I, los genes que Los genes de rRNA, Si se requiere más
codifican los rRNA y tRNA e histona RNA del que puede
algunos otros RNA repetidos en tándem transcribirse a
involucrados en el corte so necesarios para partir de un gen, se
y empalme de RNA satisfacer la enorme necesitan múltiples
aparecen como demanda celular de copias del gen.
repeticiones en tándem sus transcripciones

Los múltiples genes Dentro de una

repetidos en tándem disposición en tándem
codifican proteínas de genes de rRNA cada
idénticas o casi copia es exactamente, o
idénticas o RNA casi exactamente
funcionales similar.
 DNA de secuencia
simple:
Células eucariontes -3% del genoma
contienen humano
múltiples copias de Dos tipos de -Compuesto de
otras secuencias DNA repetitivos: repeticiones
de DNA en el perfectas o casi
genoma, perfectas de
denominado DNA secuencias
repetitivo. relativamente
cortas.

DNA repetitivo:
-Compuesto de
secuencias
relativamente
cortas.
El DNA de secuencia simple suele denominarse DNA satélite

Algunos DNA de
S.S formaban Los DNA de secuencia simple en los cuales
bandas en una
posición las repeticiones contienen 1-13 pares de
diferente de la
mayoría de DNA
celular
bases se denominan microsatélites
Los microsatélites se
Bandas satélite: La mayoría tiene longitudes originaron por “deslizamiento
para distinguirlas
de la banda repetidas de 150 pares de hacia atrás” de una hebra hija
principal de DNA bases o menos. sobre su hebra molde durante
en el gradiente
de equilibrio de
la replicación de ADN.
densidad.
 Los tipos más comunes
de enfermedades
asociadas con las
Los microsatélites repeticiones expandidas
expandidos se de microsatélites: la
comportan como distrofia miotónica y la
Microsatélites mutaciones recesivas ataxia espinocerebelosa.
expandidos provocan al porque transfieren en la
menos 14 tipos de función o la expansión
Tienen lugar en diferentes del gen codificado.
ocasiones dentro de las enfermedades
unidades de neuromusculares, según
transcripción el gen en el cual
ocurran.
 >Las enfermedades
asociadas a
microsatélites son:
distrofia miotónica y la
ataxia
espinocerebelosa
>Son mutaciones
dominantes porque
interfieren en el
procesamiento del
ARN en las neuronas
Microsatélites donde se expresan los
genes afectados.
La mayoría del DNA satélite
está compuesto de 14-500
pares de bases repetidas en
tándem de 20-100kb.

También se sitúa en los

La mayoría de mamíferos, gran telomeros, pueden ser útiles para
parte de DNA satélite se sitúa identificar cromosomas
cerca de los centrómeros particulares mediante hibridación
in situ con fluorescencia (FISH).

•  El DNA de secuencia simple situado en los centrómeros puede asistir

en la adhesión de cromosomas a los microtúbulos del huso durante
la mitosis.
 Dentro de Las secuencias de las De las secuencias
unidades repetidas simples de DNA están
una especie tándem altamente conservadas

En el número de
Tándem de secuencias
Son bastante comunes las repeticiones y la
simples que contienen la
diferencias longitud de las
misma unidad repetida
disposiciones en

Entrecruzamiento
Las longitudes de
desigual entre regiones
Diferencias en la longitud resultan disposiciones en tándem
dentro del DNA de
del son únicas para cada
secuencia simple en la
individuo
meiosis
 Tienen unidades repetidas muy
Los minisatélites son regiones
cortas, en las que se puede
mas comunes de DNA satélite
detectar leves diferencias en las
repetidas en tandem, que son
longitudes totales de diversos
de alrededor de 20-100 kb de
individuos, mediante Southern
longitud.
blot del DNA.

