LES ENTEROBACTERIES

Prof. Iyane Sow

Bactério-Virologie
 Objectifs pédagogiques
• Citer les caractères de définition des
Entérobactéries
• Lister les principaux caractères différentiels
des Entérobactéries
• Expliquer le pouvoir pathogène des
entérobactéries
• Décrire la démarche diagnostique au
laboratoire de chaque genre
• Proposer antibiotiques actifs et vaccins
 1. Introduction
* Vaste famille : Enterobacteriaceae
* 7 caractères communs :
- Bacilles à Gram négatif
- Immobiles ou mobiles péritriche
- Aéro-anaérobie facultatifs
- Se développent sur milieux ordinaires
- Fermentent le glucose
- Nitrate réductase (+)
- Oxydase (-)
• Genres : variés
- Salmonella, Shigella, Yersinia
- Escherichia, Klebsiella, Proteus
- Enterobacter, Serratia, Hafnia
- Citrobacter, Morganella, Providencia
• Espèces : nombreuses :
Dans chaque genre
 2. HABITAT
• Bactéries du tube digestif
- Certaines vivent dans l’environnement
- D’autres chez les végétaux ou animaux
• Genres constamment pathogènes (BPS)
• Bactéries pathogènes opportunistes (BPO)
• Présentes aussi dans l’environnement
contaminé
• Transmission
- fécale orale : mains sales, aliments …
- voie iatrogène : infection nosocomiale
• Sources de contamination
- eau, aliments
- fruits, légumes ….
 3. Caractères différentiels
Distinction en genres et espèces
• Sucres :
Lactose,

mannitol,

saccharose …
• Enzymes :
bêta- galactosidase

uréase
décarboxylases

désaminase
• Culture sur milieu au
citrate de Simmons

• Production de :
sulfure d’hydrogène (SH2)
• indole

• Gaz
Galerie API
 Lactose / B-galactosidase

(+) (-)

VP Voges Proskauër TDA

Tryptophane Désaminase
Escherichia Salmonella
Klebsiella Shigella
Enterobacter Proteus
Serratia Providencia
 4. Escherichia coli
• Espèce type du genre Escherichia
• Bactérie la plus utilisée en génétique
et en physiologie
• Réputée commensale du tube digestif
mais souches entérovirulentes + +
• Espèce aérobie la plus représentative
dans l’intestin
 4.1. Caractères bactériologiques
Morphologie :
Bacille à Gram négatif mobile

Culture : facile sur milieu nutritif

Caractères biochimiques :
Lactose (+), Gaz (+), indole (+)
Uréase (-), VP (-), C. de Simmons (-), SH2 (-)
 4.2. Pouvoir pathogène
* Infections intestinales : divers pathovars
/ E. coli entéropathogènes (ECEP) :
diarrhée infantile (1-2 ans)
12 sérotypes (agglutination)

/ E. coli entérotoxinogènes (ECET) : diarrhée

cholériforme (tourista chez le voyageur)
/ E. coli entéro-invasifs (ECEI) :
syndrome dysenterique
sécrétion de toxine + invasion

/ E. coli entérohémorragiques (ECEH):

diarrhée sanglante
complication: syndrome hémolytique et
urémique

/ Autres
* Infections urinaires :
E. coli : principale cause
- Propriétés différentes
- Production d’hémolysine
* Autres infections :
Méningites : E. coli K1
Cholécystite : vésicule biliaire
Septicémie
 4.3. Diagnostic biologique
• Prélèvements :
Selles, urines, LCR, sang, pus
• Isolement : milieux sélectifs ou non
• Identification biochimique
• Facteurs de virulence dans les diarrhées
- Agglutination avec sérums (ECEP, ECEH)
- Culture cellulaire (ECET, ECEI)
- Biologie moléculaire (ECEI)
4.4. Sensibilité aux antibiotiques
Bactérie généralement sensible
Mais résistances acquises :
pénicillines A, sulfamides et associés

Quinolones + + (infections urinaires)

Antibiogramme
 5. Genre Shigella
5.1. Caractères bactériologiques :
* Bacilles à Gram négatif immobiles
* Germe non exigeant (milieux nutritifs)
* Beaucoup de caractères négatifs :
CS, TDA, Uréase, Gaz, SH2
* Mannitol variable : négatif pour S. dysenteriae
* Indole : variable
* Quatre sérogroupes : quatre espèces
A : Shigella dysenteriae (10 sérotypes)
type 1 : épidémies + +
B : Shigella flexneri (6 sérotypes)
C : Shigella boydii (15 sérotypes)
D : Shigella sonnei (1 sérotype)
 5.2. Pouvoir pathogène
Lié à 2 phénomènes : caractère invasif &
production de toxine
* Maladie du péril fécal : contamination
orale
* Syndrome dysenterique fébrile :
épreintes, ténesme, évacuations rectales
afécales (glaire, sang, mucus)
Complications : déshydratation, SHU
* Autre forme clinique : diarrhée aqueuse
 5.3. Diagnostic au laboratoire :
Diagnostic direct : coproculture
* Prélèvements : Selles fraîches (sang, glaire)
Transport rapide ou milieu de transport Cary Blair
* Etapes du diagnostic :
- Examen microscopique
- Culture : milieux sélectifs
- Identification biochimique
- Sérogroupage, sérotypage
- Antibiogramme
5.4. Sensibilité aux antibiotiques :
* En général : bonne sensibilité (antibiogramme)
Mais émergence de résistances multiples (Shigella
dysenteriae 1) : Pénicillines A, cyclines, Sulfamides et
associés
* Choix orienté selon la souche
* Recommandation OMS : quinolones (acide
nalidixique & fluoroquinolones)
5.5. Prévention : - Hygiène + +
- Vaccins : à l’étude
 6. Genre Salmonella
Genre le plus vaste de la famille
Nouvelle classification : 1 seule espèce
Salmonella enterica
7 sous espèces : sous espèce I = 99 %
Sérovars ou sérotypes : sans italique ex.
Salmonella Typhi
 6.1. Caractères bactériologiques

