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1.

Explique qual a diferença entre uma enzima Michaeliana (que responde à


cinética de Michaelis-Menten) e uma enzima regulatória.
Uma ENZIMA MICHAELIANA (hiperbólico) atua em função da concentração do
substrato. ENZIMAS REGULATÓRIAS (sigmoidal) apresentam atividade que pode ser
controlada (regulada) em função da situação metabólica da célula.
ENZIMAS REGULATÓRIAS São enzimas que sofrem alteração na atividade catalítica
em resposta a fatores metabólicos. A atividade catalítica é regulada podendo ser
aumentada ou diminuída; As enzimas regulatórias são responsáveis pelo controle de
uma via metabólica e são estruturalmente mais complexas do que as enzimas
Michaelianas  costumam apresentar diversas subunidades  apresentam pelo
menos 2 sítios de ligação de compostos: • sítio ativo: local da transformação do
substrato em produto • sítio regulatório: (é responsável pelo controle da atividade
da enzima) Local de ligação do modulador alostérico OU Local de modificação
covalente da enzima.
2. Explique o papel dos moduladores alostéricos (positivos ou negativos) no
controle catalítico de enzimas regulatórias. Por que o efeito desses
moduladores na atividade enzimática só é observado com o aumento de
concentração dos mesmos?
Regulação Alostérica • efetores ou moduladores alostéricos (interação): O controle/
atividade da enzima é dependente da interação da enzima com o modulador.
O efeito do modulador alostérico é observado somente quando está interagindo
(associado) com o sítio regulatório (alostérico). A diminuição da concentração do
modulador leva a sua saída do sítio regulatório (alostérico) e a enzima volta a ter
atividade normal. *Quando aumenta a concentração do modulador, há modificação
na atividade da enzima.
3. Qual a diferença entre um inibidor e um modulador alostérico negativo em
termos de atividade catalítica?
Na maioria das vias metabólicas, é comum que o produto final atue como modulador
alostérico negativo da enzima que catalisa as primeiras reações da via. Portanto,
quando a concentração deste produto aumenta ele vai agir como
um inibidor alostérico, diminuindo a velocidade da via e a sua própria produção. Na
inibição enzimática, a substância inibidora forma ligações químicas com as enzimas,
de modo a interferir na sua atividade catalítica.

4. A via metabólica abaixo tem como função a produção de F e ATP. Responda:


a) Existe uma enzima regulatória que controla esta via. Qual seria esta enzima?
Justifique
e1, que pode ser controlada de forma alostéricamente negativa.
b) Como é possível controlar negativamente a atividade desta enzima?
Através de compostos que são usados como reguladores negativos, como F e ATP,
pois é possível que a enzima e1 tenha um sítio de ligação regulatório para F e tenha
um sítio de ligação para ATP, então, se aumenta a concentração de F ou ATP, eles
ocupam o sitio regulatório de e1 e a atividade da enzima e1 é diminuída.
c) É possível controlar positivamente esta enzima? Como?
Sim, através do regulador positivo, ADP, então a concentração elevada do ADP, ela
vai se ligar a uma enzima regulatória (e1) e a enzima vai funcionar melhor, ela vai
aumentar a velocidade de produção de B, e aumentando a produção de B, aumenta
o resto.
5. Em cada uma das alternativas abaixo, indique a forma solicitada:
a) forma reduzida: NADH ou NAD+
b) forma oxidada: FADH2 ou FAD
c) indicativo de alta taxa energética:
[ATP] / [ADP] ↑
d) indicativo de baixa taxa energética:
[ATP] / [ADP] ↓
7. Suponha que você tenha descoberto uma levedura mutante (modificada) cuja
via glicolítica (glicólise) apresente uma reação a menos devido a presença de uma
enzima que catalisa a reação a seguir: gliceraldeído 3-fosfato + H2O + NAD+  3-
fosfoglicerato + NADH + H+ Muito embora esta enzima diminua a glicólise em
apenas um passo, explique como será afetada a produção anaeróbica (sem O2) de
ATP.
Não. Não há produção de ATP em condições anaeróbias; a produção aeróbia de ATP
será levemente reduzida.