Así como la PCR pueden

Estos polimorfismos de DNA
detectar diferencias en las
forman la base de las huellas
longitudes de los minisatélites
dactilares de DNA.
entre los individuos.
 El segundo tipo de Estas secuencias El proceso por el cual estas
repeticiones de DNA de los diseminadas en todos los secuencias se copian y se
genomas eucariontes genomas de los mamíferos, insertan en un nuevo sitio
denominadas repeticiones constituyen (25/50%) y en el genoma se denomina
dispersas 45% del DNA humano “transposición”

Las secuencias de Los elementos

DNA móviles, son
Está compuesto
moderadamente simbiontes
de un número
repetidas tienen la moleculares,
muy grande de
capacidad de parecen no tener
copias de
moverse, función especifica
relativamente
“Elementos en la biología de
pocas familias de
móviles de DNA (o sus organismos
secuencias.
elementos huésped. “DNA
transponibles)” EGOÍSTAS”
 Caracterizó entidades genéticas que podían entrar y salir de los genes,
cambiando el fenotipo de los granos de maíz

1) Los que se transponen directamente como DNA.

2) Los que transponen a través de un intermediario de RNA
Barbara polimerasa y luego se convierte en DNA de doble hebra por
McClintock: acción de las transcriptasa inversa.
experimentos
genéticos clásicos Los elementos móviles que se transponen a través de un
en el maíz. intermediario se denominan: TRANSPOSONES DE DNA.

Los elementos móviles que se transponen a nuevos sitios en el

genoma a través de un intermediario de RNA se llaman
RETROTRANSPOSONES.
 Elementos móviles

Se transponen directamente TRANSPOSONES DE DNA. Transponerse entre las células

Genes evolucionaron y
lograron codificar cubiertas
virales

Se transponen a nuevos sitios en el

genoma a través de un intermediario RETROTRANSPOSONES Movimiento es análogo al
de RNA proceso infeccioso de
los retrovirus
Clasificación de elementos móviles en
dos clases principales

Se desplazan
Se desplazan mediante el
mediante el mecanismo de
mecanismo de copia y plegado
corte y plegado
 Son porciones de DNA
La mayoría de los elementos insertadas se denominan
móviles en las bacterias se secuencias de inserción
transponen directamente
como DNA

Es un hecho muy raro, solo

tiene lugar en una de 105- 107
células por generación, según
el elemento IS

La mayoría de elementos Los elementos IS se transponen

móviles en los eucariontes son más o menos de manera aleatoria,
retrotransposones, pero
también existen transposones
algunas secuencias transpuestas
de DNA eucarionte. entran en regiones no esenciales
del genoma.
 Los IS pueden insertarse
en plásmidos o virus
lisogénicos y por lo tanto
transferir a otras células

En una repetición invertida

que contiene alrededor de Cuando esto sucede, los
50 pares de bases. elementos IS se pueden
transponer a los
En una repetición invertida cromosomas de células
la secuencia 5’-3’ sobre una vírgenes.
hebra en la otra hebra

La estructura general de los

elementos IS: en cada
extremo de una secuencia de
inserción invariablemente hay
una repetición invertida (50
pares de bases)
 Transposición de un elemento IS – hecho muy raro

Muchas transposiciones inactivan genes esenciales y matan a la célula

huésped y a los elemento IS que transporta

Elementos IS se transponen de manera aleatoria , algunas secuencias

transpuestas entran en regiones no esenciales del genoma

IS también pueden insertarse en plásmidos o virus lisosómicos y transferirse a

otras células . IS pueden transponer a los cromosomas de células vírgenes.
En cada extremo
de una secuencia En región
de inserción invertida se
invariable hay encuentra la
una repetición TRANSPOSASA
invertida

Enzima
requerida para Transposasa se
transposición del expresa a
elemento IS a un velocidad lenta
nuevo sitio
 Inmediatamente
Secuencia de
adyacente a ambos
repetición directa
extremos del elemento
corta 5 – 11 pb
insertado

Longitud de la Secuencia depende del

repetición depende de sitio diana de donde se
cada tipo de elemento inserta una copia
IS particular del
elemento IS
1.  Transposasa, codificada por elemento IS. Escinde
ambas hebras del DNA donado próximas a las
repeticiones invertidas.
1.1 Extrae elemento IS
1.2 En un sitio diana (aleatorio) transposasa efectúa
cortes escalonados en el DNA diana. (9pb)

