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ii
AGRADECIMIENTOS
PROYECTO:
iii
AGRADECIMIENTOS
su modelo educativo.
y consejos.
iv
DEDICATORIA
v
ÍNDICE GENERAL
V. CONCLUSIONES........................................................................................ 31
LITERATURA CITADA ......................................................................................... 33
1
ÍNDICE DE CUADROS
Página
ÍNDICE DE FIGURAS
2
Caracterización cultural, morfológica y molecular de aislados de Fusarium
spp. asociados a caña de azúcar en México.
RESUMEN
V.R. Guevara ; M.G. Hernández-Arenas2; S.G. Leyva Mir3
1
verticillioides, México.
3
Cultural characterization, morphological and molecular isolates of Fusarium
spp. associated with sugarcane in Mexico.
ABSTRACT
V.R. Guevara ; M.G. Hernández-Arenas2; S.G. Leyva Mir3
1
With the objective of identifying the species and genotypes of Fusarium spp.
spp. from Veracruz, Morelos, Oaxaca and Puebla. Pieces of diseased tissue
washed and disinfected with 3% NaClO for 3 min, were planted on PDA and
and CLA. Extraction was performed and DNA amplification by PCR ITS1 and ITS4
primers, the amplified product was purified and sequenced in Macrogen (Korea).
The sequences were compared with the database of the National Center for
Biotechnology Information (NCBI), after aligned with the ClustalW of the program
Mega5. For dendrogram used sequences of F. commune and aligned data matrix
was pooled using UPGMA statistical analysis. The species identified morphological
being F. proliferatum the most frequently isolated species (95.7%). There is a wide
4
I. INTRODUCCIÓN
siguientes factores:
2006).
5
frecuentes enfermedades y está prácticamente en todas las áreas productoras de
caña de azúcar del mundo (Raid, 2012). Puede causar graves pérdidas en
tolerancia a ésta enfermedad que adquiere cada vez más importancia en nuestro
Es por ello que los objetivos del presente trabajo fueron los siguientes:
spp. presentes.
donde se esparció a Asia, a las islas del Pacífico y posteriormente al resto del
mundo. A fines del siglo XV fue traída a América por Cristóbal Colón (Rosas et al.
2010).
6
La caña de azúcar que trajo Colón en 1493 a La Hispañola (ahora República
1523-24, fue conocida durante varios siglos como “caña criolla”, la misma que
Linneo clasificó por primera vez con el nombre de Saccharum officinarum en 1753
también por un incremento sostenido en la demanda por parte de los colonos, que
Actualmente los principales países productores de esta gramínea son Brasil con
lugar está la India con 347, 870 millones de ton; le sigue China con 124, 170, 500
millones de ton; Tailandia con 96,500 millones de ton; Pakistán con 58,038
millones de ton y México ocupa el sexto lugar con 50, 946, 483 millones de ton
(FAOSTAT, 2013).
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Estado Superficie sembrada Total nacional (%) Rendimiento
(miles de Ha) (ton ha -1)
Veracruz 279,944 34.98 64.3
Jalisco 79,591 9.94 97.9
San Luis Potosí 72,568 9.06 66.5
Oaxaca 70,593 8.82 69.3
Tamaulipas 61,825 7.72 57.1
Tabasco 36,960 4.61 33.0
Nayarit 34,739 4.34 78.4
Chiapas 30,962 3.86 90.5
Quintana Roo 30,141 3.76 59.8
Sinaloa 24,706 3.08 81.0
Puebla 18,474 2.30 123.7
Morelos 16,974 2.12 117.7
Colima 16,431 2.05 90.0
Michoacán 13,971 1.74 79.9
Campeche 12,337 0.015 No hay dato*
TOTAL 53,347.7 73.98
*Situación al 31 de diciembre de 2012.
Fuente: SIAP (2013)
rendimientos de 64.3 ton ha -1 valor que está por debajo del rendimiento promedio
enfermedades causadas por hongos, entre las que destacan: la roya común
9
color gris a negro que se desprende de la parte superior de la planta de caña
tallos infectados. Pueden variar en longitud desde unos pocos centímetros a varios
del tejido del hongo y comienza a emerger a partir de caña infectada de 2-4 meses
síntomas del carbón pueden ser evidentes antes de ver el látigo característico. Por
ejemplo, las nervaduras de las hojas son erectas antes de que surja el látigo, las
plantas afectadas pueden generar gran cantidad de brotes más delgados y erectos
con pequeñas hojas estrechas. Las plantas que crecen en condiciones de estrés
y Lentini, 2005).
comerciales.