* Morphologie :
Bacilles à Gram négatif mobiles

* Culture :
Milieux ordinaires, sélectifs ou non
Enrichissement possible (bouillon)
* Caractères biochimiques
- Production de gaz : sauf S. Typhi
- Sucres : Lactose (-), B-galactosidase (-)
saccharose (-), adonitol (-), salicine (-)
- Enzymes : TDA (-), uréase (-)
- Citrate de Simmons (+) : sauf S. Typhi & S.
Paratyphi A
- SH2 (+) : sauf S. Paratyphi A
* Caractères antigéniques
Trois types d’antigènes :
• Antigènes somatiques (Ag O) : portés par la
paroi, constitués de facteurs antigéniques
(coagglutinations)
• Antigènes flagellaires (Ag H): bactéries mobiles
• Antigènes capsulaires (Ag Vi) :
- Chez 3 sérotypes : S. Typhi, S. Paratyphi C,
S. Dublin
- Cachent l’Ag O (inagglutinable)
Ag O1 Facteurs Ag O2
antigéniques
communs
* Pouvoir pathogène
Formes digestives : diarrhée, vomissements
Forme septicémique : PE digestive
Autres : méninges, os, vésicule biliaire,
poumons
Distinguer :
. Salmonelloses majeures : fièvre typhoïde,
fièvres paratyphoïdes A, B, C
. Salmonelloses mineures : diarrhée banale …
 6.2. Diagnostic au laboratoire
* Diagnostic direct:
. Isolement à partir de :
Selles : coproculture
Sang : hémoculture
Autres : pus, urines, LCR …
. Identification biochimique, Sérotypage,
antibiogramme
* Diagnostic indirect :
Sérodiagnostic de Widal et Félix : recherche
d’anticorps anti O, anti H, anti Vi
 6.3. Bases du traitement
* Traitement curatif : antibiogramme
Phénicolés + +, Pénicillines A, Fluoroquinolones
* Prophylaxie :
- Hygiène (péril fécal)
- Vaccination :
/ Vaccin TAB : bactéries inactivées
/ Vaccin Ty 21a : souche vivante atténuée
/ Vaccin TYPHIM Vi : polyoside capsulaire
 7. AUTRES
ENTEROBACTERIES
7.1. Groupe Klebsiella-Enterobacter-Serratia
Bactéries pathogènes opportunistes :
infections nosocomiales
* Genre Klebsiella :
/ Principal genre du groupe
/ Bactéries à réaction de VP positive,
/ Principales espèces : K. pneumoniae, K. oxytoca,
K. ozaenae, K. rhinoscleromatis
/ Principaux caractères :
. Bacilles à Gram négatif, immobiles, encapsulées ,
. Colonies moyennes, muqueuses
. Lactose (+), Mannitol (+), Uréase (+), Gaz (+), SH2 (-),
Indole : variable
/ Pouvoir pathogène : Bronchopneumopathies
aiguës, infections urinaires, hépato-biliaires,
septicémies
/ Résistance naturelle : aminopénicillines, et
carboxypénicillines
Multirésistance : production de Bêta-lactamase à
spectre élargi + +
* Genre Enterobacter :
- Bacilles à Gram négatif, mobiles péritriches
- β-galactosidase (+), Mannitol (+), Gaz (+),
SH2 (-), Indole (-), Uréase (-)
- Espèces : E. aerogenes, E. cloacae,
E. agglomerans, E. sakazakii
- Bactéries pathogènes opportunistes :
septicémies, méningites, infections urinaires,
Inf. néonatales, suppurations
- Bactéries souvent résistantes : Résistance
naturelle : Pénicillines A, Céphalotine
* Genre Serratia :
- Bacilles à Gram négatif, mobiles péritriches
- Colonies pigmentées en rouge
- β-galactosidase (+), Mannitol (+), VP (+)
Uréase (-), Gaz (+), SH2 (-), Indole (-)
- Espèces : S. marcescens, S. rubidaea,
S. liquefaciens, S. odorifera
- Peu pathogènes chez les sujets sains : infections
hospitalières parfois épidémiques
- Résistance naturelle : Cyclines, colistine
Céphalotine
 7.2. Autres
* Genre Proteus : Mobiles péritriches, TDA+,
Bêta galactosidase (-)
. Espèces : P. mirabilis, P. vulgaris
. Uréase (++), SH2 (+), Indole variable
. Infections urinaires + + : Proteus mirabilis

* Genre Providencia :
Mobiles, TDA +, indole (+), SH2 (-)
 MERCI

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