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CAPÍTULO

13
Metabolismo

Las reacciones químicas que tienen lugar en los organismos ING convertido a un producto que sirve como sustrato para otra
bibliografía pu- abarcan lo que se llama metabolismo o, más enzima en una reacción siguiente; esto continúa hasta que el
precisamente, metabolismo intermediario. producto final se realiza en una secuencia oído lin- de
Las reacciones que se producen antes de las sustancias se reacciones ( Fig. 13.1 ). Sustancias A ( sustrato inicial) se
absorben en el tracto gastrointestinal se Ered conside- etapas transforma en producto B por acción de la enzima una, B se
premetabolic. convierte entonces en C por la enzima si, etc., hasta que la producto
metabolismo intermediario incluye procesos de la naturaleza final E se obtiene. Esta vía implica cuatro etapas o reacciones
variada, diseñado para cumplir los propósitos siguien- tes: (1) la catalizadas por enzimas. Las sustancias B, C, y D se
degradación de compuestos absorbidos en el intestino en consideran inter- productos mediatas, o metabolitos.
productos más simples que pueden ser utilizados como
precursores para la síntesis de nuevas moléculas endógenas
(proteínas, ácidos nucleicos, polisacáridos y lípidos complejos), Algunas vías metabólicas no son sólo lineal, sino que
necesarios para la estructura y función de demanda a TIS; y (2) incluyen puntos de ramificación ( Fig. 13.2 ). Cuando el producto
la generación de la energía y la potencia ducing re- necesaria (B) que resulta de la reacción que el sustrato (A) experimenta
para la síntesis de compuestos propios y diferentes funciones del tiene dos rutas alter- nativa. En el primero, la enzima si cataliza la
cuerpo. conversión de B a C, y a través de una serie de etapas, se
obtiene el producto final E. Alter- nativa, B pueden formar P a
través
Los procesos de degradación corresponden a lo que se conoce como catabolismo, de la acción de Zyme en- si' y el producto R se obtendrá
mientras que los eventos se refieren a la biosíntesis de anabolismo. después de las reacciones posteriores.

Si todas las reacciones en una vía metabólica son reversibles,


VÍAS METABÓLICAS las transformaciones químicas pueden proceda del en ambas
direcciones. Por ejemplo, como se muestra en Fig. 13.3 , Sería
transformaciones metabólicas, incluyendo tanto la degradación posible obtener libra por com- como el producto final cuando se
y la síntesis, se producen generalmente a través de una serie de comienza con E como un sustrato inicial, siguiendo las mismas
reacciones catalizadas por enzimas dispuestos en una secuencia acciones re- que conducen de la A a E, pero en la dirección
definida. Estas series de reacciones, conocido como vías inversa.
metabólicas, convertir un precursor o compuesto de partida en un
producto final ticular par-. Comúnmente, el sub- Strate inicial, bajo Cuando una o más de las reacciones son de forma práctica
la acción de una enzima específica, es irreversible, las reacciones inversas necesitan ocurrir a través de
una vía de desvío ( Fig. 13.4 ).

Bioquímica médica
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276 13. Metabolismo

FIGURA 13.1 secuencia lineal de reacciones.

FIGURA 13.5 ciclo metabólico.

FIGURA 13.2 reacciones ramificada.

Cuando las reacciones C → D y D → E son esencial- mente


irreversible, las reacciones inversas BE- tween E y C
requieren la formación de otro intermedio, S.
FIGURA 13.6 ciclos metabólicos interconectados por un intermedio
En algunos casos, las transformaciones químicas OC-act común (C).
cíclicamente y se denominan ciclos metabólicos.
Estos implican una serie ordenada de reacciones, lo que P e Y son los productos liberados. Compuesto C representa
resulta en la regeneración del compuesto inicial ( Fig. 13.5 ). un metabolito intermediario común que determina la
En el ejemplo de Fig. 13.5 , Comienza el ciclo operación interdependiente de ambos ciclos.