8. Durante uma atividade física extrema, o tecido muscular necessita de grandes


quantidades de ATP se comparado a uma situação de repouso. No músculo da
perna de um coelho em fuga, esse ATP é produzido quase exclusivamente através
da fermentação da glucose a lactato. O ATP necessário nessa situação é produzido
através de duas reações enzimáticas catalisadas pelas fosfoglicerato quinase e a
piruvato quinase. Suponha que um músculo não possua a lactato desidrogenase.
Esse músculo poderá exercer uma atividade física extrema, ou seja, ele poderá
gerar ATP em grande quantidade apenas utilizando a via glicolítica? Explique.
Lembre-se que a reação catalisada pela lactato desidrogenase não envolve ATP.
Não. A lactato-desidrogenase é requerida para a reposição de NAD+ a partir do
NADH formado durante a oxidação do gliceraldeído-3-fosfato.

9. O efeito da concentração de ATP na enzima alostérica fosfofrutoquinase (PFK) é


mostrada no gráfico abaixo. Para uma determinada concentração de frutose 6-
fosfato, a atividade de PFK aumenta com o aumento da concentração de ATP,
entretanto a um determinado ponto, o aumento da concentração de ATP provoca
a diminuição da atividade enzimática.

a) Explique como ATP pode ser tanto substrato como modulador negativo da
enzima PFK. Como essa enzima pode ser regulada por ATP?
Existem dois sítios de ligação para o ATP: um sítio catalítico e um sítio de regulação.
A ligação do ATP ao sítio de regulação inibe a PFK-1, pela redução da Vmáx ou pelo
aumento do Km para o ATP no sítio catalítico.
b) De que maneira a via glicolítica é regulada pelo nível de ATP?
O fluxo glicolítico é reduzido quando há abundância de ATP
c) A modulação negativa da PFK por ATP é diminuída quando a concentração de
ADP é alta (como mostrado no gráfico). Como essa observação pode ser
explicada.
O gráfico indica que o aumento da [ADP] suprime a inibição pelo ATP. Uma vez que
a quantidade de nucleotídeos de adenina é razoavelmente constante, o consumo de
ATP leva a um aumento na [ADP]. Os dados mostram que a atividade da PFK-1 pode
ser regulada pela proporção [ATP]/[ADP].

10. Ingerir metanol pode ser fatal. O metanol por si só não é perigoso, porém ele
é rapidamente metabolizado a formaldeído (altamente tóxico) através da ação da
enzima álcool desidrogenase. Um aspecto interessante é que um dos tratamentos
para um envenamento por metanol é fazer com que o paciente beba etanol.
Apresente uma explicação por que este tratamento é eficiente.
A enzima que transforma o metanol é a mesma que tem como substrato o etanol, a
enzima desidrogenase alcoólica hepática, por isso o uso do etanol tem sido um
tratamento eficaz, pois o etanol possui alta afinidade pela enzima álcool-
desidrogenase, ocorrendo inibição por competição e também porque o etanol liga-
se muito facilmente ao ácido fórmico, principal metabólito do metanol, excretando-
o mais facilmente.
11. Molho de soja (shoyu) é utilizado rotineiramente nas culinárias chinesa e
japonesa. O shoyu é produzido a partir da fermentação de soja e trigo na presença
de sal, através de diversos microrganismos, incluindo leveduras. Esta fermentação
ocorre por um período de 6 a 12 meses. Após remoção de material particulado, a
solução obtida é rica em lactato e etanol. Como são produzidos estes dois
compostos? A fim de prevenir o sabor de vinagre (ácido acético), O 2 não deve ser
permitido durante o processo de fermentação. Por que? Obs. grãos de soja e trigo
possuem amido.
Grãos de soja e trigo contêm amido, um polímero de glicose. Os microrganismos
degradam o amido em glicose, glicose em piruvato via glicólise, e piruvato em lactato
– porque o processo se realiza na ausência de O2 (ou seja, é uma fermentação). Se o
O2 estiver presente, o piruvato será oxidado a acetil-CoA e então a CO2 e H2O. Certa
quantidade de acetil-CoA, contudo, será também hidrolisada a ácido acético
(vinagre) na presença de oxigênio.