10
2.3.2. Roya común (Puccinia melanocephala Syd. & P. Syd)
El primer brote grave de la roya común de la caña de azúcar causada por Puccinia
casi todas las áreas cañeras del mundo (Ramouthar, 2009). En Sudáfrica ahora
(Ramouthar, 2009).
Los primeros síntomas de la infección por roya común son pequeñas y alargadas
manchas amarillas visibles en ambos lados de las hojas. Las manchas se vuelven
abaxial de las hojas, las cuales miden de 2-20 mm de largo por 1-3 mm de ancho
Sullivan, 2000).
11
2.3.3. Roya naranja [Puccinia kuehnii (W. Krüger) E.J. Butler]
mm. Rara vez son de más de 1-3 mm de ancho. Los síntomas se observan hacia
la parte apical de la hoja. Las pústulas, que producen esporas, por lo general se
1,0-1,5 de forma regular, mientras que las de P. kuehnii son más espaciadas y
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Aunque una serie de productos químicos están registrados para el control de
de azúcar, ya sea tallo, hojas, brotes y raíces. Completa su ciclo de vida en la hoja
(Duttamajumder, 2008).
Los síntomas típicos en el tallo son manchas blancas en contraste con áreas
cuando el cultivo está en la etapa final del ciclo productivo. En las primeras etapas
oscura en la corteza del tallo a menudo se hace evidente cuando los tejidos
13
planta afectada mueren. En la plantación se puede observar en manchones o el
2008).
mayoría, sino en todas, las áreas productoras de caña de azúcar del mundo (Raid,
14
2.3.5.1. Historia
reportó por primera vez en Java por Walker en 1886 y más tarde por Edgerton en
2.3.5.2. Síntomas
acortamiento de las hojas afectadas (Figura 1B), y en casos severos, muerte del
hojas sanas (Figura 1A). En las hojas maduras, dentro de las partes cloróticas, se
desarrollan orificios que no tienen arreglo definido. Este tejido rojizo puede formar
15
En ocasiones la infección del cogollo desciende dentro del tallo con líneas café
mezcladas con lesiones que dan la apariencia de corte de cuchillo. Estas lesiones
16
2.3.5.3. Agente causal
figuran maíz, arroz, caña de azúcar, esparrago y plátano, a los que ocasiona
pudrición del tallo y mazorca, en caña de azúcar induce la pudrición del tallo o
común en las zonas frías donde el maíz se cultiva y se asocia a la pudrición del
Este patógeno puede persistir en los residuos de maíz, ya sea en la superficie del
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suelo o enterrados en un campo durante al menos 21 meses. Varias cepas
barbecho por muchos años lo que permite que las plagas y enfermedades se
(1gramo por litro de agua); oxicloruro de cobre al 0.2% (2 gramos por litro de
del Pokkah boeng (VSI, 2013). Sin embargo, la única medida de control eficiente
Raid, 2012).
18
En el periodo de enero a diciembre de 2012, se realizaron una serie de colectas
Zacatepec, Morelos.
cortaron trozos de la zona de transición entre tejido sano y enfermo. Los trozos se
(NaClO) al 3% por tres minutos y se enjuagaron con agua destilada estéril por el
incubaron a 25±1°C.
punta de hifa en una nueva caja Petri con PDA, las cuales se incubaron a 25±1°C
19
Para la obtención de cultivos monospóricos se colocaron 10 mL de agua destilada
nuevamente con una pipeta Pasteur para depositarla en un tubo de ensaye de 100
mL. A partir de esta solución madre, se realizaron diluciones de 1:10 hasta obtener
-20°C.
como el más adecuado para observar estas características según López y López,
20
evaluaron características de la colonia como son: crecimiento radial promedio por
1°C por 3 horas con 30 minutos. Una vez secas se enviaron al Instituto Nacional
megarads).