con la reacción entre A y S para formar sub- postura B. El En otros procesos metabólicos, las reacciones si- bajo un “ cascada
producto B se convierte en C, que finalmente se convierte en D. ”O escalonados disposición de las reacciones ( Fig. 13.7 ).
Sustancia D a continuación, se descompone en dos productos, P Generalmente, estos incluyen reacciones de la enzima de
y A. La sustancia P se libera y comienza el compuesto A una activación. Por ejemplo, un zimógeno A se convierte en la
nueva serie de reacciones mediante la combinación con mol- enzima activa B a través de la catálisis por la enzima a. B cataliza
ecule S. Sustancias aportados desde el exterior (S en este la conversión de la enzima M inactivo en la enzima activa N,
ejemplo) se llaman alimentadores; sustancias que, a su vez, activa X a Y. Este tipo de proceso permite una
ción amplifica- progresiva de la respuesta. Esto es esencial en
A, B, C, y D son metabolitos intermedios gene- ated durante la los casos en los que se requiere la producción rápida y
operación de ciclo, y P es la molécula producto liberado. abundante del compuesto nal fi. Un ejemplo de este tipo de
reacción es la cascada de coagulación de la sangre (Capítulo
ciclos metabólicos pueden ser interconectados por uno o 31).
metabolitos intermedios más comunes ( Fig. 13.6 ).

Ciclos I y II comparten las C. Sustancias intermedias S y Las vías metabólicas se pueden distinguir en tres grupos
X son alimentadores y moléculas diferentes: (1) catabólico, (2) anabólico, y (3) reacciones
anfibólicos.

FIGURA 13.3 Secuencia de reacciones reversibles.

FIGURA 13.4 Reversibilidad de una ruta metabólica a través de una ruta de


desvío. FIGURA 13.7 secuencia de cascada escalonada o metabólica.
Estudios metabólicos 277

Las vías catabólicas. En estas reacciones, el sustrato original Se proporcionan los nutrientes en cantidad y calidad adecuada.
se convierte en compuestos más simples. Incluyen reacciones
oxidativas que están involucrados en la producción de energía; Por el contrario, en los organismos jóvenes en crecimiento y en las
por lo tanto, son exergónica ( - Δ SOL). La energía química mujeres embarazadas hay predominancia del anabolismo, con la
obtenida a partir de los sustratos está atrapado en forma de ATP incorporación neta de materia. En la edad avanzada, sin embargo, el
y los equivalentes reductores generaciones rados en la reacción equilibrio se desplaza en favor del catabolismo. En muchas condiciones
son aceptados por redox enzimas co, tales como NAD +. patológicas, el equilibrio entre el anabolismo y el catabolismo puede ser
Ejemplos de este tipo de reacciones son las vías oxi- dación alterado en cualquier dirección.
glucolíticas y de ácidos grasos.

Las vías anabólicas. Estas vías forman productos químicos


que son más complejos que los sustratos iniciales, siguiendo METABÓLICO ESTUDIOS
una serie de reacciones Ergonic finales (+ Δ SOL), que sólo
proceder si se acoplan a las reacciones exergónicos El estado actual del conocimiento del metabolismo
(comúnmente asociada con la hidrólisis de ATP). En general, termediario es el resultado de las contribuciones de muchos
tienen el potencial de reducción; la NADPH coen- Zyme es el investigadores, que han resuelto, paso a paso, el intrincado
principal donante de hidrógeno en los procesos anabólicos. laberinto de transformaciones bioquímicas que tienen lugar en
Los ejemplos incluyen el ácido graso y colesterol vías de el cuerpo. Esto no fue una tarea sencilla. La resolución
síntesis. completa de una vía metabólica presenta enormes desafíos,
principalmente debido a la extremadamente baja concentración
anfibólica vías. Estas vías pueden funcionar como anabólico y la corta vida de muchos de los metabolitos ary interme-. En la
o catabólico ing Dependiendo de las necesidades de la célula. actualidad, ha sido posible determinar con precisión numerosas
Se degradan sustratos por oxidación, pero también puede vías metabólicas,
producir metabolitos que se utilizan para la síntesis de nuevos
compuestos. Un ejemplo incluye el CLE Cy-ácido tricarboxílico, incluyendo sus interconexiones,
que oxida de etilo para CO 2 y H 2 O con la producción de energía establecer y desarrollar “mapas metabólicos,” complejos que
y genera productos intermedios que son sustratos para la proporcionan una visión integrada del metabolismo.
síntesis de diversos compuestos.

