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Profesora Guía
PhD. Vivian Morera Córdova
Autora
Karen Marcela Vásquez Bautista
Año
2016
ii
----------------------------------------------------
Vivian Morera Córdova
Doctora en Ciencias Biológicas
CI: 1756346811
iii
“Declaro que este trabajo es original, de mi autoría, que se han citado las
fuentes correspondientes y que en su ejecución se respetaron las disposiciones
legales que protegen los derechos de autor vigentes.”
-------------------------------------------------------
Karen Marcela Vásquez Bautista
CI: 0502638828
iv
AGRADECIMIENTOS
DEDICATORIA
RESUMEN
ABSTRACT
The rapid population growth has spurred the increased agricultural activities
with consequences involved such as the indiscriminate use of pesticides and
chemical fertilizers; raising negative impacts on ecosystems. Boron is a
micronutrient needed in commercial fertilizers for optimal crop development.
When the boron concentration exceeds the maximum on the soil (1 to 9 ppm),
depending on the crop, it becomes toxic causing environmental and agricultural
problems. The impact of excessive concentrations of this metalloid is reflected
in reducing soil quality, functionality and performance. In this study, in order to
identify a method to reduce high boron concentrations in agricultural soils,
bacterial strains that accumulate this element were isolated and identified from
broccoli crops soil samples in Poaló town, Cotopaxi – Ecuador. Forty bacterial
were initially chosen and exposed to boron concentrations between 4 and 750
ppm in Luria Bertani (LB) agar, and finally only five strains were selected to test
bioaccumulation and biochemical enzymatic identification. BorA16, BorB27,
BorB29, BorC310 and BorD46 that tolerate boron concentration levels of at
least 750 ppm, and bioaccumulated 55%, 57.5%, 62.5%, 37.5% and 55% ppm
respectively, of the concentration at which were exposed. Results of this
analysis show that selected bacteria could belong to the genera: Bacillus spp,
Brevibacterium spp. and Pseudomonas spp., and that they could be considered
suitable for bioremediation of agricultural soils affected by excessive boron
concentration levels.
ÍNDICE
INTRODUCCIÓN ...................................................................................... 1
Antecedentes .............................................................................................. 2
Planteamiento del problema .................................................................... 4
Hipótesis de la investigación ................................................................... 4
Alcance ......................................................................................................... 5
Justificación ................................................................................................. 5
Objetivos ...................................................................................................... 7
Objetivo General ......................................................................................... 7
Objetivos Específicos .................................................................................. 7
INTRODUCCIÓN
Antecedentes
Un estudio realizado por Moraga, Poma, Amoroso y Rajal (2014) del Instituto
de Investigaciones para la Industria Química de Argentina, aisló cepas
pertenecientes al género Streptomyces y Actinomyces con capacidad de tolerar
hasta 4.757 ppm de boro, cuyo objetivo fue remover de suelos mineros
contaminados a dicho elemento.
Hipótesis de la investigación
Alcance
Justificación
Objetivos
Objetivo General
Objetivos Específicos
1.1 Brócoli
Se caracteriza por tener un color verde intenso, con varias cabezas florales
carnosas en forma de árbol, sobre un tallo grueso comestible. Es un cultivo de
clima cálido y fresco (Espinoza, 2014).
Se cree que uno de los principales beneficios que se tiene al consumir brócoli,
es que reduce el riesgo de contraer cáncer, ya que es un vegetal crucífero con
valores medicinales y nutricionales con alto contenido de proteínas, vitaminas,
fito-nutrientes, antioxidantes carbohidratos y minerales. (FAO, 2006; Moon et
al., 2010).
9
Cotopaxi
Pichincha
16,84%
Imbabura
Chimborazo
73,35%
Otros
1.2 Boro
Existen más de 200 tipos de minerales que contienen boro pero solo cuatro son
de importancia comercial; el bórax, la ulexita, la kernita y el ácido bórico se
extraen de manera masiva. En la agricultura se utiliza ácido bórico y bórax
como fertilizantes y se aplica directamente al suelo o de manera foliar (Parks y
Edwards, 2005).
de un puente borato.