Este medio se preparó de la siguiente forma: agua agar al 2% (20 gramos de agar
transfirió a una caja Petri con medio de cultivo CLA que se incubaron a
21
fotografías para realizar la caracterización cualitativa (forma) y cuantitativa (largo
medio PDA y con el uso del DNeasy Plant Mini Kit de QIAGEN ® de acuerdo al
reactivos PROMEGA®. Cada tubo contenía 5µl de buffer 1X, 1.5µl de MgCll de
final de 72°C/5 min. Los productos de PCR se separaron por electroforesis en gel
22
Para el dendrograma se utilizaron secuencias de F. commune y la matriz de datos
0.43-1.1 cm día-1 el cual fue un dato similar a lo que reportaron Jahan et al.
macroconidios con célula apical curvada y célula basal en forma de pie, de 21.6-
Los datos anteriores coincidieron con los descritos por Pavlovic et al. (2009) para
el caso de F. proliferatum.
23
Figura 2. Fusarium proliferatum. Variabilidad en el tipo de micelio (2A-D) y
pigmentación (2E-H); microconidios (2I); falsas cabezas (2J) y macroconidios
(2K).
24
macroconidios (Figura 3I) de 3 septos transversales, con célula apical ligeramente
curvada y célula basal en forma de pie (Figura 3K) de 24.2-31.8 × 2.0- 3.1 µm;
México en Japón.
25
4.2. Caracterización molecular
Figura 4. Dendrograma generado utilizando el análisis UPGMA, basado la región parcial del
gen 18 S, ITS1, 5.8s, ITS2 y región parcial del 28 S. Se utilizó la secuencia de Fusarium
proliferatum y Fusarium verticillioides como referencia y a F. commune como grupo externo. 26
El análisis de la región ITS confirmó la identificación morfológica. Los 67 aislados
(Figura 4). Una secuencia no fue incluida en el análisis filogenético debido a que
Las especies del genero Fusarium asociadas a plantas de caña de azúcar con
variación genética que existe entre los aislados de cada especie está presente
que en este trabajo se encontró que únicamente estas dos especies están
como una segunda etapa del proyecto del que forma parte este trabajo de
investigación.
27
ESTADO CLAVE ALTITUD LATITUD LONGITUD ESPECIE
Veracruz F14 19°01' 06.09" 96°37'15.22” Fusarium proliferatum
Morelos F37 951 18°42'28.0" 99°22'32.8" Fusarium proliferatum
Morelos A 25 912 18°37'23.3" 99°09'41.8" Fusarium proliferatum
Morelos A26 912 18°37'23.3" 99°09'41.8" Fusarium proliferatum
Morelos F22 898 18°36'4.5" 99°19'15.3" Fusarium proliferatum
Morelos F23 898 18°36'4.5" 99°19'15.3" Fusarium proliferatum
Morelos F4 897 18°36'22.3" 99°10'40.1" Fusarium proliferatum
Morelos F5 897 18°36'22.3" 99°10'40.1" Fusarium proliferatum
Morelos F6 897 18°36'22.3" 99°10'40.1" Fusarium proliferatum
Morelos F7 897 18°36'22.3" 99°10'40.1" Fusarium proliferatum
Morelos F8 897 18°36'22.3" 99°10'40.1" Fusarium proliferatum
Morelos F9 897 18°36'22.3" 99°10'40.1" Fusarium proliferatum
Morelos F10 905 18°35'43.8" 99°11'40.0" Fusarium proliferatum
Morelos F11 905 18°35'43.8" 99°11'40.0" Fusarium proliferatum
Morelos F12 905 18°35'43.8" 99°11'40.0" Fusarium proliferatum
Morelos F13 905 18°35'43.8" 99°11'40.0" Fusarium proliferatum
Morelos F19 905 18°35'43.8" 99°11'40.0" Fusarium proliferatum
Morelos A12 897 18°34'58.5" 99°11'50.2" Fusarium proliferatum
Morelos A 14 884 18°35'00.2" 99°11'49.2" Fusarium proliferatum
Morelos A15 879 18°34'54.9" 99°11'49.4" Fusarium proliferatum
Morelos A16 880 18°34'54.9" 99°11'49.4" Fusarium proliferatum
Morelos A7 897 18°34'58.5'' 99°11'50.2'' Fusarium verticilloides
Morelos A8 879 18°34'54.9'' 99°11'49.4'' Fusarium proliferatum