14. O fígado pode realizar a neoglucogênese utilizando oxaloacetato como


composto de partida. Explique como pode ser afetado o ciclo do ácido cítrico com
a produção excessiva de glucose a partir de oxaloacetato.
O fígado é o principal órgão que produz tais substâncias. Estas vão de suas
mitocôndrias para o sangue, que as transporta. A produção excessiva destes
compostos é denominada cetose, podendo causar acidez sanguínea – cetoacidose –
a longo prazo. A acetona, dificilmente oxidada e volátil é eliminada pela urina
(cetonúria) e expelida pela boca, conferindo um odor característico.

17. Embora o O2 não participe diretamente do ciclo do ácido cítrico, o mesmo


funciona somente quando O2 está presente. Por que? Qual o papel do O2 no
processo de oxidação da glucose a CO2?
Neste caso o oxigênio é o último aceptor de elétrons na cadeia respiratória, o mesmo
tem a função de reciclar as coenzimas NADH e FADH2 que foram reduzidas. Em
ausência do oxigênio não há reoxidação dos transportadores de elétrons.

18. Como a velocidade do ciclo do ácido cítrico pode ser afetada pelo aumento da
relação [NADH]/[NAD+ ] na matriz mitocondrial? Justifique a sua resposta.
O aumento na [NADH]/[NAD+] inibe o ciclo do ácido cítrico, pela ação das massas, nas três
etapas de redução do NAD+; a alta [NADH] desloca o equilíbrio em direção ao NAD+.
19. Rotenona, um produto tóxico obtido de plantas, inibe fortemente a NADH
desidrogenase (complexo I) da cadeia de transporte de elétrons em mitocôndrias
de insetos e peixes. A antimicina A, outro antibiótico tóxico, inibe fortemente a
oxidação do ubiquinol (UQ).
a) Explique por que a ingestão de rotenona é letal para peixes e insetos.
A inibição da NADH-desidrogenase pela rotenona reduz a velocidade do fluxo de
elétrons pela cadeia respiratória, o que, por sua vez, reduz a taxa de produção de
ATP. Se essa taxa reduzida não for capaz de suprir as necessidades do organismo por
ATP, ele morrerá.
b) Explique por que a antimicina A é considerado um veneno.
A actinomicina A inibe fortemente a oxidação da coenzima Q na cadeia respiratória,
reduzindo a velocidade de transferência de elétrons e levando às consequências
descritas em (a).
c) Assumindo que a rotenona e a antimicina A sejam igualmente eficientes em
bloquear seus respectivos sítios na cadeia de transporte de elétrons, qual dos dois
seria um veneno mais potente? Explique.
c) Uma vez que a actinomicina A bloqueia todo o fluxo de elétrons para o oxigênio,
ela é um veneno mais potente do que a rotenona, a qual bloqueia o fluxo de elétrons
a partir do NADH, mas não do FADH2.