El boro cumple una función importante en las bacterias del género Azotobacter
debido a que este ayuda a su crecimiento y es requerido para la fijación de
nitrógeno (Anderson y Jordan 1961), mientras que la cianobacteria Anabaena
sp. utiliza para crecer en condiciones deficientes de nitrógeno (Mateo et al.,
1986). Se ha demostrado que el boro en forma de ácido bórico, puede ser
utilizado para la composición de la membrana bacteriana y también como un
mecanismo de trasporte de proteínas o compuestos orgánicos (Miwa et al.,
2009).
16
1.3 Bioacumulación
Algunas bacterias han demostrado estar cubiertas por una superficie proteica
llamada capa S, es la parte más externa de la superficie bacteriana conformada
por proteínas o glicoporteinas que se autoensamblan alrededor de la bacteria
capaz de unirse a altas cantidades de iones metálicos (Sleytr, Györvary y Pum,
2003).
Muestreo
Identificación bioquímica
2.1 Participantes
Código Fecha de Cantón/Parroquia/ Coordenadas Altitud Edad Variedad del Cultivo Observaciones
del muestreo de brócoli anterior del manejo del
campo Localidad GPS cultivo suelo
San Cotopaxi/ Latacunga / Poaló/ O78˚39ˈ24.87ˈˈ 2907m 89 Brócoli Avenger Papa Preparación del
Cristóbal 2015-09- Hacienda Santa Días suelo mecánico,
I 14 Isabel S0˚52ˈ2.43ˈˈ Potrero Fertilizante
aplicado es una
mezcla de N. P.
K. Ca. Mg. S 130-
80-250-20-10-
San Cotopaxi/ Latacunga / Poaló/ O78˚39ˈ22.64ˈˈ 2906m 39 Brócoli Avenger Papa 10Kg
Cristóbal Días Respectivamente
II 2015-09- Hacienda Santa S0˚52ˈ4.18ˈˈ Potrero el B. Fe. Zn. Mg
14 Isabel de manera foliar y
fosfitos.
Pesticidas
(Insecticidas)
San Cotopaxi/ Latacunga / Poaló/ O78˚39ˈ22.8ˈˈ 2906m 80 Brócoli Avenger Potrero Clorpirifós,
Cristóbal Días Cañón,
III 2015-09- Hacienda Santa S0˚52ˈ6.13ˈˈ Pasto Cipermetrina,
14 Isabel Dimetoato, Ingeo,
(Fungicidas)
Metalic, Revuz,
Lanchero, Comet,
Sico, Cantus folio
gold. Utilización
de Biol
Era Vieja Cotopaxi/ Latacunga / Poaló/ O78˚39ˈ20.25ˈˈ 2907m 35 Brócoli Avenger Kikuyo
I Días Existe rotación de
2015-09- Hacienda Santa S0˚52ˈ16.18ˈˈ cultivos cada dos
14 Isabel años.
22
23
Contenido de agua en el
Humedad suelo, definido como el Porcentaje de agua
coeficiente entre el volumen contenida en el suelo.
de agua presente en un
volumen total de muestra
de suelo
pH Coeficiente de acidez o pH
basicidad
(Ecuación 1)
Dónde:
W: Porcentaje de humedad
Ww: Peso de la muestra húmeda más el recipiente – peso de la muestra seca
más el recipiente
Ws: Peso de la muestra seca más recipiente – peso del recipiente
(Ecuación 2)
Dónde:
UFC/ g s.s.: Unidades formadoras de colonias / g de suelo seco.
NC: Número de colonias en una caja.
FD: Factor de dilución correspondiente a la caja.
V: Volumen inoculado en la caja
P: Peso de la muestra húmeda.
FH: Factor de humedad (1-(% humedad/100)).
Figura. 7 Medios inoculados con cinco cepas bacterianas después de siete días en agitación
a 30 °C.
(Ecuación 3)
Para las bacterias Gram positivas se utilizó las pruebas API ® 50CHB/E y
Microgen® Bacillus-ID; para las Gram negativas el sistema Microgen GN-ID
como se observa en la figura 8. Se siguieron las instrucciones mencionadas
por el fabricante de cada producto. Además de eso se realizaron pruebas de
oxidasa, catalasa y motilidad.
