În afară de problemele ipotezei antrenării parțiale a eterului, o altă problemă majoră a apărut odată cu

experimentul Michelson–Morley (1887). În teoria lui Fresnel, eterul este aproape staționar, așa că
experimentul ar fi dat un rezultat pozitiv. Cu toate acestea, rezultatul acestui experiment a fost negativ.
Astfel, din punct de vedere al modelelor eterului existente la acel moment, situația experimentală era
contradictorie: Pe de o parte, aberația luminii, experimentul Fizeau și repetarea lui de către Michelson și
Morley în 1886 păreau a sprijini antrenarea parțială a eterului. Pe de altă parte, experimentul
Michelson–Morley din 1887 părea să demonstreze că eterul este în repaus în raport cu Pământul,
susținând aparent ideea antrenării complete a eterului.[S 9] Astfel, însuși succesul ipotezei lui Fresnel în
explicarea rezultatelor lui Fizeau a contribuit la intrarea într-o criză teoretică, care nu a fost rezolvată
până la dezvoltarea teoriei relativității restrânse.[S 8]