¿Cómo los científicos han podido descifrar el metabolismo y sus


múltiples vías. Una breve refe- rencia de las principales
Los procesos de biosíntesis y la degradación operan herramientas y enfoques utilizados en este campo sigue.
continuamente en los organismos vivos. Las estructuras
químicas experimentan cam- bios permanentes; anabolismo y Los primeros estudios relacionados con el equilibrio químico
catabolismo se encuentran en una equilibrio dinámico. Como mostró que ciertos precursores eran ed convert- por organismos
resultado de este equilibrio, se establece una Ance equili- entre vivos en un producto final particular.
el organismo y su entorno. Los alimentos proporcionan la
energía y los elementos necesarios para la reparación y el Observaciones sobre el proceso de fermentación fueron la
mantenimiento de las estructuras vitales. En contraste, los base del balance de materiales y destacaron la importancia de
productos metabólicos de desecho y sustancias no utilizados la catálisis. Por ejem- plo, la fermentación de la glucosa por
son ex atrás creted al medio. Mantenimiento del equilibrio entre levadura produce dióxido de carbono y etanol de acuerdo con la
las sustancias que entran y se excretan del cuerpo es una ecuación general siguien- tes:
característica de un adulto sano y requiere que apropiado

CHO 122CO 2→CH OH


6 6 2
+ 2 5
278 13. Metabolismo

De carbono no se forma o se pierde en el proceso; los átomos de se ha convertido en una herramienta valiosa en bioquímica in- vestigación en
carbono procedentes de molécula de glucosa se reorganizan para general.
formar los productos finales. Otra línea de investigación es el estudio directo de las
Las contribuciones de Claude Bernard están entre los enzimas implicadas en las vías metabólicas. El hallazgo de
primeros en este campo. Se sabía que cose Glu- se secreta inhibidores específicos de las enzimas permiten la
en la circulación por el hígado. Bernard fue capaz de comprensión de las propiedades de las enzimas
demostrar que una sustancia meric poli-, glicógeno, fue el metabólicas, la inter- medio metabolitos que modifican o los
precursor de la glucosa liberada a la sangre. compuestos que producen, y las vías específicas en las que
las enzimas ejercen su acción. Así, si una enzima particu- lar
A partir de esta evidencia temprana, los conceptos de la en una vía metabólica se bloquea con un inhibidor
transformación de moléculas precursoras en productos, específico, su sustrato, así como otros intermediarios
equilibrio químico, y el papel funda- mental de catalizadores metabólicos anteriores se acumularán, mientras que los
surgieron. Esto fue seguido por la caracterización de las productos de la reacción disminuirá. En este caso, la
múltiples reacciones implicadas en diferentes vías metabólicas. medición de los cambios en sustratos y productos
proporciona información impor- tante de esa vía metabólica.