Las pruebas API 50CHB/E se dividen en dos; la primera es API 20E que
contienen una serie de pruebas bioquímicas como: Voges–Proskauer, ONPG,
arginina dehidrolasa, lisina y ornitina descarboxilasa, utilización de citrato,
producción de sulfuro de hidrógeno, ureasa, TDA, producción de indol,
producción de acetoína, hidrólisis de gelatina y fermentación/ oxidación de
glucosa y manitol. La segunda prueba API 50 CHB (Fermentación de
carbohidratos y derivados) contiene diferentes sustratos como glicerol, eritrirol,
D-arabidosa, ribosa, glucosa, manosa, celobiosa, L-sorbosa, xilpiranosido,
dulcitol, inositol, D-galactosa, maltosa, lactosa, melibiosa, trehalosa, xilosa,
manitol, fructuosa, L-sorbosa, L-ramnosa, dulcitol, inositol, amigdalina, arbutina,
sorbitol, D-adonitrol, metil-BD-xilpiranosido, metil-αD-manopiranosido, metil-αD-
glucopiranosido, N-acetilglucosamida.
® TM
Figura.8 Pruebas API 50CH/E y Sistemas Microgen GnA+B-ID – Bacillius-ID.
La tabla 4 indica que la temperatura por cada punto de muestreo varió entre
10,9 °C – 15,5 °C y la humedad de los campos muestreados en la provincia de
Cotopaxi fue entre 15,07% - 23,00 %. El pH varió entre 7,9 – 8,2 demostrando
ser suelos ligeramente alcalinos.
Tabla 5. Resultado del análisis físico-químico de los cuatro campos cultivados con brócoli de Cotopaxi-Ecuador.
Clase CE CICE NH4 P NH3 K Ca Mg Na Cu Fe Mn Zn B SO4
Textural MO
Campo pH (mmhos/cm) (meq/100mL) ppm ppm ppm (meq/ (meq/ (meq/ (meq/ ppm ppm ppm ppm ppm ppm
(%)
100mL) 100mL) 100mL) 100mL)
Franco 7,90 1,67 12,15 1,8 66,8 66,0 72,20 0,51 8,13 3,06 0,45 3,90 69,8 4,80 6,50 3,98 37,5
San Cristóbal I
Arenoso LAI S M B M A M A A A S S A B S A S
San Cristóbal Franco 7,90 2,65 18,10 2,18 51,90 124,6 112,60 1,08 12,17 4,30 0,55 4,20 96,0 6,90 7,80 5,08 63,5
II Arenoso LAI A M M M E S A E A S A E M A E E
San Cristobal Franco
8,20 1,80 17,56 1,94 61,40 120,4 36,90 0,89 11,88 4,24 0,55 4,10 77,9 6,90 7,80 4,50 55,1
III Arenoso -
Arena
Al S M B A E B A E A S A E M A E A
Franca
Franco 8,10 2,16 20,86 2,47 62,80 110,8 76,00 0,86 14,68 4,77 0,55 4,40 69,6 7,40 8,10 5,85 57,8
Era Vieja I
Arenoso Al A A M A E M A E A S A A M A E A
Nota: Los símbolos de B, M, S, A, E: Bajo, Medio, Suficiente, Alto, Exceso respectivamente; LAI, Al: Ligeramente alcalino y Alcalino estos valores
tienen como significado clasificar los valores de los parámetros analizados con un nivel de confianza del 95%. AGROBIOLAB 2015.
32
33
La tabla 5 nos presenta el resultado del análisis físico químico, donde se puede
observar que en todos los campos muestreados la concentración del boro se
encuentra en exceso, la cantidad de los otros elementos inorgánicos
importantes como Calcio (Ca), Hierro (Fe), Zinc (Zn), Potasio (K), Cobre (Cu),
Fosforo (P) y Magnesio (Mg), tienen niveles entre altos y en exceso. El sodio
(Na) tiene un nivel suficiente en cada campo.
Prueba general:
Tabla 6. Análisis de varianza de las UFC/g.s.s de los cuatro campos brocoleros muestreados.
Adicionalmente, para identificar si los grupos son diferentes entre sí, sé realizó
la prueba de Tukey, una prueba de significancia que efectúa comparaciones
entre las medias utilizando un rango estandarizado de distribución.