2. Transposasa cataliza la unión entre los extremos 3
´del elemento IS con los sitios escalonados del DNA
diana.

3. Brechas de 9pb del DNA monocatenario que
quedan en el intermedio se llenan por acción de una
polimerasa celular.

3.1 DNA ligasa celular forma enlaces diester 3´- 5´
entre los extremos de 3´de las hebras DNA diana y
los extremos 5´ de las hebras IS
 La mitad de las La repetición de este
mutaciones espontáneas Cuando la replicación del
DNA se completa al final de proceso a lo largo del
en Drosophila se deben a tiempo evolutivo produjo
la inserción de elementos la fase S, también se ha
replicado el DNA diana en su la acumulación de
móviles grandes cantidades de
nueva ubicación
transposones de DNA

La mayoría de los elementos

El DNA humano contiene
móviles en Drosophila Para producir un incremento alrededor de 300.000 copias
funcionan como en el número de copias de un de transposones de DNA de
retrotransposones, al menos transposón longitud completa y
uno –el elemento P-
eliminados

Se mueve mediante un
Funciona como un
mecanismo de corte y
transposón de DNA
pegado
 Transposones de DNA eucarionte

•  Mutaciones
espontaneas en el
maíz que afecta
alguna de las enzimas
requeridas para hacer
antocianina
•  Los elementos AC son equivalentes a los
elementos IS bacterianos
Reconoce repeticiones terminales

TRANSPOSASA
Cataliza la transposición a un nuevo sitio en el Dna
•  La transposición del DNA puede producir un
incremento en el numero de copias de un
transposon cuando ocurre durante la fase S

El DNA HUMANO contiene 300000 copias

de transposones de DNA
( 3%)
 Algunos retrotransposones contienen LTR y se
comportan como retrovirus intracelulares
Estructura general de los
retrotransposones con LTR

La región central codificadora de

proteínas está flanqueada por dos
repeticiones terminales largas
(LTR).
los retrotransposones integrados
tienen repeticiones directas cortas
del sitio diana en cada extremo.

La región codificadora de proteínas

constituye el 80% o más de un
retrotransposón y codifica la
transcriptasa inversa, la integrasa y
otras proteínas retrovirales.
 Generación de RNA genómico retroviral a
partir de DNA retroviral integrado.

La LTR izquierda dirige la RNA

polimerasa II celular para iniciar la
transcripción en el primer nucleótido
de la región R izquierda. El transcripto
primario resultante se extiende más
allá de la LTR derecha.

La LTR derecha, ahora presente en el transcripto primario de RNA, dirige las

enzimas celulares para que escindan el transcripto primario en el último
nucleótido de la región R derecha y para añadir una cola poli(A), produciendo un
genoma de RNA retroviral.
1 Una vez que un retrovirus
infecta una célula, produce
un DNA de doble hebra que
contiene LTR completas.
Proceso en el cual esta
involucrada la transcripción
Inversa.
2 La integrasa, emplea un
mecanismo para insertar el
DNA retroviral de doble hebra
en el genoma de la célula
huésped.
3

Se generan repeticiones
c o r t a s d i r e c t a s d e l a
secuencia del sitio diana en
cada extremo de la secuencia
de DNA viral insertada.
Estructura de retrotransposones
con LTR

Son caracteristicas de los

DNA RETROVIRALES

Ciclo vital de los

retrovirus

DNA RNA
RETROVIRAL GENOMICO
INTEGRADO RETROVIRAL

Codifican para todas las proteinas de los retrovirus ( transcriptasa inversa y la integrasa)
excepto los de las envolturas

RNA GENOMICO RETROVIRAL SE EMPAQUETA EN UN VIRION

RNasaH
 Los plásmidos
recombinantes
demuestran que el
elemento Ty de la
levadura se
transpone a través de
un intermediario de
RNA
Retrotransposones sin LTR
(no virales)
Retrotransposones no LTR

Elementos dispersos
6kb de largo
largos (LINE)

Se dividen en
dos clases
Los elementos Elementos dispersos
más
cortos (SINE). 100 y 400 bp
abundantes en
mamíferos son
No virales los que carecen
de repeticiones
terminales
largas (LTR)
 LINE

•  Tienen una longitud de 6 a 8 kpb.