Los métodos utilizados para estudiar el metabolismo


Las personas que carecen de una enzima en particular pueden
El uso de marcadores ha sido uno de los recursos metodológicos
tener alteraciones en las vías metabólicas específicas. Estos son
más fructíferos utilizados en estudios metabólicos. Una sustancia
defectos comúnmente genéticos y se corresponden a una clase de
precursora se etiqueta y su distribución y las transformaciones se
enfermedades conocidas como errores innatos del metabolismo. El
realiza un seguimiento en el cuerpo. Uno de los ejemplos clásicos de
estudio de estos trastornos han desentrañado información importante
este od met- es el experimento de oxidación de ácidos grasos cuerpo
sobre las vías metabólicas dife- rentes.
por von Knoop en 1904. En este experimento, los ácidos grasos se
marcaron mediante la unión a ellos un radical fenilo. Cuando se
Las técnicas desarrolladas por la biología molecular, que pueden
metabolizan estos ácidos, sus productos oxidados permanecieron
eliminar o reducir la expresión y actividad de una enzima particular en
unidos al radical fenilo, lo que permite su identificación.
las células o incluso en un animal entero (por ejemplo, ratones
knock-out, mutagénesis dirigida, ARN de interferencia, ver los capítulos
22 y 23), han proporcionado nuevas herramientas esenciales en el
La incorporación subsiguiente de ele- mentos isotópicas como
ámbito de la investigación metabólica.
marcadores de una sustancia precursora, sus- tancialmente
mejorado estudios metabólicos. El cuerpo no distingue entre los
isótopos artificiales y elementos naturales; tanto someterse a las
mismas vías metabólicas y por lo tanto, radioisótopos permiten Sistemas modelo utilizado en estudios metabólicos
después de la distribución y destino de una sustancia en el cuerpo.
Los métodos descritos anteriormente se han aplicado a
Los estudios de Schoenheimer con deuterio y nitrógeno isótopos ( 2 H
diferentes sistemas biológicos. Cada presentan ventajas
y 15 N) se encuentran entre la primera que utiliza esta técnica. Se
diferentes y deben ser cionado SE- de acuerdo con los
demostró que las moléculas de la materia viva, están en constante
objetivos específicos de la investigación y la capacidad del
degradación y resíntesis. A partir de estos experimentos surgió el
laboratorio. Estos sistemas incluyen:
concepto de cuerpo com- ponente “vidas medias”; este es el
momento en el que se renueva el 50% de un compuesto dado en
un tejido. 1. animales intactos ( en vivo). Los experimentos están
realizado en todo el organismo.
2. (órganos intactos in vivo o in vitro). Un organo,
El uso de isótopos radiactivos ha permitido la disección ya sea in situ o aislado, se utiliza. La sustancia
de muchas rutas metabólicas y precursor se añade por perfusión
Regulación del metabolismo 279

a través del sistema arterial y las muestras de sangre que de transformaciones químicas. El conjunto de metabolitos
sale del sistema venoso se obtienen para el análisis de los representan lo que se ha llamado la
productos. metaboloma. Se estima que la tabolome me- normales
3. rebanadas de tejido ( in vitro). El experimento es comprende al menos 3.000 compuestos; Sin embargo,
llevado a cabo utilizando secciones finas de un tejido, en algunos autores afirman que el número es mucho mayor ( ~ 100.000).
el que la difusión de sustancias entre la muestra y el Un mación estimación precisa de los metabolitos endógenos
medio se ve facilitada por el espesor reducido de la es difícil porque hay múltiples sustancias com- ing del medio
sección. ambiente, así como de los alimentos ingeridos, que tienen el
4. células enteras. Los experimentos se llevan a cabo potencial de erate nuevas generaciones productos derivados
con una población homogénea de células, ya sea aislado a partir de de su propio metabolismo.
tejidos (cultivo de células primario), o desarrollados en cultivo como
una línea celular inmortal.
5. tejidos homogeneizadas ( in vitro). Esto incluye El metaboloma ha sido considerada por algunos autores como el
preparaciones de tejido en el que las membranas plasmáticas mejor indicador del fenotipo de un particular indicación. Una
se rompen por medios mecánicos o físicos. Si esto se lleva a instantánea de la perfil metabólico en un momento dado o en virtud de
cabo en soluciones isotónicas, con precauciones especiales, un DICIÓN con- particular proporciona información importante CON
orgánulos subcelulares intactos pueden ser separados de todo RESPECTO A tejido y la función del cuerpo, siendo por lo tanto de
el homogeneizado de células por centrifugación fraccionada gran interés médico.
(diferentes partículas tienen diferentes densidades).
preparaciones homogéneas de núcleos, mitocondrias, El avance de la metabolómica coincidió con el desarrollo
lisosomas, y otros orgánulos se pueden obtener de esta de altamente resuelta analíticamente Cal técnicas, sis
manera. especialmente capilar electrophore-, cromatografía de gases,
cromatografía líquida (de alto rendimiento y ultra-alto
rendimiento, HPLC y UPLC), espectrometría de masas, y nu-
6. Los extractos de tejido. Enzimas, factores o claro magnético resonancia (RMN).
metabolitos pueden ser aislados y purificados a partir de extractos de
tejido. La identificación de estos, incluso en concentraciones muy
bajas, es posible hoy en día con la ayuda de métodos
extremadamente sensibles.
Regulación del metabolismo
espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN).
RMN se ha utilizado en los últimos años para el estudio del Las múltiples vías metabólicas que existen en cada necesidad de
metabolismo con gran éxito. Esta técnica permite el estudio de células y el tejido a ser finamente coordinación NATed para garantizar
las transformaciones químicas, iden- tificar intermedios el funcionamiento adecuado de la ganism or- como un todo. El
metabólicos, y para determinando ing el flujo de metabolitos a suministro y la demanda de un compuesto dado varía en diferentes
través de diferentes vías celulares en los órganos, e incluso momentos, por lo que el flujo de metabolitos a través de las vías
todo el organismo. Es una técnica no invasiva que no perturba catabólicas o anabólicas debe ser ed constantemente Ajustar- a las
la fisiología normal. circunstancias y necesidades que una célula u organismo caras.
Survival altamente depende de la capacidad de un organismo para
regular cesos pro- metabólicas, para asegurar la constancia de los
medios de comunicación intra y extracelulares dentro de límites
estrechos sarios sario para realizar funciones básicas.
metaboloma