Morelos A9 879 18°34'54.9'' 99°11'49.4'' Fusarium proliferatum
Morelos A10 879 18°34'54.9'' 99°11'49.4'' Fusarium proliferatum
Morelos A31 897 18°34'58.5'' 99°11'50.2'' Fusarium proliferatum
Morelos F 16 921 18° 39' 13.9" 99° 11' 55.2" Fusarium proliferatum
Morelos F 17 921 18° 39' 13.9" 99° 11' 55.2" Fusarium proliferatum
Morelos F18 921 18° 39' 13.9" 99° 11' 55.2" Fusarium proliferatum
Morelos F20 921 18° 39' 13.9" 99° 11' 55.2" Fusarium proliferatum
Morelos A27 897 18°36'22.1" 99°10'37.0" Fusarium proliferatum
Morelos A28 898 18°36'22.1" 99°10'37.0" Fusarium proliferatum
Morelos F43 933 18°39'53.3" 99°10'57.2" Fusarium proliferatum
28
Morelos A29 957 18°40'38.7'' 99°09'59.5'' Fusarium proliferatum
Morelos F41 1168 18°42'58.4" 98°56'32.1" Fusarium verticilloides
Morelos F35 1164 18°42'57.0" 98°56'35.6" Fusarium proliferatum
Morelos F36 1164 18°42'57.0" 98°56'35.6" Fusarium proliferatum
Morelos F38 1164 18°42'57.0" 98°56'35.6" Fusarium proliferatum
Morelos F39 1164 18°42'57.0" 98°56'35.6" Fusarium proliferatum
Morelos F40 1165 18°42'57.0" 98°56'35.6" Fusarium verticilloides
Morelos F15 1171 18°43'36.5'' 98°59'39.8'' Fusarium proliferatum
Morelos A17 Fusarium proliferatum
Morelos A18 Fusarium proliferatum
Morelos A19 Fusarium proliferatum
Morelos A20 Fusarium proliferatum
Morelos A21 Fusarium proliferatum
Morelos A22 Fusarium proliferatum
Morelos A23 Fusarium proliferatum
Morelos A24 1305 18°51'12.1" 98°59'44.2" Fusarium proliferatum
Morelos F31 1254 18°47'38.6" 98°58'42.8" Fusarium proliferatum
Morelos F32 1254 18°47'38.6" 98°58'42.8" Fusarium proliferatum
Morelos F33 1247 18°47'35.4" 18°58'36.0" Fusarium proliferatum
Morelos F34 1247 18°47'35.4" 18°58'36.0" Fusarium proliferatum
Oaxaca F29 17°57'51.2" 96°05'16.0" Fusarium proliferatum
Oaxaca F30 18°35'05.2" 96°39'0.67" Fusarium proliferatum
Oaxaca F3 17°15'45.3" 96°12'06.1" Fusarium proliferatum
Oaxaca A30 Fusarium proliferatum
Oaxaca F25 18°08'13.3" 96°13'18.7" Fusarium proliferatum
Oaxaca F26 18°09'08.6" 96°11'57.6" Fusarium proliferatum
Oaxaca F27 18°03'57.1" 96°14'21.3" Fusarium proliferatum
Oaxaca F28 18°00'34.2" 96°02'11.8" Fusarium proliferatum
Puebla P1 1348 18.6317 98.3668 Fusarium proliferatum
Puebla P5 1338 18°37'53.8" 98°21'55.6" Fusarium proliferatum
Puebla P4 1338 18°37'53.8" 98°21'55.6" Fusarium proliferatum
Puebla P13 1224 18.5404 98.4997 Fusarium proliferatum
Puebla P22 1208 18°32'17.3" 98°30'05.5" Fusarium proliferatum
Puebla P23 1208 18.54128 99.4995 Fusarium proliferatum
29
Puebla P34 1159 18°32'30.2" 98°32'4.6" Fusarium proliferatum
Puebla P49 1012 18°28'29.2" 98°41'46.5" Fusarium proliferatum
Puebla P40 1201 18°57'12.7" 98°55'94.2" Fusarium proliferatum
y Puebla.
y Puebla.
30
En el presente estudio, basados en la combinación de caracterización morfológica
McFarlane et al. (2009) quien encontró a Fusarium proliferatum en solo una área
área (N12); y con Mohammadi et al. (2012) quien reportó a Fusarium verticillioides
V. CONCLUSIONES
31
12.85% en Puebla. Fusarium verticillioides se aisló solamente en el estado de
purpura con pigmentación variable, desde blanco hasta rojo oscuro; crecimiento
ligeramente curvada y célula basal en forma de pie de 24.2-31.8 × 2.0- 3.1 µm;
clamidosporas ausentes.
El análisis de la región ITS confirmó las especies del genero Fusarium asociadas a
32
LITERATURA CITADA
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