Valor alfa=0,05
Campo N A B
San Cristóbal I 3 1,00E5
San Cristóbal II 3 1,23E5 1,23E5
San Cristóbal III 3 1,23E5 1,23E5
Era Vieja I 1,36E5
Sig. 0,086 0,399
Nota: La diferencia de medias es significativa al nivel 0,05.
Se hizo una diferencia entre los datos del boro inicial colocado en el medio y
los datos del boro residual (Verce et al., 2012), de esta manera se adquirió los
datos de la concentración intracelular de dicho elemento en las bacterias como
se observa en la tabla 9.
Tabla 9. Cuantificación del boro residual e intracelular de las cinco cepas bacterianas aisladas.
Boro Boro
Código de
residual intracelular
aislamiento
(ppm) (ppm)
BorA16 1,8 2,2
BorB27 1,7 2,3
BorB29 1,5 2,5
BorD46 1,8 2,2
BorC310 2,5 1,5
39
Bioacumulación de Boro
3
Bioacumulación de boro (ppm)
2,5
2
1,5
1
0,5
0
BorC 310 BorA16 BorD46 BorB27 BorB29
Código de aislamiento bacteriano
Una vez que se obtienen las cepas con las mejores características de
tolerancia y bioacumulación se procedió a realizar las pruebas bioquímicas de
las marcas API® BioMérieux, MicrogenTM GnA+B-ID y Microgen® Bacillus-ID
siguiendo las consideraciones de los fabricantes.
Tabla 10. Identificación de las bacterias con mayor tolerancia y bioacumulación de boro.
Código de Código de Morfología Tinción Catalas Oxidas Posible
aislamient identificació bacteriana Gram a a género
o n bioquímica bacteriano
00230124 Bacilo
BorA16 Microgen® esporulado Positivo Positivo Positivo Bacillus spp.
Bacillus-ID r
00014525
BorB27 Microgen® Bacilo Positivo Positivo Positivo Bacillus spp.
Bacillus-ID
0522000000
Bacilo
050130012 Negativ Brevibacteriu
BorB29 esporulado Positivo Positivo
o m spp.
API® r
BioMérieux,
440020001
TM
Microgen Negativ Pseudomonas
BorC310 Bacilo Positivo Positivo
GnA+B-ID o spp.
00260024 Bacilo
BorD46 Microgen® esporulado Positivo Positivo Positivo Bacillus spp.
Bacillus-ID r
41
El análisis físico químico de los cuatro suelos mostró que existen varios
micronutrientes y macronutrientes en cantidades altas y en exceso, como es el
caso del Mg, K, P, Ca, B, Fe y Zn. Estas cantidades altas pueden provocar un
bloqueo y déficit de otros nutrientes, bajas concentraciones de materia orgánica
y la reducción de la funcionalidad normal del suelo lo cual está confirmado por
Barbazán y Suelos (1998).
Otro mecanismo importante y el cual podría estar relacionado con las bacterias
de este estudio, son las interacciones intracelulares o procesos de
bioacumulación. Este proceso es lento y requiere de energía, por esta razón
solo se da en bacterias vivas, es capaz de atrapar mayor cantidad de iones
metálicos a diferencia de los demás mecanismos. Pueden existir
transformaciones enzimáticas y síntesis de proteínas enlazadoras a los metales
denominadas metaloproteínas. Estas proteínas enlazan los metales al interior
celular, debido a su alta afinidad que tienen hacia los iones metálicos
(Churchill, Walters y Churchill, 1995; Brady y Duncan, 1994, Kassan, 1993).