Como correlato de los estudios del genoma y proteoma


(pp. 496 y 515), muchos laboratorios empezaron a caracterizar Un número de ES proceso- reguladores metabólicos se
los metabolitos resultantes han estudiado a nivel molecular
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especialmente en las bacterias. Esto es debido a la simplicidad de


los microorganismos, en comparación con la de los eucariotas
superiores. Los organismos superiores necesitan integrar la
función metabólica lleva a cabo en diferentes órganos para lograr
una función armónica e integrada de todo el cuerpo. Esto se logra
principalmente a través de los sistemas nervioso y crine endo.
FIGURA 13.9 regulación de la retroalimentación en una vía metabólica ramificada.

Como todas las reacciones químicas en una célula son cata-


lisaron por las enzimas, por lo tanto, el control de su actividad es la conversión de nuevo en moléculas A B. Este es un ejemplo
esencial para controlar la velocidad de reacciones específicas y en de retroalimentación negativa, en el que el producto final de
última instancia de las diferentes vías metabólicas. La velocidad a la una ruta metabólica inhibe la enzima responsable de la
que procede una reac- ción particular, depende tanto de la cantidad reacción inicial.
absoluta de enzima presente y su eficiencia efi- catalítica. La En vías ramificados, cada uno de los pro- ductos finales pueden
cantidad de la enzima en una célula depende del equilibrio entre su actuar como un efector alostérico negativo de la enzima en el punto
síntesis y su degrada- ción. Como se verá en otros capítulos, la de ramificación donde comienza la tesis syn- de ese producto
biosíntesis de proteínas está estrechamente ajustada por inducción particular. Fig. 13.9
y la represión de su gen correspondiente. también están regulados muestra una representación esquemática de los sitios de la inhibición por
Los procesos de degradación de la proteína específica. retroalimentación dentro de una vía metabólica ramificada.

La modificación covalente, por adición o moval re- de


fosfato, adenilación, etc. es otro mecanismo utilizado para
Otro mecanismo para lograr ulación REG metabólico es el modular la actividad de Zymes en- y regular las vías
control de la actividad enzimática. Esto depende, en muchos metabólicas. ejemplos especí- espe- de estos tipos de control,
casos, en la acción de las sustancias de bajo peso molecular mecanismos de inte- gración, y efectos hormonales
que funcionan como específicas sobre las vías metabólicas se tratarán en más
efectores alostéricos. Los cambios en la concentración de sustratos, detalle en otros capítulos.
coenzimas, compuestos intermedios o productos finales del metabolismo
pueden afectar a la actividad de una enzima o bien mediante la
estimulación (efectores positivos) o inhibir (efectores negativos) de ella.
Compartimentación de las enzimas implicadas
en el metabolismo
Un tipo común de regulación es el mecanismo de
retroalimentación. En las células eucariotas, las enzimas que actúan en cada
En una secuencia metabólica, como la que se muestra en la Fig. vía metabólica son por lo general confinadas a un
13.8 , El precursor A se convierte en el producto final D a través compartimento celular definida. Esto proporciona la
de la ac- ción catalítica de tres enzimas ( una a C). El producto final localización espacial apropiada y aumenta la eficiencia de las
(D) puede actuar como un inhibidor alostérico de la enzima a. transformaciones metabólicas. La distribución
compartimentada de enzimas al- ellos mínimos a la función en
Por lo tanto, cuando una cantidad suficiente de D ha acu- RELAClONADAS, se orden secuencial, por lo que el producto de una reacción se
detendrá su propia producción mediante el bloqueo libera en el dad vicin- del sitio activo de la siguiente enzima en
la vía metabólica, facilitando su catálisis. El flujo de
metabolitos en una dirección dada se llama “canalización” o
“túnel”. Los mecanismos responsables de la distribución
FIGURA 13.8 regulación de la retroalimentación en una vía metabólica lineal. espacial adecuada
bibliografía 281