20. Em uma mitocôndria em condições normais a velocidade da transferência de


elétrons é fortemente acoplada a demanda por ATP. Assim quando a taxa de
utilização de ATP é relativamente baixa, a velocidade da transferência de elétrons
também é baixa. Da mesma forma que quando a demanda de ATP é alta, a
velocidade de transferência de elétrons também é alta. Sob tais circunstâncias, o
número de moléculas de ATP produzido por O2 consumido, quando o NADH é o
doador de elétrons, é aproximadamente 3 (relação conhecida como P/O).
a) Diga o efeito de concentrações relativamente baixas de um agente desacoplador
na velocidade de transferência de elétrons e na relação P/O. E no caso de uma
concentração relativamente alta do mesmo desacoplador?
A velocidade de transferência de elétrons necessária para suprir a demanda de ATP
aumenta, e por isso a relação P/O diminui.
b) A ingestão de desacopladores da cadeia respiratória (cadeia de transporte de
elétrons) provoca o aumento da temperatura corpórea e alta taxa de transpiração.
Explique esse fenômeno em termos moleculares. O que acontece com a relação
P/O com a presença de desacopladores?
Uma alta concentração do desacoplador reduz a relação P/O para quase zero. A
relação P/O diminui, e é necessário oxidar mais combustível para gerar a mesma
quantidade de ATP. O calor extra liberado por essa oxidação eleva a temperatura
corporal.
c) O desacoplador 2,4-dinitrofenol foi, durante algum tempo, prescrito como um
remédio para emagrecimento. Como essa droga pode, em princípio, ser utilizado
para o emagrecimento? Tais drogas não são mais prescritas devido a morte de
pacientes. Por que a ingestão de desacopladores pode levar a morte?
O mecanismo é idêntico ao do pentaclorofenol. Ocorre estímulo do ciclo de Krebs,
que deverá ser alimentado por Acetil-CoAs. Estes deverão ser provenientes dos
combustíveis metabólicos, principalmente ácidos graxos que devem ser mobilizados
a partir dos estoques de triacilgliceróis ou triglicerídeos do tecido adiposo. Por isso,
a pessoa emagrece.
Pode levar a morte pois acontece que se a relação P/O (síntese de ATP) cair muito,
as células do organismo poderão entrar em deficiência grave de ATPs e isto
contribuirá para danos graves, semelhante a um choque por falta de oxigênio. A
diferença básica é que o DNP irá estimular o consumo de O2, de combustíveis
metabólicos, provocará elevação da temperatura corporal e sudorese, e baixa
síntese de ATP pelas células do organismo de maneira sistêmica, caso a ingestão seja
elevada, o organismo pode não ter saída.

21. Quando O2 é adicionado a uma suspensão de células crescendo em


anaerobiose e, portanto, com alto consumo de glucose, a velocidade de consumo
desse monossacarídeo cai dramaticamente na medida em que O 2 é consumido.
Outro fato é que a acumulação de lactato para na medida em que a cultura passa
para aerobiose. Esses efeitos, observados primeiramente por Louis Pasteur na
década de 1860 são característicos de células capazes de crescer tanto em
anaerobiose como em aerobiose.
a) Por que o acúmulo de lactato para quando O2 é adicionado ao sistema?
O lactato estava acumulando devido a necessidade de reciclar o NAD+. Com adição
de oxigênio, o NADH será reciclado pela cadeia respiratória e, assim, a produção de
lactato cessa.
b) Por que a presença de O2 diminui a taxa de consumo de glucose?
A geração de energia através da cadeia respiratória (implica na presença de
oxigênio) é muito maior que pela fermentação láctica. Não há necessidade de
consumir tanta glucose, como na fermentação láctica.
c) Como o consumo de O2 influencia as enzimas controladoras do ciclo da glicólise?
Com o consumo de oxigênio, aumenta a produção de ATP, que passa a inibir a
fosfofrutocinase 1. É a regulação alostérica desta enzima.
24. Explique o papel de carnitina e co-enzima A no processo de degradação de ácidos
graxos.
A L-carnitina é uma amina naturalmente produzida pelo organismo a partir dos
aminoácidos lisina e metionina. Sua principal função é participar do metabolismo de
lipídios, desempenhando papel fundamental no transporte desses do citoplasma
para a matriz mitocondrial, onde são oxidados. L-Carnitina é uma substância que
desempenha um papel importante no metabolismo da gordura, transportando os
ácidos graxos de cadeia longa, para a mitocôndria (fonte energética das células),
contribuindo assim para a combustão da gordura. A carnitina atua na queima de
gordura na mitocôndria, gerando energia para o funcionamento dos músculos. Sem
carnitina suficiente a gordura não entra na mitocôndria e pode retornar ao sangue
como forma de triglicerídeos.
A coenzima A (CoA, CoASH ou HSCoA) é uma coenzima, notável pelo seu papel
na síntese e na oxidação de ácidos gordos, assim como na descarboxilação oxidativa
do ácido pirúvico antes do ciclo de Krebs. A sua molécula é constituída por ácido
pantoténico (vitamina B5), adenosina trifosfato e cisteamina. Posto que a coenzima
A é quimicamente um tiol, pode reagir com os ácidos carboxílicos para
formar tioésteres, de modo que atue como um portador de grupo acilo. Uma
molécula de coenzima A que leva um grupo acetilo é referida como Acetil-CoA.
Quando não está unida a um grupo acetilo é referida geralmente como "CoASH" o
"HSCoA". Quando a Coenzima A se une ao Acetil, ela permite que ele seja degradado
pelas enzimas do ciclo de krebs, o qual ocorre posteriormente a degradação da
mesma.