En esta investigación, los Bacillus ssp. demostraron ser los segundos mejores
bioacumuladores de boro, estudios registran la alta capacidad que tiene este
género, en adsorber metales pesados como el plomo, cadmio, cobre, níquel,
manganeso, cromo, zinc, boro, cobalto y otras soluciones mixtas de metales en
condiciones de laboratorio (Kim et al., 2007). Existen varias especies
pertenecientes al género Bacillus spp. involucrados en mecanismos de
tolerancia y bioacumulación de boro, como es el caso de cepas que podrían ser
Bacillus cereus (1), Bacillus cereus (2), Bacillus pumilus, Bacillus safensis,
Bacillus boroniphilus mencionados anteriormente (Ahmed et al., 2007a; Miwa et
al., Raja et al., 2012a,b;). Velásquez y Dussan (2009) señalan que especies
del Bacillus spp. pueden realizar procesos de biosorción y bioacumulación, ya
sea en biomasa viva o muerta; la adsorción se da por medio de las moléculas
de superficie (capa S) y la acumulación se da a través de proteínas
(metaloproteínas), que la célula usa normalmente para incorporar elementos
esenciales, tales como el fósforo y el azufre.
se compara con los datos obtenidos de Miwa et al. (2009), donde señala que
las cepas menos favorables a la bioacumulación de boro fueron las que tenían
un 99% de homología al género Pseudomona con un total de bioacumulación
de tan solo 0,00648 ppm de boro intracelular.
Este género es importante dentro del área de la biotecnología, debido a que las
aplicaciones son muy variadas en la industria como; la biodegradación de
tóxicos, las biotrasformaciones mediadas por encimas, la producción de
metabolitos, la biorremediación de suelos y aguas contaminadas con petróleo.
Teitzel y Parsek, (2003) menciona que existen bacterias de este y otros
géneros que han desarrollado una variedad de mecanismos de tolerancia, para
contrarrestar el estrés en medios contaminados con metales pesados o
residuos petrolíferos, donde incluyen procesos de secuestro, formación de
complejos y finalmente la eliminación fuera de la célula.
48
5.1 Conclusiones
5.2 Recomendaciones
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ANEXOS
ANEXO 1. Puntos muestreados en los cuatro campos.
CAMPO 1 CAMPO 4
Mues Largo Ancho Mues Largo Ancho Mues Largo Ancho Mues Largo Ancho
tra (m) (m) tra (m) (m) tra (m) (m) tra (m) (m)
1 34,5 6 1 123 37 1 111 49,5 1 28,5 6
2 67,5 40 2 120 9,5 2 31,5 28 2 54 36
3 121,5 6 3 135 12,5 3 48 4 3 16,5 11,5
4 99 8,5 4 51 41,5 4 60 9 4 114 16,5
5 69 0,5 5 109,5 43 5 13,5 44 5 0 16
6 139,5 41,5 6 142,5 20 6 90 10,5 6 87 48,5
7 136,5 8,5 7 76,5 4,5 7 43,5 30,5 7 40,5 25,5
8 67,5 6,5 8 94,5 28,5 8 46,5 30 8 78 45,5
9 18 46 9 28,5 48,5 9 18 39 9 73,5 34
10 145,5 26 10 40,5 32 10 64,5 48,5 10 60 10
CAMPO 3 CAMPO 2
Mues Largo Ancho Mues Largo Ancho Mues Largo Ancho Mues Largo Ancho
tra (m) (m) tra (m) (m) tra (m) (m) tra (m) (m)
1 9 37 1 145,5 9,5 1 18 22,5 1 111 40
2 148,5 10,5 2 18 18 2 120 40,5 2 28,5 45
3 84 16 3 108 5,5 3 18 33 3 37,5 17
4 12 20 4 34,5 38 4 25,5 23 4 124,5 36,5
5 27 4,5 5 49,5 0 5 1,5 46,5 5 129 47,5
6 132 30 6 48 29 6 124,5 45,5 6 60 25,5
7 31,5 14,5 7 145,5 13,5 7 25,5 22,5 7 13,5 31,5
8 19,5 6 8 85,5 9,5
8 91,5 15,5 8 76,5 26
9 138 48,5 9 145,5 13,5
9 90 6 9 136,5 24,5
10 117 21,5 10 102 20 10 78 41 10 97,5 46
ANEXO 2. Los cuatro campos de brócoli muestreados con diferentes
estadios de crecimiento.
ANEXO 3. Recolección de muestras de suelo en cultivos de brócoli.
Reactivo Cantidad
Peptona de caseína 10 g/l
Agar 15 g/l
pH 7.0
ANEXO 7. Cuantificación del boro residual de cada caldo LB.
ANEXO 8. Características de las colonias bacterianas aisladas del suelo.