de enzimas en una ruta se varían: (1) que pueden ser ciclos metabólicos abarcar una serie de reacciones en las que
el sustrato se reforma de manera continua y los metabolitos intermedios se
clasificadas por inserción en una membrana (es decir,
regeneran continuamente. Las sustancias que entran en el ciclo se conocen
componentes de la cadena de transporte de electrones en la
como alimentadores del ciclo, mientras que las moléculas que salen del ciclo
membrana interna de las mitocondrias), (2) que se pueden se denominan productos. reacciones en cascada son los procesos
organizar en lar molecu- altamente estructurado complejos metabólicos en el que la
(es decir, la piruvato deshidrogenasa multienzimático
producto de una reacción activa la velocidad de una segunda reacción. Esto
complejo en la matriz mitocondrial), y (3) que pueden
produce una amplificación significativa de una respuesta.
interactuar, incluso cuando están en solución. La distribución
ordenada de enzimas en el citosol limita la difu- sión libre de El estudio del metabolismo ha tomado ventaja de la utilización de
metabolitos en el medio, facilita el encuentro de marcadores bioquímicos para etiquetar una sustancia particular y seguir su
enzima-sustrato y aumenta la eficiencia de las reacciones. fe metabólico. isótopos han sido los marcadores muy útiles en estudios
metabólicos. espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) es otro
Una asociación de enzimas solubles con los elementos
recurso poderoso para seguir la transformación química de los compuestos.
estructurales de la matriz citoplasmática se ha propuesto para
Este tipo de técnicas se puede aplicar a animales intactos o los órganos,
enzimas de la ruta glicolítica. células, homogeneizados, y extractos de tejidos. Además, los estudios de la
función y propiedades de las enzimas han ayudado en gran medida en el
metabolismo de la comprensión.

Por otra parte, la existencia de portadores específicos que son


regulados específicamente en las membranas en la superficie
la regulación metabólica es esencial para satisfacer las necesidades de la organiza-
celular y en orgánulos permite con- trol del tráfico de sustratos en ismo. Los mecanismos implicados incluyen la modulación de la actividad
diferentes compartimentos celulares y para regular la función de enzimática (como efectos alostéricos y modificación covalente) y el incremento o

las vías metabólicas. regulación por disminución de la cantidad de moléculas de enzima existentes en las
células, a través de inducción o represión de su síntesis o degradación.

compartimentación en la célula permite la espacial adecuada


localización de las enzimas de rutas metabólicas. La restricción en la
RESUMEN distribución y la disposición secuencial de las enzimas en un
compartimento celular o aumenta orgánulos la eficiencia a la cual las
transformaciones químicas pueden proceder.
Metabolismo comprende todas las reacciones químicas que se producen con-
en los organismos vivos. Los procesos que implican la degradación de los
compuestos corresponden a catabolismo y las que conducen a la síntesis de
nuevas moléculas corresponden a
Bibliografía
anabolismo. En general, el catabolismo tiene una naturaleza oxidativa y utiliza
coenzimas como NAD + como aceptor de electrones. Es exergónica; el - Δ sol se Golpe, N., 2008. La metabolómica: la nueva imagen de la bioquímica.
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