•  El ADN humano contiene tres familias principales de secuencias
LINE que van a tener similares mecanismos de transposición pero
que van a diferir en sus secuencias: L1. L2 Y L3.
•  Solo los L1, una secuencia de unas 6 kb repetida unas 800,000
veces, se transponen en el genoma humano y se localizan
predominantemente en las bandas G de los cromosomas.
•  Aparentemente no hay copias funcionales de L2 Y L3.
 LINE
6kb

1kb 4kb

•  Están presentes en más o menos 900.000 sitios dentro del genoma

humano, alcanzando aproximadamente el 21% de este.
 LINE
Un elemento L1 codifica dos proteínas:
•  una ARN-binding protein en el marco de lectura ORF1 y,
•  una proteína con actividad endonucleasa y retrotranscriptasa en el
marco de lectura ORF2.
Está flanqueado por unas pequeñas repeticiones directas (en la misma
orientación) y termina en una cola poli-A.
Los elementos LINE son retrotransposones, puesto que pueden copiarse a
sí mismos a través de un intermediario ARN y transponerse a otras
localizaciones genómicas.
 LINE

•  La transcripción mediante
RNApol-2 está dirigida por
secuencias promotoras en el
extremo izquierdo del DNA
LINE integrado.
•  El RNA LINE resultante es
poliadenilado. Luego este
RNA LINE es traducido en
proteínas ORF1 y ORF2.
•  Posteriormente, múltiples
copias de la proteína ORF1
se unen al RNA LINE y la
proteína ORF2 se une a la
cola poli-A.
 TRANSCRIPCION INVERSA Y LA
INTEGRACIÓN DE LOS DNA LINE

•  El RNA LINE es transportado nuevamente

al núcleo como un complejo con ORF1 y
ORF2.
•  D e s p u é s e l O R F 2 r e a l i z a c o r t e s
escalonados en el DNA cromosómico a
cada lado de cualquier secuencia rica en
A/T(1).
•  La transcripción inversa del RNA LINE
mediante el ORF2 se ceba mediante una
secuencia de hebra simple rica en T la
cual se hibrida con la cola poli-A del LINE
(2).
 TRANSCRIPCION INVERSA Y LA
INTEGRACIÓN DE LOS DNA
•  LINE
Luego el ORF2 transcribe de
manera inversa el RNA LINE (3).
•  Luego esta nueva cadena de DNA
se elonga y va desplazando la
cadena de DNA cromosómico (4 y
5).
•  Después las enzimas celulares
hidrolizan el RNA y extienden el
extremo 3’ de la hebra superior de
DNA cromosómico reemplazando la
hebra de RNA LINE con DNA (6).
 TRANSCRIPCION INVERSA Y LA
INTEGRACIÓN DE LOS DNA
LINE
•  Por último los extremos 5’ y 3’ de
las hebras de DNA se ligan y se
completa la inserción (7).
•  E s t o s ú l t i m o s p a s o s
probablemente están catalizados
por las enzimas celulares que
eliminan los cebadores de RNA y
ligan los fragmentos de Okazaki
durante la replicación.
 LINE
•  La gran mayoría de los LINE en el genoma humano están cortados en su extremo 5’. Esto
sugiere que la transcripción inversa termina antes de completarse y que los fragmentos
resultantes se extienden a distancias variables desde la cola poli-A.
•  Debido a este acortamiento, el tamaño promedio de los LINE es de alrededor de 900 pares de
bases (no los 6kb).
 SINE
•  Constituyen alrededor del 13% del total del DNA. Su longitud
varía aproximadamente de 100 a 400 pares de bases, estos
retrotransposones no codifican proteínas, pero la mayoría
contienen una secuencia 3’ rica en A/T similar a la de los LINE.
 SINE
•  Los SINE son transcritos por la RNApol-3; la misma polimerasa
nuclear que transcribe los genes que codifican los tRNA, rRNA 5S
y otros RNA estables pequeños.
•  Muy probablemente las proteínas ORF1 y ORF2 expresadas a
partir de LINE median la transcripción inversa e integración de
los SINE a través del mismo mecanismo explicado anteriormente
para los LINE.
•  Es decir, van a competir con los LINE por los ORF1 y ORF2.
 Alu

Abundantes en el
genoma
IMPORTANCIA

gen 7SL ARN

(complejo 300 pares de bases
ribosonmal)

Estabilidad Control
genómica epigenético

Ricas en guanina y
cada 3 kilobases. citosina.
 Origen Alu
65 millones de años

Los SINE aparecen en1,6 Denominación

millones de sitios en el 1, 1 millones son elementos Alu Contienen un único sitio de
genoma humano.
reconocimiento para la enzima
de restricción Alu

Componente de la partícula de
RNA 7SL
reconocimiento de señal

Partícula ribonucleoproteica citosólica

Dirige ciertos polipéptidos, hacia las membranas del retículo

endoplasmático
 Estructura Alu

•  Una secuencia Alu está compuesta por dos monómeros similares

terminados en un fragmento poli-A.