27. Quando a quantidade de acetil-CoA produzido durante a oxidação  no fígado


ultrapassa a capacidade do ciclo do ácido cítrico, o excesso de acetil-CoA é utilizado
para a síntese de corpos cetônicos. Este tipo de situação acontece, por exemplo, em
casos de severa diabete devido a incapacidade do organismo em utilizar glucose como
fonte de energia; esses pacientes utilizam como fonte de energia a gordura. Embora
acetil-CoA não seja tóxico a mitocôndria deve dirigir o acetil-CoA para a síntese de
corpos cetônicos. Por que? Como esse desvio para a síntese de corpos cetônicos
resolve o problema de obtenção de energia em pacientes com severa diabete?
Uma vez que o reservatório de CoA mitocondrial é pequeno, essa deve ser reciclada a
partir de acetil-CoA via a formação de corpos cetônicos. Isso permite o funcionamento
da via da -oxidação, necessária para a produção de energia.
26. Diz a lenda que os camelos podem permanecer longos períodos sem beber água
devido ao armazenamento do líquido nas suas corcovas. Na verdade, as corcovas do
animal são grandes depósitos de gordura. Como esses depósitos de gordura podem
ser utilizados na obtenção de água?
As corcovas são realmente um reservatório de tecido adiposo. Concentrando-se a
gordura corporal em suas corcovas minimizam o calor isolando todo o resto do seu
corpo, que é uma das adaptações para viver em climas quentes. Quando este tecido é
metabolizado, ele age como uma fonte de energia, e produz mais de 1 g de água para
cada 1 g de gordura convertido por reação com o oxigênio do ar. Este processo de
metabolização de gordura gera uma perda líquida de água através da respiração para o
oxigênio necessário para converter a gordura.
Na verdade, os camelos minimizam a perda de água eliminando urina concentrada e
fezes secas e controlando a transpiração. Esses animais podem ficar de 2 a 3 semanas
sem beber água, por isso a gordura e o tecido muscular das corcovas contribuem para a
sobrevivência do animal, pois ele a usa como uma reserva de energia. A água é
armazenada principalmente na corrente sanguínea, evitando a desidratação dos
camelos.
29. Diferente do coelho com curtos períodos de alta atividade física, pássaros
migratórios necessitam de energia por longos períodos de tempo. Por exemplo, patos
geralmente voam milhares de quilômetros durante o período de migração. O músculo
de vôo desses pássaros possuem uma alta capacidade oxidativa e esses animais obtém
o ATP necessário através da oxidação de acetil-CoA via o ciclo do ácido cítrico e
fosforilação oxidativa. Compare a regulação da glicólise no músculo durante curtos
períodos de alta atividade física (como no caso de um coelho em fuga) e durante
longos períodos de atividade física (como no caso de pássaros migratórios). Por que a
regulação metabólica nessas duas situações deve ser diferente?
O pássaro migratório conta com uma oxidação de gorduras altamente eficiente, em vez
do metabolismo anaeróbio da glicose utilizado pelo coelho corredor. O pássaro reserva
o glicogênio de seus músculos para curtas “explosões” de energia durante situações de
emergência.

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