El monómero izquierdo controla la

retrotransposición al contener un promotor de RNA El monómero derecho tiene 32 nucleótidos
polimerasa III (caja a y b)
 Localización Alu

Diseminados en •  Entre genes

todo el genoma •  Dentro de los intrones
humano •  En las regiones 3' no traducidas
de algunos mRNA

Nueve elementos Alu se localizan dentro del grupo de genes

de la beta-globina humana
 Grupos de Alu

•  La mutaciones ocurridas en los

elementos Alu permiten la definición de sus
grupos.

Alu Y (las más

recientes)

Alu S (de edad

intermedia)

Alu J (más antiguas)

 Actualidad

Se estima que la frecuencia general de las

retrotransposiciones

L1 y SINE en los seres •  40% L1

humanos es de alrededor •  60%, SINE de los cuales ""90% son
de cada ocho individuos elementos Alu.
 Hemofilia A y B

La inserción de un elemento Alu en

• Deficiencia del factor
La VIII (cromosoma X)
el intrón 18 del gen del factor VIII,
origina un entrecruzamiento
hemofilia A inapropiado, saltándose el exón 19

• Deficiencia del factor

La IX de coagulación Una inserción Alu que provoca una
hemofilia B (cromosoma X). deleción en parte de la proteína codificada
por el factor IX.



INTEGRONES

Bacilos gram
Familia Identificado integron
funcional en BGP
negativos Enterobacteri Corynebacterium
fermentadores as y Vibrion glutamicum
Unidades genéticas contienen información para
reconocimiento de sitios específicos de
recombinación de un casete genético (genes
capturados)

Los integrones se asocian al cromosoma o

plásmidos y transposones que sirven como
vehículos, para su transmisión o entre especie

La capacidad para adquirir y expresar nuevos

genes permite a los integrones contribuir a la
variabilidad genética en el ADN cromosómico
 Estructura básica

Extremo altamente Región variable Extremo altamente
conservado presencia o ausencia conservado (3´CS)
(5´CS) de casetes genéticos se encuentran genes
de resistencia a de resistencia a
contienen antibioticos. Tiene compuestos de
gen intI que codifica promotores (P) de amonio cuaternarios,
para una integrasa genes de la sulfonamidas
resistencia.
 proteína con
actividad
recombinasa Sitio attI: Adyacente
al intI
específica de sitio
(intL)

Sitio de
Gen intI: Codifica a
recombinación
la integrasa
específica de sitio
Estructura
genética
La enzima integrasa E n t r e i n t i I y a t t I s e
media la recombinación encuentran dos promotores
e n t r e u n s i t i o d e divergentes:
recombinación primaria P 1 , p r o m o t o r p a r a l a
(atLI) y una secuencia expresión de los casetes
blanco denominada sitio g e n é t i c o s ( d i r i g e l a
attC (o elemento 59pb). transcripción de los casetes
integrados).
 Cassets génicos
círculos covalentemente cerrados independientes, no
replicativos, contienen sólo un marco de lectura
abierta completo orf o gen de resistencia

continuación del orf, se encuentra Transcripción de los casetes

un sitio de recombinación integrados, attC o 59 pb, se lleva a
específica, el elemento 59 pb, cabo desde un promotor
localizado en el extremo 3´del gen localizado en 5´CS
EXTREMO 5´CS

Segmento de DNA tiene

una longitud de 1,36 kb

Cuenta con un promotor,

un gen int y una zona attI
que es uno de los lugares
donde se insertan las IS
 El gen qacEA1 es un
determinante de
Se incluyen unos genes resistencia a
que dotan a la bacteria compuestos
de resistencia cuaternarios de amonio,
antisépticos y
desinfectantes

El gen sulI determina

longitud 2 kb resistencia a las
sulfonamidas

Extremo
3´CS
SECUENCIAS INSERTADAS

Las secuencias que pueden insertarse entre los extremos 5’ y 3’ CS son unos
pequeños trozos de DNA, de unos pocos cientos de bases.

Estos elementos tienen en su extremo final (3’) una secuencia de 59 pares

de bases. Esta secuencia es variable tanto en la composición de sus bases
como en longitud (3)

Producir la inserción y escisión de las IS, mediante una recombinación

genética específica de sitio catalizada por la integrasa y en la que participan,
además, la zona attI, o bien otro elemento de 59 pb de otra IS

En este proceso está implicado de forma más activa un triplete GTT (1, 9, 15,
16) incluido en una región de 7 bases, también denominada "core".

El core es una pequeña secuencia muy conservada entre los diferentes

elementos de 59 pb, que se repite al principio de las IS y al final, en la zona
de 59 pb.
Los retrotransposones que carecen de
LTR se mueven por un mecanismo
distinto
LINE SINE
Elementos nucleares dispersos largos, Elementos nucleares dispersos cortos,
son secuencias de 6 kb de largo. Son secuencias cortas, generalmente
de 300 bp

En protozoos, insectos y Tanto los SINE como

plantas, se observaron los LINE se hallan
secuencias repetidas con principalmente en el
las características de los D N A d e l o s
LINE. mamíferos.
 LINE

El marco abierto de lectura más El ORF2, de ,.4 kb de largo,

corto (0RF1 ), de "'1 kb de largo, c o d i f i c a u n a p r o t e í n a
codifica una proteína de unión a bifuncional con actividad de
RNA. transcriptasa inversa y de
endonucleasa de DNA.
1. El RNA LINE es transportado nuevamente
al núcleo como
un complejo con ORFl y ORF2.
El ORF2 realiza cortes escalonados en el
DNA cromosómico a cada lado de cualquier
secuencia rica en A/T en el genoma.

2. La transcripción inversa del RNA LINE

mediante el ORF2 se ceba mediante la
secuencia de hebra simple rica en T
generada por la muesca en la hebra
inferior, la cual se híbrida con la cola de
poli(A) del LINE.

3. ORF2 luego transcribe de manera

inversa el RNA LINE.
4. Y 5. Continúa la nueva hebra de DNA,
cambiando a la región de cadena simple
de la hebra cromosómica superior como
molde.

6. Las enzimas celulares hidrolizan el

RNA y extienden el extremo 3' de la
hebra superior de DNA cromosómico,
reemplazando la hebra de RNA LINE con
DNA

7. Los extremos 5' y 3' de las hebras de

DNA se ligan y se completa la inserción.
 SINE
Constituyen aproximadamente Estos retrotransposones
13% del total del DNA. Con no codifican proteínas,
u n a l o n g i t u d q u e v a r í a pero la mayoría contiene
aproximadamente de 100 a una secuencia 3' rica en A/
400 pares de bases. T similar a la de los LINE.

Los SINE son transcriptos por la RNA polimerasa III, la misma RNA
polimerasa nuclear que transcribe los genes que codifican los tRNA,
rRNA SS y otros RNA estables pequeños.
 Características del SINE

La mayoría de los SINE

s o n e l e m e n t o s A l u ,
denominados así porque
la mayoría de ellos
contienen un único sitio
de reconocimiento para Los elementos Alu están
la enzima de restricción diseminados en todo el
Alu 1. genoma humano en sitios
donde su inserción no altera
la expresión génica: entre
g e n e s , d e n t r o d e l o s
intrones y en las regiones 3'
no traducidas de algunos
mRNA.
Es probable que los elementos de DNA
móviles hayan tenido una influencia
significativa sobre la evolución
Mezcla de exones (exon shuffling) entre
repeticiones dispersas homologas.

Este proceso que pudo haber

ocurrido durante la evolución
de los genes que codifican el
a c t i v a d o r t i s u l a r d e l
plasminógeno, el receptor Neu
y el factor de crecimiento
epidérmico, que contienen un
dominio EGF.
Mezcla de exones (exon shuffling) mediante
transposición

Tanto los transposones de

DNA como los
retrotransposones LINE
han mostrado llevarse
ocasionalmente secuencias
flanqueantes no
relacionadas cuando se
insertan en sitios nuevos.